sp|Q9SMX9|SPL1_ARATH ----> Squamosa promoter-binding-like protein 1
Intron 1 GTATGCTATT ... TCCTTCACAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 10.23 | 46 | 6.5 | 5.3 |
| A2 | 27.72 | 26 | 5.3 | 10 |
| A3 | 28.57 | 20 | 3.3 | 8 |
| A4 | 21.59 | 18 | 3.5 | 5 |
| A5 | 22.22 | 14 | 0.3 | 4 |
| A6 | 31.13 | 21 | 2.5 | 9.5 |
| A7 | 20.26 | 15.8 | 1.5 | 4 |
| A8 | 15.79 | 16 | 1.5 | 3 |
| A9 | 15.79 | 16 | 1 | 3 |
| A10 | 11.11 | 16 | 2 | 2 |
>TRINITY_DN108238_c0_g1_i1 from sample A3 / Example spliced isoformCTGAGCTAGAATTCTGATCGTATTACTATGTCCATTCTTCCTGACATGTGATGCTTTTAACACAGGATCGTACTGGACGAATAGTTTTCAAACTCTTTGGCAAAGATCCAAGTGAAATTCCTCAAGTTTTACGTTCACAGATCCTAGATTGGCTTGCTCACAGCCCTTCAGATATAGAGAGCTATATCAGGCCTGGCTGT
GTCATACTAACAATTTATTTATGCTTATCCGAGCCTGTGTGGCAGGAGCTTACCAGGGGCTTCAAAGTTTGCTTAGAGAGGCTTCTTGGGGCCTCAAATAGTGATTTCTGGAATACAGGATGGATATTTGCCCAACTGGATCATCAAATTGCATTCATTTATGATGGTCAGGTTTTGTTGGACATGTCCTCAAATTATGC
GAGTGCTCCTCTACTTTTAAGTGTTACGCCCATTGCTGTTACTGCTGGCGAGAAAGCAAACATTGTGGTGAAAGGCCATAATCTTACCAGTTCAACTTCAAAGATTCTTTGTGCCTTTCAAGGGAAGCACACGGTACAAGAAGCTTCAACTGAATACGTACAAGATGTTCATGTTCCATTTCACGGTGGCAGCGATAATT
TTGAGGGATGCACACAGATCCTGTGTCGGAGCTTTTCCTGGTCCCCACAGAATGTCATTGGAAGATGCTTTATTGAGGTTGAAGGCCATGATATGAGAGGTAATTTCTTTCCAGTCATAGTGGCAGAAGAAGATGTTTGTGCTGAAATTCGCACGCTAGAAAGGTATATTGATATGCCTTTTAGTAGCAATCATGGTGTC
ACAAAACAAAATCCAGATTTGCAACTGAAAGTACAGAGACAGGCAATAAAATTCTTGCATGAACTAGGTTGGCTATTTCAGAGAAGCTTCTTATCTCAGTCAAACCTTGGGATCTTACCTCTGACTACATTTTCACCTATTCGATTGAAGTGGCTTCTTGAGTATGCAACTGAACAGGACTGGTGCTCAGTTGTGCGGAA
ACTTCTGAACATTTTATTCAGTAGCAATGTAAACGGTGCTAATTCGTCAGCCATCACCATTTTGGGTGAAGTTGGTATTTTACATATAGCTGTGCGGAGAAATTGCAGGGCAATGGTTGAGTTTCTATTGGCTTATGTTCCGGAGTCTGTGGCAGAAGAGACAATGTTCACACCCGGTCAAGGACATGAGAAACTAAGTA
GCAGCAATGGCTTTGTACTCAAGCCTGACATGCCTGGACCTGCGGGCCTTACTCCTCTTCATATTGCAGCTAGCATGGAGAAAGCAGAAGGTGTACTGGATGCACTCACCAATGATCCAGGCCAGGTAATTAAAAATGTTTATGCTAGTTGCACA
>TRINITY_DN108238_c0_g1_i4 from sample A3 / Example unspliced isoform:CCGAGCCTGTGTGGCAGGAGgtatgctattttaattgcaatttttctgtttagcttttatgtattagttgggaacttgatttgatctttttcttccttcacagCTTACCAGGGGCTTCAAAGTTTGCTTAGAGAGGCTTCTTGGGGCCTCAAATAGTGATTTCTGGAATACAGGATGGATATTTGCCCAACTGGATCATC
AAATTGCATTCATTTATGATGGTCAGGTTTTGTTGGACATGTCCTCAAATTATGCGAGTGCTCCTCTACTTTTAAGTGTTACGCCCATTGCTGTTACTGCTGGCGAGAAAGCAAACATTGTGGTGAAAGGCCATAATCTTACCAGTTCAACTTCAAAGATTCTTTGTGCCTTTCAAGGGAAGCACACGGTACAAGAAGCT
