sp|B8BDK0|ITPK6_ORYSI ----> Inositol-tetrakisphosphate 1-kinase 6
Intron 1 GTCGGGGATG ... CATGTTGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 77.78 | 7 | 18 | 31 |
| A2 | 63.86 | 15 | 17 | 36 |
| A3 | 78.72 | 10 | 23 | 51 |
| A4 | 49.02 | 13 | 10 | 15 |
| A5 | 66.67 | 2 | 0 | 8 |
| A6 | 65.62 | 55 | 60 | 150 |
| A7 | 70.12 | 62 | 83 | 208 |
| A8 | 65.01 | 130 | 154 | 329 |
| A9 | 70 | 84 | 134 | 258 |
| A10 | 58.06 | 52 | 46 | 98 |
>TRINITY_DN47124_c0_g1_i1 from sample A10 / Example spliced isoformAAGTGGGTTCGATTCTCTTATCACTGGAGTATAATTGATACCTTCGGGACACATTTTAGGCTGGCTGGGATCATATTCTACTCTGCCAGGTCCTTATAGACACTCCAGGAATTTGTTGCGGAGGAAAGTGGGTTCGATTCTCTTATCACTGGAGTATAATTGATACCTTCGGAACACATTTTAGGCTGGCTGGTATCATA
TTGTACTCTGACAGGTCCTTATCTCTGAAAGGAAGGCCTTGCCCGAAGCTCAGCCAAAACCAGTGATGGGACCTGTAAAAGGAGTTGTATTGGACGAATCATTTTTATTCTCTGTGAGTGATGACAATGATCAAAACAGCGCGCATTTGCAGCCAGCCGCAGAAAAAATGCTTCTCAGGCTTCAGTACTCCAACCTTCAT
ATTGGTATCTCTTACAAGGAAGATCTTTGTTCTCAAAAGGAGGCATTGATTCAACATGTGGCAGTGCTGTATACATTACAATTGGTCAAGTTTGATGTGTCCTGTCCAGAGCATACTCTTCAAGCAACTTCCTCAGCCTGGGATGTGACCTCTGATACATGTGTTTTTGTGACTTCTAAACTGGATGAAGTTATTTGTCG
TAATATTTGTAGTCAAGGCTGGACTGTTATTCTTCAAGGTTTGGAAAATACTGTTTCAAACATGTCTGGTGTGACAACGATTCACAAGCTGCAAGACTTACTTATTACTCTATCTCACCTGAACAAAATGGCTTTGGGAGATTCCATAATTACAGTTGGATATGTTATGAAGTGGACTAGGGAAAAGGATTTTCTGAAGA
GAGGTGCATTCCCTACAATTCCAACCAACAATGGGTTGACATTCATTTCTATTGATCTTGATCTGCCATTAATATCCCAGTTACAGACAGTTGATGTAGTTCTTCACAAAGCAACTGATGAAATTTCCAGCATTGACGAGGGTCAGTTGTTCAGCATCTCTAAAGGGGTTACGTTCTCTGAAGGGATGCAACAGTTGAAG
AGGTGTATGAAGCATTTGCATTACTTTTTGATAGATCCTTTAGAGAATATTATCCCTTTGCTGGATCGTGATGCCATCCAAAATATATTGCAAGATTTGGTCGAAATAAATACTCCAGGAAACTGCAGGATCAGGGCCCCTCATTACCTAAAGGTTTCAAATTTTGATGAGCCAGATTTGGTAGAAAAACTCGATCAAGC
ACAATTAGCTCTTCCAGCAATTGTAAAGCCACAGATTGCCTGTGGTGTATCCAATGCACATACAATGGCAGTGGTCTTTAAAATGGAAGAATTTGTTGAACTTCCAGTCCCTCTTCCATCAGTCATTCAGGAATACATCGATCATGGGTCCATTGTGTACAAATTCTATGTATTAGGTGAAAGGGTTTTCCATGCGGTTA
GAAAGTCGACACCAAATGCTGCATCATTGTTACTTTCTTCAGGAAATAAATGCTCTTCGGCAGTCATTTTTGACAGTTTAAAGTCACTTCCTGTTGATTCCACTGGCAACCTGACATCAGACTCTGACGGAGTAAAGCTTGATCTTGATATTGTAACTAGTGCAGCAATGTGGATGAGGGGAAAACTCCATCTTACAATT
TTTGGATTTGACGTTGTTATACAGGCTGGCACTCAAGATCATGTGATTGTTGATATCAATTATCTTCCTTCTTTCAAGGAAATACCCAATGAAACTGCAATTCCAGCATTTTGGGAGGCTATTCAGAGTTCATATAAATCTTACAAATCCAGCAGCGAACAGGCTGCAGATGACAAAAATTTAAATGTTCCCAATACATA
