sp|F6HQ26|RU1C_VITVI ----> U1 small nuclear ribonucleoprotein C


Intron 1 GTTAGTTGGT ... TATGCTGAAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A148.0514169.9
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A540.081058.4
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A1028.46451620.1



>TRINITY_DN111556_c0_g1_i7 from sample A1 / Example spliced isoform
ATAGTGTATTATAACCAGGTTACATAGTGTCTATGTGGGGTTTTTGAGTGCAAGTGGATTTCATGCTTTTTTTTCTTGCACCTTCTGTTACATTTGATCTGCATATTCTGCGTTTTTTCTTTGGTGCGGCTTTGCTATCTATTCAGCCGAAGTAACAGACGTTCTTGACAGGAAATGTGCAAAACTGAACATCATCCAGA
CTTGTTTGCGAGAAATTTGGAAATCTCTGAAAATCGCTAAGTGGAGAGATCTGAAGCCCCCCAAACCCTATCTTGGTTACTATGCCTCGGTATTATTGCGACTATTGCGATACTTATTTGACTCACGATTCGCCCTCAGTCAGAAAGCAGCATAATGCAGGGTACAAGCACAAGGCAAATGTTCGGGCATATTATCAACA
ATTTGAGGAGCAGCAAACTCAGAGTTTGATAGATCAGAGGGTCAAGGAACATCTCGGTCAGACAGCAGCTTTCCAGCAGCAAGTTGGTGCTGCTTTTCAGCAGCATCTTGCTTCTATGCAGGTTGGGCAGCAGAGGCCTCGTATTCCAATGTTGCCACCACCTACTTTGCCTGTACCAGGATCTACACAGCTACCAAATG
GCTTGCAAATGTTACCTACTGTTCGTCCCCCTGTCCTACCTCGACCTACAATAATGCCTCCAGGCTATGGTCCATCTATGGGGACATCTCCAATGATGAGACCTCCTGGTGCAGCGGTTACCTCACCTCCAGGTGTAGCACAGTCAAATGGCTTGCCAAGGCCACCTACCCTGACTCCTCCAGTTTCTACAGGAGTAACA
CTAGCGGCATCTACATCATCACCGATGTCAAATGTCCTTACATCTAATCCACCGAATTCTGGTCCTTCTGGTACATATCAAAACCAGCAACAAAATTCTATTCCTACAAGTGGAGCTTATGGAACATACAACTATGCAGCAGCCCCAACTGGTTTTTCTCAACAGAGTACATCAGTGACCCCCCCGAATCCTACCTATGG
AACTCAAACTTCCTAGAGTATCTTCATTTCCAGCTTATTATGCTGATTCTACTCTGACACGACCTTCAGCTGCAACTCCTGATATATGTATACTTTCTACTCAAGCTCCTATATTTGTATCCCAGTAATCAATCTGCTACTAATTTGGGTGTGACTTCATATGGAAAACCTGCAGGCTACTGAAGCGGAAGGTTACATTG
CGGAAGGTTACATTTATGATTTTGTCGCTAAGTAAGATCTTATTTATACTTTTGTTCTGCTATGGTTAGGTTTTGAATCTATTTTCTCTCCTATTAACAACTTAATGGCAAGCAAGCAGAGAAGGTATTTTTTGCATATATTATCTCAATTCTATTTTGATTGTTTTACAAAAGCTTTAGATACTGCAATAGATTCATAG
AATCCAAAGGTAATAGGATTATCCTATGGAAGAGGAGTGGATAATTTCTCAGCTGAATTCAAGGTGATGATTTAATGGTTGGTGTCTCTTTTATTTCCCCCTTTGCTTTTCAAATGGCCAGTGAAATACTTTCGTTCTAAAGAGCAAGGCTTGTAAGGTTCCTTTGGACAATACTCTGAAGGTTACATTGCAGAAGGTTA
CGTTTGTGATTTTGCTGCTAAGTAAGATCTTATTTATACTTTTGTTCTGCCATGGTTAGGTTTTGAATACATTTTCTCTCCTATTAACAATTTAATGGCAAGCAAGCAGAGAAGGTATTTTTTTGCATATTTATCTCAATTCTATTCTGATTGTTTTACAAGAGCTTTAGATACTGCGATAGATTCATAGAATCCAAAGG
TAATAGGATTATCCTATGGAAGAGGAGTGGATAATTTCTCAACTGAATTCAAGGTGATGATTTAATGGTTGGTGTCTCTTTTATTCCCCCCTTTGCTTTTGAAATGGCCAGTGAAATACTTTCGTTCTAAAGAGCAAGGCTTGTAAGGTTCCTTTG


>TRINITY_DN111556_c0_g1_i6 from sample A1 / Example unspliced isoform:
ATAGTGTATTATAACCAGGTTACATAGTGTCTATGTGGGGTTTTTGAGTGCAAGTGGATTTCATGCTTTTTTTTCTTGCACCTTCTGTTACATTTGATCTGCATATTCTGCGTTTTTTCTTTGGTGCGGCTTTGCTATCTATTCAGCCGAAGTAACAGACGTTCTTGACAGGAAATGTGCAAAACTGAACATCATCCAGA
CTTGTTTGCGAGAAATTTgttagttggtagtccgttttctcaaatttctccatgatttgtgagttctaaaaaaattacggagtctcagtctttcattcgaaattttaggtttgtctttcattggtttatgctgaagGGAAATCTCTGAAAATCGCTAAGTGGAGAGATCTGAAGCCCCCCAAACCCTATCTTGGTTACTA
TGCCTCGGTAAGTGAAAAGACGTTCGGTAAAACCCTAATGTTTTCAAACCCTTTTATTTATCTATCTATTTATTTTTGCAGGGGTGGCGCTATGCTTCCTCTCTACTGTTTTCTTAATTTATTTATTTTTGTCTGCAACATAACGATGTTGTTTTACTGTGA




Intron 2 GTAGTCCGTT ... GAAATTTTAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
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A1036.5120167



