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TCCATTTATTGATTCTGCTGTGCAATTCATGAAATATAATTTGAGGCCTCATACCTGGGGCGTCGGCCTAATCCAATCCAAAGCCTTTTATCAACAATTATAGCACGAGTTTTAATGAATTCAGCGGAACAATAGAACTAAAGAAGAGCGCTTCATCGCAGTGGAATGAATGAACGAATGGATGGATTAGTTCGGTTGAT
CGATGATATAGATTCATAGGCGCCCAAAAAGAGCAGACTCCACAACGCATCCAGTTCTAATGCCTTTGTTTTTGGATTGAGTTCTGTCGACACAAAGTATATTTTGTATAAAGGATAACACGTTTAATTGTAATCAATGATTAAAAATGCAACGGGTTGGATAGTTCCTATCGGTCTCTATCTCATCTTGTGCTAAAGAA
GAACATCTCTCAAAATCAAACCGGGGAGATGGCCTGGTATTGGGCCAGCCACTCTCTGAATATATTAGTATTAGTACGTATCAACATCAACATTTTCTACATTACTAACATCCGTGGGTTGCTGCCTTAATTTGTTAGAGTCCGATATTTGATTTTTGGAATACCTGGAGAATTGGGATTACTGGGCGAATTATGGTGTA
AACATCTTCTTTTGATGGGAGCCTCTGGCCATGATAGGCGGGTCATTTACTTCAAGATTTTCTTCCCATCCGTGCTTAAGAATGCAGTTCCTCACACTCTGGCAGGAGAGCAATGTTTGGGCAATACACGTCAAGTAGATATTTACTTTAGAACTTCTAGAGCATAAAGATAGTGCAGATCAGTCACTTATGATCTTAGT
AAAACATCTTTATAGAAACTGAGATAACTTTGGTTCATACTGATGGCCACTGAATCTAATGGTTCAATCCTCCTGGAGCCACCAGACACACGAGATGGCCTCACAGTGGTTTCACCATTACCTCAGGAAGGTGGTTTCCCAGATGGCGCCACAGTGGTTCCAACATTACCTCAGGAAGGCGATATCCCTCATTCTTCAAC
AGAACTGAATGATGAAAGTATGCAAATTTCACCCATCAAGAAAACTGTGTCGGATATAGAAGATGTTATGCAAGTTTCACCCATCAAGACAACTGTGTCGGATATAGAAGATGTCACGCAAATTTCACCTGTCAAGACAAGTGTGTCAGGTAAAGAAGATGTTATGCAAATTTCACCAATCAAGACAACTGTGTCAGATA
AAGAAGATGCTATGGACATTTCACCCAGAAAGACAACTGTGTCAGATATAGAAGATGTGAATTTGATTTCTTTGAAGCACCCCGACACAGCCATAGATAGTAAAGCAGAGGTTGGGTTACCTGAGAGCTTCTCTGATAAAAATATTGGCATGCAGCATGATATTCTTACAGGGGGGAATACTAAAGGGGTTAGTTCTTTA
TGCTCTGCTGACAAGGATGAAGAAGAAGACCGCATTGAACATGTTGCTAAGAAACTAAAAATTGGCAAGGACACTAAAATTGAGAAAAGAAAATCACTTGATGCTGCAATCAAGCAGACATCAGAGATGGTGCTTGTTTTAGCGGGGATGGGACGGATGAGAGCAGGCAGATGTCCAACAGACTTTGAAAGAGGACTTAT
GGCTGAGGCACGGCAAAAACTTGGATATTTGGCTGGAAAGCTGGCTCCCAAGGATTTAGTTTCAAAGGACGCTGTTGAAAGTATGATAGAAGATCTTGGGCTAAACAGAGTGAAGGACCCTACAAAAACTGCAGGTCCAAAGAAATCAATAGCGGAAAGAGCACTGGAAACCATGAAGAAGATTGAACAAGCAAGGCAAT
TGACAACAGGTGCACGCATGTTACCCACTTCATTGTCTAAAGCAGAACATGCCTCTGTTAATTCTACAAGCCATGATACCTCATCGGCATTGACAAATCAAGGAGCCCAACCAGCTCCAGTGAAACTGTCACCTTCAATTTCACAGCCTCTTCCAGGAGCGCAGTTATTCATGCCAGCTATTTCAGTAACACCACGGGCT
CCGATTGCACAATCTGTTTCAATTGAGCCAAGGGCTCCAGTTGTAACAACAGCTTCAGTTGTACGACAGTCCCCGGGTGGGCCAACATCGTTGGTTTCTCAGCAGGCTCAAGTTTCACTGATGGCACCAGTTGCATTGTTTGCTCCTGTTGCACAAGAAGCAGAGACAAAGCCACCAGTAGTTGCACTACCTACCACAAG
GGTGTTGCAACCTGTTCCAGAGGCACAGTCATTACTACTTCAAAAACCTGGTGAGGTCGTGAAGCCATTGGCAGCTCCTGGTAATATATCTGAAGAAAATACAAAACCTCTTTCAGCAGAGGCAGCAAGGGTTGTTGATAGGGAACATTCAAAGGATTCTGTAATTTCACCTTCTAAAGTTTTACCTCTTGTTCAGACCT
CAACATCGTCAGCTAATGTTGGCAAGGATGTTGATCTGCCTGCAAAAATATTAAGGAAGCTTGAGAATCTTCACACGACACAGACTTCTCAAGGTCCAAAGCCAGCTGAATCTCTTGCAATTCGTGCTAATCATGCTGACATTGCAAAAAATGTTCAGAAAATCTTGCAATCAAGGCCTCCAGATTTTCGTCAATGGGAA
CCTCCTTCAAAAGCCTATATGAGTGCTCCTGTATTGTGCCAAATCTGTAAGATTAATTCTATTGATATAGACAATATACTAGTTTGTGATGCTTGTGAGAAAGCAGTTCACTTAAAATGTGTTCAGTCGTACAACCAGAGGGGTATCCCGAAGGGTGACTGGCACTGCCCTAAGTGCTTGATTGCAAGCAATGGTCGTCC
ATTTCCTCCCAAGTATGGTCGTGTTGGTAAAAGTACTATTGTTCGGAAAATGCCAGCAAACAAGAGTAGCCATCAAGCTTCTCCTGTGAAGAAGATGGAAACTTCCCATCCAAAGTCTCCTCAGCACACAATTGTATCAAATGGCCTGAATACTGCTGCAGAGGTTCCTGTCCATGTTGATCTGAGTCGTAGCAACCACA
TGCATATCCTTCAGGAAACGGGAAACACAAGTGGAGACCTAAGGCCAAATTCTGAAATGTCTTTTGCTGAAAGCAGAAAGAATGCAGAAGATGTGTCAAATGAGCCTTTAAACCATGACTTTTCTCAACAAGCCCCTGAAGCGGTTAATGCTCTCTTAGTAAAGCTTCCAGAGAATGAGAATAACTGTAGCCCAAGTAAT
ACAGTTTCACAATTTCCCGATCAGCAGTCTGCCCATGCTGCTGCATTAGTGTCTGCCAGTCAAATTGGATCTAAAGGTTCTCAAACCAGGCAGCAATCAAGCATTAATTTGCATGATGTAAAGCAACCTCAAACCTCCAGTAATTCCCAGGGTGCAGACAGATTAAGATTGCAGCAAGAAGCTGGTGCATCTGGAACTCT
TTTACAGGACAATGAAATTCAGAGAGTACCTGCAGAATCAAAAGGGTTGCCTTTTTCTCAGTTCCCTATGGCAGGACAGAATTGTGCAGCTATAGGAAGTGACAGTTGTCAACAAGGTGAAGATGCCCAATGGAGAACATTGCACAAGAATTCTGTTCTTGATGCAAAATCATTATGTGAAGGTATTAATCAAAACAGAT
CTACTGAAGGGGAGCCGGAGGATGCCTATCGTGTTGAGTGGGTTGGTGATAAGTTGCAAGTTACAGACGGAAAAACATATTACCATTCATGCTCTGTAAGGGGTGTTCTATATAAGCTGCATGATTATGCTTTATTTCGCCCTGAAACTCCTAATGTTCCTCCGTACATTGCAAGGCTTCAGATTTTGTGGGAGGATGAT
AATACTGGGTCAAAGTGGGTACGGGTCAACTGGTGTTATTATCCCAATGATATCCCACAAATGGTCTGCCGTCCTACACCACCAGAAAAAGATGAGGTTTATGAATCAAATCATGGAGACAACAACCTGGTGGGTTCTATCCAAGGTCCTTGTCAGGTTCTGTCTTCTGAGAAGTACACGGAAGAGATTGAGAAGCGAAT
GGCACTTTTGAAGGGAGGGCATGAGATTACTGCATTTCATCCAGTCTTCCTGTGCAAGTGGTTTTATGATGCACAAAAGGGAAATTTCCACTCTGTTTGACATTGATGCAGTTGATACTTTTCCTCAGATTTCTCTTTAAGTTGTAATATACATTAGGGAATGATTGCAAGGTCTTACTCTCTGCAGCCAGGTAATTTGT
ACTCTAGACACCTGGATCATTTAATTGAGATATGATGAATACCACTGCTTAGTGCAAAATTCAGTGATGTGCTTCATTATGTCCAGTGTATCCTATAATTTCTTACACGTACCTTTTGTTATCCTTAATACAAGCAACTTCTCTTGGAGAAGGCAGTTTATTGTAAGTTATTCCTATTGTTTCATATCCGAGCTCTAATT
TTTTGATGGAATATAACAAACACTTACACATTCTGGAAGTAAAAAGGCAATCGTTTGGATGGTGGCATCATTTGATGATTTTCCACCTGAGGCCTCGTGCAATCTTCACTCAACAGATCTGAACAATCCAGTTGAGTATGTGCAGTGTTTCAAGACAGACTTTTGTAATTGTAAACCAAATTTGGAAAACTGTATTTTGG
ACTGTAAAAGAGAGTAAAATATTAACATCGGCCTCATGCTATGACATTGTAAATCATATCTATTGGTTATGCAATTGTACCAAGTTCATTATTCTACTGCTTAATTGTAATTAATGTTCTAAATCTGTAAACTAAGCAAGCAAGTTTCCAGGTCTGAAACCATCTTTCTAAGTCTCTGTCTAAGTCCAG


>TRINITY_DN44149_c0_g1_i6 from sample A10 / Example unspliced isoform:
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TCCATTTATTGATTCTGCTGTGCAATTCATGAAATATAATTTGAGGCCTCATACCTGGGGCGTCGGCCTAATCCAATCCAAAGCCTTTTATCAACAATTATAGCACGAGTTTTAATGAATTCAGCGGAACAATAGAACTAAAGAAGAGCGCTTCATCGCAGTGGAATGAATGAACGAATGGATGGATTAGTTCGGTTGAT
CGATGATATAGATTCATAGGCGCCCAAAAAGAGgtaaattctctctctctcctctccttacgcttaaaaacaattcaaaacttagttcatttcttcctgcactccacagttgcagggccattcgcgatcgggactcgaccccgagaccccccagtggcaatatcagaggtgggtatccggtgtttgttgctctctccttc
gctgcttctgcttctgtagcgtttgggtgcctgttatcttccctccactccgtacccatttctttgtctatgcaagttcatggattagtaggaattgggtattttcacaacatggctgaacatgttctttctttgtggtcacttgtagtgtacaccattactgttctcaaagatttctgttagatacagttacaaggcac
tgcgttccttatctccaatttgactgaaaaaattccgtttatgtcttccag
CAGACTCCACAACGCATCCAGTTCTAATGCCTTTGTTTTTGGATTGAGTTCTGTCGACACAAAGTATATTTTGTATAAAGGATAACACGTTTAATTGTAATCAATGATTAAAAATGCAACGGGTTGGATAGTTCCTATCGGTCTCTATC
TCATCTTGTGCTAAAGAAGAACATCTCTCAAAATCAAACCGGGGAGATGGCCTGGTATTGGGCCAGCCACTCTCTGAATATATTAGTATTAGTACGTATCAACATCAACATTTTCTACATTACTAACATCCGTGGGTTGCTGCCTTAATTTGTTAGAGTCCGATATTTGATTTTTGGAATACCTGGAGAATTGGGATTAC
