sp|Q9ZU35|AB7G_ARATH ----> ABC transporter G family member 7
Intron 1 GTAATTTATT ... GCTTTGGTAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 13.81 | 134 | 23.3 | 14.7 |
| A2 | 11.64 | 104 | 14.7 | 10.7 |
| A3 | 13.46 | 94 | 15.7 | 11.7 |
| A4 | 9.22 | 81 | 8.7 | 9.3 |
| A5 | 13.33 | 24 | 4 | 5.7 |
| A6 | 12.64 | 314 | 48 | 23.3 |
| A7 | 13.59 | 436 | 74 | 33 |
| A8 | 11.77 | 506 | 72 | 39 |
| A9 | 9.36 | 392 | 42.7 | 31.7 |
| A10 | 12.48 | 304 | 46.7 | 19.3 |
>TRINITY_DN107554_c0_g1_i3 from sample A3 / Example spliced isoformCTCAGCCTAAGCGAAAGAATACCCCAAATGATTGGCCATCCATCTCTACCCGAGGATTATATTATATTATCTTCTAATCATATCTTCATCTCCTCGCATACTCCCTTTGCTCTCCATGCTGCTTAGCTTTTATCATTAAAGAATTGGGTTCTTCACCAGGCAGGCTATGGCTACTCCCATTGCTAAAATTTTAGCAACCA
TAGTGGCAGCTTTGGCCATTCGTATATTTGCTTTGCCGGGTCCTGTGATTGTTGGAAAAACCCAATTCCAGGATGATGGCAGGAAGGAAGAAGATCAAGAGAACAACGAAGACGAAGAAATCCATGGGAAGATTGTTCCTGTTACACTTCAGTGGCAGAACATCACATGTACTTTATCAGACAAAGCCAAGAAACTAACG
AGATTTCTGCTCACAAATGTCACTGGTGAAGCAAAAGCAGGGCGACTTCTTGCAATAATGGGGCCATCAGGATCTGGAAAGACGACATTGCTAAATGTTCTAGCAGGCCAGCTTGCTGCATCACCTCGGTTACACCTCACCGGCCAACTATATGTCAATGGCAGTCCATTCTATAAGACGTCACCTAAGATAGCTTTTGT
AAGACAAGAAGACCTCTTCTTCTCTCAGTTAACAGTCCGAGAAACATTGTCTCTAGCTGTTGAGCTCCAGCTTTCTAAATTTTCAACTCCTGAAGATAGAGAAAAATATGTGAATGATCTTATCTTTCGTTTAGGCCTGGTAAATTGTGCAGACACTGTTGTTGGTGATGCAAAAGTTAGGGGAATTAGTGGGGGTGAAA
AGAAAAGGCTGTCAGTTGCTTGTGAGATGATTGCCAGCCCATCAGTGATTTTCGCAGATGAACCAACAACTGGGCTAGATGCTTTCCAGGCAGAGATGGTAATGGAGACACTTCGACAACTTGCTCAAGAAGGACATACAGTAGTATGTTCTATTCATCAGCCTCGAGGTTCAATCTACACAAAATTTGATGATCTAATC
TTGTTATCAGAAGGGGCAGTTGTATATGCTGGTCCTGCGAAAGAGGAACCTTTAGTCTATTTTGCTGAACATGGGTTTGTATGTCAAGAGCATGTAAATCCAGCTGAATTCTTTGCAGACCTTATATCCATTGATTACAGCTCATCTGAAAGTGAACATTTATCCCGAAAGAGGATTGATGGGATGATAGAGGCATTTAC
TAACAAGTTTTCAACGATGCCAGATCTAAAGGATGGGAATGTGGGATTTGGAATGGAAACTGATAAGGTATCTGTGAAATTAAGAAGGAAAGCTGTTACCCCTGGGAAAGGTGGCTGGTGGAAGCAGTTTCGGCTATTATTGAAGCGAGCATGGATGCAGGCTACTCGAGATGGGCCTACAAATAAAGTGCGAGGAAGGA
TGTCTGTTGCTTCTGCCCTGATCTTTGGATCGATTTTTTGGCGAATGGGATTATCCCAAACATCCATACAGGATCGCATGGGACTACTTCAGGTGGCGGCTATCAACACAGCAATGGCAGCACTCACTAAGACTGTTAGTGTTTTCCCAAAGGAACGTGCAATTGTAGATAGGGAGCGTGCAAAGGGTTCATATGCCCTG
GGACCTTATCTTTTTGCTAAGTTGTTAGCTGAGATTCCTGTTGGAGCTGCTTTTCCTTTGGTCTTTGGTATAATTCTATATCCTCTGGCACATCTTCACCCAAGTTTATTGAGGTTTGGGACATTCTCCAGTATTGTGACTGTGGAGTCATTTGCTGCATCAGCCATGGGCTTAACTGTGGGGGCCATGGTGCCTACGAC
TGAGGCAGCTATGGCTGTAGGGCCATCACTTATGACCATTTTCATTGTCTTTGGAGGTTATTATGTTAACTCAGAGAACACTCCTACAGTTTTTAGATGGATCCCCCGAATTTCTCTAATCAGATGGGCCTTTCAAGCCCTCTGTATCAATGAATTCAAGGGTCTGAAATTTGAGCAACAACAATCATTTGACCTTCAGA
ATGGTGAACAGGTGTTGGAACGGCTATCCTTCAGTGGAAGTTCTGTAGGTGATGCACTTGCTCAAGAAGGCCGCATACTACTTTTTTGGTACTGGATGACGTATGCTCTTCTGAAAATGAAGAAGCCTAAATACCAACCTCTAGAGCTTCCAACCATACAAGTCCAGTCTACAGCAAAGCTGGAAGAGTTGAAGGATTAA
ATCACATTGTTATTTAGAAGAGTGAATGTCCTTGCACCTACAGGGAGGACATGTAAATAAATAAGTTGTAAAATTTTAATTACTGGCTTTAGGAATATAGCCAATCAAGATCATATTTTACTGGCCTCTTTAACTTGGATTACATGATTGGAGTCTGCAATTCCATTTATATCCAAAGTCAAGTATATACTTGTAGCCCT
TCCATGTCATCTTGTAGAAGGTTCACTACTTGAGCATAATTAGAAAGAATTTTTCTGTTAACCAAATGTCTTCTCATTTTGTTATGGAAGTTATCCCTAAACTGCAGGCACCGATATTTTTCAAAAACTATGGAAGGGTAAACTCTCTCA
>TRINITY_DN107554_c0_g1_i5 from sample A3 / Example unspliced isoform:CCCGAATTTCTCTAATCAGATGgtaatttattattcagatatatttttgctcattaaatgttgataaccaaacttgatagatctgataactattttctgcactgtgattgaagtctgtaaacttctagaaatgtgagtctcttgtttgattatgtgatcctcagtctgagacatttgcttctgttttttttaattttctg
ctttggtagGGCCTTTCAAGCCCTCTGTATCAATGAATTCAAGGGTCTGAAATTTGAGCAACAACAATCATTTGACCTTCAGAATGGTGAACAGGTGTTGGAACGGCTATCCTTCAGTGGAAGTTCTGTAGGTGATGCACTTGCTCAAGAAGGCCGCATACTACTTTTTTGGTACTGGATGACGTATGCTCTTCTGAAAA