>TRINITY_DN43472_c0_g1_i7 from sample A6 / Example spliced isoform
TATAGTGTATTATAACCAGGTTACATAGTGTCTATGTGGGGTTTTTGAGTGCAAGTGGATTTCATGCTTTTTTTTCTTGCACCTTCTGTTACATTTGATCTGCATATTCTGCGTTTTTTCTTTGGTGCGGCTTTGCTATCTATTCAGCCGAAGTAACAGACGTTCTTGACAGGAAATGTGCAAAACTGAACATCATCCAG
ACTTGTTTGCGAGAAATTTGTTAGTTGGTTTGTCTTTCATTGGTTTATGCTGAAGGGAAATCTCTGAAAATCGCTAAGTGGAGAGATCTGAAGCCCCCCAAACCCTATCTTGGTTACTATGCCTCGGTATTATTGCGACTATTGCGATACTTATTTGACTCACGATTCGCCCTCAGTCAGAAAGCAGCATAATGCAGGGT
ACAAGCACAAGGCAAATGTTCGGGCATATTATCAACAATTTGAGGAGCAGCAAACTCAGAGTTTGATAGATCAGAGGGTCAAGGAACATCTCGGTCAGACAGCAGCTTTCCAGCAGCAAGTTGGTGCTGCTTTTCAGCAGCATCTTGCTTCTATGCAGGTTGGGCAGCAGAGGCCTCGTATTCCAATGTTGCCACCACCT
ACTTTGCCTGTACCAGGATCTACACAGCTACCAAATGGCTTGCAAATGTTACCTACTGTTCGTCCCCCTGTCCTACCTCGACCTACAATAATGCCTCCAGGCTATGGTCCATCTATGGGGACATCTCCAATGATGAGACCTCCTGGTGCAGCGGTTACCTCACCTCCAGGTGTAGCACAGTCAAATGGCTTGCCAAGGCC
ACCTACCCTGACTCCTCCAGTTTCTACAGGAGTAACACTAGCGGCATCTACATCATCACCGATGTCAAATGTCCTTACATCTAATCCACCGAATTCTGGTCCTTCTGGTACATATCAAAACCAGCAACAAAATTCTATTCCTACAAGTGGAGCTTATGGAACATACAACTATGCAGCAGCCCCAACTGGTTTTTCTCAAC
AGAGTACATCAGTGACCCCCCCGAATCCTACCTATGGAACTCAAACTTCCTAGAGTATCTTCATTTCCAGCTTATTATGCTGATTCTACTCTGACACGACCTTCAGCTGCAACTCCTGATATATGTATACTTTCTACTCAAGCTCCTATATTTGTATCCCAGTAATCAATCTGCTACTAATTTGGGTGTGACTTCATATG
GAAAACCTGCAGGCTACTGAAGCGGAAGGTTACATTGCGGAAGGTTACATTTATGATTTTGTCGCTAAGTAAGATCTTATTTATACTTTTGTTCTGCTATGGTTAGGTTTTGAATCTATTTTCTCTCCTATTAACAACTTAATGGCAAGCAAGCAGAGAAGGTATTTTTTGCATATATTATCTCAATTCTATTTTGATTG
TTTTACAAAAGCTTTAGATACTGCAATAGATTCATAGAATCCAAAGGTAATAGGATTATCCTATGGAAGAGGAGTGGATAATTTCTCAGCTGAATTCAAGGTGATGATTTAATGGTTGGTGTCTCTTTTATTTCCCCCTTTGCTTTTCAAATGGCCAGTGAAATACTTTCGTTCTAAAGAGCAAGGCTTGTAAGGTTCCT
TTGGACAATACTCTGAAGGTTACATTGCAGAAGGTTACGTTTGTGATTTTGCTGCTAAGTAAGATCTTATTTATACTTTTGTTCTGCCATGGTTAGGTTTTGAATACATTTTCTCTCCTATTAACAATTTAATGGCAAGCAAGCAGAGAAGGTATTTTTTTGCATATTTATCTCAATTCTATTCTGATTGTTTTACAAGA
GCTTTAGATACTGCGATAGATTCATAGAATCCAAAGGTAATAGGATTATCCTATGGAAGAGGAGTGGATAATTTCTCAGCTGAATTCAAGGTGATGATTTAATGGTTGGTGTCTCTTTTATTCCCCCCTTTGCTTTTGAAATGGCCAGTGAAATACTTTCGTTCTAAAGAGCAAGGCTTGTAAGGTTCCTTTGAACAATA
CTCGAGGTAAAATAGTATTTCAATTATACATGTGAACTATTTTCAGGGGAAGAATAAAAACCATAAACTTTTTTATGGGTAAGCTGGTATATATTTTATTCTTCCATTAATGATCCAAGCAAGGAATGCCG