ATGAATATTATGTCCTCAAACTTTCTATTTCTATATGATTTCAGTATGAGTGAGCAGCATGTCACTCACGATAATCTTCAGTACTCTATGAGTCACAGTGGTTGAAAAGGTTATGAACAAACAAACTGACTTGTTCACTGAAACTGAAAATAACTTCTATGACTATTTGATGTAAGTCCTATGACAATGCTTTAAACCCC
GGGATAAATTATAGAATCTTGATAGACAGTCTACAGTTTTAAAATAGTGAACAATTTCAAATATGGGCACTGTATAAAAGCTCAGTCATAGCATTGGTGATACAAGTGTGCTTCCTGTTTTCTATGGTATGCAAAACATGACTGGGAGAAAGAAAGTCAATTACTAAATAGCAAAGAGAGTAG
>TRINITY_DN47124_c0_g1_i2 from sample A10 / Example unspliced isoform:AAGTGGGTTCGATTCTCTTATCACTGGAGTATAATTGATACCTTCGGGACACATTTTAGGCTGGCTGGGATCATATTCTACTCTGCCAGGTCCTTATAGACACTCCAGGAATTTGTTGCGGAGGAAAGTGGGTTCGATTCTCTTATCACTGGAGTATAATTGATACCTTCGGAACACATTTTAGGCTGGCTGGTATCATA
TTGTACTCTGACAGGTCCTTATCTCTGAAAGGAAGGCCTTGCCCGAAGCTCAGCCAAAACCAGTGATGGGACCTGTAAAAGGAGTTGTATTGGACGAATCATTTTTATTCTCTGTGAGTGATGACAATGATCAAAACAGCGCGCATTTGCAGCCAGCCGCAGAAAAAATGCTTCTCAGGCTTCAGTACTCCAACCTTCAT
ATTGGTATCTCTTACAAGGAAGATCTTTGTTCTCAAAAGGAGGCATTGATTCAACATGTGGCAGTGCTGTATACATTACAATTGGTCAAGTTTGATGTGTCCTGTCCAGAGCATACTCTTCAAGCAACTTCCTCAGCCTGGGATGTGACCTCTGATACATGTGTTTTTGTGACTTCTAAACTGGATGAAGTTATTTGTCG
TAATATTTGTAGTCAAGGCTGGACTGTTATTCTTCAAGGTTTGGAAAATACTGTTTCAAACATGTCTGGTGTGACAACGATTCACAAGCTGCAAGACTTACTTATTACTCTATCTCACCTGAACAAAATGGCTTTGGGAGATTCCATAATTACAGTTGGATATGTTATGAAGTGGACTAGGGAAAAGGATTTTCTGAAGA
GAGGTGCATTCCCTACAATTCCAACCAACAATGGGTTGACATTCATTTCTATTGATCTTGATCTGCCATTAATATCCCAGTTACAGACAGTTGATGTAGTTCTTCACAAAGCAACTGATGAAATTTCCAGCATTGACGAGGGTCAGTTGTTCAGCATCTCTAAAGGGGTTACGTTCTCTGAAGGGATGCAACAGTTGAAG
AGGTGTATGAAGCATTTGCATTACTTTTTGATAGATCCTTTAGAGAATATTATCCCTTTGCTGGATCGTGATGCCATCCAAAATATATTGCAAGATTTGGTCGAAATAAATACTCCAGGAAACTGCAGGATCAGGGCCCCTCATTACCTAAAGGTTTCAAATTTTGATGAGCCAGATTTGGTAGAAAAACTCGATCAAGC
ACAATTAGCTCTTCCAGCAATTGTAAAGCCACAGATTGCCTGTGGTGTATCCAATGCACATACAATGGCAGTGGTCTTTAAAATGGAAGAATTTGTTGAACTTCCAGTCCCTCTTCCATCAGTCATTCAGGAATACATCGATCATGGGTCCATTGTGTACAAATTCTATGTATTAGGTGAAAGGGTTTTCCATGCGGTTA
GAAAGTCGACACCAAATGCTGCATCATTGTTACTTTCTTCAGGAAATAAATGCTCTTCGGCAGTCATTTTTGACAGTTTAAAGTCACTTCCTGTTGATTCCACTGGCAACCTGACATCAGACTCTGACGGAGTAAAGCTTGATCTTGATATTGTAACTAGTGCAGCAATGTGGATGAGGGGAAAACTCCATCTTACAATT
TTTGGATTTGACGTTGTTATACAGGCTGGCACTCAAGATCATGTGATTGTTGATATCAATTATCTTCCTTCTTTCAAGGAAATACCCAATGAAACTGCAATTCCAGCATTTTGGGAGGCTATTCAGAGTTCATATAAATCTTACAAATCCAGCAGCGAACAGGGTTCCTCCTCCATACCCTTGCACCAAATTTAATAATG
