sp|Q9LU10|DEGP8_ARATH ----> Protease Do-like 8, chloroplastic

Intron 1 GTATGAGTCC ... GCTGATGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	53.85	3	6	1
A2	13.04	10	2	1
A3	6.67	7	1	0
A4	0	8	0	0
A5	33.33	10	6	4
A6	21.8	52	13	16
A7	20.93	34	2	16
A8	14.73	55	1	18
A9	15.52	49	5	13
A10	17.65	28	5	7

>TRINITY_DN43124_c0_g1_i8 from sample A9 / Example spliced isoform

CAGTCTATATGCTCTTGCCACTACTCACAAGAAAGAGGCTGACAAATTGGTCTCTGGCATCTGATGTAAATATTATTTTCCTTGTTAGAGGATATGAAGGTATTGAGGAGAATATTCATCGTGCAAATTGTTTAAAAAGTATATTTTCATCTCGGAGATTACTTTTTGCCAGTATGATATTTTCTTATTGGGCGCCACCC
TTCAGGTACTTATCAGCACATGCTCTAGGGGATCCTACAGCGACTTTTGAAGAGGTGACACGACAGGTCTCACCCACGGGGAAACTTTTTCAATCCGAGGAAAGAACTGTGGAGATTTTTGAAAGGAACACCTATTCTGTGGTGAATATTTTTGATGTAACCCTACGCCCACAATTGAACATGACAGGAATGATTGAAGT
TCCTGAAGGAAATGGTTCTGGAGTAGTCTGGGATGAGCAAGGGCATATTGTGACAAACTATCATGTGATTGGCAATGCCCTCTCAAAAAATCCCAGACCTGGTGAAGTGGTTGCCCGGGTTAATATTCTTGCATTTGATGGGGTTCAAAAGAGTTTTGAGGGTACATTGGTTGGTGCAGACCGCACAAAGGATCTTGCTG
TCTTGAAGGTGGATGCCCCTAAGGAAATCCTGCGGGCGGTAGACTCTGGGCAGTCCTCCAAACTTAAAGTAGGTCAACGATGTTTTGCAATTGGCAACCCATTTGGTTTTGATCACACTTTGACTGCTGGGGTACTTAGTGGATTGAACCGTGAGATATTCAGTCAAGCGGGTGTGACTATAAGCGGTGGTATTCAGACT
GATGCAGCCATCAATCCTGGAAATAGTGGTGGTCCGTTACTAGATTCCAAAGGAAAATTGATTGGGATCAACACAGCTATATTTACTCAAACAGGAACATCAGCAGGAGTAGGTTTTGCTATTCCAAGTGACACAGTCCTCAAGATTGTGCCTCAATTGATCCAATCTGGGAAGGTAACGCGTCCAGGTTTGAATTTAGA
CATAGCCCCTGAGTTAATTGCAAATCAATTAAACGTCAGAAGTGGAGCTCTTGTTCTATCGGTTCCGGAAAAGAGTGCTGCAGCAAAGGCAGGGGTGATTCCAACAAAGAGAGGATTCGCTGGAAACATAATGCTTGGCGATGTGATTGTTGCTATTGATAATCGTACGATAAAAAATGTAGCAGAACTCTTTAAAATTG
TGGATGACTACAATGTGGGGGACAAAATAGTCTTAAAGGTTCAGCGAAGCAATGGTGTAGCAGAAATACCAATTACATTGGAAGAGAGCATAATATAACAAGCCAAACTAGCCCATTTTAACTTGCTGCAATGGTGCTACAATAGCTGTTCCTCTTTCATTAATCAAGCACGAGAAGCATGCATATCACGATTTTAGATT
TATTTTTCAATTTCAACTGTCATTAACTTAAAAGAATTAAAAATTTATGTTTCTGGTGATATTATACTATTTCAGGAGCATTTTCGTGCTGTGGCACATTTGGTTGATGATAAATTGAGAACATCTAATGAGAAAACTGTGCTTCTGCTGGATGAAATGAAAAGACAGGAACTATCTTGTAATTGCAGTTATTAAAGCTG
TCTGTAGTTTTAACGGCAATCATTATTTTTTCATTGGAGCAGAGCATTGTATAAAATTGCAAGGGATACAAGAACCACTTTTCCTGGTCTATGTCAATACTCAGAATCTTTGGTTGTTACAGCATTCAGTCAAAGTATTTAGGACCTTCTCATGCATATTACAACAAACTTCTAGATTTGAAATTTCTGGCAGGAAGTAT
TAGCTTTTCTGGTACTTAGAATGTAATAAGAACGTTATTGTGTTAAGGTAGTGTTTCCGCCTAATACACACTTGGGGAGAACGTGGCAGGAAACCTTCAAGTCACTCGATGTGTCCTTGGGGGCAAGTGAAAGTCAAGTGTTGTCACATAATTACTCGACTCCTCCGTCTAGGCTTACTCCTAGTGAAGCCAGGGGGGTG
GTCCCTATGAAAAATTTCTAAGGTTTTTAATCTATGAAAAAATAATAAAAACTATTCTAGG