TGAAGAAGCCTAAATACCAACCTCTAGAGCTTCCAACCATACAAGTCCAGTCTACAGCAAAGCTGGAAGAGTTGAAGGATTAAATCACATTGTTATTTAGAAGAGTGAATGTCCTTGCACCTACAGGGAGGACATGTAAATAAATAAGTTGTAAAATTTTAATTACTGGCTTTAGGAATATAGCCAATCAAGATCATATT
TTACTGGCCTCTTTAACTTGGATTACATGATTGGAGTCTGCAATTCCATTTATATCCAAAGTCAAGTATATACTTGTAGCCCTTCCATGTCATCTTGTAGAAGGTTCACTACTTGAGCATAATTAGAAAGAATTTTTCTGTTAACCAAATGTCTTCTCATTTTGTTATGGAAGTTATCCCTAAACTGCAGGCACCGATAT
TTTTCAAAAACTATGGAAGGGTAAACTCTCTCA
Intron 2 GTTGAAATTT ... CCACCTTTAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 21.77 | 230 | 96 | 32 |
| A2 | 24.07 | 194 | 76 | 47 |
| A3 | 21.65 | 237 | 79 | 52 |
| A4 | 21.34 | 212 | 73 | 42 |
| A5 | 25.1 | 97 | 38 | 27 |
| A6 | 21.96 | 264.3 | 81.8 | 67 |
| A7 | 20.16 | 482.4 | 139.6 | 104 |
| A8 | 22.33 | 393 | 114 | 112 |
| A9 | 21.49 | 483.9 | 124 | 141 |
| A10 | 21.58 | 441 | 126.8 | 116 |
>TRINITY_DN113295_c0_g1_i5 from sample A2 / Example spliced isoformTTCACATGTTTCTCAGCCTAAGCGAAAGAATACCCCAAATGATTGGCCATCCATCTCTACCCGAGGATTATATTATATTATCTTCTAATCATATCTTCATCTCCTCGCATACTCCCTTTGCTCTCCATGCTGCTTAGCTTTTATCATTAAAGAATTGGGTTCTTCACCAGGCAGGCTATGGCTACTCCCATTGCTAAAAT
TTTAGCAACCATAGTGGCAGCTTTGGCCATTCGTATATTTGCTTTGCCGGGTCCTGTGATTGTTGGAAAAACCCAATTCCAGGATGATGGCAGGAAGGAAGAAGATCAAGAGAACAACGAAGACGAAGAAATCCATGGGAAGATTGTTCCTGTTACACTTCAGTGGCAGAACATCACATGTACTTTATCAGACAAAGCCA
AGAAACTAACGAGATTTCTGCTCACAAATGTCACTGGTGAAGCAAAAGCAGGGCGACTTCTTGCAATAATGGGGCCATCAGGATCTGGAAAGACGACATTGCTAAATGTTCTAGCAGGCCAGCTTGCTGCATCACCTCGGTTACACCTCACCGGCCAACTATATGTCAATGGCAGTCCATTCTATAAGACATCACCTCGG
TTACACCTCACCGGCCAACTATATGTCAATGGCAGTCCATTCTATAAGACGTCACCTAAGATAGCTTTTGTAAGACAAGAAGACCTCTTCTTCTCTCAGTTAACAGTCCGAGAAACATTGTCTCTAGCTGTTGAGCTCCAGCTTTCTAAATTTTCAACTCCTGAAGATAGAGAAAAATATGTGAATGATCTTATCTTTCG
TTTAGGCCTGGTAAATTGTGCAGACACTGTTGTTGGTGATGCAAAAGTTAGGGGAATTAGTGGGGGTGAAAAGAAAAGGCTGTCAGTTGCTTGTGAGATGATTGCCAGCCCATCAGTGATTTTCGCAGATGAACCAACAACTGGGCTAGATGCTTTCCAGGCAGAGATGGTAATGGAGACACTTCGACAACTTGCTCAAG
AAGGACATACAGTAGTATGTTCTATTCATCAGCCTCGAGGTTCAATCTACACAAAATTTGATGATCTAATCTTGTTATCAGAAGGGGCAGTTGTATATGCTGGTCCTGCGAAAGAGGAACCTTTAGTCTATTTTGCTGAACATGGGTTTGTATGTCAAGAGCATGTAAATCCAGCTGAATTCTTTGCAGACCTTATATCC
ATTGATTACAGCTCATCTGAAAGTGAACATTTATCCCGAAAGAGGATTGATGGGATGATAGAGGCATTTACTAACAAGTTTTCAACGATGCCAGATCTAAAGGATGGGAATGTGGGATTTGGAATGGAAACTGATAAGGTATCTGTGAAATTAAGAAGGAAAGCTGTTACCCCTGGGAAAGGTGGCTGGTGGAAGCAGTT
TCGGCTATTATTGAAGCGAGCATGGATGCAGGCTACTCGAGATGGGCCTACAAATAAAGTGCGAGGAAGGATGTCTGTTGCTTCTGCCCTGATCTTTGGATCGATTTTTTGGCGAATGGGATTATCCCAAACATCCATACAGGATCGCATGGGACTACTTCAGGTGGCGGCTATCAACACAGCAATGGCAGCACTCACTA
AGACTGTTAGTGTTTTCCCAAAGGAACGTGCAATTGTAGATAGGGAGCGTGCAAAGGGTTCATATGCCCTGGGACCTTATCTTTTTGCTAAGTTGTTAGCTGAGATTCCTGTTGGAGCTGCTTTTCCTTTGGTCTTTGGTATAATTCTATATCCTCTGGCACATCTTCACCCAAGTTTATTGAGGTTTGGGACATTCTCC
AGTATTGTGACTGTGGAGTCATTTGCTGCATCAGCCATGGGCTTAACTGTGGGGGCCATGGTGCCTACGACTGAGGCAGCTATGGCTGTAGGGCCATCACTTATGACCATTTTCATTGTCTTTGGAGGTTATTATGTTAACTCAGAGAACACTCCTACAGTTTTTAGATGGATCCCCCGAATTTCTCTAATCAGATGGGC
CTTTCAAGCCCTCTGTATCAATGAATTCAAGGGTCTGAAATTTGAGCAACAACAATCATTTGACCTTCAGAATGGTGAACAGGTGTTGGAACGGCTATCCTTCAGTGGAAGTTCTGTAGGTGATGCACTTGCTCAAGAAGGCCGCATACTACTTTTTTGGTACTGGATGACGTATGCTCTTCTGAAAATGAAGAAGCCTA
AATACCAACCTCTAGAGCTTCCAACCATACAAGTCCAGTCTACAGCAAAGCTGGAAGAGTTGAAGGATTAAATCACATTGTTATTTAGAAGAGTGAATGTCCTTGCACCTACAGGGAGGACATGTAAATAAATAAGTTGTAAAATTTTAATTACTGGCTTTAGGAATATAGCCAATCAAGATCATATTTTACTGGCCTCT
TTAACTTGGATTACATGATTGGAGTCTGCAATTCCATTTATATCCAAAGTCAAGTATATACTTGTAGCCCTTCCATGTCATCTTGTAGAAGGTTCACTACTTGAGCATAATTAGAAAGAATTTTCTGTTAACCAAATGTCTTCTCATTTTGTTATGGAAGTTATCCCTAAACTGCAGGCACCGATATTTTTCAAAAACTA
