sp|Q84JF4|NAGS1_ARATH ----> Probable amino-acid acetyltransferase NAGS1, chloroplastic

Intron 1 GTAAGCACAA ... TTTTTTTCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	22.26	117	20	47
A2	19.21	82	9	30
A3	23.27	94	21	36
A4	24.92	113	28	47
A5	23.81	56	16	19
A6	22.45	38	15	7
A7	22.5	93	13	41
A8	20.63	25	4	9
A9	18.7	50	10	13
A10	19.51	66	16	16

>TRINITY_DN118471_c2_g1_i2 from sample A2 / Example spliced isoform

GCATATTCTACCTTGGGAATCTACCCTGTGCTGGTGCATATTCTACCTTGGGAAGCTACCCTGTGCTGGAAGGGTACATGCCCCAATTTCCCACGGCCCCACCAATCCCCTACTGTCTCTCTCGAAACCACACGAACTTTAACCCGTGCATTATAAATAGCGCCTCGGTGCTTGCAAATTTAGTTCGTTCCCATGTCGCC
ACGATCGCTTCCCTAGAATGTCAACTGGTCGTGTATTCTTTGCTAATCAACAATGGCGGACCGTGGGATTCTTTGGCCGTGGCGGTTCGATTCCGTGAATTTACATTTTTCTGGCAATAATGTGCGTTTCGTAGCCGTGAAACTCGTGTAATTTTTACGAACAAAGGCGGCTGAGCTGTGGGTGTCTCCAAGTTCCAACT
TTCACCTGAAATATGATATCTTAATCGAGAAGATTTTAGCAGTAGAAGCTTTGAGAATGGCTTCTGCTGTCGGATTTATTAATAATGGCTGGGTTTGCGCCGGAAACCCCAGAAAAGAGTCTGTTTTCAGCGGGAATTCAAGCAGCCTGCATAATCAATTCAATCTCCTCGGACGGAATGTCTCTGGCTGGGGAAATGCC
TGGGCTTTGCCATCAGCAGTGCCAGTTGTTTCTCTTGGTCGAAGTGCCCGGAGAAGCCATTTGGTGCCACCACTGACAGCCTTGCGGGAGAAGCACCTTGGTGGGTTGAGTGTCTGGGAACCTGGCTTGCGGAGCCTTCCGTCACTGTGGGATGTCTTTGGGCAGAAGGGCTTTTGCTTGGCTTGCCGTTGCATGCCTGA
TAACGGCGATCCGGCCAATGGGGTGTCTGATTCTGCCCAGGATCAGGAGCAGTTCGTTGGATGGTTTAGACAGGCCTGGCCTTACATACAAGGCCACCAGGGGAGCACGTTTGTTGTCGTGATTTCGGGCGAGATCATGGCAAGTCCTCTCATCGACTACATTCTTCAGGATATTTCTCTCCTCCATGGTTTAGGAATCA
AGTTTGTGATTGTTCCAGGAACACATGTTCAGATTGATCAACTTTTGCAGGAGAGAGGAAATAAGGCCAAATATGTTGGGCGGTATCGAATTACAGATCCTGCATCTTTAGAAGCAGCAATGGAGGCAGCTGGTAGAATTCGTCTTACAATAGAAGCCAAACTCTCTCCAGGACCGCCGATTCCAAGCCTACGGCGACAT
GGTGACAATGACCGCTGGCATGATGTTGGAGTAAGTGTGGCCAGTGGGAATTTTCTGGCAGCTAAGCGTAGAGGAGTTGTTGGTGGAATCGATTATATGGCAACTGGGGAGGTAAAAAGAATTGATGTTTCTCGGATACGGGAGAGACTTGAAGCTAGTTGTATTGTCATAGTGAGCAACCTAGGCTACTCCAGCTCTGG
GCAAGTTCTAAATTGCAACACATATGAGGTAGCTACTGCCTGTGCACTGGCTCTTCAAGCAGACAAACTCATTTGCTTTGTTGATGGTCCTATTCTAGATGAAAATGGAAGGTTAATTCGTTATATGACTCTTCATGAGGCAGACCAGCTTATACGGAAGCGAGCTGAGCGAAGTGAAATTGCTGCAAAATATGTACAAG
CTGTTGCTGGCACTGATAGTAATCACCTGGAATATTCTGGTGTCAATGGAAGGGACACTTCATTGCGACAAGACTTTGGTGCTAGTAAAGGGTTTGGTACAACATTTCAGAATGGTGTTGGTTTTGATAGTGGAAATGGACTTGGTGTTGGAGGACAGGGATTTGCTATTGGTGGAGAGGAGAGGCTGAGCAGATTAAAT
GGATACCTTTCAGAACTAGCGGCGGCGGTTTTTGTTTGCAGAGTAAGATTTTCAGCTCTTAAAATGATATATTGTAGCTACATTTATCAGGTTTCTGCTTTGTTTTTACTGGCTGCAGATTCCAGAATGAATGCATTCTGGAAATTAATCTCACT