>TRINITY_DN43124_c0_g1_i2 from sample A9 / Example unspliced isoform:

GTGATAATTGTTATCGTTATCTCTTTCTATTGCCATGCACCATTGGTACCGCAGCAGCACACATCATTTACCTTTCAGTTTAATTCAATATTTACGAGGAGGTTGGACCACGTTATCCGTCCATTGAATCAGTATTCTCGTTCAGCCATCATTTGAACTCTGCAATGCCCATGGAAATTTCATCACTCACACAGTCGTTT
TCTCCACCGTTGATATTATTTGGTTCACTGTACCCTTCCAAGCCTCTGCGCAGCATCTCCAATATATTATCATATTCAGATGGCAATTGCAGCCGGAGTGAGCTCGTTTCCAGGGGACTGCGTGCATTTCGAGACTCTGAAAGAATTCATTCTCTAAATTCCGACACCGAGGGTGATTTACAATCGAATTCTTTTCACAG
AGGATATGAAGGTATTGAGGAGAATATTCATCGTGCAAATTGTTTAAAAAGTATATTTTCATCTCGGAGATTACTTTTTGCCAGTATGATATTTTCTTATTGGGCGCCACCCTTCAGGTACTTATCAGCACATGCTCTAGGGGATCCTACAGCGACTTTTGAAGAGGTGACACGACAGGTCTCACCCACGGGGAAACTTT
TTCAATCCGAGGAAAGAACTGTGGAGATTTTTGAAAGGAACACCTATTCTGTGGTGAATATTTTTGATGTAACCCTACGCCCACAATTGAACATGACAGGAATGATTGAAGTTCCTGAAGGAAATGGTTCTGGAGTAGTCTGGGATGAGCAAGGGCATATTGTGACAAACTATCATGTGATTGGCAATGCCCTCTCAAAA
AATCCCAGACCTGGTGAAGTGGTTGCCCGGGTTAATATTCTTGCATTTGATGGGGTTCAAAAGAGTTTTGAGGGTACATTGGTTGGTGCAGACCGCACAAAGGATCTTGCTGTCTTGAAGGTGGATGCCCCTAAGGAAATCCTGCGGGCGGTAGACTCTGGGCAGTCCTCCAAACTTAAAGTAGGTCAACGATGTTTTGC
AATTGGCAACCCATTTGGTTTTGATCACACTTTGACTGCTGGGGTACTTAGTGGATTGAACCGTGAGATATTCAGTCAAGCGGGTGTGACTATAAGCGGTGGTATTCAGACTGATGCAGCCATCAATCCTGGAAATAGTGGTGGTCCGTTACTAGATTCCAAAGGAAAATTGATTGGGATCAACACAGCTATATTTACTC
AAACAGGAACATCAGCAGGAGTAGGTTTTGCTATTCCAAGTGACACAGTCCTCAAGATTGTGCCTCAATTGATCCAATCTGGGAAGGTAACGCGTCCAGGTTTGAATTTAGACATAGCCCCTGAGTTAATTGCAAATCAATTAAACGTCAGAAGTGGAGCTCTTGTTCTATCGGTTCCGGAAAAGAGTGCTGCAGCAAAG
GCAGGGGTGATTCCAACAAAGAGAGGATTCGCTGGAAACATAATGCTTGGCGATGTGATTGTTGCTATTGATAATCGTACGgtatgagtccattccagaaccatttattttgcttttgggaaatgcatcttatatttcactaatgaataaaattacagattacatcaacaggtcaaagcttgggtatgcaaattaccccg
agcctctcgggacccatttttccttttttcattcttaattgcattacctatttgtccatttccgactataaatgaaaaggcaatatacaatcactcatgcacaaatccatgttacatatttcaatttgctgatgcagATAAAAAATGTAGCAGAACTCTTTAAAATTGTGGATGACTACAATGTGGGGGACAAAATAGTC
TTAAAGGTTCAGCGAAGCAATGGTGTAGCAGAAATACCAATTACATTGGAAGAGAGCATAATATAACAAGCCAAACTAGCCCATTT