>TRINITY_DN43472_c0_g1_i3 from sample A6 / Example unspliced isoform:
TATAGTGTATTATAACCAGGTTACATAGTGTCTATGTGGGGTTTTTGAGTGCAAGTGGATTTCATGCTTTTTTTTCTTGCACCTTCTGTTACATTTGATCTGCATATTCTGCGTTTTTTCTTTGGTGCGGCTTTGCTATCTATTCAGCCGAAGTAACAGACGTTCTTGACAGGAAATGTGCAAAACTGAACATCATCCAG
ACTTGTTTGCGAGAAATTTGTTAGTTGgtagtccgttttctcaaatttctccatgatttgtgagttctaaaaaaattacggagtctcagtctttcattcgaaattttagGTTTGTCTTTCATTGGTTTATGCTGAAGGGAAATCTCTGAAAATCGCTAAGTGGAGAGATCTGAAGCCCCCCAAACCCTATCTTGGTTACT
ATGCCTCGGTATTATTGCGACTATTGCGATACTTATTTGACTCACGATTCGCCCTCAGTCAGAAAGCAGCATAATGCAGGGTACAAGCACAAGGCAAATGTTCGGGCATATTATCAACAATTTGAGGAGCAGCAAACTCAGAGTTTGATAGATCAGAGGGTCAAGGAACATCTCGGTCAGACAGCAGCTTTCCAGCAGCA
AGTTGGTGCTGCTTTTCAGCAGCATCTTGCTTCTATGCAGGTTGGGCAGCAGAGGCCTCGTATTCCAATGTTGCCACCACCTACTTTGCCTGTACCAGGATCTACACAGCTACCAAATGGCTTGCAAATGTTACCTACTGTTCGTCCCCCTGTCCTACCTCGACCTACAATAATGCCTCCAGGCTATGGTCCATCTATGG
GGACATCTCCAATGATGAGACCTCCTGGTGCAGCGGTTACCTCACCTCCAGGTGTAGCACAGTCAAATGGCTTGCCAAGGCCACCTACCCTGACTCCTCCAGTTTCTACAGGAGTAACACTAGCGGCATCTACATCATCACCGATGTCAAATGTCCTTACATCTAATCCACCGAATTCTGGTCCTTCTGGTACATATCAA
AACCAGCAACAAAATTCTATTCCTACAAGTGGAGCTTATGGAACATACAACTATGCAGCAGCCCCAACTGGTTTTTCTCAACAGAGTACATCAGTGACCCCCCCGAATCCTACCTATGGAACTCAAACTTCCTAGAGTATCTTCATTTCCAGCTTATTATGCTGATTCTACTCTGACACGACCTTCAGCTGCAACTCCTG
ATATATGTATACTTTCTACTCAAGCTCCTATATTTGTATCCCAGTAATCAATCTGCTACTAATTTGGGTGTGACTTCATATGGAAAACCTGCAGGCTACTGAAGCGGAAGGTTACATTGCGGAAGGTTACATTTATGATTTTGTCGCTAAGTAAGATCTTATTTATACTTTTGTTCTGCTATGGTTAGGTTTTGAATCTA
TTTTCTCTCCTATTAACAACTTAATGGCAAGCAAGCAGAGAAGGTATTTTTTGCATATATTATCTCAATTCTATTTTGATTGTTTTACAAAAGCTTTAGATACTGCAATAGATTCATAGAATCCAAAGGTAATAGGATTATCCTATGGAAGAGGAGTGGATAATTTCTCAGCTGAATTCAAGGTGATGATTTAATGGTTG
GTGTCTCTTTTATTTCCCCCTTTGCTTTTCAAATGGCCAGTGAAATACTTTCGTTCTAAAGAGCAAGGCTTGTAAGGTTCCTTTGGACAATACTCTGAAGGTTACATTGCAGAAGGTTACGTTTGTGATTTTGCTGCTAAGTAAGATCTTATTTATACTTTTGTTCTGCCATGGTTAGGTTTTGAATACATTTTCTCTCC
TATTAACAATTTAATGGCAAGCAAGCAGAGAAGGTATTTTTTTGCATATTTATCTCAATTCTATTCTGATTGTTTTACAAGAGCTTTAGATACTGCGATAGATTCATAGAATCCAAAGGTAATAGGATTATCCTATGGAAGAGGAGTGGATAATTTCTCAGCTGAATTCAAGGTGATGATTTAATGGTTGGTGTCTCTTT
TATTCCCCCCTTTGCTTTTGAAATGGCCAGTGAAATACTTTCGTTCTAAAGAGCAAGGCTTGTAAGGTTCCTTTGAACAATACTCGAGGTAAAATAGTATTTCAATTATACATGTGAACTATTTTCAGGGGAAGAATAAAAACCATAAACTTTTTTATGGGTAAGCTGGTATATATTTTATTCTTCCATTAATGATCCAA
GCAAGGAATGCCG




Intron 3 GTTAGTTGGT ... TATGCTGAAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A131.711494
A232.0818107
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A537.51057
A636482331
A732.8421724
A838.7815712
A938.46563337
A1034.78451830



>TRINITY_DN43472_c0_g1_i6 from sample A6 / Example spliced isoform
TATAGTGTATTATAACCAGGTTACATAGTGTCTATGTGGGGTTTTTGAGTGCAAGTGGATTTCATGCTTTTTTTTCTTGCACCTTCTGTTACATTTGATCTGCATATTCTGCGTTTTTTCTTTGGTGCGGCTTTGCTATCTATTCAGCCGAAGTAACAGACGTTCTTGACAGGAAATGTGCAAAACTGAACATCATCCAG
ACTTGTTTGCGAGAAATTTGGAAATCTCTGAAAATCGCTAAGTGGAGAGATCTGAAGCCCCCCAAACCCTATCTTGGTTACTATGCCTCGGTATTATTGCGACTATTGCGATACTTATTTGACTCACGATTCGCCCTCAGTCAGAAAGCAGCATAATGCAGGGTACAAGCACAAGGCAAATGTTCGGGCATATTATCAAC
AATTTGAGGAGCAGCAAACTCAGAGTTTGATAGATCAGAGGGTCAAGGAACATCTCGGTCAGACAGCAGCTTTCCAGCAGCAAGTTGGTGCTGCTTTTCAGCAGCATCTTGCTTCTATGCAGGTTGGGCAGCAGAGGCCTCGTATTCCAATGTTGCCACCACCTACTTTGCCTGTACCAGGATCTACACAGCTACCAAAT
GGCTTGCAAATGTTACCTACTGTTCGTCCCCCTGTCCTACCTCGACCTACAATAATGCCTCCAGGCTATGGTCCATCTATGGGGACATCTCCAATGATGAGACCTCCTGGTGCAGCGGTTACCTCACCTCCAGGTGTAGCACAGTCAAATGGCTTGCCAAGGCCACCTACCCTGACTCCTCCAGTTTCTACAGGAGTAAC
ACTAGCGGCATCTACATCATCACCGATGTCAAATGTCCTTACATCTAATCCACCGAATTCTGGTCCTTCTGGTACATATCAAAACCAGCAACAAAATTCTATTCCTACAAGTGGAGCTTATGGAACATACAACTATGCAGCAGCCCCAACTGGTTTTTCTCAACAGAGTACATCAGTGACCCCCCCGAATCCTACCTATG
GAACTCAAACTTCCTAGAGTATCTTCATTTCCAGCTTATTATGCTGATTCTACTCTGACACGACCTTCAGCTGCAACTCCTGATATATGTATACTTTCTACTCAAGCTCCTATATTTGTATCCCAGTAATCAATCTGCTACTAATTTGGGTGTGACTTCATATGGAAAACCTGCAGGCTACTGAAGCGGAAGGTTACATT
GCGGAAGGTTACATTTATGATTTTGTCGCTAAGTAAGATCTTATTTATACTTTTGTTCTGCTATGGTTAGGTTTTGAATCTATTTTCTCTCCTATTAACAACTTAATGGCAAGCAAGCAGAGAAGGTATTTTTTGCATATATTATCTCAATTCTATTTTGATTGTTTTACAAAAGCTTTAGATACTGCAATAGATTCATA
GAATCCAAAGGTAATAGGATTATCCTATGGAAGAGGAGTGGATAATTTCTCAGCTGAATTCAAGGTGATGATTTAATGGTTGGTGTCTCTTTTATTTCCCCCTTTGCTTTTCAAATGGCCAGTGAAATACTTTCGTTCTAAAGAGCAAGGCTTGTAAGGTTCCTTTGGACAATACTCTGAAGGTTACATTGCAGAAGGTT
ACGTTTGTGATTTTGCTGCTAAGTAAGATCTTATTTATACTTTTGTTCTGCCATGGTTAGGTTTTGAATACATTTTCTCTCCTATTAACAATTTAATGGCAAGCAAGCAGAGAAGGTATTTTTTTGCATATTTATCTCAATTCTATTCTGATTGTTTTACAAGAGCTTTAGATACTGCGATAGATTCATAGAATCCAAAG
GTAATAGGATTATCCTATGGAAGAGGAGTGGATAATTTCTCAGCTGAATTCAAGGTGATGATTTAATGGTTGGTGTCTCTTTTATTCCCCCCTTTGCTTTTGAAATGGCCAGTGAAATACTTTCGTTCTAAAGAGCAAGGCTTGTAAGGTTCCTTTGAACAATACTCGAGGTAAAATAGTATTTCAATTATACATGTGAA
CTATTTTCAGGGGAAGAATAAAAACCATAAACTTTTTTATGGGTAAGCTGGTATATATTTTATTCTTCCATTAATGATCCAAGCAAGGAATGCCG


