sp|Q9M376|VA727_ARATH ----> Vesicle-associated membrane protein 727
Intron 1 GTATGGATAA ... GCAATTGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 22.29 | 61 | 18 | 17 |
| A2 | 25.33 | 56 | 12 | 26 |
| A3 | 24.22 | 61 | 12 | 27 |
| A4 | 25.93 | 30 | 9 | 12 |
| A5 | 14.86 | 63 | 4 | 18 |
| A6 | 18.96 | 312 | 59 | 87 |
| A7 | 17.83 | 265 | 42 | 73 |
| A8 | 19.13 | 260 | 28 | 95 |
| A9 | 18.21 | 274 | 26 | 96 |
| A10 | 17.86 | 184 | 32 | 48 |
>TRINITY_DN113434_c0_g1_i4 from sample A1 / Example spliced isoformCATCCTATCAAATTCGTTCGCGGCCACCGGATAAAGCTTCTACCCAAAGCTTTGTTCCCGACTCGAAGAGAAAAAAATACCAAATTTATAAATAACAGGAGAAAATCCAAATACGGTTTTCACATTGTTGTCGGTTCCTTTGGAATTAAGAAACTGCGGAAGGGTTCGAAGAAGGGTTGTAGGTTTCTCTATATCGATCT
CATCCCCTCGAAAGCCGTTTTCTACAATACTTCGCCAGTTTAAACACCCGATCTCTGCAGGTTTTATGCCCGCCATTGTCCGGCAGCCTGTGCTTTGCGTGATAAAAAATGAGGAATCTTCTCCTGGACCACTGAGGAGTGGAGACGTCGATTTGGTAATACATTGGACATATTTTGCAGTACGTCGTCAGTTCCATTGA
TTCCAGAATTTACATTGTAGGTTGCCTTGCACCAGGGGACCCAGATTTGCCTCCACTAAAGATCGTCCGGGTTTTGCTGTTTTCGGTTGACAAGATCAGGAACAAAATTTTGAAGGCAATTGCATGGTTTGATTCTGAGATAATAGTTCTCCAACTCCATCTGGACCGAACACTAAATATAACTACAAAAGTCAAAAGTC
ATGGCGCAGCAGTCATTAATATACAGTTTTGTTGCCAGGGGCAATATTGTACTTGCGGAGCATACATCATTTTCTGGAAATTTTAGTATTATTGCTGTCCAGTGCCTGCAAAAGCTGCCTTCAAACAGCAACAAGTTCACATACACATGTGATAATCACACATTCAATTACCTTGTGGATGATGGCTTTGTGTTTCTTGT
TGTCGCAGATGAAGCTGCAGGAAGACAGGTGCCTTTTCTTTTCTTGGAGAGAGTAAAAGAAGATTTTAAGCGGCGTTATGGAGGGCGGGCTGAGACAAGCATGGCACACAGCCTTGATAAGGACTACGGGTATGAAGAGAAATTTACTGTTGCGTACAACCTTGACAGGGAATTCGGGCCAATACTGAGAGACCACATGC
AATATTGCATGGACCATCCAGAGGAGCTGAGCAAGTTTTCTAAAATAAAGGCTCAGGTTACAGAGGTGAAAGGAATTATGATGGACAATATTGAGAAGGTTCTGGACCGAGGTGAAAAGATTGAACTTCTTGTAGATAAAACAGAAGGCTTACAATTTCAGGCTGATAATTTCCAGCGCCAAGGCAGACAGCTTCGACGG
AAGATGTGGCTCCAAAATTTGAAATTCAAATTGATTGTTTTGGGTATCGTATTAGTTATTCTTCTTATAATATGGTTGTCTGTTTGTAATGGATTTAGTTGCAAGTGAAATCTCAAATGGTTTTATGTAACATACAAGACACCGACATGTTTATCAGTGGATCAACTTTGTGTATATTGTGAAGGTGAATAAGAACACAA