GCATTAGATAAATTACTTGTCTAAAGAAAAAGAACTCGTTGGAAGAAATGTTAAAGATGGTGACATGTTATAGCATCTTCTATTGCTTTGTAATTTTGTTTCTCAATCACTTGTCTTCCACATTTGTAGCATAGCCACTTATAACATTCTTTCTCAAACTCAGTAATATGCAGTTATTTAATGCATGTGGGGCTGGTCCT
GACTCTTACAAAATCTGTGCAGCTGCAGATGACAAAAATTTAAATGTTCCCAATACATAATGAATATTATGTCCTCAAACTTTCTATTTCTATATGATTTCAGTATGAGTGAGCAGCATGTCACTCACGGTTGGTTTTGGGAAGCAGTTTTCTACCATACATGTTGTCTTTAGTAGGCATTTATGCTTAATAATTAGACC
AGATAAGAAATAAGATGTTTGAAGAAACAAAGATAAAGCTTGAGCAGTTTGTCTGTTTTAATGCATATAATCTTCAGTACTCTATGAGTCACAGTGGTTGAAAAGgtcggggatgatccacaatcaagttcatgtgttttgcaccaaattaaaacattgctagaggtcctggacataaaagttcataagcacgacaatga
tttgcatgttgcagGTTATGAACAAACAAACTGACTTGTTCACTGAAACTGAAAATAACTTCTATGACTATTTGATGTAAGTCCTATGACAATGCTTTAAACCCCGGGATAAATTATAGAATCTTGATAGACAGTCTACAGTTTTAAAATAGTGAACAATTTCAAATATGGGCACTGTATAAAAGCTCAGTCATAGCATT
GGTGATACAAGTGTGCTTCCTGTTTTCTATGGTATGCAAAACATGACTGGGAGAAAGAAAGTCAATTACTAAATAGCAAAGAGAGTAG
Intron 2 GTAATTTTGT ... ATCTGTGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 87.34 | 5 | 40 | 29 |
| A2 | 95.45 | 1 | 26 | 16 |
| A3 | 84.13 | 5 | 21 | 32 |
| A4 | 73.33 | 4 | 15 | 7 |
| A5 | 100 | 0 | 13 | 8 |
| A6 | 83.56 | 24 | 119 | 125 |
| A7 | 89.71 | 14 | 117 | 127 |
| A8 | 83.3 | 41 | 203 | 206 |
| A9 | 84.82 | 29 | 147 | 177 |
| A10 | 88.68 | 9 | 71 | 70 |
>TRINITY_DN109805_c4_g2_i2 from sample A3 / Example spliced isoformTTTAGTCATTGTAAAAAAGAGAGTACCTACTAAACACGAAAATATGTTTGAGCCATACGGTGCTCACACCATAGTGCATCAACGTAATACTTAGTTTAGACCCTCCAGAGATTTATTGCCGAGGAGACAAGTGGGTTCGATTTTCTTATCACTGGAGTATAATTGATACCTTCGGGACACATTTTAGGCTGGCTGGGATC
ATATTCTACTCTGCCAGGTCCTTATAGACACTCCAGGAATTTGTTGCGGAGGAAAGTGGGTTCGATTCTCTTATCACTGGAGTATAATTGATACCTTCGGAACACATTTTAGGCTGGCTGGTATCATATTGTACTCTGACAGGTCCTTATCTCTGAAAGGAAGGCCTTGCCCGAAGCTCAGCCAAAACCAGTGATGGGAC
CTGTAAAAGGAGTTGTATTGGACGAATCATTTTTATTCTCTGTGAGTGATGACAATGATCAAAACAGCGCGCATTTGCAGCCAGCCGCAGAAAAAATGCTTCTCAGGCTTCAGTACTCCAACCTTCATATTGGTATCTCTTACAAGGAAGATCTTTGTTCTCAAAAGGAGGCATTGATTCAACATGTGGCAGTGCTGTAT
ACATTACAATTGGTCAAGTTTGATGTGTCCTGTCCAGAGCATACTCTTCAAGCAACTTCCTCAGCCTGGGATGTGACCTCTGATACATGTGTTTTTGTGACTTCTAAACTGGATGAAGTTATTTGTCGTAATATTTGTAGTCAAGGCTGGACTGTTATTCTTCAAGGTTTGGAAAATACTGTTTCAAACATGTCTGGTGT