TGGGCGAATTATGGTGTAAACATCTTCTTTTGATGGGAGCCTCTGGCCATGATAGGCGGGTCATTTACTTCAAGATTTTCTTCCCATCCGTGCTTAAGAATGCAGTTCCTCACACTCTGGCAGGAGAGCAATGTTTGGGCAATACACGTCAAGTAGATATTTACTTTAGAACTTCTAGAGCATAAAGATAGTGCAGATCA
GTCACTTATGATCTTAGTAAAACATCTTTATAGAAACTGAGATAACTTTGGTTCATACTGATGGCCACTGAATCTAATGGTTCAATCCTCCTGGAGCCACCAGACACACGAGATGGCCTCACAGTGGTTTCACCATTACCTCAGGAAGGTGGTTTCCCAGATGGCGCCACAGTGGTTCCAACATTACCTCAGGAAGGCGA
TATCCCTCATTCTTCAACAGAACTGAATGATGAAAGTATGCAAATTTCACCCATCAAGAAAACTGTGTCGGATATAGAAGATGTTATGCAAGTTTCACCCATCAAGACAACTGTGTCGGATATAGAAGATGTCACGCAAATTTCACCTGTCAAGACAAGTGTGTCAGGTAAAGAAGATGTTATGCAAATTTCACCAATCA
AGACAACTGTGTCAGATAAAGAAGATGCTATGGACATTTCACCCAGAAAGACAACTGTGTCAGATATAGAAGATGTGAATTTGATTTCTTTGAAGCACCCCGACACAGCCATAGATAGTAAAGCAGAGGTTGGGTTACCTGAGAGCTTCTCTGATAAAAATATTGGCATGCAGCATGATATTCTTACAGGGGGGAATACT
AAAGGGGTTAGTTCTTTATGCTCTGCTGACAAGGATGAAGAAGAAGACCGCATTGAACATGTTGCTAAGAAACTAAAAATTGGCAAGGACACTAAAATTGAGAAAAGAAAATCACTTGATGCTGCAATCAAGCAGACATCAGAGATGGTGCTTGTTTTAGCGGGGATGGGACGGATGAGAGCAGGCAGATGTCCAACAGA
CTTTGAAAGAGGACTTATGGCTGAGGCACGGCAAAAACTTGGATATTTGGCTGGAAAGCTGGCTCCCAAGGATTTAGTTTCAAAGGACGCTGTTGAAAGTATGATAGAAGATCTTGGGCTAAACAGAGTGAAGGACCCTACAAAAACTGCAGGTCCAAAGAAATCAATAGCGGAAAGAGCACTGGAAACCATGAAGAAGA
TTGAACAAGCAAGGCAATTGACAACAGGTGCACGCATGTTACCCACTTCATTGTCTAAAGCAGAACATGCCTCTGTTAATTCTACAAGCCATGATACCTCATCGGCATTGACAAATCAAGGAGCCCAACCAGCTCCAGTGAAACTGTCACCTTCAATTTCACAGCCTCTTCCAGGAGCGCAGTTATTCATGCCAGCTATT
TCAGTAACACCACGGGCTCCGATTGCACAATCTGTTTCAATTGAGCCAAGGGCTCCAGTTGTAACAACAGCTTCAGTTGTACGACAGTCCCCGGGTGGGCCAACATCGTTGGTTTCTCAGCAGGCTCAAGTTTCACTGATGGCACCAGTTGCATTGTTTGCTCCTGTTGCACAAGAAGCAGAGACAAAGCCACCAGTAGT
TGCACTACCTACCACAAGGGTGTTGCAACCTGTTCCAGAGGCACAGTCATTACTACTTCAAAAACCTGGTGAGGTCGTGAAGCCATTGGCAGCTCCTGGTAATATATCTGAAGAAAATACAAAACCTCTTTCAGCAGAGGCAGCAAGGGTTGTTGATAGGGAACATTCAAAGGATTCTGTAATTTCACCTTCTAAAGTTT
TACCTCTTGTTCAGACCTCAACATCGTCAGCTAATGTTGGCAAGGATGTTGATCTGCCTGCAAAAATATTAAGGAAGCTTGAGAATCTTCACACGACACAGACTTCTCAAGGTCCAAAGCCAGCTGAATCTCTTGCAATTCGTGCTAATCATGCTGACATTGCAAAAAATGTTCAGAAAATCTTGCAATCAAGGCCTCCA
GATTTTCGTCAATGGGAACCTCCTTCAAAAGCCTATATGAGTGCTCCTGTATTGTGCCAAATCTGTAAGATTAATTCTATTGATATAGACAATATACTAGTTTGTGATGCTTGTGAGAAAGCAGTTCACTTAAAATGTGTTCAGTCGTACAACCAGAGGGGTATCCCGAAGGGTGACTGGCACTGCCCTAAGTGCTTGAT
TGCAAGCAATGGTCGTCCATTTCCTCCCAAGTATGGTCGTGTTGGTAAAAGTACTATTGTTCGGAAAATGCCAGCAAACAAGAGTAGCCATCAAGCTTCTCCTGTGAAGAAGATGGAAACTTCCCATCCAAAGTCTCCTCAGCACACAATTGTATCAAATGGCCTGAATACTGCTGCAGAGGTTCCTGTCCATGTTGATC
TGAGTCGTAGCAACCACATGCATATCCTTCAGGAAACGGGAAACACAAGTGGAGACCTAAGGCCAAATTCTGAAATGTCTTTTGCTGAAAGCAGAAAGAATGCAGAAGATGTGTCAAATGAGCCTTTAAACCATGACTTTTCTCAACAAGCCCCTGAAGCGGTTAATGCTCTCTTAGTAAAGCTTCCAGAGAATGAGAAT
AACTGTAGCCCAAGTAATACAGTTTCACAATTTCCCGATCAGCAGTCTGCCCATGCTGCTGCATTAGTGTCTGCCAGTCAAATTGGATCTAAAGGTTCTCAAACCAGGCAGCAATCAAGCATTAATTTGCATGATGTAAAGCAACCTCAAACCTCCAGTAATTCCCAGGGTGCAGACAGATTAAGATTGCAGCAAGAAGC
TGGTGCATCTGGAACTCTTTTACAGGACAATGAAATTCAGAGAGTACCTGCAGAATCAAAAGGGTTGCCTTTTTCTCAGTTCCCTATGGCAGGACAGAATTGTGCAGCTATAGGAAGTGACAGTTGTCAACAAGGTGAAGATGCCCAATGGAGAACATTGCACAAGAATTCTGTTCTTGATGCAAAATCATTATGTGAAG
GTATTAATCAAAACAGATCTACTGAAGGGGAGCCGGAGGATGCCTATCGTGTTGAGTGGGTTGGTGATAAGTTGCAAGTTACAGACGGAAAAACATATTACCATTCATGCTCTGTAAGGGGTGTTCTATATAAGCTGCATGATTATGCTTTATTTCGCCCTGAAACTCCTAATGTTCCTCCGTACATTGCAAGGCTTCAG
ATTTTGTGGGAGGATGATAATACTGGGTCAAAGTGGGTACGGGTCAACTGGTGTTATTATCCCAATGATATCCCACAAATGGTCTGCCGTCCTACACCACCAGAAAAAGATGAGGTTTATGAATCAAATCATGGAGACAACAACCTGGTGGGTTCTATCCAAGGTCCTTGTCAGGTTCTGTCTTCTGAGAAGTACACGGA
AGAGATTGAGAAGCGAATGGCACTTTTGAAGGGAGGGCATGAGATTACTGCATTTCATCCAGTCTTCCTGTGCAAGTGGTTTTATGATGCACAAAAGGGAAATTTCCACTCTGTTTGACATTGATGCAGTTGATACTTTTCCTCAGATTTCTCTTTAAGTTGTAATATACATTAGGGAATGATTGCAAGGTCTTACTCTC
TGCAGCCAGGTAATTTGTACTCTAGACACCTGGATCATTTAATTGAGATATGATGAATACCACTGCTTAGTGCAAAATTCAGTGATGTGCTTCATTATGTCCAGTGTATCCTATAATTTCTTACACGTACCTTTTGTTATCCTTAATACAAGCAACTTCTCTTGGAGAAGGCAGTTTATTGTAAGTTATTCCTATTGTTT
CATATCCGAGCTCTAATTTTTTGATGGAATATAACAAACACTTACACATTCTGGAAGTAAAAAGGCAATCGTTTGGATGGTGGCATCATTTGATGATTTTCCACCTGAGGCCTCGTGCAATCTTCACTCAACAGATCTGAACAATCCAGTTGAGTATGTGCAGTGTTTCAAGACAGACTTTTGTAATTGTAAACCAAATT
TGGAAAACTGTATTTTGGACTGTAAAAGAGAGTAAAATATTAACATCGGCCTCATGCTATGACATTGTAAATCATATCTATTGGTTATGCAATTGTACCAAGTTCATTATTCTACTGCTTAATTGTAATTAATGTTCTAAATCTGTAAACTAAGCAAGCAAGTTTCCAGGTCTGAAACCATCTTTCTAAGTCTCTGTCTA
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Intron 2 GTAAATTCTC ... CACTCCACAG

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TTTTCCCTTAATAAATCTTGAATTTCGTCAGTCATCCATTTATTGATTCTGCTGTGCAATTCATGAAATATAATTTGAGGCCTCATACCTGGGGCGTCGGCCTAATCCAATCCAAAGCCTTTTATCAACAATTATAGCACGAGTTTTAATGAATTCAGCGGAACAATAGAACTAAAGAAGAGCGCTTCATCGCAGTGGAA
TGAATGAACGAATGGATGGATTAGTTCGGTTGATCGATGATATAGATTCATAGGCGCCCAAAAAGAGTTGCAGGGCCATTCGCGATCGGGACTCGACCCCGAGACCCCCCAGTGGCAATATCAGAGGTGGGTATCCGGTGTTTGTTGCTCTCTCCTTCGCTGCTTCTGCTTCTGTAGCGTTTGGGTGCCTGTTATCTTCC
CTCCACTCCGTACCCATTTCTTTGTCTATGCAAGTTCATGGATTAGTAGGAATTGGGTATTTTCACAACATGGCTGAACATGTTCTTTCTTTGTGGTCACTTGTAGTGTACACCATTACTGTTCTCAAAGATTTCTGTTAGATACAGTTACAAGGCACTGCGTTCCTTATCTCCAATTTGACTGAAAAAATTCCGTTTAT
GTCTTCCAGCAGACTCCACAACGCATCCAGTTCTAATGCCTTTGTTTTTGGATTGAGTTCTGTCGACACAAAGTATATTTTGTATAAAGGATAACACGTTTAATTGTAATCAATGATTAAAAATGCAACGGGTTGGATAGTTCCTATCGGTCTCTATCTCATCTTGTGCTAAAGAAGAACATCTCTCAAAATCAAACCGG
GGAGATGGCCTGGTATTGGGCCAGCCACTCTCTGAATATATTAGTATTAGTACGTATCAACATCAACATTTTCTACATTACTAACATCCGTGGGTTGCTGCCTTAATTTGTTAGAGTCCGATATTTGATTTTTGGAATACCTGGAGAATTGGGATTACTGGGCGAATTATGGTGTAAACATCTTCTTTTGATGGGAGCCT
CTGGCCATGATAGGCGGGTCATTTACTTCAAGATTTTCTTCCCATCCGTGCTTAAGAATGCAGTTCCTCACACTCTGGCAGGAGAGCAATGTTTGGGCAATACACGTCAAGTAGATATTTACTTTAGAACTTCTAGAGCATAAAGATAGTGCAGATCAGTCACTTATGATCTTAGTAAAACATCTTTATAGAAACTGAGA
TAACTTTGGTTCATACTGATGGCCACTGAATCTAATGGTTCAATCCTCCTGGAGCCACCAGACACACGAGATGGCCTCACAGTGGTTTCACCATTACCTCAGGAAGGTGGTTTCCCAGATGGCGCCACAGTGGTTCCAACATTACCTCAGGAAGGCGATATCCCTCATTCTTCAACAGAACTGAATGATGAAAGTATGCA
AATTTCACCCATCAAGAAAACTGTGTCGGATATAGAAGATGTTATGCAAGTTTCACCCATCAAGACAACTGTGTCGGATATAGAAGATGTCACGCAAATTTCACCTGTCAAGACAAGTGTGTCAGGTAAAGAAGATGTTATGCAAATTTCACCAATCAAGACAACTGTGTCAGATAAAGAAGATGCTATGGACATTTCAC