>TRINITY_DN118471_c2_g1_i4 from sample A2 / Example unspliced isoform:

GCATATTCTACCTTGGGAATCTACCCTGTGCTGGTGCATATTCTACCTTGGGAAGCTACCCTGTGCTGGAAGGGTACATGCCCCAATTTCCCACGGCCCCACCAATCCCCTACTGTCTCTCTCGAAACCACACGAACTTTAACCCGTGCATTATAAATAGCGCCTCGGTGCTTGCAAATTTAGTTCGTTCCCATGTCGCC
ACGATCGCTTCCCTAGAATGTCAACTGGTCGTGTATTCTTTGCTAATCAACAATGGCGGACCGTGGGATTCTTTGGCCGTGGCGGTTCGATTCCGTGAATTTACATTTTTCTGGCAATAATGTGCGTTTCGTAGCCGTGAAACTCGTGTAATTTTTACGAACAAAGGCGGCTGAGCTGTGGGTGTCTCCAAGTTCCAACT
TTCACCTGAAATATGATATCTTAATCGAGAAGATTTTAGCAGTAGAAGCTTTGAGAATGGCTTCTGCTGTCGGATTTATTAATAATGGCTGGGTTTGCGCCGGAAACCCCAGAAAAGAGTCTGTTTTCAGCGGGAATTCAAGCAGCCTGgtaagcacaattcttgttattatttttttatatgtcaacataaatccgtgt
gaatggcgccgaagatttgaataatgtctgttattgggaatatctctttgtaagttgtcggaacggggcgaattctgttattccgtgtattggctgcctcttaatctgtagaaatgtcctggccactaaattgtaagaagcgggttttgcaatgtgctttcttgttcagtggaacgaatttaagctcattacacagggtt
ttatagagagcaagcacagcaaaaaaggttgacgttcgacgtgctttaatcggaatcaatttgtacttcgttctctggggtttagggtttaacgctttttgttcctttgatagtttagattattgtttttgtctttacttttcaggacatgccctcggcactcttatcttatctatatgggatcgatgttctttttgagt
cttattgatctgatttagtcgtttgtggctttaatctaatttttttcagCATAATCAATTCAATCTCCTCGGACGGAATGTCTCTGGCTGGGGAAATGCCTGGGCTTTGCCATCAGCAGTGCCAGTTGTTTCTCTTGGTCGAAGTGCCCGGAGAAGCCATTTGGTGCCACCACTGACAGCCTTGCGGGAGAAGCACCTTG
GTGGGTTGAGTGTCTGGGAACCTGGCTTGCGGAGCCTTCCGTCACTGTGGGATGTCTTTGGGCAGAAGGGCTTTTGCTTGGCTTGCCGTTGCATGCCTGATAACGGCGATCCGGCCAATGGGGTGTCTGATTCTGCCCAGGATCAGGAGCAGTTCGTTGGATGGTTTAGACAGGCCTGGCCTTACATACAAGGCCACCAG
GGGAGCACGTTTGTTGTCGTGATTTCGGGCGAGATCATGGCAAGTCCTCTCATCGACTACATTCTTCAGGATATTTCTCTCCTCCATGGTTTAGGAATCAAGTTTGTGATTGTTCCAGGAACACATGTTCAGATTGATCAACTTTTGCAGGAGAGAGGAAATAAGGCCAAATATGTTGGGCGGTATCGAATTACAGATCC