GACAACGATTCACAAGCTGCAAGACTTACTTATTACTCTATCTCACCTGAACAAAATGGCTTTGGGAGATTCCATAATTACAGTTGGATATGTTATGAAGTGGACTAGGGAAAAGGATTTTCTGAAGAGAGGTGCATTCCCTACAATTCCAACCAACAATGGGTTGACATTCATTTCTATTGATCTTGATCTGCCATTAA
TATCCCAGTTACAGACAGTTGATGTAGTTCTTCACAAAGCAACTGATGAAATTTCCAGCATTGACGAGGGTCAGTTGTTCAGCATCTCTAAAGGGGTTACGTTCTCTGAAGGGATGCAACAGTTGAAGAGGTGTATGAAGCATTTGCATTACTTTTTGATAGATCCTTTAGAGAATATTATCCCTTTGCTGGATCGTGAT
GCCATCCAAAATATATTGCAAGATTTGGTCGAAATAAATACTCCAGGAAACTGCAGGATCAGGGCCCCTCATTACCTAAAGGTTTCAAATTTTGATGAGCCAGATTTGGTAGAAAAACTCGATCAAGCACAATTAGCTCTTCCAGCAATTGTAAAGCCACAGATTGCCTGTGGTGTATCCAATGCACATACAATGGCAGT
GGTCTTTAAAATGGAAGAATTTGTTGAACTTCCAGTCCCTCTTCCATCAGTCATTCAGGAATACATCGATCATGGGTCCATTGTGTACAAATTCTATGTATTAGGTGAAAGGGTTTTCCATGCGGTTAGAAAGTCGACACCAAATGCTGCATCATTGTTACTTTCTTCAGGAAATAAATGCTCTTCGGCAGTCATTTTTG
ACAGTTTAAAGTCACTTCCTGTTGATTCCACTGGCAACCTGACATCAGACTCTGACGGAGTAAAGCTTGATCTTGATATTGTAACTAGTGCAGCAATGTGGATGAGGGGAAAACTCCATCTTACAATTTTTGGATTTGACGTTGTTATACAGGCTGGCACTCGAGATCATGTGATTGTTGATATCAATTATCTTCCTTCT
TTCAAGGAAATACCCAATGAAACTGCAATTCCAGCATTTTGGGAGGCTATTCAGAGTTCATATAAATCTTACAAATCCAGCAGCGAACAGGGTTCCTCCTCCATACCCTTGCACCAAATTTAATAATGGCATTAGATAAATTACTTGTCTAAAGAAAAAGAACTCGTTGGAAGAAATGTTAAAGATGGTGACATGTTATA
GCATCTTCTATTGCTTTCTGCAGATGACAAAAATTTAAATGTTCCCAATACATAATGAATATTATGTCCTCAAACTTTCTATTTCTATATGATTTCAGTATGA
>TRINITY_DN109805_c4_g2_i1 from sample A3 / Example unspliced isoform:TTTAGTCATTGTAAAAAAGAGAGTACCTACTAAACACGAAAATATGTTTGAGCCATACGGTGCTCACACCATAGTGCATCAACGTAATACTTAGTTTAGACCCTCCAGAGATTTATTGCCGAGGAGACAAGTGGGTTCGATTTTCTTATCACTGGAGTATAATTGATACCTTCGGGACACATTTTAGGCTGGCTGGGATC
ATATTCTACTCTGCCAGGTCCTTATAGACACTCCAGGAATTTGTTGCGGAGGAAAGTGGGTTCGATTCTCTTATCACTGGAGTATAATTGATACCTTCGGAACACATTTTAGGCTGGCTGGTATCATATTGTACTCTGACAGGTCCTTATCTCTGAAAGGAAGGCCTTGCCCGAAGCTCAGCCAAAACCAGTGATGGGAC
CTGTAAAAGGAGTTGTATTGGACGAATCATTTTTATTCTCTGTGAGTGATGACAATGATCAAAACAGCGCGCATTTGCAGCCAGCCGCAGAAAAAATGCTTCTCAGGCTTCAGTACTCCAACCTTCATATTGGTATCTCTTACAAGGAAGATCTTTGTTCTCAAAAGGAGGCATTGATTCAACATGTGGCAGTGCTGTAT
ACATTACAATTGGTCAAGTTTGATGTGTCCTGTCCAGAGCATACTCTTCAAGCAACTTCCTCAGCCTGGGATGTGACCTCTGATACATGTGTTTTTGTGACTTCTAAACTGGATGAAGTTATTTGTCGTAATATTTGTAGTCAAGGCTGGACTGTTATTCTTCAAGGTTTGGAAAATACTGTTTCAAACATGTCTGGTGT
GACAACGATTCACAAGCTGCAAGACTTACTTATTACTCTATCTCACCTGAACAAAATGGCTTTGGGAGATTCCATAATTACAGTTGGATATGTTATGAAGTGGACTAGGGAAAAGGATTTTCTGAAGAGAGGTGCATTCCCTACAATTCCAACCAACAATGGGTTGACATTCATTTCTATTGATCTTGATCTGCCATTAA