TGAGCTTAATGAATTAATAGGGGAGGAAATGCTCATATTGAGATACATATGATGTATATAATGAAACAAATGGGCAATGTTGTTAGATGTTTCTGTTATTGATTAAAATATCCTTGTATAACATTCTTTGTGTTTTTAAGGGTGAAGGATTGATGATTATATTAAAATTTGAAAGACTAATAAGAAGGTCAAAATTGGAA
ACTTCCTTATTGCATTGAAGTGTTGAATATCCACCAGCTATGAAATTTGGACACTGTTTTACACGTATGAGGTGTGTAACCTCTCAGCTTGAAGTGCCATGAAAGC
>TRINITY_DN113434_c0_g1_i2 from sample A1 / Example unspliced isoform:CATCCTATCAAATTCGTTCGCGGCCACCGGATAAAGCTTCTACCCAAAGCTTTGTTCCCGACTCGAAGAGAAAAAAATACCAAATTTATAAATAACAGGAGAAAATCCAAATACGGTTTTCACATTGTTGTCGGTTCCTTTGGAATTAAGAAACTGCGGAAGGGTTCGAAGAAGGGTTGTAGGTTTCTCTATATCGATCT
CATCCCCTCGAAAGCCGTTTTCTACAATACTTCGCCAGTTTAAACACCCGATCTCTGCAGGTTTTATGCCCGCCATTGTCCGGCAGCCTGTGCTTTGCGTGATAAAAAATGAGGAATCTTCTCCTGGACCACTGAGGAGTGGAGACGTCGATTTGGTAATACATTGGACATATTTTGCAGTACGTCGTCAGTTCCATTGA
TTCCAGAATTTACATTGTAGGTTGCCTTGCACCAGGGGACCCAGATTTGCCTCCACTAAAGATCGTCCGGGTTTTGCTGTTTTCGGTTGACAAGATCAGGAACAAAATTTTGAAGGCAATTGCATGGTTTGATTCTGAGATAATAGTTCTCCAACTCCATCTGGACCGAACACTAAATATAACTACAAAAGTCAAAAGTC
ATGGCGCAGCAGTCATTAATATACAGTTTTGTTGCCAGGGGCAATATTGTACTTGCGGAGCATACATCATTTTCTGGAAATTTTAGTATTATTGCTGTCCAGTGCCTGCAAAAGCTGCCTTCAAACAGCAACAAGTTCACATACACATGTGATAATCACACATTCAATTACCTTGTGGATGATGGCTTTGTGTTTCTTGT
TGTCGCAGATGAAGCTGCAGGAAGACAGGTGCCTTTTCTTTTCTTGGAGAGAGTAAAAGAAGATTTTAAGCGGCGTTATGGAGGGCGGGCTGAGACAAGCATGGCACACAGCCTTGATAAGGACTACGGGTATGAAGAGAAATTTACTGTTGCGTACAACCTTGACAGGGAATTCGGgtatggataagtggtttatcgtg
tgcatcattttcactttttcttcatctgtatgtaacctcttttgatttctctaatgcaattgcagGCCAATACTGAGAGACCACATGCAATATTGCATGGACCATCCAGAGGAGCTGAGCAAGTTTTCTAAAATAAAGGCTCAGGTTACAGAGGTGAAAGGAATTATGATGGACAATATTGAGAAGGTTCTGGACCGAGG
TGAAAAGATTGAACTTCTTGTAGATAAAACAGAAGGCTTACAATTTCAGGCTGATAATTTCCAGCGCCAAGGCAGACAGCTTCGACGGAAGATGTGGCTCCAAAATTTGAAATTCAAATTGATTGTTTTGGGTATCGTATTAGTTATTCTTCTTATAATATGGTTGTCTGTTTGTAATGGATTTAGTTGCAAGTGAAATC
TCAAATGGTTTTATGTAACATACAAGACACCGACATGTTTATCAGTGGATCAACTTTGTGTATATTGTGAAGGTGAATAAGAACACAATGAGCTTAATGAATTAATAGGGGAGGAAATGCTCATATTGAGATACATATGATGTATATAATGAAACAAATGGGCAATGTTGTTAGATGTTTCTGTTATTGATTAAAATATC