TCAACTGAATACGTACAAGATGTTCATGTTCCATTTCACGGTGGCAGCGATAATTTTGAGGGATGCACACAGATCCTGTGTCGGAGCTTTTCCTGGTCCCCACAGAATGTCATTGGAAGATGCTTTATTGAGGTTGAAGGCCATGATATGAGAGGTAATTTCTTTCCAGTCATAGTGGCAGAAGAAGATGTTTGTGCTGA
AATTCGCACGCTAGAAAGGTATATTGATATGCCTTTTAGTAGCAATCATGGTGTCACAAAACAAAATCCAGATTTGCAACTGAAAGTACAGAGACAGGCAATAAAATTCTTGCATGAACTAGGTTGGCTATTTCAGAGAAGCTTCTTATCTCAGTCAAACCTTGGGATCTTACCTCTGACTACATTTTCACCTATTCGAT
TGAAGTGGCTTCTTGAGTATGCAACTGAACAGGACTGGTGCTCAGTTGTGCGGAAACTTCTGAACATTTTATTCAGTAGCAATGTAAACGGTGCTAATTCGTCAGCCATCACCATTTTGGGTGAAGTTGGTATTTTACATATAGCTGTGCGGAGAAATTGCAGGGCAATGGTTGAGTTTCTATTGGCTTATGTTCCGGAG
TCTGTGGCAGAAGAGACAATGTTCACACCCGGTCAAGGACATGAGAAACTAAGTAGCAGCAATGGCTTTGTACTCAAGCCTGACATGCCTGGACCTGCGGGCCTTACTCCTCTTCATATTGCAGCTAGCATGGAGAAAGCAGAAGGTGTACTGGATGCACTCACCAATGATCCAGGCCAGATTGGAGCTAAAGCATGGAC
CGATGTTCGTGATAAAACTGGCATGACTCCTGAAGACTATGCATTGCTAAGAGGCCGCCATGCTTACATTGAACTGGTTCATAAAAAACGTGAAAAAAATGTGATACCTGAACATGTTAGCCTTGACATTCCTGAGCATTTGTCCCACGAAAAAAGCAGCATAACAACACCAGTTTCTGCACTATGTTTGACTTCACAGG
CAGGCAAAAGTGAAGGTAATATACAGGGGAAAAAAGCTGACCTGGAGTTGAGTCAGAAGATTAGATGGTCTGGTGGTCTCCATTCAGACCAAGGTAAGATACGGCCTTTGCCATCTTATTGCAAACTTTGTGACCAGCAACAACTTAGCAGATACAGATCAAACACCCTTTTATACAGGCCTGCGATGCTTTCTATGATG
GCTATTGCAACTGTCTGTCTGTGTGTGACAATTCTTCTGAAGGGACCACCGCAAGTTCTCTTTGTGATGCCTCCTTTCAGGTGGGAATCGGTAAAATTTGGACCCATGTAAAGTGTATTTTTAGTGGCAATGTAGTCAAGGCTGTTTCTGCTATTTTATCAATAATCGAGCAACAAGGCTAGGGCTGTGGTTACTAACCA
ACCCTCTGCCAATTGCAGAGTCTAACTTTATCTGTTTATTGTTAGGTATTGTTTCTTCTATGGTTTGTACATCTATCATTTTATTCATTTTCTTAAATAAGTATGCCTGTATTACAAGTTGAGATAGTTTCCACTTGTTTTTGTCCTGTGCAAGATAAGTAAAATATGAACAGTATGCCCCGCACTTCAACTGAGAAATA
CTATTCTGTTGTTTTAATTTGATTATGAACATTTGATTCTTTCCAGATCATGCTACTTTCAACATGGTATGATGTAATACTGGATGTACTTTATAGTGTAAAGTTATGTGTAGTGTCTAATATTTAGAATTATTGTTGAAAGATTTGGAGATGTTCACG
Intron 2 GTAATGCTTA ... AAATGGAGAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 13.89 | 31 | 2 | 8 |
| A2 | 24.53 | 20 | 12 | 1 |
| A3 | 14.89 | 20 | 3 | 4 |
| A4 | 16 | 21 | 2 | 6 |
| A5 | 20 | 26 | 9 | 4 |
| A6 | 11.43 | 31 | 4 | 4 |
| A7 | 5 | 38 | 2 | 2 |
| A8 | 7.32 | 19 | 1 | 2 |
| A9 | 5.45 | 26 | 1 | 2 |
| A10 | 10.34 | 13 | 1 | 2 |
