NA ----> NA

Intron 1 GTCTCATCCG ... TGGATTTCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	42.61	17.5	7.7	8.8
A2	30.29	36.2	13.7	10.7
A3	53.01	22	21.3	20
A4	56.18	16.5	9.8	15.2
A5	44.15	8.7	2.7	2.3
A6	51.58	123.8	84.5	107.2
A7	51.85	144.5	117.7	126.8
A8	50.41	160.7	136.3	134.7
A9	43.14	205.3	117.5	119.3
A10	47.04	117.2	78.8	94

>TRINITY_DN110382_c0_g1_i1 from sample A4 / Example spliced isoform

CTGTCAGTGTAACTTTAACACCTCGAAAATATTTACAGTTATTTGCCCGGGACACACCACAGCTGGTTTACATTGTATGGCAGAAGGTTAGTTTGGATGGATTTCAGGTCTCGAATGACAGAACAATTGTAGATGGTTTATATTGGAGGGATTTCTTCGTCTTTGAGGGTTCCTCGGATAGTTTGGATGGATTTCAGGTC
TCGAATGACAGAACAATTGTAGATGGTTTAGATTGTCATTGGACGGATTTTTTCGTCTTTAAGGGTTCCTCGGATGAAAGACATTGTAATAGTTATTTGTATATTTGTATTTGCATCGCATTGCAGATGGTTGGCTTGGATGGGTTTCTTTCGTTTTCAGAGATCTCAAATGAAATAATGTTGTTGTTGCTGGTTATCAC
CGATGATACCGATGTGGTGCTTAAACAGAGAAGAGGATCGGTGTACTGAATACCGAATTTTATTAATTATTTATTTTCAGGTTTACGGCTTCATCCTATTAATTTTTTTCGTGCTTATCCCGCTCTCTAATATTTCTTTGCCATCATACTAAAGCTAATTTAATTGAATATTGCTCTGATAATGCTCCAATAACCCTAGA
TATAAAATTTATCCGGTCTAATAACCCTAGTTATTGAATTTCCA

>TRINITY_DN110382_c0_g1_i5 from sample A4 / Example unspliced isoform:

CTGTCAGTGTAACTTTAACACCTCGAAAATATTTACAGTTATTTGCCCGGGACACACCACAGCTGGTTTACATTGTATGGCAGAAGGTTAGTTTGGATGGATTTCAGGTCTCGAATGACAGAACAATTGTAGATGGTTTATATTGGAGTGGTTTATATTGGACGATTTCTTCGTCTTTAAGGGTTCCTCGGATAGTTTGG
ATGGATTTCAGgtctcatccgagtttggatggatttcagGTCTCGAATGACAGAACAATTGTAGATGGTTTAGATTGTCATTGGACGGATTTTTTCGTCTTTAAGGGTTCCTCGGATGAAAGACATTGTAATAGTTATTTGTATATTTGTATTTGCATCGCATTGCAGATGGTTGGCTTGGATGGGTTTCTTTCGTTTTC
AGAGATCTCAAATGAAATAATGTTGTTGTTGCTGGTTATCACCGATGATACCGATGTGGTGCTTAAACAGAGAAGAGGATCGGTGTACTGAATACCGAATTTTATTAATTATTTATTTTCAGGTTTACGGCTTCATCCTATTAATTTTTTTCGTGCTTATCCCGCTCTCTAATATTTCTTTGCCATCATACTAAAGCTAA
TTTAATTGAATATTGCTCTGATAATGCTCCAATAACCCTAGATATAAAATTTATCCGGTCTAATAACCCTAGTTATTGAATTTCCA