sp|A8MR93|ALG12_ARATH ----> Dol-P-Man:Man(7)GlcNAc(2)-PP-Dol alpha-1,6-mannosyltransferase
Intron 1 GTCAGATTGA ... CTGGCTGTAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 44.15 | 9 | 5.3 | 9 |
| A2 | 68.69 | 3.6 | 6.7 | 9 |
| A3 | 66.11 | 3 | 6.7 | 5 |
| A4 | 49.04 | 13.4 | 21.9 | 4 |
| A5 | 64.1 | 2.8 | 2.9 | 6 |
| A6 | 65.03 | 6.8 | 10.9 | 14 |
| A7 | 58.49 | 13.2 | 19.2 | 17 |
| A8 | 60.76 | 7 | 9.6 | 11 |
| A9 | 56.01 | 13.4 | 20.9 | 13 |
| A10 | 44.87 | 10.2 | 7.8 | 9 |
>TRINITY_DN111703_c1_g3_i1 from sample A3 / Example spliced isoformCTCAACCACTCCATTTTGCTGTGAAGTGTAGGGTGTGGTGTATTGTCTTTGTATCCCATGGTTAGCACATAAATTTTTAAACTTTTTAGTAGATCAAGAAATGTTTATAAAATGAAATGCAAGTGTTTAGATTTCTCTAACTAAATTGATCGAATTATGTAGGTGCTCTTATTGTATCTCTACTATCATCACCATTTATA
GCAGCTATCAATCTCTTAAAACTACCAAAGCTGTATGGAATTTTAATCGCTCGTCTGGTACTAGGGAGCATTGTATTGTCAGGTTTACATCTTTTTCGAATGCAGTAAACTTGGCATATGCTTTTTGGATAAACGGGCTCCCCTTTGCAACATTGAGATGCCTGGTACATTCTACTCTATCTTCCTCGGAAAAGTGAAAA
GATTACTTTATCGTCACACATACATGTCAACTCGCATGCACACAAGCACACACAGTACTCCAAATTTCAAAGATTTGATTTCTTGGTGCTTTCCAATATAGTCCAAGTTTGTGGTCATTCGTTGGACATTGATAGAATTATCTTATCTCATCTTATCTAGCTTATATGAAATGATAAAAAGAAACTAGTCTTGCAGCTTT
GTGGTCATGACATGGTTTAATTGGTAACATTTCTAATATTGTTTTTTTCTTAGCTCTTATTTTTTCATTTTAGTATACATTTTCATTATATTAAGAATATAAAAAATTTACAACAATAGTGGGTAGCTGGATGCAATATTAGTAATTACAAGACAACCTGGCTAATCAAACTCTATGATTTTGTCAACGGGAGATGTTGG
CAATACCAATCTCACATTTAAAGGGCATACAGTAGAGGTAGTAACCTCTTATACTTAATTGCAAGTGGTTTTCTCTAGCCCACCCTTTAGCTTGAAGTAGTTTTCTCTAGAATCTAGATTGAGCAAGGGTTATAAAACTATTATAACTTTGGAAATATAGATTTTTTAGTTGTGGTTCCCTGATATATGGTCTTAAGGTT
TGTGTTTTTCATTCCTTAGTAACACTATCTCTCAAGGTGGCTCCATCTGTGGCTTGGTTGATTCGTGGGCTGTCCAAGCAATGAATCTGTGGTTCCACCCAGAATTTTAGGAGATTGTCTAGAGCTTTTGTTTAGCAGGGTCTTTTCAGTGGAGTGTAACCTAATTTGCATCCTCTTTTCTGATAACCACCTTAGAACCA
TAGACCAATTGTGCAATTACATACATTGTGGGTTTAAAAATAGAGGAGTTTATTGAGTGGAAATAGAAAGAGGGTCCATGGATGACTATACTCACAGAAACCAGTGAATTCTGCAACAGGGAACAATTTGAGTACCTTAAAAACTGCAATAGTAACAGAGGGATCAACTTACAGCCCCACTGATATAGTCATGGAGTTGG
ATTTCTTGTACTGGGAATCCCAGAGTAAAAACCTACTATGATGGATGGAGTCCCTTGAACTCGAGAATGACAAGCCCCATGCAGAGATGCACATTCTCTCTACTAGAT
>TRINITY_DN111703_c1_g3_i7 from sample A3 / Example unspliced isoform:ATATGTATATATACTGTCACAGTGGTTCTAACATATTCTTATTCAATTATTTATTTATTATTTTCCTATATGGATTTCTATTTATTGTCCTTCCTATGTTGGAGATATGCTAGTAAATGAACTTATGTTCATTTCAGATTGATAATGAGTTTGATGACAATGAAATAGAGGAGGTTTTCATGTTTTAAGAGGCCAACTCT
TTGAAAACATAAGGGATTTGGTGTAGATGTAGCTCACCATGGATCATTGTCCAATAATTTGGGAGATCTAAGATTTGGGATATTGAGAATATGAAATTCTGGAACTCGGGAATTCAATAGACTTGGAACTTGGGAATTATACCTTTATGAGGTTGATGAGACAACTTGATGGAGTACCTGCATGGTCCCAGAACCGTGGA