>TRINITY_DN96799_c0_g1_i5 from sample A4 / Example spliced isoformGTGATGTGGAGTGGGGCGGTTATGTAATGTTGCGCTTGGTTAAAGCGTCTGATATGAAATGAGTGAATGACCTTTGGTAGGAAGCCTACTTGTCTGTCCGGATGGTAGGTTAAAAATGGTGTGTACCCGACTGCAGGAGGTTCTGTGGAGAAAGTCAGTCTTTTCGGATAACGATGGAATGGAAGTCATTACTTAGAAAT
GGTGCCTGGAAGCAGGTTTCGTTGAATCGATTGGTGTTTTTGGGTGTATTTGGTAGTTTAGATCTGAAGGCAAACGATGCCCAGTTGCAGACTCTTTAGGTGAAAGTGCAGGTTATGATGGGTGCTTGTGACGTTACGTCTGGGGAAATTGGTGCCCAAGTTCAGGGTCAATAGAAGGTAAAAGTTTTGGAGTTTTTCTA
GGCTTGTTTCAAATATTGAATATTGATGTGCCAGCATAGCTTGTTGATAATTCTGGGGGCAGAAATAAGGGTTTTGAGTTGTTTGGAAGCTTAGATCTGGTAACAGAATACCCAATTGCAAGGGTGTGGTAGCTATTGTGAGGTGTGTCTAGAGGCTTGGATTAGCAGAAACTGATGCTCAACCGCAGGTTTCGGTGGTG
TTTGGAAGTCTGGGCGTGGAAGGAGTGATTCCCAAGGTAGGTTTGGTGGAGATTTTGGTAAAAAGAAGATATATTTGAGTGTGTGTTGGATGAGGTAGAGGTGAGGTGAAAATATGGAGGCAGAAATTGGTAGAAATCATTGTGATGATCAGGTTTATCAGCAGCAGAGGCAGCAACAGCGCCAGATTTACGCTTCCAAA
GGACACAATTTTATGTCGAAGGGGAAGCACATACTGGAAGATCATGAATGGGATGTGAACAACTGGGAATGGGACTGCAATCGCTTCATTGCCAGGCCTCTGAGCATTGACAAGGGACTGGGATTTCAAGGTAAACATCTCTTGGCAGATGGTTCACAGCCTGCTAATGGGATTTCCAATGACTTTCACAACAAAAATGG
CGATGCGTACAATAATGGGTTTCATAGTTATAACATAAATGATGCAGCAGAGAAGAGAAGAAAGGTGTCAGTTGTGGAAGAGGAGGAAACGGCAGAAGAAGAAACAGCAGCATGCTTAACTCTTAAGCTCGGTGGAAGTGATTTTCCCGTTGCAGATACAGATGCAGATGCGGCCAACGGTGGGAGTAAGAATGGAAAGA
GGTCTCGTGGGATGCCGGCTTCGTCTCATCATCATCCAATGTGCCAAGTTGATGATTGTAAAGCAGATCTCAACAATGCGAAAGACTATCACAGGCGCCATAAGGTCTGCGAGATGCATGCTAAGGCTAACAAGGCTCTTGTCAGCAGGCTTATGCAGAGGTTTTGTCAGCAGTGTAGCAGGTTTCATCTTCTTCAAGAG
TTTGATGAGGGGAAGAGAAGTTGCCGAAGACGCTTAGCTGGTCATAATAGGCGGCGGAGGAAAACTCATCCCGATGGCATTATTGCTGGGACTTGTCTGAATGATGAGCGTGGCAGTTACTCTCTGATTATCAATCTGTTGAAGGTTCTAGCTCAGTTACAGACATCTAATAATCCTGACCAGGCAAGTAACCAGGATAC
TGTACTTGAACTTCTGAAGAAACTTGCTACCTCTGCTACCATACCTGAGGATACCAATACAGCAGCTGCAAAACAATCCACGGCAGATCAGCCAAATAATAGAGTCTCTCTTGGTGTCCCTTCAGAAAATACATTGCATCCATTGCAAAACAATTTTCTTGTTTGCAATGCCACTGCTGAAAGCAAAAAACCACATGATT
CGGTCAGACCTCATGATGTGCAATCTAGCATGCAAAATATTTCAACTATTGGATCATTATCTATGGGATGTCTGGACTCTCATTCAGATGTATTCAGGAAGAGTACAGAGCCTTCTATCTGTGAGCGTGAACAACCTTTTGTTTCAACTCAAATGCGAAATGATGTACTTTTTCCATATGATTCTGCACAGAAAACTGTT
ATATCAGCTGTACCCCAGTATTCTTGTAACTTTCGGCAGAAACATGAAGGTATTCAGCAAGAACATGTGTTAACTGGATCTGTGCCACAGTCTCTATCGATGGAATCAACTGATAAACGGAGGTCTAGCATATCAAATGGTTTTGATTTAAATAACGTTTACAATACACCTGAAGAATTAGTTCCTGGATCAGATGGTCC