TGCATCTTTAGAAGCAGCAATGGAGGCAGCTGGTAGAATTCGTCTTACAATAGAAGCCAAACTCTCTCCAGGACCGCCGATTCCAAGCCTACGGCGACATGGTGACAATGACCGCTGGCATGATGTTGGAGTAAGTGTGGCCAGTGGGAATTTTCTGGCAGCTAAGCGTAGAGGAGTTGTTGGTGGAATCGATTATATGG
CAACTGGGGAGGTAAAAAGAATTGATGTTTCTCGGATACGGGAGAGACTTGAAGCTAGTTGTATTGTCATAGTGAGCAACCTAGGCTACTCCAGCTCTGGGCAAGTTCTAAATTGCAACACATATGAGGTAGCTACTGCCTGTGCACTGGCTCTTCAAGCAGACAAACTCATTTGCTTTGTTGATGGTCCTATTCTAGAT
GAAAATGGAAGGTTAATTCGTTATATGACTCTTCATGAGGCAGACCAGCTTATACGGAAGCGAGCTGAGCGAAGTGAAATTGCTGCAAAATATGTACAAGCTGTTGCTGGCACTGATAGTAATCACCTGGAATATTCTGGTGTCAATGGAAGGGACACTTCATTGCGACAAGACTTTGGTGCTAGTAAAGGGTTTGGTAC
AACATTTCAGAATGGTGTTGGTTTTGATAGTGGAAATGGACTTGGTGTTGGAGGACAGGGATTTGCTATTGGTGGAGAGGAGAGGCTGAGCAGATTAAATGGATACCTTTCAGAACTAGCGGCGGCGGTTTTTGTTTGCAGAGGTGGTGTACAGAGGGTTCATCTCTTGGATGGTACTGTTGGTGGAGCTATATTACTAG
AACTATTCACGAGGGATGGCATGGGTACCATGGTAGCAAGGGATGTGTATGAAGGCACTCGGACAGCAGGGGCAGGTGACATCAATGGAATACAGTATGTTTTACAACCTCTGGAAGAAATCGGTGCAGTGATTAAGAGGAGCAATGAGCAGTTGCTCGAAGAAATAGACAAATTCACTGTTGTGCAGAGGGATGGTTCG
ATTATTGCATGTGCTGCTCTCTTTCCATTCTATGATGAAAAGTGTGGAGAATTAGCTGCTCTTGCAGTTGCCCCAGAATGTCGAGGTCATGGACAAGGTGATAAGTTGCTTGATTACATTGAAAAGAAAGCAATATTGATGGGACTAGAGAGGCTATTTTTGTTGACAACTCGCACTGCAGATTGGTTTGTTAGCCGTGG
TTTTTCAGAATGCACTATAGATTCTATTCCAGAATCAAGGAGAACAAAGATAAATCTAACCCGTGGATCAAAGTACTACATTAAAAAGCTTCAACCCATATATAATAGAATTACCATTGACAAGATGGGATGAAATTTTATTCTTGGGACATTCGCAATGCATTGATTGATCTATAATTTTTCATTGTTAAGATACAAAC
ATTCTTGCGCATCGTTACTTGGTTGCAGGGTAATACTAAAATTTAGTGACATGCAAGAAAGTTATGAATTTGGTCAAAATGTTGACTATGGGTGAGGAAAAGCCAAAGAGTGTATTGCTTGTAGGTGTATAAGCACTCAAAATTTTGCCATCGAGATTTGGAAGAAATAGTAAGGCCTGAAAATGTACTAGAATTGAGGT
TTAGAATGTTTACTAATAATTCCTACAGTTTTTAAAGGTTCGTTGTGAAAAAATCCAATCCATGATGAGTAATGTACTGGATCAAGAAATTAATATATCTGTGAAATATTTTGAGCTGTAA