GAGGGGAAATCACCCAAGAAGTTTACTTTTAATATTTGGTTATCAATCAATTTTTTAATAGTTAGTATTATAGCTGTAACAAGTGTTAGAGCATAAGGTTTCGATGATGCATATAATAAAGTCACGTGTTATAAGTGACTCTGATAAATAGTTAATAGGATTTAATTTTAATTGGTGTCATTAATAGGGTAGTTAGATTA
GGTAGTTAGGTCATGCAAATCTATAAAAGGGATCAATGTTATTGTAAAAGAGCATTCCACATTTAATAATGATCGTGTTAGCATTTGTGTGTATATTGTTTTTGCTGCGTAGTCTATATTTTCTGTTGCAAGCACCATTTATCCCTCTCATCTGCACTCCAATAAAAATCTTTTGATCTTGCCACGAAGTGAGAGAAAGT
TAACTGCATGGCATATATGCAACTCGGTTGAAGCAAGATATGGCATGCATCCAAGATATGTATGTAAGAAGCAACACTATCATAAATCATTTTTTTGTCAGTTTGGTAAGATTCTTAGAGAGAAAAGGAAGTTTGTGTTTTATCCATTTGTGAGAATATGCTTTCATGCTTTATAGTTTGCAATTTCTTCATATGATTTG
GTTTATCATTTATGCAGGCAATACATGATATCCTTTATCATCACTATCACTTAGAAAAGTATGATCATTTTGAATTTCCAGGAGTTGTACCCCGCACCTTCATAGGTGCTCTTATTGTATCTCTACTATCATCACCATTTATAGCAGCTATCAATCTCTTAAAACTACCAAAGCTGTATGGAATTTTAATCGCTCGTCTG
GTACTAGGGAGCATTGTATTGTCAGGTTTACATCTTTTTCGAATGCAGgtcagattgaagtttggtcaacaggtctccaacttatttgcaataatgatagctctgcagttccatcttttattttactgttcaagaccacttccaaatatttttgctctggctgtagTAAACTTGGCATATGCTTTTTGGATAAACGGGCT
CCCCTTTGCAACATTGAGATGCCTGGTTTTTTCGATGGTTGTGTTCAGATGTGATATTGTGTTGCTCCTGTGTCCTATTGGTTTACACTTTCTGCTGACTAGACAAGTTACGTTATTGAGCGCTGTAAGATGCTGTGCAACTACAGCTCTTTTGAGCATAGGGGCTACAATCCTGATTGACTCAATTATGTGGAAAAGGA
TCACATGGCCAGAAATGGAGGTTTTCTGGTTTAATTCTGTCTTGAACCGTAGCTCTGAATGGGGTGTATTTCCGGTGCATTGGTATTTTACATCAGCTCTTCCACGATCAATGTTGGCGGCATTTCCACTGTGCTTTCTAGGTGTAATCCTTGAGAGAAGGATGCTAGAGTACATGTTACCTGTCTTTGCCTTTATTGTA
CTTTACTCCAAACTTCCACACAAGGAGCTCCGGTTTATAATTTTGGCAATTCCCATGCTGAACCTCTCTGCAGCAATTGCAGCTACAAGAATTTACAACAACAGGAAGAAAACAATCTGGAAGTGGGCATACATTGGCATGATTGGCTCACTCTTTGCAAGTTTAGGATTCTCTATGATTATGAGTGCTGCTTCATATGC
AAACTACCCAGCTGGCTATGCACTAGATGCTCTTCACCATAAAGACTTTAACAGAACTTCCAGCTGTGTGGTTCACATTGATTCAATGGCAGCAATGAATGGTATTTCCCGCTTTTGTGAAAAGGATCTTCTTTGGAGGTATTCCAAGGAAGAACATATTTCTGATGAAGAAATCCTTGCCAAAAGTTTTACGTATCTGA
TCAATGAACGTTCAAGAATACCTGGCTTTAAATGCTTATTGGCTACCTCTGGATTTTCTAGGCTACTTGTTCAGCTCTCCTTCCCACCTGTTCGCCTGTTAACTGAGCCCAAAGTTTTTGTCCATGGCAATATAAGAAGTGAAGGTATTGAAGATATAAGATGGCCTGGTTGTCCTTACTCCTAGCAGGAGAACCACACA
GCTGTCAACTTATCCAATAATATTACTAGAGTTGAAGTGTTTAATCTTAATTGTCCAAGAATGGTATTCTTCCAGCATTGCAGTGGAAGATTGCAATGCTTGAATCACATTTAAGGGTTATTCTTTTGTATATGGAACCCTGCCATATCTAAGCATAGGTGC
Intron 2 GTATGTCAAA ... AATGGTTCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 13.68 | 19.8 | 2.6 | 3.7 |
| A2 | 8.21 | 30.3 | 2.3 | 3.1 |
| A3 | 1.89 | 17.1 | 0.6 | 0.1 |
| A4 | 18.11 | 20.2 | 4.5 | 4.6 |
| A5 | 30.98 | 2.7 | 1.3 | 1 |
| A6 | 0.75 | 21 | 0 | 0.4 |
| A7 | 1.81 | 40.5 | 0.9 | 0.7 |
| A8 | 1.63 | 41.9 | 0.6 | 0.9 |
| A9 | 0.67 | 31.8 | 0 | 0.5 |
| A10 | 0.23 | 24.1 | 0 | 0.1 |