TTCAACGTTATTGCTGCTAGGAGGACTTGACAGTATAAGCAGGCAGAATGCTCCTCTCTGCAGTTCATGGGCAGCATCAGACATTTACCGAACAAGTCCACCTCAAATAAGTGACAACTCGGAATCGGGGTCTGACCAATCACCATCAAGTTCACAAGGAGATGGCCAGGATCGTACTGGACGAATAGTTTTCAAACTCT
TTGGCAAAGATCCAAGTGAAATTCCTCAAGTTTTACGTTCACAGATCCTAGATTGGCTTGCTCACAGCCCTTCAGATATAGAGAGCTATATCAGGCCTGGCTGTGTCATACTAACAATTTATTTATGCTTATCCGAGCCTGTGTGGCAGGAGCTTACCAGGGGCTTCAAAGTTTGCTTAGAGAGGCTTCTTGGGGCCTCA
AATAGTGATTTCTGGAATACAGGATGGATATTTGCCCAACTGGATCATCAAATTGCATTCATTTATGATGGTCAGGTTTTGTTGGACATGTCCTCAAATTATGCGAGTGCTCCTCTACTTTTAAGTGTTACGCCCATTGCTGTTACTGCTGGCGAGAAAGCAAACATTGTGGTGAAAGGCCATAATCTTACCAGTTCAAC
TTCAAAGATTCTTTGTGCCTTTCAAGGGAAGCACACGGTACAAGAAGCTTCAACTGAATACGTACAAGATGTTCATGTTCCATTTCACGGTGGCAGCGATAATTTTGAGGGATGCACACAGATCCTGTGTCGGAGCTTTTCCTGGTCCCCACAGAATGTCATTGGAAGATGCTTTATTGAGGTTGAAGGCCATGATATGA
GAGGTAATTTCTTTCCAGTCATAGTGGCAGAAGAAGATGTTTGTGCTGAAATTCGCACGCTAGAAAGGTATATTGATATGCCTTTTAGTAGCAATCATGGTGTCACAAAACAAAATCCAGATTTGCAACTGAAAGTACAGAGACAGGCAATAAAATTCTTGCATGAACTAGGTTGGCTATTTCAGAGAAGCTTCTTATCT
CAGTCAAACCTTGGGATCTTACCTCTGACTACATTTTCACCTATTCGATTGAAGTGGCTTCTTGAGTATGCAACTGAACAGGACTGGTGCTCAGTTGTGCGGAAACTTCTGAACATTTTATTCAGTAGCAATGTAAACGGTGCTAATTCGTCAGCCATCACCATTTTGGGTGAAGTTGGTATTTTACATATAGCTGTGCG
GAGAAATTGCAGGGCAATGGTTGAGTTTCTATTGGCTTATGTTCCGGAGTCTGTGGCAGAAGAGACAATGTTCACACCCGGTCAAGGACATGAGAAACTAAGTAGCAGCAATGGCTTTGTACTCAAGCCTGACATGCCTGGACCTGCGGGCCTTACTCCTCTTCATATTGCAGCTAGCATGGAGAAAGCAGAAGGTGTAC
TGGATGCACTCACCAATGATCCAGGCCAGATTGGAGCTAAAGCATGGACCGATGTTCGTGATAAAACTGGCATGACTCCTGAAGACTATGCATTGCTAAGAGGCCGCCATGCTTACATTGAACTGGTTCATAAAAAACGTGAAAAAAATGTGATACCTGAACATGTTAGCCTTGACATTCCTGAGCATTTGTCCCACGAA
AAAAGCAGCATAACAACACCAGTTTCTGCACTATGTTTGACTTCACAGGCAGGCAAAAGTGAAGGTAATATACAGGGGAAAAAAGCTGACCTGGAGTTGAGTCAGAAGATTAGATGGTCTGGTGGTCTCCATTCAGACCAAGGTAAGATACGGCCTTTGCCATCTTATTGCAAACTTTGTGACCAGCAACAACTTAGCAG
ATACAGATCAAACACCCTTTTATACAGGCCTGCGATGCTTTCTATGATGGCTATTGCAACTGTCTGTCTGTGTGTGACAATTCTTCTGAAGGGACCACCGCAAGTTCTCTTTGTGATGCCTCCTTTCAGGTGGGAATCGGTAAAATTTGGACCCATGTAAAGTGTATTTTTAGTGGCAATGTAGTCAAGGCTGTTTCTGC
TATTTTATCAATAATCGAGCAACAAGGCTAGGGCTGTGGTTACTAACCAACCCTCTGCCAATTGCAGAGTCTAACTTTATCTGTTTATTGTTAGGTATTGTTTCTTCTATGGTTTGTACATCTATCATTTTATTCATTTTCTTAAATAAGTATGCCTGTATTACAAGTTGAGATAGTTTCCACTTGTTTTTGTCCTGTGC
AAGATAAGTAAAATATGAACAGTATGCCCCGCACTTCAACTGAGAAATACTATTCTGTTGTTTTAATTTGATT
