NA ----> NA
Intron 1 GTCAAGTACC ... CTCTGAGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 52.54 | 28 | 13 | 31 |
| A2 | 55.56 | 44 | 10 | 55 |
| A3 | 59.68 | 25 | 10 | 37 |
| A4 | 53.85 | 30 | 14 | 35 |
| A5 | 60 | 10 | 0 | 15 |
| A6 | 56.57 | 251 | 40 | 327 |
| A7 | 57.77 | 223 | 34 | 305 |
| A8 | 55.43 | 271 | 48 | 337 |
| A9 | 55.62 | 229 | 55 | 287 |
| A10 | 52.66 | 178 | 47 | 198 |
>TRINITY_DN106425_c0_g2_i2 from sample A3 / Example spliced isoformCACAAATTCATTGAGTTGAGATGAGCTATAACAAATTTTGGTGCACCTTGGATATTTTCAGCTCGTTTTTCTTGAAAGAATTTTCATACAGCACATCTCAAAAATTCTTGATATGCCTTTGAGATTGAGTTAGTGGATGAACAATAAGGGGGATTGGGGATATAATTGTGGTGAATTTCCCATCTCCATTGAGTGTGATG
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ATTGCATGGATTGTTTCTGCCTTCTTATTGACACT
>TRINITY_DN106425_c0_g2_i1 from sample A3 / Example unspliced isoform:CACAAATTCATTGAGTTGAGATGAGCTATAACAAATTTTGGTGCACCTTGGATATTTTCAGCTCGTTTTTCTTGAAAGAATTTTCATACAGCACATCTCAAAAATTCTTGATATGCCTTTGAGATTGAGTTAGTGGATGAACAATAAGGGGGATTGGGGATATAATTGTGGTGAATTTCCCATCTCCATTGAGTGTGATG
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CAGAGGAATATGCTCTACATGATTAACATAGAAGGAAATTTCATAGATGAAATTTAAATCCCTTAAATTATTTGAGGTGCCCTTTCTACATTGTGCATATTATTCCACCTTTTTTGTATAAACAATGCTGTTTATTTTATTGGTGCAAAGTTCAAACATAGTTTCTTTGGGTATATTTTAGGGCATTTGTCTCATGGGAG
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ttgtcaggaggagctttggtaagtttagggctttatgctttggccttgtgatggtgcacctttgtttcttcatgggttggactattggagatggtccaatggacacaattttaatttagtattcagtcagagtaaacaaaacctatgttccttgtaaatttgcttttccttgtcatgttaactttaccagataacttctt
ttgcacaaagataagtattttgacaatctaaagaatgcacgccgacagatttccttacttgctgagtgctctataaaaggaaggaggaaattgaaaaggaaaggaaaaaacatggatgcaattttagattgtacagcatagagagacttgagagagctgtttgattcttactgggatgaacatggtatcacaaataaacg
tttttcattcaacttatgtaataaataatgaactctgagcagGTTGTAGCTTCTGAAAAGGAGAGCAAAGGAGGTTTGCATGAGAAGCTAACAATGACAGTTGCTGTACCACTTCTCTGGGGCATTCCACCTGCTGCAGATAGGCTTCACTTTGCTGTTCGAACTGGTGGTGGAATTGTAGAGAAAGTATATTGGCAGTG
GGACTTCTTATGATTACTTTGTTTGCCAGTCTTGAACTGTATATAATTGTATGTTACATTCTCTCGTCTTATTCATCTGCAGCCAACAATACGGGCCTGCACAACCGTATGCCTTTCTTTTCTTTAAGATTATGTATAGAGACTATAAAATATGGCTTAGAGCTGCGTGCTTATTTTTCATTATTGGATAATGTGTATGA
CTCATGGGCAAGCCCCTGGCAGAAATGTTCAATTTTGTTTCTCCTTGGAGATCATCTGCAAGCTGCTTATATGAATACTAATGAGCATAATGCCAATCTCTGTTATCACCATTTACACAATTGCATGGATTGTTTCTGCCTTCTTATTGACACT