sp|Q9FG93|MNS4_ARATH ----> Alpha-mannosidase I MNS4


Intron 1 GTAATTGATA ... ATGTTTGCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A113.041021
A229.171786
A321.882577
A438.46864
A50300
A625622
A724.1422113
A826.321455
A915.7932111
A1032.220514



>TRINITY_DN100053_c0_g1_i1 from sample A4 / Example spliced isoform
ATAAGTTGGGGAATGTCGGTAGTGTTTGGATCTTTAAAGTTCTATTGACTCCTCATTGCTCAAAGGCTTTGTAGTTGTTATTATTAGATGAGCAATGAGGCGCCCTCAAATTCCGAAGTTGTTAATCTGGTCCAATCTATACGTATAGATAAAACCAGATACAATTGCCTTGCCCGGAAATCTAATTATATCTGGCAAAG
TTTGTTAGTGTAATTGCAATGGTATACGAGAAACATGAAGGGATTCAATGTATTGATATTGATATTGGCATTGCTTCCGCTTTCCACTCAGTCCAGTGGAGCTTCTGTCACTCCTCAAGAGGCAAAGCTGCTCCGAGATGAGGTTAGACAAATGTTTTATCATGCTTTTGATGGGTATATGGAATATGCTTTCCCTCTTG
ATGAGCTAAGGCCGTTAAGTTGTACAGGAGAAAACACACTGGGTGGCTATGCATTGACACTTGTTGATTCATTGGATACATTGGCACTGTTTGGTGATAAGGAAAGATTCAGTGCAGCAGTTCAATGGCTGGGCAAAAATCTGCGTTTTGATAAAAACAAAACTGTTTCTGTATTTGAGACAACAATTCGAGTACTTGGA
GGCTTGCTTTCAGCACATCTTATAGCAAGTGATGATGCTACAGGAATGAGGGTCGATTCTTATAACAATGAATTGCTTCATCTTTCTGAGGATTTGGCTCGAAGGATGTTACCTTCATTTGAAACTCCAACAGGTCACTTCAACTGCTGGAGGTGGCACTCTCACCTTGGAGTTTGGGCTTTTGAGTCGCTTGATTGGAG
ATCCTGTTTTCGAGAAAGTTACAAAGAATGCAGTGCGGGGGCTCTGGGCCCAACGCTCAGATATTGGTCTTGTCGGAGCTCACATAAATGTTTTCTCTGGGCATTGGACTCAGAAGGATGCTGGAATTGGCACCAGCATAGACTCATTCTATGAGTATCTTTTGAAAGCATATTTGTTACTTGGAGATGAAGAATATTTA
TACATGTTTCAGGAGGCCTACAAAGCTGCCATGCAGTATCTTTACAATGATCCATGGTATGTGGAGGTGAATATGAACTCAGCAGCAATTGTATGGCCATTGTTCAACAGTCTGCAGGCATTTTGGCCTGGTCTTCAGGTTTTGGCTGGGGATGTTGAGCCAGCTGTCCGAACACACAAAGCTTTCTTTAGTGTCTGGAA
ACAATTTGGATTTACACCAGAGGGCTTCAATCTTGCTACATTGAGTGTGCAGCCTGGTCAAAGGAGTTACCCCCTGCGTCCTGAGTTAATTGAGAGCACCTACTGGCTTTTCAAAGCTACTAGCGATCCCATGTATCTTGATGTTGGACGAGACATTGTTGTCAGTTTACAGTATGCTGCACGGTGCCCTTGTGGATATT
GTCACATAGCAGATGTAGAATCCCACCAACAAGATGATCACATGGAAAGCTTTTTCCTTGCTGAAACAGTTAAATACCTTTGGCTTCTTTTTGATTTGGCTGTGGGTGGGGAAAACATGGTGGAAAAAGGGCCATACCCATACATATTTAGCACAGAAGGCCATTTATTCCCCATGACCCCTGAGATATCTTTAACAAAA
GAGCACTGCACTTATGCTGGAAGCTTTTGCAAAAGTGTCCATGGCCATGACGGTGTGCTAAATGACTTCAAAACTGATGTCAAGGAGGGAAAGGAATTGCAGGCAAATGAAAGGGAATTTGGCATAGGTTGGTGTCCTGCAAAAGAATCAACACAGGTGATAAAGGACAAGAATAATGTGATACATGGACTCAAGGGGGT
TTGTACAGGGTTAAGCCATTGGCGAAAGTTTGGAATTTCCTCCTTGGCTGACGATGTGTCTATGGCAAGGAAAACAAGTACACACCCTCAAGATCATTTGGATAATCAATATGAGGCTGGTTTGAGCAAGTCTCCAATAGTTATGGTTTTCCATAAAGATGACCAAGAGTCTGTAGTTTCTGAAAATGATAATTTGATCA
AGAAGCCATTATCAGGTAGTGGAAGTATTAATGGTCAAGATCTTACTGAGAATGAAAATTTAGATGATCAAGGAAATAGGATATCTATTGCCAGGACTATCAATCATTTACATCGCAGCAGTGTAGAT