Intron 2 GTAAGATTTT ... TATATCAAAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	25.39	6	4	0
A2	45	2.5	1	3
A3	23.13	15	5	4
A4	0	7	0	0
A5	32.05	8.5	0	8
A6	17.07	29.5	0	12
A7	12.31	18	1	4
A8	7.54	18.5	0	3
A9	17	32.5	8	5
A10	6.85	20.5	0	3

>TRINITY_DN112274_c0_g1_i12 from sample A3 / Example spliced isoform

CGTTCAGCCATCATTTGAACTCTGTAATGCCCATGGAAATTTCATCACTCACACGGTCGTTTTCTCCACCGTTGATATTATTTGGTTCACTGTACCCTTCCAAGCCTCTGCGCAGCATCTCCAATATATTATCATATTCAGATGGCAATTGCAGCCGGAGTGAGCTCGTTTCCAGGGGACTGCGTGCATTTCGAGACTCT
GAAAGAATTCATTCTCTAAATTCCGACACCGAGGGTGATTTACAATCGAATTCTTTTCACAGAGGATATGAAGGTATTGAGGAGAATATTCATCGTGCAAATTGTTTAAAAAGTATATTTTCATCTCGGAGATTACTTTTTGCCAGTATGATATTTTCTTATTGGGCGCCACCCTTCAGCACATGCTCTAGGGGATCCTA
CAGCGACTTTTGAAGAGGTGACACGACAGGTCTCACCCACGGGGAAACTTTTTCAATCCGAGGAAAGAACTGTGGAGATTTTTGAAAGGAACACCTATTCTGTGGTGAATATTTTTGATGTAACCCTACGCCCACAATTGAACATGACAGGAATGATTGAAGTTCCTGAAGGAAATGGTTCTGGAGTAGTCTGGGATGAG
CAAGGGCATATTGTGACAAACTATCATGTGATTGGCAATGCCCTCTCAAAAAATCCCAGACCTGGTGAAGTGGTTGCCCGGGTTAATATTCTTGCATTTGATGGGGTTCAAAAGAGTTTTGAGGGTACATTGGTTGGTGCAGACCGCACAAAGGATCTTGCTGTCTTGAAGGTGGATGCCCCTAAGGAAATCCTGCGGGC
GGTAGACTCTGGGCAGTCCTCCAAACTTAAAGTAGGTCAACGATGTTTTGCAATTGGCAACCCATTTGGTTTTGATCACACTTTGACTGCTGGGGTACTTAGTGGATTGAACCGTGAGATATTCAGTCAAGCGGGTGTGACTATAAGCGGTGGTATTCAGACTGATGCAGCCATCAATCCTGGAAATAGTGGTGGTCCGT
TACTAGATTCCAAAGGAAAATTGATTGGGATCAACACAGCTATATTTACTCAAACAGGAACATCAGCAGGAGTAGGTTTTGCTATTCCAAGTGACACAGTCCTCAAGATTGTGCCTCAATTGATCCAATCTGGGAAGGTAACGCGTCCAGGTTTGAATTTAGACATAGCCCCTGAGTTAATTGCAAATCAATTAAACGTC
AGAAGTGGAGCTCTTGTTCTATCGGTTCCGGAAAAGAGTGCTGCAGCAAAGGCAGGGGTGATTCCAACAAAGAGAGGATTCGCTGGAAACATAATGCTTGGCGATGTGATTGTTGCTATTGATAATCGTACGATAAAAAATGTAGCAGAACTCTTTAAAATTGTGGATGACTACAATGTGGGGGACAAAATAGTCTTAAA
GGTTCAGCGAAGCAATGGTGTAGCAGAAATACCAATTACATTGGAAGAGAGCATAATATAACAAGCCAAACTAGCCCATTTTAACTTGCTGCAATGGTGCTACAATAGCTGTTCCTCTTTCATTAATCAAGCACGAGAAGCATGCATATCACGATTTTAGATTTATTTTTCAATTTCAACTGTCATTAACTTAAAAGAAT
TAAAAATTTATGTTTCTGGTGATATTATACTATTTCAGGAGCATTTTCGTGCTGTGGCACATTTGGTTGATGATAAATTGAGAACATCTAATGAGAAAACTGTGCTTTTGCTGGATGAAATGAAAAGACATGAACTATCTTGTAATTGCAGTTATTAAAGCTGTCTGTAGTTTTAACGGCAATCATTATTTTTTCATTGG
AGCAGAGCATTGTATAAAATTGCAAGGGATACAAGAACCACTTTTCCTGGTCTATGTCAATACTCAGAATCTTTGGTTGTTACAGCATTCAGTCAAAGTATTTAGGACCTTCTCATGCATATTACAACAAACTT