>TRINITY_DN121540_c9_g1_i5 from sample A1 / Example spliced isoformCTTTGCAACATTGAGATGCCTGGTTTTTTCGATGGTTGTGTTCAGATGTGATATTGTGTTGCTCCTGTGTCCTATTGGTTTACACTTTCTGCTGACTAGACAAGTTACGTTATTGAGCGCTGTAAGATGCTGTGCAACTACAGCTCTTTTGAGCATAGGGGCTACAATCCTGATTGACTCAATTATGTGGAAAAGGATCA
CATGGCCAGAAATGGAGGTTTTCTGGTTTAATTCTGTCTTGAACCGTAGCTCTGAATGGGGTGTATTTCCGGTGCATTGGTATTTTACATCAGCTCTTCCACGATCAATGTTGGCGGCATTTCCACTGTGCTTTCTAGGTGTAATCCTTGAGAGAAGGATGCTAGAGTACATGTTACCTGTCTTTGCCTTTATTGTACTT
TACTCCAAACTTCCACACAAGGAGCTCCGGTTTATAATTTTGGCAATTCCCATGCTGAACCTCTCTGCAGCAATTGCAGCTACAAGAATGTATTGTTCATGTTTTTCTTGAAAATCAATTTCCATGTCCCAAAGCCATCTTATTAATTCTATACAGCAATGAAATCTTGCATTTCACTTTGCTTGGATATGTCTTCTGGA
AGTGCTGTTAGTTTTATAAACACAATTGACAGATACTGTGTTCCAGTAATTACTAATTACAAGCTTCAATGTCTGTAGTGAATTTTGAAATTAAATTTCAGCCACCTCTATTGCAATATTTGATAAATAGCGGACTCTGGC
>TRINITY_DN121540_c9_g1_i4 from sample A1 / Example unspliced isoform:GGTTGGGAGACTTACCCGTGGTCAAGTGTGTTTTAGGCGGCAACAGTATCCAAATATGCAGGTTGGTCTTTGCACAAGGAAGATGCCTGTCCATTCTCTTGCCATTATTGCTAACACATCAGAACCATCTGACTTATTCTTCATGGGTACTTGATGTTTGCTTCAAGGATGACCTGGTTCTTGTCTGAAGTATGCAAGCT
AGAAAAAGACTGCTATGTATCAAGTGGATTGGATTCTTCTCTGTATCATCAGGCTTGAAAACTGTTTATGTAGAGCTATTAGTTATTCCATTTTCTCACAAAGTTTGATGTTTTAGAATGGAAATGAGCTAAATTGTAACAATTGTGGTACCTTTGTTGTTAATGACAGCTAGGTGTAATCCTTGAGAGAAGGATGCTAG
AGTACATGTTACCTGTCTTTGCCTTTATTGTACTTTACTCCAAACTTCCACACAAGgtatgtcaaaaatgttttccctggtgtttacttcaaactttagttatgtaatattttttcatgtaaaatgtttgcatatgatatgacagatttcattgtttttaaatggttcagGAGCTCCGGTTTATAATTTTGGCAATTCCC
ATGCTGAACCTCTCTGCAGCAATTGCAGCTACAAGAATGTATTGTTCATGTTTTTCTTGAAAATCAATTTCCATGTCCCAAAGCCATCTTATTAATTCTATACAGCAATGAAATCTTGCATTTCACTTTGCTTGGATATGTCTTCTGGAAGTGCTGTTAGTTTTATAAACACAATTGACAGATACTGTGTTCCAGTAATT
ACTAATTACAAGCTTCAATGTCTGTAGTGAATTTTGAAATTAAATTTCAGCCACCTCTATTGCAATATTTGATAAATAGCGGACTCTGGC
Intron 3 GTATCCTGAC ... GCATCTTAAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 44.07 | 16.5 | 13 | 4.4 |
| A2 | 35.9 | 21.5 | 12 | 5.5 |
| A3 | 26.54 | 13.8 | 5 | 3.4 |
| A4 | 27.4 | 13.4 | 5 | 3.8 |
| A5 | 41.18 | 7.2 | 5 | 2 |
| A6 | 16.44 | 15.4 | 3 | 2.8 |
| A7 | 25.07 | 33.3 | 11 | 6.2 |
| A8 | 28.88 | 40.8 | 16 | 24.1 |
| A9 | 31.94 | 28.2 | 13 | 8.2 |
| A10 | 50 | 5 | 5 | 1 |
>TRINITY_DN111877_c1_g1_i14 from sample A2 / Example spliced isoformGAGTATTTAGTTCTAACTTCTAACTTCTAAGATGCTTAGTTTAATGAATTAATGCAGCCATAGAAGTCCTGAAGATTTGCCATTCCATATCCTTCAAGTACAAGTCTTTTTAAATGGATGTTTCAAGTCATTGAGGGCAATGCTTCATCATGGGTGGTAATTATATATAACAGGGTATTCCCTTTTATTATATGTTTATG
TCAAATTGCTGGCAAAATGAAAACTTATTAAGAATCTTTTTTTTCTGTTCTGTCCATGTTCTGCTCCCTGTATGCATAAATATTGCTTTTGTATGTCTCTCACAAATTGTGTTGCAACTTTTTTATATCATGCAACCTTTATAGGTATCAGAATTGTTCTGATTTATATTTTGCACCTTTGGCAGACTAGACAAGTTACG
TTATTGAGCGCTGTAAGATGCTGTGCAACTACAGCTCTTTTGAGCATAGGGGCTACAATCCTGATTGACTCAATTATGTGGAAAAGGATCACATGGCCAGAAATGGAGGTTTTCTGGTTTAATTCTGTCTTGAACCGTAGCTCTGAATGGGGTGTATTTCCGGTGCATTGGTATTTTACATCAGCTCTTCCACGATCAAT
