sp|Q0DJS1|TOR_ORYSJ ----> Serine/threonine-protein kinase TOR

Intron 1 GTGGGTAACT ... TTTGTCACAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
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A10	100	0	1	0

>TRINITY_DN131445_c6_g1_i24 from sample A1 / Example spliced isoform

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CGCTCATCGCGTTCTGTGTTCCTCCCTGCATTCAATTGCTCAATTTCTCCAGGAGCAGGACAGTCGCAGAGCCAGAACAATTCAGTCCATTTTTTAAAATCTACCAGAGATCTGAGTAGCAATGGAGTCCCAGAAAGAGGACGATTTTGAACGGGAAAAGGAGGACTGTGAACTGGAAAGAGAATTCGAATTGGAAGCTG
CTATGTACAGTAGTAGTAATTCAATGCTGTCAGGTTTAGATGGCTCTGCTCTAGGTCAACAGGGAGGACCCTCCAGGTCTGGACTCTTCAGGCATTCTAACCCTAGAATGGGAGAGACACTCCTCCATATCCTTCTCTGTGCCATTCGAGGTCCTGTGCAGTCTGCCAAGGATTTTTCTGGCATTTGGCCCATTCTTGAT
GCAGCACAGTCTCGAGATTTTTGCAATATCATGCAAGGGCTTACAAATGAGCTTGATACTCAAGGTGCATTTCCTAGAAGCAATTCCCGAGTTTCATCACTTGCCTCTTGTGCTCCAAGTGCTGATAATAGGGCTGCGGAGATGGCTTTGACAGGACTTCATGAATTTTTTAGTACAGGTGATGCAAATGTCATTGAAGG
GTATGCATCACCTGTTCTCAGAGCATGCCAGGAAATTTTGGAAGATGAGAGAACCTCCTTGACTCTCCTTCGATCACTTCTGAACCTTCTGACAGTTCTTTCAGTGAAATTTACACGATGTTTCCAGTCTCATTTTGCAGATATCGTAGATTTGTTGCTTGGTTGGGCTCTTGTACCTGATCTTTCTGACACTGATAGAT
GCATAATTACAGACACATTCCTGAAGTTTCAGAAGCTCTGGTTTTACAAGCCACAGCAACTGGTGTGCTAGAAATGAACCTGCTTGAACACATTATTGAGCCGCTCCAGGAAATGCTTCAACGATTGCTTACATGCTTGTTAATGGTCACTAAAAAGTTTGGTAATACCAAATGGCTGAAGGAATCCTCAAGATGCTTGA
TTATGTTTGCCGATCTATTGAAAGAACGCTTTGCTAACTTCTATCCTGCTGCAATGGACATATTATTCCGATGCTTAGAAACAAAGAATGCAGTTGTTTTGGGTGCTGATGCACTTTCATCTAAGCAAATTCAGGCAGTGCTAAAGACCAATCTGCAGTTAATGTCTGCACAAAGACTTGCCCTTCCAGCATCAGCAGTT
CAGAACATCCTTAAGATGGATTCATTTTTTGCATATTTACGCTTACACCCAAATCATCTTGTGACAGGGCTGGCTGCAGCCACTTATCTTTTTCTGCTAAAGCATGCCTCTAATGAAGTTGTGTCTCAAGCCATTCATTCTCTAATGGCAGAACTACAAATACTGAAGAGTCTACTTTTGCAGGCTCATTCTGCAGGAAT
TCATGTCTCAGAAGAGCTTGACAACAGAAATCATAATCAAGCTGCAGTAGATTCTCTTGGAAGGGTTCTTTCAGAAGTTGAAGTTGTAGCCTTGGCAAGATTTGATCTGATGGTCTTAGCCAATTCTTTCTTGGATACCGGAAAAACAATCTCAGATGCAATAAATGTAGTCAACTGTAGGCTTGAAAGAGCAAAAGAAC
TAAGCAATTTTATCATAGAAAAATTGAATCCTTTCAAGAAACCTTTCATATGGTACTTGGAGCTGCAGTTTGCTCTAATTCAGGCTCTACATAGGATTTGTATTGTTCTTGTTTTTGGAAAACATATGGTTGGAGAGAGACTTCCTGAAACGAGTGTTGTATTCTCGGGGTCTAATGAAAAATTTCAGACTTTAGCACAG
TCAAGCAAGGAAACAAGCATGGCAGTATCCAAGAATTTAAATGTCTATGGGTTATATATTGCTAAAGCTCTGCATATTTCGGCCAGTCTTTCTGTAAAATTGGAAGCCTTGGACTGGGTTGGTAGCCTTTGTAGGGGCATGATGACCACGAGTAATGACGATACTTTTCAATTTTATTGTTACCAGGGTTGCGAAGATTT
CCGGGCATGTTGGCATACATGTTTAAGCAAGAATATATTGTTCCCAGTTTTATGTGCAGCATCAGATAGAGACTTGAAAGTCAGGTTCCGGGTTGCATCAGTTCTTCAGCTCCTTTTACAAGCAAAGCTCATATATCCAGTATACTTTGACGCCGTTGCAAATGTGGCTCTTGAAAAACTTGGAGATCCTGATTCCTCAC
TTCAAAGTGCATTTAGGAAAGTTCTTTCACTGGTTGTCCCCGCTGCATTGTATTTGGGAGGTTGCATTGAAAATGATGATAACTATGCATACAAGCACATTATGTCTTATGTTAAGGCAGGGAGCAGAAAGTATTCACACTGGAAGCAAGTGTTTACAATCAAGCACTTGTCACAATCATCACGGTCACAGCAGCTTGTC
TATATTTTGAACTACATTTCCCAACGGTCACAGGTTGTTCCCTCTTGTTGGTTCCAGCGTCTTGTTCTTAGCTATCATGGAAATTTAAAGAGTTGGCTTCCAAAACCACACAAAGATCGATTAAACTCAGAAGCAGGTAGCCTGTGGTTGGACCTTAATGTTGACTGTGAAACGCTTGAGAGAGTCTTTTCCACCAACAA
TCTTGCTGCTGCTTGGTGGTCTATACATGAAGCAGCTCGTCACTGCATCACTGTTCGGCTTCGCACTCATCTTGGTGGACCCACCCAAACATTTGCTGCTTTAGAGCGAATGCTGTTAGATATAGTGCAATTATTACAATTGGATTCTGGGCAACGTGAATCAAGTAGTGGCACAAGCTCTTCAGGTGTCCATTTATTGC
CGATGAGACTTTTATTAGAATTTGTGGAGTCTTTGAAGAAACAAATTTATAATGCATACGAAGGTTCTGCTGTATTACCAGCTGCACCCACTCAAAGTGCTCTATTCTTTCGTGCAAATAAAAAGGTGTGTGAAGAGTGGTTTGCTCGTATTTGCGAGGCGCTGATGAATGCTAGCTTAGCAATCCAATGCAATGCAGGT
ACATTCCATCATGCTGCAACACGTTTGCAAGACCTTAGAAATGCAGCAGCACCAACATTAAGGGATATGGCTAGAAGTCAAACAGCGGATAATTCACAGGGCTTGAGAGCAAAATTGATAAATGATGTGCTCCGAATCTTACGCCACGCATCACTAGCCTTGTCCAGACTTCATGAGTCAGATGCCATTGTTGGTCTCCA
GATATGGGCAACATCGACCTTTGTTACACCTCTTCTAGATGACAGTTTGCTAGGACTGAAAGCTTTGGGAGGATTTGGACTATTTGGATGGATGACAGGTCTTGTATATCAAGCTCGTGGGCAATATGAAAAAGCCACGGCCCACTTTACACACATGCTTCAGTCTGAGGAAAATCTTTCTTTGATGGGTGCTGATGGAG
TACAATTTGTCATTGCACGTATAATTGAAAGCTATGTAGCTCTAACAGATTGGGAATCTCTAGACCACTGGCTTCAGGAACTGCAGTTGATTCGAGCCAAGCATGCAGGGAAGTCCTATGCTGGAGCATTAACAACTGCTGGCAACGAAATGAATGCTATTCATGCTCTAGCTCGCTTTGATGTAGGTGATGTGCAAGGT
GCATGGGGATACTTGGACTTGACTCCACAGAGCAGCAGTGAACTTACAGTAGATCCTAGGCAGGCTCTTCACAGAAGTGAGCAAATGCTTTTGCAGGCAATGCTTCGTACTGATTCCCAAGAAAAAGAGATTAAACTGGAAACAGAGAAGGCAAAGGTGATGTTAGAAGAGGCTTTGCTAGTATCTTCAATTGATGGTTT
GCCTGAGGCAGCAGCATATGCAACCCAGTTTCACTGTATTTATGCCTTTGAACAAGGACGCAGACTTAATGCTGGCCATGATGAATCTGGGGAGTTTGCATCAATACTTAGTTCCCTGCAGAATGCAGTCCAAGTGCCGATGAATCCATTACAACAAGATTGTCTTCTGTGGTTGAAACTCTTACGCGTCTACCATGTTG
TGCTACCAGAGTCAAAGTCAACTTTGCAGCTTTGCCAACAAGTCATAAAACTAGCTCGCAAACAAACCAATTTCCAACTGGCTCATCGTCTGCACCAAGAATTGTTGAGTGGTATTTCAAGACGTCACAAAGATGACTTTTCTGAATGGCTTGTTGCAAGCTTACAGTATGAGAGTATTCTGCTTCTTTTTGCAGAGGGA
AAATGTGAGGAAGCCATAGTAGAGCTTTGGTCATTGGTACGTTCTTACATACCATTTTCTGCCTTGTCTGTTTCTGCATCTGGCAATATGTTGAAGGCGAAGGCATGTGTGAAACTGTCATTTTGGTTGAAAGAAAAGTATTCTGAAATACATTGGCCAAACTTACTCCCAAAAATGAGTTTAGATAACCCTAAGTTCAG
ATCAAGTGATATTGCTGCTAATTTGGACGAGGGAGCCACTTCAAGGGAAACTGGCTGGATGTCAGCTGGCAGCTACAACTTGATAGTTGAGGAGGTGGTTGGTGCTTCCATTAAAGCAGCAACACTTCTGTGTCCAAATATGTCTAAGGCATGGCTGTCATATGCCTCTTGGTGTTACCATCAAGCCAGAGCATCACTTT
CAGGTGATGGTGCAGCTTTAAGGTCATGCAATTTGTCACCGATTCTGATTCAGGAAGTTTCTTCTGATGGGACAGGTTTACTTGAAGAAGAGGTAATGCGAGTGCGAGCCATTATCATGAGAACACTCTTAAATAATGAAAAAGCGGATCCAGGAAGTGAGGAAATATTACTGTGGCCGGACACTGAAGTGTACATGAAC
AGTGAAAATATTAACTTTGTAGAACTATTGGTCCAACGTACTGTATATATGATGCAGTCAGCAGCAGGTGCAGCAGGAGTTGAAAATTCAGATGGTGAAAGTGCTTGTTCGCTTTTGGTTGCTCAACTTCAGCGAGAACTACTGAATATCAAGCACAATATAGATTCCTCTCTTATGACATCTTTGATTAATGAATTGAT
GGACATCTGGTGGACTTTGAGGAAGAGAAGGGTATCATTATTTGGCCATGCAGCTCGTGGCTTTTTACAGTATCTTTCACTATCAAATAGGACACATCTTGAACAAGGTCCTTGGAAAAGCTATAATTTAGATGTTTTAAAACATGGGAGGGAAGACTGCACACTCAGAGCAACTTTATACATATTAAATATCCTTCTAA
ATTATGGAGTAGAATTAGGAGAGACACTTAAAAATGGTCTTATGACAGGGCCACCTCTACCATGGCAGG

>TRINITY_DN131445_c6_g1_i23 from sample A1 / Example unspliced isoform:

GCGTTCTGTGCGATGACATGCTTTTGAGAACGCGAAATTAATGGAGTCGGTGATGAAAGAGCTCGAGGCTCTGAAGGTGGTTCGGAAGGTGGCCAGTCGTTGGGAAGGTGGCCACGGGACCGTGCTCTTGGTCCGAAGGAAAGGCAGCAACAGGCAGGTGCGAATTTCGTTGTTCTGGTACCTTTCATAGGTGTTTTTAA
CGCTCATCGCGTTCTGTGTTCCTCCCTGCATTCAATTGCTCAATTTCTCCAGGCTCAGTCATTTGAAATCCAAACCGACTGAACAATTCAACTGTTTTCACAATGGAGCAGGACAGTCGCAGAGCCAGAACAATTCAGTCCATTTTTTAAAATCTACCAGAGATCTGAGTAGCAATGGAGTCCCAGAAAGAGGACGATTT
TGAACGGGAAAAGGAGGACTGTGAACTGGAAAGAGAATTCGAATTGGAAGCTGCTATGTACAGTAGTAGTAATTCAATGCTGTCAGGTTTAGATGGCTCTGCTCTAGGTCAACAGGGAGGACCCTCCAGGTCTGGACTCTTCAGGCATTCTAACCCTAGAATGGGAGAGACACTCCTCCATATCCTTCTCTGTGCCATTC
GAGGTCCTGTGCAGTCTGCCAAGGATTTTTCTGGCATTTGGCCCATTCTTGATGCAGCACAGTCTCGAGATTTTTGCAATATCATGCAAGGGCTTACAAATGAGCTTGATACTCAAGGTGCATTTCCTAGAAGCAATTCCCGAGTTTCATCACTTGCCTCTTGTGCTCCAAGTGCTGATAATAGGGCTGCGGAGATGGCT
TTGACAGGACTTCATGAATTTTTTAGTACAGGTGATGCAAATGTCATTGAAGGGTATGCATCACCTGTTCTCAGAGCATGCCAGGAAATTTTGGAAGATGAGAGAACCTCCTTGACTCTCCTTCGATCACTTCTGAACCTTCTGACAGTTCTTTCAGTGAAATTTACACGATGTTTCCAGTCTCATTTTGCAGATATCGT
AGATTTGTTGCTTGGTTGGGCTCTTGTACCTGATCTTTCTGACACTGATAGATGCATAATTACAGACACATTCCTGAAGTTTCAGAAGCTCTGGgtgggtaacttgcagttctcgctaaacttgttaaccaaatttttaggagacatggaagttttagctcaggatgcaactcctggaacactgcaacaattacgacgat
tgcttgtgcttgtttcctgctttgtcacagTTTTACAAGCCACAGCAACTGGTGTGCTAGAAATGAACCTGCTTGAACACATTATTGAGCCGCTCCAGGAAATGCTTCAACGATTGCTTACATGCTTGTTAATGGTCACTAAAAAGTTTGGTAATACCAAATGGCTGAAGGAATCCTCAAGATGCTTGATTATGTTTGCC
GATCTATTGAAAGAACGCTTTGCTAACTTCTATCCTGCTGCAATGGACATATTATTCCGATGCTTAGAAACAAAGAATGCAGTTGTTTTGGGTGCTGATGCACTTTCATCTAAGCAAATTCAGGCAGTGCTAAAGACCAATCTGCAGTTAATGTCTGCACAAAGACTTGCCCTTCCAGCATCAGCAGTTCAGAACATCCT
TAAGATGGATTCATTTTTTGCATATTTACGCTTACACCCAAATCATCTTGTGACAGGGCTGGCTGCAGCCACTTATCTTTTTCTGCTAAAGCATGCCTCTAATGAAGTTGTGTCTCAAGCCATTCATTCTCTAATGGCAGAACTACAAATACTGAAGAGTCTACTTTTGCAGGCTCATTCTGCAGGAATTCATGTCTCAG
AAGAGCTTGACAACAGAAATCATAATCAAGCTGCAGTAGATTCTCTTGGAAGGGTTCTTTCAGAAGTTGAAGTTGTAGCCTTGGCAAGATTTGATCTGATGGTCTTAGCCAATTCTTTCTTGGATACCGGAAAAACAATCTCAGATGCAATAAATGTAGTCAACTGTAGGCTTGAAAGAGCAAAAGAACTAAGCAATTTT
ATCATAGAAAAATTGAATCCTTTCAAGAAACCTTTCATATGGTACTTGGAGCTGCAGTTTGCTCTAATTCAGGCTCTACATAGGATTTGTATTGTTCTTGTTTTTGGAAAACATATGGTTGGAGAGAGACTTCCTGAAACGAGTGTTGTATTCTCGGGGTCTAATGAAAAATTTCAGACTTTAGCACAGTCAAGCAAGGA
AACAAGCATGGCAGTATCCAAGAATTTAAATGTCTATGGGTTATATATTGCTAAAGCTCTGCATATTTCGGCCAGTCTTTCTGTAAAATTGGAAGCCTTGGACTGGGTTGGTAGCCTTTGTAGGGGCATGATGACCACGAGTAATGACGATACTTTTCAATTTTATTGTTACCAGGGTTGCGAAGATTTCCGGGCATGTT
GGCATACATGTTTAAGCAAGAATATATTGTTCCCAGTTTTATGTGCAGCATCAGATAGAGACTTGAAAGTCAGGTTCCGGGTTGCATCAGTTCTTCAGCTCCTTTTACAAGCAAAGCTCATATATCCAGTATACTTTGACGCCGTTGCAAATGTGGCTCTTGAAAAACTTGGAGATCCTGATTCCTCACTTCAAAGTGCA
TTTAGGAAAGTTCTTTCACTGGTTGTCCCCGCTGCATTGTATTTGGGAGGTTGCATTGAAAATGATGATAACTATGCATACAAGCACATTATGTCTTATGTTAAGGCAGGGAGCAGAAAGTATTCACACTGGAAGCAAGTGTTTACAATCAAGCACTTGTCACAATCATCACGGTCACAGCAGCTTGTCTATATTTTGAA
CTACATTTCCCAACGGTCACAGGTTGTTCCCTCTTGTTGGTTCCAGCGTCTTGTTCTTAGCTATCATGGAAATTTAAAGAGTTGGCTTCCAAAACCACACAAAGATCGATTAAACTCAGAAGCAGGTAGCCTGTGGTTGGACCTTAATGTTGACTGTGAAACGCTTGAGAGAGTCTTTTCCACCAACAATCTTGCTGCTG
CTTGGTGGTCTATACATGAAGCAGCTCGTCACTGCATCACTGTTCGGCTTCGCACTCATCTTGGTGGACCCACCCAAACATTTGCTGCTTTAGAGCGAATGCTGTTAGATATAGTGCAATTATTACAATTGGATTCTGGGCAACGTGAATCAAGTAGTGGCACAAGCTCTTCAGGTGTCCATTTATTGCCGATGAGACTT
TTATTAGAATTTGTGGAGTCTTTGAAGAAACAAATTTATAATGCATACGAAGGTTCTGCTGTATTACCAGCTGCACCCACTCAAAGTGCTCTATTCTTTCGTGCAAATAAAAAGGTGTGTGAAGAGTGGTTTGCTCGTATTTGCGAGGCGCTGATGAATGCTAGCTTAGCAATCCAATGCAATGCAGGTACATTCCATCA
TGCTGCAACACGTTTGCAAGACCTTAGAAATGCAGCAGCACCAACATTAAGGGATATGGCTAGAAGTCAAACAGCGGATAATTCACAGGGCTTGAGAGCAAAATTGATAAATGATGTGCTCCGAATCTTACGCCACGCATCACTAGCCTTGTCCAGACTTCATGAGTCAGATGCCATTGTTGGTCTCCAGATATGGGCAA
CATCGACCTTTGTTACACCTCTTCTAGATGACAGTTTGCTAGGACTGAAAGCTTTGGGAGGATTTGGACTATTTGGATGGATGACAGGTCTTGTATATCAAGCTCGTGGGCAATATGAAAAAGCCACGGCCCACTTTACACACATGCTTCAGTCTGAGGAAAATCTTTCTTTGATGGGTGCTGATGGAGTACAATTTGTC
ATTGCACGTATAATTGAAAGCTATGTAGCTCTAACAGATTGGGAATCTCTAGACCACTGGCTTCAGGAACTGCAGTTGATTCGAGCCAAGCATGCAGGGAAGTCCTATGCTGGAGCATTAACAACTGCTGGCAACGAAATGAATGCTATTCATGCTCTAGCTCGCTTTGATGTAGGTGATGTGCAAGGTGCATGGGGATA
CTTGGACTTGACTCCACAGAGCAGCAGTGAACTTACAGTAGATCCTAGGCAGGCTCTTCACAGAAGTGAGCAAATGCTTTTGCAGGCAATGCTTCGTACTGATTCCCAAGAAAAAGAGATTAAACTGGAAACAGAGAAGGCAAAGGTGATGTTAGAAGAGGCTTTGCTAGTATCTTCAATTGATGGTTTGCCTGAGGCAG
CAGCATATGCAACCCAGTTTCACTGTATTTATGCCTTTGAACAAGGACGCAGACTTAATGCTGGCCATGATGAATCTGGGGAGTTTGCATCAATACTTAGTTCCCTGCAGAATGCAGTCCAAGTGCCGATGAATCCATTACAACAAGATTGTCTTCTGTGGTTGAAACTCTTACGCGTCTACCATGTTGTGCTACCAGAG
TCAAAGTCAACTTTGCAGCTTTGCCAACAAGTCATAAAACTAGCTCGCAAACAAACCAATTTCCAACTGGCTCATCGTCTGCACCAAGAATTGTTGAGTGGTATTTCAAGACGTCACAAAGATGACTTTTCTGAATGGCTTGTTGCAAGCTTACAGTATGAGAGTATTCTGCTTCTTTTTGCAGAGGGAAAATGTGAGGA
AGCCATAGTAGAGCTTTGGTCATTGGTACGTTCTTACATACCATTTTCTGCCTTGTCTGTTTCTGCATCTGGCAATATGTTGAAGGCGAAGGCATGTGTGAAACTGTCATTTTGGTTGAAAGAAAAGTATTCTGAAATACATTGGCCAAACTTACTCCCAAAAATGAGTTTAGATAACCCTAAGTTCAGATCAAGTGATA
TTGCTGCTAATTTGGACGAGGGAGCCACTTCAAGGGAAACTGGCTGGATGTCAGCTGGCAGCTACAACTTGATAGTTGAGGAGGTGGTTGGTGCTTCCATTAAAGCAGCAACACTTCTGTGTCCAAATATGTCTAAGGCATGGCTGTCATATGCCTCTTGGTGTTACCATCAAGCCAGAGCATCACTTTCAGGTGATGGT
GCAGCTTTAAGGTCATGCAATTTGTCACCGATTCTGATTCAGGAAGTTTCTTCTGATGGGACAGGTTTACTTGAAGAAGAGGTAATGCGAGTGCGAGCCATTATCATGAGAACACTCTTAAATAATGAAAAAGCGGATCCAGGAAGTGAGGAAATATTACTGTGGCCGGACACTGAAGTGTACATGAACAGTGAAAATAT
TAACTTTGTAGAACTATTGGTCCAACGTACTGTATATATGATGCAGTCAGCAGCAGGTGCAGCAGGAGTTGAAAATTCAGATGGTGAAAGTGCTTGTTCGCTTTTGGTTGCTCAACTTCAGCGAGAACTACTGAATATCAAGCACAATATAGATTCCTCTCTTATGACATCTTTGATTAATGAATTGATGGACATCTGGT
GGACTTTGAGGAAGAGAAGGGTATCATTATTTGGCCATGCAGCTCGTGGCTTTTTACAGTATCTTTCACTATCAAATAGGACACATCTTGAACAAGGTCCTTGGAAAAGCTATAATTTAGATGTTTTAAAACATGGGAGGGAAGACTGCACACTCAGAGCAACTTTATACATATTAAATATCCTTCTAAATTATGGAGTA
GAATTAGGAGAGACACTTAAAAATGGTCTTATGACAGGGCCACCTCTACCATGGCAGGAGATAATCCCTCAGCTATTTGCTCGGTTGAGCACTCATCCTGAACATCAGGTTCGTAAACGGTTGGAGGGGTTGTTGATTACATTGGCAAAGTTATCTCCATGGGCTATAGTCTATCCTACACTTGTTGATATCAGTGCTTA
TGAAGGCGAGCCATCAGAGGAGCTTCAACGCATCTTAGACTGTCTGGTTAAAGTTCATCCAAAACTGGTTCAGGACGTGCAATTAATGATATTGGAACTTGGGAATATTACTGTTCTTTGGGAGGAGCAGTGGCTTAGCACACTACAAGATCTTCATGCAGATGTTATGAGACGGATAGCTACACTGAAAGAAGAGGTTT
CCAGGGTGGCAGAGAACATTACACTTACTCACAGTGAGAAGGTTAAAATAAATGCTGCCAAGTATTCTGCAATGATGGCACCAATTGCTGTAGCTTTGGAACGGCGTCTAGTTTCCACATCTCGGATGCCGGAAACTGCCCATGAGGCTTGGTTCCAGAAGGAATATGGTGAGCAACTGAAAGCTGCTATAACAAATTTC
AAGACCCCTCCTTCAACTGTTGCTTCCCTTGCAGAAATGTGGCGACCTTTTGATATAATTGCTGCATCTTTGGCGAACCATCAGAAGAAATCATCAGTCTACCTGAGTGAGGTTGCTCCACGACTTGCACAGCTGGCTTCTTCTGATGCTCCAATGCCTGGTCTTGAGAAACAGATATCAATGTCCGAATCTGAAGGAAT
TCCTGGCAGCGATCTTCTGGGCCTGGTTACAATTTCTTCTTTTAGTGAACAGGTCACTATTCTTGCAACAAAGACAAAGCCAAAGAAGCTAGTTCTATTGGGTTCAGATGGTCAAAGGTATACTTATCTTCTCAAGGGCCGGGAAGATTTGCGACTTGATGCAAGAATAATGCAGCTTTTGCAAGCTGTGAATGGAATGC
TACATGCAAGCACAAGTACACAGGGTCGTTCGCTAGCAGTTCGCTACTATTCTGTAACTCCTATAAGTGGGCGAGCAGGCTTGATCCAATGGGTGGACAATCTTATAAGCATGTATAGTGTATTCAAAGCTTGGCAGCAGCGTGCACAGTATGCTCAGTTTACATCTACTACTAGTGGTACTGCAGCTGCAAACACTCCC
ATCCCACCTGTTCCACGTCCCAGTGATATGTTCTATGGGAAGATTATTCCAGCACTAAAAGAAAAAGGTTTGCGTAAAGTCATTTCACGACGGGATTGGCCACAAGAAGTAAAAAGAAAGGTTCTGTTGGACCTTATGAAAGAGACTCCTCGTCAACTACTTTATCGAGAAATTTGGTGTGCAAGTGAAGGATTCCAAAC
CTTTAACTCAAAACTACAGAGGTTTTCAGGCAGTGTAGCAGTCATGAGCATGGTGGGGCACATTCTAGGTCTGGGTGATAGACATTTGGATAATATTCTTATGGACTTCAACACTGGTGATGTTGTCCATATAGATTATAATGTGTGCTTTGACAAGGGACTGAGATTGAAGATTCCGGAGATAGTACCATTTCGTCTTA
CTCAGATTATGCAAGCAGCATTAGGACTCATGGGAATAGAAGGCACATTCAGAGCAAACTGTGAATCTGTAATTGACATTTTACGGAAAAACAAAGACATAATCTTGATGCTTTTAGAAGTATTTGTATGGGATCCATTGATTGAGTGGATGCGTGGAGATGGCCACGATGAAGCAACCATTGGTGGAGAGGAACGGAAA
GGTATGGAGTTGGCAGTCAGTTTAAGCCTATTTGCTTCTCGAGTTCAAGAAATACGAGTACCACTTCAGGAGCATCACGATCTGCTGTTAGTAACTCTTCCTGCAGCATCATCTGCACTTCAGAGTTTGGCGGATTTGCTTGATCGGTATGATAGAATATCCACTGCATTTGTCCATGCTGAGCAAGAAAAATCCAAATC
TGCTATTGCAGAGGCATCTGCAAAGTCTATTGTTACAGAGGCAGCAAACAATCTTGAAAATGTTCAGATGGCTTATGAAGTACAAGCTCGTGAATTTGCACAGGCCAAGGCACTTGCCACTGAAGCTGCCCAGAAAGCTTCTATGTGGGTTGAACAACATAGCAGAGTTCTAGATGCATTACGCAGTGGTTCAGCTCCAG
AGCTTCAGGCTATTGGGCAACTTCCTCATACAACTGAGGCTTTGTCTCTAACATCTGCTGTGTTGGCCTCAGGAGTTCCCCTTACCATTGTTCCGGAGCCTACTCTAGCACATTGCCGAGATGTTGATAGGGAAGTTGCACACCTTATAAAAGAACGTCATGAAGCTATTTTGCATGCAGCCAAAGCACTACAGACTTAC
TCTGTGGCTTTGCAACGGCTTCTTCCAGGAAATTACATCGGTACCAGTCAGGTGCATAATTGGGCACAGGTTTTGCAATTGTCTGTGAGGAACCTCTCTCCAGATGCGCTTGCCTTAGCCAGAAGACAAGCTTCTGATCTTGTTGCAAAAGGACAGGGTGAACATGCAGACACTATACATCAGAAGTATGAAGCATTGCG
TGTGAAAATAGAGAGGCTTGTGAAAGAAATCAGAAAAGTTCAAGAAGACTGTTCTGAACTTGAGGCATCGATTGAATCAGAAAATGAACGGAAAGCTAAGGATCGAGTGCTGGCCATTTTTACAAAACATCTGCAGCCTTCTAACTATCCTAGGAAGGATGAGGATGCTCTTGCTAGGGATTCAGGTCATAACAAACAGG
ATGAAACCAAGGAGCATGATGCTAGTTCTTCAGACTACGTTGACAAGAAGGTTAAGGTATTAACCGTTCTGTATCTTGCTGCAGCTGCTTTATACAGCGAGATCAAAGACAAGATATTTAATATCTGCAATTCTTTGACAGAGAGAACTGCAGTAGGTCCAGGAGAAGATATAGGGTGCCAAAATTGGAAATGGTGTTTA
CCTGATTTGGAGGAGCAAGTTGCAAGATGTACACTTATTTCGGGAATTGTGAATGAAGTTCAGCAAATGAGTGGACAAAATTTGATCCAACGTGGATCGGGCTGGTGGGATACAATGGGTTCTGTTGATGATGATTGGACTTTGAGCTTTCAGGGTTGTTTGACTGCAATTCGTAGACTAGTGGGTCAGCTGGTTGGACG
TGCAATTCCAGAATCAATAAGATCAGTTCTTTCCCACAACCCTGCAATTATGGAGGCATTTGGTTCACTTTCACAAATACGAGGAGCTGTTGATACAGCACTGGAACAGTTGGCTGAAATTGAAATGCAAAGGGCTTCTTTATTAGAACTTGAGAGGACCTACTATGAAAATGTTGAGGAGATCACTGAACGGAAAGTGT
CGCTGGAAACGGCTATTGAAAAGGGTAGGGATCACCTTTCTTGGGAAGAAGCAGAAGAGCTTGCAAGTCAAGTGGAAGCCTGTCGAGCCCAGTTGGATAAACTGAAGAATGCATGGGACCGCCGAGATGCTCAAGCTTCTGCACTTGTGAGGAAAGAGGCAAGTGCACGAGGTGCTTTAGTGGCAGCAGAACAACGCTTT
GAGTCTCTTGTTACCATTGAGCGAGAAGGAGACATGCATCCTACAAGGGGAAAAGTTTTACTTGCAACATTTGCTAGGCCATTCTCTGAACTGGAATCCTACAATCAGAAGTTGCCTTCTTTTGGGTATGAACCCTCCTTGAGAAAGAGTTCAGTGGATCAGACAGAGATTGTCACTTCTGGCTTTTCTGGGTTCGAGTC
AGTCTGGAAGGTCACTAATATTTTAAAGGACCATACATTCTTTGTGTGGAAAGTTAGTATTATTGATACTTGTCTTGATTCATGTATCCGTAATGTTGCATCAGCTGTAGATCATACCTTAGGTTTTGACCAGACGGTTAGCAGTCAGAAGAGGAAGCTTGAGATCCTAGTTGAGTATTATTTAGATCAGTATCTCAAGG
AACGGCTTGATCCTGTTCTCCTTGAGTGCCTTGAGAAAGAGGGAGACTCATTGAAGCACATTTTGGTGGATCAAAGGGAGTTGGAATCAAATCTAGCAAAGAAAGAGCTTGATGCGGTAAAGCGGGCTCAGGGTCTGCTTGTTGAATATAGTAATGCACATGAAACTGCACGAGCTGCTAAAGCAGCAGCTTGTGCAATG
AAGATGCAAGTGGGAGAGCTCACACAGGATCTTCAGAAGGCAAACCTTGAGGCTGCCCAATTAGAGTGGCTTCATGATTATATACTTTCTCATTTAGATCAAAATACTATCCTCCAACAGAGCTGTGCAAATGAAGACAATTTTCCATCAAGCTCTATAAAGCTTAACAGAAGAAATTTATTAGAAAACCTTCGATCTGC
AATGTCTGCTATCACTAGAGCAACAGAAGGTTTACAAAACTGTGAGAGATCTGCCATTTCCACTGAGGAACAGCTTGAGAGGGCCATGGGTTGGGCTTGTGCAGGACCCAATACTGGTGGTGGCTCAAACTATTCGGGTAGAGGGATGGGAATTCCCCCTGAATTTCACGAGCATCTTCGTCACAGACGACAGTTGTTAT
GGGCAGGCCAAGAACAGGCTACGGGTATACTGAAGCTCTGTTCTGCTGCTCTGGATTTTGAGGATTCTAGGGATGGTTTCCTAAGGTCTCTTTCAGATGCATCTACTGGTGGAGCTCTAAGTGAAGGCAGAGCTTGGCAGCAAGCATACATGAATATCATTTCAAGATTGGACATTTCTTATCACTCGTTTACTTGTGCA
GACCGTGAATGGCATTTAGCACAGAAAAGCATGGAAGCAGCTGGTGCAAGTCTTTCTACTGCAACTAATGATTTGTGCCTCGTATCTATAAAATTGAAGTCCACGTCAGGTGAACTTCAAGCTACACTTTCAAGCATGAGGGATTGGACAGTTAAAGCAAGTACAGATCTGTCAGCATTTTGCCGTGTGGCAAGGGGAAA
TTCTGCTCTAACAACTGAGAGTGGATCAATGCTTGAAGAGGTTTTGGCAATAACGGAAGGAGCAGAAGGTGCACATGATGTTTATAGATTGGCAAAAGAAGCCACAGCACAACATAGTAATCTAATGTCTGAACTTAACAAAGTTAACATGCTTCTTCTTCCTCTGGAGTCCATGCTGGCTTCTGCATCAAATACAGTAA
TTGGTATTATTAACAGGGATGGTGAACAGAAATTGGAAATCTCTGTGGGTCAAGGCCAAGCATTAATCCAATCACTTCATATAAAGCTTGGAGAGGTTTGTCCTGTTTTGACAAGCACAGTTCCAGTTCTCCTGAACACTGTCAAAGAGCTACATATTGCTTTAACCAGACTTGCACGCACTGCAAGCTTTGATGCTGGT
GTTCTCCATAAAGCTCTTGAAGGTGTTGGGGAAAGTCAAGAAGCACGGTCTCAAGAATTAGATTTAGTCAGGACAGAACTTCCAGAAGATGAAGTGTTGTCTGCAGAACAAAATAGAAATATCATGGAAGCAGTTGTTGACAATGATGAACATGGTGGAGAGTCGATAACAGATGAAGAGCTCCTGCTACAAGGTGATGA
AGACTCCTGGATCTCACCTCCTGATAGTTTTTATACTAATGATTCTGAGTCAGACAATACTTCCCCAGACTCACAACATCAAGATGACTCTTTGACCATCTCCAATGACTGGGAATCTCATATAAATGGAACTGACAAGGCTAAGTTTAGTGAGGGAGTGGTATCAGATGCTTCAAGGTTTACAGTGAATGAGGATACTG
GATATACTTCTCCATCCTTTTTGGCCCATAGCCAAGAAGATCCTTTGCTAGTTGGGCATATTCAAACAGACATGAAATTTGAAGGTACAGAGGATAGTGAGAATGGGATTATTTCTATGGGAAATAGTCAAATTCATTCTGTCAAGGACACAAGTCAGAGGCCAGAAGGCTCACAGGCATCAATAAGTTCAAATAAGGTC
AGTTCTGACAGTCAGAATGCTACACACATGAACTTGTCAGACATGGGACTTGGATCTATGAATGTTTTTGAAAGACATCAGACAGGAGGAGAGATACAAATGAGGATGAAGGAAAAAGAACCTCATATATCTCGAGCTAAAGGAAGGGTTGAAAGTTATAGTGACCTATGCACACTATTTTCTTCTATGAACACGGAACA
AAGAAGTCATGGTTTTAGGGGGAAAAATGCTTATGCAGTCTCGGTGCTGAAACGAGTTGAAGCAAAGCTGGATGGCCGAGACATTGATGGGAAAAGACAATTTTCTGTTTCAGAACAAGTGGATCATCTTCTTCGTCAGGCTACAAGCATTGATAATTTATGTAATATGTATGAAGGTTGGACACCTTGGATATGATGCC
CTACAAATAGCCTCTTCAAGTTCCTGCTACTTCTCCTGGAAAGGCAGTGTTATTTTTGAGCTGGCTGGTATTCCCATTGTGTCACTTGTCAGTGATCTCAATCATCGCAGAACAGTTTAGGGTCCACCTTTTGTCTATCTTGGGTTAGACTCGTCACAAATCATTAGGATAGAAGAAATCCATTTTGGTCAATGGTGAGA
ATAGAAGAATGCTAAGGAAAATTCATCCATCATGGAAGTTGAGGCTTGAAGAATTGTTACAATCCTCTACTTTCTTTAAGCAAGATTCTGTTAAGGAAACACACAGAGACACCTTGAATTAGGATGTGATTTTACTCACAAAGGTCAGATCAGAGCACCTCCATTGTCAATATTTTAATGGAACTGCATTGTCAGGTGCA
AACTTGAGCTAGAAAAAAATGTGGACTTGTTTGATTGAGAGATAACAAACTGTCAACAACCATCCCGCCAGAGAAATGCTTTAATACTAGGTCACTTGCGCTTTGTAGTGGAAGTGCAGGATAAGTCACAAAACCGTGCTTTGCCATTGCTTGGGCAGGGCACTGTCCAGTCCATGTAGAGGTGCTGCTGGCAGTATATT
GCAGTGAGTCCAATTTCACAGCTTAACATACCCAAGTGACTTATATCAGAATTTTGGTGATCACGAAGAATCTGTTTTAGAGCATTCAGCAAAGTATTGCAAAGTGAATAGTGGAGAATTGGTGAAAGGAAATGCAAAAGAGCATTCAATGCAGGTAGTATGGTGAAATGGTAGCATCAGACTATTCTCAGTATTGGGAT
GCGATTGAGTTTTGCCAGTACTTCGAAAACAAATGCTATAAATCAAACTGCATGAAATTATATCTTGAAGCAATGGTAATGAAAATAATGGTTGAATTGAGAGGGTTCCTGTAGAAGAAGATCTTGATCACTAGGTACTTCAACGACAGATTATTTTAGCATGGCAGTTTGTTATTTTGGAGAATTTTCTTGTGGCAGTG
AATTATTTATCATTGCAGCAGGTAGGTATGGTGAAATGATAGCCAGATCAAAATCAAATGATATATGTTAAACTGTGTGAGACTCTATATCGAAGTAAAAGTTTTGAAAAATATGTTTGAGTTGAGAGGGTTACCTGTGAAAAGAAGTACTTCGTTACTGGGTACTTCAGCAATAGATAATATTAGCATGGTGATCAGTA
GACAATCGTTTAGGAAAGAGGAGGGTATAGGTAGATCTTCCCTGTATTTATACCCTCTTATCAAGGGTTATTCTTCATTTATATGATTGATTAAATTTCTTTTCACTGGTTCTTCTTAGGCTCTTTCTATATGAGATCTGTTCACGTGTTTTATGTTTCTAGTTTTGCAAATAGATTATGTTTATTTTTATTCAGCATCT
TAAAATACACATAATTGCTTTTCATTGTAACTACTATATTTGAAATGAGTTGTGTTGCTTAGTAAAGAAAGCGGGTTTGGGGA