>TRINITY_DN112274_c0_g1_i3 from sample A3 / Example unspliced isoform:

CTTGCATACTTTAAGTGATTATTAAATATCTGAGGACCTATCACTGTGGTCCCTATGCTGGCATCATATATGATTTAGCGCATAAAATAACCTCAACAATAATTAAGTGCTAGAAAAGGAAGAAACACAAGGTCAAAGGATATTTTCACTATAAGACATCCCAATGTGGCAATATGGTAATTGTTATCATGAATTGATGG
GCAGGTAACGCGTCCAGGTTTGAATTTAGACATAGCCCCTGAGTTAATTGCAAATCAATTAAACGTCAGAAGTGGAGCTCTTGTTCTATCGgtaagattttgcttctccataacagttgtgtgaatagagagaaaacaattgagcatgccattatgattagattccttctgcattccttatactttactacttaaatgaa
tttcaagctgttgtatatatcaaagGTTCCGGAAAAGAGTGCTGCAGCAAAGGCAGGGGTGATTCCAACAAAGAGAGGATTCGCTGGAAACATAATGCTTGGCGATGTGATTGTTGCTATTGATAATCGTACGATAAAAAATGTAGCAGAACTCTTTAAAATTGTGGATGACTACAATGTGGGGGACAAAATAGTCTTAA
AGGTTCAGCGAAGCAATGGTGTAGCAGAAATACCAATTACATTGGAAGAGAGCATAATATAACAAGCCAAACTAGCCCATTTTAACTTGCTGCAATGGTGCTACAATAGCTGTTCCTCTTTCATTAATCAAGCACGAGAAGCATGCATATCACGATTTTAGATTTATTTTTCAATTTCAACTGTCATTAACTTAAAAGAA
TTAAAAATTTATGTTTCTGGTGATATTATACTATTTCAGGAGCATTTTCGTGCTGTGGCACATTTGGTTGATGATAAATTGAGAACATCTAATGAGAAAACTGTGCTTTTGCTGGATGAAATGAAAAGACATGAACTATCTTGTAATTGCAGTTATTAAAGCTGTCTGTAGTTTTAACGGCAATCATTATTTTTTCATTG
GAGCAGAGCATTGTATAAAATTGCAAGGGATACAAGAACCACTTTTCCTGGTCTATGTCAATACTCAGAATCTTTGGTTGTTACAGCATTCAGTCAAAGTATTTAGGACCTTCTCATGCATATTACAACAAACTT