GTTGGCGGCATTTCCACTGTGCTTTCTAGGTGTAATCCTTGAGAGAAGGATGCTAGAGTACATGTTACCTGTCTTTGCCTTTATTGTACTTTACTCCAAACTTCCACACAAGGAGCTCCGGTTTATAATTTTGGCAATTCCCATGCTGAACCTCTCTGCAGCAATTGCAGCTACAAGAATTTACAACAACAGGAAGAAAA
CAATCTGGAAGTGGGCATACATTGGCATGATTGGCTCACTCTTTGCAAGTTTAGGATTCTCTATGATTATGAGTGCTGCTTCATATGCAAACTACCCAGCTGGCTATGCACTAGATGCTCTTCACCATAAAGACTTTAACAGAACTTCCAGCTGTGTGGTTCACATTGATTCAATGGCAGCAATGAATGGTATTTCCCGC
TTTTGTGAAAAGGATCTTCTTTGGAGGTATTCCAAGGAAGAACATATTTCTGATGAAGAAATCCTTGCCAAAAGTTTTACGTATCTGATCAATGAACGTTCAAGAATACCTGGCTTTAAATGCTTATTGGCTACCTCTGGATTTTCTAGGCTACTTGTTCAGCTCTCCTTCCCACCTGTTCGCCTGTTAACTGAGCCCAA
AGTTTTTGTCCATGGCAATATAAGAAGTGAAGGTATTGAAGATATAAGATGGCCTGGTTGTCCTTACTCCTAGCAGGAGAACCACACAGCTGTCAACTTATCCAATAATATTACTAGAGTTGAAGTGTTTAATCTTAATTGTCCAAGAATGGTATTCTTCCAGCATTGCAGTGGAAGATTGCAATGCTTGAATCACATTT
AAGGGTTATTCTTTTGTATATGGAACCCTGCCATATCTAAGCATAGGTGTTTTTTATCATAATAACATTTAATTTATTTTATTTTCACTGTGTTTAAATCATAGGCTGTATTGACATTTCCTGTATGGAAATTCAGACCATGTTTAAAATACGGTGAATATTTGGCATAGTTCCGATACGATACATTCAACTCTTGACCA
AATTATTTATTTATAAAAACACATTTTGAATTTTGAATTATTTTCTACTATATTATCATGAGTCTTGTATGCTGTTGGCTGTAGAATAGTGAATGTGAGTCTGCAATTTTTAATTAATTTATATAATTAATTATTGTCCTTTTTTATGCATGTTGTCATTTAAAGTTTTATTACGTTTTTTAATGTAGTCTTCCATTTAA
GTTTTACTTTTTCGCTTTTACCATTTACCAAGTTAAGTAACTTAAAGGTTAAGAGTTACGGTTACTTATTTTTTTTTTAAAAGATGAGGGTCACGTC
>TRINITY_DN111877_c1_g1_i4 from sample A2 / Example unspliced isoform:GTCTGATCTTCGCCTGGTGGCGAGTCTAAGAAATTATATATTGTTGAACTAGAGATTTAATGGCATGCGAGTAGTGATGGTTTTCTTGCTGAAGGCCGGTAGGAGATTCTGGAGTGACAAAATCATGCTGGACAGATGGGATATGTTGTTAATGGCTATTGCAACATTTCATGTGTTCTTGGCTCCTTACACAAAAGTTG
AAGAGAGCTTCAATGTCCAGGCAATACATGATATCCTTTATCATCACTATCACTTAGAAAAGTATGATCATTTTGAATTTCCAGGAGTTGTACCCCGCACCTTCATAGGTGCTCTTATTGTATCTCTACTATCATCACCATTTATAGCAGCTATCAATCTCTTAAAACTACCAAAGCTGTATGGAATTTTAATCGCTCGT
CTGGTACTAGGGAGCATTGTATTGTCAGGTTTACATCTTTTTCGAATGCAGGTCAGATTGAAGTTTGGTCAACAGGTCTCCAACTTATTTGCAATAATGATAGCTCTGCAGTTCCATCTTTTATTTTACTGTTCAAGACCACTTCCAAATATTTTTGCTCTGGCTGTAGTAAACTTGGCATATGCTTTTTGGATAAACGG
GCTCCCCTTTGCAACATTGAGATGCCTGGTTTTTTCGATGGTTGTGTTCAGATGTGATATTGTGTTGCTCCTGTGTCCTATTGGTTTACACTTTCTGCTGACTAGACAAGTTACGTTATTGAGCGCTGTAAGATGCTGTGCAACTACAGCTCTTTTGAGCATAGGGGCTACAATCCTGATTGACTCAATTATGTGGAAAA
GGATCACATGGCCAGAAATGGAGGTTTTCTGGTTTAATTCTGTCTTGAACCGTAGCTCTGAATGGGGTgtatcctgacattctttcaaaaacaaatgcatttatgcagatcagtttgaagtgcttagttttggcaacaaataatcaatggatgcatcttaagGTATTTCCGGTGCATTGGTATTTTACATCAGCTCTTCC
ACGATCAATGTTGGCGGCATTTCCACTGTGCTTT
Intron 4 GTTCTGATTT ... GTTGAACTAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 55.56 | 24 | 3 | 30 |