Intron 2 GTAGCAAGGT ... TTGTGTTTAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	23.6	34	18	3
A2	14.29	30	6	4
A3	8.16	45	4	4
A4	23.94	27	13	4
A5	37.14	11	10	3
A6	6.38	44	5	1
A7	6.23	143	13	6
A8	3.23	90	3	3
A9	4.27	101	6	3
A10	4.62	93	7	2

>TRINITY_DN47088_c0_g1_i5 from sample A10 / Example spliced isoform

ATTCCGTGAATTTACATTTTTCTGGCAATAATGTGCGTTTCGTAGCCGTGAAACTCGTGTAATTTTTACGAACAAAGGCGGCTGAGCTGTGGGTGTCTCCAAGTTCCAACTTTCACCTGAAATATGATATCTTAATCGAGAAGATTTTAGCAGTAGAAGCTTTGAGAATGGCTTCTGCTGTCGGATTTATTAATAATGGC
TGGGTTTGCGCCGGAAACCCCAGAAAAGAGTCTGTTTTCAGCGGGAATTCAAGCAGCCTGCATAATCAATTCAATCTCCTCGGACGGAATGTCTCTGGCTGGGGAAATGCCTGGGCTTTGCCATCAGCAGTGCCAGTTGTTTCTCTTGGTCGAAGTGCCCGGAGAAGCCATTTGGTGCCACCACTGACAGCCTTGCGGGA
GAAGCACCTTGGTGGGTTGAGTGTCTGGGAACCTGGCTTGCGGAGCCTTCCGTCACTGTGGGATGTCTTTGGGCAGAAGGGCTTTTGCTTGGCTTGCCGTTGCATGCCTGATAACGGCGATCCGGCCAATGGGGTGTCTGATTCTGCCCAGGATCAGGAGCAGTTCGTTGGATGGTTTAGACAGGCCTGGCCTTACATAC
AAGGCCACCAGGGGAGCACGTTTGTTGTCGTGATTTCGGGCGAGATCATGGCAAGTCCTCTCATCGACTACATTCTTCAGGATATTTCTCTCCTCCATGGTCTAGGAATCAAGTTTGTGATTGTTCCAGGAACACATGTTCAGATTGATCAACTTTTGCAGGAGAGAGGAAATAAGGCCAAATATGTTGGGCGGTATCGA
ATTACAGATCCTGCATCTTTAGAAGCAGCAATGGAGGCAGCTGGTAGAATTCGTCTTACAATAGAAGCCAAACTTTCTCCAGGACCGCCGATTCCAAGCCTACGGCGACATGGTGACAATGACCGCTGGCATGATGTTGGAGTAAGTGTGGCCAGTGGGAATTTTCTGGCAGCTAAGCGTAGAGGAGTTGTTGGTGGAAT
CGATTATATGGCAACTGGGGAGGTAAAAAGAATTGATGTTTCTCGGATACGGGAGAGACTTGAAGCTAGTTGTATTGTCATAGTGAGCAACCTAGGCTACTCCAGCTCTGGGCAAGTTCTAAATTGCAACACATATGAGGTAGCTACTGCCTGTGCACTGGCTCTTCAAGCAGACAAACTCATTTGCTTTGTTGATGGTC
CTATTCTAGATGAAAATGGAAGGTTAATTCGTTATATGACTCTTCATGAGGCAGACCAGCTTATACGGAAGCGAGCTGAGCGAAGTGAAATTGCTGCAAAATATGTACAAGCTGTTGCTGGCACTGATAGTAATCACCTGGAATATTCTGGTGTCAATGGAAGGGACACTTCATTGCGACAAGACTTTGGTGCTAGTAAA
GGGTTTGGTACAACATTTCAGAATGGTGTTGGTTTTGATAGTGGAAATGGACTTGGTGTTGGAGGACAGGGATTTGCTATTGGTGGAGAGGAGAGGCTGAGCAGATTAAATGGATACCTTTCAGAACTAGCGGCGGCGGTTTTTGTTTGCAGAGGTGGTGTACAGAGGGTTCATCTCTTGGATGGTACTGTTGGTGGAGC
TATATTACTAGAACTATTCACGAGGGATGGCATGGGTACCATGTTCTTCTGGAGATGAAGTTGTTCAAGTTTTGAAATGTCCCAACGTTTCGAGTGGATACTACCCCACCCATCATCAGGGGAACCCAAAAGAAGCTGGATGTGTATGAAGGCACTCGGA

>TRINITY_DN47088_c0_g1_i7 from sample A10 / Example unspliced isoform:

TGGTGTACAGAGGGTTCATCTCTTGGATGGTACTGTTGGTGGAGCTATATTACTAGAACTATTCACGAGGGATGGCATGGGTACCATGgtagcaaggtttgttcctttttgatttcaagcatccctttaggcatttcttttgctgatcctaacgataactctgatttaattcatattgccagggatggcttcacagtatt
attgaaataaagaagcatatggagtcccttatccttattttgttggttaaaatgtcttgtgtttagTTCTTCTGGAGATGAAGTTGTTCAAGTTTTGAAATGTCCCAACGTTTCGAGTGGATACTACCCCACCCATCATCAGGGGAACCCAAAAGAAGCTG