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TACTTGAAGAAGAGGTAATGCGAGTGCGAGCCATTATCATGAGAACACTCTTAAATAATGAAAAAGCGGATCCAGGAAGTGAGGAAATATTACTGTGGCCGGACACTGAAGTGTACATGAACAGTGAAAATATTAACTTTGTAGAACTATTGGTCCAACGTACTGTATATATGATGCAGTCAGCAGCAGGTGCAGCAGGA
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CTTTGGCGAACCATCAGAAGAAATCATCAGTCTACCTGAGTGAGGTTGCTCCACGACTTGCACAGCTGGCTTCTTCTGATGCTCCAATGCCTGGTCTTGAGAAACAGATATCAATGTCCGAATCTGAAGGAATTCCTGGCAGCGATCTTCTGGGCCTGGTTACAATTTCTTCTTTTAGTGAACAGGTCACTATTCTTGCA
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AGGTTTTGCAATTGTCTGTGAGGAACCTCTCTCCAGATGCGCTTGCCTTAGCCAGAAGACAAGCTTCTGATCTTGTTGCAAAAGGACAGGGTGAACATGCAGACACTATACATCAGAAGTATGAAGCATTGCGTGTGAAAATAGAGAGGCTTGTGAAAGAAATCAGAAAAGTTCAAGAAGACTGTTCTGAACTTGAGGCA
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GGCTTCATGATTATATACTTTCTCATTTAGATCAAAATACTATCCTCCAACAGAGCTGTGCAAATGAAGACAATTTTCCATCAAGCTCTATAAAGCTTAACAGAAGAAATTTATTAGAAAACCTTCGATCTGCAATGTCCGCTATCACTAGAGCAACAGAAGGTTTACAAAACTGTGAGAGATCTGCCATTTCCACTGAG
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agagagggcaagtcctatggtctatatgggctcacttgctctttcattaatttatatcatatatataaatatatttgatttaagcatttaatatatctaagtgcaaggattctgcatgcactaatgtctgtatatcaatgccagtgctgataatagggctgcggagatggctttgacagGACTTCATGAATTTTTTAGTA
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AATGCAGCAGCACCAACATTAAGGGATATGGCTAGAAGTCAAACAGCGGATAATTCACAGGGCTTGAGAGCAAAATTGATAAATGATGTGCTCCGAATCTTACGCCACGCATCACTAGCCTTGTCCAGACTTCATGAGTCAGATGCCATTGTTGGTCTCCAGATATGGGCAACATCGACCTTTGTTACACCTCTTCTAGA
TGACAGTTTGCTAGGACTGAAAGCTTTGGGAGGATTTGGACTATTTGGATGGATGACAGGTCTTGTATATCAAGCTCGTGGGCAATATGAAAAAGCCACGGCCCACTTTACACACATGCTTCAGTCTGAGGAAAATCTTTCTTTGATGGGTGCTGATGGAGTACAATTTGTCATTGCACGTATAATTGAAAGCTATGTAG
CTCTAACAGATTGGGAATCTCTAGACCACTGGCTTCAGGAACTGCAGTTGATTCGAGCCAAGCATGCAGGGAAGTCCTATGCTGGAGCATTAACAACTGCTGGCAACGAAATGAATGCTATTCATGCTCTAGCTCGCTTTGATGTAGGTGATGTGCAAGGTGCATGGGGATACTTGGACTTGACTCCACAGAGCAGCAGT
GAACTTACAGTAGATCCTAGGCAGGCTCTTCACAGAAGTGAGCAAATGCTTTTGCAGGCAATGCTTCGTACTGATTCCCAAGAAAAAGAGATTAAACTGGAAACAGAGAAGGCAAAGGTGATGTTAGAAGAGGCTTTGCTAGTATCTTCAATTGATGGTTTGCCTGAGGCAGCAGCATATGCAACCCAGTTTCACTGTAT
TTATGCCTTTGAACAAGGACGCAGACTTAATGCTGGCCATGATGAATCTGGGGAGTTTGCATCAATACTTAGTTCCCTGCAGAATGCAGTCCAAGTGCCGATGAATCCATTACAACAAGATTGTCTTCTGTGGTTGAAACTCTTACGCGTCTACCATGTTGTGCTACCAGAGTCAAAGTCAACTTTGCAGCTTTGCCAAC
AAGTCATAAAAC

Intron 3 GTATGCAAAT ... TGTCAAAAAG

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>TRINITY_DN131445_c6_g1_i7 from sample A1 / Example spliced isoform

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CGCTCATCGCGTTCTGTGTTCCTCCCTGCATTCAATTGCTCAATTTCTCCAGGAGCAGGACAGTCGCAGAGCCAGAACAATTCAGTCCATTTTTTAAAATCTACCAGAGATCTGAGTAGCAATGGAGTCCCAGAAAGAGGACGATTTTGAACGGGAAAAGGAGGACTGTGAACTGGAAAGAGAATTCGAATTGGAAGCTG
CTATGTACAGTAGTAGTAATTCAATGCTGTCAGGTTTAGATGGCTCTGCTCTAGGTCAACAGGGAGGACCCTCCAGGTCTGGACTCTTCAGGCATTCTAACCCTAGAATGGGAGAGACACTCCTCCATATCCTTCTCTGTGCCATTCGAGGTCCTGTGCAGTCTGCCAAGATCATGCAAGGGCTTACAAATGAGCTTGAT
ACTCAAGGTGCATTTCCTAGAAGCAATTCCCGAGTTTCATCACTTGCCTCTTGTGCTCCAAGTGCTGATAATAGGGCTGCGGAGATGGCTTTGACAGGACTTCATGAATTTTTTAGTACAGGTGATGCAAATGTCATTGAAGGGTATGCATCACCTGTTCTCAGAGCATGCCAGGAAATTTTGGAAGATGAGAGAACCTC
CTTGACTCTCCTTCGATCACTTCTGAACCTTCTGACAGTTCTTTCAGTGAAATTTACACGATGTTTCCAGTCTCATTTTGCAGATATCGTAGATTTGTTGCTTGGTTGGGCTCTTGTACCTGATCTTTCTGACACTGATAGATGCATAATTACAGACACATTCCTGAAGTTTCAGAAGCTCTGGGTGGGTAACTTGCAGT
TCTCGCTAAACTTGTTAACCAAATTTTTAGGAGACATGGAAGTTTTAGCTCAGGATGCAACTCCTGGAACACTGCAACAATTACGACGATTGCTTGTGCTTGTTTCCTGCTTTGTCACAGTTTTACAAGCCACAGCAACTGGTGTGCTAGAAATGAACCTGCTTGAACACATTATTGAGCCGCTCCAGGAAATGCTTCAA
CGATTGCTTACATGCTTGTTAATGGTCACTAAAAAGTTTGGTAATACCAAATGGCTGAAGGAATCCTCAAGATGCTTGATTATGTTTGCCGATCTATTGAAAGAACGCTTTGCTAACTTCTATCCTGCTGCAATGGACATATTATTCCGATGCTTAGAAACAAAGAATGCAGTTGTTTTGGGTGCTGATGCACTTTCATC
TAAGCAAATTCAGGCAGTGCTAAAGACCAATCTGCAGTTAATGTCTGCACAAAGACTTGCCCTTCCAGCATCAGCAGTTCAGAACATCCTTAAGATGGATTCATTTTTTGCATATTTACGCTTACACCCAAATCATCTTGTGACAGGGCTGGCTGCAGCCACTTATCTTTTTCTGCTAAAGCATGCCTCTAATGAAGTTG
TGTCTCAAGCCATTCATTCTCTAATGGCAGAACTACAAATACTGAAGAGTCTACTTTTGCAGGCTCATTCTGCAGGAATTCATGTCTCAGAAGAGCTTGACAACAGAAATCATAATCAAGCTGCAGTAGATTCTCTTGGAAGGGTTCTTTCAGAAGTTGAAGTTGTAGCCTTGGCAAGATTTGATCTGATGGTCTTAGCC
AATTCTTTCTTGGATACCGGAAAAACAATCTCAGATGCAATAAATGTAGTCAACTGTAGGCTTGAAAGAGCAAAAGAACTAAGCAATTTTATCATAGAAAAATTGAATCCTTTCAAGAAACCTTTCATATGGTACTTGGAGCTGCAGTTTGCTCTAATTCAGGCTCTACATAGGATTTGTATTGTTCTTGTTTTTGGAAA
ACATATGGTTGGAGAGAGACTTCCTGAAACGAGTGTTGTATTCTCGGGGTCTAATGAAAAATTTCAGACTTTAGCACAGTCAAGCAAGGAAACAAGCATGGCAGTATCCAAGAATTTAAATGTCTATGGGTTATATATTGCTAAAGCTCTGCATATTTCGGCCAGTCTTTCTGTAAAATTGGAAGCCTTGGACTGGGTTG
GTAGCCTTTGTAGGGGCATGATGACCACGAGTAATGACGATACTTTTCAATTTTATTGTTACCAGGGTTGCGAAGATTTCCGGGCATGTTGGCATACATGTTTAAGCAAGAATATATTGTTCCCAGTTTTATGTGCAGCATCAGATAGAGACTTGAAAGTCAGGTTCCGGGTTGCATCAGTTCTTCAGCTCCTTTTACAA
GCAAAGCTCATATATCCAGTATACTTTGACGCCGTTGCAAATGTGGCTCTTGAAAAACTTGGAGATCCTGATTCCTCACTTCAAAGTGCATTTAGGAAAGTTCTTTCACTGGTTGTCCCCGCTGCATTGTATTTGGGAGGTTGCATTGAAAATGATGATAACTATGCATACAAGCACATTATGTCTTATGTTAAGGCAGG
GAGCAGAAAGTATTCACACTGGAAGCAAGTGTTTACAATCAAGCACTTGTCACAATCATCACGGTCACAGCAGCTTGTCTATATTTTGAACTACATTTCCCAACGGTCACAGGTTGTTCCCTCTTGTTGGTTCCAGCGTCTTGTTCTTAGCTATCATGGAAATTTAAAGAGTTGGCTTCCAAAACCACACAAAGATCGAT
TAAACTCAGAAGCAGGTAGCCTGTGGTTGGACCTTAATGTTGACTGTGAAACGCTTGAGAGAGTCTTTTCCACCAACAATCTTGCTGCTGCTTGGTGGTCTATACATGAAGCAGCTCGTCACTGCATCACTGTTCGGCTTCGCACTCATCTTGGTGGACCCACCCAAACATTTGCTGCTTTAGAGCGAATGCTGTTAGAT
ATAGTGCAATTATTACAATTGGATTCTGGGCAACGTGAATCAAGTAGTGGCACAAGCTCTTCAGGTGTCCATTTATTGCCGATGAGACTTTTATTAGAATTTGTGGAGTCTTTGAAGAAACAAATTTATAATGCATACGAAGGTTCTGCTGTATTACCAGCTGCACCCACTCAAAGTGCTCTATTCTTTCGTGCAAATAA
AAAGGTGTGTGAAGAGTGGTTTGCTCGTATTTGCGAGGCGCTGATGAATGCTAGCTTAGCAATCCAATGCAATGCAGGTACATTCCATCATGCTGCAACACGTTTGCAAGACCTTAGAAATGCAGCAGCACCAACATTAAGGGATATGGCTAGAAGTCAAACAGCGGATAATTCACAGGGCTTGAGAGCAAAATTGATAA
ATGATGTGCTCCGAATCTTACGCCACGCATCACTAGCCTTGTCCAGACTTCATGAGTCAGATGCCATTGTTGGTCTCCAGATATGGGCAACATCGACCTTTGTTACACCTCTTCTAGATGACAGTTTGCTAGGACTGAAAGCTTTGGGAGGATTTGGACTATTTGGATGGATGACAGGTCTTGTATATCAAGCTCGTGGG
CAATATGAAAAAGCCACGGCCCACTTTACACACATGCTTCAGTCTGAGGAAAATCTTTCTTTGATGGGTGCTGATGGAGTACAATTTGTCATTGCACGTATAATTGAAAGCTATGTAGCTCTAACAGATTGGGAATCTCTAGACCACTGGCTTCAGGAACTGCAGTTGATTCGAGCCAAGCATGCAGGGAAGTCCTATGC
TGGAGCATTAACAACTGCTGGCAACGAAATGAATGCTATTCATGCTCTAGCTCGCTTTGATGTAGGTGATGTGCAAGGTGCATGGGGATACTTGGACTTGACTCCACAGAGCAGCAGTGAACTTACAGTAGATCCTAGGCAGGCTCTTCACAGAAGTGAGCAAATGCTTTTGCAGGCAATGCTTCGTACTGATTCCCAAG
AAAAAGAGATTAAACTGGAAACAGAGAAGGCAAAGGTGATGTTAGAAGAGGCTTTGCTAGTATCTTCAATTGATGGTTTGCCTGAGGCAGCAGCATATGCAACCCAGTTTCACTGTATTTATGCCTTTGAACAAGGACGCAGACTTAATGCTGGCCATGATGAATCTGGGGAGTTTGCATCAATACTTAGTTCCCTGCAG
AATGCAGTCCAAGTGCCGATGAATCCATTACAACAAGATTGTCTTCTGTGGTTGAAACTCTTACGCGTCTACCATGTTGTGCTACCAGAGTCAAAGTCAACTTTGCAGCTTTGCCAACAAGTCATAAAACTAGCTCGCAAACAAACCAATTTCCAACTGGCTCATCGTCTGCACCAAGAATTGTTGAGTGGTATTTCAAG
ACGTCACAAAGATGACTTTTCTGAATGGCTTGTTGCAAGCTTACAGTATGAGAGTATTCTGCTTCTTTTTGCAGAGGGAAAATGTGAGGAAGCCATAGTAGAGCTTTGGTCATTGGTACGTTCTTACATACCATTTTCTGCCTTGTCTGTTTCTGCATCTGGCAATATGTTGAAGGCGAAGGCATGTGTGAAACTGTCAT
TTTGGTTGAAAGAAAAGTATTCTGAAATACATTGGCCAAACTTACTCCCAAAAATGAGTTTAGATAACCCTAAGTTCAGATCAAGTGATATTGCTGCTAATTTGGACGAGGGAGCCACTTCAAGGGAAACTGGCTGGATGTCAGCTGGCAGCTACAACTTGATAGTTGAGGAGGTGGTTGGTGCTTCCATTAAAGCAGCA
ACACTTCTGTGTCCAAATATGTCTAAGGCATGGCTGTCATATGCCTCTTGGTGTTACCATCAAGCCAGAGCATCACTTTCAGGTGATGGTGCAGCTTTAAGGTCATGCAATTTGTCACCGATTCTGATTCAGGAAGTTTCTTCTGATGGGACAGGTTTACTTGAAGAAGAGGTAATGCGAGTGCGAGCCATTATCATGAG
AACACTCTTAAATAATGAAAAAGCGGATCCAGGAAGTGAGGAAATATTACTGTGGCCGGACACTGAAGTGTACATGAACAGTGAAAATATTAACTTTGTAGAACTATTGGTCCAACGTACTGTATATATGATGCAGTCAGCAGCAGGTGCAGCAGGAGTTGAAAATTCAGATGGTGAAAGTGCTTGTTCGCTTTTGGTTG
CTCAACTTCAGCGAGAACTACTGAATATCAAGCACAATATAGATTCCTCTCTTATGACATCTTTGATTAATGAATTGATGGACATCTGGTGGACTTTGAGGAAGAGAAGGGTATCATTATTTGGCCATGCAGCTCGTGGCTTTTTACAGTATCTTTCACTATCAAATAGGACACATCTTGAACAAGGTCCTTGGAAAAGC
TATAATTTAGATGTTTTAAAACATGGGAGGGAAGACTGCACACTCAGAGCAACTTTATACATATTAAATATCCTTCTAAATTATGGAGTAGAATTAGGAGAGACACTTAAAAATGGTCTTATGACAGGGCCACCTCTACCATGGCAGGAGATAATCCCTCAGCTATTTGCTCGGTTGAGCACTCATCCTGAACATCAGGT
TCGTAAACGGTTGGAGGGGTTGTTGATTACATTGGCAAAGTTATCTCCATGGGCTATAGTCTATCCTACACTTGTTGATATCAGTGCTTATGAAGGCGAGCCATCAGAGGAGCTTCAACGCATCTTAGACTGTCTGGTTAAAGTTCATCCAAAACTGGTTCAGGACGTGCAATTAATGATATTGGAACTTGGGAATATTA
CTGTTCTTTGGGAGGAGCAGTGGCTTAGCACACTACAAGATCTTCATGCAGATGTTATGAGACGGATAGCTACACTGAAAGAAGAGGTTTCCAGGGTGGCAGAGAACATTACACTTACTCACAGTGAGAAGGTTAAAATAAATGCTGCCAAGTATTCTGCAATGATGGCACCAATTGCTGTAGCTTTGGAACGGCGTCTA
GTTTCCACATCTCGGATGCCGGAAACTGCCCATGAGGCTTGGTTCCAGAAGGAATATGGTGAGCAACTGAAAGCTGCTATAACAAATTTCAAGACCCCTCCTTCAACTGTTGCTTCCCTTGCAGAAATGTGGCGACCTTTTGATATAATTGCTGCATCTTTGGCGAACCATCAGAAGAAATCATCAGTCTACCTGAGTGA
GGTTGCTCCACGACTTGCACAGCTGGCTTCTTCTGATGCTCCAATGCCTGGTCTTGAGAAACAGATATCAATGTCCGAATCTGAAGGAATTCCTGGCAGCGATCTTCTGGGCCTGGTTACAATTTCTTCTTTTAGTGAACAGGTCACTATTCTTGCAACAAAGACAAAGCCAAAGAAGCTAGTTCTATTGGGTTCAGATG
GTCAAAGGTATACTTATCTTCTCAAGGGCCGGGAAGATTTGCGACTTGATGCAAGAATAATGCAGCTTTTGCAAGCTGTGAATGGAATGCTACATGCAAGCACAAGTACACAGGGTCGTTCGCTAGCAGTTCGCTACTATTCTGTAACTCCTATAAGTGGGCGAGCAGGCTTGATCCAATGGGTGGACAATCTTATAAGC
ATGTATAGTGTATTCAAAGCTTGGCAGCAGCGTGCACAGTATGCTCAGTTTACATCTACTACTAGTGGTACTGCAGCTGCAAACACTCCCATCCCACCTGTTCCACGTCCCAGTGATATGTTCTATGGGAAGATTATTCCAGCACTAAAAGAAAAAGGTTTGCGTAAAGTCATTTCACGACGGGATTGGCCACAAGAAGT
AAAAAGAAAGGTTCTGTTGGACCTTATGAAAGAGACTCCTCGTCAACTACTTTATCGAGAAATTTGGTGTGCAAGTGAAGGATTCCAAACCTTTAACTCAAAACTACAGAGGTTTTCAGGCAGTGTAGCAGTCATGAGCATGGTGGGGCACATTCTAGGTCTGGGTGATAGACATTTGGATAATATTCTTATGGACTTCA
ACACTGGTGATGTTGTCCATATAGATTATAATGTGTGCTTTGACAAGGGACTGAGATTGAAGATTCCGGAGATAGTACCATTTCGTCTTACTCAGATTATGCAAGCAGCATTAGGACTCATGGGAATAGAAGGCACATTCAGAGCAAACTGTGAATCTGTAATTGACATTTTACGGAAAAACAAAGACATAATCTTGATG
CTTTTAGAAGTATTTGTATGGGATCCATTGATTGAGTGGATGCGTGGAGATGGCCACGATGAAGCAACCATTGGTGGAGAGGAACGGAAAGGTATGGAGTTGGCAGTCAGTTTAAGCCTATTTGCTTCTCGAGTTCAAGAAATACGAGTACCACTTCAGGAGCATCACGATCTGCTGTTAGTAACTCTTCCTGCAGCATC
ATCTGCACTTCAGAGTTTGGCGGATTTGCTTGATCGGTATGATAGAATATCCACTGCATTTGTCCATGCTGAGCAAGAAAAATCCAAATCTGCTATTGCAGAGGCATCTGCAAAGTCTATTGTTACAGAGGCAGCAAACAATCTTGAAAATGTTCAGATGGCTTATGAAGTACAAGCTCGTGAATTTGCACAGGCCAAGG
CACTTGCCACTGAAGCTGCCCAGAAAGCTTCTATGTGGGTTGAACAACATAGCAGAGTTCTAGATGCATTACGCAGTGGTTCAGCTCCAGAGCTTCAGGCTATTGGGCAACTTCCTCATACAACTGAGGCTTTGTCTCTAACATCTGCTGTGTTGGCCTCAGGAGTTCCCCTTACCATTGTTCCGGAGCCTACTCTAGCA
CATTGCCGAGATGTTGATAGGGAAGTTGCACACCTTATAAAAGAACGTCATGAAGCTATTTTGCATGCAGCCAAAGCACTACAGACTTACTCTGTGGCTTTGCAACGGCTTCTTCCAGGAAATTACATCGGTACCAGTCAGGTGCATAATTGGGCACAGGTTTTGCAATTGTCTGTGAGGAACCTCTCTCCAGATGCGCT
TGCCTTAGCCAGAAGACAAGCTTCTGATCTTGTTGCAAAAGGACAGGGTGAACATGCAGACACTATACATCAGAAGTATGAAGCATTGCGTGTGAAAATAGAGAGGCTTGTGAAAGAAATCAGAAAAGTTCAAGAAGACTGTTCTGAACTTGAGGCATCGATTGAATCAGAAAATGAACGGAAAGCTAAGGATCGAGTGC
TGGCCATTTTTACAAAACATCTGCAGCCTTCTAACTATCCTAGGAAGGATGAGGATGCTCTTGCTAGGGATTCAGGTCATAACAAACAGGATGAAACCAAGGAGCATGATGCTAGTTCTTCAGACTACGTTGACAAGAAGGTTAAGGTATTAACCGTTCTGTATCTTGCTGCAGCTGCTTTATACAGCGAGATCAAAGAC
AAGATATTTAATATCTGCAATTCTTTGACAGAGAGAACTGCAGTAGGTCCAGGAGAAGATATAGGGTGCCAAAATTGGAAATGGTGTTTACCTGATTTGGAGGAGCAAGTTGCAAGATGTACACTTATTTCGGGAATTGTGAATGAAGTTCAGCAAATGAGTGGACAAAATTTGATCCAACGTGGATCGGGCTGGTGGGA
TACAATGGGTTCTGTTGATGATGATTGGACTTTGAGCTTTCAGGGTTGTTTGACTGCAATTCGTAGACTAGTGGGTCAGCTGGTTGGACGTGCAATTCCAGAATCAATAAGATCAGTTCTTTCCCACAACCCTGCAATTATGGAGGCATTTGGTTCACTTTCACAAATACGAGGAGCTGTTGATACAGCACTGGAACAGT
TGGCTGAAATTGAAATGCAAAGGGCTTCTTTATTAGAACTTGAGAGGACCTACTATGAAAATGTTGAGGAGATCACTGAACGGAAAGTGTCGCTGGAAACGGCTATTGAAAAGGGTAGGGATCACCTTTCTTGGGAAGAAGCAGAAGAGCTTGCAAGTCAAGTGGAAGCCTGTCGAGCCCAGTTGGATAAACTGAAGAAT
GCATGGGACCGCCGAGATGCTCAAGCTTCTGCACTTGTGAGGAAAGAGGCAAGTGCACGAGGTGCTTTAGTGGCAGCAGAACAACGCTTTGAGTCTCTTGTTACCATTGAGCGAGAAGGAGACATGCATCCTACAAGGGGAAAAGTTTTACTTGCAACATTTGCTAGGCCATTCTCTGAACTGGAATCCTACAATCAGAA
GTTGCCTTCTTTTGGGTATGAACCCTCCTTGAGAAAGAGTTCAGTGGATCAGACAGAGATTGTCACTTCTGGCTTTTCTGGGTTCGAGTCAGTCTGGAAGGTCACTAATATTTTAAAGGACCATACATTCTTTGTGTGGAAAGTTAGTATTATTGATACTTGTCTTGATTCATGTATCCGTAATGTTGCATCAGCTGTAG
ATCATACCTTAGGTTTTGACCAGACGGTTAGCAGTCAGAAGAGGAAGCTTGAGATCCTAGTTGAGTATTATTTAGATCAGTATCTCAAGGAACGGCTTGATCCTGTTCTCCTTGAGTGCCTTGAGAAAGAGGGAGACTCATTGAAGCACATTTTGGTGGATCAAAGGGAGTTGGAATCAAATCTAGCAAAGAAAGAGCTT
GATGCGGTAAAGCGGGCTCAGGGTCTGCTTGTTGAATATAGTAATGCACATGAAACTGCACGAGCTGCTAAAGCAGCAGCTTGTGCAATGAAGATGCAAGTGGGAGAGCTCACACAGGATCTTCAGAAGGCAAACCTTGAGGCTGCCCAATTAGAGTGGCTTCATGATTATATACTTTCTCATTTAGATCAAAATACTAT
CCTCCAACAGAGCTGTGCAAATGAAGACAATTTTCCATCAAGCTCTATAAAGCTTAACAGAAGAAATTTATTAGAAAACCTTCGATCTGCAATGTCTGCTATCACTAGAGCAACAGAAGGTTTACAAAACTGTGAGAGATCTGCCATTTCCACTGAGGAACAGCTTGAGAGGGCCATGGGTTGGGCTTGTGCAGGACCCA
ATACTGGTGGTGGCTCAAACTATTCGGGTAGAGGGATGGGAATTCCCCCTGAATTTCACGAGCATCTTCGTCACAGACGACAGTTGTTATGGGCAGGCCAAGAACAGGCTACGGGTATACTGAAGCTCTGTTCTGCTGCTCTGGATTTTGAGGATTCTAGGGATGGTTTCCTAAGGTCTCTTTCAGATGCATCTACTGGT
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AACATAGTAATCTAATGTCTGAACTTAACAAAGTTAACATGCTTCTTCTTCCTCTGGAGTCCATGCTGGCTTCTGCATCAAATACAGTAATTGGTATTATTAACAGGGATGGTGAACAGAAATTGGAAATCTCTGTGGGTCAAGGCCAAGCATTAATCCAATCACTTCATATAAAGCTTGGAGAGGTTTGTCCTGTTTTG
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ATTTCTATGGGAAATAGTCAAATTCATTCTGTCAAGGACACAAGTCAGAGGCCAGAAGGCTCACAGGCATCAATAAGTTCAAATAAGGTCAGTTCTGACAGTCAGAATGCTACACACATGAACTTGTCAGACATGGGACTTGGATCTATGAATGTTTTTGAAAGACATCAGACAGGAGGAGAGATACAAATGAGGATGAA
GGAAAAAGAACCTCATATATCTCGAGCTAAAGGAAGGGTTGAAAGTTATAGTGACCTATGCACACTATTTTCTTCTATGAACACGGAACAAAGAAGTCATGGTTTTAGGGGGAAAAATGCTTATGCAGTCTCGGTGCTGAAACGAGTTGAAGCAAAGCTGGATGGCCGAGACATTGATGGGAAAAGACAATTTTCTGTTT
CAGAACAAGTGGATCATCTTCTTCGTCAGGCTACAAGCATTGATAATTTATGTAATATGTATGAAGGTTGGACACCTTGGATATGATGCCCTACAAATAGCCTCTTCAAGTTCCTGCTACTTCTCCTGGAAAGGCAGTGTTATTTTTGAGCTGGCTGGTATTCCCATTGTGTCACTTGTCAGTGATCTCAATCATCGCAG
AACAGTTTAGGGTCCACCTTTTGTCTATCTTGGGTTAGACTCGTCACAAATCATTAGGATAGAAGAAATCCATTTTGGTCAATGGTGAGAATAGAAGAATGCTAAGGAAAATTCATCCATCATGGAAGTTGAGGCTTGAAGAATTGTTACAATCCTCTACTTTCTTTAAGCAAGATTCTGTTAAGGAAACACACAGAGAC
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GTGGAGAATTGGTGAAAGGAAATGCAAAAGAGCATTCAATGCAGCAGGTAGTATGGTGAAATGGTAGCATCAGACTATTCTCAGTATTGGGATGCGATTGAGTTTTGCCAGTACTTCGAAAACAAATGCTATAAATCAAACTGCATGAAATTATATCTTGAAGCAATGGTAATGAAAATAATGGTTGAATTGAGAGGGTT
CCTGTAGAAGAAGATCTTGATCACTAGGTACTTCAACGACAGATTATTTTAGCATGGCAGTTTGTTATTTTGGAGAATTTTCTTGTGGCAGTGAATTATTTATCATTGCAGCAGGTAGGTATGGTGAAATGATAGCCAGATCAAAATCAAATGATATATGTTAAACTGTGTGAGACTCTATATCGAAGTAAAAGTTTTGA
AAAATATGTTTGAGTTGAGAGGGTTACCTGTGAAAAGAAGTACTTCGTTACTGGGTACTTCAGCAATAGATAATATTAGCATGGTGATCAGTAGACAATCGTTTAGGAAAGAGGAGGGTATAGGTAGATCTTCCCTGTATTTATACCCTCTTATCAAGGGTTATTCTTCATTTATATGATTGATTAAATTTCTTTTCACT
GGTTCTTCTTAGGCTCTTTCTATATGAGATCTGTTCACGTGTTTTATGTTTCTAGTTTTGCAAATAGATTATGTTTATTTTTATTCAGCATCTTAAAATACACATAATTGCTTTTCATTGTAACTACTATATTTGAAATGAGTTGTGTTGCTTAGTAAAGAAAGCGGGTTTGGGGA

>TRINITY_DN131445_c6_g1_i25 from sample A1 / Example unspliced isoform:

GCGTTCTGTGCGATGACATGCTTTTGAGAACGCGAAATTAATGGAGTCGGTGATGAAAGAGCTCGAGGCTCTGAAGGTGGTTCGGAAGGTGGCCAGTCGTTGGGAAGGTGGCCACGGGACCGTGCTCTTGGTCCGAAGGAAAGGCAGCAACAGGCAGGTGCGAATTTCGTTGTTCTGGTACCTTTCATAGGTGTTTTTAA
CGCTCATCGCGTTCTGTGTTCCTCCCTGCATTCAATTGCTCAATTTCTCCAGGAGCAGGACAGTCGCAGAGCCAGAACAATTCAGTCCATTTTTTAAAATCTACCAGAGATCTGAGTAGCAATGGAGTCCCAGAAAGAGGACGATTTTGAACGGGAAAAGGAGGACTGTGAACTGGAAAGAGAATTCGAATTGGAAGCTG
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GCAGTTTGCTCTAATTCAGGCTCTACATAGGATTTGTATTGTTCTTGTTTTTGGAAAACATATGGTTGGAGAGAGACTTCCTGAAACGAGTGTTGTATTCTCGGGGTCTAATGAAAAATTTCAGACTTTAGCACAGTCAAGCAAGGAAACAAGCATGGCAGTATCCAAGAATTTAAATGTCTATGGGTTATATATTGCTA
AAGCTCTGCATATTTCGGCCAGTCTTTCTGTAAAATTGGAAGCCTTGGACTGGGTTGGTAGCCTTTGTAGGGGCATGATGACCACGAGTAATGACGATACTTTTCAATTTTATTGTTACCAGGGTTGCGAAGATTTCCGGGCATGTTGGCATACATGTTTAAGCAAGAATATATTGTTCCCAGTTTTATGTGCAGCATCA
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TCTGCTGTGTTGGCCTCAGGAGTTCCCCTTACCATTGTTCCGGAGCCTACTCTAGCACATTGCCGAGATGTTGATAGGGAAGTTGCACACCTTATAAAAGAACGTCATGAAGCTATTTTGCATGCAGCCAAAGCACTACAGACTTACTCTGTGGCTTTGCAACGGCTTCTTCCAGGAAATTACATCGGTACCAGTCAGGT
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TTCAGGCTATTGGGCAACTTCCTCATACAACTGAGGCTTTGTCTCTAACATCTGCTGTGTTGGCCTCAGGAGTTCCCCTTACCATTGTTCCGGAGCCTACTCTAGCACATTGCCGAGATGTTGATAGGGAAGTTGCACACCTTATAAAAGAACGTCATGAAGCTATTTTGCATGCAGCCAAAGCACTACAGACTTACTCT
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GAAAATAGAGAGGCTTGTGAAAGAAATCAGAAAAGTTCAAGAAGACTGTTCTGAACTTGAGGCATCGATTGAATCAGAAAATGAACGGAAAGCTAAGGATCGAGTGCTGGCCATTTTTACAAAACATCTGCAGCCTTCTAACTATCCTAGGAAGGATGAGGATGCTCTTGCTAGGGATTCAGGTCATAACAAACAGGATG
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TGGAAACGGCTATTGAAAAGGGTAGGGATCACCTTTCTTGGGAAGAAGCAGAAGAGCTTGCAAGTCAAGTGGAAGCCTGTCGAGCCCAGTTGGATAAACTGAAGAATGCATGGGACCGCCGAGATGCTCAAGCTTCTGCACTTGTGAGGAAAGAGGCAAGTGCACGAGGTGCTTTAGTGGCAGCAGAACAACGCTTTGAG
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ATGCAAGTGGGAGAGCTCACACAGGATCTTCAGAAGGCAAACCTTGAGGCTGCCCAATTAGAGTGGCTTCATGATTATATACTTTCTCATTTAGATCAAAATACTATCCTCCAACAGAGCTGTGCAAATGAAGACAATTTTCCATCAAGCTCTATAAAGCTTAACAGAAGAAATTTATTAGAAAACCTTCGATCTGCAAT
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CAGGCCAAGAACAGGCTACGGGTATACTGAAGCTCTGTTCTGCTGCTCTGGATTTTGAGGATTCTAGGGATGGTTTCCTAAGGTCTCTTTCAGATGCATCTACTGGTGGAGCTCTAAGTGAAGGCAGAGCTTGGCAGCAAGCATACATGAATATCATTTCAAGATTGGACATTTCTTATCACTCGTTTACTTGTGCAGAC
CGTGAATGGCATTTAGCACAGAAAAGCATGGAAGCAGCTGGTGCAAGTCTTTCTACTGCAACTAATGATTTGTGCCTCGTATCTATAAAATTGAAGTCCACGTCAGGTGAACTTCAAGCTACACTTTCAAGCATGAGGGATTGGACAGTTAAAGCAAGTACAGATCTGTCAGCATTTTGCCGTGTGGCAAGGGGAAATTC
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CTCCTGGATCTCACCTCCTGATAGTTTTTATACTAATGATTCTGAGTCAGACAATACTTCCCCAGACTCACAACATCAAGATGACTCTTTGACCATCTCCAATGACTGGGAATCTCATATAAATGGAACTGACAAGGCTAAGTTTAGTGAGGGAGTGGTATCAGATGCTTCAAGGTTTACAGTGAATGAGGATACTGGAT
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TCTGACAGTCAGAATGCTACACACATGAACTTGTCAGACATGGGACTTGGATCTATGAATGTTTTTGAAAGACATCAGACAGGAGGAGAGATACAAATGAGGATGAAGGAAAAAGAACCTCATATATCTCGAGCTAAAGGAAGGGTTGAAAGTTATAGTGACCTATGCACACTATTTTCTTCTATGAACACGGAACAAAG
AAGTCATGGTTTTAGGGGGAAAAATGCTTATGCAGTCTCGGTGCTGAAACGAGTTGAAGCAAAGCTGGATGGCCGAGACATTGATGGGAAAAGACAATTTTCTGTTTCAGAACAAGTGGATCATCTTCTTCGTCAGGCTACAAGCATTGATAATTTATGTAATATGTATGAAGGTTGGACACCTTGGATATGATGCCCTA
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GACAATCGTTTAGGAAAGAGGAGGGTATAGGTAGATCTTCCCTGTATTTATACCCTCTTATCAAGGGTTATTCTTCATTTATATGATTGATTAAATTTCTTTTCACTGGTTCTTCTTAGGCTCTTTCTATATGAGATCTGTTCACGTG

>TRINITY_DN119182_c1_g2_i11 from sample A3 / Example unspliced isoform:

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TCATTGAAGGGTATGCATCACCTGTTCTCAGAGCATGCCAGGAAATTTTGGAAGATGAGAGAACCTCCTTGACTCTCCTTCGATCACTTCTGAACCTTCTGACAGTTCTTTCAGTGAAATTTACACGATGTTTCCAGTCTCATTTTGCAGATATCGTAGATTTGTTGCTTGGTTGGGCTCTTGTACCTGATCTTTCTGAC
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TAAAATAAATGCTGCCAAGTATTCTGCAATGATGGCACCAATTGCTGTAGCTTTGGAACGGCGTCTAGTTTCCACATCTCGGATGCCGGAAACTGCCCATGAGGCTTGGTTCCAGAAGGAATATGGTGAGCAACTGAAAGCTGCTATAACAAATTTCAAGACCCCTCCTTCAACTGTTGCTTCCCTTGCAGAAATGTGGC
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GCAAACAATCTTGAAAATGTTCAGATGGCTTATGAAGTACAAGCTCGTGAATTTGCACAGGCCAAGGCACTTGCCACTGAAGCTGCCCAGAAAGCTTCTATGTGGGTTGAACAACATAGCAGAGTTCTAGATGCATTACGCAGTGGTTCAGCTCCAGAGCTTCAGGCTATTGGGCAACTTCCTCATACAACTGAGGCTTT
GTCTCTAACATCTGCTGTGTTGGCCTCAGGAGTTCCCCTTACCATTGTTCCGGAGCCTACTCTAGCACATTGCCGAGATGTTGATAGGGAAGTTGCACACCTTATAAAAGAACGTCATGAAGCTATTTTGCATGCAGCCAAAGCACTACAGACTTACTCTGTGGCTTTGCAACGGCTTCTTCCAGGAAATTACATCGGTA
CCAGTCAGGTGCATAATTGGGCACAGGTTTTGCAATTGTCTGTGAGGAACCTCTCTCCAGATGCGCTTGCCTTAGCCAGAAGACAAGCTTCTGATCTTGTTGCAAAAGGACAGGGTGAACATGCAGACACTATACATCAGAAGTATGAAGCATTGCGTGTGAAAATAGAGAGGCTTGTGAAAGAAATCAGAAAAGTTCAA
GAAGACTGTTCTGAACTTGAGGCATCGATTGAATCAGAAAATGAACGGAAAGCTAAGGATCGAGTGCTGGCCATTTTTACAAAACATCTGCAGCCTTCTAACTATCCTAGGAAGGATGAGGATGCTCTTGCTAGGGATTCAGGTCATAACAAACAGGATGAAACCAAGGAGCATGATGCTAGTTCTTCAGACTACGTTGA
CAAGAAGGTTAAGGTATTAACCGTTCTGTATCTTGCTGCAGCTGCTTTATACAGCGAGATCAAAGACAAGATATTTAATATCTGCAATTCTTTGACAGAGAGAACTGCAGTAGGTCCAGGAGAAGATATAGGGTGCCAAAATTGGAAATGGTGTTTACCTGATTTGGAGGAGCAAGTTGCAAGATGTACACTTATTTCGG
GAATTGTGAATGAAGTTCAGCAAATGAGTGGACAAAATTTGATCCAACGTGGATCGGGCTGGTGGGATACAATGGGTTCTGTTGATGATGATTGGACTTTGAGCTTTCAGGGTTGTTTGACTGCAATTCGTAGACTAGTGGGTCAGCTGGTTGGACGTGCAATTCCAGAATCAATAAGATCAGTTCTTTCCCACAACCCT
GCAATTATGGAGGCATTTGGTTCACTTTCACAAATACGAGGAGCTGTTGATACAGCACTAGAACAGTTGGCTGAAATTGAAATGCAAAGGGCTTCTTTATTAGAACTTGAGAGGACCTACTATGAAAATGTTGAGGAGATCACTGAACGGAAAGTGTCGCTGGAAACGGCTATTGAAAAGGGTAGGGATCACCTTTCTTG
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GTGTGGAAAGTTAGTATTATTGATACTTGTCTTGATTCATGTATCCGTAATGTTGCATCAGCTGTAGATCATACCTTAGGTTTTGACCAGACGGTTAGCAGTCAGAAGAGGAAGCTTGAGATCCTAGTTGAGTATTATTTAGATCAGTATCTCAAGGAACGGCTTGATCCTGTTCTCCTTGAGTGCCTTGAGAAAGAGGG
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ACCTTGAGGCTGCCCAATTAGAGTGGCTTCATGATTATATACTTTCTCATTTAGATCAAAATACTATCCTCCAACAGAGCTGTGCAAATGAAGACAATTTTCCATCAAGCTCTATAAAGCTTAACAGAAGAAATTTATTAGAAAACCTTCGATCTGCAATGTCCGCTATCACTAGAGCAACAGAAGGTTTACAAAACTGT
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TGCTGCTCTGGATTTTGAGGATTCTAGGGATGGTTTCCTAAGGTCTCTTTCAGATGCATCTACTGGTGGAGCTCTAAGTGAAGGCAGAGCTTGGCAGCAAGCATACATGAATATCATTTCAAGATTGGACATTTCTTATCACTCGTTTACTTGTGCAGACCGTGAATGGCATTTAGCACAGAAAAGCATGGAAGCAGCTG
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TCTGAGTCAGACAATACTTCCCCAGACTCACAACATCAAGATGACTCTTTGACCATCTCCAATGACTGGGAATCTCATATAAATGGAACTGACAAGGCTAAGTTTAGTGAGGGAGTGGTATCAGATGCTTCAAGGTTTACAGTGAATGAGGATACTGGATATACTTCTCCATCCTTTTTGGCCCATAGCCAAGAAGATCC
TTTGCTAGTTGGGCATATTCAAACAGACATGAAATTTGAAGGTACAGAGGATAGTGAGAATGGGATTATTTCTATGGGAAATAGTCAAATTCATTCTGTCAAGGACACAAGTCAGAGGCCAGAAGGCTCACAGGCATCAATAAGTTCAAATAAGGTCAGTTCTGACAGTCAGAATGCTACACACATGAACTTGTCAGACA
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TTTACTCACAAAGGTCAGATCAGAGCACCTCCATTGTCAATATTTTAATGGAACTGCATTGTCAGGTGCAAACTTGAGCTAGAAAAAAATGTGGACTTGTTTGATTGAGAGATAACAAACTGTCAACAACCATCCCGCCAGAGAAATGCTTTAATACTAGGTCACTTGCGCTTTGTAGTGGAAGTGCAGGATAAGTCACA
AAACCGTGCTTTGCCATTGCTTGGGCAGGGCACTGTCCAGTCCATGTAGAGGTGCTGCTGGCAGTATATTGCAGTGAGTCCAATTTCACAGCTTAACATACCCAAGTGACTTATATCAGAATTTTGGTGATCACGAAGAATCTGTTTTAGAGCATTCAGCAAAGTATTGCAAAGTGAATAGTGGAGAATTGGTGAAAGGA
AATGCAAAAGAGCATTCAATGCAGCAGGTAGTATGGTGAAATGGTAGCATCAGACTATTCTCAGTATTGGGATGCGATTGAGTTTTGCCAGTACTTCGAAAACAAATGCTATAAATCAAACTGCATGAAATTATATCTTGAAGCAATGGTAATGAAAATAATGGTTGAATTGAGAGGGTTCCTGTAGAAGAAGATCTTGA
TCACTAGGTACTTCAACGACAGATTATTTTAGCATGGCAGTTTGTTATTTTGGAGAATTTTCTTGTGGCAGTGAATTATTTATCATTGCAGCAGGTAGGTATGGTGAAATGATAGCCAGATCAAAATCAAATGATATATGTTAAACTGTGTGAGACTCTATATCGAAGTAAAAGTTTTGAAAAATATGTTTGAGTTGAGA
GGGTTACCTGTGAAAAGAAGTACTTCGTTACTGGGTACTTCAGCAATAGATAATATTAGCATGGTGATCAGTAGACAATCGTTTAGGAAAGAGGAGGGTATAGGTAGATCTTCCCTGTATTTATACCCTCTTATCAAGGGTTATTCTTCATTTATATGATTGATTAAATTTCTTTTCACTGGTTCTTCTTAGGCTCTTTC
TATATGAGATCTGTTCACGTG

Intron 5 GTGAGTCCAA ... TTGATTGCAG

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>TRINITY_DN131445_c6_g1_i29 from sample A1 / Example spliced isoform

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CGCTCATCGCGTTCTGTGTTCCTCCCTGCATTCAATTGCTCAATTTCTCCAGGAGCAGGACAGTCGCAGAGCCAGAACAATTCAGTCCATTTTTTAAAATCTACCAGAGATCTGAGTAGCAATGGAGTCCCAGAAAGAGGACGATTTTGAACGGGAAAAGGAGGACTGTGAACTGGAAAGAGAATTCGAATTGGAAGCTG
CTATGTACAGTAGTAGTAATTCAATGCTGTCAGGTTTAGATGGCTCTGCTCTAGGTCAACAGGGAGGACCCTCCAGGTCTGGACTCTTCAGGCATTCTAACCCTAGAATGGGAGAGACACTCCTCCATATCCTTCTCTGTGCCATTCGAGGTCCTGTGCAGTCTGCCAAGGATTTTTCTGGCATTTGGCCCATTCTTGAT
GCAGCACAGTCTCGAGATTTTTGCAATATCATGCAAGGGCTTACAAATGAGCTTGATACTCAAGGTGCATTTCCTAGAAGCAATTCCCGAGTTTCATCACTTGCCTCTTGTGCTCCAAGTGCTGATAATAGGGCTGCGGAGATGGCTTTGACAGGACTTCATGAATTTTTTAGTACAGGTGATGCAAATGTCATTGAAGG
GTATGCATCACCTGTTCTCAGAGCATGCCAGGAAATTTTGGAAGATGAGAGAACCTCCTTGACTCTCCTTCGATCACTTCTGAACCTTCTGACAGTTCTTTCAGTGAAATTTACACGATGTTTCCAGTCTCATTTTGCAGATATCGTAGATTTGTTGCTTGGTTGGGCTCTTGTACCTGATCTTTCTGACACTGATAGAT
GCATAATTACAGACACATTCCTGAAGTTTCAGAAGCTCTGGGTGGGTAACTTGCAGTTCTCGCTAAACTTGTTAACCAAATTTTTAGGAGACATGGAAGTTTTAGCTCAGGATGCAACTCCTGGAACACTGCAACAATTACGACGATTGCTTGTGCTTGTTTCCTGCTTTGTCACAGTTTTACAAGCCACAGCAACTGGT
GTGCTAGAAATGAACCTGCTTGAACACATTATTGAGCCGCTCCAGGAAATGCTTCAACGATTGCTTACATGCTTGTTAATGGTCACTAAAAAGTTTGGTAATACCAAATGGCTGAAGGAATCCTCAAGATGCTTGATTATGTTTGCCGATCTATTGAAAGAACGCTTTGCTAACTTCTATCCTGCTGCAATGGACATATT
ATTCCGATGCTTAGAAACAAAGAATGCAGTTGTTTTGGGTGCTGATGCACTTTCATCTAAGCAAATTCAGGCAGTGCTAAAGACCAATCTGCAGTTAATGTCTGCACAAAGACTTGCCCTTCCAGCATCAGCAGTTCAGAACATCCTTAAGATGGATTCATTTTTTGCATATTTACGCTTACACCCAAATCATCTTGTGA
CAGGGCTGGCTGCAGCCACTTATCTTTTTCTGCTAAAGCATGCCTCTAATGAAGTTGTGTCTCAAGCCATTCATTCTCTAATGGCAGAACTACAAATACTGAAGAGTCTACTTTTGCAGGCTCATTCTGCAGGAATTCATGTCTCAGAAGAGCTTGACAACAGAAATCATAATCAAGCTGCAGTAGATTCTCTTGGAAGG
GTTCTTTCAGAAGTTGAAGTTGTAGCCTTGGCAAGATTTGATCTGATGGTCTTAGCCAATTCTTTCTTGGATACCGGAAAAACAATCTCAGATGCAATAAATGTAGTCAACTGTAGGCTTGAAAGAGCAAAAGAACTAAGCAATTTTATCATAGAAAAATTGAATCCTTTCAAGAAACCTTTCATATGGTACTTGGAGCT
GCAGTTTGCTCTAATTCAGGCTCTACATAGGATTTGTATTGTTCTTGTTTTTGGAAAACATATGGTTGGAGAGAGACTTCCTGAAACGAGTGTTGTATTCTCGGGGTCTAATGAAAAATTTCAGACTTTAGCACAGTCAAGCAAGGAAACAAGCATGGCAGTATCCAAGAATTTAAATGTCTATGGGTTATATATTGCTA
AAGCTCTGCATATTTCGGCCAGTCTTTCTGTAAAATTGGAAGCCTTGGACTGGGTTGGTAGCCTTTGTAGGGGCATGATGACCACGAGTAATGACGATACTTTTCAATTTTATTGTTACCAGGGTTGCGAAGATTTCCGGGCATGTTGGCATACATGTTTAAGCAAGAATATATTGTTCCCAGTTTTATGTGCAGCATCA
GATAGAGACTTGAAAGTCAGGTTCCGGGTTGCATCAGTTCTTCAGCTCCTTTTACAAGCAAAGCTCATATATCCAGTATACTTTGACGCCGTTGCAAATGTGGCTCTTGAAAAACTTGGAGATCCTGATTCCTCACTTCAAAGTGCATTTAGGAAAGTTCTTTCACTGGTTGTCCCCGCTGCATTGTATTTGGGAGGTTG
CATTGAAAATGATGATAACTATGCATACAAGCACATTATGTCTTATGTTAAGGCAGGGAGCAGAAAGTATTCACACTGGAAGCAAGTGTTTACAATCAAGCACTTGTCACAATCATCACGGTCACAGCAGCTTGTCTATATTTTGAACTACATTTCCCAACGGTCACAGGTTGTTCCCTCTTGTTGGTTCCAGCGTCTTG
TTCTTAGCTATCATGGAAATTTAAAGAGTTGGCTTCCAAAACCACACAAAGATCGATTAAACTCAGAAGCAGGTAGCCTGTGGTTGGACCTTAATGTTGACTGTGAAACGCTTGAGAGAGTCTTTTCCACCAACAATCTTGCTGCTGCTTGGTGGTCTATACATGAAGCAGCTCGTCACTGCATCACTGTTCGGCTTCGC
ACTCATCTTGGTGGACCCACCCAAACATTTGCTGCTTTAGAGCGAATGCTGTTAGATATAGTGCAATTATTACAATTGGATTCTGGGCAACGTGAATCAAGTAGTGGCACAAGCTCTTCAGGTGTCCATTTATTGCCGATGAGACTTTTATTAGAATTTGTGGAGTCTTTGAAGAAACAAATTTATAATGCATACGAAGG
TTCTGCTGTATTACCAGCTGCACCCACTCAAAGTGCTCTATTCTTTCGTGCAAATAAAAAGGTGTGTGAAGAGTGGTTTGCTCGTATTTGCGAGGCGCTGATGAATGCTAGCTTAGCAATCCAATGCAATGCAGGTACATTCCATCATGCTGCAACACGTTTGCAAGACCTTAGAAATGCAGCAGCACCAACATTAAGGG
ATATGGCTAGAAGTCAAACAGCGGATAATTCACAGGGCTTGAGAGCAAAATTGATAAATGATGTGCTCCGAATCTTACGCCACGCATCACTAGCCTTGTCCAGACTTCATGAGTCAGATGCCATTGTTGGTCTCCAGATATGGGCAACATCGACCTTTGTTACACCTCTTCTAGATGACAGTTTGCTAGGACTGAAAGCT
TTGGGAGGATTTGGACTATTTGGATGGATGACAGGTCTTGTATATCAAGCTCGTGGGCAATATGAAAAAGCCACGGCCCACTTTACACACATGCTTCAGTCTGAGGAAAATCTTTCTTTGATGGGTGCTGATGGAGTACAATTTGTCATTGCACGTATAATTGAAAGCTATGTAGCTCTAACAGATTGGGAATCTCTAGA
CCACTGGCTTCAGGAACTGCAGTTGATTCGAGCCAAGCATGCAGGGAAGTCCTATGCTGGAGCATTAACAACTGCTGGCAACGAAATGAATGCTATTCATGCTCTAGCTCGCTTTGATGTAGGTGATGTGCAAGGTGCATGGGGATACTTGGACTTGACTCCACAGAGCAGCAGTGAACTTACAGTAGATCCTAGGCAGG
CTCTTCACAGAAGTGAGCAAATGCTTTTGCAGGCAATGCTTCGTACTGATTCCCAAGAAAAAGAGATTAAACTGGAAACAGAGAAGGCAAAGGTGATGTTAGAAGAGGCTTTGCTAGTATCTTCAATTGATGGTTTGCCTGAGGCAGCAGCATATGCAACCCAGTTTCACTGTATTTATGCCTTTGAACAAGGACGCAGA
CTTAATGCTGGCCATGATGAATCTGGGGAGTTTGCATCAATACTTAGTTCCCTGCAGAATGCAGTCCAAGTGCCGATGAATCCATTACAACAAGATTGTCTTCTGTGGTTGAAACTCTTACGCGTCTACCATGTTGTGCTACCAGAGTCAAAGTCAACTTTGCAGCTTTGCCAACAAGTCATAAAACTAGCTCGCAAACA
AACCAATTTCCAACTGGCTCATCGTCTGCACCAAGAATTGTTGAGTGGTATTTCAAGACGTCACAAAGATGACTTTTCTGAATGGCTTGTTGCAAGCTTACAGTATGAGAGTATTCTGCTTCTTTTTGCAGAGGGAAAATGTGAGGAAGCCATAGTAGAGCTTTGGTCATTGGTACGTTCTTACATACCATTTTCTGCCT
TGTCTGTTTCTGCATCTGGCAATATGTTGAAGGCGAAGGCATGTGTGAAACTGTCATTTTGGTTGAAAGAAAAGTATTCTGAAATACATTGGCCAAACTTACTCCCAAAAATGAGTTTAGATAACCCTAAGTTCAGATCAAGTGATATTGCTGCTAATTTGGACGAGGGAGCCACTTCAAGGGAAACTGGCTGGATGTCA
GCTGGCAGCTACAACTTGATAGTTGAGGAGGTGGTTGGTGCTTCCATTAAAGCAGCAACACTTCTGTGTCCAAATATGTCTAAGGCATGGCTGTCATATGCCTCTTGGTGTTACCATCAAGCCAGAGCATCACTTTCAGGTGATGGTGCAGCTTTAAGGTCATGCAATTTGTCACCGATTCTGATTCAGGAAGTTTCTTC
TGATGGGACAGGTTTACTTGAAGAAGAGGTAATGCGAGTGCGAGCCATTATCATGAGAACACTCTTAAATAATGAAAAAGCGGATCCAGGAAGTGAGGAAATATTACTGTGGCCGGACACTGAAGTGTACATGAACAGTGAAAATATTAACTTTGTAGAACTATTGGTCCAACGTACTGTATATATGATGCAGTCAGCAG
CAGGTGCAGCAGGAGTTGAAAATTCAGATGGTGAAAGTGCTTGTTCGCTTTTGGTTGCTCAACTTCAGCGAGAACTACTGAATATCAAGCACAATATAGATTCCTCTCTTATGACATCTTTGATTAATGAATTGATGGACATCTGGTGGACTTTGAGGAAGAGAAGGGTATCATTATTTGGCCATGCAGCTCGTGGCTTT
TTACAGTATCTTTCACTATCAAATAGGACACATCTTGAACAAGGTCCTTGGAAAAGCTATAATTTAGATGTTTTAAAACATGGGAGGGAAGACTGCACACTCAGAGCAACTTTATACATATTAAATATCCTTCTAAATTATGGAGTAGAATTAGGAGAGACACTTAAAAATGGTCTTATGACAGGGCCACCTCTACCATG
GCAGGAGATAATCCCTCAGCTATTTGCTCGGTTGAGCACTCATCCTGAACATCAGGTTCGTAAACGGTTGGAGGGGTTGTTGATTACATTGGCAAAGTTATCTCCATGGGCTATAGTCTATCCTACACTTGTTGATATCAGTGCTTATGAAGGCGAGCCATCAGAGGAGCTTCAACGCATCTTAGACTGTCTGGTTAAAG
TTCATCCAAAACTGGTTCAGGACGTGCAATTAATGATATTGGAACTTGGGAATATTACTGTTCTTTGGGAGGAGCAGTGGCTTAGCACACTACAAGATCTTCATGCAGATGTTATGAGACGGATAGCTACACTGAAAGAAGAGGTTTCCAGGGTGGCAGAGAACATTACACTTACTCACAGTGAGAAGGTTAAAATAAAT
GCTGCCAAGTATTCTGCAATGATGGCACCAATTGCTGTAGCTTTGGAACGGCGTCTAGTTTCCACATCTCGGATGCCGGAAACTGCCCATGAGGCTTGGTTCCAGAAGGAATATGGTGAGCAACTGAAAGCTGCTATAACAAATTTCAAGACCCCTCCTTCAACTGTTGCTTCCCTTGCAGAAATGTGGCGACCTTTTGA
TATAATTGCTGCATCTTTGGCGAACCATCAGAAGAAATCATCAGTCTACCTGAGTGAGGTTGCTCCACGACTTGCACAGCTGGCTTCTTCTGATGCTCCAATGCCTGGTCTTGAGAAACAGATATCAATGTCCGAATCTGAAGGAATTCCTGGCAGCGATCTTCTGGGCCTGGTTACAATTTCTTCTTTTAGTGAACAGG
TCACTATTCTTGCAACAAAGACAAAGCCAAAGAAGCTAGTTCTATTGGGTTCAGATGGTCAAAGGTATACTTATCTTCTCAAGGGCCGGGAAGATTTGCGACTTGATGCAAGAATAATGCAGCTTTTGCAAGCTGTGAATGGAATGCTACATGCAAGCACAAGTACACAGGGTCGTTCGCTAGCAGTTCGCTACTATTCT
GTAACTCCTATAAGTGGGCGAGCAGGCTTGATCCAATGGGTGGACAATCTTATAAGCATGTATAGTGTATTCAAAGCTTGGCAGCAGCGTGCACAGTATGCTCAGTTTACATCTACTACTAGTGGTACTGCAGCTGCAAACACTCCCATCCCACCTGTTCCACGTCCCAGTGATATGTTCTATGGGAAGATTATTCCAGC
ACTAAAAGAAAAAGGTTTGCGTAAAGTCATTTCACGACGGGATTGGCCACAAGAAGTAAAAAGAAAGGTTCTGTTGGACCTTATGAAAGAGACTCCTCGTCAACTACTTTATCGAGAAATTTGGTGTGCAAGTGAAGGATTCCAAACCTTTAACTCAAAACTACAGAGGTTTTCAGGCAGTGTAGCAGTCATGAGCATGG
TGGGGCACATTCTAGGTCTGGGTGATAGACATTTGGATAATATTCTTATGGACTTCAACACTGGTGATGTTGTCCATATAGATTATAATGTGTGCTTTGACAAGGGACTGAGATTGAAGATTCCGGAGATAGTACCATTTCGTCTTACTCAGATTATGCAAGCAGCATTAGGACTCATGGGAATAGAAGGCACATTCAGA
GCAAACTGTGAATCTGTAATTGACATTTTACGGAAAAACAAAGACATAATCTTGATGCTTTTAGAAGTATTTGTATGGGATCCATTGATTGAGTGGATGCGTGGAGATGGCCACGATGAAGCAACCATTGGTGGAGAGGAACGGAAAGGTATGGAGTTGGCAGTCAGTTTAAGCCTATTTGCTTCTCGAGTTCAAGAAAT
ACGAGTACCACTTCAGGAGCATCACGATCTGCTGTTAGTAACTCTTCCTGCAGCATCATCTGCACTTCAGAGTTTGGCGGATTTGCTTGATCGGTATGATAGAATATCCACTGCATTTGTCCATGCTGAGCAAGAAAAATCCAAATCTGCTATTGCAGAGGCATCTGCAAAGTCTATTGTTACAGAGGCAGCAAACAATC
TTGAAAATGTTCAGATGGCTTATGAAGTACAAGCTCGTGAATTTGCACAGGCCAAGGCACTTGCCACTGAAGCTGCCCAGAAAGCTTCTATGTGGGTTGAACAACATAGCAGAGTTCTAGATGCATTACGCAGTGGTTCAGCTCCAGAGCTTCAGGCTATTGGGCAACTTCCTCATACAACTGAGGCTTTGTCTCTAACA
TCTGCTGTGTTGGCCTCAGGAGTTCCCCTTACCATTGTTCCGGAGCCTACTCTAGCACATTGCCGAGATGTTGATAGGGAAGTTGCACACCTTATAAAAGAACGTCATGAAGCTATTTTGCATGCAGCCAAAGCACTACAGACTTACTCTGTGGCTTTGCAACGGCTTCTTCCAGGAAATTACATCGGTACCAGTCAGGT
GCATAATTGGGCACAGGTTTTGCAATTGTCTGTGAGGAACCTCTCTCCAGATGCGCTTGCCTTAGCCAGAAGACAAGCTTCTGATCTTGTTGCAAAAGGACAGGGTGAACATGCAGACACTATACATCAGAAGTATGAAGCATTGCGTGTGAAAATAGAGAGGCTTGTGAAAGAAATCAGAAAAGTTCAAGAAGACTGTT
CTGAACTTGAGGCATCGATTGAATCAGAAAATGAACGGAAAGCTAAGGATCGAGTGCTGGCCATTTTTACAAAACATCTGCAGCCTTCTAACTATCCTAGGAAGGATGAGGATGCTCTTGCTAGGGATTCAGGTCATAACAAACAGGATGAAACCAAGGAGCATGATGCTAGTTCTTCAGACTACGTTGACAAGAAGGTT
AAGGTATTAACCGTTCTGTATCTTGCTGCAGCTGCTTTATACAGCGAGATCAAAGACAAGATATTTAATATCTGCAATTCTTTGACAGAGAGAACTGCAGTAGGTCCAGGAGAAGATATAGGGTGCCAAAATTGGAAATGGTGTTTACCTGATTTGGAGGAGCAAGTTGCAAGATGTACACTTATTTCGGGAATTGTGAA
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AGGCATTTGGTTCACTTTCACAAATACGAGGAGCTGTTGATACAGCACTGGAACAGTTGGCTGAAATTGAAATGCAAAGGGCTTCTTTATTAGAACTTGAGAGGACCTACTATGAAAATGTTGAGGAGATCACTGAACGGAAAGTGTCGCTGGAAACGGCTATTGAAAAGGGTAGGGATCACCTTTCTTGGGAAGAAGCA
GAAGAGCTTGCAAGTCAAGTGGAAGCCTGTCGAGCCCAGTTGGATAAACTGAAGAATGCATGGGACCGCCGAGATGCTCAAGCTTCTGCACTTGTGAGGAAAGAGGCAAGTGCACGAGGTGCTTTAGTGGCAGCAGAACAACGCTTTGAGTCTCTTGTTACCATTGAGCGAGAAGGAGACATGCATCCTACAAGGGGAAA
AGTTTTACTTGCAACATTTGCTAGGCCATTCTCTGAACTGGAATCCTACAATCAGAAGTTGCCTTCTTTTGGGTATGAACCCTCCTTGAGAAAGAGTTCAGTGGATCAGACAGAGATTGTCACTTCTGGCTTTTCTGGGTTCGAGTCAGTCTGGAAGGTCACTAATATTTTAAAGGACCATACATTCTTTGTGTGGAAAG
TTAGTATTATTGATACTTGTCTTGATTCATGTATCCGTAATGTTGCATCAGCTGTAGATCATACCTTAGGTTTTGACCAGACGGTTAGCAGTCAGAAGAGGAAGCTTGAGATCCTAGTTGAGTATTATTTAGATCAGTATCTCAAGGAACGGCTTGATCCTGTTCTCCTTGAGTGCCTTGAGAAAGAGGGAGACTCATTG
AAGCACATTTTGGTGGATCAAAGGGAGTTGGAATCAAATCTAGCAAAGAAAGAGCTTGATGCGGTAAAGCGGGCTCAGGGTCTGCTTGTTGAATATAGTAATGCACATGAAACTGCACGAGCTGCTAAAGCAGCAGCTTGTGCAATGAAGATGCAAGTGGGAGAGCTCACACAGGATCTTCAGAAGGCAAACCTTGAGGC
TGCCCAATTAGAGTGGCTTCATGATTATATACTTTCTCATTTAGATCAAAATACTATCCTCCAACAGAGCTGTGCAAATGAAGACAATTTTCCATCAAGCTCTATAAAGCTTAACAGAAGAAATTTATTAGAAAACCTTCGATCTGCAATGTCTGCTATCACTAGAGCAACAGAAGGTTTACAAAACTGTGAGAGATCTG
CCATTTCCACTGAGGAACAGCTTGAGAGGGCCATGGGTTGGGCTTGTGCAGGACCCAATACTGGTGGTGGCTCAAACTATTCGGGTAGAGGGATGGGAATTCCCCCTGAATTTCACGAGCATCTTCGTCACAGACGACAGTTGTTATGGGCAGGCCAAGAACAGGCTACGGGTATACTGAAGCTCTGTTCTGCTGCTCTG
GATTTTGAGGATTCTAGGGATGGTTTCCTAAGGTCTCTTTCAGATGCATCTACTGGTGGAGCTCTAAGTGAAGGCAGAGCTTGGCAGCAAGCATACATGAATATCATTTCAAGATTGGACATTTCTTATCACTCGTTTACTTGTGCAGACCGTGAATGGCATTTAGCACAGAAAAGCATGGAAGCAGCTGGTGCAAGTCT
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GGCCAAGCATTAATCCAATCACTTCATATAAAGCTTGGAGAGGTTTGTCCTGTTTTGACAAGCACAGTTCCAGTTCTCCTGAACACTGTCAAAGAGCTACATATTGCTTTAACCAGACTTGCACGCACTGCAAGCTTTGATGCTGGTGTTCTCCATAAAGCTCTTGAAGGTGTTGGGGAAAGTCAAGAAGCACGGTCTCA
AGAATTAGATTTAGTCAGGACAGAACTTCCAGAAGATGAAGTGTTGTCTGCAGAACAAAATAGAAATATCATGGAAGCAGTTGTTGACAATGATGAACATGGTGGAGAGTCGATAACAGATGAAGAGCTCCTGCTACAAGGTGATGAAGACTCCTGGATCTCACCTCCTGATAGTTTTTATACTAATGATTCTGAGTCAG
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ATCTATGAATGTTTTTGAAAGACATCAGACAGGAGGAGAGATACAAATGAGGATGAAGGAAAAAGAACCTCATATATCTCGAGCTAAAGGAAGGGTTGAAAGTTATAGTGACCTATGCACACTATTTTCTTCTATGAACACGGAACAAAGAAGTCATGGTTTTAGGGGGAAAAATGCTTATGCAGTCTCGGTGCTGAAAC
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CTTACTAAAATTGCTGTTATTCTTCTTTGTAATGGTGTCAAAAAGGTGATCACGAAGAATCTGTTTTAGAGCATTCAGCAAAGTATTGCAAAGTGAATAGTGGAGAATTGGTGAAAGGAAATGCAAAAGAGCATTCAATGCAGCAGGTAGTATGGTGAAATGGTAGCATCAGACTATTCTCAGTATTGGGATGCGATTGA
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TTTAGGAAAGAGGAGGGTATAGGTAGATCTTCCCTGTATTTATACCCTCTTATCAAGGGTTATTCTTCATTTATATGATTGATTAAATTTCTTTTCACTGGTTCTTCTTAGGCTCTTTCTATATGAGATCTGTTCACGTGTTTTATGTTTCTAGTTTTGCAAATAGATTATGTTTATTTTTATTCAGCATCTTAAAATAC
ACATAATTGCTTTTCATTGTAACTACTATATTTGAAATGAGTTGTGTTGCTTAGTAAAGAAAGCGGGTTTGGGGA

>TRINITY_DN131445_c6_g1_i25 from sample A1 / Example unspliced isoform:

GCGTTCTGTGCGATGACATGCTTTTGAGAACGCGAAATTAATGGAGTCGGTGATGAAAGAGCTCGAGGCTCTGAAGGTGGTTCGGAAGGTGGCCAGTCGTTGGGAAGGTGGCCACGGGACCGTGCTCTTGGTCCGAAGGAAAGGCAGCAACAGGCAGGTGCGAATTTCGTTGTTCTGGTACCTTTCATAGGTGTTTTTAA
CGCTCATCGCGTTCTGTGTTCCTCCCTGCATTCAATTGCTCAATTTCTCCAGGAGCAGGACAGTCGCAGAGCCAGAACAATTCAGTCCATTTTTTAAAATCTACCAGAGATCTGAGTAGCAATGGAGTCCCAGAAAGAGGACGATTTTGAACGGGAAAAGGAGGACTGTGAACTGGAAAGAGAATTCGAATTGGAAGCTG
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GTATGCATCACCTGTTCTCAGAGCATGCCAGGAAATTTTGGAAGATGAGAGAACCTCCTTGACTCTCCTTCGATCACTTCTGAACCTTCTGACAGTTCTTTCAGTGAAATTTACACGATGTTTCCAGTCTCATTTTGCAGATATCGTAGATTTGTTGCTTGGTTGGGCTCTTGTACCTGATCTTTCTGACACTGATAGAT
GCATAATTACAGACACATTCCTGAAGTTTCAGAAGCTCTGGGTGGGTAACTTGCAGTTCTCGCTAAACTTGTTAACCAAATTTTTAGGAGACATGGAAGTTTTAGCTCAGGATGCAACTCCTGGAACACTGCAACAATTACGACGATTGCTTGTGCTTGTTTCCTGCTTTGTCACAGTTTTACAAGCCACAGCAACTGGT
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CAGGGCTGGCTGCAGCCACTTATCTTTTTCTGCTAAAGCATGCCTCTAATGAAGTTGTGTCTCAAGCCATTCATTCTCTAATGGCAGAACTACAAATACTGAAGAGTCTACTTTTGCAGGCTCATTCTGCAGGAATTCATGTCTCAGAAGAGCTTGACAACAGAAATCATAATCAAGCTGCAGTAGATTCTCTTGGAAGG
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GCAGTTTGCTCTAATTCAGGCTCTACATAGGATTTGTATTGTTCTTGTTTTTGGAAAACATATGGTTGGAGAGAGACTTCCTGAAACGAGTGTTGTATTCTCGGGGTCTAATGAAAAATTTCAGACTTTAGCACAGTCAAGCAAGGAAACAAGCATGGCAGTATCCAAGAATTTAAATGTCTATGGGTTATATATTGCTA
AAGCTCTGCATATTTCGGCCAGTCTTTCTGTAAAATTGGAAGCCTTGGACTGGGTTGGTAGCCTTTGTAGGGGCATGATGACCACGAGTAATGACGATACTTTTCAATTTTATTGTTACCAGGGTTGCGAAGATTTCCGGGCATGTTGGCATACATGTTTAAGCAAGAATATATTGTTCCCAGTTTTATGTGCAGCATCA
GATAGAGACTTGAAAGTCAGGTTCCGGGTTGCATCAGTTCTTCAGCTCCTTTTACAAGCAAAGCTCATATATCCAGTATACTTTGACGCCGTTGCAAATGTGGCTCTTGAAAAACTTGGAGATCCTGATTCCTCACTTCAAAGTGCATTTAGGAAAGTTCTTTCACTGGTTGTCCCCGCTGCATTGTATTTGGGAGGTTG
CATTGAAAATGATGATAACTATGCATACAAGCACATTATGTCTTATGTTAAGGCAGGGAGCAGAAAGTATTCACACTGGAAGCAAGTGTTTACAATCAAGCACTTGTCACAATCATCACGGTCACAGCAGCTTGTCTATATTTTGAACTACATTTCCCAACGGTCACAGGTTGTTCCCTCTTGTTGGTTCCAGCGTCTTG
TTCTTAGCTATCATGGAAATTTAAAGAGTTGGCTTCCAAAACCACACAAAGATCGATTAAACTCAGAAGCAGGTAGCCTGTGGTTGGACCTTAATGTTGACTGTGAAACGCTTGAGAGAGTCTTTTCCACCAACAATCTTGCTGCTGCTTGGTGGTCTATACATGAAGCAGCTCGTCACTGCATCACTGTTCGGCTTCGC
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ATATGGCTAGAAGTCAAACAGCGGATAATTCACAGGGCTTGAGAGCAAAATTGATAAATGATGTGCTCCGAATCTTACGCCACGCATCACTAGCCTTGTCCAGACTTCATGAGTCAGATGCCATTGTTGGTCTCCAGATATGGGCAACATCGACCTTTGTTACACCTCTTCTAGATGACAGTTTGCTAGGACTGAAAGCT
TTGGGAGGATTTGGACTATTTGGATGGATGACAGGTCTTGTATATCAAGCTCGTGGGCAATATGAAAAAGCCACGGCCCACTTTACACACATGCTTCAGTCTGAGGAAAATCTTTCTTTGATGGGTGCTGATGGAGTACAATTTGTCATTGCACGTATAATTGAAAGCTATGTAGCTCTAACAGATTGGGAATCTCTAGA
CCACTGGCTTCAGGAACTGCAGTTGATTCGAGCCAAGCATGCAGGGAAGTCCTATGCTGGAGCATTAACAACTGCTGGCAACGAAATGAATGCTATTCATGCTCTAGCTCGCTTTGATGTAGGTGATGTGCAAGGTGCATGGGGATACTTGGACTTGACTCCACAGAGCAGCAGTGAACTTACAGTAGATCCTAGGCAGG
CTCTTCACAGAAGTGAGCAAATGCTTTTGCAGGCAATGCTTCGTACTGATTCCCAAGAAAAAGAGATTAAACTGGAAACAGAGAAGGCAAAGGTGATGTTAGAAGAGGCTTTGCTAGTATCTTCAATTGATGGTTTGCCTGAGGCAGCAGCATATGCAACCCAGTTTCACTGTATTTATGCCTTTGAACAAGGACGCAGA
CTTAATGCTGGCCATGATGAATCTGGGGAGTTTGCATCAATACTTAGTTCCCTGCAGAATGCAGTCCAAGTGCCGATGAATCCATTACAACAAGATTGTCTTCTGTGGTTGAAACTCTTACGCGTCTACCATGTTGTGCTACCAGAGTCAAAGTCAACTTTGCAGCTTTGCCAACAAGTCATAAAACTAGCTCGCAAACA
AACCAATTTCCAACTGGCTCATCGTCTGCACCAAGAATTGTTGAGTGGTATTTCAAGACGTCACAAAGATGACTTTTCTGAATGGCTTGTTGCAAGCTTACAGTATGAGAGTATTCTGCTTCTTTTTGCAGAGGGAAAATGTGAGGAAGCCATAGTAGAGCTTTGGTCATTGGTACGTTCTTACATACCATTTTCTGCCT
TGTCTGTTTCTGCATCTGGCAATATGTTGAAGGCGAAGGCATGTGTGAAACTGTCATTTTGGTTGAAAGAAAAGTATTCTGAAATACATTGGCCAAACTTACTCCCAAAAATGAGTTTAGATAACCCTAAGTTCAGATCAAGTGATATTGCTGCTAATTTGGACGAGGGAGCCACTTCAAGGGAAACTGGCTGGATGTCA
GCTGGCAGCTACAACTTGATAGTTGAGGAGGTGGTTGGTGCTTCCATTAAAGCAGCAACACTTCTGTGTCCAAATATGTCTAAGGCATGGCTGTCATATGCCTCTTGGTGTTACCATCAAGCCAGAGCATCACTTTCAGGTGATGGTGCAGCTTTAAGGTCATGCAATTTGTCACCGATTCTGATTCAGGAAGTTTCTTC
TGATGGGACAGGTTTACTTGAAGAAGAGGTAATGCGAGTGCGAGCCATTATCATGAGAACACTCTTAAATAATGAAAAAGCGGATCCAGGAAGTGAGGAAATATTACTGTGGCCGGACACTGAAGTGTACATGAACAGTGAAAATATTAACTTTGTAGAACTATTGGTCCAACGTACTGTATATATGATGCAGTCAGCAG
CAGGTGCAGCAGGAGTTGAAAATTCAGATGGTGAAAGTGCTTGTTCGCTTTTGGTTGCTCAACTTCAGCGAGAACTACTGAATATCAAGCACAATATAGATTCCTCTCTTATGACATCTTTGATTAATGAATTGATGGACATCTGGTGGACTTTGAGGAAGAGAAGGGTATCATTATTTGGCCATGCAGCTCGTGGCTTT
TTACAGTATCTTTCACTATCAAATAGGACACATCTTGAACAAGGTCCTTGGAAAAGCTATAATTTAGATGTTTTAAAACATGGGAGGGAAGACTGCACACTCAGAGCAACTTTATACATATTAAATATCCTTCTAAATTATGGAGTAGAATTAGGAGAGACACTTAAAAATGGTCTTATGACAGGGCCACCTCTACCATG
GCAGGAGATAATCCCTCAGCTATTTGCTCGGTTGAGCACTCATCCTGAACATCAGGTTCGTAAACGGTTGGAGGGGTTGTTGATTACATTGGCAAAGTTATCTCCATGGGCTATAGTCTATCCTACACTTGTTGATATCAGTGCTTATGAAGGCGAGCCATCAGAGGAGCTTCAACGCATCTTAGACTGTCTGGTTAAAG
TTCATCCAAAACTGGTTCAGGACGTGCAATTAATGATATTGGAACTTGGGAATATTACTGTTCTTTGGGAGGAGCAGTGGCTTAGCACACTACAAGATCTTCATGCAGATGTTATGAGACGGATAGCTACACTGAAAGAAGAGGTTTCCAGGGTGGCAGAGAACATTACACTTACTCACAGTGAGAAGGTTAAAATAAAT
GCTGCCAAGTATTCTGCAATGATGGCACCAATTGCTGTAGCTTTGGAACGGCGTCTAGTTTCCACATCTCGGATGCCGGAAACTGCCCATGAGGCTTGGTTCCAGAAGGAATATGGTGAGCAACTGAAAGCTGCTATAACAAATTTCAAGACCCCTCCTTCAACTGTTGCTTCCCTTGCAGAAATGTGGCGACCTTTTGA
TATAATTGCTGCATCTTTGGCGAACCATCAGAAGAAATCATCAGTCTACCTGAGTGAGGTTGCTCCACGACTTGCACAGCTGGCTTCTTCTGATGCTCCAATGCCTGGTCTTGAGAAACAGATATCAATGTCCGAATCTGAAGGAATTCCTGGCAGCGATCTTCTGGGCCTGGTTACAATTTCTTCTTTTAGTGAACAGG
TCACTATTCTTGCAACAAAGACAAAGCCAAAGAAGCTAGTTCTATTGGGTTCAGATGGTCAAAGGTATACTTATCTTCTCAAGGGCCGGGAAGATTTGCGACTTGATGCAAGAATAATGCAGCTTTTGCAAGCTGTGAATGGAATGCTACATGCAAGCACAAGTACACAGGGTCGTTCGCTAGCAGTTCGCTACTATTCT
GTAACTCCTATAAGTGGGCGAGCAGGCTTGATCCAATGGGTGGACAATCTTATAAGCATGTATAGTGTATTCAAAGCTTGGCAGCAGCGTGCACAGTATGCTCAGTTTACATCTACTACTAGTGGTACTGCAGCTGCAAACACTCCCATCCCACCTGTTCCACGTCCCAGTGATATGTTCTATGGGAAGATTATTCCAGC
ACTAAAAGAAAAAGGTTTGCGTAAAGTCATTTCACGACGGGATTGGCCACAAGAAGTAAAAAGAAAGGTTCTGTTGGACCTTATGAAAGAGACTCCTCGTCAACTACTTTATCGAGAAATTTGGTGTGCAAGTGAAGGATTCCAAACCTTTAACTCAAAACTACAGAGGTTTTCAGGCAGTGTAGCAGTCATGAGCATGG
TGGGGCACATTCTAGGTCTGGGTGATAGACATTTGGATAATATTCTTATGGACTTCAACACTGGTGATGTTGTCCATATAGATTATAATGTGTGCTTTGACAAGGGACTGAGATTGAAGATTCCGGAGATAGTACCATTTCGTCTTACTCAGATTATGCAAGCAGCATTAGGACTCATGGGAATAGAAGGCACATTCAGA
GCAAACTGTGAATCTGTAATTGACATTTTACGGAAAAACAAAGACATAATCTTGATGCTTTTAGAAGTATTTGTATGGGATCCATTGATTGAGTGGATGCGTGGAGATGGCCACGATGAAGCAACCATTGGTGGAGAGGAACGGAAAGGTATGGAGTTGGCAGTCAGTTTAAGCCTATTTGCTTCTCGAGTTCAAGAAAT
ACGAGTACCACTTCAGGAGCATCACGATCTGCTGTTAGTAACTCTTCCTGCAGCATCATCTGCACTTCAGAGTTTGGCGGATTTGCTTGATCGGTATGATAGAATATCCACTGCATTTGTCCATGCTGAGCAAGAAAAATCCAAATCTGCTATTGCAGAGGCATCTGCAAAGTCTATTGTTACAGAGGCAGCAAACAATC
TTGAAAATGTTCAGATGGCTTATGAAGTACAAGCTCGTGAATTTGCACAGGCCAAGGCACTTGCCACTGAAGCTGCCCAGAAAGCTTCTATGTGGGTTGAACAACATAGCAGAGTTCTAGATGCATTACGCAGTGGTTCAGCTCCAGAGCTTCAGGCTATTGGGCAACTTCCTCATACAACTGAGGCTTTGTCTCTAACA
TCTGCTGTGTTGGCCTCAGGAGTTCCCCTTACCATTGTTCCGGAGCCTACTCTAGCACATTGCCGAGATGTTGATAGGGAAGTTGCACACCTTATAAAAGAACGTCATGAAGCTATTTTGCATGCAGCCAAAGCACTACAGACTTACTCTGTGGCTTTGCAACGGCTTCTTCCAGGAAATTACATCGGTACCAGTCAGGT
GCATAATTGGGCACAGGTTTTGCAATTGTCTGTGAGGAACCTCTCTCCAGATGCGCTTGCCTTAGCCAGAAGACAAGCTTCTGATCTTGTTGCAAAAGGACAGGGTGAACATGCAGACACTATACATCAGAAGTATGAAGCATTGCGTGTGAAAATAGAGAGGCTTGTGAAAGAAATCAGAAAAGTTCAAGAAGACTGTT
CTGAACTTGAGGCATCGATTGAATCAGAAAATGAACGGAAAGCTAAGGATCGAGTGCTGGCCATTTTTACAAAACATCTGCAGCCTTCTAACTATCCTAGGAAGGATGAGGATGCTCTTGCTAGGGATTCAGGTCATAACAAACAGGATGAAACCAAGGAGCATGATGCTAGTTCTTCAGACTACGTTGACAAGAAGGTT
AAGGTATTAACCGTTCTGTATCTTGCTGCAGCTGCTTTATACAGCGAGATCAAAGACAAGATATTTAATATCTGCAATTCTTTGACAGAGAGAACTGCAGTAGGTCCAGGAGAAGATATAGGGTGCCAAAATTGGAAATGGTGTTTACCTGATTTGGAGGAGCAAGTTGCAAGATGTACACTTATTTCGGGAATTGTGAA
TGAAGTTCAGCAAATGAGTGGACAAAATTTGATCCAACGTGGATCGGGCTGGTGGGATACAATGGGTTCTGTTGATGATGATTGGACTTTGAGCTTTCAGGGTTGTTTGACTGCAATTCGTAGACTAGTGGGTCAGCTGGTTGGACGTGCAATTCCAGAATCAATAAGATCAGTTCTTTCCCACAACCCTGCAATTATGG
AGGCATTTGGTTCACTTTCACAAATACGAGGAGCTGTTGATACAGCACTGGAACAGTTGGCTGAAATTGAAATGCAAAGGGCTTCTTTATTAGAACTTGAGAGGACCTACTATGAAAATGTTGAGGAGATCACTGAACGGAAAGTGTCGCTGGAAACGGCTATTGAAAAGGGTAGGGATCACCTTTCTTGGGAAGAAGCA
GAAGAGCTTGCAAGTCAAGTGGAAGCCTGTCGAGCCCAGTTGGATAAACTGAAGAATGCATGGGACCGCCGAGATGCTCAAGCTTCTGCACTTGTGAGGAAAGAGGCAAGTGCACGAGGTGCTTTAGTGGCAGCAGAACAACGCTTTGAGTCTCTTGTTACCATTGAGCGAGAAGGAGACATGCATCCTACAAGGGGAAA
AGTTTTACTTGCAACATTTGCTAGGCCATTCTCTGAACTGGAATCCTACAATCAGAAGTTGCCTTCTTTTGGGTATGAACCCTCCTTGAGAAAGAGTTCAGTGGATCAGACAGAGATTGTCACTTCTGGCTTTTCTGGGTTCGAGTCAGTCTGGAAGGTCACTAATATTTTAAAGGACCATACATTCTTTGTGTGGAAAG
TTAGTATTATTGATACTTGTCTTGATTCATGTATCCGTAATGTTGCATCAGCTGTAGATCATACCTTAGGTTTTGACCAGACGGTTAGCAGTCAGAAGAGGAAGCTTGAGATCCTAGTTGAGTATTATTTAGATCAGTATCTCAAGGAACGGCTTGATCCTGTTCTCCTTGAGTGCCTTGAGAAAGAGGGAGACTCATTG
AAGCACATTTTGGTGGATCAAAGGGAGTTGGAATCAAATCTAGCAAAGAAAGAGCTTGATGCGGTAAAGCGGGCTCAGGGTCTGCTTGTTGAATATAGTAATGCACATGAAACTGCACGAGCTGCTAAAGCAGCAGCTTGTGCAATGAAGATGCAAGTGGGAGAGCTCACACAGGATCTTCAGAAGGCAAACCTTGAGGC
TGCCCAATTAGAGTGGCTTCATGATTATATACTTTCTCATTTAGATCAAAATACTATCCTCCAACAGAGCTGTGCAAATGAAGACAATTTTCCATCAAGCTCTATAAAGCTTAACAGAAGAAATTTATTAGAAAACCTTCGATCTGCAATGTCTGCTATCACTAGAGCAACAGAAGGTTTACAAAACTGTGAGAGATCTG
CCATTTCCACTGAGGAACAGCTTGAGAGGGCCATGGGTTGGGCTTGTGCAGGACCCAATACTGGTGGTGGCTCAAACTATTCGGGTAGAGGGATGGGAATTCCCCCTGAATTTCACGAGCATCTTCGTCACAGACGACAGTTGTTATGGGCAGGCCAAGAACAGGCTACGGGTATACTGAAGCTCTGTTCTGCTGCTCTG
GATTTTGAGGATTCTAGGGATGGTTTCCTAAGGTCTCTTTCAGATGCATCTACTGGTGGAGCTCTAAGTGAAGGCAGAGCTTGGCAGCAAGCATACATGAATATCATTTCAAGATTGGACATTTCTTATCACTCGTTTACTTGTGCAGACCGTGAATGGCATTTAGCACAGAAAAGCATGGAAGCAGCTGGTGCAAGTCT
TTCTACTGCAACTAATGATTTGTGCCTCGTATCTATAAAATTGAAGTCCACGTCAGGTGAACTTCAAGCTACACTTTCAAGCATGAGGGATTGGACAGTTAAAGCAAGTACAGATCTGTCAGCATTTTGCCGTGTGGCAAGGGGAAATTCTGCTCTAACAACTGAGAGTGGATCAATGCTTGAAGAGGTTTTGGCAATAA
CGGAAGGAGCAGAAGGTGCACATGATGTTTATAGATTGGCAAAAGAAGCCACAGCACAACATAGTAATCTAATGTCTGAACTTAACAAAGTTAACATGCTTCTTCTTCCTCTGGAGTCCATGCTGGCTTCTGCATCAAATACAGTAATTGGTATTATTAACAGGGATGGTGAACAGAAATTGGAAATCTCTGTGGGTCAA
GGCCAAGCATTAATCCAATCACTTCATATAAAGCTTGGAGAGGTTTGTCCTGTTTTGACAAGCACAGTTCCAGTTCTCCTGAACACTGTCAAAGAGCTACATATTGCTTTAACCAGACTTGCACGCACTGCAAGCTTTGATGCTGGTGTTCTCCATAAAGCTCTTGAAGGTGTTGGGGAAAGTCAAGAAGCACGGTCTCA
AGAATTAGATTTAGTCAGGACAGAACTTCCAGAAGATGAAGTGTTGTCTGCAGAACAAAATAGAAATATCATGGAAGCAGTTGTTGACAATGATGAACATGGTGGAGAGTCGATAACAGATGAAGAGCTCCTGCTACAAGGTGATGAAGACTCCTGGATCTCACCTCCTGATAGTTTTTATACTAATGATTCTGAGTCAG
ACAATACTTCCCCAGACTCACAACATCAAGATGACTCTTTGACCATCTCCAATGACTGGGAATCTCATATAAATGGAACTGACAAGGCTAAGTTTAGTGAGGGAGTGGTATCAGATGCTTCAAGGTTTACAGTGAATGAGGATACTGGATATACTTCTCCATCCTTTTTGGCCCATAGCCAAGAAGATCCTTTGCTAGTT
GGGCATATTCAAACAGACATGAAATTTGAAGGTACAGAGGATAGTGAGAATGGGATTATTTCTATGGGAAATAGTCAAATTCATTCTGTCAAGGACACAAGTCAGAGGCCAGAAGGCTCACAGGCATCAATAAGTTCAAATAAGGTCAGTTCTGACAGTCAGAATGCTACACACATGAACTTGTCAGACATGGGACTTGG
ATCTATGAATGTTTTTGAAAGACATCAGACAGGAGGAGAGATACAAATGAGGATGAAGGAAAAAGAACCTCATATATCTCGAGCTAAAGGAAGGGTTGAAAGTTATAGTGACCTATGCACACTATTTTCTTCTATGAACACGGAACAAAGAAGTCATGGTTTTAGGGGGAAAAATGCTTATGCAGTCTCGGTGCTGAAAC
GAGTTGAAGCAAAGCTGGATGGCCGAGACATTGATGGGAAAAGACAATTTTCTGTTTCAGAACAAGTGGATCATCTTCTTCGTCAGGCTACAAGCATTGATAATTTATGTAATATGTATGAAGGTTGGACACCTTGGATATGATGCCCTACAAATAGCCTCTTCAAGTTCCTGCTACTTCTCCTGGAAAGGCAGTGTTAT
TTTTGAGCTGGCTGGTATTCCCATTGTGTCACTTGTCAGTGATCTCAATCATCGCAGAACAGTTTAGGGTCCACCTTTTGTCTATCTTGGGTTAGACTCGTCACAAATCATTAGGATAGAAGAAATCCATTTTGGTCAATGGTGAGAATAGAAGAATGCTAAGGAAAATTCATCCATCATGGAAGTTGAGGCTTGAAGAA
TTGTTACAATCCTCTACTTTCTTTAAGCAAGATTCTGTTAAGGAAACACACAGAGACACCTTGAATTAGGATGTGATTTTACTCACAAAGGTCAGATCAGAGCACCTCCATTGTCAATATTTTAATGGAACTGCATTGTCAGGTGCAAACTTGAGCTAGAAAAAAATGTGGACTTGTTTGATTGAGAGATAACAAACTGT
CAACAACCATCCCGCCAGAGAAATGCTTTAATACTAGGTCACTTGCGCTTTGTAGTGGAAGTGCAGGATAAGTCACAAAACCGTGCTTTGCCATTGCTTGGGCAGGGCACTGTCCAGTCCATGTAGAGGTGCTGCTGGCAGTATATTGCAgtgagtccaatttcacagcttaacatacccaagtgacttatatcagaatt
ttggtatgcaaatctagaatccagatgtggtggttatgactgctaatttttatttcctagagcttttgtgattttgattgcagGTATTTGTCTAGTTGAACCTACTACTTTGATCTGAGAGCAAATGAACACTCTTACTAAAATTGCTGTTATTCTTCTTTGTAATGGTGTCAAAAAGGTGATCACGAAGAATCTGTTTT
AGAGCATTCAGCAAAGTATTGCAAAGTGAATAGTGGAGAATTGGTGAAAGGAAATGCAAAAGAGCATTCAATGCAGCAGGTAGTATGGTGAAATGGTAGCATCAGACTATTCTCAGTATTGGGATGCGATTGAGTTTTGCCAGTACTTCGAAAACAAATGCTATAAATCAAACTGCATGAAATTATATCTTGAAGCAATG
GTAATGAAAATAATGGTTGAATTGAGAGGGTTCCTGTAGAAGAAGATCTTGATCACTAGGTACTTCAACGACAGATTATTTTAGCATGGCAGTTTGTTATTTTGGAGAATTTTCTTGTGGCAGTGAATTATTTATCATTGCAGCAGGTAGGTATGGTGAAATGATAGCCAGATCAAAATCAAATGATATATGTTAAACTG
TGTGAGACTCTATATCGAAGTAAAAGTTTTGAAAAATATGTTTGAGTTGAGAGGGTTACCTGTGAAAAGAAGTACTTCGTTACTGGGTACTTCAGCAATAGATAATATTAGCATGGTGATCAGTAGACAATCGTTTAGGAAAGAGGAGGGTATAGGTAGATCTTCCCTGTATTTATACCCTCTTATCAAGGGTTATTCTT
CATTTATATGATTGATTAAATTTCTTTTCACTGGTTCTTCTTAGGCTCTTTCTATATGAGATCTGTTCACGTGTTTTATGTTTCTAGTTTTGCAAATAGATTATGTTTATTTTTATTCAGCATCTTAAAATACACATAATTGCTTTTCATTGTAACTACTATATTTGAAATGAGTTGTGTTGCTTAGTAAAGAAAGCGGG
TTTGGGGA

Intron 6 GTATTTGTCT ... TGTCAAAAAG

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>TRINITY_DN119837_c5_g1_i5 from sample A2 / Example spliced isoform

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GCGATCTTCTGGGCCTGGTTACAATTTCTTCTTTTAGTGAACAGGTCACTATTCTTGCAACAAAGACAAAGCCAAAGAAGCTAGTTCTATTGGGTTCAGATGGTCAAAGGTATACTTATCTTCTCAAGGGCCGGGAAGATTTGCGACTTGATGCAAGAATAATGCAGCTTTTGCAAGCTGTGAATGGAATGCTACATGCA
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TGTTCCACGTCCCAGTGATATGTTCTATGGGAAGATTATTCCAGCACTAAAAGAAAAAGGTTTGCGTAAAGTCATTTCACGACGGGATTGGCCACAAGAAGTAAAAAGAAAGGTTCTGTTGGACCTTATGAAAGAGACTCCTCGTCAACTACTTTATCGAGAAATTTGGTGTGCAAGTGAAGGATTCCAAACCTTTAACT
CAAAACTACAGAGGTTTTCAGGCAGTGTAGCAGTCATGAGCATGGTGGGGCACATTCTAGGTCTGGGTGATAGACATTTGGATAATATTCTTATGGACTTCAACACTGGTGATGTTGTCCATATAGATTATAATGTGTGCTTTGACAAGGGACTGAGATTGAAGATTCCGGAGATAGTACCATTTCGTCTTACTCAGATT
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CAGAGGCATCTGCAAAGTCTATTGTTACAGAGGCAGCAAACAATCTTGAAAATGTTCAGATGGCTTATGAAGTACAAGCTCGTGAATTTGCACAGGCCAAGGCACTTGCCACTGAAGCTGCCCAGAAAGCTTCTATGTGGGTTGAACAACATAGCAGAGTTCTAGATGCATTACGCAGTGGTTCAGCTCCAGAGCTTCAG
GCTATTGGGCAACTTCCTCATACAACTGAGGCTTTGTCTCTAACATCTGCTGTGTTGGCCTCAGGAGTTCCCCTTACCATTGTTCCGGAGCCTACTCTAGCACATTGCCGAGATGTTGATAGGGAAGTTGCACACCTTATAAAAGAACGTCATGAAGCTATTTTGCATGCAGCCAAAGCACTACAGACTTACTCTGTGGC
TTTGCAACGGCTTCTTCCAGGAAATTACATCGGTACCAGTCAGGTGCATAATTGGGCACAGGTTTTGCAATTGTCTGTGAGGAACCTCTCTCCAGATGCGCTTGCCTTAGCCAGAAGACAAGCTTCTGATCTTGTTGCAAAAGGACAGGGTGAACATGCAGACACTATACATCAGAAGTATGAAGCATTGCGTGTGAAAA
TAGAGAGGCTTGTGAAAGAAATCAGAAAAGTTCAAGAAGACTGTTCTGAACTTGAGGCATCGATTGAATCAGAAAATGAACGGAAAGCTAAGGATCGAGTGCTGGCCATTTTTACAAAACATCTGCAGCCTTCTAACTATCCTAGGAAGGATGAGGATGCTCTTGCTAGGGATTCAGGTCATAACAAACAGGATGAAACC
AAGGAGCATGATGCTAGTTCTTCAGACTACGTTGACAAGAAGGTTAAGGTATTAACCGTTCTGTATCTTGCTGCAGCTGCTTTATACAGCGAGATCAAAGACAAGATATTTAATATCTGCAATTCTTTGACAGAGAGAACTGCAGTAGGTCCAGGAGAAGATATAGGGTGCCAAAATTGGAAATGGTGTTTACCTGATTT
GGAGGAGCAAGTTGCAAGATGTACACTTATTTCGGGAATTGTGAATGAAGTTCAGCAAATGAGTGGACAAAATTTGATCCAACGTGGATCGGGCTGGTGGGATACAATGGGTTCTGTTGATGATGATTGGACTTTGAGCTTTCAGGGTTGTTTGACTGCAATTCGTAGACTAGTGGGTCAGCTGGTTGGACGTGCAATTC
CAGAATCAATAAGATCAGTTCTTTCCCACAACCCTGCAATTATGGAGGCATTTGGTTCACTTTCACAAATACGAGGAGCTGTTGATACAGCACTGGAACAGTTGGCTGAAATTGAAATGCAAAGGGCTTCTTTATTAGAACTTGAGAGGACCTACTATGAAAATGTTGAGGAGATCACTGAACGGAAAGTGTCGCTGGAA
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TGTTACCATTGAGCGAGAAGGAGACATGCATCCTACAAGGGGAAAAGTTTTACTTGCAACATTTGCTAGGCCATTCTCTGAACTGGAATCCTACAATCAGAAGTTGCCTTCTTTTGGGTATGAACCCTCCTTGAGAAAGAGTTCAGTGGATCAGACAGAGATTGTCACTTCTGGCTTTTCTGGGTTCGAGTCAGTCTGGA
AGGTCACTAATATTTTAAAGGACCATACATTCTTTGTGTGGAAAGTTAGTATTATTGATACTTGTCTTGATTCATGTATCCGTAATGTTGCATCAGCTGTAGATCATACCTTAGGTTTTGACCAGACGGTTAGCAGTCAGAAGAGGAAGCTTGAGATCCTAGTTGAGTATTATTTAGATCAGTATCTCAAGGAACGGCTT
GATCCTGTTCTCCTTGAGTGCCTTGAGAAAGAGGGAGACTCATTGAAGCACATTTTGGTGGATCAAAGGGAGTTGGAATCAAATCTAGCAAAGAAAGAGCTTGATGCGGTAAAGCGGGCTCAGGGTCTGCTTGTTGAATATAGTAATGCACATGAAACTGCACGAGCTGCTAAAGCAGCAGCTTGTGCAATGAAGATGCA
AGTGGGAGAGCTCACACAGGATCTTCAGAAGGCAAACCTTGAGGCTGCCCAATTAGAGTGGCTTCATGATTATATACTTTCTCATTTAGATCAAAATACTATCCTCCAACAGAGCTGTGCAAATGAAGACAATTTTCCATCAAGCTCTATAAAGCTTAACAGAAGAAATTTATTAGAAAACCTTCGATCTGCAATGTCCG
CTATCACTAGAGCAACAGAAGGTTTACAAAACTGTGAGAGATCTGCCATTTCCACTGAGGAACAGCTTGAGAGGGCCATGGGTTGGGCTTGTGCAGGACCCAATACTGGTGGTGGCTCAAACTATTCGGGTAGAGGGATGGGAATTCCCCCTGAATTTCACGAGCATCTTCGTCACAGACGACAGTTGTTATGGGCAGGC
CAAGAACAGGCTACGGGTATACTGAAGCTCTGTTCTGCTGCTCTGGATTTTGAGGATTCTAGGGATGGTTTCCTAAGGTCTCTTTCAGATGCATCTACTGGTGGAGCTCTAAGTGAAGGCAGAGCTTGGCAGCAAGCATACATGAATATCATTTCAAGATTGGACATTTCTTATCACTCGTTTACTTGTGCAGACCGTGA
ATGGCATTTAGCACAGAAAAGCATGGAAGCAGCTGGTGCAAGTCTTTCTACTGCAACTAATGATTTGTGCCTCGTATCTATAAAATTGAAGTCCACGTCAGGTGAACTTCAAGCTACACTTTCAAGCATGAGGGATTGGACAGTTAAAGCAAGTACAGATCTGTCAGCATTTTGCCGTGTGGCAAGGGGAAATTCTGCTC
TAACAACTGAGAGTGGATCAATGCTTGAAGAGGTTTTGGCAATAACGGAAGGAGCAGAAGGTGCACATGATGTTTATAGATTGGCAAAAGAAGCCACAGCACAACATAGTAATCTAATGTCTGAACTTAACAAAGTTAACATGCTTCTTCTTCCTCTGGAGTCCATGCTGGCTTCTGCATCAAATACAGTAATTGGTATT
ATTAACAGGGATGGTGAACAGAAATTGGAAATCTCTGTGGGTCAAGGCCAAGCATTAATCCAATCACTTCATATAAAGCTTGGAGAGGTTTGTCCTGTTTTGACAAGCACAGTTCCAGTTCTCCTGAACACTGTCAAAGAGCTACATATTGCTTTAACCAGACTTGCACGCACTGCAAGCTTTGATGCTGGTGTTCTCCA
TAAAGCTCTTGAAGGTGTTGGGGAAAGTCAAGAAGCACGGTCTCAAGAATTAGATTTAGTCAGGACAGAACTTCCAGAAGATGAAGTGTTGTCTGCAGAACAAAATAGAAATATCATGGAAGCAGTTGTTGACAATGATGAACATGGTGGAGAGTCGATAACAGATGAAGAGCTCCTGCTACAAGGTGATGAAGACTCCT
GGATCTCACCTCCTGATAGTTTTTATACTAATGATTCTGAGTCAGACAATACTTCCCCAGACTCACAACATCAAGATGACTCTTTGACCATCTCCAATGACTGGGAATCTCATATAAATGGAACTGACAAGGCTAAGTTTAGTGAGGGAGTGGTATCAGATGCTTCAAGGTTTACAGTGAATGAGGATACTGGATATACT
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ATGGTTTTAGGGGGAAAAATGCTTATGCAGTCTCGGTGCTGAAACGAGTTGAAGCAAAGCTGGATGGCCGAGACATTGATGGGAAAAGACAATTTTCTGTTTCAGAACAAGTGGATCATCTTCTTCGTCAGGCTACAAGCATTGATAATTTATGTAATATGTATGAAGGTTGGACACCTTGGATATGATGCCCTACAAAT
AGCCTCTTCAAGTTCCTGCTACTTCTCCTGGAAAGGCAGTGTTATTTTTGAGCTGGCTGGTATTCCCATTGTGTCACTTGTCAGTGATCTCAATCATCGCAGAACAGTTTAGGGTCCACCTTTTGTCTATCTTGGGTTAGACTCGTCACAAATCATTAGGATAGAAGAAATCCATTTTGGTCAATGGTGAGAATAGAAGA
ATGCTAAGGAAAATTCATCCATCATGGAAGTTGAGGCTTGAAGAATTGTTACAATCCTCTACTTTCTTTAAGCAAGATTCTGTTAAGGAAACACACAGAGACACCTTGAATTAGGATGTGATTTTACTCACAAAGGTCAGATCAGAGCACCTCCATTGTCAATATTTTAATGGAACTGCATTGTCAGGTGCAAACTTGAG
CTAGAAAAAAATGTGGACTTGTTTGATTGAGAGATAACAAACTGTCAACAACCATCCCGCCAGAGAAATGCTTTAATACTAGGTCACTTGCGCTTTGTAGTGGAAGTGCAGGATAAGTCACAAAACCGTGCTTTGCCATTGCTTGGGCAGGGCACTGTCCAGTCCATGTAGAGGTGCTGCTGGCAGTATATTGCAGTGAT
CACGAAGAATCTGTTTTAGAGCATTCAGCAAAGTATTGCAAAGTGAATAGTGGAGAATTGGTGAAAGGAAATGCAAAAGAGCATTCAATGCAGCAGGTAGTATGGTGAAATGGTAGCATCAGACTATTCTCAGTATTGGGATGCGATTGAGTTTTGCCAGTACTTCGAAAACAAATGCTATAAATCAAACTGCATGAAAT
TATATCTTGAAGCAATGGTAATGAAAATAATGGTTGAATTGAGAGGGTTCCTGTAGAAGAAGATCTTGATCACTAGGTACTTCAACGACAGATTATTTTAGCATGGCAGTTTGTTATTTTGGAGAATTTTCTTGTGGCAGTGAATTATTTATCATTGCAGCAGGTAGGTATGGTGAAATGATAGCCAGATCAAAATCAAA
TGATATATGTTAAACTGTGTGAGACTCTATATCGAAGTAAAAGTTTTGAAAAATATGTTTGAGTTGAGAGGGTTACCTGTGAAAAGAAGTACTTCGTTACTGGGTACTTCAGCAATAGATAATATTAGCATGGTGATCAGTAGACAATCGTTTAGGAAAGAGGAGGGTATAGGTAGATCTTCCCTGTATTTATACCCTCT
TATCAAGGGTATAGGTAGATCTTCCCTGTATTTATACCCTCTTATCAAGGGTATAGGTAGATCTTCCCTG

>TRINITY_DN119837_c5_g1_i1 from sample A2 / Example unspliced isoform:

TGGTCTTGAGAAACAGATATCAATGTCCGAATCTGAAGGAATTCCTGGCAGCGATCTTCTGGGCCTGGTTACAATTTCTTCTTTTAGTGAACAGGTCACTATTCTTGCAACAAAGACAAAGCCAAAGAAGCTAGTTCTATTGGGTTCAGATGGTCTTGAGAAACAGATATCAATGTCCGAATCTGAAGGAATTCCTGGCA
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CAAAACTACAGAGGTTTTCAGGCAGTGTAGCAGTCATGAGCATGGTGGGGCACATTCTAGGTCTGGGTGATAGACATTTGGATAATATTCTTATGGACTTCAACACTGGTGATGTTGTCCATATAGATTATAATGTGTGCTTTGACAAGGGACTGAGATTGAAGATTCCGGAGATAGTACCATTTCGTCTTACTCAGATT
ATGCAAGCAGCATTAGGACTCATGGGAATAGAAGGCACATTCAGAGCAAACTGTGAATCTGTAATTGACATTTTACGGAAAAACAAAGACATAATCTTGATGCTTTTAGAAGTATTTGTATGGGATCCATTGATTGAGTGGATGCGTGGAGATGGCCACGATGAAGCAACCATTGGTGGAGAGGAACGGAAAGGTATGGA
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TTTGCAACGGCTTCTTCCAGGAAATTACATCGGTACCAGTCAGGTGCATAATTGGGCACAGGTTTTGCAATTGTCTGTGAGGAACCTCTCTCCAGATGCGCTTGCCTTAGCCAGAAGACAAGCTTCTGATCTTGTTGCAAAAGGACAGGGTGAACATGCAGACACTATACATCAGAAGTATGAAGCATTGCGTGTGAAAA
TAGAGAGGCTTGTGAAAGAAATCAGAAAAGTTCAAGAAGACTGTTCTGAACTTGAGGCATCGATTGAATCAGAAAATGAACGGAAAGCTAAGGATCGAGTGCTGGCCATTTTTACAAAACATCTGCAGCCTTCTAACTATCCTAGGAAGGATGAGGATGCTCTTGCTAGGGATTCAGGTCATAACAAACAGGATGAAACC
AAGGAGCATGATGCTAGTTCTTCAGACTACGTTGACAAGAAGGTTAAGGTATTAACCGTTCTGTATCTTGCTGCAGCTGCTTTATACAGCGAGATCAAAGACAAGATATTTAATATCTGCAATTCTTTGACAGAGAGAACTGCAGTAGGTCCAGGAGAAGATATAGGGTGCCAAAATTGGAAATGGTGTTTACCTGATTT
GGAGGAGCAAGTTGCAAGATGTACACTTATTTCGGGAATTGTGAATGAAGTTCAGCAAATGAGTGGACAAAATTTGATCCAACGTGGATCGGGCTGGTGGGATACAATGGGTTCTGTTGATGATGATTGGACTTTGAGCTTTCAGGGTTGTTTGACTGCAATTCGTAGACTAGTGGGTCAGCTGGTTGGACGTGCAATTC
CAGAATCAATAAGATCAGTTCTTTCCCACAACCCTGCAATTATGGAGGCATTTGGTTCACTTTCACAAATACGAGGAGCTGTTGATACAGCACTGGAACAGTTGGCTGAAATTGAAATGCAAAGGGCTTCTTTATTAGAACTTGAGAGGACCTACTATGAAAATGTTGAGGAGATCACTGAACGGAAAGTGTCGCTGGAA
ACGGCTATTGAAAAGGGTAGGGATCACCTTTCTTGGGAAGAAGCAGAAGAGCTTGCAAGTCAAGTGGAAGCCTGTCGAGCCCAGTTGGATAAACTGAAGAATGCATGGGACCGCCGAGATGCTCAAGCTTCTGCACTTGTGAGGAAAGAGGCAAGTGCACGAGGTGCTTTAGTGGCAGCAGAACAACGCTTTGAGTCTCT
TGTTACCATTGAGCGAGAAGGAGACATGCATCCTACAAGGGGAAAAGTTTTACTTGCAACATTTGCTAGGCCATTCTCTGAACTGGAATCCTACAATCAGAAGTTGCCTTCTTTTGGGTATGAACCCTCCTTGAGAAAGAGTTCAGTGGATCAGACAGAGATTGTCACTTCTGGCTTTTCTGGGTTCGAGTCAGTCTGGA
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GATCCTGTTCTCCTTGAGTGCCTTGAGAAAGAGGGAGACTCATTGAAGCACATTTTGGTGGATCAAAGGGAGTTGGAATCAAATCTAGCAAAGAAAGAGCTTGATGCGGTAAAGCGGGCTCAGGGTCTGCTTGTTGAATATAGTAATGCACATGAAACTGCACGAGCTGCTAAAGCAGCAGCTTGTGCAATGAAGATGCA
AGTGGGAGAGCTCACACAGGATCTTCAGAAGGCAAACCTTGAGGCTGCCCAATTAGAGTGGCTTCATGATTATATACTTTCTCATTTAGATCAAAATACTATCCTCCAACAGAGCTGTGCAAATGAAGACAATTTTCCATCAAGCTCTATAAAGCTTAACAGAAGAAATTTATTAGAAAACCTTCGATCTGCAATGTCCG
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GGATCTCACCTCCTGATAGTTTTTATACTAATGATTCTGAGTCAGACAATACTTCCCCAGACTCACAACATCAAGATGACTCTTTGACCATCTCCAATGACTGGGAATCTCATATAAATGGAACTGACAAGGCTAAGTTTAGTGAGGGAGTGGTATCAGATGCTTCAAGGTTTACAGTGAATGAGGATACTGGATATACT
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CAGTCAGAATGCTACACACATGAACTTGTCAGACATGGGACTTGGATCTATGAATGTTTTTGAAAGACATCAGACAGGAGGAGAGATACAAATGAGGATGAAGGAAAAAGAACCTCATATATCTCGAGCTAAAGGAAGGGTTGAAAGTTATAGTGACCTATGCACACTATTTTCTTCTATGAACACGGAACAAAGAAGTC
ATGGTTTTAGGGGGAAAAATGCTTATGCAGTCTCGGTGCTGAAACGAGTTGAAGCAAAGCTGGATGGCCGAGACATTGATGGGAAAAGACAATTTTCTGTTTCAGAACAAGTGGATCATCTTCTTCGTCAGGCTACAAGCATTGATAATTTATGTAATATGTATGAAGGTTGGACACCTTGGATATGATGCCCTACAAAT
AGCCTCTTCAAGTTCCTGCTACTTCTCCTGGAAAGGCAGTGTTATTTTTGAGCTGGCTGGTATTCCCATTGTGTCACTTGTCAGTGATCTCAATCATCGCAGAACAGTTTAGGGTCCACCTTTTGTCTATCTTGGGTTAGACTCGTCACAAATCATTAGGATAGAAGAAATCCATTTTGGTCAATGGTGAGAATAGAAGA
ATGCTAAGGAAAATTCATCCATCATGGAAGTTGAGGCTTGAAGAATTGTTACAATCCTCTACTTTCTTTAAGCAAGATTCTGTTAAGGAAACACACAGAGACACCTTGAATTAGGATGTGATTTTACTCACAAAGGTCAGATCAGAGCACCTCCATTGTCAATATTTTAATGGAACTGCATTGTCAGGTGCAAACTTGAG
CTAGAAAAAAATGTGGACTTGTTTGATTGAGAGATAACAAACTGTCAACAACCATCCCGCCAGAGAAATGCTTTAATACTAGGTCACTTGCGCTTTGTAGTGGAAGTGCAGGATAAGTCACAAAACCGTGCTTTGCCATTGCTTGGGCAGGGCACTGTCCAGTCCATGTAGAGGTGCTGCTGGCAGTATATTGCAgtatt
tgtctagttgaacctactactttgatctgagagcaaatgaacactcttactaaaattgctgttattcttctttgtaatggtgtcaaaaagGTGATCACGAAGAATCTGTTTTAGAGCATTCAGCAAAGTATTGCAAAGTGAATAGTGGAGAATTGGTGAAAGGAAATGCAAAAGAGCATTCAATGCAGGTTTGAATTGCT
TGTTATTTTTATTATAGATATAGATATCCTTCCTGATACGAAGACTAAAATAAAATGCAGTCTCATTTTTCCTTGGAGGGACAAAAGGTGTAAATTGTAATTAATATTGGGCAA