| A2 | 62.5 | 21 | 6 | 35 |
| A3 | 73.91 | 6 | 9 | 17 |
| A4 | 65 | 14 | 5 | 26 |
| A5 | 68.75 | 10 | 4 | 22 |
| A6 | 58.82 | 14 | 0 | 20 |
| A7 | 66.67 | 9 | 0 | 18 |
| A8 | 75.76 | 8 | 3 | 25 |
| A9 | 62.5 | 9 | 1 | 15 |
| A10 | 61.9 | 8 | 2 | 13 |
>TRINITY_DN111877_c1_g1_i20 from sample A2 / Example spliced isoformGTAAAGTCCACCCATATTCTTTTTACAGAGTTGCTTTTCTCATTTGCCTCAGAAAAATACTCGGCAATCTGGTTGATTTGATCTACAAGTATCATATGTAAAAGAGATTTAATGGCATGCGAGTAGTGATGGTTTTCTTGCTGAAGGCCGGTAGGAGATTCTGGAGTGACAAAATCATGCTGGACAGATGGGATATGTTG
TTAATGGCTATTGCAACATTTCATGTGTTCTTGGCTCCTTACACAAAAGTTGAAGAGAGCTTCAATGTCCAGGCAATACATGATATCCTTTATCATCACTATCACTTAGAAAAGTATGATCATTTTGAATTTCCAGGAGTTGTACCCCGCACCTTCATAGGTGCTCTTATTGTATCTCTACTATCATCACCATTTATAGC
AGCTATCAATCTCTTAAAACTACCAAAGCTGTATGGAATTTTAATCGCTCGTCTGGTACTAGGGAGCATTGTATTGTCAGGTTTACATCTTTTTCGAATGCAGGTCAGATTGAAGTTTGGTCAACAGGTCTCCAACTTATTTGCAATAATGATAGCTCTGCAGTTCCATCTTTTATTTTACTGTTCAAGACCACTTCCAA
ATATTTTTGCTCTGGCTGTAGTAAACTTGGCATATGCTTTTTGGATAAACGGGCTCCCCTTTGCAACATTGAGATGCCTGGTTTTTTCGATGGTTGTGTTCAGATGTGATATTGTGTTGCTCCTGTGTCCTATTGGTTTACACTTTCTGCTGACTAGACAAGTTACGTTATTGAGCGCTGTAAGATGCTGTGCAACTACA
GCTCTTTTGAGCATAGGGGCTACAATCCTGATTGACTCAATTATGTGGAAAAGGATCACATGGCCAGAAATGGAGGTTTTCTGGTTTAATTCTGTCTTGAACCGTAGCTCTGAATGGGGTGTATTTCCGGTGCATTGGTATTTTACATCAGCTCTTCCACGATCAATGTTGGCGGCATTTCCACTGTGCTTTGTAAGTTC
TGTTATGCTAATGGTCTTACTTTTCTGTCTTGTCATCTTTTTATTAATAAATTATAAAGTTCTTATCAGACAATCAAACAAAGATAAATGAAATGGATGAAACTTAGGACATTTCATATTATTTCATCGTGAGCAATCTGTATTGAGTTGGTTAATGTTCCTAATGCTTGACACTAGTTA
>TRINITY_DN111877_c1_g1_i12 from sample A2 / Example unspliced isoform:GTAAAGTCCACCCATATTCTTTTTACAGAGTTGCTTTTCTCATTTGCCTCAGAAAAATACTCGGCAATCTGGTTGATTTGATCTACAAGTATCATATGTAAAAGgttctgatttatataaatggtgataacgtatattggctaatttagaatctgtaacttatgtgatccaggtctaagaaattatatattgttgaacta
gAGATTTAATGGCATGCGAGTAGTGATGGTTTTCTTGCTGAAGGCCGGTAGGAGATTCTGGAGTGACAAAATCATGCTGGACAGATGGGATATGTTGTTAATGGCTATTGCAACATTTCATGTGTTCTTGGCTCCTTACACAAAAGTTGAAGAGAGCTTCAATGTCCAGGTAAGTAATTGGTCTTTACATGTGCAATGGA
ATATAAATTACAGTTTACTGCTTTAACACAGTAGAAGAAAAGAAAGATTGACAATTAACTGACACAAGCTATTGGTTCTTGCTCTACTCATAAAGCTTCTTCTGGAAAATATTTGTATTTCCTTGCTAAAGTTGAAGCTTAGGGTTGGATTCAATCATATTTTTTGATAGCATAATATGGGTGCGATTCTTGTACTTGTA
TGCCTTATTATATTGTTAGGAGTATGCCAAGGTACTGCTCCTTATTTCATTTTTTGTATGTTGTTATGCATTTCAATATTTTCATTTTGATATTGTGTGCTTTCTTGAGGTACTTCATGTACTTGTGAGATTATTTAGTTGATTATATGATACTTCAGAGGCTTTTTCTTGGATCGTGATTATGTCACATTCTCTTTCTT
AAAACGATCGTATTAATTTCTTATTATAGGTTTGAAAAAGACATTGAGAAATGCACAAAGTGTGAGTATTAAGTGATTGATCAAGTGATGTAATTTGGTACCTCTGATGGACTACCTGAAAGCTCATTTAACATGAAGTCTTGTTGCATTCGATGCTATGAACTTGTTTACAGACTGACAATGAAGTGAAATTATATTAA