TATCCCAGTTACAGACAGTTGATGTAGTTCTTCACAAAGCAACTGATGAAATTTCCAGCATTGACGAGGGTCAGTTGTTCAGCATCTCTAAAGGGGTTACGTTCTCTGAAGGGATGCAACAGTTGAAGAGGTGTATGAAGCATTTGCATTACTTTTTGATAGATCCTTTAGAGAATATTATCCCTTTGCTGGATCGTGAT
GCCATCCAAAATATATTGCAAGATTTGGTCGAAATAAATACTCCAGGAAACTGCAGGATCAGGGCCCCTCATTACCTAAAGGTTTCAAATTTTGATGAGCCAGATTTGGTAGAAAAACTCGATCAAGCACAATTAGCTCTTCCAGCAATTGTAAAGCCACAGATTGCCTGTGGTGTATCCAATGCACATACAATGGCAGT
GGTCTTTAAAATGGAAGAATTTGTTGAACTTCCAGTCCCTCTTCCATCAGTCATTCAGGAATACATCGATCATGGGTCCATTGTGTACAAATTCTATGTATTAGGTGAAAGGGTTTTCCATGCGGTTAGAAAGTCGACACCAAATGCTGCATCATTGTTACTTTCTTCAGGAAATAAATGCTCTTCGGCAGTCATTTTTG
ACAGTTTAAAGTCACTTCCTGTTGATTCCACTGGCAACCTGACATCAGACTCTGACGGAGTAAAGCTTGATCTTGATATTGTAACTAGTGCAGCAATGTGGATGAGGGGAAAACTCCATCTTACAATTTTTGGATTTGACGTTGTTATACAGGCTGGCACTCGAGATCATGTGATTGTTGATATCAATTATCTTCCTTCT
TTCAAGGAAATACCCAATGAAACTGCAATTCCAGCATTTTGGGAGGCTATTCAGAGTTCATATAAATCTTACAAATCCAGCAGCGAACAGGGTTCCTCCTCCATACCCTTGCACCAAATTTAATAATGGCATTAGATAAATTACTTGTCTAAAGAAAAAGAACTCGTTGGAAGAAATGTTAAAGATGGTGACATGTTATA
GCATCTTCTATTGCTTTgtaattttgtttctcaatcacttgtcttccacatttgtagcatagccacttataacattctttctcaaactcagtaatatgcagttatttaatgcatgtggggctggtcctgactcttacaaaatctgtgcagCTGCAGATGACAAAAATTTAAATGTTCCCAATACATAATGAATATTATGT
CCTCAAACTTTCTATTTCTATATGATTTCAGTATGAGTGAGCAGCATGTCACTCACGGTTGGTTTTGGGAAGCAGTTTTCTACCATACATGTTGTCTTTAGTAGGCATTTATGCTTAATAATTAGACCAGATAAGAAATAAGATGTTTGAAGAAACAAAGATAAAGCTTGAGCAGTTTGTCTGTTTTAATGCAGATAATC
TTCAGTACTCTATGAGTCACAGTGGTTGAAAAGGTCGGGGATGATCCACAATCAAGTTCATGTGTTTTGCACCAAATTAAACATTGCTAGAGGTTTTGGACATAAAAGTTCATAAGGACGACAATGATTTGCATGTTGCAGGTTATGAACAAACAAACTGACTTGTTCACTGAAACTGAAAATAACTTCTATGACTATTT
GATGTAAGTCCTATGACAATGCTTTAAACCCCGGGATAAATTATAGAATCTTGATAGACAGTCTACAGTTTTAAAATAGTGAACAATTTCAAATATGGGCACTGTATAAAAGCTCAGTCATAGCATTGGTGATACAAGTGTGCTTCCTGTTTTCTATGGTATGCAAAACATGACTGGGAGAAAGAAAG
Intron 3 GTTGGGGATG ... CATGTTGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 78.12 | 7 | 19 | 31 |
| A2 | 63.6 | 15 | 16.5 | 36 |
| A3 | 77.45 | 10 | 18 | 51 |
| A4 | 52.2 | 13 | 13.5 | 15 |
| A5 | 73.95 | 2 | 3.5 | 8 |
| A6 | 65.73 | 55 | 61 | 150 |
| A7 | 70.41 | 62 | 87 | 208 |
| A8 | 65.77 | 130 | 170.5 | 329 |
| A9 | 69.65 | 84 | 128 | 258 |
| A10 | 58.48 | 52 | 48.5 | 98 |
