sp|Q9FNY2|DPB_ARATH ----> Transcription factor-like protein DPB

Intron 1 GTAAGAGAAT ... TGGTTTTCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	21.11	142	38	17
A2	28.07	205	80	9
A3	28.31	233	92	4
A4	24.21	144	46	1
A5	25	87	29	2
A6	26.56	893	323	10
A7	25.07	756	253	4
A8	27.45	436	165	5
A9	22.85	719	213	8
A10	25.95	665	233	0

>TRINITY_DN122723_c0_g1_i4 from sample A1 / Example spliced isoform

GTCGCGACTAATAAATCAGTGATTCGTGTGATTGTTCTGTTATTTTACTGCGTATCTGATTGTTGGAAGGAAGGCAGCTATGGCGAGTCTAATAGCAGCCAGGCTTGGCACGTCCTCGAGGTTGAAGCCTGCGTTTGCCCATCTTTTGCGAGCAAATATATTGTCAAAACTTCTAGTTGGAGGGCATGAGCATGTTCGGA
ATATAACTTCTCATGTAGCACTGGACTCTCAGGCTGGTAGAAAGGATCTCAGGCTTCCATTTGCAGTCAAAACTTCTATACGATCATTTTGTTCAGACATCAGTGCATTACCCCAAGTAACAGACCTCGATGTTAAGAATGCACTGAAGGACGTATTGGCTGCAGATTGGGAGGAGCTTCCTGAACCTTTACAGGCTGAT
GTTATGAATGCATTGTCAAAGGAAACAGATGATAAGGCTGGACAGGAAGCTCTAACAAATGCATGGCGTGCAGCTGAGGCAGTGGAGCAGTTCTCTGGAGTTTTGGAATCCTTGAAAATGGAGCTAGATGAAATAAGTGGGCATACAGGCGAGAATGTGAGACCCTTGCCAGTGGAAATTCAAGATGCTTTACGGGCTGC
ATATAAACGTTACAGCAATTACTTGGAGGCATTTGGCCCAGATGAAACTTACTTGAGAAAGAAAGTTGAAACAGAGCTAGGCCGTCAAATGATTTATATAAAGATGCGATGTAGTGGGCTTGGCGCAGAATGGGGAAAGGTTACACTTATTGGCACCTCTGGACTTTCTGGCTCATACATTGAGCAGCGTAGTTAACCTT
GTTAAAGCTATCCCTGAGAGGCCGGGGATACAGTTTGAGCATAAAGCTCGTGGAACCTTGTCAAATTTTCAATTTATGTTATGCATACTGCATAGCATGATTTAGATGGAAGATGGGTGCAGCATTTGTGCACTTGCTGTTTTTCACCAGGAATTGGGTTAGTGACGCTGTTGGTTGTTGTGAAGACTATTGATATAGAT
TCTGGGATTGTGGAACAAACTTGTATTTGAAGAGAATAAAAGAATGGCCTTGTACATCATACATTTCTCATAGAAGAATCTGGTTAATGCTAGAGCTTGTATGGCTGTTTTGGCATATAAACTAAAAATACATGTAATCACTATTATGAGATCCGTTTTTTTACTGAAGTGGGCATTCAGATGTGCTTCAGCCTTCCTTA
CACCATCTGGTTGATTGTCATACTCTGGTATGTCTTATTGGATTATGGCTTCTTAACCTACATCTTACCCTAACAACTAGTTTTTTCATTAAAAAAAAA

>TRINITY_DN122723_c0_g1_i5 from sample A1 / Example unspliced isoform:

GTCGCGACTAATAAATCAGTGATTCGTGTGATTGTTCTGTTATTTTACTGCGTATCTGATTGTTGGAAGGAAGGCAGCTATGGCGAGTCTAATAGCAGCCAGGCTTGGCACGTCCTCGAGGTTGAAGCCTGCGTTTGCCCATCTTTTGCGAGCAAATATATTGTCAAAACTTCTAGTTGGAGGGCATGAGCATGTTCGGA
ATATAACTTCTCATGTAGCACTGGgtaagagaatgcaaattctcatttccatgtcactatgtttcttagtttgattcgtaatttttatcttatgtgctaagtttatgttgttggttttcagACTCTCAGGCTGGTAGAAAGGATCTCAGGTAGGCATTGAGAGATTTATTAGGACTATCATACATATGTGCTATCTGGAA
AATAGCATTTGCATGTTCGACAAATATGGTCATGACTATTGAATGCTTTCCATGTAATCAATGGGGCTCTTCCTTTTCTTATAAGCATCTTTCTTTACATTTAATTGAAGGAACTTTTCTTTGTTTGCTTTTGTATGATCCTTCTGTAAAAGGCAATCAAGTAGGGCTTGTTTTTCATTTGACACTGATGTCTTGAAGAC
AGGAATGAAGGGCACTTGGGCCCAATCTGTTTTGAAGGATGTTGTAATAAGTAGAATCTGATAGGTTACCGACTGTTTCTGAACTTTGGTCATGAGCCGAGAGGCTAAGCTGTTGTATATTTTGATTTCAAGCTTGAAATATAAAATATAAAGTTTTTTTTTCTTGGAAAAAAAGGATTATATGATGGTACAAACTTTCT
TTAATCCATAACAGGGTTTGATTTAAGTACAATCTCTAGCAATGCTAAGAATGTACTATGAGCATCCTGCCTTTTATGTCTTCTCTATGAGACTTCGTTTGTCATACTTCAGTGGCCCTTTTGTTCAATCCATTTTCTAGTTGACTACTTATCAATTGCATGGCCAGTGCATGGTTGATAGTTACATGTTCTGATCTATA
GTATGATTTGACGTCAACAATAAGTGGTGACATTGTACTGTTGTAGTTGTATAATAGTTATACAACATACCTATCAACGATAATATGGTTGAAGGCTTCCATAATATCTAGAACAAAATCCATAAATTGTTACAGCTCTAGTTAGGAAAGGC

Intron 2 GTACAGTTAC ... CTCCACGAAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	19.61	123	36	24
A2	22.13	183	56	48
A3	20.9	212	54	58
A4	21.44	185	62	39
A5	17.91	110	33	15
A6	21.38	1403	383	380
A7	22.76	1108	352	301
A8	21.09	679	169	194
A9	21.8	911	249	259
A10	20.99	753	199	201

>TRINITY_DN45954_c1_g1_i4 from sample A7 / Example spliced isoform

AAACTGTTGATCTTAGGGATCAATAAAAGTTTTAAAGAATAAGCTTTCACAGCAATAGTTAAAAGGCTTATAAATACAGCTTACAGCGAGATTTCAGAACGTCCGAGGCGGAGCAGGGCATTATTCAAGATTTCCCCGCTTCCAAATTTTACAAGGGTTTTGCGGTTTTTATTTTCATTTTTTTTCTCGATTTCTGCTTT
AGTTGCGCTCGCGTTCTACAGTCTCGAACTTTGGACTTCTCTGGGAGCATTTGGATATTTTTATCATTCAAAATGCTTCCTTTGTCACTACTAAGGACAGCTCAAGGCCATCCCATGCTTGTTGAGTTGAAGAATGGCGAAACTTATAATGGACACTTGGTGAACTGTGATACTTGGATGAACATACATTTGCGTGAGGT
CATATGTACATCCAAGGATGGTGACCGTTTTTGGCGAATGCCTGAGTGCTATATCCGTGGGAATACTATCAAATATCTTCGTGTACCTGATGAAGTTATTGATAAAGTTCAAGAGGAGAAACGAATAGATAGGAAGCCTCCTATTACCGGTCGGGGAAGAGGCAGAGGGAGAGGGGACGAAGCTGGTGGAAGGGGACCAC
CCAGAGGTGGTGGCCGAGGATATCAAGAAGAGGGGGGAGGTCGGGGTGGAGGTCGTGGTAAAGGTGTTGGAAGGGGACCAATTGGAAGAGGGGGTGGCCGTGGTCGTACTTGAGAGCTGCTTATTTTATTGTAGCATGGAAGCAGTTTTTGACAATATTCATTTCACTCGATTTTCTGCTGATTGGAAGGTTGCTTAGAA
GACAAAGGACGATGTTGCATATCCTACATTGGCCTTCTGCTTCTCTAGAAATCTTGTATAGCACTGTTTAAAAATCTCCCAGCCCCTTGTTCGACATGGCTGATTTTTGGATACCAATAATGAAGTGCTATTGTTGTGTGTTGTGTAGTTTTGTGTTTAAGAACTGAAGGGTTGGGCCAGGGGGAGGGAGTGCTATTGTC
CATCTGGTATTCTAATTTAGCATAGTTTGATCGGTCGTACCCTTAGGTAATTGGTATAGATATTATTACAAATCAATGTTAAAAGTACATTTTCTCTAGTTTACGCAAGATGTGTGCTTGTAATATCAAACACTGTTTGAAGATTCTATTTGATCCTAAGTTAGTTGCAACACATGCATGTGATTTTTCTCCATTATCTA
TTTTCAATGGCAATTGTTTGATCATTATCTATTATCCAA