CTTGTATAACATTCTTTGTGTTTTTAAGGGTGAAGGATTGATGATTATATTAAAATTTGAAAGACTAATAAGAAGGTCAAAATTGGAAACTTCCTTATTGCATTGAAGTGTTGAATATCCACCAGCTATGAAATTTGGACACTGTTTTACACGTATGAGGTGTGTAACCTCTCAGCTTGAAGTGCCATGAAAGC
Intron 2 GTTTGATTCT ... TTGTTGCCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 62.89 | 26 | 36.3 | 51.9 |
| A2 | 61.41 | 21 | 27.1 | 40 |
| A3 | 53.81 | 16 | 15.4 | 22 |
| A4 | 68.14 | 16 | 33.6 | 35 |
| A5 | 74.21 | 3 | 8.3 | 9 |
| A6 | 66.18 | 51 | 96.7 | 104 |
| A7 | 65.63 | 41 | 80.4 | 77 |
| A8 | 70.4 | 38 | 81.6 | 99.9 |
| A9 | 76.35 | 22 | 63.4 | 79.3 |
| A10 | 71.52 | 32 | 61 | 100 |
>TRINITY_DN103538_c0_g1_i2 from sample A3 / Example spliced isoformAAAGCTTCTACCCAAAGCTTTGTTCCCGACTCGAAGAGAAAAAAATACCAAATTTATAAATAACAGGAGAAAATCCAAATACGGTTTTCACATTGTTGTCGGTTCCTTTGGAATTAAGAAACTGCGGAAGGGTTCGAAGAAGGGTTTGTAGGTTTCTCTATATCGATCTCATCCCCTCGAAAGCCGTTTTCTACAATACT
TCGCCAGTTTAAACACCCGATCTCTGCAGGTTTTATGCCCGCCATTGTCCGGCAGCCTGTGCTTTGCGTGATAAAAAATGAGGAATCTTCTCCTGGACCACTGAGGAGTGGAGACGTCGATTTGGTAATACATTGGACATATTTTGCAGTACGTCGTCAGTTCCATTGATTCCAGAATTTACATTGTAGGTTGCCTTGCA
CCAGGGGACCCAGATTTGCCTCCACTAAAGATCGTCCGGGTTTTGCTGTTTTCGGTTGACAAGATCAGGAACAAAATTTTGAAGGCAATTGCATGGGGCAATATTGTACTTGCGGAGCATACATCATTTTCTGGAAATTTTAGTATTATTGCTGTCCAGTGCCTGCAAAAGCTGCCTTCAAACAGCAACAAGTTCACATA
CACATGTGATAATCACACATTCAATTACCTTGTGGATGATGGCTTTGTGTTTCTTGTTGTCGCAGATGAAGCTGCAGGAAGACAGGTGCCTTTTCTTTTCTTGGAGAGAGTAAAAGAAGATTTTAAGCGGCGTTATGGAGGGCGGGCTGAGACAAGCATGGCACACAGCCTTGATAAGGACTACGGGTATGAAGAGAAAT
TTACTGTTGCGTACAACCTTGACAGGGAATTCGGGCCAATACTGAGAGACCACATGCAATATTGCATGGACCATCCAGAGGAGCTGAGCAAGTTTTCTAAAATAAAGGCTCAGGTTACAGAGGTGAAAGGAATTATGATGGACAATATTGAGAAGGTTCTGGACCGAGGTGAAAAGATTGAACTTCTTGTAGATAAAACA
GAAGGCTTACAATTTCAGGCTGATAATTTCCAGCGCCAAGGCAGACAGCTTCGACGGAAGATGTGGCTCCAAAATTTGAAATTCAAATTGATTGTTTTGGGTATCGTATTAGTTATTCTTCTTATAATATGGTTGTCTGTTTGTAATGGATTTAGTTGCAAGTGAAATCTCAAATGGTTTTATGTAACATACAAGACACC