TGGAAGGGTAAACTCTCTCACTGCTTTAATGAAGTTGCTGAAGCA
>TRINITY_DN113295_c0_g1_i11 from sample A2 / Example unspliced isoform:AAAAAATTTGAAGTTTTGACAGTGAAAAGAAGGAAATAACATGGGCAAGATGAAGATTTACTAAAATGGCACAATAAGCCCTTACAGATATTTAGATGTTTTGCAGATTTTTAATTCTAAATTAGTTGCATGTAACAAGACCTTCCTGTTTTAATATTCTCTCATTCAAAAAGATAAGGCATACTATGTTGTTCGCTGTG
GAAAATGCTGTACATAAGTATGGGTTTTGGTGACAGGGTACTCACTGCAGCCTGAATATATTCCAGGTTTGTATGTCAAGAGCATGTAAATCCAGCTGAATTCTTTGCAGACCTTATATCCATTGATTACAGCTCATCTGAAAGTGAACATTTATCCCGAAAGAGGATTGATGGGATGATAGAGGCATTTACTAACAAGT
TTTCAACGATGCCAGATCTAAAGGATGGGAATGTGGGATTTGGAATGGAAACTGATAAGGTATCTGTGAAATTAAGAAGGAAAGCTGTTACCCCTGGGAAAGGTGGCTGGTGGAAGCAGTTTCGGCTATTATTGAAGCGAGCATGGATGCAGgttgaaatttgaataactatttaagtctgtgttttctagaatatctat
ttcattttgcattagcttaaatttctcagcatttctttactagtatcatacttcacgatacttatttgcttaaattttaacatcttgattcttggtcatatgatcttagcttgtgagtaaataaacccaccttatttccatgaatttcagtatatctcctgttgtagctactggaatatagtccaatttaaaatgtgtag
atgctgctatttacaatgcttgtatttgcaccatatttggtgatacttaacaatatttctgtgtcatgactcctttctaccgagatactgtgcagtatagtatttgcaaagtcaatttcaatattagctgcctctgtgttagtgctgccaaattcattggaagaatatatattttcatgaagtatgatataactctgaag
caatctcttattcctttaaactgtgagtggaactggatattgacattttaatcaaaggtgccacctttagGCTACTCGAGATGGGCCTACAAATAAAGTGCGAGGAAGGATGTCTGTTGCTTCTGCCCTGATCTTTGGATCGATTTTTTGGCGAATGGGATTATCCCAAACATCCATACAGGATCGCATGGGACTACTTC
AGGTGGCGGCTATCAACACAGCAATGGCAGCACTCACTAAGACTGTTAGTGTTTTCCCAAAGGAACGTGCAATTGTAGATAGGGAGCGTGCAAAGGGTTCATATGCCCTGGGACCTTATCTTTTTGCTAAGTTGTTAGCTGAGATTCCTGTTGGAGCTGCTTTTCCTTTGGTCTTTGGTATAATTCTATATCCTCTGGCA
CATCTTCACCCAAGTTTATTGAGGTTTGGGACATTCTCCAGTATTGTGACTGTGGAGTCATTTGCTGCATCAGCCATGGGCTTAACTGTGGGGGCCATGGTGCCTACGACTGAGGCAGCTATGGCTGTAGGGCCATCACTTATGACCATTTTCATTGTCTTTGGAGGTTATTATGTTAACTCAGAGAACACTCCTACAGT
TTTTAGATGGATCCCCCGAATTTCTCTAATCAGATGGGCCTTTCAAGCCCTCTGTATCAATGAATTCAAGGGTCTGAAATTTGAGCAACAACAATCATTTGACCTTCAGAATGGTGAACAGGTGTTGGAACGGCTATCCTTCAGTGGAAGTTCTGTAGGTGATGCACTTGCTCAAGAAGGCCGCATACTACTTTTTTGGT
ACTGGATGACGTATGCTCTTCTGAAAATGAAGAAGCCTAAATACCAACCTCTAGAGCTTCCAACCATACAAGTCCAGTCTACAGCAAAGCTGGAAGAGTTGAAGGATTAAATCACATTGTTATTTAGAAGAGTGAATGTCCTTGCACCTACAGGGAGGACATGTAAATAAATAAGTTGTAAAATTTTAATTACTGGCTTT
AGGAATATAGCCAATCAAGATCATATTTTACTGGCCTCTTTAACTTGGATTACATGATTGGAGTCTGCAATTCCATTTATATCCAAAGTCAAGTATATACTTGTAGCCCTTCCATGTCATCTTGTAGAAGGTTCACTACTTGAGCATAATTAGAAAGAATTTTCTGTTAACCAAATGTCTTCTCATTTTGTTATGGAAGT
TATCCCTAAACTGCAGGCACCGATATTTTTCAAAAACTATGGAAGGGTAAACTCTCTCACTGCTTTAATGAAGTTGCTGAAGCA
Intron 3 GTTAGTTTGC ... TGCACATCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 66.67 | 3 | 2 | 6 |
| A2 | 68.75 | 5 | 7 | 11 |
| A3 | 46.15 | 7 | 0 | 6 |
| A4 | 100 | 0 | 1 | 3 |
| A5 | 33.33 | 4 | 0 | 2 |
| A6 | 57.14 | 3 | 0 | 4 |
| A7 | 66.67 | 4 | 1 | 8 |
| A8 | 42.86 | 12 | 3 | 9 |
| A9 | 100 | 0 | 1 | 9 |
| A10 | 100 | 0 | 1 | 1 |
>TRINITY_DN45952_c1_g1_i2 from sample A8 / Example spliced isoformCTCAGCCTAAGCGAAAGAATACCCCAAATGATTGGCCATCCATCTCTACCCGAGGATTATATTATATTATCTTCTAATCATATCTTCATCTCCTCGCATACTCCCTTTGCTCTCCATGCTGCTTAGCTTTTATCATTAAAGAATTGGGTTCTTCACCAGGCAGGCTATGGCTACTCCCATTGCTAAAATTTTAGCAACCA
TAGTGGCAGCTTTGGCGATTCGTATATTTGCTTTGCCGGGTCCTGTGATTGTTGGAAAAACCCAATTCCAGGATGATGGCAGGAAGGAAGAAGATCAAGAGAACAACGAAGACGAAGAAATCCATGGGAAGATTGTTCCTGTTACACTTCAGTGGCAGAACATCACATGTACTTTATCAGACAAAGCCAAGAAACTAACG
AGATTTCTGCTCACAAATGTCACTGGTGAAGCAAAAGCAGGGCGACTTCTTGCAATAATGGGGCCATCAGGATCTGGAAAGACGACATTGCTAAATGTTCTAGCAGGCCAGCTTGCTGCATCACCTCGGTTACACCTCACCGGCCAACTATATGTCAATGGCAGTCCATTCTATAAGACGTCACCTAAGATAGCTTTTGT