>TRINITY_DN100053_c0_g1_i4 from sample A4 / Example unspliced isoform:
ATAAGTTGGGGAATGTCGGTAGTGTTTGGATCTTTAAAGTTCTATTGACTCCTCATTGCTCAAAGGCTTTGTAGTTGTTATTATTAGATGAGCAATGAGGCGCCCTCAAATTCCGAAGTTGTTAATCTGGTCCAATCTATACGTATAGATAAAACCAGATACAATTGCCTTGCCCGGAAATCTAATTATATCTGGCAAAG
TTTGTTAGTGTAATTGCAATGGTATACGAGAAACATGAAGGGATTCAATGTATTGATATTGATATTGGCATTGCTTCCGCTTTCCACTCAGTCCAGTGGAGCTTCTGTCACTCCTCAAGAGGCAAAGCTGCTCCGAGATGAGGTTAGACAAATGTTTTATCATGCTTTTGATGGGTATATGGAATATGCTTTCCCTCTTG
ATGAGCTAAGGCCGTTAAGTTGTACAGGAGAAAACACACTGGGTGGCTATGCATTGACACTTGTTGATTCATTGGATACATTGGCACTGTTTGGTGATAAGGAAAGATTCAGTGCAGCAGTTCAATGGCTGGGCAAAAATCTGCGTTTTGATAAAAACAAAACTGTTTCTGTATTTGAGACAACAATTCGAGTACTTGGA
GGCTTGCTTTCAGCACATCTTATAGCAAGTGATGATGCTACAGGATCCCTTATGGTTCTGTGAATCTACTATATGGTGTTGATGAAAATGAAAGCAAGGTCACTTCAACTGCTGGAGGTGGCACTCTCACCTTGGAGTTTGGGCTTTTGAGTCGCTTGATTGGAGATCCTGTTTTCGAGAAAGTTACAAAGAATGCAGTG
CGGGGGCTCTGGGCCCAACGCTCAGATATTGGTCTTGTCGGAGCTCACATAAATGTTTTCTCTGGGCATTGGACTCAGAAGGATGCTGGAATTGGCACCAGCATAGACTCATTCTATGAGTATCTTTTGAAAGCATATTTGTTACTTGGAGATGAAGAATATTTATACATGTTTCAGGAGGCCTACAAAGCTGCCATGCA
GTATCTTTACAATGATCCATGgtaattgatagattagacaaccatgattgacatatcataaggcccctttattgtgaggtatgaaccttttaattgtatgaaaatctatatgtttgcagGTATGTGGAGGTGAATATGAACTCAGCAGCAATTGTATGGCCATTGTTCAACAGTCTGCAGGCATTTTGGCCTGGTCTTCA
GGTTTTGGCTGGGGATGTTGAGCCAGCTGTCCGAACACACAAAGCTTTCTTTAGTGTCTGGAAACAATTTGGATTTACACCAGAGGGCTTCAATCTTGCTACATTGAGTGTGCAGCCTGGTCAAAGGAGTTACCCCCTGCGTCCTGAGTTAATTGAGAGCACCTACTGGCTTTTCAAAGCTACTAGCGATCCCATGTATC
TTGATGTTGGACGAGACATTGTTGTCAGTTTACAGTATGCTGCACGGTGCCCTTGTGGATATTGTCACATAGCAGATGTAGAATCCCACCAACAAGATGATCACATGGAAAGCTTTTTCCTTGCTGAAACAGTTAAATACCTTTGGCTTCTTTTTGATTTGGCTGTGGGTGGGGAAAACATGGTGGAAAAAGGGCCATAC
CCATACATATTTAGCACAGAAGGCCATTTATTCCCCATGACCCCTGAGATATCTTTAACAAAAGAGCACTGCACTTATGCTGGAAGCTTTTGCAAAAGTGTCCATGGCCATGACGGTGTGCTAAATGACTTCAAAACTGATGTCAAGGAGGGAAAGGAATTGCAGGCAAATGAAAGGGAATTTGGCATAGGTTGGTGTCC
TGCAAAAGAATCAACACAGGTGATAAAGGACAAGAATAATGTGATACATGGACTCAAGGGGGTTTGTACAGGGTTAAGCCATTGGCGAAAGTTTGGAATTTCCTCCTTGGCTGACGATGTGTCTATGGCAAGGAAAACAAGTACACACCCTCAAGATCATTTGGATAATCAATATGAGGCTGGTTTGAGCAAGTCTCCAA
TAGTTATGGTTTTCCATAAAGATGACCAAGAGTCTGTAGTTTCTGAAAATGATAATTTGATCAAGAAGCCATTATCAGGTAGTGGAAGTATTAATGGTCAAGATCTTACTGAGAATGAAAATTTAGATGATCAAGGAAATAGGATATCTATTGCCAGGACTATCAATCATTTACATCGCAGCAGTGTAGAT




Intron 2 GTATGTGGAG ... TGGTCTTCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A157.89121023
A26881717
A363.16142523
A462.798819
A5100034
A668.897625
A772.97152259
A865.43141439
A982.6993254
A107692037



