sp|B6EUA9|PR40A_ARATH ----> Pre-mRNA-processing protein 40A


Intron 1 GTAACTTTCC ... TCTGTGACAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A137.93983
A256.917.312.37
A354.847116
A448.8411912
A546.6712138
A662.79162133
A766.67142630
A858.97162521
A960.71112014
A1055.56121119



>TRINITY_DN60967_c0_g1_i2 from sample A4 / Example spliced isoform
TACTTTCATCAATTAAATAAAAAGGGAGGTATATGTTTGTGAGATTCTGGTAGAACTGATATGTTTAATGACTGATGGCCTCTCTACTGTATACCTAGTTAGATGAAAGAATGGTTGCGCAGGGTATGAACTCTATTATTGATTCAGATCATTCATAAAAGTTTTGGAGATCTAAATTTGAAGCTACAATTTAAAAATGA
AAAAATAAAAGATCTTTTGTTTGGAAGGGAAACAATTTTCAGATTGCCTGGAAATGGAAAGTCTAAGGTGAAAGCAATTTAATTATTTTAACAGTACCTAATTTATCTGTCATAAGGTTCAAAGGGACGGAAGCTGAGTGCAAATGAATGTAGAGAATTTTTTATGCTTTGCATATTGGATTCAGTGAACTGCAATGGAG
TGATTAGAAGCATAAAGAACCATCGAATTTATTCGTGTATCTGATAAGGGCTACTTTGAGCTTTTCATGTATCAGTAGTTTCAGTTGCCAAAAGGACATTGGATTTAAAAGTTAAGTTTATGTACATGTGGAAAATCTTGTTTTCTGCTATCAAGAGTTGTACTCTTTATGAGTAGTGCCTATCCTTTGATCAATTTGTT
TGATCTAAATATTGATGTAATTAAAGTTTCTTTGTTACAAATGTGTGGTTCTTTGTGATTTTGCATGTCAGTTACAGTAGCTTTATACAGCAGTTCAGATTTCTGAGGCGTTATATGTATATTCTGTTTTAAGATGGAAACATTTAAGTGACTTTAGTAACTTTTAGCCTAAGATCTATGGTGGCG


>TRINITY_DN60967_c0_g1_i1 from sample A4 / Example unspliced isoform:
TACTTTCATCAATTAAATAAAAAGGGAGGTATATGTTTGTGAGATTCTGGTAGAACTGATATGTTTAATGACTGATGGCCTCTCTACTGTATACCTAGTTAGATGAAAGAATGGTTGCGCAGGGTATGAACTCTATTATTGATTCAGgtaactttcctctgttcttaaaggactgtatgattgcttataaccaaacaaga
tgcttgatctggtttattctaattgtagactttcctcgtctttctgtgacag
ATCATTCATAAAAGTTTTGGAGATCTAAATTTGAAGCTACAATTTAAAAATGAAAAAATAAAAGATCTTTTGTTTGGAAGGGAAACAATTTTCAGATTGCCTGGAAATGGAAAGTCTAAGGTGAAAGCAATTTAATTATTTTAACAGT
ACCTAATTTATCTGTCATAAGGTTCAAAGGGACGGAAGCTGAGTGCAAATGAATGTAGAGAATTTTTTATGCTTTGCATATTGGATTCAGTGAACTGCAATGGAGTGATTAGAAGCATAAAGAACCATCGAATTTATTCGTGTATCTGATAAGGGCTACTTTGAGCTTTTCATGTATCAGTAGTTTCAGTTGCCAAAAGG
ACATTGGATTTAAAAGTTAAGTTTATGTACATGTGGAAAATCTTGTTTTCTGCTATCAAGAGTTGTACTCTTTATGAGTAGTGCCTATCCTTTGATCAATTTGTTTGATCTAAATATTGATGTAATTAAAGTTTCTTTGTTACAAATGTGTGGTTCTTTGTGATTTTGCATGTCAGTTACAGTAGCTTTATACAGCAGTT
CAGATTTCTGAGGCGTTATATGTATATTCTGTTTTAAGATGGAAACATTTAAGTGACTTTAGTAACTTTTAGCCTAAGATCTATGGTGGCG