CCAGAAAGACAACTGTGTCAGATATAGAAGATGTGAATTTGATTTCTTTGAAGCACCCCGACACAGCCATAGATAGTAAAGCAGAGGTTGGGTTACCTGAGAGCTTCTCTGATAAAAATATTGGCATGCAGCATGATATTCTTACAGGGGGGAATACTAAAGGGGTTAGTTCTTTATGCTCTGCTGACAAGGATGAAGAA
GAAGACCGCATTGAACATGTTGCTAAGAAACTAAAAATTGGCAAGGACACTAAAATTGAGAAAAGAAAATCACTTGATGCTGCAATCAAGCAGACATCAGAGATGGTGCTTGTTTTAGCGGGGATGGGACGGATGAGAGCAGGCAGATGTCCAACAGACTTTGAAAGAGGACTTATGGCTGAGGCACGGCAAAAACTTGG
ATATTTGGCTGGAAAGCTGGCTCCCAAGGATTTAGTTTCAAAGGACGCTGTTGAAAGTATGATAGAAGATCTTGGGCTAAACAGAGTGAAGGACCCTACAAAAACTGCAGGTCCAAAGAAATCAATAGCGGAAAGAGCACTGGAAACCATGAAGAAGATTGAACAAGCAAGGCAATTGACAACAGGTGCACGCATGTTAC
CCACTTCATTGTCTAAAGCAGAACATGCCTCTGTTAATTCTACAAGCCATGATACCTCATCGGCATTGACAAATCAAGGAGCCCAACCAGCTCCAGTGAAACTGTCACCTTCAATTTCACAGCCTCTTCCAGGAGCGCAGTTATTCATGCCAGCTATTTCAGTAACACCACGGGCTCCGATTGCACAATCTGTTTCAATT
GAGCCAAGGGCTCCAGTTGTAACAACAGCTTCAGTTGTACGACAGTCCCCGGGTGGGCCAACATCGTTGGTTTCTCAGCAGGCTCAAGTTTCACTGATGGCACCAGTTGCATTGTTTGCTCCTGTTGCACAAGAAGCAGAGACAAAGCCACCAGTAGTTGCACTACCTACCACAAGGGTGTTGCAACCTGTTCCAGAGGC
ACAGTCATTACTACTTCAAAAACCTGGTGAGGTCGTGAAGCCATTGGCAGCTCCTGGTAATATATCTGAAGAAAATACAAAACCTCTTTCAGCAGAGGCAGCAAGGGTTGTTGATAGGGAACATTCAAAGGATTCTGTAATTTCACCTTCTAAAGTTTTACCTCTTGTTCAGACCTCAACATCGTCAGCTAATGTTGGCA
AGGATGTTGATCTGCCTGCAAAAATATTAAGGAAGCTTGAGAATCTTCACACGACACAGACTTCTCAAGGTCCAAAGCCAGCTGAATCTCTTGCAATTCGTGCTAATCATGCTGACATTGCAAAAAATGTTCAGAAAATCTTGCAATCAAGGCCTCCAGATTTTCGTCAATGGGAACCTCCTTCAAAAGCCTATATGAGT
GCTCCTGTATTGTGCCAAATCTGTAAGATTAATTCTATTGATATAGACAATATACTAGTTTGTGATGCTTGTGAGAAAGCAGTTCACTTAAAATGTGTTCAGTCGTACAACCAGAGGGGTATCCCGAAGGGTGACTGGCACTGCCCTAAGTGCTTGATTGCAAGCAATGGTCGTCCATTTCCTCCCAAGTATGGTCGTGT
TGGTAAAAGTACTATTGTTCGGAAAATGCCAGCAAACAAGAGTAGCCATCAAGCTTCTCCTGTGAAGAAGATGGAAACTTCCCATCCAAAGTCTCCTCAGCACACAATTGTATCAAATGGCCTGAATACTGCTGCAGAGGTTCCTGTCCATGTTGATCTGAGTCGTAGCAACCACATGCATATCCTTCAGGAAACGGGAA
ACACAAGTGGAGACCTAAGGCCAAATTCTGAAATGTCTTTTGCTGAAAGCAGAAAGAATGCAGAAGATGTGTCAAATGAGCCTTTAAACCATGACTTTTCTCAACAAGCCCCTGAAGCGGTTAATGCTCTCTTAGTAAAGCTTCCAGAGAATGAGAATAACTGTAGCCCAAGTAATACAGTTTCACAATTTCCCGATCAG
CAGTCTGCCCATGCTGCTGCAGTAGTGTCTGCCAGTCAAATTGGATCTAAAGGTTCTCAAACCAGGCAGCAATCAAGCATTAATTTGCATGATGTAAAGCAACCTCAAACCTCCAGTAATTCCCAGGGTGCAGACAGATTAAGATTGCAGCAAGAAGCTGGTGCATCTGGAACTCTTTTACAGGACAATGAAATTCAGAG
AGTACCTGCAGAATCAAAAGGGTTGCCTTTTTCTCAGTTCCCTATGGCAGGACAGAATTGTGCAGCTATAGGAAGTGACAGTTGTCAACAAGGTGAAGATGCCCAATGGAGAACATTGCACAAGAATTCTGTTCTTGATGCAAAATCATTATGTGAAGGTATTAATCAAAACAGATCTACTGAAGGGGAGCCGGAGGATG
CCTATCGTGTTGAGTGGGTTGGTGATAAGTTGCAAGTTACAGACGGAAAAACATATTACCATTCATGCTCTGTAAGGGGTGTTCTATATAAGCTGCATGATTATGCTTTATTTCGCCCTGAAACTCCTAATGTTCCTCCGTACATTGCAAGGCTTCAGATTTTGTGGGAGGATGATAATACTGGGTCAAAGTGGGTACGG
GTCAACTGGTGTTATTATCCCAATGATATCCCACAAATGGTCTGCCGTCCTACACCACCAGAAAAAGATGAGGTTTATGAATCAAATCATGGAGACAACAACCTGGTGGGTTCTATCCAAGGTCCTTGTCAGGTTCTGTCTTCTGAGAAGTACACGGAAGAGATTGAGAAGCGAATGGCACTTTTGAAGGGAGGGCATGA
GATTACTGCATTTCATCCAGTCTTCCTGTGCAAGTGGTTTTATGATGCACAAAAGGGAAATTTCCACTCTGTTTGACATTGATGCAGTTGATACTTTTCCTCAGATTTCTCTTTAAGTTGTAATATACATTAGGGAATGATTGCAAGGTCTTACTCTCTGCAGCCAGGTAATTTGTACTCTAGACACCTGGATCATTTAA
TTGAGATATGATGAATACCACTGCTTAGTGCAAAATTCAGTGATGTGCTTCATTATGTCCAGTGTATCCTATAATTTCTTACACGTACCTTTTGTTATCCTTAATACAAGCAACTTCTCTTGGAGAAGGCAGTTTATTGTAAGTTATTCCTATTGTTTCATATCCGAGCTCTAATTTTTTGATGGAATATAACAAACACT
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>TRINITY_DN124632_c1_g1_i21 from sample A1 / Example unspliced isoform:
GGCGGGATAGTCAAATCAACAACATACTTGGAGACAACAACCACTCTTCTTTCCCACTTAAATTTGCCAAAGCCACTCTTCCCCAACCCTTAGCCCACTCTTCCTCCAATGGAGAAGCCCTAATTATTTTCCCCCAAAAACTTAAAAACCCTTGTTGTGCTTCCCTATGTGCTTTTTTTAACCTTCTGCACAACTCTTCC
TTTTCCCTTAATAAATCTTGAATTTCGTCAGTCATCCATTTATTGATTCTGCTGTGCAATTCATGAAATATAATTTGAGGCCTCATACCTGGGGCGTCGGCCTAATCCAATCCAAAGCCTTTTATCAACAATTATAGCACGAGTTTTAATGAATTCAGCGGAACAATAGAACTAAAGAAGAGCGCTTCATCGCAGTGGAA
TGAATGAACGAATGGATGGATTAGTTCGGTTGATCGATGATATAGATTCATAGGCGCCCAAAAAGAGgtaaattctctctctctcctctccttacgcttaaaaacaattcaaaacttagttcatttcttcctgcactccacagTTGCAGGGCCATTCGCGATCGGGACTCGACCCCGAGACCCCCCAGTGGCAATATCAG
AGGTGGGTATCCGGTGTTTGTTGCTCTCTCCTTCGCTGCTTCTGCTTCTGTAGCGTTTGGGTGCCTGTTATCTTCCCTCCACTCCGTACCCATTTCTTTGTCTATGCAAGTTCATGGATTAGTAGGAATTGGGTATTTTCACAACATGGCTGAACATGTTCTTTCTTTGTGGTCACTTGTAGTGTACACCATTACTGTTC
TCAAAGATTTCTGTTAGATACAGTTACAAGGCACTGCGTTCCTTATCTCCAATTTGACTGAAAAAATTCCGTTTATGTCTTCCAGCAGACTCCACAACGCATCCAGTTCTAATGCCTTTGTTTTTGGATTGAGTTCTGTCGACACAAAGTATATTTTGTATAAAGGATAACACGTTTAATTGTAATCAATGATTAAAAAT
GCAACGGGTTGGATAGTTCCTATCGGTCTCTATCTCATCTTGTGCTAAAGAAGAACATCTCTCAAAATCAAACCGGGGAGATGGCCTGGTATTGGGCCAGCCACTCTCTGAATATATTAGTATTAGTACGTATCAACATCAACATTTTCTACATTACTAACATCCGTGGGTTGCTGCCTTAATTTGTTAGAGTCCGATAT
TTGATTTTTGGAATACCTGGAGAATTGGGATTACTGGGCGAATTATGGTGTAAACATCTTCTTTTGATGGGAGCCTCTGGCCATGATAGGCGGGTCATTTACTTCAAGATTTTCTTCCCATCCGTGCTTAAGAATGCAGTTCCTCACACTCTGGCAGGAGAGCAATGTTTGGGCAATACACGTCAAGTAGATATTTACTT
TAGAACTTCTAGAGCATAAAGATAGTGCAGATCAGTCACTTATGATCTTAGTAAAACATCTTTATAGAAACTGAGATAACTTTGGTTCATACTGATGGCCACTGAATCTAATGGTTCAATCCTCCTGGAGCCACCAGACACACGAGATGGCCTCACAGTGGTTTCACCATTACCTCAGGAAGGTGGTTTCCCAGATGGCG
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GGTAAAGAAGATGTTATGCAAATTTCACCAATCAAGACAACTGTGTCAGATAAAGAAGATGCTATGGACATTTCACCCAGAAAGACAACTGTGTCAGATATAGAAGATGTGAATTTGATTTCTTTGAAGCACCCCGACACAGCCATAGATAGTAAAGCAGAGGTTGGGTTACCTGAGAGCTTCTCTGATAAAAATATTGG
CATGCAGCATGATATTCTTACAGGGGGGAATACTAAAGGGGTTAGTTCTTTATGCTCTGCTGACAAGGATGAAGAAGAAGACCGCATTGAACATGTTGCTAAGAAACTAAAAATTGGCAAGGACACTAAAATTGAGAAAAGAAAATCACTTGATGCTGCAATCAAGCAGACATCAGAGATGGTGCTTGTTTTAGCGGGGA
TGGGACGGATGAGAGCAGGCAGATGTCCAACAGACTTTGAAAGAGGACTTATGGCTGAGGCACGGCAAAAACTTGGATATTTGGCTGGAAAGCTGGCTCCCAAGGATTTAGTTTCAAAGGACGCTGTTGAAAGTATGATAGAAGATCTTGGGCTAAACAGAGTGAAGGACCCTACAAAAACTGCAGGTCCAAAGAAATCA
ATAGCGGAAAGAGCACTGGAAACCATGAAGAAGATTGAACAAGCAAGGCAATTGACAACAGGTGCACGCATGTTACCCACTTCATTGTCTAAAGCAGAACATGCCTCTGTTAATTCTACAAGCCATGATACCTCATCGGCATTGACAAATCAAGGAGCCCAACCAGCTCCAGTGAAACTGTCACCTTCAATTTCACAGCC