>TRINITY_DN127233_c2_g1_i9 from sample A1 / Example spliced isoform
GCTGGACATAACAGCCGCGATGAGGCCCACGACGGCTCAAATGTTTGTTAAAATGGAGTATACATAAGTTGGGGAATGTCGGTAGTGTTTGGATCTTTAAGGTTCTATTGACTCCTCATTGCTCAAAGGCTTTGTAGTTGTTATTATTAGATGAGCAATGAGGCGCCCTCAAACTCCGAAGTTGTTAATCTGGTCCAATC
TATGCGTATAGATAAAACCAGCTACAATTGCCTGGCGCGGAAATCTAATTATATCTGGCAAAGTTTGTCAGTGTAATTGCAATGGTATACGAGAAACATGAAGGGATTCAATGTATTGATATTGATATTGGCATTGCTTCCGCTTTCCACTCAGTCCAATGGAGCTTCTGTCACTCCTCAAGAGGCAAAGCTGCTCCGAG
ATGAGGTTAGACAAATGTTTTATCATGCTTTTGATGGGTATATGGAATATGCTTTCCCTCTTGATGAGCTAAGGCCGTTAAGTTGTACAGGAGAAAACACACTGGGTGGCTATGCATTGACACTTGTTGATTCATTGGATACATTGGCACTGTTTGGTGATAAGGAAAGATTCAGTGCAGCAGTTCAATGGCTGGGCAAA
AATCTGCGTTTTGATAAAAACAAAACTGTTTCTGTATTTGAGACAACAATTCGAGTACTTGGAGGCTTGCTTTCAGCACATCTTATAGCAAGTGATGATGCTACAGGAATGAGGGTCGATTCTTATAACAATGAATTGCTTCATCTTTCTGAGGATTTGGCTCGAAGGATGTTACCTTCATTTGAAACTCCAACAGGGAT
CCCTTATGGTTCTGTGAATCTACTATATGGTGTTGATGAAAATGAAAGCAAGGTCACTTCAACTGCTGGAGGTGGCACTCTCACCTTGGAGTTTGGGCTTTTGAGTCGCTTGATTGGAGATCCTGTTTTCGAGAAAGTTACAAAGAATGCAGTGCGGGGGCTCTGGGCCCAACGCTCAGATATTGGTCTTGTCGGAGCTC
ACATAAATGTTTTCTCTGGGCATTGGACTCAGAAGGATGCTGGAATTGGCACCAGCATAGACTCATTCTATGAGTATCTTTTGAAAGCATATTTGTTACTTGGAGATGAAGAATATTTATACATGTTTCAGGAGGCCTACAAAGCTGCCATGCAGTATCTTTACAATGATCCATGGTTTTGGCTGGGGATGTTGAGCCAG
CTGTCCGAACACACAAAGCTTTCTTTAGTGTCTGGAAACAATTTGGATTTACACCAGAGGGCTTCAATCTTGCTACATTGAGTGTGCAGCCTGGTCAAAGGAGTTACCCCCTGCGTCCTGAGTTAATTGAGAGCACCTACTGGCTTTTCAAAGCTACCAGCGATCCGATGTATCTTGATGTTGGACGAGACATTGTTGTC
AGTTTACAGTATGCTGCACGGTGCCCTTGTGGATATTGTCACATAGCAGATGTAGAATCCCACCAACAAGATGATCACATGGAAAGCTTTTTCCTTGCTGAAACAGT


>TRINITY_DN127233_c2_g1_i6 from sample A1 / Example unspliced isoform:
GCTGGACATAACAGCCGCGATGAGGCCCACGACGGCTCAAATGTTTGTTAAAATGGAGTATACATAAGTTGGGGAATGTCGGTAGTGTTTGGATCTTTAAGGTTCTATTGACTCCTCATTGCTCAAAGGCTTTGTAGTTGTTATTATTAGATGAGCAATGAGGCGCCCTCAAACTCCGAAGTTGTTAATCTGGTCCAATC
TATGCGTATAGATAAAACCAGCTACAATTGCCTGGCGCGGAAATCTAATTATATCTGGCAAAGTTTGTCAGTGTAATTGCAATGGTATACGAGAAACATGAAGGGATTCAATGTATTGATATTGATATTGGCATTGCTTCCGCTTTCCACTCAGTCCAATGGAGCTTCTGTCACTCCTCAAGAGGCAAAGCTGCTCCGAG
ATGAGGTTAGACAAATGTTTTATCATGCTTTTGATGGGTATATGGAATATGCTTTCCCTCTTGATGAGCTAAGGCCGTTAAGTTGTACAGGAGAAAACACACTGGGTGGCTATGCATTGACACTTGTTGATTCATTGGATACATTGGCACTGTTTGGTGATAAGGAAAGATTCAGTGCAGCAGTTCAATGGCTGGGCAAA
AATCTGCGTTTTGATAAAAACAAAACTGTTTCTGTATTTGAGACAACAATTCGAGTACTTGGAGGCTTGCTTTCAGCACATCTTATAGCAAGTGATGATGCTACAGGAATGAGGGTCGATTCTTATAACAATGAATTGCTTCATCTTTCTGAGGATTTGGCTCGAAGGATGTTACCTTCATTTGAAACTCCAACAGGGAT
CCCTTATGGTTCTGTGAATCTACTATATGGTGTTGATGAAAATGAAAGCAAGGTCACTTCAACTGCTGGAGGTGGCACTCTCACCTTGGAGTTTGGGCTTTTGAGTCGCTTGATTGGAGATCCTGTTTTCGAGAAAGTTACAAAGAATGCAGTGCGGGGGCTCTGGGCCCAACGCTCAGATATTGGTCTTGTCGGAGCTC
ACATAAATGTTTTCTCTGGGCATTGGACTCAGAAGGATGCTGGAATTGGCACCAGCATAGACTCATTCTATGAGTATCTTTTGAAAGCATATTTGTTACTTGGAGATGAAGAATATTTATACATGTTTCAGGAGGCCTACAAAGCTGCCATGCAGTATCTTTACAATGATCCATGgtatgtggaggtgaatatgaactca
gcagcaattgtatggccattgttcaacagtctgcaggcattttggcctggtcttcag
GTTTTGGCTGGGGATGTTGAGCCAGCTGTCCGAACACACAAAGCTTTCTTTAGTGTCTGGAAACAATTTGGATTTACACCAGAGGGCTTCAATCTTGCTACATTGAGTGTGCAGCCTGGTCAAAGGAGTTACCCCCTGCGTCC
TGAGTTAATTGAGAGCACCTACTGGCTTTTCAAAGCTACCAGCGATCCGATGTATCTTGATGTTGGACGAGACATTGTTGTCAGTTTACAGTATGCTGCACGGTGCCCTTGTGGATATTGTCACATAGCAGATGTAGAATCCCACCAACAAGATGATCACATGGAAAGCTTTTTCCTTGCTGAAACAGTTAAATACCTTT
GGCTTCTTTTTGATTTGGCTGTGGGTGGGGAAAACATGGTGGAAAAAGGGCCATACCCATACATATTTAGCACAGAAGGCCATTTATTCCCCATGACCCCTGAGATATCTTTAACAAAAGAGCACTGCACTTATGCTGGAAGCTTTTGCAAAAGTGTCCATGGCCATGACGGTGTGCTAAATGACTTCAAAACTGATGTC
AAGGAGGTAAAGGAATTGCAGGCAAATGAAAGGGAATTTGGCATAGGTTGGTGTCCTGCAAAAGAATCAGCACAGGTGATAAAGGACAAGAATAATGTGATACATGGACTCAAGGGGGTTTGTACAGGGTTAAGCCATTGGCGAAAGTTTGGAATTTCCTCCTTGGCTGACGATGTGTCTATGGCAAGGAAAACAAGTAC
ACACCCTCAAGATCATTTGGATAATCAATATGAGGCTGGTTTGAGCAAGTCTCCAATAGTTATGGTTTTCCATAAAGATGACCAAGAGTCTGTAGTTTCTGAAAATGATAATCTGATCAAGAAGCCATTATCAGGTAGTGGAAGTATTTATGGTCAAGATCTTACTGAGAATGAAAATTTAGATGATCAAGGAAATAGGA
TATCTATTGCCAGGACTATCAATAATTTACATCGCAGCAGTGTAGATGATAGAACTCTGCAAAATTTTTCAGAGGAAAGTTAGTTTATGCTGTGAAATTAGAAAAAGGAATAATCCACAATGGTATGAATGATGTTTATTTATGGCTTTGTTAAATCCTGAATATGTTTTCTCATATCAGGATTCATTGTTAGAATTTCC
TATCATGCATCTTAAGTTCGAAACTTCGATATGCTTACATTGGTGTGGTTCAGATTCTGTGTTTAGACAATCCTCCATTTTTTGTGCACAGACAAATGAAGTTTTGTCCAATTAAACAAAAAGAAACAAAGCCCCAACTATGGTTAACCAGGTTTGAGAATCCACTTATTACATTATTGACTTCTCTTTATTCTTTTCTG
TTTGATTTTCCCCACATTTCCTGAATTTTAATGTTTTCTTATTTGCCAAGCCCTCAATATCTGCTACTGGTTGCCCTTCTTTAGTTC