AAGACAAGAAGACCTCTTCTTCTCTCAGTTAACAGTCCGAGAAACATTGTCTCTAGCTGTTGAGCTCCAGCTTTCTAAATTTTCAACTCCTGAAGATAGAGAAAAATATGTGAATGATCTTATCTTTCGTTTAGGCCTGGTAAATTGTGCAGACACTGTTGTTGGTGATGCAAAAGTTAGGGGAATTAGTGGGGGTGAAA
AGAAAAGGCTGTCAGTTGCTTGTGAGATGATTGCCAGCCCATCAGTGATTTTCGCAGATGAACCAACAACTGGGCTAGATGCTTTCCAGGCAGAGATGGTAATGGAGACACTTCGACAACTTGCTCAAGAAGGACATACAGTAGTATGTTCTATTCATCAGCCTCGAGGTTCAATCTACACAAAATTTGATGATCTAATC
TTGTTATCAGAAGGGGCAGTTGTATATGCTGGTCCTGCGAAAGAGGAACCTTTAGTCTATTTTGCTGAACATGGGTTTGTATGTCAAGAGCATGTAAATCCAGCTGAATTCTTTGCAGACCTTATATCCATTGATTACAGCTCATCTGAAAGTGAACATTTATCCCGAAAGAGGATTGATGGGATGATAGAGGCATTTAC
TAACAAGTTTTCAACGATGCCAGATCTAAAGGATGGGAATGTGGGATTTGGAATGGAAACTGATAAGGTATCTGTGAAATTAAGAAGGAAAGCTGTTACCCCTGGGAAAGGTGGCTGGTGGAAGCAGTTTCGGCTATTATTGAAGCGAGCATGGATGCAGGCTACTCGAGATGGGCCTACAAATAAAGTGCGAGGAAGGA
TGTCTGTTGCTTCTGCCCTGATCTTTGGATCGATTTTTTGGCGAATGGGATTATCCCAAACATCCATACAGGATCGCATGGGACTACTTCAGGTGGCGGCTATCAACACAGCAATGGCAGCACTCACTAAGACTGTTAGTGTTTTCCCAAAGGAACGTGCAATTGTAGATAGGGAGCGTGCAAAGGGTTCATATGCCCTG
GGACCTTATCTTTTTGCTAAGTTGTTAGCTGAGATTCCTGTTGGAGCTGCTTTTCCTTTGGTCTTTGGTATAATTCTATATCCTCTGGCACATCTTCACCCAAGTTTATTGAGGTTTGGGACATTCTCCAGTATTGTGACTGTGGAGTCATTTGCTGCATCAGCCATGGGCTTAACTGTGGGGGCCATGGTGCCTACGAC
TGAGGCAGCTATGGCTGTAGGGCCATCACTTATGACCATTTTCATTGTCTTTGGAGGTTATTATGTTAACTCAGAGAACACTCCTACAGTTTTTAGATGGATCCCCCGAATTTCTCTAATCAGATGGTAATTTATTATTCAGATATATTTTTGCTCATTAAATGTTGATAACCAAACTTGATAGATCTGATAACTATTTT
CTGCACTGTGATTGAAGTCTGTAAACTTCTAGAAATGTGAGTCTCTTGTTTGATTATGTGATCCTCAGTCTGAGACATTTGCTTCTGTTTTTTTTAATTTTCTGCTTTGGTAGGGCCTTTCAAGCCCTCTGTATCAATGAATTCAAGGGTCTGAAATTTGAGCAACAACAATCATTTGACCTTCAGAATGGTGAACAGGA
AAATTTATGTTCTTTACAGCATTGTGGCCTGGTCTAATCAACCTTCCGCAACATATTAGTGAAAATTTCCTTACAATTTTCATGGAAAATAAGTTAATAACTGGTGGAATGTTTGACAATAATCCAATCTTTTATTACTATGTGGAAGCCAATAAATTTAAACAAAAAAAATATAGCTGTTTACATGAAGATAAGAACTA
TATTAGGATTTTTCCTGTACTCCATCCTGAGCAGGAACTTTCAAAAATTTGAATCAAAGATTTTAAACTTCCATTTGGGGCATTTTATTCTGTCCTGTTTTCTGCAGTCAGCCAGTTTTATTTTAAGAATGAGTGGCTACATTTTTCTTTTCTTTTTTGAAGACAAGAAACTCAAGCAATTTGTCTGCTTAGGTCTGTGT
CAACAACACC
>TRINITY_DN45952_c1_g1_i6 from sample A8 / Example unspliced isoform:GACCTTCAGAATGGTGAACAGgttagtttgcatctctgcatattttctatgtaagaatgggaagagataaatgatagtggagttaaacaatgtttcattatctgatttagaagtatttgaatcctcattttgagatatgtaagagaaaattctgtactgttctttaatattgcacatcagGAAAATTTATGTTCTTTACA
GCATTGTGGCCTGGTCTAATCAACCTTCCGCAACATATTAGTGAAAATTTCCTTACAATTTTCATGGAAAATAAGTTAATAACTGGTGGAATGTTTGACAATAATCCAATCTTTTATTACTATGTGGAAGCCAATAAATTTAAACAAAAAAAATATAGCTGTTTACATGAAGATAAGAACTATATTAGGATTTTTCCTGT
ACTCCATCCTGAGCAGGAACTTTCAAAAATTTGAATCAAAGATTTTAAACTTCCATTTGGGGCATTTTATTCTGTCCTGTTTTCTGCAGTCAGCCAGTTTTATTTTAAGAATGAGTGGCTACATTTTTCTTTTCTTTTTTGAAGACAAGAAACTCAAGCAATTTGTCTGCTTAGGTCTGTGTCAACAACACC
Intron 4 GTATTTTAAT ... TGAACTGAAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 27.19 | 158 | 59 | 13 |
| A2 | 23.23 | 152 | 46 | 21 |
| A3 | 21.1 | 187 | 50 | 20 |
| A4 | 28.36 | 144 | 57 | 20 |
| A5 | 26.18 | 49 | 17.4 | 8 |
| A6 | 21.69 | 254 | 70.4 | 19 |
| A7 | 19.43 | 394 | 95 | 24 |
| A8 | 21.79 | 341 | 95 | 20 |
| A9 | 21.32 | 347 | 94 | 23 |
| A10 | 22.68 | 317 | 93 | 24 |
>TRINITY_DN113295_c0_g1_i11 from sample A2 / Example spliced isoformAAAAAATTTGAAGTTTTGACAGTGAAAAGAAGGAAATAACATGGGCAAGATGAAGATTTACTAAAATGGCACAATAAGCCCTTACAGATATTTAGATGTTTTGCAGATTTTTAATTCTAAATTAGTTGCATGTAACAAGACCTTCCTGTTTTAATATTCTCTCATTCAAAAAGATAAGGCATACTATGTTGTTCGCTGTG
GAAAATGCTGTACATAAGTATGGGTTTTGGTGACAGGGTACTCACTGCAGCCTGAATATATTCCAGGTTTGTATGTCAAGAGCATGTAAATCCAGCTGAATTCTTTGCAGACCTTATATCCATTGATTACAGCTCATCTGAAAGTGAACATTTATCCCGAAAGAGGATTGATGGGATGATAGAGGCATTTACTAACAAGT