Intron 3 GTTTGTTCCT ... TTGTGTTTAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	18.92	45	18	3
A2	13.51	32	6	4
A3	8	46	4	4
A4	24.64	26	13	4
A5	31.71	14	10	3
A6	5.77	49	5	1
A7	6.4	139	13	6
A8	3.36	72	2	3
A9	4.57	94	6	3
A10	4.92	87	7	2

>TRINITY_DN47088_c0_g1_i2 from sample A10 / Example spliced isoform

ATTCCGTGAATTTACATTTTTCTGGCAATAATGTGCGTTTCGTAGCCGTGAAACTCGTGTAATTTTTACGAACAAAGGCGGCTGAGCTGTGGGTGTCTCCAAGTTCCAACTTTCACCTGAAATATGATATCTTAATCGAGAAGATTTTAGCAGTAGAAGCTTTGAGAATGGCTTCTGCTGTCGGATTTATTAATAATGGC
TGGGTTTGCGCCGGAAACCCCAGAAAAGAGTCTGTTTTCAGCGGGAATTCAAGCAGCCTGCATAATCAATTCAATCTCCTCGGACGGAATGTCTCTGGCTGGGGAAATGCCTGGGCTTTGCCATCAGCAGTGCCAGTTGTTTCTCTTGGTCGAAGTGCCCGGAGAAGCCATTTGGTGCCACCACTGACAGCCTTGCGGGA
GAAGCACCTTGGTGGGTTGAGTGTCTGGGAACCTGGCTTGCGGAGCCTTCCGTCACTGTGGGATGTCTTTGGGCAGAAGGGCTTTTGCTTGGCTTGCCGTTGCATGCCTGATAACGGCGATCCGGCCAATGGGGTGTCTGATTCTGCCCAGGATCAGGAGCAGTTCGTTGGATGGTTTAGACAGGCCTGGCCTTACATAC
AAGGCCACCAGGGGAGCACGTTTGTTGTCGTGATTTCGGGCGAGATCATGGCAAGTCCTCTCATCGACTACATTCTTCAGGATATTTCTCTCCTCCATGGTCTAGGAATCAAGTTTGTGATTGTTCCAGGAACACATGTTCAGATTGATCAACTTTTGCAGGAGAGAGGAAATAAGGCCAAATATGTTGGGCGGTATCGA
ATTACAGATCCTGCATCTTTAGAAGCAGCAATGGAGGCAGCTGGTAGAATTCGTCTTACAATAGAAGCCAAACTTTCTCCAGGACCGCCGATTCCAAGCCTACGGCGACATGGTGACAATGACCGCTGGCATGATGTTGGAGTAAGTGTGGCCAGTGGGAATTTTCTGGCAGCTAAGCGTAGAGGAGTTGTTGGTGGAAT
CGATTATATGGCAACTGGGGAGGTAAAAAGAATTGATGTTTCTCGGATACGGGAGAGACTTGAAGCTAGTTGTATTGTCATAGTGAGCAACCTAGGCTACTCCAGCTCTGGGCAAGTTCTAAATTGCAACACATATGAGGTAGCTACTGCCTGTGCACTGGCTCTTCAAGCAGACAAACTCATTTGCTTTGTTGATGGTC
CTATTCTAGATGAAAATGGAAGGTTAATTCGTTATATGACTCTTCATGAGGCAGACCAGCTTATACGGAAGCGAGCTGAGCGAAGTGAAATTGCTGCAAAATATGTACAAGCTGTTGCTGGCACTGATAGTAATCACCTGGAATATTCTGGTGTCAATGGAAGGGACACTTCATTGCGACAAGACTTTGGTGCTAGTAAA
GGGTTTGGTACAACATTTCAGAATGGTGTTGGTTTTGATAGTGGAAATGGACTTGGTGTTGGAGGACAGGGATTTGCTATTGGTGGAGAGGAGAGGCTGAGCAGATTAAATGGATACCTTTCAGAACTAGCGGCGGCGGTTTTTGTTTGCAGAGGTGGTGTACAGAGGGTTCATCTCTTGGATGGTACTGTTGGTGGAGC
TATATTACTAGAACTATTCACGAGGGATGGCATGGGTACCATGGTAGCAAGTTCTTCTGGAGATGAAGTTGTTCAAGTTTTGAAATGTCCCAACGTTTCGAGTGGATACTACCCCACCCATCATCAGGGGAACCCAAAAGAAGCTGTAAGATAGAAAAGAGTGAGCATGCGAGATGAATAAATAGGAGGTGTCCTTGTTT
TGAAGCAAGCCTACAGTAGTACATAGATTACTTGAACCTTTATATATATTTAGTTAGAGAAGACTATTGCTATAATATATTACTTGAAC