>TRINITY_DN45954_c1_g1_i2 from sample A7 / Example unspliced isoform:

AAACTGTTGATCTTAGGGATCAATAAAAGTTTTAAAGAATAAGCTTTCACAGCAATAGTTAAAAGGCTTATAAATACAGCTTACAGCGAGATTTCAGAACGTCCGAGGCGGAGCAGGGCATTATTCAAGATTTCCCCGCTTCCAAATTTTACAAGGGTTTTGCGGTTTTTATTTTCATTTTTTTTCTCGATTTCTGCTTT
AGTTGCGCTCGCGTTCTACAGTCTCGAACTTTGGACTTCTCTGGGAGCATTTGGATATTTTTATCATTCAAAATGgtacagttacgcttcttcattctatcattatgtttctgcaagtccgaactagtttgtttgatttagcttggttgcagtttcaagtatatagttagttgttttgtgggttcgcatctcttgtgcat
ctttattgtcagtttaaggtcagggtctcggacggatgggttatggagggtttacaagttttcattggatatattttacggaattgatgcggttttgcataatactctttaccccctctttaagtacttgactttgaggtggcctggcctgttttctcactggaaatctttgaattcctcgtgcgtgccattttcacccc
atcacaattccatagagaataatggaaatcttgggcaaattcctgaaagacggaccatttcttctttcttctgactaactcttgttactgatgtcatctgttgcaatgatgatgccttctactttgctgctggccataccacttctttatgcctccacgaagCTTCCTTTGTCACTACTAAGGACAGCTCAAGGCCATCC
CATGCTTGTTGAGTTGAAGAATGGCGAAACTTATAATGGACACTTGGTGAACTGTGATACTTGGATGAACATACATTTGCGTGAGGTCATATGTACATCCAAGGATGGTGACCGTTTTTGGCGAATGCCTGAGTGCTATATCCGTGGGAATACTATCAAATATCTTCGTGTACCTGATGAAGTTATTGATAAAGTTCAAG
AGGAGAAACGAATAGATAGGAAGCCTCCTATTACCGGTCGGGGAAGAGGCAGAGGGAGAGGGGACGAAGCTGGTGGAAGGGGACCACCCAGAGGTGGTGGCCGAGGATATCAAGAAGAGGGGGGAGGTCGGGGTGGAGGTCGTGGTAAAGGTGTTGGAAGGGGACCAATTGGAAGAGGGGGTGGCCGTGGTCGTACTTGA
GAGCTGCTTATTTTATTGTAGCATGGAAGCAGTTTTTGACAATATTCATTTCACTCGATTTTCTGCTGATTGGAAGGTTGCTTAGAAGACAAAGGACGATGTTGCATATCCTACATTGGCCTTCTGCTTCTCTAGAAATCTTGTATAGCACTGTTTAAAAATCTCCCAGCCCCTTGTTCGACATGGCTGATTTTTGGATA
CCAATAATGAAGTGCTATTGTTGTGTGTTGTGTAGTTTTGTGTTTAAGAACTGAAGGGTTGGGCCAGGGGGAGGGAGTGCTATTGTCCATCTGGTATTCTAATTTAGCATAGTTTGATCGGTCGTACCCTTAGGTAATTGGTATAGATATTATTACAAATCAATGTTAAAAGTACATTTTCTCTAGTTTACGCAAGATGT
GTGCTTGTAATATCAAACACTGTTTGAAGATTCTATTTGATCCTAAGTTAGTTGCAACACATGCATGTGATTTTTCTCCATTATCTATTTTCAATGGCAATTGTTTGATCATTATCTATTATCCAA