TTTCAACGATGCCAGATCTAAAGGATGGGAATGTGGGATTTGGAATGGAAACTGATAAGGTATCTGTGAAATTAAGAAGGAAAGCTGTTACCCCTGGGAAAGGTGGCTGGTGGAAGCAGTTTCGGCTATTATTGAAGCGAGCATGGATGCAGGTTGAAATTTGAATAACTATTTAAGTCTGTGTTTTCTAGAATATCTAT
TTCATTTTGCATTAGCTTAAATTTCTCAGCATTTCTTTACTAGTATCATACTTCACGATACTTATTTGCTTAAATTTTAACATCTTGATTCTTGGTCATATGATCTTAGCTTGTGAGTAAATAAACCCACCTTATTTCCATGAATTTCAGTATATCTCCTGTTGTAGCTACTGGAATATAGTCCAATTTAAAATGTGTAG
ATGCTGCTATTTACAATGCTTGTATTTGCACCATATTTGGTGATACTTAACAATATTTCTGTGTCATGACTCCTTTCTACCGAGATACTGTGCAGTATAGTATTTGCAAAGTCAATTTCAATATTAGCTGCCTCTGTGTTAGTGCTGCCAAATTCATTGGAAGAATATATATTTTCATGAAGTATGATATAACTCTGAAG
CAATCTCTTATTCCTTTAAACTGTGAGTGGAACTGGATATTGACATTTTAATCAAAGGTGCCACCTTTAGGCTACTCGAGATGGGCCTACAAATAAAGTGCGAGGAAGGATGTCTGTTGCTTCTGCCCTGATCTTTGGATCGATTTTTTGGCGAATGGGATTATCCCAAACATCCATACAGGATCGCATGGGACTACTTC
AGGTGGCGGCTATCAACACAGCAATGGCAGCACTCACTAAGACTGTTAGTGTTTTCCCAAAGGAACGTGCAATTGTAGATAGGGAGCGTGCAAAGGGTTCATATGCCCTGGGACCTTATCTTTTTGCTAAGTTGTTAGCTGAGATTCCTGTTGGAGCTGCTTTTCCTTTGGTCTTTGGTATAATTCTATATCCTCTGGCA
CATCTTCACCCAAGTTTATTGAGGTTTGGGACATTCTCCAGTATTGTGACTGTGGAGTCATTTGCTGCATCAGCCATGGGCTTAACTGTGGGGGCCATGGTGCCTACGACTGAGGCAGCTATGGCTGTAGGGCCATCACTTATGACCATTTTCATTGTCTTTGGAGGTTATTATGTTAACTCAGAGAACACTCCTACAGT
TTTTAGATGGATCCCCCGAATTTCTCTAATCAGATGGGCCTTTCAAGCCCTCTGTATCAATGAATTCAAGGGTCTGAAATTTGAGCAACAACAATCATTTGACCTTCAGAATGGTGAACAGGTGTTGGAACGGCTATCCTTCAGTGGAAGTTCTGTAGGTGATGCACTTGCTCAAGAAGGCCGCATACTACTTTTTTGGT
ACTGGATGACGTATGCTCTTCTGAAAATGAAGAAGCCTAAATACCAACCTCTAGAGCTTCCAACCATACAAGTCCAGTCTACAGCAAAGCTGGAAGAGTTGAAGGATTAAATCACATTGTTATTTAGAAGAGTGAATGTCCTTGCACCTACAGGGAGGACATGTAAATAAATAAGTTGTAAAATTTTAATTACTGGCTTT
AGGAATATAGCCAATCAAGATCATATTTTACTGGCCTCTTTAACTTGGATTACATGATTGGAGTCTGCAATTCCATTTATATCCAAAGTCAAGTATATACTTGTAGCCCTTCCATGTCATCTTGTAGAAGGTTCACTACTTGAGCATAATTAGAAAGAATTTTCTGTTAACCAAATGTCTTCTCATTTTGTTATGGAAGT
TATCCCTAAACTGCAGGCACCGATATTTTTCAAAAACTATGGAAGGGTAAACTCTCTCACTGCTTTAATGAAGTTGCTGAAGCA
>TRINITY_DN113295_c0_g1_i2 from sample A2 / Example unspliced isoform:TTCACATGTTTCTCAGCCTAAGCGAAAGAATACCCCAAATGATTGGCCATCCATCTCTACCCGAGGATTATATTATATTATCTTCTAATCATATCTTCATCTCCTCGCATACTCCCTTTGCTCTCCATGCTGCTTAGCTTTTATCATTAAAGAATTGGGTTCTTCACCAGGCAGGCTATGGCTACTCCCATTGCTAAAAT
TTTAGCAACCATAGTGGCAGCTTTGGCCATTCGTATATTTGCTTTGCCGGGTCCTGTGATTGTTGGAAAAACCCAATTCCAGGATGATGGCAGGAAGGAAGAAGATCAAGAGAACAACGAAGACGAAGAAATCCATGGGAAGATTGTTCCTGTTACACTTCAGTGGCAGAACATCACATGTACTTTATCAGACAAAGCCA
AGAAACTAACGAGATTTCTGCTCACAAATGTCACTGGTGAAGCAAAAGCAGGGCGACTTCTTGCAATAATGGGGCCATCAGGATCTGGAAAGACGACATTGCTAAATGTTCTAGCAGGCCAGCTTGCTGCATCACCTCGGTTACACCTCACCGGCCAACTATATGTCAATGGCAGTCCATTCTATAAGACATCACCTCGG
TTACACCTCACCGGCCAACTATATGTCAATGGCAGTCCATTCTATAAGACGTCACCTAAGATAGCTTTTGTAAGACAAGAAGACCTCTTCTTCTCTCAGTTAACAGTCCGAGAAACATTGTCTCTAGCTGTTGAGCTCCAGCTTTCTAAATTTTCAACTCCTGAAGATAGAGAAAAATATGTGAATGATCTTATCTTTCG
TTTAGGCCTGGTAAATTGTGCAGACACTGTTGTTGGTGATGCAAAAGTTAGGGGAATTAGTGGGGGTGAAAAGAAAAGGCTGTCAGTTGCTTGTGAGATGATTGCCAGCCCATCAGTGATTTTCGCAGATGAACCAACAACTGGGCTAGATGCTTTCCAGGCAGAGATGGTAATGGAGACACTTCGACAACTTGCTCAAG
AAGGACATACAGTAGTATGTTCTATTCATCAGCCTCGAGGTTCAATCTACACAAAATTTGATGATCTAATCTTGTTATCAGAAGGGGCAGTTGTATATGCTGGTCCTGCGAAAGAGGAACCTTTAGTCTATTTTGCTGAACATGGGTTTGTATGTCAAGAGCATGTAAATCCAGCTGAATTCTTTGCAGACCTTATATCC
ATTGATTACAGCTCATCTGAAAGTGAACATTTATCCCGAAAGAGGATTGATGGGATGATAGAGGCATTTACTAACAAGTTTTCAACGATGCCAGATCTAAAGGATGGGAATGTGGGATTTGGAATGGAAACTGATAAGGTATCTGTGAAATTAAGAAGGAAAGCTGTTACCCCTGGGAAAGGTGGCTGGTGGAAGCAGTT
TCGGCTATTATTGAAGCGAGCATGGATGCAGGCTACTCGAGATGGGCCTACAAATAAAGTGCGAGGAAGGATGTCTGTTGCTTCTGCCCTGATCTTTGGATCGATTTTTTGGCGAATGGGATTATCCCAAACATCCATACAGGATCGCATGGGACTACTTCAGgtattttaatcctcaaaattgaactttccagttctat