TCTTCCAGGAGCGCAGTTATTCATGCCAGCTATTTCAGTAACACCACGGGCTCCGATTGCACAATCTGTTTCAATTGAGCCAAGGGCTCCAGTTGTAACAACAGCTTCAGTTGTACGACAGTCCCCGGGTGGGCCAACATCGTTGGTTTCTCAGCAGGCTCAAGTTTCACTGATGGCACCAGTTGCATTGTTTGCTCCTG
TTGCACAAGAAGCAGAGACAAAGCCACCAGTAGTTGCACTACCTACCACAAGGGTGTTGCAACCTGTTCCAGAGGCACAGTCATTACTACTTCAAAAACCTGGTGAGGTCGTGAAGCCATTGGCAGCTCCTGGTAATATATCTGAAGAAAATACAAAACCTCTTTCAGCAGAGGCAGCAAGGGTTGTTGATAGGGAACAT
TCAAAGGATTCTGTAATTTCACCTTCTAAAGTTTTACCTCTTGTTCAGACCTCAACATCGTCAGCTAATGTTGGCAAGGATGTTGATCTGCCTGCAAAAATATTAAGGAAGCTTGAGAATCTTCACACGACACAGACTTCTCAAGGTCCAAAGCCAGCTGAATCTCTTGCAATTCGTGCTAATCATGCTGACATTGCAAA
AAATGTTCAGAAAATCTTGCAATCAAGGCCTCCAGATTTTCGTCAATGGGAACCTCCTTCAAAAGCCTATATGAGTGCTCCTGTATTGTGCCAAATCTGTAAGATTAATTCTATTGATATAGACAATATACTAGTTTGTGATGCTTGTGAGAAAGCAGTTCACTTAAAATGTGTTCAGTCGTACAACCAGAGGGGTATCC
CGAAGGGTGACTGGCACTGCCCTAAGTGCTTGATTGCAAGCAATGGTCGTCCATTTCCTCCCAAGTATGGTCGTGTTGGTAAAAGTACTATTGTTCGGAAAATGCCAGCAAACAAGAGTAGCCATCAAGCTTCTCCTGTGAAGAAGATGGAAACTTCCCATCCAAAGTCTCCTCAGCACACAATTGTATCAAATGGCCTG
AATACTGCTGCAGAGGTTCCTGTCCATGTTGATCTGAGTCGTAGCAACCACATGCATATCCTTCAGGAAACGGGAAACACAAGTGGAGACCTAAGGCCAAATTCTGAAATGTCTTTTGCTGAAAGCAGAAAGAATGCAGAAGATGTGTCAAATGAGCCTTTAAACCATGACTTTTCTCAACAAGCCCCTGAAGCGGTTAA
TGCTCTCTTAGTAAAGCTTCCAGAGAATGAGAATAACTGTAGCCCAAGTAATACAGTTTCACAATTTCCCGATCAGCAGTCTGCCCATGCTGCTGCAGTAGTGTCTGCCAGTCAAATTGGATCTAAAGGTTCTCAAACCAGGCAGCAATCAAGCATTAATTTGCATGATGTAAAGCAACCTCAAACCTCCAGTAATTCCC
AGGGTGCAGACAGATTAAGATTGCAGCAAGAAGCTGGTGCATCTGGAACTCTTTTACAGGACAATGAAATTCAGAGAGTACCTGCAGAATCAAAAGGGTTGCCTTTTTCTCAGTTCCCTATGGCAGGACAGAATTGTGCAGCTATAGGAAGTGACAGTTGTCAACAAGGTGAAGATGCCCAATGGAGAACATTGCACAAG
AATTCTGTTCTTGATGCAAAATCATTATGTGAAGGTATTAATCAAAACAGATCTACTGAAGGGGAGCCGGAGGATGCCTATCGTGTTGAGTGGGTTGGTGATAAGTTGCAAGTTACAGACGGAAAAACATATTACCATTCATGCTCTGTAAGGGGTGTTCTATATAAGCTGCATGATTATGCTTTATTTCGCCCTGAAAC
TCCTAATGTTCCTCCGTACATTGCAAGGCTTCAGATTTTGTGGGAGGATGATAATACTGGGTCAAAGTGGGTACGGGTCAACTGGTGTTATTATCCCAATGATATCCCACAAATGGTCTGCCGTCCTACACCACCAGAAAAAGATGAGGTTTATGAATCAAATCATGGAGACAACAACCTGGTGGGTTCTATCCAAGGTC
CTTGTCAGGTTCTGTCTTCTGAGAAGTACACGGAAGAGATTGAGAAGCGAATGGCACTTTTGAAGGGAGGGCATGAGATTACTGCATTTCATCCAGTCTTCCTGTGCAAGTGGTTTTATGATGCACAAAAGGGAAATTTCCACTCTGTTTGACATTGATGCAGTTGATACTTTTCCTCAGATTTCTCTTTAAGTTGTAAT
ATACATTAGGGAATGATTGCAAGGTCTTACTCTCTGCAGCCAGGTAATTTGTACTCTAGACACCTGGATCATTTAATTGAGATATGATGAATACCACTGCTTAGTGCAAAATTCAGTGATGTGCTTCATTATGTCCAGTGTATCCTATAATTTCTTACACGTACCTTTTGTTATCCTTAATACAAGCAACTTCTCTTGGA
GAAGGCAGTTTATTGTAAGTTATTCCTATTGTTTCATATCCGAGCTCTAATTTTTTGATGGAATATAACAAACACTTACACATTCTGGAAGTAAAAAGGCAATCGTTTGGATGGTGGCATCATTTGATGATTTTCCACCTGAGGCCTCGTGCAATCTTCACTCAACAGATCTGAACAATCCAGTTGAGTATGTGCAGTGT
TTCAAGACAGACTTTTGTAATTGTAAACCAAATTTGGAAAACTGTATTTTGGACTGTAAAAGAGAGTAAAATATTAACATCGGCCTCATGCTATGACATTGTAAATCATATCTATTGGTTATGCAATTGTACCAAGTTCATTATTCTACTGCTTAATTGTAATTAATGTTCTAAATCTGTAAACTAAGCAAGCAAGTTTC
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TGAATGAACGAATGGATGGATTAGTTCGGTTGATCGATGATATAGATTCATAGGCGCCCAAAAAGAGAGTCCGATATTTGATTTTTGGAATACCTGGAGAATTGGGATTACTGGGCGAATTATGGTGTAAACATCTTCTTTTGATGGGAGCCTCTGGCCATGATAGGCGGGTCATTTACTTCAAGATTTTCTTCCCATCC
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AAGTTTCACCCATCAAGACAACTGTGTCGGATATAGAAGATGTCACGCAAATTTCACCTGTCAAGACAAGTGTGTCAGGTAAAGAAGATGTTATGCAAATTTCACCAATCAAGACAACTGTGTCAGATAAAGAAGATGCTATGGACATTTCACCCAGAAAGACAACTGTGTCAGATATAGAAGATGTGAATTTGATTTCT
TTGAAGCACCCCGACACAGCCATAGATAGTAAAGCAGAGGTTGGGTTACCTGAGAGCTTCTCTGATAAAAATATTGGCATGCAGCATGATATTCTTACAGGGGGGAATACTAAAGGGGTTAGTTCTTTATGCTCTGCTGACAAGGATGAAGAAGAAGACCGCATTGAACATGTTGCTAAGAAACTAAAAATTGGCAAGGA
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>TRINITY_DN124632_c1_g1_i21 from sample A1 / Example unspliced isoform:
GGCGGGATAGTCAAATCAACAACATACTTGGAGACAACAACCACTCTTCTTTCCCACTTAAATTTGCCAAAGCCACTCTTCCCCAACCCTTAGCCCACTCTTCCTCCAATGGAGAAGCCCTAATTATTTTCCCCCAAAAACTTAAAAACCCTTGTTGTGCTTCCCTATGTGCTTTTTTTAACCTTCTGCACAACTCTTCC
TTTTCCCTTAATAAATCTTGAATTTCGTCAGTCATCCATTTATTGATTCTGCTGTGCAATTCATGAAATATAATTTGAGGCCTCATACCTGGGGCGTCGGCCTAATCCAATCCAAAGCCTTTTATCAACAATTATAGCACGAGTTTTAATGAATTCAGCGGAACAATAGAACTAAAGAAGAGCGCTTCATCGCAGTGGAA
TGAATGAACGAATGGATGGATTAGTTCGGTTGATCGATGATATAGATTCATAGGCGCCCAAAAAGAGgtaaattctctctctctcctctccttacgcttaaaaacaattcaaaacttagttcatttcttcctgcactccacagttgcagggccattcgcgatcgggactcgaccccgagaccccccagtggcaatatcag
aggtgggtatccggtgtttgttgctctctccttcgctgcttctgcttctgtagcgtttgggtgcctgttatcttccctccactccgtacccatttctttgtctatgcaagttcatggattagtaggaattgggtattttcacaacatggctgaacatgttctttctttgtggtcacttgtagtgtacaccattactgttc
tcaaagatttctgttagatacagttacaaggcactgcgttccttatctccaatttgactgaaaaaattccgtttatgtcttccagcagactccacaacgcatccagttctaatgcctttgtttttggattgagttctgtcgacacaaagtatattttgtataaaggataacacgtttaattgtaatcaatgattaaaaat
gcaacgggttggatagttcctatcggtctctatctcatcttgtgctaaagaagaacatctctcaaaatcaaaccggggagatggcctggtattgggccagccactctctgaatatattagtattagtacgtatcaacatcaacattttctacattactaacatccgtgggttgctgccttaatttgttag
AGTCCGATAT
TTGATTTTTGGAATACCTGGAGAATTGGGATTACTGGGCGAATTATGGTGTAAACATCTTCTTTTGATGGGAGCCTCTGGCCATGATAGGCGGGTCATTTACTTCAAGATTTTCTTCCCATCCGTGCTTAAGAATGCAGTTCCTCACACTCTGGCAGGAGAGCAATGTTTGGGCAATACACGTCAAGTAGATATTTACTT
TAGAACTTCTAGAGCATAAAGATAGTGCAGATCAGTCACTTATGATCTTAGTAAAACATCTTTATAGAAACTGAGATAACTTTGGTTCATACTGATGGCCACTGAATCTAATGGTTCAATCCTCCTGGAGCCACCAGACACACGAGATGGCCTCACAGTGGTTTCACCATTACCTCAGGAAGGTGGTTTCCCAGATGGCG
CCACAGTGGTTCCAACATTACCTCAGGAAGGCGATATCCCTCATTCTTCAACAGAACTGAATGATGAAAGTATGCAAATTTCACCCATCAAGAAAACTGTGTCGGATATAGAAGATGTTATGCAAGTTTCACCCATCAAGACAACTGTGTCGGATATAGAAGATGTCACGCAAATTTCACCTGTCAAGACAAGTGTGTCA
GGTAAAGAAGATGTTATGCAAATTTCACCAATCAAGACAACTGTGTCAGATAAAGAAGATGCTATGGACATTTCACCCAGAAAGACAACTGTGTCAGATATAGAAGATGTGAATTTGATTTCTTTGAAGCACCCCGACACAGCCATAGATAGTAAAGCAGAGGTTGGGTTACCTGAGAGCTTCTCTGATAAAAATATTGG
CATGCAGCATGATATTCTTACAGGGGGGAATACTAAAGGGGTTAGTTCTTTATGCTCTGCTGACAAGGATGAAGAAGAAGACCGCATTGAACATGTTGCTAAGAAACTAAAAATTGGCAAGGACACTAAAATTGAGAAAAGAAAATCACTTGATGCTGCAATCAAGCAGACATCAGAGATGGTGCTTGTTTTAGCGGGGA
TGGGACGGATGAGAGCAGGCAGATGTCCAACAGACTTTGAAAGAGGACTTATGGCTGAGGCACGGCAAAAACTTGGATATTTGGCTGGAAAGCTGGCTCCCAAGGATTTAGTTTCAAAGGACGCTGTTGAAAGTATGATAGAAGATCTTGGGCTAAACAGAGTGAAGGACCCTACAAAAACTGCAGGTCCAAAGAAATCA