Intron 3 GTCAGTATGC ... TGTTTGATAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	75.27	23	95	45
A2	75.32	19	67	49
A3	65.43	42	122	37
A4	69.23	24	68	40
A5	57.25	28	54	21
A6	65.41	55	136	72
A7	57.6	92	188	62
A8	67.17	65	176	90
A9	63.69	57	132	68
A10	65.02	78	203	87

>TRINITY_DN114792_c1_g1_i3 from sample A3 / Example spliced isoform

ATACAAGGTTGAATTCGTTCGCAACCTAGTTCTGTAGTTTGTTTGGGAAATGAGATAGCCCGAAGGCTTGTTACCTCTTTTGTTCCATTTTATATATAGATTGTTAGATCAAAGCGAGTGAGGAAGGACCACCATGACCCTGGCGGACTCACCAAAGCACGACAACTCCAAATCTTTAAAAAGGAAGTGATCGCAACTCT
TGGGGGGGAAGCAGTTTTTGAGATGGTCTGCGTCTGAGATCTAGCCCAGTGTTTTCTCGAGTGAACCTTGTCTCTGCGGGGTAGCAATTTTGGGTGATCTGCGACTAGATCTAGCTCGGTTTTTATCCTGGAGTGAACGCTATCTCTGCTATGTCAGTGCAAAGGTTAAAGGGAGCTCGTCGGGAAGGGAAGAAATCTGT
TATGGAAAAACTGTGATCCGAGTAAGGTAGATGATAAATGGTGGCTGCGCACTCAGAAGATGTATTTCTAATATATATTAATGCCTGGATATGTTGCTTTGAGGAAAGAAGGATTATGAGGCAGTAGCTTCGAATTTATGTTTTTATTTATGCCGGAGGTCAAAGGAGAATTTTAACTGAGTGCTAGATTTTGTTGATGA
ATTAGACTTCTGTATGGCGGATATTTGTAGCATTTGAAAGTGTAGTAATCTTGGTTGCTGCTTTTCTTGGATTCTTCAATCCTGTCGTTTTTTCCCTTCTGGCAATACCATTTGGTGACTTGGTGTTTCCTTTCTGCGTATATGAAGTTGCAGATCTACCATTACTACCGCTTGGAACTGTCAATGCTTACTGTTTGGTT
GATTTTTATTTCTGAATCTTTATTTATTTTTGTTGATGACTGCGAATCCATCCATTGATGACCTCGATTTAGTTGGTCTTCCCTCTATCTATTTTAATGACTGCGGTTTGAAGTTCCAATTCTACCTATGCCTGCAATTTAGGTTTTACTCTTTAGATTGTAACCAAGGATTCAAGATCAGACTACTATTCTCTTTGAGA
TGTTATATTGGTAGTAATTGTGAACCTTAGCAATCTTGGTTGATTGGTTGGATTTTACATAGAATTTTTAATGAACTATATTGTAGTTCTAAATAGTGGTTGTAGTATTCACCGTAGCAGATATGGATACTTTATCCTCTATGTATAGATGTTATTTTGATAATAAGCGTAAAAGCCCTGGTAACTTTAATCGCTGGACG
ATTGATTGCATATTTTCTGATGAACGATATTCAGTTCATAATTTTGGTTATGACTGCGTTTTGAAGTGCCATATTTTAACATTGCTTACGATTTGGTTACACTCCCTTGTGGTGTATAGTATGTCTAGATAAATGAAGATTCAGGTCTACTTTTCTGCATATAGTAGGTCTAGAAAGAAGTAATGTAATCTAGGTATACA
TTGCAGGATAATTTATTTAATCGCTGGAAGTTACTTCTATCCAAAAGTTGAATACTACGCGGCTCTACAATTTCCTTGCATGTATTTATATTAGTCATTTGATAGAGTTTTGCATGTATAAGAGGTCGATTATACAAGTTAACGAAATCGCAAGATGTCTTTGATTGAAAAATAATAAACATTATAATGGGCTAGCTTAC
ATTGCTTTGATCTCGTAACTCTCTGATTTGAATGTTAATATGATGCTTAAGTTATTTCCTTGTTGTGTATCAATCAAGTGAATTTTTTTTGTTCATCGAATAGATTGTTTTGGGATGTTTTCTCCTTTGGTTAAAGTTTAGAAATACATTAATGTTTATAATATATCTTTAGGTTATAGGATTTCTTAAACTCGGAAAAC
TGTCCAGTTTAATATGTATCTTATGTAAAGGAATTGATACCCATAGTTAAGATCTACTTCTAGCCTTTGTTACGGTTAATTGCTACCTTGAAGGTATTAAATGTATATGGTTGATTCATGAAAAGATCTATGTGATAGAGGCTTGACGGAAGAAGAAGGAATCTTGTTACAGCAACCATGTTGCTTGTTGTAATCTTATT
ACCTCTTTGCCTAATAATAAATGATGCACACACC