>TRINITY_DN47124_c0_g1_i1 from sample A10 / Example spliced isoformAAGTGGGTTCGATTCTCTTATCACTGGAGTATAATTGATACCTTCGGGACACATTTTAGGCTGGCTGGGATCATATTCTACTCTGCCAGGTCCTTATAGACACTCCAGGAATTTGTTGCGGAGGAAAGTGGGTTCGATTCTCTTATCACTGGAGTATAATTGATACCTTCGGAACACATTTTAGGCTGGCTGGTATCATA
TTGTACTCTGACAGGTCCTTATCTCTGAAAGGAAGGCCTTGCCCGAAGCTCAGCCAAAACCAGTGATGGGACCTGTAAAAGGAGTTGTATTGGACGAATCATTTTTATTCTCTGTGAGTGATGACAATGATCAAAACAGCGCGCATTTGCAGCCAGCCGCAGAAAAAATGCTTCTCAGGCTTCAGTACTCCAACCTTCAT
ATTGGTATCTCTTACAAGGAAGATCTTTGTTCTCAAAAGGAGGCATTGATTCAACATGTGGCAGTGCTGTATACATTACAATTGGTCAAGTTTGATGTGTCCTGTCCAGAGCATACTCTTCAAGCAACTTCCTCAGCCTGGGATGTGACCTCTGATACATGTGTTTTTGTGACTTCTAAACTGGATGAAGTTATTTGTCG
TAATATTTGTAGTCAAGGCTGGACTGTTATTCTTCAAGGTTTGGAAAATACTGTTTCAAACATGTCTGGTGTGACAACGATTCACAAGCTGCAAGACTTACTTATTACTCTATCTCACCTGAACAAAATGGCTTTGGGAGATTCCATAATTACAGTTGGATATGTTATGAAGTGGACTAGGGAAAAGGATTTTCTGAAGA
GAGGTGCATTCCCTACAATTCCAACCAACAATGGGTTGACATTCATTTCTATTGATCTTGATCTGCCATTAATATCCCAGTTACAGACAGTTGATGTAGTTCTTCACAAAGCAACTGATGAAATTTCCAGCATTGACGAGGGTCAGTTGTTCAGCATCTCTAAAGGGGTTACGTTCTCTGAAGGGATGCAACAGTTGAAG
AGGTGTATGAAGCATTTGCATTACTTTTTGATAGATCCTTTAGAGAATATTATCCCTTTGCTGGATCGTGATGCCATCCAAAATATATTGCAAGATTTGGTCGAAATAAATACTCCAGGAAACTGCAGGATCAGGGCCCCTCATTACCTAAAGGTTTCAAATTTTGATGAGCCAGATTTGGTAGAAAAACTCGATCAAGC
ACAATTAGCTCTTCCAGCAATTGTAAAGCCACAGATTGCCTGTGGTGTATCCAATGCACATACAATGGCAGTGGTCTTTAAAATGGAAGAATTTGTTGAACTTCCAGTCCCTCTTCCATCAGTCATTCAGGAATACATCGATCATGGGTCCATTGTGTACAAATTCTATGTATTAGGTGAAAGGGTTTTCCATGCGGTTA
GAAAGTCGACACCAAATGCTGCATCATTGTTACTTTCTTCAGGAAATAAATGCTCTTCGGCAGTCATTTTTGACAGTTTAAAGTCACTTCCTGTTGATTCCACTGGCAACCTGACATCAGACTCTGACGGAGTAAAGCTTGATCTTGATATTGTAACTAGTGCAGCAATGTGGATGAGGGGAAAACTCCATCTTACAATT
TTTGGATTTGACGTTGTTATACAGGCTGGCACTCAAGATCATGTGATTGTTGATATCAATTATCTTCCTTCTTTCAAGGAAATACCCAATGAAACTGCAATTCCAGCATTTTGGGAGGCTATTCAGAGTTCATATAAATCTTACAAATCCAGCAGCGAACAGGCTGCAGATGACAAAAATTTAAATGTTCCCAATACATA
ATGAATATTATGTCCTCAAACTTTCTATTTCTATATGATTTCAGTATGAGTGAGCAGCATGTCACTCACGATAATCTTCAGTACTCTATGAGTCACAGTGGTTGAAAAGGTTATGAACAAACAAACTGACTTGTTCACTGAAACTGAAAATAACTTCTATGACTATTTGATGTAAGTCCTATGACAATGCTTTAAACCCC
GGGATAAATTATAGAATCTTGATAGACAGTCTACAGTTTTAAAATAGTGAACAATTTCAAATATGGGCACTGTATAAAAGCTCAGTCATAGCATTGGTGATACAAGTGTGCTTCCTGTTTTCTATGGTATGCAAAACATGACTGGGAGAAAGAAAGTCAATTACTAAATAGCAAAGAGAGTAG