atatttcagaactgacgagtttttcatttcagtcaaaatgtatcaattttactcaatttgggggagaagttgaaagtttttacatagatatcaaatggtcaagtgcacctaatgatgaaaatctgctttagtctgaaagacgataaaaaataccactttttcaaggtggcagctatcaacacaacaatttaattactgaa
gcttgtgaatgaactgaagGTGGCGGCTATCAACACAGCAATGGCAGCACTCACTAAGACTGTTAGTGTTTTCCCAAAGGAACGTGCAATTGTAGATAGGGAGCGTGCAAAGGGTTCATATGCCCTGGGACCTTATCTTTTTGCTAAGTTGTTAGCTGAGATTCCTGTTGGAGCTGCTTTTCCTTTGGTCTTTGGTATAA
TTCTATATCCTCTGGCACATCTTCACCCAAGTTTATTGAGGTTTGGGACATTCTCCAGTATTGTGACTGTGGAGTCATTTGCTGCATCAGCCATGGGCTTAACTGTGGGGGCCATGGTGCCTACGACTGAGGCAGCTATGGCTGTAGGGCCATCACTTATGACCATTTTCATTGTCTTTGGAGGTTATTATGTTAACTCA
GAGAACACTCCTACAGTTTTTAGATGGATCCCCCGAATTTCTCTAATCAGATGGGCCTTTCAAGCCCTCTGTATCAATGAATTCAAGGGTCTGAAATTTGAGCAACAACAATCATTTGACCTTCAGAATGGTGAACAGGTGTTGGAACGGCTATCCTTCAGTGGAAGTTCTGTAGGTGATGCACTTGCTCAAGAAGGCCG
CATACTACTTTTTTGGTACTGGATGACGTATGCTCTTCTGAAAATGAAGAAGCCTAAATACCAACCTCTAGAGCTTCCAACCATACAAGTCCAGTCTACAGCAAAGCTGGAAGAGTTGAAGGATTAAATCACATTGTTATTTAGAAGAGTGAATGTCCTTGCACCTACAGGGAGGACATGTAAATAAATAAGTTGTAAAA
TTTTAATTACTGGCTTTAGGAATATAGCCAATCAAGATCATATTTTACTGGCCTCTTTAACTTGGATTACATGATTGGAGTCTGCAATTCCATTTATATCCAAAGTCAAGTATATACTTGTAGCCCTTCCATGTCATCTTGTAGAAGGTTCACTACTTGAGCATAATTAGAAAGAATTTTCTGTTAACCAAATGTCTTCT
CATTTTGTTATGGAAGTTATCCCTAAACTGCAGGCACCGATATTTTTCAAAAACTATGGAAGGGTAAACTCTCTCACTGCTTTAATGAAGTTGCTGAAGCA
Intron 5 GTGTTGGAAC ... TATCCTTCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 45.83 | 117 | 102 | 96 |
| A2 | 43.77 | 88 | 77 | 60 |
| A3 | 42.19 | 74 | 58 | 50 |
| A4 | 44.58 | 69 | 57 | 54 |
| A5 | 45.88 | 23 | 20 | 19 |
| A6 | 45.03 | 293 | 242 | 238 |
| A7 | 46.03 | 418 | 374 | 339 |
| A8 | 45.36 | 586 | 517 | 456 |
| A9 | 45.38 | 476 | 422 | 369 |
| A10 | 45.31 | 271 | 236 | 213 |
>TRINITY_DN39630_c0_g1_i4 from sample A10 / Example spliced isoformACTCAGCCTAAGCGAAAGAATACCCCAAATGATTGGCCATCCATCTCTACCCGAGGATTATATTATATTATCTTCTAATCATATCTTCATCTCCTCGCATACTCCCTTTGCTCTCCATGCTGCTTAGCTTTTATCATTAAAGAATTGGGTTCTTCACCAGGCAGGCTATGGCTACTCCCATTGCTAAAATTTTAGCAACC
ATAGTGGCAGCTTTGGCGATTCGTATATTTGCTTTGCCGGGTCCTGTGATTGTTGGAAAAACCCAATTCCAGGATGATGGCAGGAAGGAAGAAGATCAAGAGAACAACGAAGACGAAGAAATCCATGGGAAGATTGTTCCTGTTACACTTCAGTGGCAGAACATCACATGTACTTTATCAGACAAAGCCAAGAAACTAAC
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AAGAAAAGGCTGTCAGTTGCTTGTGAGATGATTGCCAGCCCATCAGTGATTTTCGCAGATGAACCAACAACTGGGCTAGATGCTTTCCAGGCAGAGATGGTAATGGAGACACTTCGACAACTTGCTCAAGAAGGACATACAGTAGTATGTTCTATTCATCAGCCTCGAGGTTCAATCTACACAAAATTTGATGATCTAAT
CTTGTTATCAGAAGGGGCAGTTGTATATGCTGGTCCTGCGAAAGAGGAACCTTTAGTCTATTTTGCTGAACATGGGTTTGTATGTCAAGAGCATGTAAATCCAGCTGAATTCTTTGCAGACCTTATATCCATTGATTACAGCTCATCTGAAAGTGAACATTTATCCCGAAAGAGGATTGATGGGATGATAGAGGCATTTA
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ATGTCTGTTGCTTCTGCCCTGATCTTTGGATCGATTTTTTGGCGAATGGGATTATCCCAAACATCCATACAGGATCGCATGGGACTACTTCAGGTGGCGGCTATCAACACAGCAATGGCAGCACTCACTAAGACTGTTAGTGTTTTCCCAAAGGAACGTGCAATTGTAGATAGGGAGCGTGCAAAGGGTTCATATGCCCT
GGGACCTTATCTTTTTGCTAAGTTGTTAGCTGAGATTCCTGTTGGAGCTGCTTTTCCTTTGGTCTTTGGTATAATTCTATATCCTCTGGCACATCTTCACCCAAGTTTATTGAGGTTTGGGACATTCTCCAGTATTGTGACTGTGGAGTCATTTGCTGCATCAGCCATGGGCTTAACTGTGGGGGCCATGGTGCCTACGA
CTGAGGCAGCTATGGCTGTAGGGCCATCACTTATGACCATTTTCATTGTCTTTGGAGGTTATTATGTTAACTCAGAGAACACTCCTACAGTTTTTAGATGGATCCCCCGAATTTCTCTAATCAGATGGGCCTTTCAAGCCCTCTGTATCAATGAATTCAAGGGTCTGAAATTTGAGCAACAACAATCATTTGACCTTCAG
AATGGTGAACAGTGGAAGTTCTGTAGGTGATGCACTTGCTCAAGAAGGCCGCATACTACTTTTTTGGTACTGGATGACGTATGCTCTTCTGAAAATGAAGAAGCCTAAATACCAACCTCTAGAGCTTCCAACCATACAAGTCCAGTCTACAGCAAAGCTGGAAGAGTTGAAGGATTAAATCACATTGTTATTTAGAAGAG