Intron 3 GTAAGATTTT ... TATATCAAAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	0	7	0	0
A2	50	3	0	3
A3	20	16	0	4
A4	0	8	0	0
A5	47.06	9	0	8
A6	26.67	33	0	12
A7	16.67	20	0	4
A8	13.04	20	0	3
A9	11.63	38	0	5
A10	12	22	0	3

>TRINITY_DN44304_c9_g3_i1 from sample A8 / Example spliced isoform

CCCTTCCAAGCCTCTGCGCAGCATCTCCAATATATTATCATATTCAGATGGCAATTGCAGCCGGAGTGAGCTCGTTTCCAGGGGACTGCGCGCATTTCGAGACTCTGAAAGAATTCATTCTCTAAATTCCGACACCGAGGGTGATTTACAATCGAATTCTTTTCACAGAGGATGTGAAGGTATTGAGGAGAATATTCATC
GTGCAAATTGTTTAAAAAGTATATTTTCATCTCGGAGATTACTTTTTGCCAGTATGATATTTTCTTATTGGGCGCCACCCTTCAGGTACTTATCAGCACATGCTCTAGGGGATCCTACAGCGACTTTTGAAGAGGTGACACGACAGGTCTCACCCACGGGGAAACTTTTTCAATCCGAGGAAAGAACTGTGGAGATTTTT
GAAAGGAACACCTATTCTGTGGTGAATATTTTTGATGTAACCCTACGCCCACAATTGAACATGACAGGAATGATTGAAGTTCCTGAAGGAAATGGTTCTGGAGTAGTCTGGGATGAGCAAGGGCATATTGTGACAAACTATCATGTGATTGGCAATGCCCTCTCAAAAAATCCCAGACCTGGTGAAGTGGTTGCCCGGGT
TAATATTCTTGCATTTGATGGGGTTCAAAAGAGTTTTGAGGGTACATTGGTTGGTGCAGACCGCACAAAGGATCTTGCTGTCTTGAAGGTGGATGCCCCTAAGGAAATCCTGCGGGCGGTAGACTCTGGGCAGTCCTCCAAACTTAAAGTAGGTCAACGATGTTTTGCAATTGGCAACCCATTTGGTTTTGATCACACTT
TGACTGCTGGGGTACTTAGTGGATTGAACCGTGAGATATTCAGTCAAGCGGGTGTGACTATAAGCGGTGGTATTCAGACTGATGCAGCCATCAATCCTGGAAATAGTGGTGGTCCGTTACTAGATTCCAAAGGAAAATTGATTGGGATCAACACAGCTATATTTACTCAAACAGGAACATCAGCAGGAGTAGGTTTTGCT
ATTCCAAGTGACACAGTCCTCAAGATTGTGCCTCAATTGATCCAATCTGGGAAGGTAACGCGTCCAGGTTTGAATTTAGACATAGCCCCTGAGTTAATTGCAAATCAATTAAACGTCAGAAGTGGAGCTCTTGTTCTATCGGTTCCGGAAAAGAGTGCTGCAGCAAAGGCAGGGGTGATTCCAACAAAGAGAGGATTCGC
TGGAAACATAATGCTTGGCGATGTGATTGTTGCTATTGATAATCGTACGATAAAAAATGTAGCAGAACTCTTTAAAATTGTGGATGACTACAATGTGGGGGACAAAATAGTCTTAAAGGTTCAGCGAAGCAATGGTGTAGCAGAAATACCAATTACATTGGAAGAGAGCATAATATAACAAGCCAAACTAGCCCATTTTA
ACTTGCTGCAATGGTGCTACAATAGCTGTTCCTCTTTCATTAATCAAGCACGAGAAGCATGCATATCACGATTTTAGATTTATTTTTCAATTTCAACTGTCATTAACTTAAAAGAATTAAAAATTTATGTTTCTGGTGATATTATACTATTTCAGGAGCATTTTCGTGCTGTGGCACATTTGGTTGATGATAAATTGAGA
ACATCTAATGAGAAAACTGTGCTTCTGCTGGATGAAATGAAAAGACAGGAACTATCTTGTAATTGCAGTTATTAAAGCTGTCTGTAGTTTTAACGGCAATCATTATTTTTTCATTGGAGCAGAGCATTGTATAAAATTGCAAGGGATACAAGAACCACTTTTCCTGGTCTATGTCAATACTCAGAATCTTTGGTTGTTAC
AGCATTCAGTCAAAGTATTTAGGACCTTCTCATGCATATTACAACAAACTTCTAGATTTGAAATTTCTGGCAGGAAGTATTAGCTTTTCTGGTACTTAGAATGTAATAAGAACGTTATTGTGTTAAGGTAGTGTTTCCGCCTAATACACACTTGGGGAGAACGTGGCAGGAAACCTTCAAGTCACTCGATGTGTCCTTGG
GGGCAAGTGAAAGTCAAGTGTTGTCACATAATTACTCGACTCCTCCGTCTAGGCTTACTCCTAGTGAAGCCAGGGGGGTGGTCCCTATGAAAAATTTCTAAGGTTTTTAATCTATGAAAAAATAATAAAAACTATTCTAGGA