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>TRINITY_DN131445_c6_g1_i19 from sample A1 / Example spliced isoform

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GCAGGAGATAATCCCTCAGCTATTTGCTCGGTTGAGCACTCATCCTGAACATCAGGTTCGTAAACGGTTGGAGGGGTTGTTGATTACATTGGCAAAGTTATCTCCATGGGCTATAGTCTATCCTACACTTGTTGATATCAGTGCTTATGAAGGCGAGCCATCAGAGGAGCTTCAACGCATCTTAGACTGTCTGGTTAAAG
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TCACTATTCTTGCAACAAAGACAAAGCCAAAGAAGCTAGTTCTATTGGGTTCAGATGGTCAAAGGTATACTTATCTTCTCAAGGGCCGGGAAGATTTGCGACTTGATGCAAGAATAATGCAGCTTTTGCAAGCTGTGAATGGAATGCTACATGCAAGCACAAGTACACAGGGTCGTTCGCTAGCAGTTCGCTACTATTCT
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TGGGGCACATTCTAGGTCTGGGTGATAGACATTTGGATAATATTCTTATGGACTTCAACACTGGTGATGTTGTCCATATAGATTATAATGTGTGCTTTGACAAGGGACTGAGATTGAAGATTCCGGAGATAGTACCATTTCGTCTTACTCAGATTATGCAAGCAGCATTAGGACTCATGGGAATAGAAGGCACATTCAGA
GCAAACTGTGAATCTGTAATTGACATTTTACGGAAAAACAAAGACATAATCTTGATGCTTTTAGAAGTATTTGTATGGGATCCATTGATTGAGTGGATGCGTGGAGATGGCCACGATGAAGCAACCATTGGTGGAGAGGAACGGAAAGGTATGGAGTTGGCAGTCAGTTTAAGCCTATTTGCTTCTCGAGTTCAAGAAAT
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ATCTATGAATGTTTTTGAAAGACATCAGACAGGAGGAGAGATACAAATGAGGATGAAGGAAAAAGAACCTCATATATCTCGAGCTAAAGGAAGGGTTGAAAGTTATAGTGACCTATGCACACTATTTTCTTCTATGAACACGGAACAAAGAAGTCATGGTTTTAGGGGGAAAAATGCTTATGCAGTCTCGGTGCTGAAAC
GAGTTGAAGCAAAGCTGGATGGCCGAGACATTGATGGGAAAAGACAATTTTCTGTTTCAGAACAAGTGGATCATCTTCTTCGTCAGGCTACAAGCATTGATAATTTATGTAATATGTATGAAGGTTGGACACCTTGGATATGATGCCCTACAAATAGCCTCTTCAAGTTCCTGCTACTTCTCCTGGAAAGGCAGTGTTAT
TTTTGAGCTGGCTGGTATTCCCATTGTGTCACTTGTCAGTGATCTCAATCATCGCAGAACAGTTTAGGGTCCACCTTTTGTCTATCTTGGGTTAGACTCGTCACAAATCATTAGGATAGAAGAAATCCATTTTGGTCAATGGTGAGAATAGAAGAATGCTAAGGAAAATTCATCCATCATGGAAGTTGAGGCTTGAAGAA
TTGTTACAATCCTCTACTTTCTTTAAGCAAGATTCTGTTAAGGAAACACACAGAGACACCTTGAATTAGGATGTGATTTTACTCACAAAGGTCAGATCAGAGCACCTCCATTGTCAATATTTTAATGGAACTGCATTGTCAGGTGCAAACTTGAGCTAGAAAAAAATGTGGACTTGTTTGATTGAGAGATAACAAACTGT
CAACAACCATCCCGCCAGAGAAATGCTTTAATACTAGGTCACTTGCGCTTTGTAGTGGAAGTGCAGGATAAGTCACAAAACCGTGCTTTGCCATTGCTTGGGCAGGGCACTGTCCAGTCCATGTAGAGGTGCTGCTGGCAGTATATTGCAGTGAGTCCAATTTCACAGCTTAACATACCCAAGTGACTTATATCAGAATT
TTGGTGATCACGAAGAATCTGTTTTAGAGCATTCAGCAAAGTATTGCAAAGTGAATAGTGGAGAATTGGTGAAAGGAAATGCAAAAGAGCATTCAATGCAGGTAGTATGGTGAAATGGTAGCATCAGACTATTCTCAGTATTGGGATGCGATTGAGTTTTGCCAGTACTTCGAAAACAAATGCTATAAATCAAACTGCAT
GAAATTATATCTTGAAGCAATGGTAATGAAAATAATGGTTGAATTGAGAGGGTTCCTGTAGAAGAAGATCTTGATCACTAGGTACTTCAACGACAGATTATTTTAGCATGGCAGTTTGTTATTTTGGAGAATTTTCTTGTGGCAGTGAATTATTTATCATTGCAGCAGGTAGGTATGGTGAAATGATAGCCAGATCAAAA
TCAAATGATATATGTTAAACTGTGTGAGACTCTATATCGAAGTAAAAGTTTTGAAAAATATGTTTGAGTTGAGAGGGTTACCTGTGAAAAGAAGTACTTCGTTACTGGGTACTTCAGCAATAGATAATATTAGCATGGTGATCAGTAGACAATCGTTTAGGAAAGAGGAGGGTATAGGTAGATCTTCCCTGTATTTATAC
CCTCTTATCAAGGGTTATTCTTCATTTATATGATTGATTAAATTTCTTTTCACTGGTTCTTCTTAGGCTCTTTCTATATGAGATCTGTTCACGTGTTTTATGTTTCTAGTTTTGCAAATAGATTATGTTTATTTTTATTCAGCATCTTAAAATACACATAATTGCTTTTCATTGTAACTACTATATTTGAAATGAGTTGT
GTTGCTTAGTAAAGAAAGCGGGTTTGGGGA

>TRINITY_DN131445_c6_g1_i13 from sample A1 / Example unspliced isoform:

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CGCTCATCGCGTTCTGTGTTCCTCCCTGCATTCAATTGCTCAATTTCTCCAGGAGCAGGACAGTCGCAGAGCCAGAACAATTCAGTCCATTTTTTAAAATCTACCAGAGATCTGAGTAGCAATGGAGTCCCAGAAAGAGGACGATTTTGAACGGGAAAAGGAGGACTGTGAACTGGAAAGAGAATTCGAATTGGAAGCTG
CTATGTACAGTAGTAGTAATTCAATGCTGTCAGGTTTAGATGGCTCTGCTCTAGGTCAACAGGGAGGACCCTCCAGGTCTGGACTCTTCAGGCATTCTAACCCTAGAATGGGAGAGACACTCCTCCATATCCTTCTCTGTGCCATTCGAGGTCCTGTGCAGTCTGCCAAGGATTTTTCTGGCATTTGGCCCATTCTTGAT
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GTATGCATCACCTGTTCTCAGAGCATGCCAGGAAATTTTGGAAGATGAGAGAACCTCCTTGACTCTCCTTCGATCACTTCTGAACCTTCTGACAGTTCTTTCAGTGAAATTTACACGATGTTTCCAGTCTCATTTTGCAGATATCGTAGATTTGTTGCTTGGTTGGGCTCTTGTACCTGATCTTTCTGACACTGATAGAT
GCATAATTACAGACACATTCCTGAAGTTTCAGAAGCTCTGGGTGGGTAACTTGCAGTTCTCGCTAAACTTGTTAACCAAATTTTTAGGAGACATGGAAGTTTTAGCTCAGGATGCAACTCCTGGAACACTGCAACAATTACGACGATTGCTTGTGCTTGTTTCCTGCTTTGTCACAGTTTTACAAGCCACAGCAACTGGT
GTGCTAGAAATGAACCTGCTTGAACACATTATTGAGCCGCTCCAGGAAATGCTTCAACGATTGCTTACATGCTTGTTAATGGTCACTAAAAAGTTTGGTAATACCAAATGGCTGAAGGAATCCTCAAGATGCTTGATTATGTTTGCCGATCTATTGAAAGAACGCTTTGCTAACTTCTATCCTGCTGCAATGGACATATT
ATTCCGATGCTTAGAAACAAAGAATGCAGTTGTTTTGGGTGCTGATGCACTTTCATCTAAGCAAATTCAGGCAGTGCTAAAGACCAATCTGCAGTTAATGTCTGCACAAAGACTTGCCCTTCCAGCATCAGCAGTTCAGAACATCCTTAAGATGGATTCATTTTTTGCATATTTACGCTTACACCCAAATCATCTTGTGA
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GTTCTTTCAGAAGTTGAAGTTGTAGCCTTGGCAAGATTTGATCTGATGGTCTTAGCCAATTCTTTCTTGGATACCGGAAAAACAATCTCAGATGCAATAAATGTAGTCAACTGTAGGCTTGAAAGAGCAAAAGAACTAAGCAATTTTATCATAGAAAAATTGAATCCTTTCAAGAAACCTTTCATATGGTACTTGGAGCT
GCAGTTTGCTCTAATTCAGGCTCTACATAGGATTTGTATTGTTCTTGTTTTTGGAAAACATATGGTTGGAGAGAGACTTCCTGAAACGAGTGTTGTATTCTCGGGGTCTAATGAAAAATTTCAGACTTTAGCACAGTCAAGCAAGGAAACAAGCATGGCAGTATCCAAGAATTTAAATGTCTATGGGTTATATATTGCTA
AAGCTCTGCATATTTCGGCCAGTCTTTCTGTAAAATTGGAAGCCTTGGACTGGGTTGGTAGCCTTTGTAGGGGCATGATGACCACGAGTAATGACGATACTTTTCAATTTTATTGTTACCAGGGTTGCGAAGATTTCCGGGCATGTTGGCATACATGTTTAAGCAAGAATATATTGTTCCCAGTTTTATGTGCAGCATCA
GATAGAGACTTGAAAGTCAGGTTCCGGGTTGCATCAGTTCTTCAGCTCCTTTTACAAGCAAAGCTCATATATCCAGTATACTTTGACGCCGTTGCAAATGTGGCTCTTGAAAAACTTGGAGATCCTGATTCCTCACTTCAAAGTGCATTTAGGAAAGTTCTTTCACTGGTTGTCCCCGCTGCATTGTATTTGGGAGGTTG
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TTCTTAGCTATCATGGAAATTTAAAGAGTTGGCTTCCAAAACCACACAAAGATCGATTAAACTCAGAAGCAGGTAGCCTGTGGTTGGACCTTAATGTTGACTGTGAAACGCTTGAGAGAGTCTTTTCCACCAACAATCTTGCTGCTGCTTGGTGGTCTATACATGAAGCAGCTCGTCACTGCATCACTGTTCGGCTTCGC
ACTCATCTTGGTGGACCCACCCAAACATTTGCTGCTTTAGAGCGAATGCTGTTAGATATAGTGCAATTATTACAATTGGATTCTGGGCAACGTGAATCAAGTAGTGGCACAAGCTCTTCAGGTGTCCATTTATTGCCGATGAGACTTTTATTAGAATTTGTGGAGTCTTTGAAGAAACAAATTTATAATGCATACGAAGG
TTCTGCTGTATTACCAGCTGCACCCACTCAAAGTGCTCTATTCTTTCGTGCAAATAAAAAGGTGTGTGAAGAGTGGTTTGCTCGTATTTGCGAGGCGCTGATGAATGCTAGCTTAGCAATCCAATGCAATGCAGGTACATTCCATCATGCTGCAACACGTTTGCAAGACCTTAGAAATGCAGCAGCACCAACATTAAGGG
ATATGGCTAGAAGTCAAACAGCGGATAATTCACAGGGCTTGAGAGCAAAATTGATAAATGATGTGCTCCGAATCTTACGCCACGCATCACTAGCCTTGTCCAGACTTCATGAGTCAGATGCCATTGTTGGTCTCCAGATATGGGCAACATCGACCTTTGTTACACCTCTTCTAGATGACAGTTTGCTAGGACTGAAAGCT
TTGGGAGGATTTGGACTATTTGGATGGATGACAGGTCTTGTATATCAAGCTCGTGGGCAATATGAAAAAGCCACGGCCCACTTTACACACATGCTTCAGTCTGAGGAAAATCTTTCTTTGATGGGTGCTGATGGAGTACAATTTGTCATTGCACGTATAATTGAAAGCTATGTAGCTCTAACAGATTGGGAATCTCTAGA
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TGTCTGTTTCTGCATCTGGCAATATGTTGAAGGCGAAGGCATGTGTGAAACTGTCATTTTGGTTGAAAGAAAAGTATTCTGAAATACATTGGCCAAACTTACTCCCAAAAATGAGTTTAGATAACCCTAAGTTCAGATCAAGTGATATTGCTGCTAATTTGGACGAGGGAGCCACTTCAAGGGAAACTGGCTGGATGTCA
GCTGGCAGCTACAACTTGATAGTTGAGGAGGTGGTTGGTGCTTCCATTAAAGCAGCAACACTTCTGTGTCCAAATATGTCTAAGGCATGGCTGTCATATGCCTCTTGGTGTTACCATCAAGCCAGAGCATCACTTTCAGGTGATGGTGCAGCTTTAAGGTCATGCAATTTGTCACCGATTCTGATTCAGGAAGTTTCTTC
TGATGGGACAGGTTTACTTGAAGAAGAGGTAATGCGAGTGCGAGCCATTATCATGAGAACACTCTTAAATAATGAAAAAGCGGATCCAGGAAGTGAGGAAATATTACTGTGGCCGGACACTGAAGTGTACATGAACAGTGAAAATATTAACTTTGTAGAACTATTGGTCCAACGTACTGTATATATGATGCAGTCAGCAG
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TTACAGTATCTTTCACTATCAAATAGGACACATCTTGAACAAGGTCCTTGGAAAAGCTATAATTTAGATGTTTTAAAACATGGGAGGGAAGACTGCACACTCAGAGCAACTTTATACATATTAAATATCCTTCTAAATTATGGAGTAGAATTAGGAGAGACACTTAAAAATGGTCTTATGACAGGGCCACCTCTACCATG
GCAGGAGATAATCCCTCAGCTATTTGCTCGGTTGAGCACTCATCCTGAACATCAGGTTCGTAAACGGTTGGAGGGGTTGTTGATTACATTGGCAAAGTTATCTCCATGGGCTATAGTCTATCCTACACTTGTTGATATCAGTGCTTATGAAGGCGAGCCATCAGAGGAGCTTCAACGCATCTTAGACTGTCTGGTTAAAG
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TCACTATTCTTGCAACAAAGACAAAGCCAAAGAAGCTAGTTCTATTGGGTTCAGATGGTCAAAGGTATACTTATCTTCTCAAGGGCCGGGAAGATTTGCGACTTGATGCAAGAATAATGCAGCTTTTGCAAGCTGTGAATGGAATGCTACATGCAAGCACAAGTACACAGGGTCGTTCGCTAGCAGTTCGCTACTATTCT
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TGGGGCACATTCTAGGTCTGGGTGATAGACATTTGGATAATATTCTTATGGACTTCAACACTGGTGATGTTGTCCATATAGATTATAATGTGTGCTTTGACAAGGGACTGAGATTGAAGATTCCGGAGATAGTACCATTTCGTCTTACTCAGATTATGCAAGCAGCATTAGGACTCATGGGAATAGAAGGCACATTCAGA
GCAAACTGTGAATCTGTAATTGACATTTTACGGAAAAACAAAGACATAATCTTGATGCTTTTAGAAGTATTTGTATGGGATCCATTGATTGAGTGGATGCGTGGAGATGGCCACGATGAAGCAACCATTGGTGGAGAGGAACGGAAAGGTATGGAGTTGGCAGTCAGTTTAAGCCTATTTGCTTCTCGAGTTCAAGAAAT
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AGGCATTTGGTTCACTTTCACAAATACGAGGAGCTGTTGATACAGCACTGGAACAGTTGGCTGAAATTGAAATGCAAAGGGCTTCTTTATTAGAACTTGAGAGGACCTACTATGAAAATGTTGAGGAGATCACTGAACGGAAAGTGTCGCTGGAAACGGCTATTGAAAAGGGTAGGGATCACCTTTCTTGGGAAGAAGCA
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Intron 8 GTATTCTTCA ... CACCCTTTAG

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>TRINITY_DN131445_c6_g1_i25 from sample A1 / Example spliced isoform

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GCAGTTTGCTCTAATTCAGGCTCTACATAGGATTTGTATTGTTCTTGTTTTTGGAAAACATATGGTTGGAGAGAGACTTCCTGAAACGAGTGTTGTATTCTCGGGGTCTAATGAAAAATTTCAGACTTTAGCACAGTCAAGCAAGGAAACAAGCATGGCAGTATCCAAGAATTTAAATGTCTATGGGTTATATATTGCTA
AAGCTCTGCATATTTCGGCCAGTCTTTCTGTAAAATTGGAAGCCTTGGACTGGGTTGGTAGCCTTTGTAGGGGCATGATGACCACGAGTAATGACGATACTTTTCAATTTTATTGTTACCAGGGTTGCGAAGATTTCCGGGCATGTTGGCATACATGTTTAAGCAAGAATATATTGTTCCCAGTTTTATGTGCAGCATCA
GATAGAGACTTGAAAGTCAGGTTCCGGGTTGCATCAGTTCTTCAGCTCCTTTTACAAGCAAAGCTCATATATCCAGTATACTTTGACGCCGTTGCAAATGTGGCTCTTGAAAAACTTGGAGATCCTGATTCCTCACTTCAAAGTGCATTTAGGAAAGTTCTTTCACTGGTTGTCCCCGCTGCATTGTATTTGGGAGGTTG
CATTGAAAATGATGATAACTATGCATACAAGCACATTATGTCTTATGTTAAGGCAGGGAGCAGAAAGTATTCACACTGGAAGCAAGTGTTTACAATCAAGCACTTGTCACAATCATCACGGTCACAGCAGCTTGTCTATATTTTGAACTACATTTCCCAACGGTCACAGGTTGTTCCCTCTTGTTGGTTCCAGCGTCTTG
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TTCTGCTGTATTACCAGCTGCACCCACTCAAAGTGCTCTATTCTTTCGTGCAAATAAAAAGGTGTGTGAAGAGTGGTTTGCTCGTATTTGCGAGGCGCTGATGAATGCTAGCTTAGCAATCCAATGCAATGCAGGTACATTCCATCATGCTGCAACACGTTTGCAAGACCTTAGAAATGCAGCAGCACCAACATTAAGGG
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TTGGGAGGATTTGGACTATTTGGATGGATGACAGGTCTTGTATATCAAGCTCGTGGGCAATATGAAAAAGCCACGGCCCACTTTACACACATGCTTCAGTCTGAGGAAAATCTTTCTTTGATGGGTGCTGATGGAGTACAATTTGTCATTGCACGTATAATTGAAAGCTATGTAGCTCTAACAGATTGGGAATCTCTAGA
CCACTGGCTTCAGGAACTGCAGTTGATTCGAGCCAAGCATGCAGGGAAGTCCTATGCTGGAGCATTAACAACTGCTGGCAACGAAATGAATGCTATTCATGCTCTAGCTCGCTTTGATGTAGGTGATGTGCAAGGTGCATGGGGATACTTGGACTTGACTCCACAGAGCAGCAGTGAACTTACAGTAGATCCTAGGCAGG
CTCTTCACAGAAGTGAGCAAATGCTTTTGCAGGCAATGCTTCGTACTGATTCCCAAGAAAAAGAGATTAAACTGGAAACAGAGAAGGCAAAGGTGATGTTAGAAGAGGCTTTGCTAGTATCTTCAATTGATGGTTTGCCTGAGGCAGCAGCATATGCAACCCAGTTTCACTGTATTTATGCCTTTGAACAAGGACGCAGA
CTTAATGCTGGCCATGATGAATCTGGGGAGTTTGCATCAATACTTAGTTCCCTGCAGAATGCAGTCCAAGTGCCGATGAATCCATTACAACAAGATTGTCTTCTGTGGTTGAAACTCTTACGCGTCTACCATGTTGTGCTACCAGAGTCAAAGTCAACTTTGCAGCTTTGCCAACAAGTCATAAAACTAGCTCGCAAACA
AACCAATTTCCAACTGGCTCATCGTCTGCACCAAGAATTGTTGAGTGGTATTTCAAGACGTCACAAAGATGACTTTTCTGAATGGCTTGTTGCAAGCTTACAGTATGAGAGTATTCTGCTTCTTTTTGCAGAGGGAAAATGTGAGGAAGCCATAGTAGAGCTTTGGTCATTGGTACGTTCTTACATACCATTTTCTGCCT
TGTCTGTTTCTGCATCTGGCAATATGTTGAAGGCGAAGGCATGTGTGAAACTGTCATTTTGGTTGAAAGAAAAGTATTCTGAAATACATTGGCCAAACTTACTCCCAAAAATGAGTTTAGATAACCCTAAGTTCAGATCAAGTGATATTGCTGCTAATTTGGACGAGGGAGCCACTTCAAGGGAAACTGGCTGGATGTCA
GCTGGCAGCTACAACTTGATAGTTGAGGAGGTGGTTGGTGCTTCCATTAAAGCAGCAACACTTCTGTGTCCAAATATGTCTAAGGCATGGCTGTCATATGCCTCTTGGTGTTACCATCAAGCCAGAGCATCACTTTCAGGTGATGGTGCAGCTTTAAGGTCATGCAATTTGTCACCGATTCTGATTCAGGAAGTTTCTTC
TGATGGGACAGGTTTACTTGAAGAAGAGGTAATGCGAGTGCGAGCCATTATCATGAGAACACTCTTAAATAATGAAAAAGCGGATCCAGGAAGTGAGGAAATATTACTGTGGCCGGACACTGAAGTGTACATGAACAGTGAAAATATTAACTTTGTAGAACTATTGGTCCAACGTACTGTATATATGATGCAGTCAGCAG
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TTACAGTATCTTTCACTATCAAATAGGACACATCTTGAACAAGGTCCTTGGAAAAGCTATAATTTAGATGTTTTAAAACATGGGAGGGAAGACTGCACACTCAGAGCAACTTTATACATATTAAATATCCTTCTAAATTATGGAGTAGAATTAGGAGAGACACTTAAAAATGGTCTTATGACAGGGCCACCTCTACCATG
GCAGGAGATAATCCCTCAGCTATTTGCTCGGTTGAGCACTCATCCTGAACATCAGGTTCGTAAACGGTTGGAGGGGTTGTTGATTACATTGGCAAAGTTATCTCCATGGGCTATAGTCTATCCTACACTTGTTGATATCAGTGCTTATGAAGGCGAGCCATCAGAGGAGCTTCAACGCATCTTAGACTGTCTGGTTAAAG
TTCATCCAAAACTGGTTCAGGACGTGCAATTAATGATATTGGAACTTGGGAATATTACTGTTCTTTGGGAGGAGCAGTGGCTTAGCACACTACAAGATCTTCATGCAGATGTTATGAGACGGATAGCTACACTGAAAGAAGAGGTTTCCAGGGTGGCAGAGAACATTACACTTACTCACAGTGAGAAGGTTAAAATAAAT
GCTGCCAAGTATTCTGCAATGATGGCACCAATTGCTGTAGCTTTGGAACGGCGTCTAGTTTCCACATCTCGGATGCCGGAAACTGCCCATGAGGCTTGGTTCCAGAAGGAATATGGTGAGCAACTGAAAGCTGCTATAACAAATTTCAAGACCCCTCCTTCAACTGTTGCTTCCCTTGCAGAAATGTGGCGACCTTTTGA
TATAATTGCTGCATCTTTGGCGAACCATCAGAAGAAATCATCAGTCTACCTGAGTGAGGTTGCTCCACGACTTGCACAGCTGGCTTCTTCTGATGCTCCAATGCCTGGTCTTGAGAAACAGATATCAATGTCCGAATCTGAAGGAATTCCTGGCAGCGATCTTCTGGGCCTGGTTACAATTTCTTCTTTTAGTGAACAGG
TCACTATTCTTGCAACAAAGACAAAGCCAAAGAAGCTAGTTCTATTGGGTTCAGATGGTCAAAGGTATACTTATCTTCTCAAGGGCCGGGAAGATTTGCGACTTGATGCAAGAATAATGCAGCTTTTGCAAGCTGTGAATGGAATGCTACATGCAAGCACAAGTACACAGGGTCGTTCGCTAGCAGTTCGCTACTATTCT
GTAACTCCTATAAGTGGGCGAGCAGGCTTGATCCAATGGGTGGACAATCTTATAAGCATGTATAGTGTATTCAAAGCTTGGCAGCAGCGTGCACAGTATGCTCAGTTTACATCTACTACTAGTGGTACTGCAGCTGCAAACACTCCCATCCCACCTGTTCCACGTCCCAGTGATATGTTCTATGGGAAGATTATTCCAGC
ACTAAAAGAAAAAGGTTTGCGTAAAGTCATTTCACGACGGGATTGGCCACAAGAAGTAAAAAGAAAGGTTCTGTTGGACCTTATGAAAGAGACTCCTCGTCAACTACTTTATCGAGAAATTTGGTGTGCAAGTGAAGGATTCCAAACCTTTAACTCAAAACTACAGAGGTTTTCAGGCAGTGTAGCAGTCATGAGCATGG
TGGGGCACATTCTAGGTCTGGGTGATAGACATTTGGATAATATTCTTATGGACTTCAACACTGGTGATGTTGTCCATATAGATTATAATGTGTGCTTTGACAAGGGACTGAGATTGAAGATTCCGGAGATAGTACCATTTCGTCTTACTCAGATTATGCAAGCAGCATTAGGACTCATGGGAATAGAAGGCACATTCAGA
GCAAACTGTGAATCTGTAATTGACATTTTACGGAAAAACAAAGACATAATCTTGATGCTTTTAGAAGTATTTGTATGGGATCCATTGATTGAGTGGATGCGTGGAGATGGCCACGATGAAGCAACCATTGGTGGAGAGGAACGGAAAGGTATGGAGTTGGCAGTCAGTTTAAGCCTATTTGCTTCTCGAGTTCAAGAAAT
ACGAGTACCACTTCAGGAGCATCACGATCTGCTGTTAGTAACTCTTCCTGCAGCATCATCTGCACTTCAGAGTTTGGCGGATTTGCTTGATCGGTATGATAGAATATCCACTGCATTTGTCCATGCTGAGCAAGAAAAATCCAAATCTGCTATTGCAGAGGCATCTGCAAAGTCTATTGTTACAGAGGCAGCAAACAATC
TTGAAAATGTTCAGATGGCTTATGAAGTACAAGCTCGTGAATTTGCACAGGCCAAGGCACTTGCCACTGAAGCTGCCCAGAAAGCTTCTATGTGGGTTGAACAACATAGCAGAGTTCTAGATGCATTACGCAGTGGTTCAGCTCCAGAGCTTCAGGCTATTGGGCAACTTCCTCATACAACTGAGGCTTTGTCTCTAACA
TCTGCTGTGTTGGCCTCAGGAGTTCCCCTTACCATTGTTCCGGAGCCTACTCTAGCACATTGCCGAGATGTTGATAGGGAAGTTGCACACCTTATAAAAGAACGTCATGAAGCTATTTTGCATGCAGCCAAAGCACTACAGACTTACTCTGTGGCTTTGCAACGGCTTCTTCCAGGAAATTACATCGGTACCAGTCAGGT
GCATAATTGGGCACAGGTTTTGCAATTGTCTGTGAGGAACCTCTCTCCAGATGCGCTTGCCTTAGCCAGAAGACAAGCTTCTGATCTTGTTGCAAAAGGACAGGGTGAACATGCAGACACTATACATCAGAAGTATGAAGCATTGCGTGTGAAAATAGAGAGGCTTGTGAAAGAAATCAGAAAAGTTCAAGAAGACTGTT
CTGAACTTGAGGCATCGATTGAATCAGAAAATGAACGGAAAGCTAAGGATCGAGTGCTGGCCATTTTTACAAAACATCTGCAGCCTTCTAACTATCCTAGGAAGGATGAGGATGCTCTTGCTAGGGATTCAGGTCATAACAAACAGGATGAAACCAAGGAGCATGATGCTAGTTCTTCAGACTACGTTGACAAGAAGGTT
AAGGTATTAACCGTTCTGTATCTTGCTGCAGCTGCTTTATACAGCGAGATCAAAGACAAGATATTTAATATCTGCAATTCTTTGACAGAGAGAACTGCAGTAGGTCCAGGAGAAGATATAGGGTGCCAAAATTGGAAATGGTGTTTACCTGATTTGGAGGAGCAAGTTGCAAGATGTACACTTATTTCGGGAATTGTGAA
TGAAGTTCAGCAAATGAGTGGACAAAATTTGATCCAACGTGGATCGGGCTGGTGGGATACAATGGGTTCTGTTGATGATGATTGGACTTTGAGCTTTCAGGGTTGTTTGACTGCAATTCGTAGACTAGTGGGTCAGCTGGTTGGACGTGCAATTCCAGAATCAATAAGATCAGTTCTTTCCCACAACCCTGCAATTATGG
AGGCATTTGGTTCACTTTCACAAATACGAGGAGCTGTTGATACAGCACTGGAACAGTTGGCTGAAATTGAAATGCAAAGGGCTTCTTTATTAGAACTTGAGAGGACCTACTATGAAAATGTTGAGGAGATCACTGAACGGAAAGTGTCGCTGGAAACGGCTATTGAAAAGGGTAGGGATCACCTTTCTTGGGAAGAAGCA
GAAGAGCTTGCAAGTCAAGTGGAAGCCTGTCGAGCCCAGTTGGATAAACTGAAGAATGCATGGGACCGCCGAGATGCTCAAGCTTCTGCACTTGTGAGGAAAGAGGCAAGTGCACGAGGTGCTTTAGTGGCAGCAGAACAACGCTTTGAGTCTCTTGTTACCATTGAGCGAGAAGGAGACATGCATCCTACAAGGGGAAA
AGTTTTACTTGCAACATTTGCTAGGCCATTCTCTGAACTGGAATCCTACAATCAGAAGTTGCCTTCTTTTGGGTATGAACCCTCCTTGAGAAAGAGTTCAGTGGATCAGACAGAGATTGTCACTTCTGGCTTTTCTGGGTTCGAGTCAGTCTGGAAGGTCACTAATATTTTAAAGGACCATACATTCTTTGTGTGGAAAG
TTAGTATTATTGATACTTGTCTTGATTCATGTATCCGTAATGTTGCATCAGCTGTAGATCATACCTTAGGTTTTGACCAGACGGTTAGCAGTCAGAAGAGGAAGCTTGAGATCCTAGTTGAGTATTATTTAGATCAGTATCTCAAGGAACGGCTTGATCCTGTTCTCCTTGAGTGCCTTGAGAAAGAGGGAGACTCATTG
AAGCACATTTTGGTGGATCAAAGGGAGTTGGAATCAAATCTAGCAAAGAAAGAGCTTGATGCGGTAAAGCGGGCTCAGGGTCTGCTTGTTGAATATAGTAATGCACATGAAACTGCACGAGCTGCTAAAGCAGCAGCTTGTGCAATGAAGATGCAAGTGGGAGAGCTCACACAGGATCTTCAGAAGGCAAACCTTGAGGC
TGCCCAATTAGAGTGGCTTCATGATTATATACTTTCTCATTTAGATCAAAATACTATCCTCCAACAGAGCTGTGCAAATGAAGACAATTTTCCATCAAGCTCTATAAAGCTTAACAGAAGAAATTTATTAGAAAACCTTCGATCTGCAATGTCTGCTATCACTAGAGCAACAGAAGGTTTACAAAACTGTGAGAGATCTG
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GATTTTGAGGATTCTAGGGATGGTTTCCTAAGGTCTCTTTCAGATGCATCTACTGGTGGAGCTCTAAGTGAAGGCAGAGCTTGGCAGCAAGCATACATGAATATCATTTCAAGATTGGACATTTCTTATCACTCGTTTACTTGTGCAGACCGTGAATGGCATTTAGCACAGAAAAGCATGGAAGCAGCTGGTGCAAGTCT
TTCTACTGCAACTAATGATTTGTGCCTCGTATCTATAAAATTGAAGTCCACGTCAGGTGAACTTCAAGCTACACTTTCAAGCATGAGGGATTGGACAGTTAAAGCAAGTACAGATCTGTCAGCATTTTGCCGTGTGGCAAGGGGAAATTCTGCTCTAACAACTGAGAGTGGATCAATGCTTGAAGAGGTTTTGGCAATAA
CGGAAGGAGCAGAAGGTGCACATGATGTTTATAGATTGGCAAAAGAAGCCACAGCACAACATAGTAATCTAATGTCTGAACTTAACAAAGTTAACATGCTTCTTCTTCCTCTGGAGTCCATGCTGGCTTCTGCATCAAATACAGTAATTGGTATTATTAACAGGGATGGTGAACAGAAATTGGAAATCTCTGTGGGTCAA
GGCCAAGCATTAATCCAATCACTTCATATAAAGCTTGGAGAGGTTTGTCCTGTTTTGACAAGCACAGTTCCAGTTCTCCTGAACACTGTCAAAGAGCTACATATTGCTTTAACCAGACTTGCACGCACTGCAAGCTTTGATGCTGGTGTTCTCCATAAAGCTCTTGAAGGTGTTGGGGAAAGTCAAGAAGCACGGTCTCA
AGAATTAGATTTAGTCAGGACAGAACTTCCAGAAGATGAAGTGTTGTCTGCAGAACAAAATAGAAATATCATGGAAGCAGTTGTTGACAATGATGAACATGGTGGAGAGTCGATAACAGATGAAGAGCTCCTGCTACAAGGTGATGAAGACTCCTGGATCTCACCTCCTGATAGTTTTTATACTAATGATTCTGAGTCAG
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GGGCATATTCAAACAGACATGAAATTTGAAGGTACAGAGGATAGTGAGAATGGGATTATTTCTATGGGAAATAGTCAAATTCATTCTGTCAAGGACACAAGTCAGAGGCCAGAAGGCTCACAGGCATCAATAAGTTCAAATAAGGTCAGTTCTGACAGTCAGAATGCTACACACATGAACTTGTCAGACATGGGACTTGG
ATCTATGAATGTTTTTGAAAGACATCAGACAGGAGGAGAGATACAAATGAGGATGAAGGAAAAAGAACCTCATATATCTCGAGCTAAAGGAAGGGTTGAAAGTTATAGTGACCTATGCACACTATTTTCTTCTATGAACACGGAACAAAGAAGTCATGGTTTTAGGGGGAAAAATGCTTATGCAGTCTCGGTGCTGAAAC
GAGTTGAAGCAAAGCTGGATGGCCGAGACATTGATGGGAAAAGACAATTTTCTGTTTCAGAACAAGTGGATCATCTTCTTCGTCAGGCTACAAGCATTGATAATTTATGTAATATGTATGAAGGTTGGACACCTTGGATATGATGCCCTACAAATAGCCTCTTCAAGTTCCTGCTACTTCTCCTGGAAAGGCAGTGTTAT
TTTTGAGCTGGCTGGTATTCCCATTGTGTCACTTGTCAGTGATCTCAATCATCGCAGAACAGTTTAGGGTCCACCTTTTGTCTATCTTGGGTTAGACTCGTCACAAATCATTAGGATAGAAGAAATCCATTTTGGTCAATGGTGAGAATAGAAGAATGCTAAGGAAAATTCATCCATCATGGAAGTTGAGGCTTGAAGAA
TTGTTACAATCCTCTACTTTCTTTAAGCAAGATTCTGTTAAGGAAACACACAGAGACACCTTGAATTAGGATGTGATTTTACTCACAAAGGTCAGATCAGAGCACCTCCATTGTCAATATTTTAATGGAACTGCATTGTCAGGTGCAAACTTGAGCTAGAAAAAAATGTGGACTTGTTTGATTGAGAGATAACAAACTGT
CAACAACCATCCCGCCAGAGAAATGCTTTAATACTAGGTCACTTGCGCTTTGTAGTGGAAGTGCAGGATAAGTCACAAAACCGTGCTTTGCCATTGCTTGGGCAGGGCACTGTCCAGTCCATGTAGAGGTGCTGCTGGCAGTATATTGCAGTGAGTCCAATTTCACAGCTTAACATACCCAAGTGACTTATATCAGAATT
TTGGTATGCAAATCTAGAATCCAGATGTGGTGGTTATGACTGCTAATTTTTATTTCCTAGAGCTTTTGTGATTTTGATTGCAGGTATTTGTCTAGTTGAACCTACTACTTTGATCTGAGAGCAAATGAACACTCTTACTAAAATTGCTGTTATTCTTCTTTGTAATGGTGTCAAAAAGGTGATCACGAAGAATCTGTTTT
AGAGCATTCAGCAAAGTATTGCAAAGTGAATAGTGGAGAATTGGTGAAAGGAAATGCAAAAGAGCATTCAATGCAGCAGGTAGTATGGTGAAATGGTAGCATCAGACTATTCTCAGTATTGGGATGCGATTGAGTTTTGCCAGTACTTCGAAAACAAATGCTATAAATCAAACTGCATGAAATTATATCTTGAAGCAATG
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TGTGAGACTCTATATCGAAGTAAAAGTTTTGAAAAATATGTTTGAGTTGAGAGGGTTACCTGTGAAAAGAAGTACTTCGTTACTGGGTACTTCAGCAATAGATAATATTAGCATGGTGATCAGTAGACAATCGTTTAGGAAAGAGGAGGGTATAGGTAGATCTTCCCTGTATTTATACCCTCTTATCAAGGGTTATTCTT
CATTTATATGATTGATTAAATTTCTTTTCACTGGTTCTTCTTAGGCTCTTTCTATATGAGATCTGTTCACGTGTTTTATGTTTCTAGTTTTGCAAATAGATTATGTTTATTTTTATTCAGCATCTTAAAATACACATAATTGCTTTTCATTGTAACTACTATATTTGAAATGAGTTGTGTTGCTTAGTAAAGAAAGCGGG
TTTGGGGA