>TRINITY_DN47124_c0_g1_i3 from sample A10 / Example unspliced isoform:AAGTGGGTTCGATTCTCTTATCACTGGAGTATAATTGATACCTTCGGGACACATTTTAGGCTGGCTGGGATCATATTCTACTCTGCCAGGTCCTTATAGACACTCCAGGAATTTGTTGCGGAGGAAAGTGGGTTCGATTCTCTTATCACTGGAGTATAATTGATACCTTCGGAACACATTTTAGGCTGGCTGGTATCATA
TTGTACTCTGACAGGTCCTTATCTCTGAAAGGAAGGCCTTGCCCGAAGCTCAGCCAAAACCAGTGATGGGACCTGTAAAAGGAGTTGTATTGGACGAATCATTTTTATTCTCTGTGAGTGATGACAATGATCAAAACAGCGCGCATTTGCAGCCAGCCGCAGAAAAAATGCTTCTCAGGCTTCAGTACTCCAACCTTCAT
ATTGGTATCTCTTACAAGGAAGATCTTTGTTCTCAAAAGGAGGCATTGATTCAACATGTGGCAGTGCTGTATACATTACAATTGGTCAAGTTTGATGTGTCCTGTCCAGAGCATACTCTTCAAGCAACTTCCTCAGCCTGGGATGTGACCTCTGATACATGTGTTTTTGTGACTTCTAAACTGGATGAAGTTATTTGTCG
TAATATTTGTAGTCAAGGCTGGACTGTTATTCTTCAAGGTTTGGAAAATACTGTTTCAAACATGTCTGGTGTGACAACGATTCACAAGCTGCAAGACTTACTTATTACTCTATCTCACCTGAACAAAATGGCTTTGGGAGATTCCATAATTACAGTTGGATATGTTATGAAGTGGACTAGGGAAAAGGATTTTCTGAAGA
GAGGTGCATTCCCTACAATTCCAACCAACAATGGGTTGACATTCATTTCTATTGATCTTGATCTGCCATTAATATCCCAGTTACAGACAGTTGATGTAGTTCTTCACAAAGCAACTGATGAAATTTCCAGCATTGACGAGGGTCAGTTGTTCAGCATCTCTAAAGGGGTTACGTTCTCTGAAGGGATGCAACAGTTGAAG
AGGTGTATGAAGCATTTGCATTACTTTTTGATAGATCCTTTAGAGAATATTATCCCTTTGCTGGATCGTGATGCCATCCAAAATATATTGCAAGATTTGGTCGAAATAAATACTCCAGGAAACTGCAGGATCAGGGCCCCTCATTACCTAAAGGTTTCAAATTTTGATGAGCCAGATTTGGTAGAAAAACTCGATCAAGC
ACAATTAGCTCTTCCAGCAATTGTAAAGCCACAGATTGCCTGTGGTGTATCCAATGCACATACAATGGCAGTGGTCTTTAAAATGGAAGAATTTGTTGAACTTCCAGTCCCTCTTCCATCAGTCATTCAGGAATACATCGATCATGGGTCCATTGTGTACAAATTCTATGTATTAGGTGAAAGGGTTTTCCATGCGGTTA
GAAAGTCGACACCAAATGCTGCATCATTGTTACTTTCTTCAGGAAATAAATGCTCTTCGGCAGTCATTTTTGACAGTTTAAAGTCACTTCCTGTTGATTCCACTGGCAACCTGACATCAGACTCTGACGGAGTAAAGCTTGATCTTGATATTGTAACTAGTGCAGCAATGTGGATGAGGGGAAAACTCCATCTTACAATT
TTTGGATTTGACGTTGTTATACAGGCTGGCACTCAAGATCATGTGATTGTTGATATCAATTATCTTCCTTCTTTCAAGGAAATACCCAATGAAACTGCAATTCCAGCATTTTGGGAGGCTATTCAGAGTTCATATAAATCTTACAAATCCAGCAGCGAACAGGCTGCAGATGACAAAAATTTAAATGTTCCCAATACATA
ATGAATATTATGTCCTCAAACTTTCTATTTCTATATGATTTCAGTATGAGTGAGCAGCATGTCACTCACGGTTGGTTTTGGGAAGCAGTTTTCTACCATACATGTTGTCTTTAGTAGGCATTTATGCTTAATAATTAGACCAGATAAGAAATAAGATGTTTGAAGAAACAAAGATAAAGCTTGAGCAGTTTGTCTGTTTT
AATGCAGATAATCTTCAGTACTCTATGAGTCACAGTGGTTGAAAAGgttggggatgatccacaatcaagttcatgtgttttgcaccaaattaaacattgctagaggttttggacataaaagttcataaggacgacaatgatttgcatgttgcagGTTATGAACAAACAAACTGACTTGTTCACTGAAACTGAAAATAACT