>TRINITY_DN114792_c1_g1_i1 from sample A3 / Example unspliced isoform:

ATACAAGGTTGAATTCGTTCGCAACCTAGTTCTGTAGTTTGTTTGGGAAATGAGATAGCCCGAAGGCTTGTTACCTCTTTTGTTCCATTTTATATATAGATTGTTAGATCAAAGCGAGTGAGGAAGGACCACCATGACCCTGGCGGACTCACCAAAGCACGACAACTCCAAATCTTTAAAAAGGAAGTGATCGCAACTCT
TGGGGGGGAAGCAGTTTTTGAGATGGTCTGCGTCTGAGATCTAGCCCAGTGTTTTCTCGAGTGAACCTTGTCTCTGCGGGGTAGCAATTTTGGGTGATCTGCGACTAGATCTAGCTCGGTTTTTATCCTGGAGTGAACGCTATCTCTGCTATGTCAGTGCAAAGGTTAAAGGGAGCTCGTCGGGAAGGGAAGAAATCTGg
tcagtatgctgacttacgttcatagatctttttttttcttattttgtatgctgagttacatttcgtagatattgtgatcttggtaggagaagtaggattcagttttccaagttttatgagagtgtaagtacatggaatcatgaactgtatgcctagctgagagtgttcgcattataatcaccttacatccttctgttttg
aaagaatcaccgtagttctctgctaaatacctggttgatttagattgacgagatccgattaaatggaaatttgtaatagatgcattgtgcttatttagatggttccttgtttgatagTTATGGAAAAACTGTGATCCGAGTAAGGTAGATGATAAATGGTGGCTGCGCACTCAGAAGATGTATTTCTAATATATATTAAT
GCCTGGATATGTTGCTTTGAGGAAAGAAGGATTATGAGGCAGTAGCTTCGAATTTATGTTTTTATTTATGCCGGAGGTCAAAGGAGAATTTTAACTGAGTGCTAGATTTTGTTGATGAATTAGACTTCTGTATGGCGGATATTTGTAGCATTTGAAAGTGTAGTAATCTTGGTTGCTGCTTTTCTTGGATTCTTCAATCC
TGTCGTTTTTTCCCTTCTGGCAATACCATTTGGTGACTTGGTGTTTCCTTTCTGCGTATATGAAGTTGCAGATCTACCATTACTACCGCTTGGAACTGTCAATGCTTACTGTTTGGTTGATTTTTATTTCTGAATCTTTATTTATTTTTGTTGATGACTGCGAATCCATCCATTGATGACCTCGATTTAGTTGGTCTTCC
CTCTATCTATTTTAATGACTGCGGTTTGAAGTTCCAATTCTACCTATGCCTGCAATTTAGGTTTTACTCTTTAGATTGTAACCAAGGATTCAAGATCAGACTACTATTCTCTTTGAGATGTTATATTGGTAGTAATTGTGAACCTTAGCAATCTTGGTTGATTGGTTGGATTTTACATAGAATTTTTAATGAACTATATT
GTAGTTCTAAATAGTGGTTGTAGTATTCACCGTAGCAGATATGGATACTTTATCCTCTATGTATAGATGTTATTTTGATAATAAGCGTAAAAGCCCTGGTAACTTTAATCGCTGGACGATTGATTGCATATTTTCTGATGAACGATATTCAGTTCATAATTTTGGTTATGACTGCGTTTTGAAGTGCCATATTTTAACAT
TGCTTACGATTTGGTTACACTCCCTTGTGGTGTATAGTATGTCTAGATAAATGAAGATTCAGGTCTACTTTTCTGCATATAGTAGGTCTAGAAAGAAGTAATGTAATCTAGGTATACATTGCAGGATAATTTATTTAATCGCTGGAAGTTACTTCTATCCAAAAGTTGAATACTACGCGGCTCTACAATTTCCTTGCATG
TATTTATATTAGTCATTTGATAGAGTTTTGCATGTATAAGAGGTCGATTATACAAGTTAACGAAATCGCAAGATGTCTTTGATTGAAAAATAATAAACATTATAATGGGCTAGCTTACATTGCTTTGATCTCGTAACTCTCTGATTTGAATGTTAATATGATGCTTAAGTTATTTCCTTGTTGTGTATCAATCAAGTGAA
TTTTTTTTGTTCATCGAATAGATTGTTTTGGGATGTTTTCTCCTTTGGTTAAAGTTTAGAAATACATTAATGTTTATAATATATCTTTAGGTTATAGGATTTCTTAAACTCGGAAAACTGTCCAGTTTAATATGTATCTTATGTAAAGGAATTGATACCCATAGTTAAGATCTACTTCTAGCCTTTGTTACGGTTAATTG
CTACCTTGAAGGTATTAAATGTATATGGTTGATTCATGAAAAGATCTATGTGATAGAGGCTTGACGGAAGAAGAAGGAATCTTGTTACAGCAACCATGTTGCTTGTTGTAATCTTATTACCTCTTTGCCTAATAATAAATGATGCACACACC