ATAGCGGAAAGAGCACTGGAAACCATGAAGAAGATTGAACAAGCAAGGCAATTGACAACAGGTGCACGCATGTTACCCACTTCATTGTCTAAAGCAGAACATGCCTCTGTTAATTCTACAAGCCATGATACCTCATCGGCATTGACAAATCAAGGAGCCCAACCAGCTCCAGTGAAACTGTCACCTTCAATTTCACAGCC
TCTTCCAGGAGCGCAGTTATTCATGCCAGCTATTTCAGTAACACCACGGGCTCCGATTGCACAATCTGTTTCAATTGAGCCAAGGGCTCCAGTTGTAACAACAGCTTCAGTTGTACGACAGTCCCCGGGTGGGCCAACATCGTTGGTTTCTCAGCAGGCTCAAGTTTCACTGATGGCACCAGTTGCATTGTTTGCTCCTG
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TCAAAGGATTCTGTAATTTCACCTTCTAAAGTTTTACCTCTTGTTCAGACCTCAACATCGTCAGCTAATGTTGGCAAGGATGTTGATCTGCCTGCAAAAATATTAAGGAAGCTTGAGAATCTTCACACGACACAGACTTCTCAAGGTCCAAAGCCAGCTGAATCTCTTGCAATTCGTGCTAATCATGCTGACATTGCAAA
AAATGTTCAGAAAATCTTGCAATCAAGGCCTCCAGATTTTCGTCAATGGGAACCTCCTTCAAAAGCCTATATGAGTGCTCCTGTATTGTGCCAAATCTGTAAGATTAATTCTATTGATATAGACAATATACTAGTTTGTGATGCTTGTGAGAAAGCAGTTCACTTAAAATGTGTTCAGTCGTACAACCAGAGGGGTATCC
CGAAGGGTGACTGGCACTGCCCTAAGTGCTTGATTGCAAGCAATGGTCGTCCATTTCCTCCCAAGTATGGTCGTGTTGGTAAAAGTACTATTGTTCGGAAAATGCCAGCAAACAAGAGTAGCCATCAAGCTTCTCCTGTGAAGAAGATGGAAACTTCCCATCCAAAGTCTCCTCAGCACACAATTGTATCAAATGGCCTG
AATACTGCTGCAGAGGTTCCTGTCCATGTTGATCTGAGTCGTAGCAACCACATGCATATCCTTCAGGAAACGGGAAACACAAGTGGAGACCTAAGGCCAAATTCTGAAATGTCTTTTGCTGAAAGCAGAAAGAATGCAGAAGATGTGTCAAATGAGCCTTTAAACCATGACTTTTCTCAACAAGCCCCTGAAGCGGTTAA
TGCTCTCTTAGTAAAGCTTCCAGAGAATGAGAATAACTGTAGCCCAAGTAATACAGTTTCACAATTTCCCGATCAGCAGTCTGCCCATGCTGCTGCAGTAGTGTCTGCCAGTCAAATTGGATCTAAAGGTTCTCAAACCAGGCAGCAATCAAGCATTAATTTGCATGATGTAAAGCAACCTCAAACCTCCAGTAATTCCC
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AATTCTGTTCTTGATGCAAAATCATTATGTGAAGGTATTAATCAAAACAGATCTACTGAAGGGGAGCCGGAGGATGCCTATCGTGTTGAGTGGGTTGGTGATAAGTTGCAAGTTACAGACGGAAAAACATATTACCATTCATGCTCTGTAAGGGGTGTTCTATATAAGCTGCATGATTATGCTTTATTTCGCCCTGAAAC
TCCTAATGTTCCTCCGTACATTGCAAGGCTTCAGATTTTGTGGGAGGATGATAATACTGGGTCAAAGTGGGTACGGGTCAACTGGTGTTATTATCCCAATGATATCCCACAAATGGTCTGCCGTCCTACACCACCAGAAAAAGATGAGGTTTATGAATCAAATCATGGAGACAACAACCTGGTGGGTTCTATCCAAGGTC
CTTGTCAGGTTCTGTCTTCTGAGAAGTACACGGAAGAGATTGAGAAGCGAATGGCACTTTTGAAGGGAGGGCATGAGATTACTGCATTTCATCCAGTCTTCCTGTGCAAGTGGTTTTATGATGCACAAAAGGGAAATTTCCACTCTGTTTGACATTGATGCAGTTGATACTTTTCCTCAGATTTCTCTTTAAGTTGTAAT
ATACATTAGGGAATGATTGCAAGGTCTTACTCTCTGCAGCCAGGTAATTTGTACTCTAGACACCTGGATCATTTAATTGAGATATGATGAATACCACTGCTTAGTGCAAAATTCAGTGATGTGCTTCATTATGTCCAGTGTATCCTATAATTTCTTACACGTACCTTTTGTTATCCTTAATACAAGCAACTTCTCTTGGA
GAAGGCAGTTTATTGTAAGTTATTCCTATTGTTTCATATCCGAGCTCTAATTTTTTGATGGAATATAACAAACACTTACACATTCTGGAAGTAAAAAGGCAATCGTTTGGATGGTGGCATCATTTGATGATTTTCCACCTGAGGCCTCGTGCAATCTTCACTCAACAGATCTGAACAATCCAGTTGAGTATGTGCAGTGT
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CAGGTCTGAAA




Intron 4 GTGGTTTTAT ... CTGCAGCCAG

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>TRINITY_DN124632_c1_g1_i19 from sample A1 / Example spliced isoform
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TAGTTTGTGATGCTTGTGAGAAAGCAGTTCACTTAAAATGTGTTCAGTCGTACAACCAGAGGGGTATCCCGAAGGGTGACTGGCACTGCCCTAAGTGCTTGATTGCAAGCAATGGTCGTCCATTTCCTCCCAAGTATGGTCGTGTTGGTAAAAGTACTATTGTTCGGAAAATGCCAGCAAACAAGAGTAGCCATCAAGCT
TCTCCTGTGAAGAAGATGGAAACTTCCCATCCAAAGTCTCCTCAGCACACAATTGTATCAAATGGCCTGAATACTGCTGCAGAGGTTCCTGTCCATGTTGATCTGAGTCGTAGCAACCACATGCATATCCTTCAGGAAACGGGAAACACAAGTGGAGACCTAAGGCCAAATTCTGAAATGTCTTTTGCTGAAAGCAGAAA
GAATGCAGAAGATGTGTCAAATGAGCCTTTAAACCATGACTTTTCTCAACAAGCCCCTGAAGCGGTTAATGCTCTCTTAGTAAAGCTTCCAGAGAATGAGAATAACTGTAGCCCAAGTAATACAGTTTCACAATTTCCCGATCAGCAGTCTGCCCATGCTGCTGCAGTAGTGTCTGCCAGTCAAATTGGATCTAAAGGTT
CTCAAACCAGGCAGCAATCAAGCATTAATTTGCATGATGTAAAGCAACCTCAAACCTCCAGTAATTCCCAGGGTGCAGACAGATTAAGATTGCAGCAAGAAGCTGGTGCATCTGGAACTCTTTTACAGGACAATGAAATTCAGAGAGTACCTGCAGAATCAAAAGGGTTGCCTTTTTCTCAGTTCCCTATGGCAGGACAG
AATTGTGCAGCTATAGGAAGTGACAGTTGTCAACAAGGTGAAGATGCCCAATGGAGAACATTGCACAAGAATTCTGTTCTTGATGCAAAATCATTATGTGAAGGTATTAATCAAAACAGATCTACTGAAGGGGAGCCGGAGGATGCCTATCGTGTTGAGTGGGTTGGTGATAAGTTGCAAGTTACAGACGGAAAAACATA
TTACCATTCATGCTCTGTAAGGGGTGTTCTATATAAGCTGCATGATTATGCTTTATTTCGCCCTGAAACTCCTAATGTTCCTCCGTACATTGCAAGGCTTCAGATTTTGTGGGAGGATGATAATACTGGGTCAAAGTGGGTACGGGTCAACTGGTGTTATTATCCCAATGATATCCCACAAATGGTCTGCCGTCCTACAC
CACCAGAAAAAGATGAGGTTTATGAATCAAATCATGGAGACAACAACCTGGTGGGTTCTATCCAAGGTCCTTGTCAGGTTCTGTCTTCTGAGAAGTACACGGAAGAGATTGAGAAGCGAATGGCACTTTTGAAGGGAGGGCATGAGATTACTGCATTTCATCCAGTCTTCCTGTGCAAGTAATTTGTACTCTAGACACCT
GGATCATTTAATTGAGATATGATGAATACCACTGCTTAGTGCAAAATTCAGTGATGTGCTTCATTATGTCCAGTGTATCCTATAATTTCTTACACGTACCTTTTGTTATCCTTAATACAAGCAACTTCTCTTGGAGAAGGCAGTTTATTGTAAGTTATTCCTATTGTTTCATATCCGAGCTCTAATTTTTTGATGGAATA
TAACAAACACTTACACATTCTGGAAGTAAAAAGGCAATCGTTTGGATGGTGGCATCATTTGATGATTTTCCACCTGAGGCCTCGTGCAATCTTCACTCAACAGATCTGAACAATCCAGTTGAGTATGTGCAGTGTTTCAAGACAGACTTTTGTAATTGTAAACCAAATTTGGAAAACTGTATTTTGGACTGTAAAAGAGA
GTAAAATATTAACATCGGCCTCATGCTATGACATTGTAAATCATATCTATTGGTTATGCAATTGTACCAAGTTCATTATTCTACTGCTTAATTGTAATTAATGTTCTAAATCTGTAAACTAAGCAAGCAAGTTTCCAGGTCTGAAA


>TRINITY_DN124632_c1_g1_i3 from sample A1 / Example unspliced isoform:
GGCGGGATAGTCAAATCAACAACATACTTGGAGACAACAACCACTCTTCTTTCCCACTTAAATTTGCCAAAGCCACTCTTCCCCAACCCTTAGCCCACTCTTCCTCCAATGGAGAAGCCCTAATTATTTTCCCCCAAAAACTTAAAAACCCTTGTTGTGCTTCCCTATGTGCTTTTTTTAACCTTCTGCACAACTCTTCC
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TGAATGAACGAATGGATGGATTAGTTCGGTTGATCGATGATATAGATTCATAGGCGCCCAAAAAGAGTTGCAGGGCCATTCGCGATCGGGACTCGACCCCGAGACCCCCCAGTGGCAATATCAGAGGTGGGTATCCGGTGTTTGTTGCTCTCTCCTTCGCTGCTTCTGCTTCTGTAGCGTTTGGGTGCCTGTTATCTTCC
CTCCACTCCGTACCCATTTCTTTGTCTATGCAAGTTCATGGATTAGTAGGAATTGGGTATTTTCACAACATGGCTGAACATGTTCTTTCTTTGTGGTCACTTGTAGTGTACACCATTACTGTTCTCAAAGATTTCTGTTAGATACAGTTACAAGGCACTGCGTTCCTTATCTCCAATTTGACTGAAAAAATTCCGTTTAT
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CTGGCCATGATAGGCGGGTCATTTACTTCAAGATTTTCTTCCCATCCGTGCTTAAGAATGCAGTTCCTCACACTCTGGCAGGAGAGCAATGTTTGGGCAATACACGTCAAGTAGATATTTACTTTAGAACTTCTAGAGCATAAAGATAGTGCAGATCAGTCACTTATGATCTTAGTAAAACATCTTTATAGAAACTGAGA
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GAGCCAAGGGCTCCAGTTGTAACAACAGCTTCAGTTGTACGACAGTCCCCGGGTGGGCCAACATCGTTGGTTTCTCAGCAGGCTCAAGTTTCACTGATGGCACCAGTTGCATTGTTTGCTCCTGTTGCACAAGAAGCAGAGACAAAGCCACCAGTAGTTGCACTACCTACCACAAGGGTGTTGCAACCTGTTCCAGAGGC