>TRINITY_DN131445_c6_g1_i1 from sample A1 / Example unspliced isoform:

GCGTTCTGTGCGATGACATGCTTTTGAGAACGCGAAATTAATGGAGTCGGTGATGAAAGAGCTCGAGGCTCTGAAGGTGGTTCGGAAGGTGGCCAGTCGTTGGGAAGGTGGCCACGGGACCGTGCTCTTGGTCCGAAGGAAAGGCAGCAACAGGCAGGTGCGAATTTCGTTGTTCTGGTACCTTTCATAGGTGTTTTTAA
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GCAGCACAGTCTCGAGATTTTTGCAATATCATGCAAGGGCTTACAAATGAGCTTGATACTCAAGGTGCATTTCCTAGAAGCAATTCCCGAGTTTCATCACTTGCCTCTTGTGCTCCAAGTGCTGATAATAGGGCTGCGGAGATGGCTTTGACAGGACTTCATGAATTTTTTAGTACAGGTGATGCAAATGTCATTGAAGG
GTATGCATCACCTGTTCTCAGAGCATGCCAGGAAATTTTGGAAGATGAGAGAACCTCCTTGACTCTCCTTCGATCACTTCTGAACCTTCTGACAGTTCTTTCAGTGAAATTTACACGATGTTTCCAGTCTCATTTTGCAGATATCGTAGATTTGTTGCTTGGTTGGGCTCTTGTACCTGATCTTTCTGACACTGATAGAT
GCATAATTACAGACACATTCCTGAAGTTTCAGAAGCTCTGGGTGGGTAACTTGCAGTTCTCGCTAAACTTGTTAACCAAATTTTTAGGAGACATGGAAGTTTTAGCTCAGGATGCAACTCCTGGAACACTGCAACAATTACGACGATTGCTTGTGCTTGTTTCCTGCTTTGTCACAGTTTTACAAGCCACAGCAACTGGT
GTGCTAGAAATGAACCTGCTTGAACACATTATTGAGCCGCTCCAGGAAATGCTTCAACGATTGCTTACATGCTTGTTAATGGTCACTAAAAAGTTTGGTAATACCAAATGGCTGAAGGAATCCTCAAGATGCTTGATTATGTTTGCCGATCTATTGAAAGAACGCTTTGCTAACTTCTATCCTGCTGCAATGGACATATT
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CAGGGCTGGCTGCAGCCACTTATCTTTTTCTGCTAAAGCATGCCTCTAATGAAGTTGTGTCTCAAGCCATTCATTCTCTAATGGCAGAACTACAAATACTGAAGAGTCTACTTTTGCAGGCTCATTCTGCAGGAATTCATGTCTCAGAAGAGCTTGACAACAGAAATCATAATCAAGCTGCAGTAGATTCTCTTGGAAGG
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GCAGTTTGCTCTAATTCAGGCTCTACATAGGATTTGTATTGTTCTTGTTTTTGGAAAACATATGGTTGGAGAGAGACTTCCTGAAACGAGTGTTGTATTCTCGGGGTCTAATGAAAAATTTCAGACTTTAGCACAGTCAAGCAAGGAAACAAGCATGGCAGTATCCAAGAATTTAAATGTCTATGGGTTATATATTGCTA
AAGCTCTGCATATTTCGGCCAGTCTTTCTGTAAAATTGGAAGCCTTGGACTGGGTTGGTAGCCTTTGTAGGGGCATGATGACCACGAGTAATGACGATACTTTTCAATTTTATTGTTACCAGGGTTGCGAAGATTTCCGGGCATGTTGGCATACATGTTTAAGCAAGAATATATTGTTCCCAGTTTTATGTGCAGCATCA
GATAGAGACTTGAAAGTCAGGTTCCGGGTTGCATCAGTTCTTCAGCTCCTTTTACAAGCAAAGCTCATATATCCAGTATACTTTGACGCCGTTGCAAATGTGGCTCTTGAAAAACTTGGAGATCCTGATTCCTCACTTCAAAGTGCATTTAGGAAAGTTCTTTCACTGGTTGTCCCCGCTGCATTGTATTTGGGAGGTTG
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TTCTTAGCTATCATGGAAATTTAAAGAGTTGGCTTCCAAAACCACACAAAGATCGATTAAACTCAGAAGCAGGTAGCCTGTGGTTGGACCTTAATGTTGACTGTGAAACGCTTGAGAGAGTCTTTTCCACCAACAATCTTGCTGCTGCTTGGTGGTCTATACATGAAGCAGCTCGTCACTGCATCACTGTTCGGCTTCGC
ACTCATCTTGGTGGACCCACCCAAACATTTGCTGCTTTAGAGCGAATGCTGTTAGATATAGTGCAATTATTACAATTGGATTCTGGGCAACGTGAATCAAGTAGTGGCACAAGCTCTTCAGGTGTCCATTTATTGCCGATGAGACTTTTATTAGAATTTGTGGAGTCTTTGAAGAAACAAATTTATAATGCATACGAAGG
TTCTGCTGTATTACCAGCTGCACCCACTCAAAGTGCTCTATTCTTTCGTGCAAATAAAAAGGTGTGTGAAGAGTGGTTTGCTCGTATTTGCGAGGCGCTGATGAATGCTAGCTTAGCAATCCAATGCAATGCAGGTACATTCCATCATGCTGCAACACGTTTGCAAGACCTTAGAAATGCAGCAGCACCAACATTAAGGG
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CTTAATGCTGGCCATGATGAATCTGGGGAGTTTGCATCAATACTTAGTTCCCTGCAGAATGCAGTCCAAGTGCCGATGAATCCATTACAACAAGATTGTCTTCTGTGGTTGAAACTCTTACGCGTCTACCATGTTGTGCTACCAGAGTCAAAGTCAACTTTGCAGCTTTGCCAACAAGTCATAAAACTAGCTCGCAAACA
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TGTCTGTTTCTGCATCTGGCAATATGTTGAAGGCGAAGGCATGTGTGAAACTGTCATTTTGGTTGAAAGAAAAGTATTCTGAAATACATTGGCCAAACTTACTCCCAAAAATGAGTTTAGATAACCCTAAGTTCAGATCAAGTGATATTGCTGCTAATTTGGACGAGGGAGCCACTTCAAGGGAAACTGGCTGGATGTCA
GCTGGCAGCTACAACTTGATAGTTGAGGAGGTGGTTGGTGCTTCCATTAAAGCAGCAACACTTCTGTGTCCAAATATGTCTAAGGCATGGCTGTCATATGCCTCTTGGTGTTACCATCAAGCCAGAGCATCACTTTCAGGTGATGGTGCAGCTTTAAGGTCATGCAATTTGTCACCGATTCTGATTCAGGAAGTTTCTTC
TGATGGGACAGGTTTACTTGAAGAAGAGGTAATGCGAGTGCGAGCCATTATCATGAGAACACTCTTAAATAATGAAAAAGCGGATCCAGGAAGTGAGGAAATATTACTGTGGCCGGACACTGAAGTGTACATGAACAGTGAAAATATTAACTTTGTAGAACTATTGGTCCAACGTACTGTATATATGATGCAGTCAGCAG
CAGGTGCAGCAGGAGTTGAAAATTCAGATGGTGAAAGTGCTTGTTCGCTTTTGGTTGCTCAACTTCAGCGAGAACTACTGAATATCAAGCACAATATAGATTCCTCTCTTATGACATCTTTGATTAATGAATTGATGGACATCTGGTGGACTTTGAGGAAGAGAAGGGTATCATTATTTGGCCATGCAGCTCGTGGCTTT
TTACAGTATCTTTCACTATCAAATAGGACACATCTTGAACAAGGTCCTTGGAAAAGCTATAATTTAGATGTTTTAAAACATGGGAGGGAAGACTGCACACTCAGAGCAACTTTATACATATTAAATATCCTTCTAAATTATGGAGTAGAATTAGGAGAGACACTTAAAAATGGTCTTATGACAGGGCCACCTCTACCATG
GCAGgtattcttcagtctgtttgatgtatgctttgtcattctcctctataaattattgtgaatgcagtgcctctatgttcatctgatgttttctttatctctttttcaccctttagGAGATAATCCCTCAGCTATTTGCTCGGTTGAGCACTCATCCTGAACATCAGGTTCGTAAACGGTTGGAGGGGTTGTTGATTACA
TTGGCAAAGTTATCTCCATGGGCTATAGTCTATCCTACACTTGTTGATATCAGTGCTTATGAAGGCGAGCCATCAGAGGAGCTTCAACGCATCTTAGACTGTCTGGTTAAAGTTCATCCAAAACTGGTTCAGGACGTGCAATTAATGATATTGGAACTTGGGAATATTACTGTTCTTTGGGAGGAGCAGTGGCTTAGCAC
ACTACAAGATCTTCATGCAGATGTTATGAGACGGATAGCTACACTGAAAGAAGAGGTTTCCAGGGTGGCAGAGAACATTACACTTACTCACAGTGAGAAGGTTAAAATAAATGCTGCCAAGTATTCTGCAATGATGGCACCAATTGCTGTAGCTTTGGAACGGCGTCTAGTTTCCACATCTCGGATGCCGGAAACTGCCC
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TCTGATGCTCCAATGCCTGGTCTTGAGAAACAGATATCAATGTCCGAATCTGAAGGAATTCCTGGCAGCGATCTTCTGGGCCTGGTTACAATTTCTTCTTTTAGTGAACAGGTCACTATTCTTGCAACAAAGACAAAGCCAAAGAAGCTAGTTCTATTGGGTTCAGATGGTCAAAGGTATACTTATCTTCTCAAGGGCCG
GGAAGATTTGCGACTTGATGCAAGAATAATGCAGCTTTTGCAAGCTGTGAATGGAATGCTACATGCAAGCACAAGTACACAGGGTCGTTCGCTAGCAGTTCGCTACTATTCTGTAACTCCTATAAGTGGGCGAGCAGGCTTGATCCAATGGGTGGACAATCTTATAAGCATGTATAGTGTATTCAAAGCTTGGCAGCAGC
GTGCACAGTATGCTCAGTTTACATCTACTACTAGTGGTACTGCAGCTGCAAACACTCCCATCCCACCTGTTCCACGTCCCAGTGATATGTTCTATGGGAAGATTATTCCAGCACTAAAAGAAAAAGGTTTGCGTAAAGTCATTTCACGACGGGATTGGCCACAAGAAGTAAAAAGAAAGGTTCTGTTGGACCTTATGAAA
GAGACTCCTCGTCAACTACTTTATCGAGAAATTTGGTGTGCAAGTGAAGGATTCCAAACCTTTAACTCAAAACTACAGAGGTTTTCAGGCAGTGTAGCAGTCATGAGCATGGTGGGGCACATTCTAGGTCTGGGTGATAGACATTTGGATAATATTCTTATGGACTTCAACACTGGTGATGTTGTCCATATAGATTATAA
TGTGTGCTTTGACAAGGGACTGAGATTGAAGATTCCGGAGATAGTACCATTTCGTCTTACTCAGATTATGCAAGCAGCATTAGGACTCATGGGAATAGAAGGCACATTCAGAGCAAACTGTGAATCTGTAATTGACATTTTACGGAAAAACAAAGACATAATCTTGATGCTTTTAGAAGTATTTGTATGGGATCCATTGA
TTGAGTGGATGCGTGGAGATGGCCACGATGAAGCAACCATTGGTGGAGAGGAACGGAAAGGTATGGAGTTGGCAGTCAGTTTAAGCCTATTTGCTTCTCGAGTTCAAGAAATACGAGTACCACTTCAGGAGCATCACGATCTGCTGTTAGTAACTCTTCCTGCAGCATCATCTGCACTTCAGAGTTTGGCGGATTTGCTT
GATCGGTATGATAGAATATCCACTGCATTTGTCCATGCTGAGCAAGAAAAATCCAAATCTGCTATTGCAGAGGCATCTGCAAAGTCTATTGTTACAGAGGCAGCAAACAATCTTGAAAATGTTCAGATGGCTTATGAAGTACAAGCTCGTGAATTTGCACAGGCCAAGGCACTTGCCACTGAAGCTGCCCAGAAAGCTTC
TATGTGGGTTGAACAACATAGCAGAGTTCTAGATGCATTACGCAGTGGTTCAGCTCCAGAGCTTCAGGCTATTGGGCAACTTCCTCATACAACTGAGGCTTTGTCTCTAACATCTGCTGTGTTGGCCTCAGGAGTTCCCCTTACCATTGTTCCGGAGCCTACTCTAGCACATTGCCGAGATGTTGATAGGGAAGTTGCAC
ACCTTATAAAAGAACGTCATGAAGCTATTTTGCATGCAGCCAAAGCACTACAGACTTACTCTGTGGCTTTGCAACGGCTTCTTCCAGGAAATTACATCGGTACCAGTCAGGTGCATAATTGGGCACAGGTTTTGCAATTGTCTGTGAGGAACCTCTCTCCAGATGCGCTTGCCTTAGCCAGAAGACAAGCTTCTGATCTT
GTTGCAAAAGGACAGGGTGAACATGCAGACACTATACATCAGAAGTATGAAGCATTGCGTGTGAAAATAGAGAGGCTTGTGAAAGAAATCAGAAAAGTTCAAGAAGACTGTTCTGAACTTGAGGCATCGATTGAATCAGAAAATGAACGGAAAGCTAAGGATCGAGTGCTGGCCATTTTTACAAAACATCTGCAGCCTTC
TAACTATCCTAGGAAGGATGAGGATGCTCTTGCTAGGGATTCAGGTCATAACAAACAGGATGAAACCAAGGAGCATGATGCTAGTTCTTCAGACTACGTTGACAAGAAGGTTAAGGTATTAACCGTTCTGTATCTTGCTGCAGCTGCTTTATACAGCGAGATCAAAGACAAGATATTTAATATCTGCAATTCTTTGACAG
AGAGAACTGCAGTAGGTCCAGGAGAAGATATAGGGTGCCAAAATTGGAAATGGTGTTTACCTGATTTGGAGGAGCAAGTTGCAAGATGTACACTTATTTCGGGAATTGTGAATGAAGTTCAGCAAATGAGTGGACAAAATTTGATCCAACGTGGATCGGGCTGGTGGGATACAATGGGTTCTGTTGATGATGATTGGACT
TTGAGCTTTCAGGGTTGTTTGACTGCAATTCGTAGACTAGTGGGTCAGCTGGTTGGACGTGCAATTCCAGAATCAATAAGATCAGTTCTTTCCCACAACCCTGCAATTATGGAGGCATTTGGTTCACTTTCACAAATACGAGGAGCTGTTGATACAGCACTGGAACAGTTGGCTGAAATTGAAATGCAAAGGGCTTCTTT
ATTAGAACTTGAGAGGACCTACTATGAAAATGTTGAGGAGATCACTGAACGGAAAGTGTCGCTGGAAACGGCTATTGAAAAGGGTAGGGATCACCTTTCTTGGGAAGAAGCAGAAGAGCTTGCAAGTCAAGTGGAAGCCTGTCGAGCCCAGTTGGATAAACTGAAGAATGCATGGGACCGCCGAGATGCTCAAGCTTCTG
CACTTGTGAGGAAAGAGGCAAGTGCACGAGGTGCTTTAGTGGCAGCAGAACAACGCTTTGAGTCTCTTGTTACCATTGAGCGAGAAGGAGACATGCATCCTACAAGGGGAAAAGTTTTACTTGCAACATTTGCTAGGCCATTCTCTGAACTGGAATCCTACAATCAGAAGTTGCCTTCTTTTGGGTATGAACCCTCCTTG
AGAAAGAGTTCAGTGGATCAGACAGAGATTGTCACTTCTGGCTTTTCTGGGTTCGAGTCAGTCTGGAAGGTCACTAATATTTTAAAGGACCATACATTCTTTGTGTGGAAAGTTAGTATTATTGATACTTGTCTTGATTCATGTATCCGTAATGTTGCATCAGCTGTAGATCATACCTTAGGTTTTGACCAGACGGTTAG
CAGTCAGAAGAGGAAGCTTGAGATCCTAGTTGAGTATTATTTAGATCAGTATCTCAAGGAACGGCTTGATCCTGTTCTCCTTGAGTGCCTTGAGAAAGAGGGAGACTCATTGAAGCACATTTTGGTGGATCAAAGGGAGTTGGAATCAAATCTAGCAAAGAAAGAGCTTGATGCGGTAAAGCGGGCTCAGGGTCTGCTTG
TTGAATATAGTAATGCACATGAAACTGCACGAGCTGCTAAAGCAGCAGCTTGTGCAATGAAGATGCAAGTGGGAGAGCTCACACAGGATCTTCAGAAGGCAAACCTTGAGGCTGCCCAATTAGAGTGGCTTCATGATTATATACTTTCTCATTTAGATCAAAATACTATCCTCCAACAGAGCTGTGCAAATGAAGACAAT
TTTCCATCAAGCTCTATAAAGCTTAACAGAAGAAATTTATTAGAAAACCTTCGATCTGCAATGTCTGCTATCACTAGAGCAACAGAAGGTTTACAAAACTGTGAGAGATCTGCCATTTCCACTGAGGAACAGCTTGAGAGGGCCATGGGTTGGGCTTGTGCAGGACCCAATACTGGTGGTGGCTCAAACTATTCGGGTAG
AGGGATGGGAATTCCCCCTGAATTTCACGAGCATCTTCGTCACAGACGACAGTTGTTATGGGCAGGCCAAGAACAGGCTACGGGTATACTGAAGCTCTGTTCTGCTGCTCTGGATTTTGAGGATTCTAGGGATGGTTTCCTAAGGTCTCTTTCAGATGCATCTACTGGTGGAGCTCTAAGTGAAGGCAGAGCTTGGCAGC
AAGCATACATGAATATCATTTCAAGATTGGACATTTCTTATCACTCGTTTACTTGTGCAGACCGTGAATGGCATTTAGCACAGAAAAGCATGGAAGCAGCTGGTGCAAGTCTTTCTACTGCAACTAATGATTTGTGCCTCGTATCTATAAAATTGAAGTCCACGTCAGGTGAACTTCAAGCTACACTTTCAAGCATGAGG
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AGTTAACATGCTTCTTCTTCCTCTGGAGTCCATGCTGGCTTCTGCATCAAATACAGTAATTGGTATTATTAACAGGGATGGTGAACAGAAATTGGAAATCTCTGTGGGTCAAGGCCAAGCATTAATCCAATCACTTCATATAAAGCTTGGAGAGGTTTGTCCTGTTTTGACAAGCACAGTTCCAGTTCTCCTGAACACTG
TCAAAGAGCTACATATTGCTTTAACCAGACTTGCACGCACTGCAAGCTTTGATGCTGGTGTTCTCCATAAAGCTCTTGAAGGTGTTGGGGAAAGTCAAGAAGCACGGTCTCAAGAATTAGATTTAGTCAGGACAGAACTTCCAGAAGATGAAGTGTTGTCTGCAGAACAAAATAGAAATATCATGGAAGCAGTTGTTGAC
AATGATGAACATGGTGGAGAGTCGATAACAGATGAAGAGCTCCTGCTACAAGGTGATGAAGACTCCTGGATCTCACCTCCTGATAGTTTTTATACTAATGATTCTGAGTCAGACAATACTTCCCCAGACTCACAACATCAAGATGACTCTTTGACCATCTCCAATGACTGGGAATCTCATATAAATGGAACTGACAAGGC
TAAGTTTAGTGAGGGAGTGGTATCAGATGCTTCAAGGTTTACAGTGAATGAGGATACTGGATATACTTCTCCATCCTTTTTGGCCCATAGCCAAGAAGATCCTTTGCTAGTTGGGCATATTCAAACAGACATGAAATTTGAAGGTACAGAGGATAGTGAGAATGGGATTATTTCTATGGGAAATAGTCAAATTCATTCTG
TCAAGGACACAAGTCAGAGGCCAGAAGGCTCACAGGCATCAATAAGTTCAAATAAGGTCAGTTCTGACAGTCAGAATGCTACACACATGAACTTGTCAGACATGGGACTTGGATCTATGAATGTTTTTGAAAGACATCAGACAGGAGGAGAGATACAAATGAGGATGAAGGAAAAAGAACCTCATATATCTCGAGCTAAA
GGAAGGGTTGAAAGTTATAGTGACCTATGCACACTATTTTCTTCTATGAACACGGAACAAAGAAGTCATGGTTTTAGGGGGAAAAATGCTTATGCAGTCTCGGTGCTGAAACGAGTTGAAGCAAAGCTGGATGGCCGAGACATTGATGGGAAAAGACAATTTTCTGTTTCAGAACAAGTGGATCATCTTCTTCGTCAGGC
TACAAGCATTGATAATTTATGTAATATGTATGAAGGTTGGACACCTTGGATATGATGCCCTACAAATAGCCTCTTCAAGTTCCTGCTACTTCTCCTGGAAAGGCAGTGTTATTTTTGAGCTGGCTGGTATTCCCATTGTGTCACTTGTCAGTGATCTCAATCATCGCAGAACAGTTTAGGGTCCACCTTTTGTCTATCTT
GGGTTAGACTCGTCACAAATCATTAGGATAGAAGAAATCCATTTTGGTCAATGGTGAGAATAGAAGAATGCTAAGGAAAATTCATCCATCATGGAAGTTGAGGCTTGAAGAATTGTTACAATCCTCTACTTTCTTTAAGCAAG

Intron 9 GTTGGACACC ... TTTAAGCAAG

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>TRINITY_DN119182_c1_g2_i13 from sample A3 / Example spliced isoform

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ATAGGTGTTTTTAACGCTCATCGCGTTCTGTGTTCCTCCCTGCATTCAATTGCTCAATTTCTCCAGGAGCAGGACAGTCGCAGAGCCAGAACAATTCAGTCCATTTTTTAAAATCTACCAGAGATCTGAGTAGCAATGGAGTCCCAGAAAGAGGACGATTTTGAACGGGAAAAGGAGGACTGTGAACTGGAAAGAGAATT
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GGCCCATTCTTGATGCAGCACAGTCTCGAGATTTTTGCAATATCATGCAAGGGCTTACAAATGAGCTTGATACTCAAGGTGCATTTCCTAGAAGCAATTCCCGAGTTTCATCACTTGCCTCTTGTGCTCCAAGTGCTGATAATAGGGCTGCGGAGATGGCTTTGACAGGACTTCATGAATTTTTTAGTACAGGTGATGCA
AATGTCATTGAAGGGTATGCATCACCTGTTCTCAGAGCATGCCAGGAAATTTTGGAAGATGAGAGAACCTCCTTGACTCTCCTTCGATCACTTCTGAACCTTCTGACAGTTCTTTCAGTGAAATTTACACGATGTTTCCAGTCTCATTTTGCAGATATCGTAGATTTGTTGCTTGGTTGGGCTCTTGTACCTGATCTTTC
TGACACTGATAGATGCATAATTACAGACACATTCCTGAAGTTTCAGAAGCTCTGGGTGGGTAACTTGCAGTTCTCGCTAAACTTGTTAACCAAATTTTTAGGAGACATGGAAGTTTTAGCTCAGGATGCAACTCCTGGAACACTGCAACAATTACGACGATTGCTTGTGCTTGTTTCCTGCTTTGTCACAGTTTTACAAG
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GCAATGGACATATTATTCCGATGCTTAGAAACAAAGAATGCAGTTGTTTTGGGTGCTGATGCACTTTCATCTAAGCAAATTCAGGCAGTGCTAAAGACCAATCTGCAGTTAATGTCTGCACAAAGACTTGCCCTTCCAGCATCAGCAGTTCAGAACATCCTTAAGATGGATTCATTTTTTGCATATTTACGCTTACACCC
AAATCATCTTGTGACAGGGCTGGCTGCAGCCACTTATCTTTTTCTGCTAAAGCATGCCTCTAATGAAGTTGTGTCTCAAGCCATTCATTCTCTAATGGCAGAACTACAAATACTGAAGAGTCTACTTTTGCAGGCTCATTCTGCAGGAATTCATGTCTCAGAAGAGCTTGACAACAGAAATCATAATCAAGCTGCAGTAG
ATTCTCTTGGAAGGGTTCTTTCAGAAGTTGAAGTTGTAGCCTTGGCAAGATTTGATCTGATGGTCTTAGCCAATTCTTTCTTGGATACCGGAAAAACAATCTCAGATGCAATAAATGTAGTCAACTGTAGGCTTGAAAGAGCAAAAGAACTAAGCAATTTTATCATAGAAAAATTGAATCCTTTCAAGAAACCTTTCATA
TGGTACTTGGAGCTGCAGTTTGCTCTAATTCAGGCTCTACATAGGATTTGTATTGTTCTTGTTTTTGGAAAACATATGGTTGGAGAGAGACTTCCTGAAACGAGTGTTGTATTCTCGGGGTCTAATGAAAAATTTCAGACTTTAGCACAGTCAAGCAAGGAAACAAGCATGGCAGTATCCAAGAATTTAAATGTCTATGG
GTTATATATTGCTAAAGCTCTGCATATTTCGGCCAGTCTTTCTGTAAAATTGGAAGCCTTGGACTGGGTTGGTAGCCTTTGTAGGGGCATGATGACCACGAGTAATGACGATACTTTTCAATTTTATTGTTACCAGGGTTGCGAAGATTTCCGGGCATGTTGGCATACATGTTTAAGCAAGAATATATTGTTCCCAGTTT
TATGTGCAGCATCAGATAGAGACTTGAAAGTCAGGTTCCGGGTTGCATCAGTTCTTCAGCTCCTTTTACAAGCAAAGCTCATATATCCAGTATACTTTGACGCCGTTGCAAATGTGGCTCTTGAAAAACTTGGAGATCCTGATTCCTCACTTCAAAGTGCATTTAGGAAAGTTCTTTCACTGGTTGTCCCCGCTGCATTG
TATTTGGGAGGTTGCATTGAAAATGATGATAACTATGCATACAAGCACATTATGTCTTATGTTAAGGCAGGGAGCAGAAAGTATTCACACTGGAAGCAAGTGTTTACAATCAAGCACTTGTCACAATCATCACGGTCACAGCAGCTTGTCTATATTTTGAACTACATTTCCCAACGGTCACAGGTTGTTCCCTCTTGTTG
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AATGCATACGAAGGTTCTGCTGTATTACCAGCTGCACCCACTCAAAGTGCTCTATTCTTTCGTGCAAATAAAAAGGTGTGTGAAGAGTGGTTTGCTCGTATTTGCGAGGCGCTGATGAATGCTAGCTTAGCAATCCAATGCAATGCAGGTACATTCCATCATGCTGCAACACGTTTGCAAGACCTTAGAAATGCAGCAGC
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TAGGACTGAAAGCTTTGGGAGGATTTGGACTATTTGGATGGATGACAGGTCTTGTATATCAAGCTCGTGGGCAATATGAAAAAGCCACGGCCCACTTTACACACATGCTTCAGTCTGAGGAAAATCTTTCTTTGATGGGTGCTGATGGAGTACAATTTGTCATTGCACGTATAATTGAAAGCTATGTAGCTCTAACAGAT
TGGGAATCTCTAGACCACTGGCTTCAGGAACTGCAGTTGATTCGAGCCAAGCATGCAGGGAAGTCCTATGCTGGAGCATTAACAACTGCTGGCAACGAAATGAATGCTATTCATGCTCTAGCTCGCTTTGATGTAGGTGATGTGCAAGGTGCATGGGGATACTTGGACTTGACTCCACAGAGCAGCAGTGAACTTACAGT
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AACAAGGACGCAGACTTAATGCTGGCCATGATGAATCTGGGGAGTTTGCATCAATACTTAGTTCCCTGCAGAATGCAGTCCAAGTGCCGATGAATCCATTACAACAAGATTGTCTTCTGTGGTTGAAACTCTTACGCGTCTACCATGTTGTGCTACCAGAGTCAAAGTCAACTTTGCAGCTTTGCCAACAAGTCATAAAA
CTAGCTCGCAAACAAACCAATTTCCAACTGGCTCATCGTCTGCACCAAGAATTGTTGAGTGGTATTTCAAGACGTCACAAAGATGACTTTTCTGAATGGCTTGTTGCAAGCTTACAGTATGAGAGTATTCTGCTTCTTTTTGCAGAGGGAAAATGTGAGGAAGCCATAGTAGAGCTTTGGTCATTGGTACGTTCTTACAT
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TGGCGACCTTTTGATATAATTGCTGCATCTTTGGCGAACCATCAGAAGAAATCATCAGTCTACCTGAGTGAGGTTGCTCCACGACTTGCACAGCTGGCTTCTTCTGATGCTCCAATGCCTGGTCTTGAGAAACAGATATCAATGTCCGAATCTGAAGGAATTCCTGGCAGCGATCTTCTGGGCCTGGTTACAATTTCTTC
TTTTAGTGAACAGGTCACTATTCTTGCAACAAAGACAAAGCCAAAGAAGCTAGTTCTATTGGGTTCAGATGGTCAAAGGTATACTTATCTTCTCAAGGGCCGGGAAGATTTGCGACTTGATGCAAGAATAATGCAGCTTTTGCAAGCTGTGAATGGAATGCTACATGCAAGCACAAGTACACAGGGTCGTTCGCTAGCAG
TTCGCTACTATTCTGTAACTCCTATAAGTGGGCGAGCAGGCTTGATCCAATGGGTGGACAATCTTATAAGCATGTATAGTGTATTCAAAGCTTGGCAGCAGCGTGCACAGTATGCTCAGTTTACATCTACTACTAGTGGTACTGCAGCTGCAAACACTCCCATCCCACCTGTTCCACGTCCCAGTGATATGTTCTATGGG
AAGATTATTCCAGCACTAAAAGAAAAAGGTTTGCGTAAAGTCATTTCACGACGGGATTGGCCACAAGAAGTAAAAAGAAAGGTTCTGTTGGACCTTATGAAAGAGACTCCTCGTCAACTACTTTATCGAGAAATTTGGTGTGCAAGTGAAGGATTCCAAACCTTTAACTCAAAACTACAGAGGTTTTCAGGCAGTGTAGC
AGTCATGAGCATGGTGGGGCACATTCTAGGTCTGGGTGATAGACATTTGGATAATATTCTTATGGACTTCAACACTGGTGATGTTGTCCATATAGATTATAATGTGTGCTTTGACAAGGGACTGAGATTGAAGATTCCGGAGATAGTACCATTTCGTCTTACTCAGATTATGCAAGCAGCATTAGGACTCATGGGAATAG
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TGCTTGGGCAGGGCACTGTCCAGTCCATGTAGAGGTGCTGCTGGCAGTATATTGCAGTGA

>TRINITY_DN119182_c1_g2_i17 from sample A3 / Example unspliced isoform:

GTTTCCTCTGTCCGGCGTTCTGTGCGATGACATGCTTTTGAGAACGCGAAATTAATGGAGTCGGTGATGAAAGAGCTCGAGGCTCTGAAGGTGGTTCGGAAGGTGGCCAGTCGTTGGGACGGTGGCCACGGGACCGTGCTCTTGGTCCGAAGGAAAGGCAGCAACAGGCAGGTGCGAATTTCGTTGTTCTGGTACCTTTC
ATAGGTGTTTTTAACGCTCATCGCGTTCTGTGTTCCTCCCTGCATTCAATTGCTCAATTTCTCCAGGAGCAGGACAGTCGCAGAGCCAGAACAATTCAGTCCATTTTTTAAAATCTACCAGAGATCTGAGTAGCAATGGAGTCCCAGAAAGAGGACGATTTTGAACGGGAAAAGGAGGACTGTGAACTGGAAAGAGAATT
CGAATTGGAAGCTGCTATGTACAGTAGTAGTAATTCAATGCTGTCAGGTTTAGATGGCTCTGCTCTAGGTCAACAGGGAGGACCCTCCAGGTCTGGACTCTTCAGGCATTCTAACCCTAGAATGGGAGAGACACTCCTCCATATCCTTCTCTGTGCCATTCGAGGTCCTGTGCAGTCTGCCAAGATCATGCAAGGGCTTA
CAAATGAGCTTGATACTCAAGGTGCATTTCCTAGAAGCAATTCCCGAGTTTCATCACTTGCCTCTTGTGCTCCAAGGTTTGTGTTTTTAATGCCCTTCATATTCTTTACTTTATGGTTAGGAAGATTATATCTTGTTTGATTATAATGAAGTTCTTTGAGTATCTTTGGTTTGATTTTTGGGCTTATAATTCCAGAGAGG
GCAAGTCCTATGGTCTATATGGGCTCACTTGCTCTTTCATTAATTTATATCATATATATAAATATATTTGATTTAAGCATTTAATATATCTAAGTGCAAGGATTCTGCATGCACTAATGTCTGTATATCAATGCCAGTGCTGATAATAGGGCTGCGGAGATGGCTTTGACAGGACTTCATGAATTTTTTAGTACAGGTGA
TGCAAATGTCATTGAAGGGTATGCATCACCTGTTCTCAGAGCATGCCAGGAAATTTTGGAAGATGAGAGAACCTCCTTGACTCTCCTTCGATCACTTCTGAACCTTCTGACAGTTCTTTCAGTGAAATTTACACGATGTTTCCAGTCTCATTTTGCAGATATCGTAGATTTGTTGCTTGGTTGGGCTCTTGTACCTGATC
TTTCTGACACTGATAGATGCATAATTACAGACACATTCCTGAAGTTTCAGAAGCTCTGGGTGGGTAACTTGCAGTTCTCGCTAAACTTGTTAACCAAATTTTTAGGAGACATGGAAGTTTTAGCTCAGGATGCAACTCCTGGAACACTGCAACAATTACGACGATTGCTTGTGCTTGTTTCCTGCTTTGTCACAGTTTTA
CAAGCCACAGCAACTGGTGTGCTAGAAATGAACCTGCTTGAACACATTATTGAGCCGCTCCAGGAAATGCTTCAACGATTGCTTACATGCTTGTTAATGGTCACTAAAAAGTTTGGTAATACCAAATGGCTGAAGGAATCCTCAAGATGCTTGATTATGTTTGCCGATCTATTGAAAGAACGCTTTGCTAACTTCTATCC
TGCTGCAATGGACATATTATTCCGATGCTTAGAAACAAAGAATGCAGTTGTTTTGGGTGCTGATGCACTTTCATCTAAGCAAATTCAGGCAGTGCTAAAGACCAATCTGCAGTTAATGTCTGCACAAAGACTTGCCCTTCCAGCATCAGCAGTTCAGAACATCCTTAAGATGGATTCATTTTTTGCATATTTACGCTTAC
ACCCAAATCATCTTGTGACAGGGCTGGCTGCAGCCACTTATCTTTTTCTGCTAAAGCATGCCTCTAATGAAGTTGTGTCTCAAGCCATTCATTCTCTAATGGCAGAACTACAAATACTGAAGAGTCTACTTTTGCAGGCTCATTCTGCAGGAATTCATGTCTCAGAAGAGCTTGACAACAGAAATCATAATCAAGCTGCA
GTAGATTCTCTTGGAAGGGTTCTTTCAGAAGTTGAAGTTGTAGCCTTGGCAAGATTTGATCTGATGGTCTTAGCCAATTCTTTCTTGGATACCGGAAAAACAATCTCAGATGCAATAAATGTAGTCAACTGTAGGCTTGAAAGAGCAAAAGAACTAAGCAATTTTATCATAGAAAAATTGAATCCTTTCAAGAAACCTTT
CATATGGTACTTGGAGCTGCAGTTTGCTCTAATTCAGGCTCTACATAGGATTTGTATTGTTCTTGTTTTTGGAAAACATATGGTTGGAGAGAGACTTCCTGAAACGAGTGTTGTATTCTCGGGGTCTAATGAAAAATTTCAGACTTTAGCACAGTCAAGCAAGGAAACAAGCATGGCAGTATCCAAGAATTTAAATGTCT
ATGGGTTATATATTGCTAAAGCTCTGCATATTTCGGCCAGTCTTTCTGTAAAATTGGAAGCCTTGGACTGGGTTGGTAGCCTTTGTAGGGGCATGATGACCACGAGTAATGACGATACTTTTCAATTTTATTGTTACCAGGGTTGCGAAGATTTCCGGGCATGTTGGCATACATGTTTAAGCAAGAATATATTGTTCCCA
GTTTTATGTGCAGCATCAGATAGAGACTTGAAAGTCAGGTTCCGGGTTGCATCAGTTCTTCAGCTCCTTTTACAAGCAAAGCTCATATATCCAGTATACTTTGACGCCGTTGCAAATGTGGCTCTTGAAAAACTTGGAGATCCTGATTCCTCACTTCAAAGTGCATTTAGGAAAGTTCTTTCACTGGTTGTCCCCGCTGC
ATTGTATTTGGGAGGTTGCATTGAAAATGATGATAACTATGCATACAAGCACATTATGTCTTATGTTAAGGCAGGGAGCAGAAAGTATTCACACTGGAAGCAAGTGTTTACAATCAAGCACTTGTCACAATCATCACGGTCACAGCAGCTTGTCTATATTTTGAACTACATTTCCCAACGGTCACAGGTTGTTCCCTCTT
GTTGGTTCCAGCGTCTTGTTCTTAGCTATCATGGAAATTTAAAGAGTTGGCTTCCAAAACCACACAAAGATCGATTAAACTCAGAAGCAGGTAGCCTGTGGTTGGACCTTAATGTTGACTGTGAAACGCTTGAGAGAGTCTTTTCCACCAACAATCTTGCTGCTGCTTGGTGGTCTATACATGAAGCAGCTCGTCACTGC
ATCACTGTTCGGCTTCGCACTCATCTTGGTGGACCCACCCAAACATTTGCTGCTTTAGAGCGAATGCTGTTAGATATAGTGCAATTATTACAATTGGATTCTGGGCAACGTGAATCAAGTAGTGGCACAAGCTCTTCAGGTGTCCATTTATTGCCGATGAGACTTTTATTAGAATTTGTGGAGTCTTTGAAGAAACAAAT
TTATAATGCATACGAAGGTTCTGCTGTATTACCAGCTGCACCCACTCAAAGTGCTCTATTCTTTCGTGCAAATAAAAAGGTGTGTGAAGAGTGGTTTGCTCGTATTTGCGAGGCGCTGATGAATGCTAGCTTAGCAATCCAATGCAATGCAGGTACATTCCATCATGCTGCAACACGTTTGCAAGACCTTAGAAATGCAG
CAGCACCAACATTAAGGGATATGGCTAGAAGTCAAACAGCGGATAATTCACAGGGCTTGAGAGCAAAATTGATAAATGATGTGCTCCGAATCTTACGCCACGCATCACTAGCCTTGTCCAGACTTCATGAGTCAGATGCCATTGTTGGTCTCCAGATATGGGCAACATCGACCTTTGTTACACCTCTTCTAGATGACAGT
TTGCTAGGACTGAAAGCTTTGGGAGGATTTGGACTATTTGGATGGATGACAGGTCTTGTATATCAAGCTCGTGGGCAATATGAAAAAGCCACGGCCCACTTTACACACATGCTTCAGTCTGAGGAAAATCTTTCTTTGATGGGTGCTGATGGAGTACAATTTGTCATTGCACGTATAATTGAAAGCTATGTAGCTCTAAC
AGATTGGGAATCTCTAGACCACTGGCTTCAGGAACTGCAGTTGATTCGAGCCAAGCATGCAGGGAAGTCCTATGCTGGAGCATTAACAACTGCTGGCAACGAAATGAATGCTATTCATGCTCTAGCTCGCTTTGATGTAGGTGATGTGCAAGGTGCATGGGGATACTTGGACTTGACTCCACAGAGCAGCAGTGAACTTA
CAGTAGATCCTAGGCAGGCTCTTCACAGAAGTGAGCAAATGCTTTTGCAGGCAATGCTTCGTACTGATTCCCAAGAAAAAGAGATTAAACTGGAAACAGAGAAGGCAAAGGTGATGTTAGAAGAGGCTTTGCTAGTATCTTCAATTGATGGTTTGCCTGAGGCAGCAGCATATGCAACCCAGTTTCACTGTATTTATGCC
TTTGAACAAGGACGCAGACTTAATGCTGGCCATGATGAATCTGGGGAGTTTGCATCAATACTTAGTTCCCTGCAGAATGCAGTCCAAGTGCCGATGAATCCATTACAACAAGATTGTCTTCTGTGGTTGAAACTCTTACGCGTCTACCATGTTGTGCTACCAGAGTCAAAGTCAACTTTGCAGCTTTGCCAACAAGTCAT
AAAACTAGCTCGCAAACAAACCAATTTCCAACTGGCTCATCGTCTGCACCAAGAATTGTTGAGTGGTATTTCAAGACGTCACAAAGATGACTTTTCTGAATGGCTTGTTGCAAGCTTACAGTATGAGAGTATTCTGCTTCTTTTTGCAGAGGGAAAATGTGAGGAAGCCATAGTAGAGCTTTGGTCATTGGTACGTTCTT
ACATACCATTTTCTGCCTTGTCTGTTTCTGCATCTGGCAATATGTTGAAGGCGAAGGCATGTGTGAAACTGTCATTTTGGTTGAAAGAAAAGTATTCTGAAATACATTGGCCAAACTTACTCCCAAAAATGAGTTTAGATAACCCTAAGTTCAGATCAAGTGATATTGCTGCTAATTTGGACGAGGGAGCCACTTCAAGG
GAAACTGGCTGGATGTCAGCTGGCAGCTACAACTTGATAGTTGAGGAGGTGGTTGGTGCTTCCATTAAAGCAGCAACACTTCTGTGTCCAAATATGTCTAAGGCATGGCTGTCATATGCCTCTTGGTGTTACCATCAAGCCAGAGCATCACTTTCAGGTGATGGTGCAGCTTTAAGGTCATGCAATTTGTCACCGATTCT
GATTCAGGAAGTTTCTTCTGATGGGACAGGTTTACTTGAAGAAGAGGTAATGCGAGTGCGAGCCATTATCATGAGAACACTCTTAAATAATGAAAAAGCGGATCCAGGAAGTGAGGAAATATTACTGTGGCCGGACACTGAAGTGTACATGAACAGTGAAAATATTAACTTTGTAGAACTATTGGTCCAACGTACTGTAT
ATATGATGCAGTCAGCAGCAGGTGCAGCAGGAGTTGAAAATTCAGATGGTGAAAGTGCTTGTTCGCTTTTGGTTGCTCAACTTCAGCGAGAACTACTGAATATCAAGCACAATATAGATTCCTCTCTTATGACATCTTTGATTAATGAATTGATGGACATCTGGTGGACTTTGAGGAAGAGAAGGGTATCATTATTTGGC
CATGCAGCTCGTGGCTTTTTACAGTATCTTTCACTATCAAATAGGACACATCTTGAACAAGGTCCTTGGAAAAGCTATAATTTAGATGTTTTAAAACATGGGAGGGAAGACTGCACACTCAGAGCAACTTTATACATATTAAATATCCTTCTAAATTATGGAGTAGAATTAGGAGAGACACTTAAAAATGGTCTTATGAC
AGGGCCACCTCTACCATGGCAGGAGATAATCCCTCAGCTATTTGCTCGGTTGAGCACTCATCCTGAACATCAGGTTCGTAAACGGTTGGAGGGGTTGTTGATTACATTGGCAAAGTTATCTCCATGGGCTATAGTCTATCCTACACTTGTTGATATCAGTGCTTATGAAGGCGAGCCATCAGAGGAGCTTCAACGCATCT
TAGACTGTCTGGTTAAAGTTCATCCAAAACTGGTTCAGGACGTGCAATTAATGATATTGGAACTTGGGAATATTACTGTTCTTTGGGAGGAGCAGTGGCTTAGCACACTACAAGATCTTCATGCAGATGTTATGAGACGGATAGCTACACTGAAAGAAGAGGTTTCCAGGGTGGCAGAGAACATTACACTTACTCACAGT
GAGAAGGTTAAAATAAATGCTGCCAAGTATTCTGCAATGATGGCACCAATTGCTGTAGCTTTGGAACGGCGTCTAGTTTCCACATCTCGGATGCCGGAAACTGCCCATGAGGCTTGGTTCCAGAAGGAATATGGTGAGCAACTGAAAGCTGCTATAACAAATTTCAAGACCCCTCCTTCAACTGTTGCTTCCCTTGCAGA
AATGTGGCGACCTTTTGATATAATTGCTGCATCTTTGGCGAACCATCAGAAGAAATCATCAGTCTACCTGAGTGAGGTTGCTCCACGACTTGCACAGCTGGCTTCTTCTGATGCTCCAATGCCTGGTCTTGAGAAACAGATATCAATGTCCGAATCTGAAGGAATTCCTGGCAGCGATCTTCTGGGCCTGGTTACAATTT
CTTCTTTTAGTGAACAGGTCACTATTCTTGCAACAAAGACAAAGCCAAAGAAGCTAGTTCTATTGGGTTCAGATGGTCAAAGGTATACTTATCTTCTCAAGGGCCGGGAAGATTTGCGACTTGATGCAAGAATAATGCAGCTTTTGCAAGCTGTGAATGGAATGCTACATGCAAGCACAAGTACACAGGGTCGTTCGCTA
GCAGTTCGCTACTATTCTGTAACTCCTATAAGTGGGCGAGCAGGCTTGATCCAATGGGTGGACAATCTTATAAGCATGTATAGTGTATTCAAAGCTTGGCAGCAGCGTGCACAGTATGCTCAGTTTACATCTACTACTAGTGGTACTGCAGCTGCAAACACTCCCATCCCACCTGTTCCACGTCCCAGTGATATGTTCTA
TGGGAAGATTATTCCAGCACTAAAAGAAAAAGGTTTGCGTAAAGTCATTTCACGACGGGATTGGCCACAAGAAGTAAAAAGAAAGGTTCTGTTGGACCTTATGAAAGAGACTCCTCGTCAACTACTTTATCGAGAAATTTGGTGTGCAAGTGAAGGATTCCAAACCTTTAACTCAAAACTACAGAGGTTTTCAGGCAGTG
TAGCAGTCATGAGCATGGTGGGGCACATTCTAGGTCTGGGTGATAGACATTTGGATAATATTCTTATGGACTTCAACACTGGTGATGTTGTCCATATAGATTATAATGTGTGCTTTGACAAGGGACTGAGATTGAAGATTCCGGAGATAGTACCATTTCGTCTTACTCAGATTATGCAAGCAGCATTAGGACTCATGGGA
ATAGAAGGCACATTCAGAGCAAACTGTGAATCTGTAATTGACATTTTACGGAAAAACAAAGACATAATCTTGATGCTTTTAGAAGTATTTGTATGGGATCCATTGATTGAGTGGATGCGTGGAGATGGCCACGATGAAGCAACCATTGGTGGAGAGGAACGGAAAGGTATGGAGTTGGCAGTCAGTTTAAGCCTATTTGC
TTCTCGAGTTCAAGAAATACGAGTACCACTTCAGGAGCATCACGATCTGCTGTTAGTAACTCTTCCTGCAGCATCATCTGCACTTCAGAGTTTGGCGGATTTGCTTGATCGGTATGATAGAATATCCACTGCATTTGTCCATGCTGAGCAAGAAAAATCCAAATCTGCTATTGCAGAGGCATCTGCAAAGTCTATTGTTA
CAGAGGCAGCAAACAATCTTGAAAATGTTCAGATGGCTTATGAAGTACAAGCTCGTGAATTTGCACAGGCCAAGGCACTTGCCACTGAAGCTGCCCAGAAAGCTTCTATGTGGGTTGAACAACATAGCAGAGTTCTAGATGCATTACGCAGTGGTTCAGCTCCAGAGCTTCAGGCTATTGGGCAACTTCCTCATACAACT
GAGGCTTTGTCTCTAACATCTGCTGTGTTGGCCTCAGGAGTTCCCCTTACCATTGTTCCGGAGCCTACTCTAGCACATTGCCGAGATGTTGATAGGGAAGTTGCACACCTTATAAAAGAACGTCATGAAGCTATTTTGCATGCAGCCAAAGCACTACAGACTTACTCTGTGGCTTTGCAACGGCTTCTTCCAGGAAATTA
CATCGGTACCAGTCAGGTGCATAATTGGGCACAGGTTTTGCAATTGTCTGTGAGGAACCTCTCTCCAGATGCGCTTGCCTTAGCCAGAAGACAAGCTTCTGATCTTGTTGCAAAAGGACAGGGTGAACATGCAGACACTATACATCAGAAGTATGAAGCATTGCGTGTGAAAATAGAGAGGCTTGTGAAAGAAATCAGAA
AAGTTCAAGAAGACTGTTCTGAACTTGAGGCATCGATTGAATCAGAAAATGAACGGAAAGCTAAGGATCGAGTGCTGGCCATTTTTACAAAACATCTGCAGCCTTCTAACTATCCTAGGAAGGATGAGGATGCTCTTGCTAGGGATTCAGGTCATAACAAACAGGATGAAACCAAGGAGCATGATGCTAGTTCTTCAGAC
TACGTTGACAAGAAGGTTAAGGTATTAACCGTTCTGTATCTTGCTGCAGCTGCTTTATACAGCGAGATCAAAGACAAGATATTTAATATCTGCAATTCTTTGACAGAGAGAACTGCAGTAGGTCCAGGAGAAGATATAGGGTGCCAAAATTGGAAATGGTGTTTACCTGATTTGGAGGAGCAAGTTGCAAGATGTACACT
TATTTCGGGAATTGTGAATGAAGTTCAGCAAATGAGTGGACAAAATTTGATCCAACGTGGATCGGGCTGGTGGGATACAATGGGTTCTGTTGATGATGATTGGACTTTGAGCTTTCAGGGTTGTTTGACTGCAATTCGTAGACTAGTGGGTCAGCTGGTTGGACGTGCAATTCCAGAATCAATAAGATCAGTTCTTTCCC
ACAACCCTGCAATTATGGAGGCATTTGGTTCACTTTCACAAATACGAGGAGCTGTTGATACAGCACTAGAACAGTTGGCTGAAATTGAAATGCAAAGGGCTTCTTTATTAGAACTTGAGAGGACCTACTATGAAAATGTTGAGGAGATCACTGAACGGAAAGTGTCGCTGGAAACGGCTATTGAAAAGGGTAGGGATCAC
CTTTCTTGGGAAGAAGCAGAAGAGCTTGCAAGTCAAGTGGAAGCCTGTCGAGCCCAGTTGGATAAACTGAAGAATGCATGGGACCGCCGAGATGCTCAAGCTTCTGCACTTGTGAGGAAAGAGGCAAGTGCACGAGGTGCTTTAGTGGCAGCAGAACAACGCTTTGAGTCTCTTGTTACCATTGAGCGAGAAGGAGACAT
GCATCCTACAAGGGGAAAAGTTTTACTTGCAACATTTGCTAGGCCATTCTCTGAACTGGAATCCTACAATCAGAAGTTGCCTTCTTTTGGGTATGAACCCTCCTTGAGAAAGAGTTCAGTGGATCAGACAGAGATTGTCACTTCTGGCTTTTCTGGGTTCGAGTCAGTCTGGAAGGTCACTAATATTTTAAAGGACCATA
CATTCTTTGTGTGGAAAGTTAGTATTATTGATACTTGTCTTGATTCATGTATCCGTAATGTTGCATCAGCTGTAGATCATACCTTAGGTTTTGACCAGACGGTTAGCAGTCAGAAGAGGAAGCTTGAGATCCTAGTTGAGTATTATTTAGATCAGTATCTCAAGGAACGGCTTGATCCTGTTCTCCTTGAGTGCCTTGAG
AAAGAGGGAGACTCATTGAAGCACATTTTGGTGGATCAAAGGGAGTTGGAATCAAATCTAGCAAAGAAAGAGCTTGATGCGGTAAAGCGGGCTCAGGGTCTGCTTGTTGAATATAGTAATGCACATGAAACTGCACGAGCTGCTAAAGCAGCAGCTTGTGCAATGAAGATGCAAGTGGGAGAGCTCACACAGGATCTTCA
GAAGGCAAACCTTGAGGCTGCCCAATTAGAGTGGCTTCATGATTATATACTTTCTCATTTAGATCAAAATACTATCCTCCAACAGAGCTGTGCAAATGAAGACAATTTTCCATCAAGCTCTATAAAGCTTAACAGAAGAAATTTATTAGAAAACCTTCGATCTGCAATGTCCGCTATCACTAGAGCAACAGAAGGTTTAC
AAAACTGTGAGAGATCTGCCATTTCCACTGAGGAACAGCTTGAGAGGGCCATGGGTTGGGCTTGTGCAGGACCCAATACTGGTGGTGGCTCAAACTATTCGGGTAGAGGGATGGGAATTCCCCCTGAATTTCACGAGCATCTTCGTCACAGACGACAGTTGTTATGGGCAGGCCAAGAACAGGCTACGGGTATACTGAAG
CTCTGTTCTGCTGCTCTGGATTTTGAGGATTCTAGGGATGGTTTCCTAAGGTCTCTTTCAGATGCATCTACTGGTGGAGCTCTAAGTGAAGGCAGAGCTTGGCAGCAAGCATACATGAATATCATTTCAAGATTGGACATTTCTTATCACTCGTTTACTTGTGCAGACCGTGAATGGCATTTAGCACAGAAAAGCATGGA
AGCAGCTGGTGCAAGTCTTTCTACTGCAACTAATGATTTGTGCCTCGTATCTATAAAATTGAAGTCCACGTCAGGTGAACTTCAAGCTACACTTTCAAGCATGAGGGATTGGACAGTTAAAGCAAGTACAGATCTGTCAGCATTTTGCCGTGTGGCAAGGGGAAATTCTGCTCTAACAACTGAGAGTGGATCAATGCTTG
AAGAGGTTTTGGCAATAACGGAAGGAGCAGAAGGTGCACATGATGTTTATAGATTGGCAAAAGAAGCCACAGCACAACATAGTAATCTAATGTCTGAACTTAACAAAGTTAACATGCTTCTTCTTCCTCTGGAGTCCATGCTGGCTTCTGCATCAAATACAGTAATTGGTATTATTAACAGGGATGGTGAACAGAAATTG
GAAATCTCTGTGGGTCAAGGCCAAGCATTAATCCAATCACTTCATATAAAGCTTGGAGAGGTTTGTCCTGTTTTGACAAGCACAGTTCCAGTTCTCCTGAACACTGTCAAAGAGCTACATATTGCTTTAACCAGACTTGCACGCACTGCAAGCTTTGATGCTGGTGTTCTCCATAAAGCTCTTGAAGGTGTTGGGGAAAG
TCAAGAAGCACGGTCTCAAGAATTAGATTTAGTCAGGACAGAACTTCCAGAAGATGAAGTGTTGTCTGCAGAACAAAATAGAAATATCATGGAAGCAGTTGTTGACAATGATGAACATGGTGGAGAGTCGATAACAGATGAAGAGCTCCTGCTACAAGGTGATGAAGACTCCTGGATCTCACCTCCTGATAGTTTTTATA
CTAATGATTCTGAGTCAGACAATACTTCCCCAGACTCACAACATCAAGATGACTCTTTGACCATCTCCAATGACTGGGAATCTCATATAAATGGAACTGACAAGGCTAAGTTTAGTGAGGGAGTGGTATCAGATGCTTCAAGGTTTACAGTGAATGAGGATACTGGATATACTTCTCCATCCTTTTTGGCCCATAGCCAA
GAAGATCCTTTGCTAGTTGGGCATATTCAAACAGACATGAAATTTGAAGGTACAGAGGATAGTGAGAATGGGATTATTTCTATGGGAAATAGTCAAATTCATTCTGTCAAGGACACAAGTCAGAGGCCAGAAGGCTCACAGGCATCAATAAGTTCAAATAAGGTCAGTTCTGACAGTCAGAATGCTACACACATGAACTT
GTCAGACATGGGACTTGGATCTATGAATGTTTTTGAAAGACATCAGACAGGAGGAGAGATACAAATGAGGATGAAGGAAAAAGAACCTCATATATCTCGAGCTAAAGGAAGGGTTGAAAGTTATAGTGACCTATGCACACTATTTTCTTCTATGAACACGGAACAAAGAAGTCATGGTTTTAGGGGGAAAAATGCTTATG
CAGTCTCGGTGCTGAAACGAGTTGAAGCAAAGCTGGATGGCCGAGACATTGATGGGAAAAGACAATTTTCTGTTTCAGAACAAGTGGATCATCTTCTTCGTCAGGCTACAAGCATTGATAATTTATGTAATATGTATGAAGgttggacaccttggatatgatgccctacaaatagcctcttcaagttcctgctacttctc
ctggaaaggcagtgttatttttgagctggctggtattcccattgtgtcacttgtcagtgatctcaatcatcgcagaacagtttagggtccaccttttgtctatcttgggttagactcgtcacaaatcattaggatagaagaaatccattttggtcaatggtgagaatagaagaatgctaaggaaaattcatccatcatgg
aagttgaggcttgaagaattgttacaatcctctactttctttaagcaagATTCTGTTAAGGAAACACACAGAGACACCTTGAATTAGGATGTGATTTTACTCACAAAGGTCAGATCAGAGCACCTCCATTGTCAATATTTTAATGGAACTGCATTGTCAGGTGCAAACTTGAGCTAGAAAAAAATGTGGACTTGTTTGAT
TGAGAGATAACAAACTGTCAACAACCATCCCGCCAGAGAAATGCTTTAATACTAGGTCACTTGCGCTTTGTAGTGGAAGTGCAGGATAAGTCACAAAACCGTGCTTTGCCATTGCTTGGGCAGGGCACTGTCCAGTCCATGTAGAGGTGCTGCTGGCAGTATATTGCAGTGAGTCCAATTTCACAGCTTAACATACCCAA
GTGACTTATATCAGAATTTTGGTGATCACGAAGAATCTGTTTTAGAGCATTCAGCAAAGTATTGCAAAGTGAATAGTGGAGAATTGGTGAAAGGAAATGCAAAAGAGCATTCAATGCAGCAGGTAGTATGGTGAAATGGTAGCATCAGACTATTCTCAGTATTGGGATGCGATTGAGTTTTGCCAGTACTTCGAAAACAA
ATGCTATAAATCAAACTGCATGAAATTATATCTTGAAGCAATGGTAATGAAAATAATGGTTGAATTGAGAGGGTTCCTGTAGAAGAAGATCTTGATCACTAGGTACTTCAACGACAGATTATTTTAGCATGGCAGTTTGTTATTTTGGAGAATTTTCTTGTGGCAGTGAATTATTTATCATTGCAGCAGGTAGGTATGGT
GAAATGATAGCCAGATCAAAATCAAATGATATATGTTAAACTGTGTGAGACTCTATATCGAAGTAAAAGTTTTGAAAAATATGTTTGAGTTGAGAGGGTTACCTGTGAAAAGAAGTACTTCGTTACTGGGTACTTCAGCAATAGATAATATTAGCATGGTGATCAGTAGACAATCGTTTAGGAAAGAGGAGGGTATAGGT
AGATCTTCCCTGTATTTATACCCTCTTATCAAGGGTTATTCTTCATTTATATGATTGATTAAATTTCTTTTCACTGGTTCTTCTTAGGCTCTTTCTATATGAGATCTGTTCACGTG

Intron 10 GTTTGAATTG ... TGCATTTCAG

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A1	29.48	52.3	17.6	26
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>TRINITY_DN131445_c6_g1_i25 from sample A1 / Example spliced isoform

GCGTTCTGTGCGATGACATGCTTTTGAGAACGCGAAATTAATGGAGTCGGTGATGAAAGAGCTCGAGGCTCTGAAGGTGGTTCGGAAGGTGGCCAGTCGTTGGGAAGGTGGCCACGGGACCGTGCTCTTGGTCCGAAGGAAAGGCAGCAACAGGCAGGTGCGAATTTCGTTGTTCTGGTACCTTTCATAGGTGTTTTTAA
CGCTCATCGCGTTCTGTGTTCCTCCCTGCATTCAATTGCTCAATTTCTCCAGGAGCAGGACAGTCGCAGAGCCAGAACAATTCAGTCCATTTTTTAAAATCTACCAGAGATCTGAGTAGCAATGGAGTCCCAGAAAGAGGACGATTTTGAACGGGAAAAGGAGGACTGTGAACTGGAAAGAGAATTCGAATTGGAAGCTG
CTATGTACAGTAGTAGTAATTCAATGCTGTCAGGTTTAGATGGCTCTGCTCTAGGTCAACAGGGAGGACCCTCCAGGTCTGGACTCTTCAGGCATTCTAACCCTAGAATGGGAGAGACACTCCTCCATATCCTTCTCTGTGCCATTCGAGGTCCTGTGCAGTCTGCCAAGGATTTTTCTGGCATTTGGCCCATTCTTGAT
GCAGCACAGTCTCGAGATTTTTGCAATATCATGCAAGGGCTTACAAATGAGCTTGATACTCAAGGTGCATTTCCTAGAAGCAATTCCCGAGTTTCATCACTTGCCTCTTGTGCTCCAAGTGCTGATAATAGGGCTGCGGAGATGGCTTTGACAGGACTTCATGAATTTTTTAGTACAGGTGATGCAAATGTCATTGAAGG
GTATGCATCACCTGTTCTCAGAGCATGCCAGGAAATTTTGGAAGATGAGAGAACCTCCTTGACTCTCCTTCGATCACTTCTGAACCTTCTGACAGTTCTTTCAGTGAAATTTACACGATGTTTCCAGTCTCATTTTGCAGATATCGTAGATTTGTTGCTTGGTTGGGCTCTTGTACCTGATCTTTCTGACACTGATAGAT
GCATAATTACAGACACATTCCTGAAGTTTCAGAAGCTCTGGGTGGGTAACTTGCAGTTCTCGCTAAACTTGTTAACCAAATTTTTAGGAGACATGGAAGTTTTAGCTCAGGATGCAACTCCTGGAACACTGCAACAATTACGACGATTGCTTGTGCTTGTTTCCTGCTTTGTCACAGTTTTACAAGCCACAGCAACTGGT
GTGCTAGAAATGAACCTGCTTGAACACATTATTGAGCCGCTCCAGGAAATGCTTCAACGATTGCTTACATGCTTGTTAATGGTCACTAAAAAGTTTGGTAATACCAAATGGCTGAAGGAATCCTCAAGATGCTTGATTATGTTTGCCGATCTATTGAAAGAACGCTTTGCTAACTTCTATCCTGCTGCAATGGACATATT
ATTCCGATGCTTAGAAACAAAGAATGCAGTTGTTTTGGGTGCTGATGCACTTTCATCTAAGCAAATTCAGGCAGTGCTAAAGACCAATCTGCAGTTAATGTCTGCACAAAGACTTGCCCTTCCAGCATCAGCAGTTCAGAACATCCTTAAGATGGATTCATTTTTTGCATATTTACGCTTACACCCAAATCATCTTGTGA
CAGGGCTGGCTGCAGCCACTTATCTTTTTCTGCTAAAGCATGCCTCTAATGAAGTTGTGTCTCAAGCCATTCATTCTCTAATGGCAGAACTACAAATACTGAAGAGTCTACTTTTGCAGGCTCATTCTGCAGGAATTCATGTCTCAGAAGAGCTTGACAACAGAAATCATAATCAAGCTGCAGTAGATTCTCTTGGAAGG
GTTCTTTCAGAAGTTGAAGTTGTAGCCTTGGCAAGATTTGATCTGATGGTCTTAGCCAATTCTTTCTTGGATACCGGAAAAACAATCTCAGATGCAATAAATGTAGTCAACTGTAGGCTTGAAAGAGCAAAAGAACTAAGCAATTTTATCATAGAAAAATTGAATCCTTTCAAGAAACCTTTCATATGGTACTTGGAGCT
GCAGTTTGCTCTAATTCAGGCTCTACATAGGATTTGTATTGTTCTTGTTTTTGGAAAACATATGGTTGGAGAGAGACTTCCTGAAACGAGTGTTGTATTCTCGGGGTCTAATGAAAAATTTCAGACTTTAGCACAGTCAAGCAAGGAAACAAGCATGGCAGTATCCAAGAATTTAAATGTCTATGGGTTATATATTGCTA
AAGCTCTGCATATTTCGGCCAGTCTTTCTGTAAAATTGGAAGCCTTGGACTGGGTTGGTAGCCTTTGTAGGGGCATGATGACCACGAGTAATGACGATACTTTTCAATTTTATTGTTACCAGGGTTGCGAAGATTTCCGGGCATGTTGGCATACATGTTTAAGCAAGAATATATTGTTCCCAGTTTTATGTGCAGCATCA
GATAGAGACTTGAAAGTCAGGTTCCGGGTTGCATCAGTTCTTCAGCTCCTTTTACAAGCAAAGCTCATATATCCAGTATACTTTGACGCCGTTGCAAATGTGGCTCTTGAAAAACTTGGAGATCCTGATTCCTCACTTCAAAGTGCATTTAGGAAAGTTCTTTCACTGGTTGTCCCCGCTGCATTGTATTTGGGAGGTTG
CATTGAAAATGATGATAACTATGCATACAAGCACATTATGTCTTATGTTAAGGCAGGGAGCAGAAAGTATTCACACTGGAAGCAAGTGTTTACAATCAAGCACTTGTCACAATCATCACGGTCACAGCAGCTTGTCTATATTTTGAACTACATTTCCCAACGGTCACAGGTTGTTCCCTCTTGTTGGTTCCAGCGTCTTG
TTCTTAGCTATCATGGAAATTTAAAGAGTTGGCTTCCAAAACCACACAAAGATCGATTAAACTCAGAAGCAGGTAGCCTGTGGTTGGACCTTAATGTTGACTGTGAAACGCTTGAGAGAGTCTTTTCCACCAACAATCTTGCTGCTGCTTGGTGGTCTATACATGAAGCAGCTCGTCACTGCATCACTGTTCGGCTTCGC
ACTCATCTTGGTGGACCCACCCAAACATTTGCTGCTTTAGAGCGAATGCTGTTAGATATAGTGCAATTATTACAATTGGATTCTGGGCAACGTGAATCAAGTAGTGGCACAAGCTCTTCAGGTGTCCATTTATTGCCGATGAGACTTTTATTAGAATTTGTGGAGTCTTTGAAGAAACAAATTTATAATGCATACGAAGG
TTCTGCTGTATTACCAGCTGCACCCACTCAAAGTGCTCTATTCTTTCGTGCAAATAAAAAGGTGTGTGAAGAGTGGTTTGCTCGTATTTGCGAGGCGCTGATGAATGCTAGCTTAGCAATCCAATGCAATGCAGGTACATTCCATCATGCTGCAACACGTTTGCAAGACCTTAGAAATGCAGCAGCACCAACATTAAGGG
ATATGGCTAGAAGTCAAACAGCGGATAATTCACAGGGCTTGAGAGCAAAATTGATAAATGATGTGCTCCGAATCTTACGCCACGCATCACTAGCCTTGTCCAGACTTCATGAGTCAGATGCCATTGTTGGTCTCCAGATATGGGCAACATCGACCTTTGTTACACCTCTTCTAGATGACAGTTTGCTAGGACTGAAAGCT
TTGGGAGGATTTGGACTATTTGGATGGATGACAGGTCTTGTATATCAAGCTCGTGGGCAATATGAAAAAGCCACGGCCCACTTTACACACATGCTTCAGTCTGAGGAAAATCTTTCTTTGATGGGTGCTGATGGAGTACAATTTGTCATTGCACGTATAATTGAAAGCTATGTAGCTCTAACAGATTGGGAATCTCTAGA
CCACTGGCTTCAGGAACTGCAGTTGATTCGAGCCAAGCATGCAGGGAAGTCCTATGCTGGAGCATTAACAACTGCTGGCAACGAAATGAATGCTATTCATGCTCTAGCTCGCTTTGATGTAGGTGATGTGCAAGGTGCATGGGGATACTTGGACTTGACTCCACAGAGCAGCAGTGAACTTACAGTAGATCCTAGGCAGG
CTCTTCACAGAAGTGAGCAAATGCTTTTGCAGGCAATGCTTCGTACTGATTCCCAAGAAAAAGAGATTAAACTGGAAACAGAGAAGGCAAAGGTGATGTTAGAAGAGGCTTTGCTAGTATCTTCAATTGATGGTTTGCCTGAGGCAGCAGCATATGCAACCCAGTTTCACTGTATTTATGCCTTTGAACAAGGACGCAGA
CTTAATGCTGGCCATGATGAATCTGGGGAGTTTGCATCAATACTTAGTTCCCTGCAGAATGCAGTCCAAGTGCCGATGAATCCATTACAACAAGATTGTCTTCTGTGGTTGAAACTCTTACGCGTCTACCATGTTGTGCTACCAGAGTCAAAGTCAACTTTGCAGCTTTGCCAACAAGTCATAAAACTAGCTCGCAAACA
AACCAATTTCCAACTGGCTCATCGTCTGCACCAAGAATTGTTGAGTGGTATTTCAAGACGTCACAAAGATGACTTTTCTGAATGGCTTGTTGCAAGCTTACAGTATGAGAGTATTCTGCTTCTTTTTGCAGAGGGAAAATGTGAGGAAGCCATAGTAGAGCTTTGGTCATTGGTACGTTCTTACATACCATTTTCTGCCT
TGTCTGTTTCTGCATCTGGCAATATGTTGAAGGCGAAGGCATGTGTGAAACTGTCATTTTGGTTGAAAGAAAAGTATTCTGAAATACATTGGCCAAACTTACTCCCAAAAATGAGTTTAGATAACCCTAAGTTCAGATCAAGTGATATTGCTGCTAATTTGGACGAGGGAGCCACTTCAAGGGAAACTGGCTGGATGTCA
GCTGGCAGCTACAACTTGATAGTTGAGGAGGTGGTTGGTGCTTCCATTAAAGCAGCAACACTTCTGTGTCCAAATATGTCTAAGGCATGGCTGTCATATGCCTCTTGGTGTTACCATCAAGCCAGAGCATCACTTTCAGGTGATGGTGCAGCTTTAAGGTCATGCAATTTGTCACCGATTCTGATTCAGGAAGTTTCTTC
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TTACAGTATCTTTCACTATCAAATAGGACACATCTTGAACAAGGTCCTTGGAAAAGCTATAATTTAGATGTTTTAAAACATGGGAGGGAAGACTGCACACTCAGAGCAACTTTATACATATTAAATATCCTTCTAAATTATGGAGTAGAATTAGGAGAGACACTTAAAAATGGTCTTATGACAGGGCCACCTCTACCATG
GCAGGAGATAATCCCTCAGCTATTTGCTCGGTTGAGCACTCATCCTGAACATCAGGTTCGTAAACGGTTGGAGGGGTTGTTGATTACATTGGCAAAGTTATCTCCATGGGCTATAGTCTATCCTACACTTGTTGATATCAGTGCTTATGAAGGCGAGCCATCAGAGGAGCTTCAACGCATCTTAGACTGTCTGGTTAAAG
TTCATCCAAAACTGGTTCAGGACGTGCAATTAATGATATTGGAACTTGGGAATATTACTGTTCTTTGGGAGGAGCAGTGGCTTAGCACACTACAAGATCTTCATGCAGATGTTATGAGACGGATAGCTACACTGAAAGAAGAGGTTTCCAGGGTGGCAGAGAACATTACACTTACTCACAGTGAGAAGGTTAAAATAAAT
GCTGCCAAGTATTCTGCAATGATGGCACCAATTGCTGTAGCTTTGGAACGGCGTCTAGTTTCCACATCTCGGATGCCGGAAACTGCCCATGAGGCTTGGTTCCAGAAGGAATATGGTGAGCAACTGAAAGCTGCTATAACAAATTTCAAGACCCCTCCTTCAACTGTTGCTTCCCTTGCAGAAATGTGGCGACCTTTTGA
TATAATTGCTGCATCTTTGGCGAACCATCAGAAGAAATCATCAGTCTACCTGAGTGAGGTTGCTCCACGACTTGCACAGCTGGCTTCTTCTGATGCTCCAATGCCTGGTCTTGAGAAACAGATATCAATGTCCGAATCTGAAGGAATTCCTGGCAGCGATCTTCTGGGCCTGGTTACAATTTCTTCTTTTAGTGAACAGG
TCACTATTCTTGCAACAAAGACAAAGCCAAAGAAGCTAGTTCTATTGGGTTCAGATGGTCAAAGGTATACTTATCTTCTCAAGGGCCGGGAAGATTTGCGACTTGATGCAAGAATAATGCAGCTTTTGCAAGCTGTGAATGGAATGCTACATGCAAGCACAAGTACACAGGGTCGTTCGCTAGCAGTTCGCTACTATTCT
GTAACTCCTATAAGTGGGCGAGCAGGCTTGATCCAATGGGTGGACAATCTTATAAGCATGTATAGTGTATTCAAAGCTTGGCAGCAGCGTGCACAGTATGCTCAGTTTACATCTACTACTAGTGGTACTGCAGCTGCAAACACTCCCATCCCACCTGTTCCACGTCCCAGTGATATGTTCTATGGGAAGATTATTCCAGC
ACTAAAAGAAAAAGGTTTGCGTAAAGTCATTTCACGACGGGATTGGCCACAAGAAGTAAAAAGAAAGGTTCTGTTGGACCTTATGAAAGAGACTCCTCGTCAACTACTTTATCGAGAAATTTGGTGTGCAAGTGAAGGATTCCAAACCTTTAACTCAAAACTACAGAGGTTTTCAGGCAGTGTAGCAGTCATGAGCATGG
TGGGGCACATTCTAGGTCTGGGTGATAGACATTTGGATAATATTCTTATGGACTTCAACACTGGTGATGTTGTCCATATAGATTATAATGTGTGCTTTGACAAGGGACTGAGATTGAAGATTCCGGAGATAGTACCATTTCGTCTTACTCAGATTATGCAAGCAGCATTAGGACTCATGGGAATAGAAGGCACATTCAGA
GCAAACTGTGAATCTGTAATTGACATTTTACGGAAAAACAAAGACATAATCTTGATGCTTTTAGAAGTATTTGTATGGGATCCATTGATTGAGTGGATGCGTGGAGATGGCCACGATGAAGCAACCATTGGTGGAGAGGAACGGAAAGGTATGGAGTTGGCAGTCAGTTTAAGCCTATTTGCTTCTCGAGTTCAAGAAAT
ACGAGTACCACTTCAGGAGCATCACGATCTGCTGTTAGTAACTCTTCCTGCAGCATCATCTGCACTTCAGAGTTTGGCGGATTTGCTTGATCGGTATGATAGAATATCCACTGCATTTGTCCATGCTGAGCAAGAAAAATCCAAATCTGCTATTGCAGAGGCATCTGCAAAGTCTATTGTTACAGAGGCAGCAAACAATC
TTGAAAATGTTCAGATGGCTTATGAAGTACAAGCTCGTGAATTTGCACAGGCCAAGGCACTTGCCACTGAAGCTGCCCAGAAAGCTTCTATGTGGGTTGAACAACATAGCAGAGTTCTAGATGCATTACGCAGTGGTTCAGCTCCAGAGCTTCAGGCTATTGGGCAACTTCCTCATACAACTGAGGCTTTGTCTCTAACA
TCTGCTGTGTTGGCCTCAGGAGTTCCCCTTACCATTGTTCCGGAGCCTACTCTAGCACATTGCCGAGATGTTGATAGGGAAGTTGCACACCTTATAAAAGAACGTCATGAAGCTATTTTGCATGCAGCCAAAGCACTACAGACTTACTCTGTGGCTTTGCAACGGCTTCTTCCAGGAAATTACATCGGTACCAGTCAGGT
GCATAATTGGGCACAGGTTTTGCAATTGTCTGTGAGGAACCTCTCTCCAGATGCGCTTGCCTTAGCCAGAAGACAAGCTTCTGATCTTGTTGCAAAAGGACAGGGTGAACATGCAGACACTATACATCAGAAGTATGAAGCATTGCGTGTGAAAATAGAGAGGCTTGTGAAAGAAATCAGAAAAGTTCAAGAAGACTGTT
CTGAACTTGAGGCATCGATTGAATCAGAAAATGAACGGAAAGCTAAGGATCGAGTGCTGGCCATTTTTACAAAACATCTGCAGCCTTCTAACTATCCTAGGAAGGATGAGGATGCTCTTGCTAGGGATTCAGGTCATAACAAACAGGATGAAACCAAGGAGCATGATGCTAGTTCTTCAGACTACGTTGACAAGAAGGTT
AAGGTATTAACCGTTCTGTATCTTGCTGCAGCTGCTTTATACAGCGAGATCAAAGACAAGATATTTAATATCTGCAATTCTTTGACAGAGAGAACTGCAGTAGGTCCAGGAGAAGATATAGGGTGCCAAAATTGGAAATGGTGTTTACCTGATTTGGAGGAGCAAGTTGCAAGATGTACACTTATTTCGGGAATTGTGAA
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AGGCATTTGGTTCACTTTCACAAATACGAGGAGCTGTTGATACAGCACTGGAACAGTTGGCTGAAATTGAAATGCAAAGGGCTTCTTTATTAGAACTTGAGAGGACCTACTATGAAAATGTTGAGGAGATCACTGAACGGAAAGTGTCGCTGGAAACGGCTATTGAAAAGGGTAGGGATCACCTTTCTTGGGAAGAAGCA
GAAGAGCTTGCAAGTCAAGTGGAAGCCTGTCGAGCCCAGTTGGATAAACTGAAGAATGCATGGGACCGCCGAGATGCTCAAGCTTCTGCACTTGTGAGGAAAGAGGCAAGTGCACGAGGTGCTTTAGTGGCAGCAGAACAACGCTTTGAGTCTCTTGTTACCATTGAGCGAGAAGGAGACATGCATCCTACAAGGGGAAA
AGTTTTACTTGCAACATTTGCTAGGCCATTCTCTGAACTGGAATCCTACAATCAGAAGTTGCCTTCTTTTGGGTATGAACCCTCCTTGAGAAAGAGTTCAGTGGATCAGACAGAGATTGTCACTTCTGGCTTTTCTGGGTTCGAGTCAGTCTGGAAGGTCACTAATATTTTAAAGGACCATACATTCTTTGTGTGGAAAG
TTAGTATTATTGATACTTGTCTTGATTCATGTATCCGTAATGTTGCATCAGCTGTAGATCATACCTTAGGTTTTGACCAGACGGTTAGCAGTCAGAAGAGGAAGCTTGAGATCCTAGTTGAGTATTATTTAGATCAGTATCTCAAGGAACGGCTTGATCCTGTTCTCCTTGAGTGCCTTGAGAAAGAGGGAGACTCATTG
AAGCACATTTTGGTGGATCAAAGGGAGTTGGAATCAAATCTAGCAAAGAAAGAGCTTGATGCGGTAAAGCGGGCTCAGGGTCTGCTTGTTGAATATAGTAATGCACATGAAACTGCACGAGCTGCTAAAGCAGCAGCTTGTGCAATGAAGATGCAAGTGGGAGAGCTCACACAGGATCTTCAGAAGGCAAACCTTGAGGC
TGCCCAATTAGAGTGGCTTCATGATTATATACTTTCTCATTTAGATCAAAATACTATCCTCCAACAGAGCTGTGCAAATGAAGACAATTTTCCATCAAGCTCTATAAAGCTTAACAGAAGAAATTTATTAGAAAACCTTCGATCTGCAATGTCTGCTATCACTAGAGCAACAGAAGGTTTACAAAACTGTGAGAGATCTG
CCATTTCCACTGAGGAACAGCTTGAGAGGGCCATGGGTTGGGCTTGTGCAGGACCCAATACTGGTGGTGGCTCAAACTATTCGGGTAGAGGGATGGGAATTCCCCCTGAATTTCACGAGCATCTTCGTCACAGACGACAGTTGTTATGGGCAGGCCAAGAACAGGCTACGGGTATACTGAAGCTCTGTTCTGCTGCTCTG
GATTTTGAGGATTCTAGGGATGGTTTCCTAAGGTCTCTTTCAGATGCATCTACTGGTGGAGCTCTAAGTGAAGGCAGAGCTTGGCAGCAAGCATACATGAATATCATTTCAAGATTGGACATTTCTTATCACTCGTTTACTTGTGCAGACCGTGAATGGCATTTAGCACAGAAAAGCATGGAAGCAGCTGGTGCAAGTCT
TTCTACTGCAACTAATGATTTGTGCCTCGTATCTATAAAATTGAAGTCCACGTCAGGTGAACTTCAAGCTACACTTTCAAGCATGAGGGATTGGACAGTTAAAGCAAGTACAGATCTGTCAGCATTTTGCCGTGTGGCAAGGGGAAATTCTGCTCTAACAACTGAGAGTGGATCAATGCTTGAAGAGGTTTTGGCAATAA
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GGCCAAGCATTAATCCAATCACTTCATATAAAGCTTGGAGAGGTTTGTCCTGTTTTGACAAGCACAGTTCCAGTTCTCCTGAACACTGTCAAAGAGCTACATATTGCTTTAACCAGACTTGCACGCACTGCAAGCTTTGATGCTGGTGTTCTCCATAAAGCTCTTGAAGGTGTTGGGGAAAGTCAAGAAGCACGGTCTCA
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GGGCATATTCAAACAGACATGAAATTTGAAGGTACAGAGGATAGTGAGAATGGGATTATTTCTATGGGAAATAGTCAAATTCATTCTGTCAAGGACACAAGTCAGAGGCCAGAAGGCTCACAGGCATCAATAAGTTCAAATAAGGTCAGTTCTGACAGTCAGAATGCTACACACATGAACTTGTCAGACATGGGACTTGG
ATCTATGAATGTTTTTGAAAGACATCAGACAGGAGGAGAGATACAAATGAGGATGAAGGAAAAAGAACCTCATATATCTCGAGCTAAAGGAAGGGTTGAAAGTTATAGTGACCTATGCACACTATTTTCTTCTATGAACACGGAACAAAGAAGTCATGGTTTTAGGGGGAAAAATGCTTATGCAGTCTCGGTGCTGAAAC
GAGTTGAAGCAAAGCTGGATGGCCGAGACATTGATGGGAAAAGACAATTTTCTGTTTCAGAACAAGTGGATCATCTTCTTCGTCAGGCTACAAGCATTGATAATTTATGTAATATGTATGAAGGTTGGACACCTTGGATATGATGCCCTACAAATAGCCTCTTCAAGTTCCTGCTACTTCTCCTGGAAAGGCAGTGTTAT
TTTTGAGCTGGCTGGTATTCCCATTGTGTCACTTGTCAGTGATCTCAATCATCGCAGAACAGTTTAGGGTCCACCTTTTGTCTATCTTGGGTTAGACTCGTCACAAATCATTAGGATAGAAGAAATCCATTTTGGTCAATGGTGAGAATAGAAGAATGCTAAGGAAAATTCATCCATCATGGAAGTTGAGGCTTGAAGAA
TTGTTACAATCCTCTACTTTCTTTAAGCAAGATTCTGTTAAGGAAACACACAGAGACACCTTGAATTAGGATGTGATTTTACTCACAAAGGTCAGATCAGAGCACCTCCATTGTCAATATTTTAATGGAACTGCATTGTCAGGTGCAAACTTGAGCTAGAAAAAAATGTGGACTTGTTTGATTGAGAGATAACAAACTGT
CAACAACCATCCCGCCAGAGAAATGCTTTAATACTAGGTCACTTGCGCTTTGTAGTGGAAGTGCAGGATAAGTCACAAAACCGTGCTTTGCCATTGCTTGGGCAGGGCACTGTCCAGTCCATGTAGAGGTGCTGCTGGCAGTATATTGCAGTGAGTCCAATTTCACAGCTTAACATACCCAAGTGACTTATATCAGAATT
TTGGTATGCAAATCTAGAATCCAGATGTGGTGGTTATGACTGCTAATTTTTATTTCCTAGAGCTTTTGTGATTTTGATTGCAGGTATTTGTCTAGTTGAACCTACTACTTTGATCTGAGAGCAAATGAACACTCTTACTAAAATTGCTGTTATTCTTCTTTGTAATGGTGTCAAAAAGGTGATCACGAAGAATCTGTTTT
AGAGCATTCAGCAAAGTATTGCAAAGTGAATAGTGGAGAATTGGTGAAAGGAAATGCAAAAGAGCATTCAATGCAGCAGGTAGTATGGTGAAATGGTAGCATCAGACTATTCTCAGTATTGGGATGCGATTGAGTTTTGCCAGTACTTCGAAAACAAATGCTATAAATCAAACTGCATGAAATTATATCTTGAAGCAATG
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TGTGAGACTCTATATCGAAGTAAAAGTTTTGAAAAATATGTTTGAGTTGAGAGGGTTACCTGTGAAAAGAAGTACTTCGTTACTGGGTACTTCAGCAATAGATAATATTAGCATGGTGATCAGTAGACAATCGTTTAGGAAAGAGGAGGGTATAGGTAGATCTTCCCTGTATTTATACCCTCTTATCAAGGGTTATTCTT
CATTTATATGATTGATTAAATTTCTTTTCACTGGTTCTTCTTAGGCTCTTTCTATATGAGATCTGTTCACGTGTTTTATGTTTCTAGTTTTGCAAATAGATTATGTTTATTTTTATTCAGCATCTTAAAATACACATAATTGCTTTTCATTGTAACTACTATATTTGAAATGAGTTGTGTTGCTTAGTAAAGAAAGCGGG
TTTGGGGA