TATCCAGTAATGCCCAAAGGAAGATCAATGGGACTGGAGTACAATCGTTACACAGCAAAATAAAGAGTGTCTAGAGGATCTCGTAGAATGATGAGAAATCTAGTCTAACATCAGTGTGAGAAGATAATAAAGGAAAAATAGCAGAGATTAACCAAGGATGGGAACCCTATACAATGTATAAGAGAATAGTCAAGAAGAAT
AGGAAAATGTCGATGACAGGTCACTAGTCTTTGTTTTATGAGTCACTGGAAGAATATGCAATGTCGTTGATCACAATAATGTCTTTGATGTTGAGCTTGATGATGTCACTGGGAGAGTGCCTTGGGCTAAGAGGAGGTGGCTAACGAGGGGGTTTGTAAGGGACCCCTTGCAACAACTCTCCTACCATCCAAGGCTGACA
TACTCATCACTAGTAGATTAGAGCTATAAATTTGCAGGGGATTGCTACCTCTTGTCCAT
Intron 5 GTATTGTTCA ... TGTTTTGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 41.94 | 18 | 5 | 13 |
| A2 | 16 | 21 | 1 | 4 |
| A3 | 39.29 | 17 | 0 | 11 |
| A4 | 25 | 18 | 0 | 6 |
| A5 | 42.86 | 4 | 0 | 3 |
| A6 | 33.33 | 26 | 0 | 13 |
| A7 | 31.82 | 45 | 1 | 21 |
| A8 | 21.05 | 30 | 1 | 8 |
| A9 | 18.92 | 30 | 0 | 7 |
| A10 | 34.29 | 23 | 0 | 12 |
>TRINITY_DN40617_c0_g1_i8 from sample A8 / Example spliced isoformCAGAAAAATACTCGGCAATCTGGTTGATTTGATCTACAAGTATCATATGTAAAAGGTTCTGATTTATATAAATGGTGATAACGTATATTGGCTAATTTAGAATCTGTAACTTATGTGATCCAGGTCTAAGAAATTATATATTGTTGAACTAGAGATTTAATGGCATGCGAGTAGTGATGGTTTTCTTGCTGAAGGCCGGT
AGGAGATTCTGGAGTGACAAAATCATGCTGGACAGATGGGATATGTTGTTAATGGCTATTGCAACATTTCATGTGTTCTTGGCTCCTTACACAAAAGTTGAAGAGAGCTTCAATGTCCAGGCAATACATGATATCCTTTATCATCACTATCACTTAGAAAAGTATGATCATTTTGAATTTCCAGGAGTTGTACCCCGCAC
CTTCATAGGTGCTCTTATTGTATCTCTACTATCATCACCATTTATAGCAGCTATCAATCTCTTAAAACTACCAAAGCTGTATGGAATTTTAATCGCTCGTCTGGTACTAGGGAGCATTGTATTGTCAGGTTTACATCTTTTTCGAATGCAGTAAACTTGGCATATGCTTTTTGGATAAACGGGCTCCCCTTTGCAACATT
GAGATGCCTGGTTTTTTCGATGGTTGTGTTCAGATGTGATATTGTGTTGCTCCTGTGTCCTATTGGTTTACACTTTCTGCTGACTAGACAAGTTACGTTATTGAGCGCTGTAAGATGCTGTGCAACTACAGCTCTTTTGAGCATAGGGGCTACAATCCTGATTGACTCAATTATGTGGAAAAGGATCACATGGCCAGAAA
TGGAGGTTTTCTGGTTTAATTCTGTCTTGAACCGTAGCTCTGAATGGGGTGTATTTCCGGTGCATTGGTATTTTACATCAGCTCTTCCACGATCAATGTTGGCGGCATTTCCACTGTGCTTTCTAGGTGTAATCCTTGAGAGAAGGATGCTAGAGTACATGTTACCTGTCTTTGCCTTTATTGTACTTTACTCCAAACTT
CCACACAAGGAGCTCCGGTTTATAATTTTGGCAATTCCCATGCTGAACCTCTCTGCAGCAATTGCAGCTACAAGAATTTACAACAACAGGAAGAAAACAATCTGGAAGTGGGCATACATTGGCATGATTGGCTCACTCTTTGCAAGTTTAGGATTCTCTATGATTATGAGTGCTGCTTCATATGCAAACTACCCAGCTGG
CTATGCACTAGATGCTCTTCACCATAAAGACTTTAACAGAACTTCCAGCTGTGTGGTTCACATTGATTCAATGGCAGCAATGAATGGTATTTCCCGCTTTTGTGAAAAGGATCTTCTTTGGAGGTATTCCAAGGAAGAACATATTTCTGATGAAGAAATCCTTGCCAAAAGTTTTACGTATCTGATCAATGAACGTTCAA
GAATACCTGGCTTTAAATGCTTATTGGCTACCTCTGGATTTTCTAGGCTACTTGTTCAGCTCTCCTTCCCACCTGTTCGCCTGTTAACTGAGCCCAAAGTTTTTGTCCATGGCAATATAAGAAGTGAAGGTATTGAAGATATAAGATGGCCTGGTTGTCCTTACTCCTAGCAGGAGAACCACACAGCTGTCAACTTATCC
AATAATATTACTAGAGTTGAAGTGTTTAATCTTAATTGTCCAAGAATGGTATTCTTCCAGCATTGCAGTGGAAGATTGCAATGCTTGAATCACATTTAAGGGTTATTCTTTTGTATATGGAACCCTGCCATATCTAAGCATAGGTGTTTTTTATCATAATAACATTTAATTTATTTTATTTTCACTGTGTTTAAATCATA