TCTATGACTATTTGATGTAAGTCCTATGACAATGCTTTAAACCCCGGGATAAATTATAGAATCTTGATAGACAGTCTACAGTTTTAAAATAGTGAACAATTTCAAATATGGGCACTGTATAAAAGCTCAGTCATAGCATTGGTGATACAAGTGTGCTTCCTGTTTTCTATGGTATGCAAAACATGACTGGGAGAAAGAAA
GTCAATTACTAAATAGCAAAGAGAGTAG
Intron 4 GTTCCTCCTC ... ATCTGTGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 45.69 | 55.9 | 65 | 29 |
| A2 | 46.65 | 23.5 | 25 | 16 |
| A3 | 48.16 | 44.7 | 51 | 32 |
| A4 | 44.41 | 18.2 | 22 | 7 |
| A5 | 48 | 13 | 16 | 8 |
| A6 | 51.68 | 131.9 | 157 | 125 |
| A7 | 48.21 | 202.2 | 249 | 127 |
| A8 | 52.39 | 206.2 | 247 | 206 |
| A9 | 56.19 | 155.5 | 220 | 177 |
| A10 | 47.49 | 124.6 | 155 | 70 |
>TRINITY_DN119134_c13_g1_i1 from sample A1 / Example spliced isoformGCCATACGGTGCTCACACCATAGTGCATCAACGTAATACTTAGTTTAGACCCTCCAGAGATTTATTGCCGAGGAGACAAGTGGGTTCGATTTTCTTATCACTGGAGTATAATTGATACCTTCGGGACACATTTTAGGCTGGCTGGGATCATATTCTACTCTGCCAGGTCCTTATAGACACTCCAGGAATTTGTTGCGGAG
GAGACAAGTGGGTTCGATTCTCTTATCACTGGAGTATAATTGATACCTTCGGAACACATTTTAGGCTGGCTGGTATCATATTGTACTCTGACAGGTCCTTATCTCTGAAAGGAAGGCCTTGCCCGAAGCTCAGCCAAAACCAGTGATGGGACCTGTAAAAGGAGTTGTATTGGACGAATCATTTTTATTCTCTGTGAGTG
ATGACAATGATCAAAACAGCGCGCATTTGCAGCCAGCCGCAGAAAAAATGCTTCTCAGGCTTCAGTACTCCAACCTTCATATTGGTATCTCTTACAAGGAAGATCTTTGTTCTCAAAAGGAGGCATTGATTCAACATGTGGCAGTGCTGTATACATTACAATTGGTCAAGTTTGATGTGTCCTGTCCAGAGCATACTCTT
CAAGCAACTTCCTCAGCCTGGGATGTGACCTCTGATACATGTGTTTTTGTGACTTCTAAACTGGATGAAGTTATTTGTCGTAATATTTGTAGTCAAGGCTGGACTGTTATTCTTCAAGGTTTGGAAAATACTGTTTCAAACATGTCTGGTGTGACAACGATTCACAAGCTGCAAGACTTACTTATTACTCTATCTCACCT
GAACAAAATGGCTTTGGGAGATTCCATAATTACAGTTGGATATGTTATGAAGTGGACTAGGGAAAAGGATTTTCTGAAGAGAGGTGCATTCCCTACAATTCCAACCAACAATGGGTTGACATTCATTTCTATTGATCTTGATCTGCCATTAATATCCCAGTTACAGACAGTTGATGTAGTTCTTCACAAAGCAACTGATG
AAATTTCCAGCATTGACGAGGGTCAGTTGTTCAGCATCTCTAAAGGGGTTACGTTCTCTGAAGGGATGCAACAGTTGAAGAGGTGTATGAAGCATTTGCATTACTTTTTGATAGATCCTTTAGAGAATATTATCCCTTTGCTGGATCGTGATGCCATCCAAAATATATTGCAAGATTTGGTCGAAATAAATACTCCAGGA
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>TRINITY_DN119134_c13_g1_i2 from sample A1 / Example unspliced isoform:GCCATACGGTGCTCACACCATAGTGCATCAACGTAATACTTAGTTTAGACCCTCCAGAGATTTATTGCCGAGGAGACAAGTGGGTTCGATTTTCTTATCACTGGAGTATAATTGATACCTTCGGGACACATTTTAGGCTGGCTGGGATCATATTCTACTCTGCCAGGTCCTTATAGACACTCCAGGAATTTGTTGCGGAG
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