>TRINITY_DN47088_c0_g1_i7 from sample A10 / Example unspliced isoform:

TGGTGTACAGAGGGTTCATCTCTTGGATGGTACTGTTGGTGGAGCTATATTACTAGAACTATTCACGAGGGATGGCATGGGTACCATGGTAGCAAGgtttgttcctttttgatttcaagcatccctttaggcatttcttttgctgatcctaacgataactctgatttaattcatattgccagggatggcttcacagtatt
attgaaataaagaagcatatggagtcccttatccttattttgttggttaaaatgtcttgtgtttagTTCTTCTGGAGATGAAGTTGTTCAAGTTTTGAAATGTCCCAACGTTTCGAGTGGATACTACCCCACCCATCATCAGGGGAACCCAAAAGAAGCTG

Intron 4 GTAAGCACAA ... AGCAAAAAAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	21.21	117	20	43
A2	18.81	82	9	29
A3	23.58	94	21	37
A4	24.16	113	28	44
A5	23.81	56	16	19
A6	26.92	38	15	13
A7	22.5	93	13	41
A8	23.08	25	4	11
A9	20	50	10	15
A10	22.35	66	16	22

>TRINITY_DN107013_c0_g1_i6 from sample A5 / Example spliced isoform

GGAATCTACCCTGTGCTGGTGCATATTCTACCTTGGGAAGCTACCCTGTGCTGGAAGGGTACATGCCCCAATTTCCCACGGCCCCACCAATCCCCTACTGTCTCTCTCGAAACCACACGAACTTTAACCCGTGCATTATAAATAGCGCCTCGGTGCTTGCAAATTTAGTTCGTTCCCATGTCGCCACGATCGCTTCCCTA
GAATGTCAACTGGTCGTGTATTCTTTGCTAATCAACAATGGCGGACCGTGGGATTCTTTGGCCGTGGCGGTTCGATTCCGTGAATTTACATTTTTCTGGCAATAATGTGCGTTTCGTAGCCGTGAAACTCGTGTAATTTTTACGAACAAAGGCGGCTGAGCTGTGGGTGTCTCCAAGTTCCAACTTTCACCTGAAATATG
ATATCTTAATCGAGAAGATTTTAGCAGTAGAAGCTTTGAGAATGGCTTCTGCTGTCGGATTTATTAATAATGGCTGGGTTTGCGCCGGAAACCCCAGAAAAGAGTCTGTTTTCAGCGGGAATTCAAGCAGCCTGCATAATCAATTCAATCTCCTCGGACGGAATGTCTCTGGCTGGGGAAATGCCTGGGCTTTGCCATCA
GCAGTGCCAGTTGTTTCTCTTGGTCGAAGTGCCCGGAGAAGCCATTTGGTGCCACCACTGACAGCCTTGCGGGAGAAGCACCTTGGTGGGTTGAGTGTCTGGGAACCTGGCTTGCGGAGCCTTCCGGCACTGTGGGATGTCTTTGGGCAGAAGGGCTATTGCTTGGCTTGCCGTTGCGTGCCTGATAACGGCGATCCGGC
CAACGGGGTGTCTGATTCTGCCCAGGATCAGGAGCAGTTCGTTGGATGGTTTAGACAGGCCTGGCCTTACATACAAGGCCACCAGGGGAGTACGTTTGTTGTCGTGATTTCAGGCGAGATCATGGCAAGTCCTCTCATCGACTACATTCTTCAGGATATTTCTCTCCTCCATGGTCTAGGAATCAAGTTTGTGATTGTTC