Intron 3 GTTATGAACA ... TTTTTGAAAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A117.862319
A217.071725
A320.692348
A422.451956
A527.27421
A615.252545
A716.959816
A822391012
A918.18541311
A1015.913786



>TRINITY_DN43271_c0_g1_i5 from sample A8 / Example spliced isoform
TTTGGATCTTTAAGGTTCTATTGACTCCTCATTGCTCAAAGGCTTTGTAGTTGTTATTATTAGATGAGCAATGAGGCGCCCTCAAATTCCGAAGTTGTTAATCTGGTCCAATCTATACGTATAGATAAAACCAGATACAATTGCCTTGCCCGGAAATCTAATTATATCTGGCAAAGTTTGTTAGTGTAATTGCAATGGTA
TACGAGAAACATGAAGGGATTCAATGTATTGATATTGATATTGGCATTGCTTCCGCTTTCCACTCAGTCCAGTGGAGCTTCTGTCACTCCTCAAGAGGCAAAGCTGCTCCGAGATGAGGTTAGACAAATGTTTTATCATGCTTTTGATGGGTATATGGAATATGCTTTCCCTCTTGATGAGCTAAGGCCGTTAAGTTGTA
CAGGAGAAAACACACTGGGTGGCTATGCATTGACACTTGTTGATTCATTGGATACATTGGCACTGTTTGGTGATAAGGAAAGATTCAGTGCAGCAGTTCAATGGCTGGGCAAAAATCTGCGTTTTGATAAAAACAAAACTGTTTCTGTATTTGAGACAACAATTCGAGTACTTGGAGGCTTGCTTTCAGCACATCTTATA
GCAAGTGATGATGCTACAGGAATGAGGGTCGATTCTTATAACAATGAATTGCTTCATCTTTCTGAGGATTTGGCTCGAAGGATGTTACCTTCATTTGAAACTCCAACAGGGATCCCTTATGGTTCTGTGAATCTACTATATGGTGTTGATGAAAATGAAAGCAAGGTCACTTCAACTGCTGGAGGTGGCACTCTCACCTT
GGAGTTTGGGCTTTTGAGTCGCTTGATTGGAGATCCTGTTTTCGAGAAAGTTACAAAGAATGCAGTGCGGGGGCTCTGGGCCCAACGCTCAGATATTGGTCTTGTCGGAGCTCACATAAATGTTTTCTCTGGGCATTGGACTCAGAAGGATGCTGGAATTGGCACCAGCATAGACTCATTCTATGAGTATCTTTTGAAAG
CATATTTGTTACTTGGAGATGAAGAATATTTATACATGTTTCAGGAGGCCTACAAAGCTGCCATGCAGTATCTTTACAATGATCCATGGTATGTGGAGGTGAATATGAACTCAGCAGCAATTGTATGGCCATTGTTCAACAGTCTGCAGGCATTTTGGCCTGGTCTTCAGGTTTTGGCTGGGGATGTTGAGCCAGCTGTC
CGAACACACAAAGCTTTCTTTAGTGTCTGGAAACAATTTGGATTTACACCAGAGGGCTTCAATCTTGCTACATTGAGTGTGCAGCCTGGTCAAAGGAGTTACCCCCTGCGTCCTGAGTTAATTGAGAGCACCTACTGGCTTTTCAAAGCTACTAGCGATCCCATGTATCTTGATGTTGGACGAGACATTGTTGTCAGTTT
ACAGTATGCTGCACGGTGCCCTTGTGGATATTGTCACATAGCAGATGTAGAATCCCACCAACAAGATGATCACATGGAAAGCTTTTTCCTTGCTGAAACAGTTAAATACCTTTGGCTTCTTTTTGATTTGGCTGTGGGTGGGGAAAACATGGTGGAAAAAGGGCCATACCCATACATATTTAGCACAGAAGGCCATTTAT
TCCCCATGACCCCTGAGATATCTTTAACAAAAGAGCACTGCACTTATGCTGGAAGTTTTTGCAAAAGTGTCCATCTCCATGACGGTGTGCTAAATGACTTCAAAACTGATGTCAAGGAGGTAAAGGAATTGCAGGCAAATGAAAGGGAATTTGGCATAGGTTGGTGTCCTGCAAAAGAATCAACACAGGTGATAAAGGAC
AAGAATAATGTGATACATGGACTCAAGGGGGTTTGTCCAGGGTTAAGCCATTGGCGAAAGTTTGGAATTTCCTCCTTGGCTGACGATGTGTCTATGGCAAGGAAAACAAGTACACACCCTCAAGATCATTTGGATAATCAATATGAGGCTGGTTTGAGCAAGTCTCCAATAGTTATGGTTTTCCATAAAGATGACCAAGA
GTCTGTAGTTTCTGAAAATGATAATCTGATCAAGAAGCCATTATCAGGTAGTGGAAGTATTTATGGTCAAGATCTTACTGAGAATGAAAATTTAGATGATCAAGGAAATAGGATATCTATTGCCAGGACTATCAATAATTTACATCGCAGCAGTGTAGATGATAGAACTCTGCAAAATTTTTCAGAGGAAAGTTAGTTTA