>TRINITY_DN43472_c0_g1_i7 from sample A6 / Example unspliced isoform:
TATAGTGTATTATAACCAGGTTACATAGTGTCTATGTGGGGTTTTTGAGTGCAAGTGGATTTCATGCTTTTTTTTCTTGCACCTTCTGTTACATTTGATCTGCATATTCTGCGTTTTTTCTTTGGTGCGGCTTTGCTATCTATTCAGCCGAAGTAACAGACGTTCTTGACAGGAAATGTGCAAAACTGAACATCATCCAG
ACTTGTTTGCGAGAAATTTgttagttggtttgtctttcattggtttatgctgaagGGAAATCTCTGAAAATCGCTAAGTGGAGAGATCTGAAGCCCCCCAAACCCTATCTTGGTTACTATGCCTCGGTATTATTGCGACTATTGCGATACTTATTTGACTCACGATTCGCCCTCAGTCAGAAAGCAGCATAATGCAGGGT
ACAAGCACAAGGCAAATGTTCGGGCATATTATCAACAATTTGAGGAGCAGCAAACTCAGAGTTTGATAGATCAGAGGGTCAAGGAACATCTCGGTCAGACAGCAGCTTTCCAGCAGCAAGTTGGTGCTGCTTTTCAGCAGCATCTTGCTTCTATGCAGGTTGGGCAGCAGAGGCCTCGTATTCCAATGTTGCCACCACCT
ACTTTGCCTGTACCAGGATCTACACAGCTACCAAATGGCTTGCAAATGTTACCTACTGTTCGTCCCCCTGTCCTACCTCGACCTACAATAATGCCTCCAGGCTATGGTCCATCTATGGGGACATCTCCAATGATGAGACCTCCTGGTGCAGCGGTTACCTCACCTCCAGGTGTAGCACAGTCAAATGGCTTGCCAAGGCC
ACCTACCCTGACTCCTCCAGTTTCTACAGGAGTAACACTAGCGGCATCTACATCATCACCGATGTCAAATGTCCTTACATCTAATCCACCGAATTCTGGTCCTTCTGGTACATATCAAAACCAGCAACAAAATTCTATTCCTACAAGTGGAGCTTATGGAACATACAACTATGCAGCAGCCCCAACTGGTTTTTCTCAAC
AGAGTACATCAGTGACCCCCCCGAATCCTACCTATGGAACTCAAACTTCCTAGAGTATCTTCATTTCCAGCTTATTATGCTGATTCTACTCTGACACGACCTTCAGCTGCAACTCCTGATATATGTATACTTTCTACTCAAGCTCCTATATTTGTATCCCAGTAATCAATCTGCTACTAATTTGGGTGTGACTTCATATG
GAAAACCTGCAGGCTACTGAAGCGGAAGGTTACATTGCGGAAGGTTACATTTATGATTTTGTCGCTAAGTAAGATCTTATTTATACTTTTGTTCTGCTATGGTTAGGTTTTGAATCTATTTTCTCTCCTATTAACAACTTAATGGCAAGCAAGCAGAGAAGGTATTTTTTGCATATATTATCTCAATTCTATTTTGATTG
TTTTACAAAAGCTTTAGATACTGCAATAGATTCATAGAATCCAAAGGTAATAGGATTATCCTATGGAAGAGGAGTGGATAATTTCTCAGCTGAATTCAAGGTGATGATTTAATGGTTGGTGTCTCTTTTATTTCCCCCTTTGCTTTTCAAATGGCCAGTGAAATACTTTCGTTCTAAAGAGCAAGGCTTGTAAGGTTCCT
TTGGACAATACTCTGAAGGTTACATTGCAGAAGGTTACGTTTGTGATTTTGCTGCTAAGTAAGATCTTATTTATACTTTTGTTCTGCCATGGTTAGGTTTTGAATACATTTTCTCTCCTATTAACAATTTAATGGCAAGCAAGCAGAGAAGGTATTTTTTTGCATATTTATCTCAATTCTATTCTGATTGTTTTACAAGA
GCTTTAGATACTGCGATAGATTCATAGAATCCAAAGGTAATAGGATTATCCTATGGAAGAGGAGTGGATAATTTCTCAGCTGAATTCAAGGTGATGATTTAATGGTTGGTGTCTCTTTTATTCCCCCCTTTGCTTTTGAAATGGCCAGTGAAATACTTTCGTTCTAAAGAGCAAGGCTTGTAAGGTTCCTTTGAACAATA
CTCGAGGTAAAATAGTATTTCAATTATACATGTGAACTATTTTCAGGGGAAGAATAAAAACCATAAACTTTTTTATGGGTAAGCTGGTATATATTTTATTCTTCCATTAATGATCCAAGCAAGGAATGCCG