ACAGTCATTACTACTTCAAAAACCTGGTGAGGTCGTGAAGCCATTGGCAGCTCCTGGTAATATATCTGAAGAAAATACAAAACCTCTTTCAGCAGAGGCAGCAAGGGTTGTTGATAGGGAACATTCAAAGGATTCTGTAATTTCACCTTCTAAAGTTTTACCTCTTGTTCAGACCTCAACATCGTCAGCTAATGTTGGCA
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AGTACCTGCAGAATCAAAAGGGTTGCCTTTTTCTCAGTTCCCTATGGCAGGACAGAATTGTGCAGCTATAGGAAGTGACAGTTGTCAACAAGGTGAAGATGCCCAATGGAGAACATTGCACAAGAATTCTGTTCTTGATGCAAAATCATTATGTGAAGGTATTAATCAAAACAGATCTACTGAAGGGGAGCCGGAGGATG
CCTATCGTGTTGAGTGGGTTGGTGATAAGTTGCAAGTTACAGACGGAAAAACATATTACCATTCATGCTCTGTAAGGGGTGTTCTATATAAGCTGCATGATTATGCTTTATTTCGCCCTGAAACTCCTAATGTTCCTCCGTACATTGCAAGGCTTCAGATTTTGTGGGAGGATGATAATACTGGGTCAAAGTGGGTACGG
GTCAACTGGTGTTATTATCCCAATGATATCCCACAAATGGTCTGCCGTCCTACACCACCAGAAAAAGATGAGGTTTATGAATCAAATCATGGAGACAACAACCTGGTGGGTTCTATCCAAGGTCCTTGTCAGGTTCTGTCTTCTGAGAAGTACACGGAAGAGATTGAGAAGCGAATGGCACTTTTGAAGGGAGGGCATGA
GATTACTGCATTTCATCCAGTCTTCCTGTGCAAgtggttttatgatgcacaaaagggaaatttccactctgtttgacattgatgcagttgatacttttcctcagatttctctttaagttgtaatatacattagggaatgattgcaaggtcttactctctgcagccagGTAATTTGTACTCTAGACACCTGGATCATTTAA
TTGAGATATGATGAATACCACTGCTTAGTGCAAAATTCAGTGATGTGCTTCATTATGTCCAGTGTATCCTATAATTTCTTACACGTACCTTTTGTTATCCTTAATACAAGCAACTTCTCTTGGAGAAGGCAGTTTATTGTAAGTTATTCCTATTGTTTCATATCCGAGCTCTAATTTTTTGATGGAATATAACAAACACT
TACACATTCTGGAAGTAAAAAGGCAATCGTTTGGATGGTGGCATCATTTGATGATTTTCCACCTGAGGCCTCGTGCAATCTTCACTCAACAGATCTGAACAATCCAGTTGAGTATGTGCAGTGTTTCAAGACAGACTTTTGTAATTGTAAACCAAATTTGGAAAACTGTATTTTGGACTGTAAAAGAGAGTAAAATATTA
ACATCGGCCTCATGCTATGACATTGTAAATCATATCTATTGGTTATGCAATTGTACCAAGTTCATTATTCTACTGCTTAATTGTAATTAATGTTCTAAATCTGTAAACTAAGCAAGCAAGTTTCCAGGTCTGAAA




Intron 5 GTGGGTATCC ... CTTCCAGCAG

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TTTTCCCTTAATAAATCTTGAATTTCGTCAGTCATCCATTTATTGATTCTGCTGTGCAATTCATGAAATATAATTTGAGGCCTCATACCTGGGGCGTCGGCCTAATCCAATCCAAAGCCTTTTATCAACAATTATAGCACGAGTTTTAATGAATTCAGCGGAACAATAGAACTAAAGAAGAGCGCTTCATCGCAGTGGAA
TGAATGAACGAATGGATGGATTAGTTCGGTTGATCGATGATATAGATTCATAGGCGCCCAAAAAGAGTTGCAGGGCCATTCGCGATCGGGACTCGACCCCGAGACCCCCCAGTGGCAATATCAGAGACTCCACAACGCATCCAGTTCTAATGCCTTTGTTTTTGGATTGAGTTCTGTCGACACAAAGTATATTTTGTATA
AAGGATAACACGTTTAATTGTAATCAATGATTAAAAATGCAACGGGTTGGATAGTTCCTATCGGTCTCTATCTCATCTTGTGCTAAAGAAGAACATCTCTCAAAATCAAACCGGGGAGATGGCCTGGTATTGGGCCAGCCACTCTCTGAATATATTAGTATTAGTACGTATCAACATCAACATTTTCTACATTACTAACA
TCCGTGGGTTGCTGCCTTAATTTGTTAGAGTCCGATATTTGATTTTTGGAATACCTGGAGAATTGGGATTACTGGGCGAATTATGGTGTAAACATCTTCTTTTGATGGGAGCCTCTGGCCATGATAGGCGGGTCATTTACTTCAAGATTTTCTTCCCATCCGTGCTTAAGAATGCAGTTCCTCACACTCTGGCAGGAGAG
CAATGTTTGGGCAATACACGTCAAGTAGATATTTACTTTAGAACTTCTAGAGCATAAAGATAGTGCAGATCAGTCACTTATGATCTTAGTAAAACATCTTTATAGAAACTGAGATAACTTTGGTTCATACTGATGGCCACTGAATCTAATGGTTCAATCCTCCTGGAGCCACCAGACACACGAGATGGCCTCACAGTGGT
TTCACCATTACCTCAGGAAGGTGGTTTCCCAGATGGCGCCACAGTGGTTCCAACATTACCTCAGGAAGGCGATATCCCTCATTCTTCAACAGAACTGAATGATGAAAGTATGCAAATTTCACCCATCAAGAAAACTGTGTCGGATATAGAAGATGTTATGCAAGTTTCACCCATCAAGACAACTGTGTCGGATATAGAAG
ATGTCACGCAAATTTCACCTGTCAAGACAAGTGTGTCAGGTAAAGAAGATGTTATGCAAATTTCACCAATCAAGACAACTGTGTCAGATAAAGAAGATGCTATGGACATTTCACCCAGAAAGACAACTGTGTCAGATATAGAAGATGTGAATTTGATTTCTTTGAAGCACCCCGACACAGCCATAGATAGTAAAGCAGAG
GTTGGGTTACCTGAGAGCTTCTCTGATAAAAATATTGGCATGCAGCATGATATTCTTACAGGGGGGAATACTAAAGGGGTTAGTTCTTTATGCTCTGCTGACAAGGATGAAGAAGAAGACCGCATTGAACATGTTGCTAAGAAACTAAAAATTGGCAAGGACACTAAAATTGAGAAAAGAAAATCACTTGATGCTGCAAT
CAAGCAGACATCAGAGATGGTGCTTGTTTTAGCGGGGATGGGACGGATGAGAGCAGGCAGATGTCCAACAGACTTTGAAAGAGGACTTATGGCTGAGGCACGGCAAAAACTTGGATATTTGGCTGGAAAGCTGGCTCCCAAGGATTTAGTTTCAAAGGACGCTGTTGAAAGTATGATAGAAGATCTTGGGCTAAACAGAG
TGAAGGACCCTACAAAAACTGCAGGTCCAAAGAAATCAATAGCGGAAAGAGCACTGGAAACCATGAAGAAGATTGAACAAGCAAGGCAATTGACAACAGGTGCACGCATGTTACCCACTTCATTGTCTAAAGCAGAACATGCCTCTGTTAATTCTACAAGCCATGATACCTCATCGGCATTGACAAATCAAGGAGCCCAA
CCAGCTCCAGTGAAACTGTCACCTTCAATTTCACAGCCTCTTCCAGGAGCGCAGTTATTCATGCCAGCTATTTCAGTAACACCACGGGCTCCGATTGCACAATCTGTTTCAATTGAGCCAAGGGCTCCAGTTGTAACAACAGCTTCAGTTGTACGACAGTCCCCGGGTGGGCCAACATCGTTGGTTTCTCAGCAGGCTCA
AGTTTCACTGATGGCACCAGTTGCATTGTTTGCTCCTGTTGCACAAGAAGCAGAGACAAAGCCACCAGTAGTTGCACTACCTACCACAAGGGTGTTGCAACCTGTTCCAGAGGCACAGTCATTACTACTTCAAAAACCTGGTGAGGTCGTGAAGCCATTGGCAGCTCCTGGTAATATATCTGAAGAAAATACAAAACCTC
TTTCAGCAGAGGCAGCAAGGGTTGTTGATAGGGAACATTCAAAGGATTCTGTAATTTCACCTTCTAAAGTTTTACCTCTTGTTCAGACCTCAACATCGTCAGCTAATGTTGGCAAGGATGTTGATCTGCCTGCAAAAATATTAAGGAAGCTTGAGAATCTTCACACGACACAGACTTCTCAAGGTCCAAAGCCAGCTGAA
TCTCTTGCAATTCGTGCTAATCATGCTGACATTGCAAAAAATGTTCAGAAAATCTTGCAATCAAGGCCTCCAGATTTTCGTCAATGGGAACCTCCTTCAAAAGCCTATATGAGTGCTCCTGTATTGTGCCAAATCTGTAAGATTAATTCTATTGATATAGACAATATACTAGTTTGTGATGCTTGTGAGAAAGCAGTTCA
CTTAAAATGTGTTCAGTCGTACAACCAGAGGGGTATCCCGAAGGGTGACTGGCACTGCCCTAAGTGCTTGATTGCAAGCAATGGTCGTCCATTTCCTCCCAAGTATGGTCGTGTTGGTAAAAGTACTATTGTTCGGAAAATGCCAGCAAACAAGAGTAGCCATCAAGCTTCTCCTGTGAAGAAGATGGAAACTTCCCATC
CAAAGTCTCCTCAGCACACAATTGTATCAAATGGCCTGAATACTGCTGCAGAGGTTCCTGTCCATGTTGATCTGAGTCGTAGCAACCACATGCATATCCTTCAGGAAACGGGAAACACAAGTGGAGACCTAAGGCCAAATTCTGAAATGTCTTTTGCTGAAAGCAGAAAGAATGCAGAAGATGTGTCAAATGAGCCTTTA
AACCATGACTTTTCTCAACAAGCCCCTGAAGCGGTTAATGCTCTCTTAGTAAAGCTTCCAGAGAATGAGAATAACTGTAGCCCAAGTAATACAGTTTCACAATTTCCCGATCAGCAGTCTGCCCATGCTGCTGCAGTAGTGTCTGCCAGTCAAATTGGATCTAAAGGTTCTCAAACCAGGCAGCAATCAAGCATTAATTT
GCATGATGTAAAGCAACCTCAAACCTCCAGTAATTCCCAGGGTGCAGACAGATTAAGATTGCAGCAAGAAGCTGGTGCATCTGGAACTCTTTTACAGGACAATGAAATTCAGAGAGTACCTGCAGAATCAAAAGGGTTGCCTTTTTCTCAGTTCCCTATGGCAGGACAGAATTGTGCAGCTATAGGAAGTGACAGTTGTC
AACAAGGTGAAGATGCCCAATGGAGAACATTGCACAAGAATTCTGTTCTTGATGCAAAATCATTATGTGAAGGTATTAATCAAAACAGATCTACTGAAGGGGAGCCGGAGGATGCCTATCGTGTTGAGTGGGTTGGTGATAAGTTGCAAGTTACAGACGGAAAAACATATTACCATTCATGCTCTGTAAGGGGTGTTCTA
TATAAGCTGCATGATTATGCTTTATTTCGCCCTGAAACTCCTAATGTTCCTCCGTACATTGCAAGGCTTCAGATTTTGTGGGAGGATGATAATACTGGGTCAAAGTGGGTACGGGTCAACTGGTGTTATTATCCCAATGATATCCCACAAATGGTCTGCCGTCCTACACCACCAGAAAAAGATGAGGTTTATGAATCAAA
TCATGGAGACAACAACCTGGTGGGTTCTATCCAAGGTCCTTGTCAGGTTCTGTCTTCTGAGAAGTACACGGAAGAGATTGAGAAGCGAATGGCACTTTTGAAGGGAGGGCATGAGATTACTGCATTTCATCCAGTCTTCCTGTGCAAGTGGTTTTATGATGCACAAAAGGGAAATTTCCACTCTGTTTGACATTGATGCA