>TRINITY_DN96799_c0_g1_i7 from sample A4 / Example unspliced isoform:CTGTCTTCTGAAGATGTTTTGGATTTGTTGCAAATACTAGTTTCTTCATTTCAACTTTTAATTATTCAAAATCTTTTATACAAATGTGTGGTATGCATCAGATCCTAGATTGGCTTGCTCACAGCCCTTCAGATATAGAGAGCTATATCAGGCCTGGCTGTGTCATACTAACAATTTATTTATGCTTATCCGAGCCTGTG
TGGCAGGAGGTATGCTATTTTAATTGCAATTTTTCTGTTTAGCTTTTATGTATTAGTTGGGAACTTGATTTGATCTTTTTCTTCCTTCACAGCTTACCAGGGGCTTCAAAGTTTGCTTAGAGAGGCTTCTTGGGGCCTCAAATAGTGATTTCTGGAATACAGGATGGATATTTGCCCAACTGGATCATCAAATTGCATTC
ATTTATGATGgtaatgcttaattttgttggcaatctgtaggtggaaaacaagagaataccatatcactcttgcttgtatgttgatctaattgtatttttgcatttctttctacatctctcttactagatagtccttgcatgggaagaagtaacccttatattttctttactagggagccagattgaaaatggagagGTCA
GGTTTTGTTGGACATGTCCTCAAATTATGCGAGTGCTCCTCTACTTTTAAGTGTTACGCCCATTGCTGTTACTGCTGGCGAGAAAGCAAACATTGTGGTGAAAGGCCATAATCTTACCAGTTCAACTTCAAAGTATTGAATCTCACTTTCATGATCATTTGTGAATATATTCTTTCATTTGGTTGGGGAAATCTGAAAGA
AATGCAC
Intron 3 GTGCAAAATT ... GCTGTTTCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 19.01 | 49 | 12 | 11 |
| A2 | 17.24 | 36 | 10 | 5 |
| A3 | 17.89 | 39 | 8 | 9 |
| A4 | 11.27 | 63 | 8 | 8 |
| A5 | 15.38 | 22 | 3 | 5 |
| A6 | 10.2 | 66 | 6 | 9 |
| A7 | 16.13 | 52 | 9 | 11 |
| A8 | 16.79 | 57 | 7 | 16 |
| A9 | 23.81 | 40 | 14 | 11 |
| A10 | 13.46 | 45 | 8 | 6 |
>TRINITY_DN114800_c0_g1_i2 from sample A1 / Example spliced isoformGTATTTTGTTAACAATTTGGTTGGTTTTTTCTAAGAGCTGTTGTTGGTGGGCGATTTTTTTTTTGAACTTTTGGTCATGTGAGTGATGTGATGTGGAGTGGGGCGGTTATGTAATGTTGCGCTTGGTTAAAGCGTCTGATATGAAATGAGTGAATGACCTTTGGTAGGAAGCCTACTTGTCTGTCCGGATGGTAGGTTAA
AAATGGTGTGTACCCGACTGCAGGAGGTTCTGTGGAGAAAGTCAGTCTTTTCGGATAACGATGGAATGGAAGTCATTACTTAGAAATGGTGCCTGGAAGCAGGTTTCGTTGAATCGATTGGTGTTTTTGGGTGTATTTGGTAGTTTAGATCTGAAGGCAAACGATGCCCAGTTGCAGACTCTTTAGGTGAAAGTGCAGGT
TATGATGGGTGCTTGTGACGTTACGTCTGGGGAAATTGGTGCCCAAGTTCAGGGTCAATAGAAGGTAAAAGTTTTGGAGTTTTTCTAGGCTTGTTTCAAATATTGAATATTGATGTGCCAGCATAGCTTGTTGATAATTCTGGGGGCAGAAATAAGGGTTTTGAGTTGTTTGGAAGCTTAGATCTGGTAACAGAATACCC
AATTGCAAGGGTGTGGTAGCTATTGTGAGGTGTGTCTAGAGGCTTGGATTAGCAGAAACTGATGCTCAACCGCAGGTTTCGGTGGTGTTTGGAAGTCTGGGCGTGGAAGGAGTGATTCCCAAGGTAGGTTTGGTGGAGATTTTGGTAAAAAGAAGATATATTTGAGTGTGTGTTGGATGAGGTAGAGGTGAGGTGAAAAT
ATGGAGGCAGAAATTGGTAGAAATCATTGTGATGATCAGGTTTATCAGCAGCAGAGGCAGCAACAGCGCCAGATTTACGCTTCCAAAGGACACAATTTTATGTCGAAGGGGAAGCACATACTGGAAGATCATGAATGGGATGTGAACAACTGGGAATGGGACTGCAATCGCTTCATTGCCAGGCCTCTGAGCATTGACAA