Intron 4 GTATACTTTC ... AAACCTGCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A170.9792519
A264.171312
A360.9881411
A477.2751915
A540.5411114
A657.39495973
A757.52242936
A856.88475569
A963.27274152
A1058.82212931



>TRINITY_DN43472_c0_g1_i1 from sample A6 / Example spliced isoform
TATAGTGTATTATAACCAGGTTACATAGTGTCTATGTGGGGTTTTTGAGTGCAAGTGGATTTCATGCTTTTTTTTCTTGCACCTTCTGTTACATTTGATCTGCATATTCTGCGTTTTTTCTTTGGTGCGGCTTTGCTATCTATTCAGCCGAAGTAACAGACGTTCTTGACAGGAAATGTGCAAAACTGAACATCATCCAG
ACTTGTTTGCGAGAAATTTGTTAGTTGGTAGTCCGTTTTCTCAAATTTCTCCATGATTTGTGAGTTCTAAAAAAATTACGGAGTCTCAGTCTTTCATTCGAAATTTTAGGTTTGTCTTTCATTGGTTTATGCTGAAGGGAAATCTCTGAAAATCGCTAAGTGGAGAGATCTGAAGCCCCCCAAACCCTATCTTGGTTACT
ATGCCTCGGTATTATTGCGACTATTGCGATACTTATTTGACTCACGATTCGCCCTCAGTCAGAAAGCAGCATAATGCAGGGTACAAGCACAAGGCAAATGTTCGGGCATATTATCAACAATTTGAGGAGCAGCAAACTCAGAGTTTGATAGATCAGAGGGTCAAGGAACATCTCGGTCAGACAGCAGCTTTCCAGCAGCA
AGTTGGTGCTGCTTTTCAGCAGCATCTTGCTTCTATGCAGGTTGGGCAGCAGAGGCCTCGTATTCCAATGTTGCCACCACCTACTTTGCCTGTACCAGGATCTACACAGCTACCAAATGGCTTGCAAATGTTACCTACTGTTCGTCCCCCTGTCCTACCTCGACCTACAATAATGCCTCCAGGCTATGGTCCATCTATGG
GGACATCTCCAATGATGAGACCTCCTGGTGCAGCGGTTACCTCACCTCCAGGTGTAGCACAGTCAAATGGCTTGCCAAGGCCACCTACCCTGACTCCTCCAGTTTCTACAGGAGTAACACTAGCGGCATCTACATCATCACCGATGTCAAATGTCCTTACATCTAATCCACCGAATTCTGGTCCTTCTGGTACATATCAA
AACCAGCAACAAAATTCTATTCCTACAAGTGGAGCTTATGGAACATACAACTATGCAGCAGCCCCAACTGGTTTTTCTCAACAGAGTACATCAGTGACCCCCCCGAATCCTACCTATGGAACTCAAACTTCCTAGAGTATCTTCATTTCCAGCTTATTATGCTGATTCTACTCTGACACGACCTTCAGCTGCAACTCCTG

ATATAT
GCTACTGAAGCGGAAGGTTACATTGCGGAAGGTTACATTTATGATTTTGTCGCTAAGTAAGATCTTATTTATACTTTTGTTCTGCTATGGTTAGGTTTTGAATCTATTTTCTCTCCTATTAACAACTTAATGGCAAGCAAGCAGAGAAGGTATTTTTTGCATATATTATCTCAATTCTATTTTGATTGTTTTAC
AAAAGCTTTAGATACTGCAATAGATTCATAGAATCCAAAGGTAATAGGATTATCCTATGGAAGAGGAGTGGATAATTTCTCAGCTGAATTCAAGGTGATGATTTAATGGTTGGTGTCTCTTTTATTTCCCCCTTTGCTTTTCAAATGGCCAGTGAAATACTTTCGTTCTAAAGAGCAAGGCTTGTAAGGTTCCTTTGGAC
AATACTCTGAAGGTTACATTGCAGAAGGTTACGTTTGTGATTTTGCTGCTAAGTAAGATCTTATTTATACTTTTGTTCTGCCATGGTTAGGTTTTGAATACATTTTCTCTCCTATTAACAATTTAATGGCAAGCAAGCAGAGAAGGTATTTTTTTGCATATTTATCTCAATTCTATTCTGATTGTTTTACAAGAGCTTTA
GATACTGCGATAGATTCATAGAATCCAAAGGTAATAGGATTATCCTATGGAAGAGGAGTGGATAATTTCTCAGCTGAATTCAAGGTGATGATTTAATGGTTGGTGTCTCTTTTATTCCCCCCTTTGCTTTTGAAATGGCCAGTGAAATACTTTCGTTCTAAAGAGCAAGGCTTGTAAGGTTCCTTTGAACAATACTCGAG
GTAAAATAGTATTTCAATTATACATGTGAACTATTTTCAGGGGAAGAATAAAAACCATAAACTTTTTTATGGGTAAGCTGGTATATATTTTATTCTTCCATTAATGATCCAAGCAAGGAATGCCG