>TRINITY_DN131445_c6_g1_i13 from sample A1 / Example unspliced isoform:

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GCAGCACAGTCTCGAGATTTTTGCAATATCATGCAAGGGCTTACAAATGAGCTTGATACTCAAGGTGCATTTCCTAGAAGCAATTCCCGAGTTTCATCACTTGCCTCTTGTGCTCCAAGTGCTGATAATAGGGCTGCGGAGATGGCTTTGACAGGACTTCATGAATTTTTTAGTACAGGTGATGCAAATGTCATTGAAGG
GTATGCATCACCTGTTCTCAGAGCATGCCAGGAAATTTTGGAAGATGAGAGAACCTCCTTGACTCTCCTTCGATCACTTCTGAACCTTCTGACAGTTCTTTCAGTGAAATTTACACGATGTTTCCAGTCTCATTTTGCAGATATCGTAGATTTGTTGCTTGGTTGGGCTCTTGTACCTGATCTTTCTGACACTGATAGAT
GCATAATTACAGACACATTCCTGAAGTTTCAGAAGCTCTGGGTGGGTAACTTGCAGTTCTCGCTAAACTTGTTAACCAAATTTTTAGGAGACATGGAAGTTTTAGCTCAGGATGCAACTCCTGGAACACTGCAACAATTACGACGATTGCTTGTGCTTGTTTCCTGCTTTGTCACAGTTTTACAAGCCACAGCAACTGGT
GTGCTAGAAATGAACCTGCTTGAACACATTATTGAGCCGCTCCAGGAAATGCTTCAACGATTGCTTACATGCTTGTTAATGGTCACTAAAAAGTTTGGTAATACCAAATGGCTGAAGGAATCCTCAAGATGCTTGATTATGTTTGCCGATCTATTGAAAGAACGCTTTGCTAACTTCTATCCTGCTGCAATGGACATATT
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GCAGTTTGCTCTAATTCAGGCTCTACATAGGATTTGTATTGTTCTTGTTTTTGGAAAACATATGGTTGGAGAGAGACTTCCTGAAACGAGTGTTGTATTCTCGGGGTCTAATGAAAAATTTCAGACTTTAGCACAGTCAAGCAAGGAAACAAGCATGGCAGTATCCAAGAATTTAAATGTCTATGGGTTATATATTGCTA
AAGCTCTGCATATTTCGGCCAGTCTTTCTGTAAAATTGGAAGCCTTGGACTGGGTTGGTAGCCTTTGTAGGGGCATGATGACCACGAGTAATGACGATACTTTTCAATTTTATTGTTACCAGGGTTGCGAAGATTTCCGGGCATGTTGGCATACATGTTTAAGCAAGAATATATTGTTCCCAGTTTTATGTGCAGCATCA
GATAGAGACTTGAAAGTCAGGTTCCGGGTTGCATCAGTTCTTCAGCTCCTTTTACAAGCAAAGCTCATATATCCAGTATACTTTGACGCCGTTGCAAATGTGGCTCTTGAAAAACTTGGAGATCCTGATTCCTCACTTCAAAGTGCATTTAGGAAAGTTCTTTCACTGGTTGTCCCCGCTGCATTGTATTTGGGAGGTTG
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TGTCTGTTTCTGCATCTGGCAATATGTTGAAGGCGAAGGCATGTGTGAAACTGTCATTTTGGTTGAAAGAAAAGTATTCTGAAATACATTGGCCAAACTTACTCCCAAAAATGAGTTTAGATAACCCTAAGTTCAGATCAAGTGATATTGCTGCTAATTTGGACGAGGGAGCCACTTCAAGGGAAACTGGCTGGATGTCA
GCTGGCAGCTACAACTTGATAGTTGAGGAGGTGGTTGGTGCTTCCATTAAAGCAGCAACACTTCTGTGTCCAAATATGTCTAAGGCATGGCTGTCATATGCCTCTTGGTGTTACCATCAAGCCAGAGCATCACTTTCAGGTGATGGTGCAGCTTTAAGGTCATGCAATTTGTCACCGATTCTGATTCAGGAAGTTTCTTC
TGATGGGACAGGTTTACTTGAAGAAGAGGTAATGCGAGTGCGAGCCATTATCATGAGAACACTCTTAAATAATGAAAAAGCGGATCCAGGAAGTGAGGAAATATTACTGTGGCCGGACACTGAAGTGTACATGAACAGTGAAAATATTAACTTTGTAGAACTATTGGTCCAACGTACTGTATATATGATGCAGTCAGCAG
CAGGTGCAGCAGGAGTTGAAAATTCAGATGGTGAAAGTGCTTGTTCGCTTTTGGTTGCTCAACTTCAGCGAGAACTACTGAATATCAAGCACAATATAGATTCCTCTCTTATGACATCTTTGATTAATGAATTGATGGACATCTGGTGGACTTTGAGGAAGAGAAGGGTATCATTATTTGGCCATGCAGCTCGTGGCTTT
TTACAGTATCTTTCACTATCAAATAGGACACATCTTGAACAAGGTCCTTGGAAAAGCTATAATTTAGATGTTTTAAAACATGGGAGGGAAGACTGCACACTCAGAGCAACTTTATACATATTAAATATCCTTCTAAATTATGGAGTAGAATTAGGAGAGACACTTAAAAATGGTCTTATGACAGGGCCACCTCTACCATG
GCAGGAGATAATCCCTCAGCTATTTGCTCGGTTGAGCACTCATCCTGAACATCAGGTTCGTAAACGGTTGGAGGGGTTGTTGATTACATTGGCAAAGTTATCTCCATGGGCTATAGTCTATCCTACACTTGTTGATATCAGTGCTTATGAAGGCGAGCCATCAGAGGAGCTTCAACGCATCTTAGACTGTCTGGTTAAAG
TTCATCCAAAACTGGTTCAGGACGTGCAATTAATGATATTGGAACTTGGGAATATTACTGTTCTTTGGGAGGAGCAGTGGCTTAGCACACTACAAGATCTTCATGCAGATGTTATGAGACGGATAGCTACACTGAAAGAAGAGGTTTCCAGGGTGGCAGAGAACATTACACTTACTCACAGTGAGAAGGTTAAAATAAAT
GCTGCCAAGTATTCTGCAATGATGGCACCAATTGCTGTAGCTTTGGAACGGCGTCTAGTTTCCACATCTCGGATGCCGGAAACTGCCCATGAGGCTTGGTTCCAGAAGGAATATGGTGAGCAACTGAAAGCTGCTATAACAAATTTCAAGACCCCTCCTTCAACTGTTGCTTCCCTTGCAGAAATGTGGCGACCTTTTGA
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TCACTATTCTTGCAACAAAGACAAAGCCAAAGAAGCTAGTTCTATTGGGTTCAGATGGTCAAAGGTATACTTATCTTCTCAAGGGCCGGGAAGATTTGCGACTTGATGCAAGAATAATGCAGCTTTTGCAAGCTGTGAATGGAATGCTACATGCAAGCACAAGTACACAGGGTCGTTCGCTAGCAGTTCGCTACTATTCT
GTAACTCCTATAAGTGGGCGAGCAGGCTTGATCCAATGGGTGGACAATCTTATAAGCATGTATAGTGTATTCAAAGCTTGGCAGCAGCGTGCACAGTATGCTCAGTTTACATCTACTACTAGTGGTACTGCAGCTGCAAACACTCCCATCCCACCTGTTCCACGTCCCAGTGATATGTTCTATGGGAAGATTATTCCAGC
ACTAAAAGAAAAAGGTTTGCGTAAAGTCATTTCACGACGGGATTGGCCACAAGAAGTAAAAAGAAAGGTTCTGTTGGACCTTATGAAAGAGACTCCTCGTCAACTACTTTATCGAGAAATTTGGTGTGCAAGTGAAGGATTCCAAACCTTTAACTCAAAACTACAGAGGTTTTCAGGCAGTGTAGCAGTCATGAGCATGG
TGGGGCACATTCTAGGTCTGGGTGATAGACATTTGGATAATATTCTTATGGACTTCAACACTGGTGATGTTGTCCATATAGATTATAATGTGTGCTTTGACAAGGGACTGAGATTGAAGATTCCGGAGATAGTACCATTTCGTCTTACTCAGATTATGCAAGCAGCATTAGGACTCATGGGAATAGAAGGCACATTCAGA
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TTGAAAATGTTCAGATGGCTTATGAAGTACAAGCTCGTGAATTTGCACAGGCCAAGGCACTTGCCACTGAAGCTGCCCAGAAAGCTTCTATGTGGGTTGAACAACATAGCAGAGTTCTAGATGCATTACGCAGTGGTTCAGCTCCAGAGCTTCAGGCTATTGGGCAACTTCCTCATACAACTGAGGCTTTGTCTCTAACA
TCTGCTGTGTTGGCCTCAGGAGTTCCCCTTACCATTGTTCCGGAGCCTACTCTAGCACATTGCCGAGATGTTGATAGGGAAGTTGCACACCTTATAAAAGAACGTCATGAAGCTATTTTGCATGCAGCCAAAGCACTACAGACTTACTCTGTGGCTTTGCAACGGCTTCTTCCAGGAAATTACATCGGTACCAGTCAGGT
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TGAAGTTCAGCAAATGAGTGGACAAAATTTGATCCAACGTGGATCGGGCTGGTGGGATACAATGGGTTCTGTTGATGATGATTGGACTTTGAGCTTTCAGGGTTGTTTGACTGCAATTCGTAGACTAGTGGGTCAGCTGGTTGGACGTGCAATTCCAGAATCAATAAGATCAGTTCTTTCCCACAACCCTGCAATTATGG
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GGCCAAGCATTAATCCAATCACTTCATATAAAGCTTGGAGAGGTTTGTCCTGTTTTGACAAGCACAGTTCCAGTTCTCCTGAACACTGTCAAAGAGCTACATATTGCTTTAACCAGACTTGCACGCACTGCAAGCTTTGATGCTGGTGTTCTCCATAAAGCTCTTGAAGGTGTTGGGGAAAGTCAAGAAGCACGGTCTCA
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TTTTGAGCTGGCTGGTATTCCCATTGTGTCACTTGTCAGTGATCTCAATCATCGCAGAACAGTTTAGGGTCCACCTTTTGTCTATCTTGGGTTAGACTCGTCACAAATCATTAGGATAGAAGAAATCCATTTTGGTCAATGGTGAGAATAGAAGAATGCTAAGGAAAATTCATCCATCATGGAAGTTGAGGCTTGAAGAA
TTGTTACAATCCTCTACTTTCTTTAAGCAAGATTCTGTTAAGGAAACACACAGAGACACCTTGAATTAGGATGTGATTTTACTCACAAAGGTCAGATCAGAGCACCTCCATTGTCAATATTTTAATGGAACTGCATTGTCAGGTGCAAACTTGAGCTAGAAAAAAATGTGGACTTGTTTGATTGAGAGATAACAAACTGT
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CTTACTAAAATTGCTGTTATTCTTCTTTGTAATGGTGTCAAAAAGGTGATCACGAAGAATCTGTTTTAGAGCATTCAGCAAAGTATTGCAAAGTGAATAGTGGAGAATTGGTGAAAGGAAATGCAAAAGAGCATTCAATGCAGgtttgaattgcttgttatttttattatagatatagatatccttcctgatacgaagac
taaaataaaatgcagtctcatttttccttggagggacaaaaggtgtaaattgtaattaatattgggcaaagttacagctttttcaagacactgcatagtttcatatttcatgttttagctcaatgagtggtcatttaattagtctaaataatcaatctggagagaaattgattacggatatgcatttcagCAGGTAGTAT
GGTGAAATGGTAGCATCAGACTATTCTCAGTATTGGGATGCGATTGAGTTTTGCCAGTACTTCGAAAACAAATGCTATAAATCAAACTGCATGAAATTATATCTTGAAGCAATGGTAATGAAAATAATGGTTGAATTGAGAGGGTTCCTGTAGAAGAAGATCTTGATCACTAGGTACTTCAACGACAGATTATTTTAGCA
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GTTTTGCAAATAGATTATGTTTATTTTTATTCAGCATCTTAAAATACACATAATTGCTTTTCATTGTAACTACTATATTTGAAATGAGTTGTGTTGCTTAGTAAAGAAAGCGGGTTTGGGGA

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GCAGGAGATAATCCCTCAGCTATTTGCTCGGTTGAGCACTCATCCTGAACATCAGGTTCGTAAACGGTTGGAGGGGTTGTTGATTACATTGGCAAAGTTATCTCCATGGGCTATAGTCTATCCTACACTTGTTGATATCAGTGCTTATGAAGGCGAGCCATCAGAGGAGCTTCAACGCATCTTAGACTGTCTGGTTAAAG
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TGTGAGACTCTATATCGAAGTAAAAGTTTTGAAAAATATGTTTGAGTTGAGAGGGTTACCTGTGAAAAGAAGTACTTCGTTACTGGGTACTTCAGCAATAGATAATATTAGCATGGTGATCAGTAGACAATCGTTTAGGAAAGAGGAGGGTATAGGTAGATCTTCCCTGTATTTATACCCTCTTATCAAGGGTTATTCTT
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TTTGGGGA

>TRINITY_DN131445_c6_g1_i8 from sample A1 / Example unspliced isoform:

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CGCTCATCGCGTTCTGTGTTCCTCCCTGCATTCAATTGCTCAATTTCTCCAGGTACTCGCTCTTCCTCCAGGCTCAGTCATTTGAAATCCAAACCGACTGAACAATTCAACTGTTTTCACAATGGAGCAGGACAGTCGCAGAGCCAGAACAATTCAGTCCATTTTTTAAAATCTACCAGAGATCTGAGTAGCAATGGAGT
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CAGGCAGTGCTAAAGACCAATCTGCAGTTAATGTCTGCACAAAGACTTGCCCTTCCAGCATCAGCAGTTCAGAACATCCTTAAGATGGATTCATTTTTTGCATATTTACGCTTACACCCAAATCATCTTGTGACAGGGCTGGCTGCAGCCACTTATCTTTTTCTGCTAAAGCATGCCTCTAATGAAGTTGTGTCTCAAGC
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GGAGAGAGACTTCCTGAAACGAGTGTTGTATTCTCGGGGTCTAATGAAAAATTTCAGACTTTAGCACAGTCAAGCAAGGAAACAAGCATGGCAGTATCCAAGAATTTAAATGTCTATGGGTTATATATTGCTAAAGCTCTGCATATTTCGGCCAGTCTTTCTGTAAAATTGGAAGCCTTGGACTGGGTTGGTAGCCTTTG
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TATATCCAGTATACTTTGACGCCGTTGCAAATGTGGCTCTTGAAAAACTTGGAGATCCTGATTCCTCACTTCAAAGTGCATTTAGGAAAGTTCTTTCACTGGTTGTCCCCGCTGCATTGTATTTGGGAGGTTGCATTGAAAATGATGATAACTATGCATACAAGCACATTATGTCTTATGTTAAGGCAGGGAGCAGAAAG
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AGCAGGTAGCCTGTGGTTGGACCTTAATGTTGACTGTGAAACGCTTGAGAGAGTCTTTTCCACCAACAATCTTGCTGCTGCTTGGTGGTCTATACATGAAGCAGCTCGTCACTGCATCACTGTTCGGCTTCGCACTCATCTTGGTGGACCCACCCAAACATTTGCTGCTTTAGAGCGAATGCTGTTAGATATAGTGCAAT
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GAAGAGTGGTTTGCTCGTATTTGCGAGGCGCTGATGAATGCTAGCTTAGCAATCCAATGCAATGCAGGTACATTCCATCATGCTGCAACACGTTTGCAAGACCTTAGAAATGCAGCAGCACCAACATTAAGGGATATGGCTAGAAGTCAAACAGCGGATAATTCACAGGGCTTGAGAGCAAAATTGATAAATGATGTGCT
CCGAATCTTACGCCACGCATCACTAGCCTTGTCCAGACTTCATGAGTCAGATGCCATTGTTGGTCTCCAGATATGGGCAACATCGACCTTTGTTACACCTCTTCTAGATGACAGTTTGCTAGGACTGAAAGCTTTGGGAGGATTTGGACTATTTGGATGGATGACAGGTCTTGTATATCAAGCTCGTGGGCAATATGAAA
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AAGTGCCGATGAATCCATTACAACAAGATTGTCTTCTGTGGTTGAAACTCTTACGCGTCTACCATGTTGTGCTACCAGAGTCAAAGTCAACTTTGCAGCTTTGCCAACAAGTCATAAAACTAGCTCGCAAACAAACCAATTTCCAACTGGCTCATCGTCTGCACCAAGAATTGTTGAGTGGTATTTCAAGACGTCACAAA
GATGACTTTTCTGAATGGCTTGTTGCAAGCTTACAGTATGAGAGTATTCTGCTTCTTTTTGCAGAGGGAAAATGTGAGGAAGCCATAGTAGAGCTTTGGTCATTGGTACGTTCTTACATACCATTTTCTGCCTTGTCTGTTTCTGCATCTGGCAATATGTTGAAGGCGAAGGCATGTGTGAAACTGTCATTTTGGTTGAA
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GGAGGAGCAGTGGCTTAGCACACTACAAGATCTTCATGCAGATGTTATGAGACGGATAGCTACACTGAAAGAAGAGGTTTCCAGGGTGGCAGAGAACATTACACTTACTCACAGTGAGAAGGTTAAAATAAATGCTGCCAAGTATTCTGCAATGATGGCACCAATTGCTGTAGCTTTGGAACGGCGTCTAGTTTCCACAT
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CGACTTGCACAGCTGGCTTCTTCTGATGCTCCAATGCCTGGTCTTGAGAAACAGATATCAATGTCCGAATCTGAAGGAATTCCTGGCAGCGATCTTCTGGGCCTGGTTACAATTTCTTCTTTTAGTGAACAGGTCACTATTCTTGCAACAAAGACAAAGCCAAAGAAGCTAGTTCTATTGGGTTCAGATGGTCAAAGGTA
TACTTATCTTCTCAAGGGCCGGGAAGATTTGCGACTTGATGCAAGAATAATGCAGCTTTTGCAAGCTGTGAATGGAATGCTACATGCAAGCACAAGTACACAGGGTCGTTCGCTAGCAGTTCGCTACTATTCTGTAACTCCTATAAGTGGGCGAGCAGGCTTGATCCAATGGGTGGACAATCTTATAAGCATGTATAGTG
TATTCAAAGCTTGGCAGCAGCGTGCACAGTATGCTCAGTTTACATCTACTACTAGTGGTACTGCAGCTGCAAACACTCCCATCCCACCTGTTCCACGTCCCAGTGATATGTTCTATGGGAAGATTATTCCAGCACTAAAAGAAAAAGGTTTGCGTAAAGTCATTTCACGACGGGATTGGCCACAAGAAGTAAAAAGAAAG
GTTCTGTTGGACCTTATGAAAGAGACTCCTCGTCAACTACTTTATCGAGAAATTTGGTGTGCAAGTGAAGGATTCCAAACCTTTAACTCAAAACTACAGAGGTTTTCAGGCAGTGTAGCAGTCATGAGCATGGTGGGGCACATTCTAGGTCTGGGTGATAGACATTTGGATAATATTCTTATGGACTTCAACACTGGTGA
TGTTGTCCATATAGATTATAATGTGTGCTTTGACAAGGGACTGAGATTGAAGATTCCGGAGATAGTACCATTTCGTCTTACTCAGATTATGCAAGCAGCATTAGGACTCATGGGAATAGAAGGCACATTCAGAGCAAACTGTGAATCTGTAATTGACATTTTACGGAAAAACAAAGACATAATCTTGATGCTTTTAGAAG
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CAGAGTTTGGCGGATTTGCTTGATCGGTATGATAGAATATCCACTGCATTTGTCCATGCTGAGCAAGAAAAATCCAAATCTGCTATTGCAGAGGCATCTGCAAAGTCTATTGTTACAGAGGCAGCAAACAATCTTGAAAATGTTCAGATGGCTTATGAAGTACAAGCTCGTGAATTTGCACAGGCCAAGGCACTTGCCAC
TGAAGCTGCCCAGAAAGCTTCTATGTGGGTTGAACAACATAGCAGAGTTCTAGATGCATTACGCAGTGGTTCAGCTCCAGAGCTTCAGGCTATTGGGCAACTTCCTCATACAACTGAGGCTTTGTCTCTAACATCTGCTGTGTTGGCCTCAGGAGTTCCCCTTACCATTGTTCCGGAGCCTACTCTAGCACATTGCCGAG
ATGTTGATAGGGAAGTTGCACACCTTATAAAAGAACGTCATGAAGCTATTTTGCATGCAGCCAAAGCACTACAGACTTACTCTGTGGCTTTGCAACGGCTTCTTCCAGGAAATTACATCGGTACCAGTCAGGTGCATAATTGGGCACAGGTTTTGCAATTGTCTGTGAGGAACCTCTCTCCAGATGCGCTTGCCTTAGCC
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TACAAAACATCTGCAGCCTTCTAACTATCCTAGGAAGGATGAGGATGCTCTTGCTAGGGATTCAGGTCATAACAAACAGGATGAAACCAAGGAGCATGATGCTAGTTCTTCAGACTACGTTGACAAGAAGGTTAAGGTATTAACCGTTCTGTATCTTGCTGCAGCTGCTTTATACAGCGAGATCAAAGACAAGATATTTA
ATATCTGCAATTCTTTGACAGAGAGAACTGCAGTAGGTCCAGGAGAAGATATAGGGTGCCAAAATTGGAAATGGTGTTTACCTGATTTGGAGGAGCAAGTTGCAAGATGTACACTTATTTCGGGAATTGTGAATGAAGTTCAGCAAATGAGTGGACAAAATTTGATCCAACGTGGATCGGGCTGGTGGGATACAATGGGT
TCTGTTGATGATGATTGGACTTTGAGCTTTCAGGGTTGTTTGACTGCAATTCGTAGACTAGTGGGTCAGCTGGTTGGACGTGCAATTCCAGAATCAATAAGATCAGTTCTTTCCCACAACCCTGCAATTATGGAGGCATTTGGTTCACTTTCACAAATACGAGGAGCTGTTGATACAGCACTGGAACAGTTGGCTGAAAT
TGAAATGCAAAGGGCTTCTTTATTAGAACTTGAGAGGACCTACTATGAAAATGTTGAGGAGATCACTGAACGGAAAGTGTCGCTGGAAACGGCTATTGAAAAGGGTAGGGATCACCTTTCTTGGGAAGAAGCAGAAGAGCTTGCAAGTCAAGTGGAAGCCTGTCGAGCCCAGTTGGATAAACTGAAGAATGCATGGGACC
GCCGAGATGCTCAAGCTTCTGCACTTGTGAGGAAAGAGGCAAGTGCACGAGGTGCTTTAGTGGCAGCAGAACAACGCTTTGAGTCTCTTGTTACCATTGAGCGAGAAGGAGACATGCATCCTACAAGGGGAAAAGTTTTACTTGCAACATTTGCTAGGCCATTCTCTGAACTGGAATCCTACAATCAGAAGTTGCCTTCT
TTTGGGTATGAACCCTCCTTGAGAAAGAGTTCAGTGGATCAGACAGAGATTGTCACTTCTGGCTTTTCTGGGTTCGAGTCAGTCTGGAAGGTCACTAATATTTTAAAGGACCATACATTCTTTGTGTGGAAAGTTAGTATTATTGATACTTGTCTTGATTCATGTATCCGTAATGTTGCATCAGCTGTAGATCATACCTT
AGGTTTTGACCAGACGGTTAGCAGTCAGAAGAGGAAGCTTGAGATCCTAGTTGAGTATTATTTAGATCAGTATCTCAAGGAACGGCTTGATCCTGTTCTCCTTGAGTGCCTTGAGAAAGAGGGAGACTCATTGAAGCACATTTTGGTGGATCAAAGGGAGTTGGAATCAAATCTAGCAAAGAAAGAGCTTGATGCGGTAA
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TCTAATGTCTGAACTTAACAAAGTTAACATGCTTCTTCTTCCTCTGGAGTCCATGCTGGCTTCTGCATCAAATACAGTAATTGGTATTATTAACAGGGATGGTGAACAGAAATTGGAAATCTCTGTGGGTCAAGGCCAAGCATTAATCCAATCACTTCATATAAAGCTTGGAGAGGTTTGTCCTGTTTTGACAAGCACAG
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GGATCATCTTCTTCGTCAGGCTACAAGCATTGATAATTTATGTAATATGTATGAAGGTTGGACACCTTGGATATGATGCCCTACAAATAGCCTCTTCAAGTTCCTGCTACTTCTCCTGGAAAGGCAGTGTTATTTTTGAGCTGGCTGGTATTCCCATTGTGTCACTTGTCAGTGATCTCAATCATCGCAGAACAGTTTAG
GGTCCACCTTTTGTCTATCTTGGGTTAGACTCGTCACAAATCATTAGGATAGAAGAAATCCATTTTGGTCAATGGTGAGAATAGAAGAATGCTAAGGAAAATTCATCCATCATGGAAGTTGAGGCTTGAAGAATTGTTACAATCCTCTACTTTCTTTAAGCAAGATTCTGTTAAGGAAACACACAGAGACACCTTGAATT
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TGAGTTGAGAGGGTTACCTGTGAAAAGAAGTACTTCGTTACTGGGTACTTCAGCAATAGATAATATTAGCATGGTGATCAGTAGACAATCGTTTAGGAAAGAGGAGGGTATAGGTAGATCTTCCCTGTATTTATACCCTCTTATCAAGGGTTATTCTTCATTTATATGATTGATTAAATTTCTTTTCACTGGTTCTTCTT
AGGCTCTTTCTATATGAGATCTGTTCACGTGTTTTATGTTTCTAGTTTTGCAAATAGATTATGTTTATTTTTATTCAGCATCTTAAAATACACATAATTGCTTTTCATTGTAACTACTATATTTGAAATGAGTTGTGTTGCTTAGTAAAGAAAGCGGGTTTGGGGA

Intron 12 GTGAGTCCAA ... TGTCAAAAAG

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>TRINITY_DN43993_c0_g1_i6 from sample A8 / Example spliced isoform

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>TRINITY_DN43993_c0_g1_i8 from sample A8 / Example unspliced isoform:

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GGGAGAGCTCACACAGGATCTTCAGAAGGCAAACCTTGAGGCTGCCCAATTAGAGTGGCTTCATGATTATATACTTTCTCATTTAGATCAAAATACTATCCTCCAACAGAGCTGTGCAAATGAAGACAATTTTCCATCAAGCTCTATAAAGCTTAACAGAAGAAATTTATTAGAAAACCTTCGATCTGCAATGTCCGCTA
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