CAGGAACACATGTTCAGATTGATCAACTTTTGCAGGAGAGAGGAAATAAGGCCAAATATGTTGGGAGGTATCGAATTACAGATCCTGCATCTTTAGAAGCAGCAATGGAGGCAGCTGGTAGAATTCGTCTTACAATAGAAGCCAAACTTTCTCCAGGACCGCCGATTCCAAGCCTACGGCGACATGGTGACAATGACCGC
TGGCATGATGTTGGAGTAAGTGTGGCCAGTGGGAATTTTCTGGCAGCTAAGCGTAGAGGAGTTGTTGGTGGAATCGATTATATGGCAACTGGGGAGGTAAAAAGAATTGATGTTTCTCGGATACGGGAGAGACTTGAAGCTAGTTGTATTGTCATAGTGAGCAACCTAGGCTACTCCAGCTCTGGGCAAGTTCTAAATTG
CAACACATATGAGGTAGCTACTGCCTGTGCACTGGCTCTTCAAGCAGACAAACTCATTTGCTTTGTTGATGGTCCTATTCTAGATGAAAATGGAAGGTTAATTCGTTATATGACTCTTCATGAGGCAGACCAGCTTATACGGAAGCGAGCTGAGCGAAGTGAAATTGCTGCAAAATATGTACAAGCTGTTGCTGGCACTG
ATAGTAATCACCTGGAATATTCTGGTGTCAATGGAAGGGACACTTCATTGCGACAAGACTTTGGTGCTAGTAAAGGGTTTGGTACAACATTTCAGAATGGTGTTGGTTTTGATAGTGGAAATGGACTTGGTGTTGGAGGACAGGGATTTGCTATTGGTGGAGAGGAGAGGCTGAGCAGATTAAATGGATACCTTTCAGAA
CTAGCGGCGGCGGTTTTTGTTTGCAGAGGTGGTGTACAGAGGGTTCATCTCTTGGATGGTACTGTTGGTGGAGCTATATTACTAGAACTATTCACGAGGGATGGCATGGGTACCATGGTAGCAAGGGATGTGTATGAAGGCACTCGGACAGCAGGGGCAGGTGACATCAATGGAATACAGTATGTTTTACAACCTCTGGA
AGAAATCGGTGCAGTGATTAAGAGGAGCAATGAGCAGTTGCTCGAAGAAATAGACAAATTCACTGTTGTGCAGAGGGATGGTTCGATTATTGCATGTGCTGCTCTCTTTCCATTCTATGATGAAAAGTGTGGAGAATTAGCTGCTCTTGCAGTTGCCCCAGAATGTCGAGGTCATGGACAAGGTGATAAGTTGCTTGATT
ACATTGAAAAGAAAGCAATATTGATGGGACTAGAGAGGCTATTTTTGTTGACAACTCGCACTGCAGATTGGTTTGTTAGCCGTGGTTTTTCAGAATGCACTATAGATTCTATTCCAGAATCAAGGAGAACAAAGATAAATCTAACCCGTGGATCAAAGTACTACATTAAAAAGCTTCAACCCATATATAATAGAATTACC
ATTGACAAGATGGGATGAAATTTTATTCTTGGGACATTCGCAATGCATTGATTGATCTATAATTTTTCATTGTTAAGATACAAACATTCTTGCGCATCGTTACTTGGTTGCGGGGTAATACTAAAATTTAGTGACATGCAAGAAAGTTATGAATTTGGTCAAAATGTTGACTATGGGTGAGGAAAAGCCAAAGAGTGTAT
TGCTTGTAGGTGTATAAGCACTCAAAATTTTGCCATCGAGATTTGGAAGAAATAGTAAGGCCTGAAAATGTACTAGAATTGAGGTTTAGAATGTTTACTAATAATTCCTACAGTTTTTAAAGGTTCGTTGTGAAAAAATCCAATCCATGATGAGTAATGTACTGGATCAAGAAATTAATATATCTGTGAAATATTTTGAG
C

>TRINITY_DN107013_c0_g1_i4 from sample A5 / Example unspliced isoform:

GGAATCTACCCTGTGCTGGTGCATATTCTACCTTGGGAAGCTACCCTGTGCTGGAAGGGTACATGCCCCAATTTCCCACGGCCCCACCAATCCCCTACTGTCTCTCTCGAAACCACACGAACTTTAACCCGTGCATTATAAATAGCGCCTCGGTGCTTGCAAATTTAGTTCGTTCCCATGTCGCCACGATCGCTTCCCTA
GAATGTCAACTGGTCGTGTATTCTTTGCTAATCAACAATGGCGGACCGTGGGATTCTTTGGCCGTGGCGGTTCGATTCCGTGAATTTACATTTTTCTGGCAATAATGTGCGTTTCGTAGCCGTGAAACTCGTGTAATTTTTACGAACAAAGGCGGCTGAGCTGTGGGTGTCTCCAAGTTCCAACTTTCACCTGAAATATG
ATATCTTAATCGAGAAGATTTTAGCAGTAGAAGCTTTGAGAATGGCTTCTGCTGTCGGATTTATTAATAATGGCTGGGTTTGCGCCGGAAACCCCAGAAAAGAGTCTGTTTTCAGCGGGAATTCAAGCAGCCTGgtaagcacaattcttgttattatttttttatatgtcaacgtaaatccgtgtgaatggcgccgaaga
tttgaataatgtctgttattgggaatatctctttgtaagttgtcggaacgtggcgaattctgttattccgtgtattggctgcctcttaatctgtagaaatgtcctggccactaaattgtaagaagcgggttttgcaatgtgctttcttgttcagtggaacgaatttaagctcattacacagggttttatagagagcaagc
acagcaaaaaagCATAATCAATTCAATCTCCTCGGACGGAATGTCTCTGGCTGGGGAAATGCCTGGGCTTTGCCATCAGCAGTGCCAGTTGTTTCTCTTGGTCGAAGTGCCCGGAGAAGCCATTTGGTGCCACCACTGACAGCCTTGCGGGAGAAGCACCTTGGTGGGTTGAGTGTCTGGGAACCTGGCTTGCGGAGCCT
TCCGGCACTGTGGGATGTCTTTGGGCAGAAGGGCTATTGCTTGGCTTGCCGTTGCGTGCCTGATAACGGCGATCCGGCCAACGGGGTGTCTGATTCTGCCCAGGATCAGGAGCAGTTCGTTGGATGGTTTAGACAGGCCTGGCCTTACATACAAGGCCACCAGGGGAGTACGTTTGTTGTCGTGATTTCAGGCGAGATCA
TGGCAAGTCCTCTCATCGACTACATTCTTCAGGATATTTCTCTCCTCCATGGTCTAGGAATCAAGTTTGTGATTGTTCCAGGAACACATGTTCAGATTGATCAACTTTTGCAGGAGAGAGGAAATAAGGCCAAATATGTTGGGAGGTATCGAATTACAGATCCTGCATCTTTAGAAGCAGCAATGGAGGCAGCTGGTAGA
ATTCGTCTTACAATAGAAGCCAAACTTTCTCCAGGACCGCCGATTCCAAGCCTACGGCGACATGGTGACAATGACCGCTGGCATGATGTTGGAGTAAGTGTGGCCAGTGGGAATTTTCTGGCAGCTAAGCGTAGAGGAGTTGTTGGTGGAATCGATTATATGGCAACTGGGGAGGTAAAAAGAATTGATGTTTCTCGGAT
ACGGGAGAGACTTGAAGCTAGTTGTATTGTCATAGTGAGCAACCTAGGCTACTCCAGCTCTGGGCAAGTTCTAAATTGCAACACATATGAGGTAGCTACTGCCTGTGCACTGGCTCTTCAAGCAGACAAACTCATTTGCTTTGTTGATGGTCCTATTCTAGATGAAAATGGAAGGTTAATTCGTTATATGACTCTTCATG
AGGCAGACCAGCTTATACGGAAGCGAGCTGAGCGAAGTGAAATTGCTGCAAAATATGTACAAGCTGTTGCTGGCACTGATAGTAATCACCTGGAATATTCTGGTGTCAATGGAAGGGACACTTCATTGCGACAAGACTTTGGTGCTAGTAAAGGGTTTGGTACAACATTTCAGAATGGTGTTGGTTTTGATAGTGGAAAT
GGACTTGGTGTTGGAGGACAGGGATTTGCTATTGGTGGAGAGGAGAGGCTGAGCAGATTAAATGGATACCTTTCAGAACTAGCGGCGGCAGTTTTTGTTTGCAGAGGTGGTGTACAGAGGGTTCATCTCTTGGATGGTACTGTTGGTGGAGCTATATTACTAGAACTATTCACGAGGGATGGCATGGGTACCATGGTAGC
AAGGTTTGTTCCTTTTTGATTTCAAGCATCCCTTTAGGCATTTTTTTTGCTGATCCTAACGATAACTCTGATTTAATTCATATTGCCAGGGATGGCTTCACAGTATTATTGAAATAAAGAAGCATATGGAGTCCCTTATCCTTATTTTGTTGGTTAAAATGTCTTGTGTTTAGTTCTTCTGGAGATGAAGTTGTTCAAGT
TTTGAAATGTCCCAACGTTTCGAGTGGATACTACCCCACCCAACATCAGGGGAACCCAAAAGAAGCAGTA