>TRINITY_DN43472_c0_g1_i6 from sample A6 / Example unspliced isoform:
TATAGTGTATTATAACCAGGTTACATAGTGTCTATGTGGGGTTTTTGAGTGCAAGTGGATTTCATGCTTTTTTTTCTTGCACCTTCTGTTACATTTGATCTGCATATTCTGCGTTTTTTCTTTGGTGCGGCTTTGCTATCTATTCAGCCGAAGTAACAGACGTTCTTGACAGGAAATGTGCAAAACTGAACATCATCCAG
ACTTGTTTGCGAGAAATTTGGAAATCTCTGAAAATCGCTAAGTGGAGAGATCTGAAGCCCCCCAAACCCTATCTTGGTTACTATGCCTCGGTATTATTGCGACTATTGCGATACTTATTTGACTCACGATTCGCCCTCAGTCAGAAAGCAGCATAATGCAGGGTACAAGCACAAGGCAAATGTTCGGGCATATTATCAAC
AATTTGAGGAGCAGCAAACTCAGAGTTTGATAGATCAGAGGGTCAAGGAACATCTCGGTCAGACAGCAGCTTTCCAGCAGCAAGTTGGTGCTGCTTTTCAGCAGCATCTTGCTTCTATGCAGGTTGGGCAGCAGAGGCCTCGTATTCCAATGTTGCCACCACCTACTTTGCCTGTACCAGGATCTACACAGCTACCAAAT
GGCTTGCAAATGTTACCTACTGTTCGTCCCCCTGTCCTACCTCGACCTACAATAATGCCTCCAGGCTATGGTCCATCTATGGGGACATCTCCAATGATGAGACCTCCTGGTGCAGCGGTTACCTCACCTCCAGGTGTAGCACAGTCAAATGGCTTGCCAAGGCCACCTACCCTGACTCCTCCAGTTTCTACAGGAGTAAC
ACTAGCGGCATCTACATCATCACCGATGTCAAATGTCCTTACATCTAATCCACCGAATTCTGGTCCTTCTGGTACATATCAAAACCAGCAACAAAATTCTATTCCTACAAGTGGAGCTTATGGAACATACAACTATGCAGCAGCCCCAACTGGTTTTTCTCAACAGAGTACATCAGTGACCCCCCCGAATCCTACCTATG
GAACTCAAACTTCCTAGAGTATCTTCATTTCCAGCTTATTATGCTGATTCTACTCTGACACGACCTTCAGCTGCAACTCCTGATATATgtatactttctactcaagctcctatatttgtatcccagtaatcaatctgctactaatttgggtgtgacttcatatggaaaacctgcagGCTACTGAAGCGGAAGGTTACATT
GCGGAAGGTTACATTTATGATTTTGTCGCTAAGTAAGATCTTATTTATACTTTTGTTCTGCTATGGTTAGGTTTTGAATCTATTTTCTCTCCTATTAACAACTTAATGGCAAGCAAGCAGAGAAGGTATTTTTTGCATATATTATCTCAATTCTATTTTGATTGTTTTACAAAAGCTTTAGATACTGCAATAGATTCATA
GAATCCAAAGGTAATAGGATTATCCTATGGAAGAGGAGTGGATAATTTCTCAGCTGAATTCAAGGTGATGATTTAATGGTTGGTGTCTCTTTTATTTCCCCCTTTGCTTTTCAAATGGCCAGTGAAATACTTTCGTTCTAAAGAGCAAGGCTTGTAAGGTTCCTTTGGACAATACTCTGAAGGTTACATTGCAGAAGGTT
ACGTTTGTGATTTTGCTGCTAAGTAAGATCTTATTTATACTTTTGTTCTGCCATGGTTAGGTTTTGAATACATTTTCTCTCCTATTAACAATTTAATGGCAAGCAAGCAGAGAAGGTATTTTTTTGCATATTTATCTCAATTCTATTCTGATTGTTTTACAAGAGCTTTAGATACTGCGATAGATTCATAGAATCCAAAG
GTAATAGGATTATCCTATGGAAGAGGAGTGGATAATTTCTCAGCTGAATTCAAGGTGATGATTTAATGGTTGGTGTCTCTTTTATTCCCCCCTTTGCTTTTGAAATGGCCAGTGAAATACTTTCGTTCTAAAGAGCAAGGCTTGTAAGGTTCCTTTGAACAATACTCGAGGTAAAATAGTATTTCAATTATACATGTGAA
CTATTTTCAGGGGAAGAATAAAAACCATAAACTTTTTTATGGGTAAGCTGGTATATATTTTATTCTTCCATTAATGATCCAAGCAAGGAATGCCG




Intron 5 GTAAGCAGTA ... TACTGTGAAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A130.1721431
A223.68581218
A324.47711523
A425.61611021
A521.953289
A628.4132030127
A72930634125
A826.12353283
A928.0732838128
A1030.9630137135



>TRINITY_DN44053_c0_g2_i7 from sample A8 / Example spliced isoform
AAACCATCCAAACATTTTAAATTAAAACGACCGAAAGAGTTTTTCGTCACATGTTAAAAAAAACAACTCTCGATGCTTCTTCATCTGTTCGAGCTTTCTAGGGTTTAAAAATACTTTCAATGCTTCATCTGTTCCGAGCTCTCAAGGGTTTCACCGAGCATCTGAAAATTTTATTCCTTTTCAGAGCTGAAAGTTTCTGA
GATTTGCTTGCAAGCCTTGGTTCTGCAAATAGAGTTCCTTCTCCGGCTGAAGCAAACAAGGTAACTTTGTTGAAGCAAAAAGAGTTTCGCAGAAACGGATAGGGTTTAAGGCGAAGGAAAAACTCAGAAGAGCGGTGATCGGAAAGATATCATTATTTTGGTTGGCATCATGCCAAGGTACTATTGCGACTATTGCGATA
CTTATCTGACTCACGACTCGCCTTCAGTCAGAAAGCAACACAATGCAGGGTACAAGCACAAGGCAAATGTTCGTGCATATTATCAACAATTTGAAGAGCAGCAAACTCAAAGCTTGATAGATCAGAGAGTCAAGGAACATCTTGGTCAGACAGCAGCTTTTCAGCAACAAGTTGGTGCTGCTTTTCAGCAGCATCTTGCT
GCTATGCAGGCTGGGCAACAGAGGCCTCGTATTCCTGTGTTGCCACCCCCAATTTTGCCTGGACCGGGATCTACACAGCTACCAAATGGCCAGCCATTGCTACCTACTGTTCGTCCACCTGTTCTACCACGACCTACAACCGGTCCTCCAGGGTACGGTGTATCTATGGGGATATCTCCGACGTTAAGACCTCCTGGTGC
GGCAGTTACATCACCACCGGGTGTATCACAGTCAAATGGTTTGCCAAGGCCGCCTACCCTGACTCCTCCAGTTCCCACCGGACTAAGGCCATCGACACCTACATCATCACCAATGTCTAATGGCCTTATGTCTACTCCACCTATTTCTGGTCCACCTGGTACGTACCAAAACCAACAGCAAAATTCTATTCCTACAAGTG
GAGCTTATGGAACTTATAACTATGCAGCTGCCCCAGTTAGTTTTCCTCAACAGAGTACATCAGCAGGGCTCCCAAATCCTACCTACACAACTCAAAATTCCTAAGTGTATAATCCCTAACAGCCTTTCTGCTCATTCTACTCCAACTCCAGCTTCAGCTGCAACTCTAGCTAGTTATATGTCGAGTGTACAGGCAATTCT
CAGAACTGCATTCTGTGGTAATTAATCTGCCTACCAATTTGGGTGGGAGTGAGACTTTGTTTGGAATAGGTACAGGCTTTTGAAGCTAAAGATCGCACCTTGTGGCCAAGCAAGATTTTGTTTTTGTTTCTCCATATACTTTTGTGATTCTATGGTTAGGTTTTGTATCCTTTTTTCCTATTAACAACTTAATTGCAACC
AAGCAGAGAGGGTGTTTAATGCATATATAATCTCAATTCCTTTTTGTTGACTTTATTTTAGAGCTTATATACAATAATGGACTGTTGTTTTATCTCTAGTACTTCAGTGTCCAAAAGTACTAGGATTCTGAAGAGGAATGCATAAATTTCAAGTTAATTCAAGGTGGTAGTTTCATGGTTAGTATCTCTTTTCTTTATGC
CTTGTTTCCTTTTATAATAGGCAGTGAAATATTTTAGTTTGAATTTAAGAGTCTAAATTTTGTACAAGAGTATGCTGGTAAATATTGTATTCCTCTGTTAATGATCCAATCAAGGAA