GTTGATACTTTTCCTCAGATTTCTCTTTAAGTTGTAATATACATTAGGGAATGATTGCAAGGTCTTACTCTCTGCAGCCAGGTAATTTGTACTCTAGACACCTGGATCATTTAATTGAGATATGATGAATACCACTGCTTAGTGCAAAATTCAGTGATGTGCTTCATTATGTCCAGTGTATCCTATAATTTCTTACACGT
ACCTTTTGTTATCCTTAATACAAGCAACTTCTCTTGGAGAAGGCAGTTTATTGTAAGTTATTCCTATTGTTTCATATCCGAGCTCTAATTTTTTGATGGAATATAACAAACACTTACACATTCTGGAAGTAAAAAGGCAATCGTTTGGATGGTGGCATCATTTGATGATTTTCCACCTGAGGCCTCGTGCAATCTTCACT
CAACAGATCTGAACAATCCAGTTGAGTATGTGCAGTGTTTCAAGACAGACTTTTGTAATTGTAAACCAAATTTGGAAAACTGTATTTTGGACTGTAAAAGAGAGTAAAATATTAACATCGGCCTCATGCTATGACATTGTAAATCATATCTATTGGTTATGCAATTGTACCAAGTTCATTATTCTACTGCTTAATTGTAA
TTAATGTTCTAAATCTGTAAACTAAGCAAGCAAGTTTCCAGGTCTGAAA


>TRINITY_DN124632_c1_g1_i3 from sample A1 / Example unspliced isoform:
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TTTTCCCTTAATAAATCTTGAATTTCGTCAGTCATCCATTTATTGATTCTGCTGTGCAATTCATGAAATATAATTTGAGGCCTCATACCTGGGGCGTCGGCCTAATCCAATCCAAAGCCTTTTATCAACAATTATAGCACGAGTTTTAATGAATTCAGCGGAACAATAGAACTAAAGAAGAGCGCTTCATCGCAGTGGAA
TGAATGAACGAATGGATGGATTAGTTCGGTTGATCGATGATATAGATTCATAGGCGCCCAAAAAGAGTTGCAGGGCCATTCGCGATCGGGACTCGACCCCGAGACCCCCCAGTGGCAATATCAGAGgtgggtatccggtgtttgttgctctctccttcgctgcttctgcttctgtagcgtttgggtgcctgttatcttcc
ctccactccgtacccatttctttgtctatgcaagttcatggattagtaggaattgggtattttcacaacatggctgaacatgttctttctttgtggtcacttgtagtgtacaccattactgttctcaaagatttctgttagatacagttacaaggcactgcgttccttatctccaatttgactgaaaaaattccgtttat
gtcttccagcag
ACTCCACAACGCATCCAGTTCTAATGCCTTTGTTTTTGGATTGAGTTCTGTCGACACAAAGTATATTTTGTATAAAGGATAACACGTTTAATTGTAATCAATGATTAAAAATGCAACGGGTTGGATAGTTCCTATCGGTCTCTATCTCATCTTGTGCTAAAGAAGAACATCTCTCAAAATCAAACCGG
GGAGATGGCCTGGTATTGGGCCAGCCACTCTCTGAATATATTAGTATTAGTACGTATCAACATCAACATTTTCTACATTACTAACATCCGTGGGTTGCTGCCTTAATTTGTTAGAGTCCGATATTTGATTTTTGGAATACCTGGAGAATTGGGATTACTGGGCGAATTATGGTGTAAACATCTTCTTTTGATGGGAGCCT
CTGGCCATGATAGGCGGGTCATTTACTTCAAGATTTTCTTCCCATCCGTGCTTAAGAATGCAGTTCCTCACACTCTGGCAGGAGAGCAATGTTTGGGCAATACACGTCAAGTAGATATTTACTTTAGAACTTCTAGAGCATAAAGATAGTGCAGATCAGTCACTTATGATCTTAGTAAAACATCTTTATAGAAACTGAGA
TAACTTTGGTTCATACTGATGGCCACTGAATCTAATGGTTCAATCCTCCTGGAGCCACCAGACACACGAGATGGCCTCACAGTGGTTTCACCATTACCTCAGGAAGGTGGTTTCCCAGATGGCGCCACAGTGGTTCCAACATTACCTCAGGAAGGCGATATCCCTCATTCTTCAACAGAACTGAATGATGAAAGTATGCA
AATTTCACCCATCAAGAAAACTGTGTCGGATATAGAAGATGTTATGCAAGTTTCACCCATCAAGACAACTGTGTCGGATATAGAAGATGTCACGCAAATTTCACCTGTCAAGACAAGTGTGTCAGGTAAAGAAGATGTTATGCAAATTTCACCAATCAAGACAACTGTGTCAGATAAAGAAGATGCTATGGACATTTCAC
CCAGAAAGACAACTGTGTCAGATATAGAAGATGTGAATTTGATTTCTTTGAAGCACCCCGACACAGCCATAGATAGTAAAGCAGAGGTTGGGTTACCTGAGAGCTTCTCTGATAAAAATATTGGCATGCAGCATGATATTCTTACAGGGGGGAATACTAAAGGGGTTAGTTCTTTATGCTCTGCTGACAAGGATGAAGAA
GAAGACCGCATTGAACATGTTGCTAAGAAACTAAAAATTGGCAAGGACACTAAAATTGAGAAAAGAAAATCACTTGATGCTGCAATCAAGCAGACATCAGAGATGGTGCTTGTTTTAGCGGGGATGGGACGGATGAGAGCAGGCAGATGTCCAACAGACTTTGAAAGAGGACTTATGGCTGAGGCACGGCAAAAACTTGG
ATATTTGGCTGGAAAGCTGGCTCCCAAGGATTTAGTTTCAAAGGACGCTGTTGAAAGTATGATAGAAGATCTTGGGCTAAACAGAGTGAAGGACCCTACAAAAACTGCAGGTCCAAAGAAATCAATAGCGGAAAGAGCACTGGAAACCATGAAGAAGATTGAACAAGCAAGGCAATTGACAACAGGTGCACGCATGTTAC
CCACTTCATTGTCTAAAGCAGAACATGCCTCTGTTAATTCTACAAGCCATGATACCTCATCGGCATTGACAAATCAAGGAGCCCAACCAGCTCCAGTGAAACTGTCACCTTCAATTTCACAGCCTCTTCCAGGAGCGCAGTTATTCATGCCAGCTATTTCAGTAACACCACGGGCTCCGATTGCACAATCTGTTTCAATT
GAGCCAAGGGCTCCAGTTGTAACAACAGCTTCAGTTGTACGACAGTCCCCGGGTGGGCCAACATCGTTGGTTTCTCAGCAGGCTCAAGTTTCACTGATGGCACCAGTTGCATTGTTTGCTCCTGTTGCACAAGAAGCAGAGACAAAGCCACCAGTAGTTGCACTACCTACCACAAGGGTGTTGCAACCTGTTCCAGAGGC
ACAGTCATTACTACTTCAAAAACCTGGTGAGGTCGTGAAGCCATTGGCAGCTCCTGGTAATATATCTGAAGAAAATACAAAACCTCTTTCAGCAGAGGCAGCAAGGGTTGTTGATAGGGAACATTCAAAGGATTCTGTAATTTCACCTTCTAAAGTTTTACCTCTTGTTCAGACCTCAACATCGTCAGCTAATGTTGGCA
AGGATGTTGATCTGCCTGCAAAAATATTAAGGAAGCTTGAGAATCTTCACACGACACAGACTTCTCAAGGTCCAAAGCCAGCTGAATCTCTTGCAATTCGTGCTAATCATGCTGACATTGCAAAAAATGTTCAGAAAATCTTGCAATCAAGGCCTCCAGATTTTCGTCAATGGGAACCTCCTTCAAAAGCCTATATGAGT
GCTCCTGTATTGTGCCAAATCTGTAAGATTAATTCTATTGATATAGACAATATACTAGTTTGTGATGCTTGTGAGAAAGCAGTTCACTTAAAATGTGTTCAGTCGTACAACCAGAGGGGTATCCCGAAGGGTGACTGGCACTGCCCTAAGTGCTTGATTGCAAGCAATGGTCGTCCATTTCCTCCCAAGTATGGTCGTGT
TGGTAAAAGTACTATTGTTCGGAAAATGCCAGCAAACAAGAGTAGCCATCAAGCTTCTCCTGTGAAGAAGATGGAAACTTCCCATCCAAAGTCTCCTCAGCACACAATTGTATCAAATGGCCTGAATACTGCTGCAGAGGTTCCTGTCCATGTTGATCTGAGTCGTAGCAACCACATGCATATCCTTCAGGAAACGGGAA
ACACAAGTGGAGACCTAAGGCCAAATTCTGAAATGTCTTTTGCTGAAAGCAGAAAGAATGCAGAAGATGTGTCAAATGAGCCTTTAAACCATGACTTTTCTCAACAAGCCCCTGAAGCGGTTAATGCTCTCTTAGTAAAGCTTCCAGAGAATGAGAATAACTGTAGCCCAAGTAATACAGTTTCACAATTTCCCGATCAG
CAGTCTGCCCATGCTGCTGCAGTAGTGTCTGCCAGTCAAATTGGATCTAAAGGTTCTCAAACCAGGCAGCAATCAAGCATTAATTTGCATGATGTAAAGCAACCTCAAACCTCCAGTAATTCCCAGGGTGCAGACAGATTAAGATTGCAGCAAGAAGCTGGTGCATCTGGAACTCTTTTACAGGACAATGAAATTCAGAG
AGTACCTGCAGAATCAAAAGGGTTGCCTTTTTCTCAGTTCCCTATGGCAGGACAGAATTGTGCAGCTATAGGAAGTGACAGTTGTCAACAAGGTGAAGATGCCCAATGGAGAACATTGCACAAGAATTCTGTTCTTGATGCAAAATCATTATGTGAAGGTATTAATCAAAACAGATCTACTGAAGGGGAGCCGGAGGATG
CCTATCGTGTTGAGTGGGTTGGTGATAAGTTGCAAGTTACAGACGGAAAAACATATTACCATTCATGCTCTGTAAGGGGTGTTCTATATAAGCTGCATGATTATGCTTTATTTCGCCCTGAAACTCCTAATGTTCCTCCGTACATTGCAAGGCTTCAGATTTTGTGGGAGGATGATAATACTGGGTCAAAGTGGGTACGG
GTCAACTGGTGTTATTATCCCAATGATATCCCACAAATGGTCTGCCGTCCTACACCACCAGAAAAAGATGAGGTTTATGAATCAAATCATGGAGACAACAACCTGGTGGGTTCTATCCAAGGTCCTTGTCAGGTTCTGTCTTCTGAGAAGTACACGGAAGAGATTGAGAAGCGAATGGCACTTTTGAAGGGAGGGCATGA
GATTACTGCATTTCATCCAGTCTTCCTGTGCAAGTGGTTTTATGATGCACAAAAGGGAAATTTCCACTCTGTTTGACATTGATGCAGTTGATACTTTTCCTCAGATTTCTCTTTAAGTTGTAATATACATTAGGGAATGATTGCAAGGTCTTACTCTCTGCAGCCAGGTAATTTGTACTCTAGACACCTGGATCATTTAA
TTGAGATATGATGAATACCACTGCTTAGTGCAAAATTCAGTGATGTGCTTCATTATGTCCAGTGTATCCTATAATTTCTTACACGTACCTTTTGTTATCCTTAATACAAGCAACTTCTCTTGGAGAAGGCAGTTTATTGTAAGTTATTCCTATTGTTTCATATCCGAGCTCTAATTTTTTGATGGAATATAACAAACACT
TACACATTCTGGAAGTAAAAAGGCAATCGTTTGGATGGTGGCATCATTTGATGATTTTCCACCTGAGGCCTCGTGCAATCTTCACTCAACAGATCTGAACAATCCAGTTGAGTATGTGCAGTGTTTCAAGACAGACTTTTGTAATTGTAAACCAAATTTGGAAAACTGTATTTTGGACTGTAAAAGAGAGTAAAATATTA
ACATCGGCCTCATGCTATGACATTGTAAATCATATCTATTGGTTATGCAATTGTACCAAGTTCATTATTCTACTGCTTAATTGTAATTAATGTTCTAAATCTGTAAACTAAGCAAGCAAGTTTCCAGGTCTGAAA