Intron 4 GTAAATCTTG ... CTAATTGCAG

Found issues: Low number of reads

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	80	1	4	4
A2	100	0	1	1
A3	60	1	3	0
A4	-1	0	0	0
A5	100	0	1	2
A6	33.33	2	1	1
A7	100	0	8	4
A8	100	0	2	2
A9	100	0	1	0
A10	-1	0	0	0

>TRINITY_DN45954_c1_g1_i12 from sample A7 / Example spliced isoform

AAACTGTTGATCTTAGGGATCAATAAAAGTTTTAAAGAATAAGCTTTCACAGCAATAGTTAAAAGGCTTATAAATACAGCTTACAGCGAGATTTCAGAACGTCCGAGGCGGAGCAGGGCATTATTCAAGATTTCCCCGCTTCCAAATTTTACAAGGGTTTTGCGGTTTTTATTTTCATTTTTTTTCTCGATTTCTGCTTT
AGTTGCGCTCGCGTTCTACAGTCTCGAACTTTGGACTTCTCTGGGAGCATTTGGATATTTTTATCATTCAAAATGGTACAGTTACGCTTCTTCATTCTATCATTATGTTTCTGCAAGTCCGAACTAGTTTGTTTGATTTAGCTTGGTTGCAGTTTCAAGTATATAGTTAGTTGTTTTGTGGGTTCGCATCTCTTGTGCAT
CTTTATTGTCAGTTTAAGGTCAGGGTCTCGGACGGATGGGTTATGGAGGGTTTACAAGTTTTCATTGGATATATTTTACGGAATTGATGCGGTTTTGCATAATACTCTTTACCCCCTCTTTAAGTACTTGACTTTGAGGTGGCCTGGCCTGTTTTCTCACTGGAAATCTTTGAATTCCTCGTGCGTGCCATTTTCACCCC
ATCACAATTCCATAGAGAATAATGGAAATCTTGGGCAAATTCCTGAAAGACGGACCATTTCTTCTTTCTTCTGACTAACTCTTGTTACTGATGTCATCTGTTGCAATGATGATGCCTTCTACTTTGCTGCTGGCCATACCACTTCTTTATGCCTCCACGAAGGTCAATTTCTCGTCATAGAGATCTTCCGTCACCATGTT
TTATTTTATTTTCAGAACAAGTACGCCTCAATGAAATAACATGTCCTCCCCAAATTGGATAAATAAAATACCTTTTCCTCATGTACTGAGGCATTGCCCTTCTTAAAGTGAACTAACTATGCTATCATTGCATATGCCCGTGATTGTGCACAGCATACCTCATCTGCATCATTGGGATCTTTATCAGATTTGTGGGCAGT
TAAATTGGTTTCTAGATCATAAATTGTAGATATAAACACCCCAAGATGAGATTCTAGAGTTGCAGGTCATTATTGCTTCTGCTTTGCATACCTTATTACTTGGAGCTCATATTCACTCTATAATTGGAGGCCAATATTTCTTCTAGTCAATGTCTCCTTCAGTGGTTCAGTTTATTCATACGCAGACTTTAGACATTCTA
GCTTCGTAGGTACTCTCAAAGAACTGTTACAAGACGTACTTGGACTTCCTCTATGCATGGGGCCTTGACCTATAATGTTAAACATAATATCTGCTGGATATGGTTCTTTCTTGCTGCTGGAAGCCTATGGCACTCGGCTTCAAGTTTTGAAACCACATTTGCATTTCCCGATTTTGCGTATGTACAATTTCCGCATCCCT
TTTACTGCACTCCCTTTCATTTGTCTGATTTTCCCATTATTTCTGCAACAAATAATTCTCGTATTTCAGTCCAAAATTCTCTTTCAGTGCGAAATTTATCTTAGTGTATATAGG