TGCTGTGAAATTAGAAAAAGGAATAATCCAGAATGGTATGAATGATGTTTATTTATGGCTTTGTTAAATCCTGAATATGTTTTCTCATATCAGGATTCATTGTTAGAATTTCCTATCATGCATCTTAAGTTCGAAACTTCGATATGCTTACATTGGTGTGGTTCAGATTCTGTGTTTAGACAATCCTCCATTTTTTGTGC
ACAGACAAATGAAGTTTTGTCCAATTAAACAAAAAGAAACAAAGCCCCAACTATGGTTAACCAGGTTTGAGAATCCACTTATTACATTATTGACTTCTCTTTATTCTTTTCTGTTTGATTTTACCCACATTTCCTGAATTTTAATGTTTTCTTATTTGCCAAGCCCTCAATATCTGCTACTGGTTGCCCTTCTTTAGTTC
TGTATTTTTGAAGGGGCTTCCTCTGTTGGCAATATGGCTTATAGTTGTCATTGATGTCAAAAGGATCTCAGTAATGAC


>TRINITY_DN43271_c0_g1_i4 from sample A8 / Example unspliced isoform:
TTTGGATCTTTAAGGTTCTATTGACTCCTCATTGCTCAAAGGCTTTGTAGTTGTTATTATTAGATGAGCAATGAGGCGCCCTCAAATTCCGAAGTTGTTAATCTGGTCCAATCTATACGTATAGATAAAACCAGATACAATTGCCTTGCCCGGAAATCTAATTATATCTGGCAAAGTTTGTTAGTGTAATTGCAATGGTA
TACGAGAAACATGAAGGGATTCAATGTATTGATATTGATATTGGCATTGCTTCCGCTTTCCACTCAGTCCAGTGGAGCTTCTGTCACTCCTCAAGAGGCAAAGCTGCTCCGAGATGAGGTTAGACAAATGTTTTATCATGCTTTTGATGGGTATATGGAATATGCTTTCCCTCTTGATGAGCTAAGGCCGTTAAGTTGTA
CAGGAGAAAACACACTGGGTGGCTATGCATTGACACTTGTTGATTCATTGGATACATTGGCACTGTTTGGTGATAAGGAAAGATTCAGTGCAGCAGTTCAATGGCTGGGCAAAAATCTGCGTTTTGATAAAAACAAAACTGTTTCTGTATTTGAGACAACAATTCGAGTACTTGGAGGCTTGCTTTCAGCACATCTTATA
GCAAGTGATGATGCTACAGGAATGAGGGTCGATTCTTATAACAATGAATTGCTTCATCTTTCTGAGGATTTGGCTCGAAGGATGTTACCTTCATTTGAAACTCCAACAGGGATCCCTTATGGTTCTGTGAATCTACTATATGGTGTTGATGAAAATGAAAGCAAGGTCACTTCAACTGCTGGAGGTGGCACTCTCACCTT
GGAGTTTGGGCTTTTGAGTCGCTTGATTGGAGATCCTGTTTTCGAGAAAGTTACAAAGAATGCAGTGCGGGGGCTCTGGGCCCAACGCTCAGATATTGGTCTTGTCGGAGCTCACATAAATGTTTTCTCTGGGCATTGGACTCAGAAGGATGCTGGAATTGGCACCAGCATAGACTCATTCTATGAGTATCTTTTGAAAG
CATATTTGTTACTTGGAGATGAAGAATATTTATACATGTTTCAGGAGGCCTACAAAGCTGCCATGCAGTATCTTTACAATGATCCATGGTATGTGGAGGTGAATATGAACTCAGCAGCAATTGTATGGCCATTGTTCAACAGTCTGCAGGCATTTTGGCCTGGTCTTCAGgttatgaacagaatgttgtttgggtggtac
tttattgcttagaaaatgttactgattcagttattgtttttgaaag
GTTTTGGCTGGGGATGTTGAGCCAGCTGTCCGAACACACAAAGCTTTCTTTAGTGTCTGGAAACAATTTGGATTTACACCAGAGGGCTTCAATCTTGCTACATTGAGTGTGCAGCCTGGTCAAAGGAGTTACCCCCTGCGTCCTGAGTTAATTG
AGAGCACCTACTGGCTTTTCAAAGCTACTAGCGATCCCATGTATCTTGATGTTGGACGAGACATTGTTGTCAGTTTACAGTATGCTGCACGGTGCCCTTGTGGATATTGTCACATAGCAGATGTAGAATCCCACCAACAAGATGATCACATGGAAAGCTTTTTCCTTGCTGAAACAGTATGGCTCATGATGAGTGGATGT
GTGTAGTGTTAATAGTTAAATACCTTTGGCTTCTTTTTGATTTGGCTGTGGGTGGGGAAAACATGGTGGAAAAAGGGCCATACCCATACATATTTAGCACAGAAGGCCATTTATTCCCCATGACCCCTGAGATATCTTTAACAAAAGAGCACTGCACTTATGCTGGAAGCTTTTGCAAAAGTGTCCATGGCCATGACGGT
GTGCTAAATGACT