GACATGTTTATCAGTGGATCAACTTTGTGTATATTGTGAAGGTGAATAAGAACACAATGAGCTTAATGAATTAATAGGGGAGGAAATGCTCATATTGAGATACATATGATGTATATAATGAAACAAATGGGCAATGTTGTTAGATGTTTCTGTTATTGATTAAAATATCCTTGTATAACATTCTTTGTGTTTTTAAGGGT
GAAGGATTGATGATTATATTAAAATTTGAAAGACTAATAAGAAGGC
>TRINITY_DN103538_c0_g1_i5 from sample A3 / Example unspliced isoform:AAAGCTTCTACCCAAAGCTTTGTTCCCGACTCGAAGAGAAAAAAATACCAAATTTATAAATAACAGGAGAAAATCCAAATACGGTTTTCACATTGTTGTCGGTTCCTTTGGAATTAAGAAACTGCGGAAGGGTTCGAAGAAGGGTTTGTAGGTTTCTCTATATCGATCTCATCCCCTCGAAAGCCGTTTTCTACAATACT
TCGCCAGTTTAAACACCCGATCTCTGCAGGTTTTATGCCCGCCATTGTCCGGCAGCCTGTGCTTTGCGTGATAAAAAATGAGGAATCTTCTCCTGGACCACTGAGGAGTGGAGACGTCGATTTGGTAATACATTGGACATATTTTGCAGTACGTCGTCAGTTCCATTGATTCCAGAATTTACATTGTAGGTTGCCTTGCA
CCAGGGGACCCAGATTTGCCTCCACTAAAGATCGTCCGGGTTTTGCTGTTTTCGGTTGACAAGATCAGGAACAAAATTTTGAAGGCAATTGCATGgtttgattctgagataatagttctccaactccatctggaccgaacactaaatataactacaaaagtcaaaagtcatggcgcagcagtcattaatatacagttttg
ttgccagGGGCAATATTGTACTTGCGGAGCATACATCATTTTCTGGAAATTTTAGTATTATTGCTGTCCAGTGCCTGCAAAAGCTGCCTTCAAACAGCAACAAGTTCACATACACATGTGATAATCACACATTCAATTACCTTGTGGATGATGGCTTTGTGTTTCTTGTTGTCGCAGATGAAGCTGCAGGAAGACAGGTG
CCTTTTCTTTTCTTGGAGAGAGTAAAAGAAGATTTTAAGCGGCGTTATGGAGGGCGGGCTGAGACAAGCATGGCACACAGCCTTGATAAGGACTACGGGTATGAAGAGAAATTTACTGTTGCGTACAACCTTGACAGGGAATTCGGGCCAATACTGAGAGACCACATGCAATATTGCATGGACCATCCAGAGGAGCTGAG
CAAGTTTTCTAAAATAAAGGCTCAGGTTACAGAGGTGAAAGGAATTATGATGGACAATATTGAGAAGGTTCTGGACCGAGGTGAAAAGATTGAACTTCTTGTAGATAAAACAGAAGGCTTACAATTTCAGGCTGATAATTTCCAGCGCCAAGGCAGACAGCTTCGACGGAAGATGTGGCTCCAAAATTTGAAATTCAAAT
TGATTGTTTTGGGTATCGTATTAGTTATTCTTCTTATAATATGGTTGTCTGTTTGTAATGGATTTAGTTGCAAGTGAAATCTCAAATGGTTTTATGTAACATACAAGACACCGACATGTTTATCAGTGGATCAACTTTGTGTATATTGTGAAGGTGAATAAGAACACAATGAGCTTAATGAATTAATAGGGGAGGAAATG
CTCATATTGAGATACATATGATGTATATAATGAAACAAATGGGCAATGTTGTTAGATGTTTCTGTTATTGATTAAAATATCCTTGTATAACATTCTTTGTGTTTTTAAGGGTGAAGGATTGATGATTATATTAAAATTTGAAAGACTAATAAGAAGGC