>TRINITY_DN44053_c0_g2_i4 from sample A8 / Example unspliced isoform:
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GATTTGCTTGCAAGCCTTGGTTCTGCAAATAGAGTTCCTTCTCCGGCTGAAGCAAACAAGGTAACTTTGTTGAAGCAAAAAGAGTTTCGCAGAAACGGATAGGGTTTAAGGCGAAGGAAAAACTCAGAAGAGCGGTGATCGGAAAGATATCAATACTCTGGTTGGCATCATGCCAAGgtaagcagtaagacgaaacgttt
ttaactcttcatttcactacggtttattttgtatttcaggtcttttccctgtgttcatgcgatcggttatttaatttgtcggtgatggttgaaattttggttttactgtgaag
GTACTATTGCGACTATTGCGATACTTATCTGACTCACGACTCGCCTTCAGTCAGAAAGCAACACAATGCAGGGTACAAGCACAAGGC
AAATGTTCGTGCATATTATCAACAATTTGAAGAGCAGCAAACTCAAAGCTTGATAGATCAGAGAGTCAAGGAACATCTTGGTCAGACAGCAGCTTTTCAGCAACAAGTTGGTGCTGCTTTTCAGCAGCATCTTGCTGCTATGCAGGCTGGGCAACAGAGGCCTCGTATTCCTGTGTTGCCACCCCCAATTTTGCCTGGAC
CGGGATCTACACAGCTACCAAATGGCCAGCCATTGCTACCTACTGTTCGTCCACCTGTTCTACCACGACCTACAACCGGTCCTCCAGGGTACGGTGTATCTATGGGGATATCTCCGACGTTAAGACCTCCTGGTGCGGCAGTTACATCACCACCGGGTGTATCACAGTCAAATGGTTTGCCAAGGCCGCCTACCCTGACT
CCTCCAGTTCCCACCGGACTAAGGCCATCGACACCTACATCATCACCAATGTCTAATGGCCTTATGTCTACTCCACCTATTTCTGGTCCACCTGGTACGTACCAAAACCAACAGCAAAATTCTATTCCTACAAGTGGAGCTTATGGAACTTATAACTATGCAGCTGCCCCAGTTAGTTTTCCTCAACAGAGTACATCAGC
AGGGCTCCCAAATCCTACCTACACAACTCAAAATTCCTAAGTGTATAATCCCTAACAGCCTTTCTGCTCATTCTACTCCAACTCCAGCTTCAGCTGCAACTCTAGCTAGTTATATGTCGAGTGTACAGGCAATTCTCAGAACTGCATTCTGTGGTAATTAATCTGCCTACCAATTTGGGTGGGAGTGAGACTTTGTTTGG
AATAGGTACAGGCTTTTGAAGCTAAAGATCGCACCTTGTGGCCAAGCAAGATTTTGTTTTTGTTTCTCCATATACTTTTGTGATTCTATGGTTAGGTTTTGTATCCTTTTTTCCTATTAACAACTTAATTGCAACCAAGCAGAGAGGGTGTTTAATGCATATATAATCTCAATTCCTTTTTGTTGACTTTATTTTAGAGC
TTATATACAATAATGGACTGTTGTTTTATCTCTAGTACTTCAGTGTCCAAAAGTACTAGGATTCTGAAGAGGAATGCATAAATTTCAAGTTAATTCAAGGTGGTAGTTTCATGGTTAGTATCTCTTTTCTTTATGCCTTGTTTCCTTTTATAATAGGCAGTGAAATATTTTAGTTTGAATTTAAGAGTCTAAATTTTGTA
CAAGAGTATGCTGGTAAATATTGTATTCCTCTGTTAATGATCCAATCAAGGAA