GGCTGTATTGACATTTCCTGTATGGAAATTCAGACCATGTTTAAAATACGGTGAATATTCGGCATAGTTCAAATACGATACATTCAACAAATCCTTGGCCAAATTCTACTATGGCCACTTTATTTATTTATAAAAACACTCATTTAAAAAAACACATTTTGAATTTTTAATTAATTTCTACTACATTATCATGAGTGTTG
TATGCTGCCGGCTGTAGAATATTGAATATGAGTCTGCAATTTT
>TRINITY_DN40617_c0_g1_i7 from sample A8 / Example unspliced isoform:TTACTCCAAACTTCCACACAAGGTATGTCAAAAATGTTTTCCCTGGTGTTTACTTCAAACTTTAGTTATGTAATATTTTTTCATGTAAAATGTTTGCATATGATATGACAGATTTCATTGTTTTTAAATGGTTCAGGAGCTCCGGTTTATAATTTTGGCAATTCCCATGCTGAACCTCTCTGCAGCAATTGCAGCTACAA
GAATgtattgttcatgtttttcttgaaaatcaatttccatgtcccaaagccatcttattaattctatacagcaatgaaatcttgcatttcactttgcttggatatgtcttctggaagtgctgttagttttttaaacacaattgacagatactgtgttccagtaattactaattacaagcttcaatgtctgtagtgaattt
tgaaattaaatttcagccacctctattgcaatatttgataaatagcggactctggcaaattttgttttaggtgtaaattacattccgatttgcacagttgaaattttcacattcttcctctttttacatattctctgggagaaaatctagtgtatacttccagttaagaaatttcttcatgaggaacttatttaggcatt
ggggactggatgagcaggatataaactgagttagatgagttcaaatgttttgttttgcagTTACAACAACAGGAAGAAAACAATCTGGAAGTGGGCATACATTGGCATGATTGGCTCACTCTTTGCAAGTTTAGGATTCTCTATGATTATGAGTGCTGCTTCATATGCAAACTACCCAGCTGGCTATGCACTAGATGCTC
TTCACCATAAAGACTTTAACAGAACTTCCAGCTGTGTGGTTCACATTGATTCAATGGCAGCAATGAATGGTATTTCCCGCTTTTGTGAAAAGGATCTTCTTTGGAGGTATTCCAAGGAAGAACATATTTCTGATGAAGAAATCCTTGCCAAAAGTTTTACGTATCTGATCAATGAACGTTCAAGAATACCTGGCTTTAAA
TGCTTATTGGCTACCTCTGGATTTTCTAGGCTACTTGTTCAGCTCTCCTTCCCACCTGTTCGCCTGTTAACTGAGCCCAAAGTTTTTGTCCATGGCAATATAAGAAGTGAAGGTATTGAAGATATAAGATGGCCTGGTTGTCCTTACTCCTAGCAGGAGAACCACACAGCTGTCAACTTATCCAATAATATTACTAGAGT
TGAAGTGTTTAATCTTAATTGTCCAAGAATGGTATTCTTCCAGCATTGCAGTGGAAGATTGCAATGCTTGAATCACATTTAAGGGTTATTCTTTTGTATATGGAACCCTGCCATATCTAAGCATAGGTGTTTTTTATCATAATAACATTTAATTTATTTTATTTTCACTGTGTTTAAATCATAGGCTGTATTGACATTTC
CTGTATGGAAATTCAGACCATGTTTAAAATACGGTGAATATTCGGCATAGTTCAAATACGATACATTCAACAAATCCTTGGCCAAATTCTACTATGGCCACTTTATTTATTTATAAAAACACTCATTTAAAAAAACACATTTTGAATTTTTAATTAATTTCTACTACATTATCATGAGTGTTGTATGCTGCCGGCTGTAG
AATATTGAATATGAGTCTGCAATTTT
Intron 6 GTATATTATT ... TTGTTTACAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 15.38 | 11 | 0 | 2 |
| A2 | 33.33 | 8 | 0 | 4 |
| A3 | 16 | 21 | 0 | 4 |
| A4 | 63.64 | 4 | 0 | 7 |
| A5 | 0 | 7 | 0 | 0 |
| A6 | 18.52 | 44 | 0 | 10 |
| A7 | 9.26 | 49 | 0 | 5 |
| A8 | 19.8 | 81 | 1 | 20 |
| A9 | 19.05 | 51 | 0 | 12 |
| A10 | 13.04 | 20 | 0 | 3 |
>TRINITY_DN40617_c0_g1_i8 from sample A8 / Example spliced isoformCAGAAAAATACTCGGCAATCTGGTTGATTTGATCTACAAGTATCATATGTAAAAGGTTCTGATTTATATAAATGGTGATAACGTATATTGGCTAATTTAGAATCTGTAACTTATGTGATCCAGGTCTAAGAAATTATATATTGTTGAACTAGAGATTTAATGGCATGCGAGTAGTGATGGTTTTCTTGCTGAAGGCCGGT