GGGACTGGGATTTCAAGGTAAACATCTCTTGGCAGATGGTTCACAGCCTGCTAATGGGATTTCCAATGACTTTCACAACAAAAATGGCGATGCGTACAATAATGGGTTTCATAGTTATAACATAAATGATGCAGCAGAGAAGAGAAGAAAGGTGTCAGTTGTGGAAGAGGAGGAAACGGCAGAAGAAGAAACAGCAGCAT
GCTTAACTCTTAAGCTCGGTGGAAGTGATTTTCCCGTTGCAGATACAGATGCAGATGCGGCCAACGGTGGGAGTAAGAATGGAAAGAGGTCTCGTGGGATGCCGGCTTCGTCTCATCATCATCCAATGTGCCAAGTTGATGATTGTAAAGCAGATCTCAACAATGCGAAAGACTATCACAGGCGCCATAAGGTCTGCGAG
ATGCATGCTAAGGCTAACAAGGCTCTTGTCAGCAGGCTTATGCAGAGGTTTTGTCAGCAGTGTAGCAGGTTTCATCTTCTTCAAGAGTTTGATGAGGGGAAGAGAAGTTGCCGAAGACGCTTAGCTGGTCATAATAGGCGGCGGAGGAAAACTCATCCCGATGGCATTATTGCTGGGACTTGTCTGAATGATGAGCGTGG
CAGTTACTCTCTGATTATCAATCTGTTGAAGGTTCTAGCTCAGTTACAGACATCTAATAATCCTGACCAGGCAAGTAACCAGGATACTGTACTTGAACTTCTGAAGAAACTTGCTACCTCTGCTACCATACCTGAGGATACCAATACAGCAGCTGCAAAACAATCCACGGCAGATCAGCCAAATAATAGAGTCTCTCTTG
GTGTCCCTTCAGAAAATACATTGCATCCATTGCAAAACAATTTTCTTGTTTGCAATGCCACTGCTGAAAGCAAAAAACCACATGATTCGGTCAGACCTCATGATGTGCAATCTAGCATGCAAAATATTTCAACTATTGGATCATTATCTATGGGATGTCTGGACTCTCATTCAGATGTATTCAGGAAGAGTACAGAGCCT
TCTATCTGTGAGCGTGAACAACCTTTTGTTTCAACTCAAATGCGAAATGATGTACTTTTTCCATATGATTCTGCACAGAAAACTGTTATATCAGCTGTACCCCAGTATTCTTGTAACTTTCGGCAGAAACATGAAGGTATTCAGCAAGAACATGTGTTAACTGGATCTGTGCCACAGTCTCTATCGATGGAATCAACTGA
TAAACGGAGGTCTAGCATATCAAATGGTTTTGATTTAAATAACGTTTACAATACACCTGAAGAATTAGTTCCTGGATCAGATGGTCCTTCAACGTTATTGCTGCTAGGAGGACTTGACAGTATAAGCAGGCAGAATGCTCCTCTCTGCAGTTCATGGGCAGCATCAGACATTTACCGAACAAGTCCACCTCAAATAAGTG
ACAACTCGGAATCGGGGTCTGATCAATCACCATCAAGTTCACAAGGAGATGGCCAGGATCGTACTGGACGAATAGTTTTCAAACTCTTTGGCAAAGATCCAAGTGAAATTCCTCAAGTTTTACGTTCACAGATCCTAGATTGGCTTGCTCACAGCCCTTCAGATATAGAGAGCTATATCAGGCCTGGCTGTGTCATACTA
ACAATTTATTTATGCTTATCCGAGCCTGTGTGGCAGGAGCTTACCAGGGGCTTCAAAGTTTGCTTAGAGAGGCTTCTTGGGGCCTCAAATAGTGATTTCTGGAATACAGGATGGATATTTGCCCAACTGGATCATCAAATTGCATTCATTTATGATGGTCAGGTTTTGTTGGACATGTCCTCAAATTATGCGAGTGCTCC
TCTACTTTTAAGTGTTACGCCCATTGCTGTTACTGCTGGCGAGAAAGCAAACATTGTGGTGAAAGGCCATAATCTTACCAGTTCAACTTCAAAGATTCTTTGTGCCTTTCAAGGGAAGCACACGGTACAAGAAGCTTCAACTGAATACGTACAAGATGTTCATGTTCCATTTCACGGTGGCAGCGATAATTTTGAGGGAT
GCACACAGATCCTGTGTCGGAGCTTTTCCTGGTCCCCACAGAATGTCATTGGAAGATGCTTTATTGAGGTTGAAGGCCATGATATGAGAGGTAATTTCTTTCCAGTCATAGTGGCAGAAGAAGATGTTTGTGCTGAAATTCGCACGCTAGAAAGGTATATTGATATGCCTTTTAGTAGCAATCATGGTGTCACAAAACAA
AATCCAGATTTGCAACTGAAAGTACAGAGACAGGCAATAAAATTCTTGCATGAACTAGGTTGGCTATTTCAGAGAAGCTTCTTATCTCAGTCAAACCTTGGGATCTTACCTCTGACTACATTTTCACCTATTCGATTGAAGTGGCTTCTTGAGTATGCAACTGAACAGGACTGGTGCTCAGTTGTGCGGAAACTTCTGAA