Intron 6 GTAGTCCGTT ... TATGCTGAAG

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>TRINITY_DN46563_c0_g2_i2 from sample A10 / Example spliced isoform
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GTTTGCGAGAAATTTGTTAGTTGGGAAATCTCTGAAAATCGCTAAGTGGAGAGATCTGAAGCCCCCCAAACCCTATCTTGGTTACTATGCCTCGGTATTATTGCGACTATTGCGATACTTATTTGACTCACGATTCGCCCTCAGTCAGAAAGCAGCATAATGCAGGGTACAAGCACAAGGCAAATGTTCGGGCATATTAT
CAACAATTTGAGGAGCAGCAAACTCAGAGTTTGATAGATCAGAGGGTCAAGGAACATCTCGGTCAGACAGCAGCTTTCCAGCAGCAAGTTGGTGCTGCTTTTCAGCAGCATCTTGCTTCTATGCAGGTTGGGCAGCAGAGGCCTCGTATTCCAATGTTGCCACCACCTACTTTGCCTGTACCAGGATCTACACAGCTACC
AAATGGCTTGCAAATGTTACCTACTGTTCGTCCCCCTGTCCTACCTCGACCTACAATAATGCCTCCAGGCTATGGTCCATCTATGGGGACATCTCCAATGATGAGACCTCCTGGTGCAGCGGTTACCTCACCTCCAGGTGTAGCACAGTCAAATGGCTTGCCAAGGCCACCTACCCTGACTCCTCCAGTTTCTACAGGAG
TAACACTAGCGGCATCTACATCATCACCGATGTCAAATGTCCTTACATCTAATCCACCGAATTCTGGTCCTTCTGGTACATATCAAAACCAGCAACAAAATTCTATTCCTACAAGTGGAGCTTATGGAACATACAACTATGCAGCAGCCCCAACTGGTTTTTCTCAACAGAGTACATCAGTGACCCCCCCGAATCCTACC
TATGGAACTCAAACTTCCTAGAGTATCTTCATTTCCAGCTTATTATGCTGATTCTACTCTGACACGACCTTCAGCTGCAACTCCTGATATATGCTACTGAAGCGGAAGGTTACATTGCGGAAGGTTACATTTATGATTTTGTCGCTAAGTAAGATCTTATTTATACTTTTGTTCTGCTATGGTTAGGTTTTGAATCTATT
TTCTCTCCTATTAACAACTTAATGGCAAGCAAGCAGAGAAGGTATTTTTTGCATATATTATCTCAATTCTATTTTGATTGTTTTACAAAAGCTTTAGATACTGCAATAGATTCATAGAATCCAAAGGTAATAGGATTATCCTATGGAAGAGGAGTGGATAATTTCTCAGCTGAATTCAAGGTGATGATTTAATGGTTGGT
GTCTCTTTTATTTCCCCCTTTGCTTTTCAAATGGCCAGTGAAATACTTTCGTTCTAAAGAGCAAGGCTTGTAAGGTTCCTTTGGACAATACTCTGAAGGTTACATTGCAGAAGGTTACGTTTGTGATTTTGCTGCTAAGTAAGATCTTATTTATACTTTTGTTCTGCCATGGTTAGGTTTTGAATACATTTTCTCTCCTA
TTAACAATTTAATGGCAAGCAAGCAGAGAAGGTATTTTTTTGCATATTTATCTCAATTCTATTCTGATTGTTTTACAAGAGCTTTAGATACTGCGATAGATTCATAGAATCCAAAGGTAATAGGATTATCCTATGGAAGAGGAGTGGATAATTTCTCAGCTGAATTCAAGGTGATGATTTAATGGTTGGTGTCTCTTTTA
TTCCCCCCTTTGCTTTTGAAATGGCCAGTGAAATACTTTCGTTCTAAAGAGCAAGGCTTGTAAGGTTCCTTTGGACAATACTCTGAAGGTTACATTGCAGAAGGTTACGTTTGTGATTTTGCTGCTAAGTAAGATCTTATTTATAC


>TRINITY_DN46563_c0_g2_i3 from sample A10 / Example unspliced isoform:
GTGTATTATAACCAGGTTACATAGTGTCTATGTGGGGTTTTTGAGTGCAAGTGGATTTCATGCTTTTTTTTCTTGCACCTTCTGTTACATTTGATCTGCATATTCTGCGTTTTTTCTTTGGTGCGGCTTTGCTATCTATTCAGCCGAAGTAACAGACGTTCTTGACAGGAAATGTGCAAAACTGAACATCATCCAGACTT
GTTTGCGAGAAATTTGTTAGTTGgtagtccgttttctcaaatttctccatgatttgtgagttctaaaaaaattacggagtctcagtctttcattcgaaattttaggtttgtctttcattggtttatgctgaagGGAAATCTCTGAAAATCGCTAAGTGGAGAGATCTGAAGCCCCCCAAACCCTATCTTGGTTACTATGC
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ATGTATACTTTCTACTCAAGCTCCTATATTTGTATCCCAGTAATCAATCTGCTACTAATTTGGGTGTGACTTCATATGGAAAACCTGCAGGCTACTGAAGCGGAAGGTTACATTGCGGAAGGTTACATTTATGATTTTGTCGCTAAGTAAGATCTTATTTATACTTTTGTTCTGCTATGGTTAGGTTTTGAATCTATTTT
CTCTCCTATTAACAACTTAATGGCAAGCAAGCAGAGAAGGTATTTTTTGCATATATTATCTCAATTCTATTTTGATTGTTTTACAAAAGCTTTAGATACTGCAATAGATTCATAGAATCCAAAGGTAATAGGATTATCCTATGGAAGAGGAGTGGATAATTTCTCAGCTGAATTCAAGGTGATGATTTAATGGTTGGTGT
CTCTTTTATTTCCCCCTTTGCTTTTCAAATGGCCAGTGAAATACTTTCGTTCTAAAGAGCAAGGCTTGTAAGGTTCCTTTGGACAATACTCTGAAGGTTACATTGCAGAAGGTTACGTTTGTGATTTTGCTGCTAAGTAAGATCTTATTTATACTTTTGTTCTGCCATGGTTAGGTTTTGAATACATTTTCTCTCCTATT
AACAATTTAATGGCAAGCAAGCAGAGAAGGTATTTTTTTGCATATTTATCTCAATTCTATTCTGATTGTTTTACAAGAGCTTTAGATACTGCGATAGATTCATAGAATCCAAAGGTAATAGGATTATCCTATGGAAGAGGAGTGGATAATTTCTCAGCTGAATTCAAGGTGATGATTTAATGGTTGGTGTCTCTTTTATT
CCCCCCTTTGCTTTTGAAATGGCCAGTGAAATACTTTCGTTCTAAAGAGCAAGGCTTGTAAGGTTCCTTTGGACAATACTCTGAAGGTTACATTGCAGAAGGTTACGTTTGTGATTTTGCTGCTAAGTAAGATCTTATTTATAC