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TCACTACTTGAGCATAATTAGAAAGAATTTTCTGTTAACCAAATGTCTTCTCATTTTGTTATGGAAGTTATCCCTAAACTGCAGGCACCGATATTTTTCAAAAACTATGGAAGGGTAAACTCTCTCACTGCTTTAATGAAGTTGCTGAAGCATAATATGAATGATTTGCTTATAAATCGG
>TRINITY_DN39630_c0_g1_i5 from sample A10 / Example unspliced isoform:ACTCAGCCTAAGCGAAAGAATACCCCAAATGATTGGCCATCCATCTCTACCCGAGGATTATATTATATTATCTTCTAATCATATCTTCATCTCCTCGCATACTCCCTTTGCTCTCCATGCTGCTTAGCTTTTATCATTAAAGAATTGGGTTCTTCACCAGGCAGGCTATGGCTACTCCCATTGCTAAAATTTTAGCAACC
ATAGTGGCAGCTTTGGCGATTCGTATATTTGCTTTGCCGGGTCCTGTGATTGTTGGAAAAACCCAATTCCAGGATGATGGCAGGAAGGAAGAAGATCAAGAGAACAACGAAGACGAAGAAATCCATGGGAAGATTGTTCCTGTTACACTTCAGTGGCAGAACATCACATGTACTTTATCAGACAAAGCCAAGAAACTAAC
GAGATTTCTGCTCACAAATGTCACTGGTGAAGCAAAAGCAGGGCGACTTCTTGCAATAATGGGGCCATCAGGATCTGGAAAGACGACATTGCTAAATGTTCTAGCAGGCCAGCTTGCTGCATCACCTCGGTTACACCTCACCGGCCAACTATATGTCAATGGCAGTCCATTCTATAAGACGTCACCTAAGATAGCTTTTG
TAAGACAAGAAGACCTCTTCTTCTCTCAGTTAACAGTCCGAGAAACATTGTCTCTAGCTGTTGAGCTCCAGCTTTCTAAATTTTCAACTCCTGAAGATAGAGAAAAATATGTGAATGATCTTATCTTTCGTTTAGGCCTGGTAAATTGTGCAGACACTGTTGTTGGTGATGCAAAAGTTAGGGGAATTAGTGGGGGTGAA
AAGAAAAGGCTGTCAGTTGCTTGTGAGATGATTGCCAGCCCATCAGTGATTTTCGCAGATGAACCAACAACTGGGCTAGATGCTTTCCAGGCAGAGATGGTAATGGAGACACTTCGACAACTTGCTCAAGAAGGACATACAGTAGTATGTTCTATTCATCAGCCTCGAGGTTCAATCTACACAAAATTTGATGATCTAAT
CTTGTTATCAGAAGGGGCAGTTGTATATGCTGGTCCTGCGAAAGAGGAACCTTTAGTCTATTTTGCTGAACATGGGTTTGTATGTCAAGAGCATGTAAATCCAGCTGAATTCTTTGCAGACCTTATATCCATTGATTACAGCTCATCTGAAAGTGAACATTTATCCCGAAAGAGGATTGATGGGATGATAGAGGCATTTA
CTAACAAGTTTTCAACGATGCCAGATCTAAAGGATGGGAATGTGGGATTTGGAATGGAAACTGATAAGGTATCTGTGAAATTAAGAAGGAAAGCTGTTACCCCTGGGAAAGGTGGCTGGTGGAAGCAGTTTCGGCTATTATTGAAGCGAGCATGGATGCAGGCTACTCGAGATGGGCCTACAAATAAAGTGCGAGGAAGG
ATGTCTGTTGCTTCTGCCCTGATCTTTGGATCGATTTTTTGGCGAATGGGATTATCCCAAACATCCATACAGGATCGCATGGGACTACTTCAGGTGGCGGCTATCAACACAGCAATGGCAGCACTCACTAAGACTGTTAGTGTTTTCCCAAAGGAACGTGCAATTGTAGATAGGGAGCGTGCAAAGGGTTCATATGCCCT
GGGACCTTATCTTTTTGCTAAGTTGTTAGCTGAGATTCCTGTTGGAGCTGCTTTTCCTTTGGTCTTTGGTATAATTCTATATCCTCTGGCACATCTTCACCCAAGTTTATTGAGGTTTGGGACATTCTCCAGTATTGTGACTGTGGAGTCATTTGCTGCATCAGCCATGGGCTTAACTGTGGGGGCCATGGTGCCTACGA
CTGAGGCAGCTATGGCTGTAGGGCCATCACTTATGACCATTTTCATTGTCTTTGGAGGTTATTATGTTAACTCAGAGAACACTCCTACAGTTTTTAGATGGATCCCCCGAATTTCTCTAATCAGATGGGCCTTTCAAGCCCTCTGTATCAATGAATTCAAGGGTCTGAAATTTGAGCAACAACAATCATTTGACCTTCAG
AATGGTGAACAGgtgttggaacggctatccttcagTGGAAGTTCTGTAGGTGATGCACTTGCTCAAGAAGGCCGCATACTACTTTTTTGGTACTGGATGACGTATGCTCTTCTGAAAATGAAGAAGCCTAAATACCAACCTCTAGAGCTTCCAACCATACAAGTCCAGTCTACAGCAAAGCTGGAAGAGTTGAAGGATTA
AATCACATTGTTATTTAGAAGAGTGAATGTCCTTGCACCTACAGGGAGGACATGTAAATAAATAAGTTGTAAAATTTTAATTACTGGCTTTAGGAATATAGCCAATCAAGATCATATTTTACTGGCCTCTTTAACTTGGATTACATGATTGGAGTCTGCAATTCCATTTATATCCAAAGTCAAGTATATACTTGTAGCCC
TTCCATGTCATCTTGTAGAAGGTTCACTACTTGAGCATAATTAGAAAGAATTTTCTGTTAACCAAATGTCTTCTCATTTTGTTATGGAAGTTATCCCTAAACTGCAGGCACCGATATTTTTCAAAAACTATGGAAGGGTAAACTCTCTCACTGCTTTAATGAAGTTGCTGAAGCATAATATGAATGATTTGCTTATAAAT
CGG
Intron 6 GTTTGTATGT ... ACGATGCCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 74.67 | 23.8 | 26.5 | 70 |
| A2 | 71.92 | 31.3 | 30 | 80 |
| A3 | 67.65 | 40.3 | 31.5 | 84 |
| A4 | 71.45 | 25.8 | 37 | 64 |
| A5 | 74.5 | 15.8 | 21 | 46 |
| A6 | 77 | 27.5 | 11 | 92 |
| A7 | 80.76 | 51 | 37.5 | 214 |
| A8 | 74.61 | 55.5 | 19 | 163 |
| A9 | 77.76 | 53.5 | 47 | 187 |
| A10 | 74.73 | 43.5 | 35.5 | 128 |
>TRINITY_DN113295_c0_g1_i6 from sample A2 / Example spliced isoformTTCACATGTTTCTCAGCCTAAGCGAAAGAATACCCCAAATGATTGGCCATCCATCTCTACCCGAGGATTATATTATATTATCTTCTAATCATATCTTCATCTCCTCGCATACTCCCTTTGCTCTCCATGCTGCTTAGCTTTTATCATTAAAGAATTGGGTTCTTCACCAGGCAGGCTATGGCTACTCCCATTGCTAAAAT