CATTTTATTCAGTAGCAATGTAAACGGTGCTAATTCGTCAGCCATCACCATTTTGGGTGAAGTTGGTATTTTACATATAGCTGTGCGGAGAAATTGCAGGGCAATGGTTGAGTTTCTATTGGCTTATGTTCCGGAGTCTGTGGCAGAAGAGACAATGTTCACACCCGGTCAAGGACATGAGAAACTAAGTAGCAGCAATG
GCTTTGTACTCAAGCCTGACATGCCTGGACCTGCGGGCCTTACTCCTCTTCATATTGCAGCTAGCATGGAGAAAGCAGAAGGTGTACTGGATGCACTCACCAATGATCCAGGCCAGGTAATTAAAAATGTTTATGCTAGTTGCACAGATACAGATATCACCAGATGTGAAAAATTAGACATGTTTAATTATTCCGGATAA
TGTAAGCCAACGCAAAATGTTTAATTCGCAAGGAGTCTGAGAATATAAAATCACACCATTAATAGTTTGGTTGTCCCTGAACGAATGTCTTTTTGAGTCGAAACCAGAGTTGATTATTT
>TRINITY_DN114800_c0_g1_i3 from sample A1 / Example unspliced isoform:GTATTTTGTTAACAATTTGGTTGGTTTTTTCTAAGAGCTGTTGTTGGTGGGCGATTTTTTTTTTGAACTTTTGGTCATGTGAGTGATGTGATGTGGAGTGGGGCGGTTATGTAATGTTGCGCTTGGTTAAAGCGTCTGATATGAAATGAGTGAATGACCTTTGGTAGGAAGCCTACTTGTCTGTCCGGATGGTAGGTTAA
AAATGGTGTGTACCCGACTGCAGGAGGTTCTGTGGAGAAAGTCAGTCTTTTCGGATAACGATGGAATGGAAGTCATTACTTAGAAATGGTGCCTGGAAGCAGGTTTCGTTGAATCGATTGGTGTTTTTGGGTGTATTTGGTAGTTTAGATCTGAAGGCAAACGATGCCCAGTTGCAGACTCTTTAGGTGAAAGTGCAGGT
TATGATGGGTGCTTGTGACGTTACGTCTGGGGAAATTGGTGCCCAAGTTCAGGGTCAATAGAAGGTAAAAGTTTTGGAGTTTTTCTAGGCTTGTTTCAAATATTGAATATTGATGTGCCAGCATAGCTTGTTGATAATTCTGGGGGCAGAAATAAGGGTTTTGAGTTGTTTGGAAGCTTAGATCTGGTAACAGAATACCC
AATTGCAAGGGTGTGGTAGCTATTGTGAGGTGTGTCTAGAGGCTTGGATTAGCAGAAACTGATGCTCAACCGCAGGTTTCGGTGGTGTTTGGAAGTCTGGGCGTGGAAGGAGTGATTCCCAAGGTAGGTTTGGTGGAGATTTTGGTAAAAAGAAGATATATTTGAGTGTGTGTTGGATGAGGTAGAGGTGAGGTGAAAAT
ATGGAGGCAGAAATTGGTAGAAATCATTGTGATGATCAGGTTTATCAGCAGCAGAGGCAGCAACAGCGCCAGATTTACGCTTCCAAAGGACACAATTTTATGTCGAAGGGGAAGCACATACTGGAAGATCATGAATGGGATGTGAACAACTGGGAATGGGACTGCAATCGCTTCATTGCCAGGCCTCTGAGCATTGACAA
GGGACTGGGATTTCAAGGTAAACATCTCTTGGCAGATGGTTCACAGCCTGCTAATGGGATTTCCAATGACTTTCACAACAAAAATGGCGATGCGTACAATAATGGGTTTCATAGTTATAACATAAATGATGCAGCAGAGAAGAGAAGAAAGGTGTCAGTTGTGGAAGAGGAGGAAACGGCAGAAGAAGAAACAGCAGCAT
GCTTAACTCTTAAGCTCGGTGGAAGTGATTTTCCCGTTGCAGATACAGATGCAGATGCGGCCAACGGTGGGAGTAAGAATGGAAAGAGGTCTCGTGGGATGCCGGCTTCGTCTCATCATCATCCAATGTGCCAAGTTGATGATTGTAAAGCAGATCTCAACAATGCGAAAGACTATCACAGGCGCCATAAGGTCTGCGAG
ATGCATGCTAAGGCTAACAAGGCTCTTGTCAGCAGGCTTATGCAGAGGTTTTGTCAGCAGTGTAGCAGGTTTCATCTTCTTCAAGAGTTTGATGAGGGGAAGAGAAGTTGCCGAAGACGCTTAGCTGGTCATAATAGGCGGCGGAGGAAAACTCATCCCGATGGCATTATTGCTGGGACTTGTCTGAATGATGAGCGTGG