Intron 4 GTATGTTGCA ... CCCAATGCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A120.931790
A20200
A328.571035
A40800
A523.08530
A641.181068
A73.123120
A86.92731
A92.561910
A10121112



>TRINITY_DN114039_c1_g1_i1 from sample A3 / Example spliced isoform
GTTTGGATCTTTAAGGTTCTATTGACTCCTCATTGCTCAAAGGCTTTGTAGTTGTTATTATTAGATGAGCAATGAGGCGCCCTCAAATTCCGAAGTTGTTAATCTGGTCCAATCTATGCGTATAGATAAAACCAGCTACAATTGCCTGGCGCGGAAATCTAATTATATCTGGCAAAGTTTGTCAGTGTAATTGCAATGGT
ATACGAGAAACATGAAGGGATTCAATGTATTGATATTGATATTGGCATTGCTTCCGCTTTCCACTCAGTCCAGTGGAGCTTCTGTCACTCCTCAAGAGGCAAAGCTGCTCCGAGATGAGGTTAGACAAATGTTTTATCATGCTTTTGATGGGTATATGGAATATGCTTTCCCTCTTGATGAGCTAAGGCCGTTAAGTTGT
ACAGGAGAAAACACACTGGGTGGCTATGCATTGACACTTGTTGATTCATTGGATACATTGGCACTGTTTGGTGATAAGGAAAGATTCAGTGCAGCAGTTCAATGGCTGGGCAAAAATCTGCGTTTTGATAAAATAAGTCCCAGAGTGTTTGCAACTTGAGATAAACTACCTCTTGGAGTTAGACAGCCAAGTGCCTTTGA
TCTGAATGAAGAAAAAGAACAAAACTGTTTCTGTATTTGAGACAACAATTCGAGTACTTGGAGGCTTGCTTTCAGCACATCTTATAGCAAGTGATGATGCTACAGGAATGAGGGTCGATTCTTATAACAATGAATTGCTTCATCTTTCTGAGGATTTGGCTCGAAGGATGTTACCTTCATTTGAAACTCCAACAGGGATC
CCTTATGGTTCTGTGAATCTACTATATGGTGTTGATGAAAATGAAAGCAAGGTCACTTCAACTGCTGGAGGTGGCACTCTCACCTTGGAGTTTGGGCTTTTGAGTCGCTTGATTGGAGATCCTGTTTTCGAGAAAGTTACAAAGAATGCAGTGCGGGGGCTCTGGGCCCAACGCTCAGATATTGGTCTTGTCGGAGCTCA
CATAAATGTTTTCTCTGGGCATTGGACTCAGAAGGATGCTGGAATTGGCACCAGCATAGACTCATTCTATGAGTATCTTTTGAAAGCATATTTGTTACTTGGAGATGAAGAATATTTATACATGTTTCAGGAGGCCTACAAAGCTGCCATGCAGTATCTTTACAATGATCCATGGTATGTGGAGGTGAATATGAACTCAG
CAGCAATTGTATGGCCATTGTTCAACAGTCTGCAGGCATTTTGGCCTGGTCTTCAGGTTTTGGCTGGGGATGTTGAGCCAGCTGTCCGAACACACAAAGCTTTCTTTAGTGTCTGGAAACAATTTGGATTTACACCAGAGGGCTTCAATCTTGCTACATTGAGTGTGCAGCCTGGTCAAAGGAGTTACCCCCTGCGTCCT
GAGTTAATTGAGAGCACCTACTGGCTTTTCAAAGCTACTAGCGATCCCATGTATCTTGATGTTGGACGAGACATTGTTGTCAGTTTACAGTATGCTGCACGGTGCCCTTGTGGATATTGTCACATAGCAGATGTAGAATCCCACCAACAAGATGATCACATGGAAAGCTTTTTCCTTGCTGAAACAGTATGGCTCATGAT
GAGTGGATGTGTGTAGTGTTAATAGTTAAATACCTTTGGCTTCTTTTTGATTTGGCTGTGGGTGGGGAAAACATGGTGGAAAAAGGGCCATACCCATACATATTTAGCACAGAAGGCCATTTATTCCCCATGACCCCTGAGATATCTTTAACAAAAGAGCACTGCACTTATGCTGGAAGTTTTTGCAAAAGTGTCCATCT
CCATGACGGTGTGCTAAATGACTTCAAAACTGATGTCAAGGAGGGAAAGGAATTGCAGGCAAATGAAAGGGAATTTGGCATAGGTTGGTGTCCTGCAAAAGAATCAACACAGGTGATAAAGGACAAGAATAATGTGATACATGGACTCAAGGGGGTTTGTCCAGGGTTAAGCCATTGGCGAAAGTTTGGAATTTCCTCCT
TGGCTGACGATGTGTCTATGGCAAGGAAAACAAGTACACACCCTCAAGATCATTTGGATAATCAATATGAGGCTGGTTTGAGCAAGTCTCCAATAGTTATGGTTTTCCATAAAGATGACCAAGAGTCTGTAGTTTCTGAAAATGATAATCTGATCAAGAAGCCATTATCAGGTAGTGGAAGTATTTATGGTCAAGATCTT
ACTGAGAATGAAAATTTAGATGATCAAGGAAATAGGATATCTATTGCCAGGACTATCAATAATTTACATCGCAGCAGTGTAGATGATAGAACTCTGCAAAATTTTTCAGAGGAAAGTTAGTTTATGCTGTGAAATTAGAAAAAGGAATAATCCAGAATGGTATGAATGATGTTTATTTATGGCTTTGTTAAATCCTGAAT
ATGTTTTCTCATATCAGGATTCATTGTTAGAATTTCCTATCATGCATCTTAAGTTCGAAACTTCGATATGCTTACATTGGTGTGGTTCAGATTCTGTGTTTAGACAATCCTCCATTTTTTGTGCACAGACAAATGAAGTTTTGTCCAATTAAACAAAAAGAAACAAAGCCCCAACTATGGTTAACCAGGTTTGAGAATCC
ACTTATTACATTATTGACTTCTCTTTATTCTTTTCTGTTTGATTTTCCCCG