Intron 6 GTGGGTATCC ... AATTTGTTAG

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>TRINITY_DN111891_c1_g1_i11 from sample A2 / Example spliced isoform
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TCCATTTATTGATTCTGCTGTGCAATTCATGAAATATAATTTGAGGCCTCATACCTGGGGCGTCGGCCTAATCCAATCCAAAGCCTTTTATCAACAATTATAGCACGAGTTTTAATGAATTCAGCGGAACAATAGAACTAAAGAAGAGCGCTTCATCGCAGTGGAATGAATGAACGAATGGATGGATTAGTTCGGTTGAT
CGATGATATAGATTCATAGGCGCCCAAAAAGAGTTGCAGGGCCATTCGCGATCGGGACTCGACCCCGAGACCCCCCAGTGGCAATATCAGAGAGTCCGATATTTGATTTTTGGAATACCTGGAGAATTGGGATTACTGGGCGAATTATGGTGTAAACATCTTCTTTTGATGGGAGCCTCTGGCCATGATAGGCGGGTCAT
TTACTTCAAGATTTTCTTCCCATCCGTGCTTAAGAATGCAGTTCCTCACACTCTGGCAGGAGAGCAATGTTTGGGCAATACACGTCAAGTAGATATTTACTTTAGAACTTCTAGAGCATAAAGATAGTGCAGATCAGTCACTTATGATCTTAGTAAAACATCTTTATAGAAACTGAGATAACTTTGGTTCATACTGATGG
CCACTGAATCTAATGGTTCAATCCTCCTGGAGCCACCAGACACACGAGATGGCCTCACAGTGGTTTCACCATTACCTCAGGAAGGTGGTTTCCCAGATGGCGCCACAGTGGTTCCAACATTACCTCAGGAAGGCGATATCCCTCATTCTTCAACAGAACTGAATGATGAAAGTATGCAAATTTCACCCATCAAGAAAACT
GTGTCGGATATAGAAGATGTTATGCAAGTTTCACCCATCAAGACAACTGTGTCGGATATAGAAGATGTCACGCAAATTTCACCTGTCAAGACAAGTGTGTCAGGTAAAGAAGATGTTATGCAAATTTCACCAATCAAGACAACTGTGTCAGATAAAGAAGATGCTATGGACATTTCACCCAGAAAGACAACTGTGTCAGA
TATAGAAGATGTGAATTTGATTTCTTTGAAGCACCCCGACACAGCCATAGATAGTAAAGCAGAGGTTGGGTTACCTGAGAGCTTCTCTGATAAAAATATTGGCATGCAGCATGATATTCTTACAGGGGGGAATACTAAAGGGGTTAGTTCTTTATGCTCTGCTGACAAGGATGAAGAAGAAGACCGCATTGAACATGTTG
CTAAGAAACTAAAAATTGGCAAGGACACTAAAATTGAGAAAAGAAAATCACTTGATGCTGCAATCAAGCAGACATCAGAGATGGTGCTTGTTTTAGCGGGGATGGGACGGATGAGAGCAGGCAGATGTCCAACAGACTTTGAAAGAGGACTTATGGCTGAGGCACGGCAAAAACTTGGATATTTGGCTGGAAAGCTGGCT
CCCAAGGATTTAGTTTCAAAGGACGCTGTTGAAAGTATGATAGAAGATCTTGGGCTAAACAGAGTGAAGGACCCTACAAAAACTGCAGGTCCAAAGAAATCAATAGCGGAAAGAGCACTGGAAACCATGAAGAAG


>TRINITY_DN111891_c1_g1_i6 from sample A2 / Example unspliced isoform:
CAACAACCACTCTTCTTTCCCACTTAAATTTGCCAAAGCCACTCTTCCCCAACCCTTAGCCCACTCTTCCTCCAATGGAGAAGCCCTAATTATTTTCCCCCAAAAACTTAAAAACCCTTGTTGTGCTTCCCTATGTGCTTTTTTTAACCTTCTGCACAACTCTTCCTTTTCCCTTAATAAATCTTGAATTTCGTCAGTCA
TCCATTTATTGATTCTGCTGTGCAATTCATGAAATATAATTTGAGGCCTCATACCTGGGGCGTCGGCCTAATCCAATCCAAAGCCTTTTATCAACAATTATAGCACGAGTTTTAATGAATTCAGCGGAACAATAGAACTAAAGAAGAGCGCTTCATCGCAGTGGAATGAATGAACGAATGGATGGATTAGTTCGGTTGAT
CGATGATATAGATTCATAGGCGCCCAAAAAGAGTTGCAGGGCCATTCGCGATCGGGACTCGACCCCGAGACCCCCCAGTGGCAATATCAGAGgtgggtatccggtgtttgttgctctctccttcgctgcttctgcttctgtagcgtttgggtgcctgttatcttccctccactccgtacccatttctttgtctatgcaag
ttcatggattagtaggaattgggtattttcacaacatggctgaacatgttctttctttgtggtcacttgtagtgtacaccattactgttctcaaagatttctgttagatacagttacaaggcactgcgttccttatctccaatttgactgaaaaaattccgtttatgtcttccagcagactccacaacgcatccagttct
aatgcctttgtttttggattgagttctgtcgacacaaagtatattttgtataaaggataacacgtttaattgtaatcaatgattaaaaatgcaacgggttggatagttcctatcggtctctatctcatcttgtgctaaagaagaacatctctcaaaatcaaaccggggagatggcctggtattgggccagccactctctg
aatatattagtattagtacgtatcaacatcaacattttctacattactaacatccgtgggttgctgccttaatttgttag
AGTCCGATATTTGATTTTTGGAATACCTGGAGAATTGGGATTACTGGGCGAATTATGGTGTAAACATCTTCTTTTGATGGGAGCCTCTGGCCATGATAGGCGGGTCATTTACTTCAAGAT
TTTCTTCCCATCCGTGCTTAAGAATGCAGTTCCTCACACTCTGGCAGGAGAGCAATGTTTGGGCAATACACGTCAAGTAGATATTTACTTTAGAACTTCTAGAGCATAAAGATAGTGCAGATCAGTCACTTATGATCTTAGTAAAACATCTTTATAGAAACTGAGATAACTTTGGTTCATACTGATGGCCACTGAATCTA
ATGGTTCAATCCTCCTGGAGCCACCAGACACACGAGATGGCCTCACAGTGGTTTCACCATTACCTCAGGAAGGTGGTTTCCCAGATGGCGCCACAGTGGTTCCAACATTACCTCAGGAAGGCGATATCCCTCATTCTTCAACAGAACTGAATGATGAAAGTATGCAAATTTCACCCATCAAGAAAACTGTGTCGGATATA
GAAGATGTTATGCAAGTTTCACCCATCAAGACAACTGTGTCGGATATAGAAGATGTCACGCAAATTTCACCTGTCAAGACAAGTGTGTCAGGTAAAGAAGATGTTATGCAAATTTCACCAATCAAGACAACTGTGTCAGATAAAGAAGATGCTATGGACATTTCACCCAGAAAGACAACTGTGTCAGATATAGAAGATGT
GAATTTGATTTCTTTGAAGCACCCCGACACAGCCATAGATAGTAAAGCAGAGGTTGGGTTACCTGAGAGCTTCTCTGATAAAAATATTGGCATGCAGCATGATATTCTTACAGGGGGGAATACTAAAGGGGTTAGTTCTTTATGCTCTGCTGACAAGGATGAAGAAGAAGACCGCATTGAACATGTTGCTAAGAAACTAA
AAATTGGCAAGGACACTAAAATTGAGAAAAGAAAATCACTTGATGCTGCAATCAAGCAGACATCAGAGATGGTGCTTGTTTTAGCGGGGATGGGACGGATGAGAGCAGGCAGATGTCCAACAGACTTTGAAAGAGGACTTATGGCTGAGGCACGGCAAAAACTTGGATATTTGGCTGGAAAGCTGGCTCCCAAGGATTTA
GTTTCAAAGGACGCTGTTGAAAGTATGATAGAAGATCTTGGGCTAAACAGAGTGAAGGACCCTACAAAAACTGCAGGTCCAAAGAAATCAATAGCGGAAAGAGCACTGGAAACCATGAAGAAGATTGAACAAGCAAGGCAATTGACAACAGGTGCACGCATGTTACCCACTTCATTGTCTAAAGCAGAACATGCCTCTGT
TAATTCTACAAGCCATGATACCTCATCGGCATTGACAAATCAAGGAGCCCAACCAGCTCCAGTGAAACTGTCACCTTCAATTTCACAGCCTCTTCCAGGAGCGCAGTTATTCATGCCAGCTATTTCAGTAACACCACGGGCTCCGATTGCACAATCTGTTTCAATTGAGCCAAGGGCTCCAGTTGTAACAACAGCTTCAG
TTGTACGACAGTCCCCGGGTGGGCCAACATCGTTGGTTTCTCAGCAGGCTCAAGTTTCACTGATGGCACCAGTTGCATTGTTTGCTCCTGTTGCACAAGAAGCAGAGACAAAGCCACCAGTAGTTGCACTACCTACCACAAGGGTGTTGCAACCTGTTCCAGAGGCACAGTCATTACTACTTCAAAAACCTGGTGAGGTC
GTGAAGCCATTGGCAGCTCCTGGTAATATATCTGAAGAAAATACAAAACCTCTTTCAGCAGAGGCAGCAAGGGTTGTTGATAGGGAACATTCAAAGGATTCTGTAATTTCACCTTCTAAAGTTTTACCTCTTGTTCAGACCTCAACATCGTCAGCTAATGTTGGCAAGGATGTTGATCTGCCTGCAAAAATATTAAGGAA
GCTTGAGAATCTTCACACGACACAGACTTCTCAAGGTCCAAAGCCAGCTGAATCTCTTGCAATTCGTGCTAATCATGCTGACATTGCAAAAAATGTTCAGAAAATCTTGCAATCAAGGCCTCCAGATTTTCGTCAATGGGAACCTCCTTCAAAAGCCTATATGAGTGCTCCTGTATTGTGCCAAATCTGTAAGATTAATT
CTATTGATATAGACAATATACTAGTTTGTGATGCTTGTGAGAAAGCAGTTCACTTAAAATGTGTTCAGTCGTACAACCAGAGGGGTATCCCGAAGGGTGACTGGCACTGCCCTAAGTGCTTGATTGCAAGCAATGGTCGTCCATTTCCTCCCAAGTATGGTCGTGTTGGTAAAAGTACTATTGTTCGGAAAATGCCAGCA
AACAAGAGTAGCCATCAAGCTTCTCCTGTGAAGAAGATGGAAACTTCCCATCCAAAGTCTCCTCAGCACACAATTGTATCAAATGGCCTGAATACTGCTGCAGAGGTTCCTGTCCATGTTGATCTGAGTCGTAGCAACCACATGCATATCCTTCAGGAAACGGGAAACACAAGTGGAGACCTAAGGCCAAATTCTGAAAT
GTCTTTTGCTGAAAGCAGAAAGAATGCAGAAGATGTGTCAAATGAGCCTTTAAACCATGACTTTTCTCAACAAGCCCCTGAAGCGGTTAATGCTCTCTTAGTAAAGCTTCCAGAGAATGAGAATAACTGTAGCCCAAGTAATACAGTTTCACAATTTCCCGATCAGCAGTCTGCCCATGCTGCTGCATTAGTGTCTGCCA
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AGTTACAGACGGAAAAACATATTACCATTCATGCTCTGTAAGGGGTGTTCTATATAAGCTGCATGATTATGCTTTATTTCGCCCTGAAACTCCTAATGTTCCTCCGTACATTGCAAGGCTTCAGATTTTGTGGGAGGATGATAATACTGGGTCAAAGTGGGTACGGGTCAACTGGTGTTATTATCCCAATGATATCCCAC
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