CAGTTACTCTCTGATTATCAATCTGTTGAAGGTTCTAGCTCAGTTACAGACATCTAATAATCCTGACCAGGCAAGTAACCAGGATACTGTACTTGAACTTCTGAAGAAACTTGCTACCTCTGCTACCATACCTGAGGATACCAATACAGCAGCTGCAAAACAATCCACGGCAGATCAGCCAAATAATAGAGTCTCTCTTG
GTGTCCCTTCAGAAAATACATTGCATCCATTGCAAAACAATTTTCTTGTTTGCAATGCCACTGCTGAAAGCAAAAAACCACATGATTCGGTCAGACCTCATGATGTGCAATCTAGCATGCAAAATATTTCAACTATTGGATCATTATCTATGGGATGTCTGGACTCTCATTCAGATGTATTCAGGAAGAGTACAGAGCCT
TCTATCTGTGAGCGTGAACAACCTTTTGTTTCAACTCAAATGCGAAATGATGTACTTTTTCCATATGATTCTGCACAGAAAACTGTTATATCAGCTGTACCCCAGTATTCTTGTAACTTTCGGCAGAAACATGAAGGTATTCAGCAAGAACATGTGTTAACTGGATCTGTGCCACAGTCTCTATCGATGGAATCAACTGA
TAAACGGAGGTCTAGCATATCAAATGGTTTTGATTTAAATAACGTTTACAATACACCTGAAGAATTAGTTCCTGGATCAGATGGTCCTTCAACGTTATTGCTGCTAGGAGGACTTGACAGTATAAGCAGGCAGAATGCTCCTCTCTGCAGTTCATGGGCAGCATCAGACATTTACCGAACAAGTCCACCTCAAATAAGTG
ACAACTCGGAATCGGGGTCTGATCAATCACCATCAAGTTCACAAGGAGATGGCCAGGATCGTACTGGACGAATAGTTTTCAAACTCTTTGGCAAAGATCCAAGTGAAATTCCTCAAGTTTTACGTTCACAGATCCTAGATTGGCTTGCTCACAGCCCTTCAGATATAGAGAGCTATATCAGGCCTGGCTGTGTCATACTA
ACAATTTATTTATGCTTATCCGAGCCTGTGTGGCAGGAGCTTACCAGGGGCTTCAAAGTTTGCTTAGAGAGGCTTCTTGGGGCCTCAAATAGTGATTTCTGGAATACAGGATGGATATTTGCCCAACTGGATCATCAAATTGCATTCATTTATGATGGTCAGGTTTTGTTGGACATGTCCTCAAATTATGCGAGTGCTCC
TCTACTTTTAAGTGTTACGCCCATTGCTGTTACTGCTGGCGAGAAAGCAAACATTGTGGTGAAAGGCCATAATCTTACCAGTTCAACTTCAAAGATTCTTTGTGCCTTTCAAGGGAAGCACACGGTACAAGAAGCTTCAACTGAATACGTACAAGATGTTCATGTTCCATTTCACGGTGGCAGCGATAATTTTGAGGGAT
GCACACAGATCCTGTGTCGGAGCTTTTCCTGGTCCCCACAGAATGTCATTGGAAGATGCTTTATTGAGgtgcaaaatttggttagaacttagaagtattgattcttcagcagtttttctccttggagtatttaggtaataaacccaatctattccaataatgctctgacatggctgtttcagGTTGAAGGCCATGATATG
AGAGGTAATTTCTTTCCAGTCATAGTGGCAGAAGAAGATGTTTGTGCTGAAATTCGCACGCTAGAAAGGTATATTGATATGCCTTTTAGTAGCAATCATGGTGTCACAAAACAAAATCCAGATTTGCAACTGAAAGTACAGAGACAGGCAATAAAATTCTTGCATGAACTAGGTTGGCTATTTCAGAGAAGCTTCTTATC
TCAGTCAAACCTTGGGATCTTACCTCTGACTACATTTTCACCTATTCGATTGAAGTGGCTTCTTGAGTATGCAACTGAACAGGACTGGTGCTCAGTTGTGCGGAAACTTCTGAACATTTTATTCAGTAGCAATGTAAACGGTGCTAATTCGTCAGCCATCACCATTTTGGGTGAAGTTGGTATTTTACATATAGCTGTGC
GGAGAAATTGCAGGGCAATGGTTGAGTTTCTATTGGCTTATGTTCCGGAGTCTGTGGCAGAAGAGACAATGTTCACACCCGGTCAAGGACATGAGAAACTAAGTAGCAGCAATGGCTTTGTACTCAAGCCTGACATGCCTGGACCTGCGGGCCTTACTCCTCTTCATATTGCAGCTAGCATGGAGAAAGCAGAAGGTGTA
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