>TRINITY_DN114039_c1_g1_i6 from sample A3 / Example unspliced isoform:
GTTTGGATCTTTAAGGTTCTATTGACTCCTCATTGCTCAAAGGCTTTGTAGTTGTTATTATTAGATGAGCAATGAGGCGCCCTCAAATTCCGAAGTTGTTAATCTGGTCCAATCTATGCGTATAGATAAAACCAGCTACAATTGCCTGGCGCGGAAATCTAATTATATCTGGCAAAGTTTGTCAGTGTAATTGCAATGGT
ATACGAGAAACATGAAGGGATTCAATGTATTGATATTGATATTGGCATTGCTTCCGCTTTCCACTCAGTCCAGTGGAGCTTCTGTCACTCCTCAAGAGGCAAAGCTGCTCCGAGATGAGGTTAGACAAATGTTTTATCATGCTTTTGATGGGTATATGGAATATGCTTTCCCTCTTGATGAGCTAAGGCCGTTAAGTTGT
ACAGGAGAAAACACACTGGGTGGCTATGCATTGACACTTGTTGATTCATTGGATACATTGGCACTGTTTGGTGATAAGGAAAGATTCAGTGCAGCAGTTCAATGGCTGGGCAAAAATCTGCGTTTTGATAAAAACAAAACTGTTTCTGTATTTGAGACAACAATTCGAGTACTTGGAGGCTTGCTTTCAGCACATCTTAT
AGCAAGTGATGATGCTACAGGAATGAGGGTCGATTCTTATAACAATGAATTGCTTCATCTTTCTGAGGATTTGGCTCGAAGGATGTTACCTTCATTTGAAACTCCAACAGGGATCCCTTATGGTTCTGTGAATCTACTATATGGTGTTGATGAAAATGAAAGCAAGGTCACTTCAACTGCTGGAGGTGGCACTCTCACCT
TGGAGTTTGGGCTTTTGAGTCGCTTGATTGGAGATCCTGTTTTCGAGAAAGTTACAAAGAATGCAGTGCGGGGGCTCTGGGCCCAACGCTCAGATATTGGTCTTGTCGGAGCTCACATAAATGTTTTCTCTGGGCATTGGACTCAGAAGGATGCTGGAATTGGCACCAGCATAGACTCATTCTATGAGTATCTTTTGAAA
GCATATTTGTTACTTGGAGATGAAGAATATTTATACATGTTTCAGGAGGCCTACAAAGCTGCCATGCAGTATCTTTACAATGATCCATGGTATGTGGAGGTGAATATGAACTCAGCAGCAATTGTATGGCCATTGTTCAACAGTCTGCAGGCATTTTGGCCTGGTCTTCAGGTTTTGGCTGGGGATGTTGAGCCAGCTGT
CCGAACACACAAAGCTTTCTTTAGTGTCTGGAAACAATTTGGATTTACACCAGAGGGCTTCAATCTTGCTACATTGAGTGTGCAGCCTGGTCAAAGGAGTTACCCCCTGCGTCCTGAGTTAATTGAGAGCACCTACTGGCTTTTCAAAGCTACTAGCGATCCCATGTATCTTGATGTTGGACGAGACATTGTTGTCAGTT
TACAGTATGCTGCACGGTGCCCTTGTGGATATTGTCACATAGCAGATGTAGAATCCCACCAACAAGATGATCACATGGAAAGCTTTTTCCTTGCTGAAACAGTATGGCTCATGATGAGTGGATGTGTGTAGTGTTAATAgtatgttgcacttcctcggggtttatttgttctatttttggccttatttcctctatgcatt
taacatccataaaatctttgcagtaatatagagctattaactcattacagcaaatcccaatgcag
GTTAAATACCTTTGGCTTCTTTTTGATTTGGCTGTGGGTGGGGAAAACATGGTGGAAAAAGGGCCATACCCGTAAGTGGATGTTTGCGATGCACTTTCAGTCAAGCTCAAAAATTAGTGTGAGAGAAAAATATGT
GGATAATTCACTAAGTATATGTGTTTTGCGTCTTCAGATACATATTTAGCACAGAAGGCCT