TTTAGCAACCATAGTGGCAGCTTTGGCCATTCGTATATTTGCTTTGCCGGGTCCTGTGATTGTTGGAAAAACCCAATTCCAGGATGATGGCAGGAAGGAAGAAGATCAAGAGAACAACGAAGACGAAGAAATCCATGGGAAGATTGTTCCTGTTACACTTCAGTGGCAGAACATCACATGTACTTTATCAGACAAAGCCA
AGAAACTAACGAGATTTCTGCTCACAAATGTCACTGGTGAAGCAAAAGCAGGGCGACTTCTTGCAATAATGGGGCCATCAGGATCTGGAAAGACGACATTGCTAAATGTTCTAGCAGGCCAGCTTGCTGCATCACCTCGGTTACACCTCACCGGCCAACTATATGTCAATGGCAGTCCATTCTATAAGACATCACCTCGG
TTACACCTCACCGGCCAACTATATGTCAATGGCAGTCCATTCTATAAGACGTCACCTAAGATAGCTTTTGTAAGACAAGAAGACCTCTTCTTCTCTCAGTTAACAGTCCGAGAAACATTGTCTCTAGCTGTTGAGCTCCAGCTTTCTAAATTTTCAACTCCTGAAGATAGAGAAAAATATGTGAATGATCTTATCTTTCG
TTTAGGCCTGGTAAATTGTGCAGACACTGTTGTTGGTGATGCAAAAGTTAGGGGAATTAGTGGGGGTGAAAAGAAAAGGCTGTCAGTTGCTTGTGAGATGATTGCCAGCCCATCAGTGATTTTCGCAGATGAACCAACAACTGGGCTAGATGCTTTCCAGGCAGAGATGGTAATGGAGACACTTCGACAACTTGCTCAAG
AAGGACATACAGTAGTATGTTCTATTCATCAGCCTCGAGGTTCAATCTACACAAAATTTGATGATCTAATCTTGTTATCAGAAGGGGCAGTTGTATATGCTGGTCCTGCGAAAGAGGAACCTTTAGTCTATTTTGCTGAACATGGGGTACTCACTGCAGCCTGAATATATTCCAGATCTAAAGGATGGGAATGTGGGATT
TGGAATGGAAACTGATAAGGTATCTGTGAAATTAAGAAGGAAAGCTGTTACCCCTGGGAAAGGTGGCTGGTGGAAGCAGTTTCGGCTATTATTGAAGCGAGCATGGATGCAGG
>TRINITY_DN113295_c0_g1_i11 from sample A2 / Example unspliced isoform:AAAAAATTTGAAGTTTTGACAGTGAAAAGAAGGAAATAACATGGGCAAGATGAAGATTTACTAAAATGGCACAATAAGCCCTTACAGATATTTAGATGTTTTGCAGATTTTTAATTCTAAATTAGTTGCATGTAACAAGACCTTCCTGTTTTAATATTCTCTCATTCAAAAAGATAAGGCATACTATGTTGTTCGCTGTG
GAAAATGCTGTACATAAGTATGGGTTTTGGTGACAGGGTACTCACTGCAGCCTGAATATATTCCAGgtttgtatgtcaagagcatgtaaatccagctgaattctttgcagaccttatatccattgattacagctcatctgaaagtgaacatttatcccgaaagaggattgatgggatgatagaggcatttactaacaagt
tttcaacgatgccagATCTAAAGGATGGGAATGTGGGATTTGGAATGGAAACTGATAAGGTATCTGTGAAATTAAGAAGGAAAGCTGTTACCCCTGGGAAAGGTGGCTGGTGGAAGCAGTTTCGGCTATTATTGAAGCGAGCATGGATGCAGGTTGAAATTTGAATAACTATTTAAGTCTGTGTTTTCTAGAATATCTAT
TTCATTTTGCATTAGCTTAAATTTCTCAGCATTTCTTTACTAGTATCATACTTCACGATACTTATTTGCTTAAATTTTAACATCTTGATTCTTGGTCATATGATCTTAGCTTGTGAGTAAATAAACCCACCTTATTTCCATGAATTTCAGTATATCTCCTGTTGTAGCTACTGGAATATAGTCCAATTTAAAATGTGTAG
ATGCTGCTATTTACAATGCTTGTATTTGCACCATATTTGGTGATACTTAACAATATTTCTGTGTCATGACTCCTTTCTACCGAGATACTGTGCAGTATAGTATTTGCAAAGTCAATTTCAATATTAGCTGCCTCTGTGTTAGTGCTGCCAAATTCATTGGAAGAATATATATTTTCATGAAGTATGATATAACTCTGAAG
CAATCTCTTATTCCTTTAAACTGTGAGTGGAACTGGATATTGACATTTTAATCAAAGGTGCCACCTTTAGGCTACTCGAGATGGGCCTACAAATAAAGTGCGAGGAAGGATGTCTGTTGCTTCTGCCCTGATCTTTGGATCGATTTTTTGGCGAATGGGATTATCCCAAACATCCATACAGGATCGCATGGGACTACTTC
AGGTGGCGGCTATCAACACAGCAATGGCAGCACTCACTAAGACTGTTAGTGTTTTCCCAAAGGAACGTGCAATTGTAGATAGGGAGCGTGCAAAGGGTTCATATGCCCTGGGACCTTATCTTTTTGCTAAGTTGTTAGCTGAGATTCCTGTTGGAGCTGCTTTTCCTTTGGTCTTTGGTATAATTCTATATCCTCTGGCA
CATCTTCACCCAAGTTTATTGAGGTTTGGGACATTCTCCAGTATTGTGACTGTGGAGTCATTTGCTGCATCAGCCATGGGCTTAACTGTGGGGGCCATGGTGCCTACGACTGAGGCAGCTATGGCTGTAGGGCCATCACTTATGACCATTTTCATTGTCTTTGGAGGTTATTATGTTAACTCAGAGAACACTCCTACAGT
TTTTAGATGGATCCCCCGAATTTCTCTAATCAGATGGGCCTTTCAAGCCCTCTGTATCAATGAATTCAAGGGTCTGAAATTTGAGCAACAACAATCATTTGACCTTCAGAATGGTGAACAGGTGTTGGAACGGCTATCCTTCAGTGGAAGTTCTGTAGGTGATGCACTTGCTCAAGAAGGCCGCATACTACTTTTTTGGT
ACTGGATGACGTATGCTCTTCTGAAAATGAAGAAGCCTAAATACCAACCTCTAGAGCTTCCAACCATACAAGTCCAGTCTACAGCAAAGCTGGAAGAGTTGAAGGATTAAATCACATTGTTATTTAGAAGAGTGAATGTCCTTGCACCTACAGGGAGGACATGTAAATAAATAAGTTGTAAAATTTTAATTACTGGCTTT
AGGAATATAGCCAATCAAGATCATATTTTACTGGCCTCTTTAACTTGGATTACATGATTGGAGTCTGCAATTCCATTTATATCCAAAGTCAAGTATATACTTGTAGCCCTTCCATGTCATCTTGTAGAAGGTTCACTACTTGAGCATAATTAGAAAGAATTTTCTGTTAACCAAATGTCTTCTCATTTTGTTATGGAAGT
TATCCCTAAACTGCAGGCACCGATATTTTTCAAAAACTATGGAAGGGTAAACTCTCTCACTGCTTTAATGAAGTTGCTGAAGCA