NA ----> NA
Intron 1 GTAGGCAATT ... CCTTCACCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 31.25 | 22 | 8 | 10 |
| A2 | 42.19 | 37 | 10 | 27 |
| A3 | 32.61 | 31 | 5 | 15 |
| A4 | 40 | 15 | 8 | 10 |
| A5 | 41.46 | 24 | 4 | 17 |
| A6 | 35.43 | 246 | 4 | 135 |
| A7 | 31.89 | 126 | 7 | 59 |
| A8 | 34.74 | 201 | 7 | 107 |
| A9 | 35.45 | 193 | 2 | 106 |
| A10 | 32.87 | 96 | 10 | 47 |
>TRINITY_DN40219_c0_g1_i1 from sample A7 / Example spliced isoformTTTGGCTGCTGTATGGCGCTGGAATCTGGTGGCTCCTGTACAGAAGTTGTATGGTTGTATGGCTGAGCTCATATGACTTTTAAAACTTCCTTTAGAAAAAAAAACTTGGAACCTAGATCAGTAGGGTTCCACAAATAAATATTGACTTTGCTTCAAAATGAAAAAATGAAACAGTACCTGAATCAGCAAAACCCTTTTGG
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>TRINITY_DN40219_c0_g1_i2 from sample A7 / Example unspliced isoform:TTTGGCTGCTGTATGGCGCTGGAATCTGGTGGCTCCTGTACAGAAGTTGTATGGTTGTATGGCTGAGCTCATATGACTTTTAAAACTTCCTTTAGAAAAAAAAACTTGGAACCTAGATCAGTAGGGTTCCACAAATAAATATTGACTTTGCTTCAAAATGAAAAAATGAAACAGTACCTGAATCAGCAAAACCCTTTTGG
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CATCTGTCCTCCTGAGTCCTTATTCAAAGTCTTCTCAGTTGAAAGAACAACCCTGCTAAGCTGCTGTCACCTTTTTGACAAATTGTTGATGATTATTTTTTGTGTGCTACTTTTTAATGTAAAGGCCTATATTAGGCATCCAGTGTGGTTAGTGGGCAAGATAATATATAGAGGGAATGGGTTCTTTAGTGAAGTGAAAC
TTTGAAAAAAAGGGAAAAGTGGATGATATTGGGATACCCAGATGTACTTGGCACTTGGGGGATGTACCCTGACCATACTAGATATGTCTTTTGATGCACTTTTACTTGGGGATGTCTCTGACGTCACTCTTCCCCTGATAACCTTGTGTTCAAATTAGTTTGTAGTATGAAGATTTTCTTCAATGGCTAAGTCACATTCT
CGTTGCTTTATAATGTGAATGGTTTTTTTGTTTCTAATCCATGCATGGTGACCTTTGCAGGGTGAACCTCAACAAGGCAAGCCAGGTTGGGAAGGGgtaggcaattttcttaacttctctttctcctaatatattcagactattttggtctaatgttaatcttccatgtttacagtttcatgcattgtatatgcatattc
cttaattgaacttgtaaatccaccttcaccagGTCCGAACCAGATGTAAAGATGAGTGGACAGAATTTCAGAAGCGAATGGAGAAAGCAGAAAAGGAATACCTGCAAGAAAATTCTCATAGTTAGTGCAGTTTTTGGTGAGGCGCACTCGTACATTTCCTATTCCTCGATGTTTCATTGTTTACATTTGTGGCTACCATG
AGCCAATTCTTTTAAAGCTTCGAGCTTGCATGTTTTTTGCAATCAAGCTTGATGGCCTTGTATTTAAACTCCCTATCGGTTTTTATGACTGGGCACTCCAGGAAATTTTAAGTGCAAACATTTCTGATGTTAAACATTTACTCTAAGCCTTTTGGTATGGTCATTAGTTTTTCTTCCTATTCTTTAACAAACACCTGCTC
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TTATTCAGATGGGGCAGGTGAGATTAATATAATAAAAAACTAAGGGA