Intron 5 GTAAGTGGAT ... GCGTCTTCAG

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>TRINITY_DN114039_c1_g1_i1 from sample A3 / Example spliced isoform
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ATACGAGAAACATGAAGGGATTCAATGTATTGATATTGATATTGGCATTGCTTCCGCTTTCCACTCAGTCCAGTGGAGCTTCTGTCACTCCTCAAGAGGCAAAGCTGCTCCGAGATGAGGTTAGACAAATGTTTTATCATGCTTTTGATGGGTATATGGAATATGCTTTCCCTCTTGATGAGCTAAGGCCGTTAAGTTGT
ACAGGAGAAAACACACTGGGTGGCTATGCATTGACACTTGTTGATTCATTGGATACATTGGCACTGTTTGGTGATAAGGAAAGATTCAGTGCAGCAGTTCAATGGCTGGGCAAAAATCTGCGTTTTGATAAAATAAGTCCCAGAGTGTTTGCAACTTGAGATAAACTACCTCTTGGAGTTAGACAGCCAAGTGCCTTTGA
TCTGAATGAAGAAAAAGAACAAAACTGTTTCTGTATTTGAGACAACAATTCGAGTACTTGGAGGCTTGCTTTCAGCACATCTTATAGCAAGTGATGATGCTACAGGAATGAGGGTCGATTCTTATAACAATGAATTGCTTCATCTTTCTGAGGATTTGGCTCGAAGGATGTTACCTTCATTTGAAACTCCAACAGGGATC
CCTTATGGTTCTGTGAATCTACTATATGGTGTTGATGAAAATGAAAGCAAGGTCACTTCAACTGCTGGAGGTGGCACTCTCACCTTGGAGTTTGGGCTTTTGAGTCGCTTGATTGGAGATCCTGTTTTCGAGAAAGTTACAAAGAATGCAGTGCGGGGGCTCTGGGCCCAACGCTCAGATATTGGTCTTGTCGGAGCTCA
CATAAATGTTTTCTCTGGGCATTGGACTCAGAAGGATGCTGGAATTGGCACCAGCATAGACTCATTCTATGAGTATCTTTTGAAAGCATATTTGTTACTTGGAGATGAAGAATATTTATACATGTTTCAGGAGGCCTACAAAGCTGCCATGCAGTATCTTTACAATGATCCATGGTATGTGGAGGTGAATATGAACTCAG
CAGCAATTGTATGGCCATTGTTCAACAGTCTGCAGGCATTTTGGCCTGGTCTTCAGGTTTTGGCTGGGGATGTTGAGCCAGCTGTCCGAACACACAAAGCTTTCTTTAGTGTCTGGAAACAATTTGGATTTACACCAGAGGGCTTCAATCTTGCTACATTGAGTGTGCAGCCTGGTCAAAGGAGTTACCCCCTGCGTCCT
GAGTTAATTGAGAGCACCTACTGGCTTTTCAAAGCTACTAGCGATCCCATGTATCTTGATGTTGGACGAGACATTGTTGTCAGTTTACAGTATGCTGCACGGTGCCCTTGTGGATATTGTCACATAGCAGATGTAGAATCCCACCAACAAGATGATCACATGGAAAGCTTTTTCCTTGCTGAAACAGTATGGCTCATGAT
GAGTGGATGTGTGTAGTGTTAATAGTTAAATACCTTTGGCTTCTTTTTGATTTGGCTGTGGGTGGGGAAAACATGGTGGAAAAAGGGCCATACCCATACATATTTAGCACAGAAGGCCATTTATTCCCCATGACCCCTGAGATATCTTTAACAAAAGAGCACTGCACTTATGCTGGAAGTTTTTGCAAAAGTGTCCATCT
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TGGCTGACGATGTGTCTATGGCAAGGAAAACAAGTACACACCCTCAAGATCATTTGGATAATCAATATGAGGCTGGTTTGAGCAAGTCTCCAATAGTTATGGTTTTCCATAAAGATGACCAAGAGTCTGTAGTTTCTGAAAATGATAATCTGATCAAGAAGCCATTATCAGGTAGTGGAAGTATTTATGGTCAAGATCTT
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ATGTTTTCTCATATCAGGATTCATTGTTAGAATTTCCTATCATGCATCTTAAGTTCGAAACTTCGATATGCTTACATTGGTGTGGTTCAGATTCTGTGTTTAGACAATCCTCCATTTTTTGTGCACAGACAAATGAAGTTTTGTCCAATTAAACAAAAAGAAACAAAGCCCCAACTATGGTTAACCAGGTTTGAGAATCC
ACTTATTACATTATTGACTTCTCTTTATTCTTTTCTGTTTGATTTTCCCCG


>TRINITY_DN114039_c1_g1_i6 from sample A3 / Example unspliced isoform:
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TAACATCCATAAAATCTTTGCAGTAATATAGAGCTATTAACTCATTACAGCAAATCCCAATGCAGGTTAAATACCTTTGGCTTCTTTTTGATTTGGCTGTGGGTGGGGAAAACATGGTGGAAAAAGGGCCATACCCgtaagtggatgtttgcgatgcactttcagtcaagctcaaaaattagtgtgagagaaaaatatgt
ggataattcactaagtatatgtgttttgcgtcttcag
ATACATATTTAGCACAGAAGGCCT