>TRINITY_DN45954_c1_g1_i1 from sample A7 / Example unspliced isoform:

AAACTGTTGATCTTAGGGATCAATAAAAGTTTTAAAGAATAAGCTTTCACAGCAATAGTTAAAAGGCTTATAAATACAGCTTACAGCGAGATTTCAGAACGTCCGAGGCGGAGCAGGGCATTATTCAAGATTTCCCCGCTTCCAAATTTTACAAGGGTTTTGCGGTTTTTATTTTCATTTTTTTTCTCGATTTCTGCTTT
AGTTGCGCTCGCGTTCTACAGTCTCGAACTTTGGACTTCTCTGGGAGCATTTGGATATTTTTATCATTCAAAATGGTACAGTTACGCTTCTTCATTCTATCATTATGTTTCTGCAAGTCCGAACTAGTTTGTTTGATTTAGCTTGGTTGCAGTTTCAAGTATATAGTTAGTTGTTTTGTGGGTTCGCATCTCTTGTGCAT
CTTTATTGTCAGTTTAAGGTCAGGGTCTCGGACGGATGGGTTATGGAGGGTTTACAAGTTTTCATTGGATATATTTTACGGAATTGATGCGGTTTTGCATAATACTCTTTACCCCCTCTTTAAGTACTTGACTTTGAGGTGGCCTGGCCTGTTTTCTCACTGGAAATCTTTGAATTCCTCGTGCGTGCCATTTTCACCCC
ATCACAATTCCATAGAGAATAATGGAAATCTTGGGCAAATTCCTGAAAGACGGACCATTTCTTCTTTCTTCTGACTAACTCTTGTTACTGATGTCATCTGTTGCAATGATGATGCCTTCTACTTTGCTGCTGGCCATACCACTTCTTTATGCCTCCACGAAGGTCAATTTCTCGTCATAGAGATCTTCCGTCACCATGTT
TTATTTTATTTTCAGAACAAGTACGCCTCAATGAAATAACATGTCCTCCCCAAATTGGATAAATAAAATACCTTTTCCTCATGTACTGAGGCATTGCCCTTCTTAAAGTGAACTAACTATGCTATCATTGCATATGCCCGTGATTGTGCACAGCATACCTCATCTGCATCATTGGGATCTTTATCAGATTTGTGGGCAGT
TAAATTGGTTTCTAGATCATAAATTGTAGATATAAACACCCCAAGATGAGATTCTAGAGTTGCAGgtaaatcttgcttcccaagttgtccctgatcgattgtcatcagttgatcagaatcttctccttcgcattatttattacttagagctcgttcatacatattcactttctaattgcagGTCATTATTGCTTCTGCTT
TGCATACCTTATTACTTGGAGCTCATATTCACTCTATAATTGGAGGCCAATATTTCTTCTAGTCAATGTCTCCTTCAGTGGTTCAGTTTATTCATACGCAGACTTTAGACATTCTAGCTTCGTAGGTACTCTCAAAGAACTGTTACAAGACGTACTTGGACTTCCTCTATGCATGGGGCCTTGACCTATAATGTTAAACA
TAATATCTGCTGGATATGGTTCTTTCTTGCTGCTGGAAGCCTATGGCACTCGGCTTCAAGTTTTGAAACCACATTTGCATTTCCCGATTTTGCGTATGTACAATTTCCGCATCCCTTTTACTGCACTCCCTTTCATTTGTCTGATTTTCCCATTATTTCTGCAACAAATAATTCTCGTATTTCAGTCCAAAATTCTCTTT
CAGTGCGAAATTTATCTTAGTGTATATAGG