AGGAGATTCTGGAGTGACAAAATCATGCTGGACAGATGGGATATGTTGTTAATGGCTATTGCAACATTTCATGTGTTCTTGGCTCCTTACACAAAAGTTGAAGAGAGCTTCAATGTCCAGGCAATACATGATATCCTTTATCATCACTATCACTTAGAAAAGTATGATCATTTTGAATTTCCAGGAGTTGTACCCCGCAC
CTTCATAGGTGCTCTTATTGTATCTCTACTATCATCACCATTTATAGCAGCTATCAATCTCTTAAAACTACCAAAGCTGTATGGAATTTTAATCGCTCGTCTGGTACTAGGGAGCATTGTATTGTCAGGTTTACATCTTTTTCGAATGCAGTAAACTTGGCATATGCTTTTTGGATAAACGGGCTCCCCTTTGCAACATT
GAGATGCCTGGTTTTTTCGATGGTTGTGTTCAGATGTGATATTGTGTTGCTCCTGTGTCCTATTGGTTTACACTTTCTGCTGACTAGACAAGTTACGTTATTGAGCGCTGTAAGATGCTGTGCAACTACAGCTCTTTTGAGCATAGGGGCTACAATCCTGATTGACTCAATTATGTGGAAAAGGATCACATGGCCAGAAA
TGGAGGTTTTCTGGTTTAATTCTGTCTTGAACCGTAGCTCTGAATGGGGTGTATTTCCGGTGCATTGGTATTTTACATCAGCTCTTCCACGATCAATGTTGGCGGCATTTCCACTGTGCTTTCTAGGTGTAATCCTTGAGAGAAGGATGCTAGAGTACATGTTACCTGTCTTTGCCTTTATTGTACTTTACTCCAAACTT
CCACACAAGGAGCTCCGGTTTATAATTTTGGCAATTCCCATGCTGAACCTCTCTGCAGCAATTGCAGCTACAAGAATTTACAACAACAGGAAGAAAACAATCTGGAAGTGGGCATACATTGGCATGATTGGCTCACTCTTTGCAAGTTTAGGATTCTCTATGATTATGAGTGCTGCTTCATATGCAAACTACCCAGCTGG
CTATGCACTAGATGCTCTTCACCATAAAGACTTTAACAGAACTTCCAGCTGTGTGGTTCACATTGATTCAATGGCAGCAATGAATGGTATTTCCCGCTTTTGTGAAAAGGATCTTCTTTGGAGGTATTCCAAGGAAGAACATATTTCTGATGAAGAAATCCTTGCCAAAAGTTTTACGTATCTGATCAATGAACGTTCAA
GAATACCTGGCTTTAAATGCTTATTGGCTACCTCTGGATTTTCTAGGCTACTTGTTCAGCTCTCCTTCCCACCTGTTCGCCTGTTAACTGAGCCCAAAGTTTTTGTCCATGGCAATATAAGAAGTGAAGGTATTGAAGATATAAGATGGCCTGGTTGTCCTTACTCCTAGCAGGAGAACCACACAGCTGTCAACTTATCC
AATAATATTACTAGAGTTGAAGTGTTTAATCTTAATTGTCCAAGAATGGTATTCTTCCAGCATTGCAGTGGAAGATTGCAATGCTTGAATCACATTTAAGGGTTATTCTTTTGTATATGGAACCCTGCCATATCTAAGCATAGGTGTTTTTTATCATAATAACATTTAATTTATTTTATTTTCACTGTGTTTAAATCATA
GGCTGTATTGACATTTCCTGTATGGAAATTCAGACCATGTTTAAAATACGGTGAATATTCGGCATAGTTCAAATACGATACATTCAACAAATCCTTGGCCAAATTCTACTATGGCCACTTTATTTATTTATAAAAACACTCATTTAAAAAAACACATTTTGAATTTTTAATTAATTTCTACTACATTATCATGAGTGTTG
TATGCTGCCGGCTGTAGAATATTGAATATGAGTCTGCAATTTT
>TRINITY_DN40617_c0_g1_i6 from sample A8 / Example unspliced isoform:TCTCCTTCCCACCTGTTCGCCTGgtatattattttggtttagccattgtttttcattatgatatttggtgaagtttaaagtccaaaatgtattaagcgttttgttgccacaccagtttagctcctaattgtttatgtttcttgtttacagTTAACTGAGCCCAAAGTTTTTGTCCATGGCAATATAAGAAGTGAAGGTAT
TGAAGATATAAGATGGCCTGGTTGTCCTTACTCCTAGCAGGAGAACCACACAGCTGTCAACTTATCCAATAATATTACTAGAGTTGAAGTGTTTAATCTTAATTGTCCAAGAATGGTATTCTTCCAGCATTGCAGTGGAAGATTGCAATGCTTGAATCACATTTAAGGGTTATTCTTTTGTATATGGAACCCTGCCATAT
CTAAGCATAGGTGTTTTTTATCATAATAACATTTAATTTATTTTATTTTCACTGTGTTTAAATCATAGGCTGTATTGACATTTCCTGTATGGAAATTCAGACCATGTTTAAAATACGGTGAATATTCGGCATAGTTCAAATACGATACATTCAACAAATCCTTGGCCAAATTCTACTATGGCCACTTTATTTATTTATAA
AAACACTCATTTAAAAAAACACATTTTGAATTTTTAATTAATTTCTACTACATTATCATGAGTGTTGTATGCTGCCGGCTGTAGAATATTGAATATGAGTCTGCAATTTT