>TRINITY_DN44304_c9_g3_i5 from sample A8 / Example unspliced isoform:

AGTGGAGCTCTTGTTCTATCGgtaagattttgcttctccataacagttgtgtgaatagagagaaaacaattgagcatgccattatgattagattccttttcgttccttatactttactacttaaatgaatttcaagctgttgtatatatcaaagGTTCCGGAAAAGAGTGCTGCAGCAAAGGCAGGGGTGATTCCAACAA
AGAGAGGATTCGCTGGAAACATAATGCTTGGCGATGTGATTGTTGCTATTGATAATCGTACGATAAAAAATGTAGCAGAACTCTTTAAAATTGTGGATGACTACAATGTGGGGGACAAAATAGTCTTAAAGGTTCAGCGAAGCAATGGTGTAGCAGAAATACCAATTACATTGGAAGAGAGCATAATATAACAAGCCAAA
CTAGCCCATTT

Intron 4 GTATGAGTCC ... GCTGATGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	25	3	2	1
A2	9.09	10	0	1
A3	22.22	7	0	2
A4	20	8	0	2
A5	28.57	10	0	4
A6	23.53	52	0	16
A7	32	34	0	16
A8	24.66	55	0	18
A9	18.33	49	0	11
A10	20	28	0	7

>TRINITY_DN46822_c0_g1_i3 from sample A7 / Example spliced isoform

CATTGGTACCGCAGCAGCACACATCATTTACCTTTCAGTTTAATTCAATATTTACGAGGAGGTTGGACCACGTTATCCGTCCATTGAATCAGTATTCTCGTTCAGCCATCATTTGAACTCTGCAATGCCCATGGAAATTTCATCACTCACACAGTCGTTTTCTCCACCGTTGATATTATTTGGTTCACTGTACCCTTCCA
AGCCTCTGCGCAGCATCTCCAATATATTATCATATTCAGATGGCAATTGCAGCCGGAGTGAGCTCGTTTCCAGGGGACTGCGTGCATTTCGAGACTCTGAAAGAATTCATTCTCTAAATTCCGACACCGAGGGTGATTTACAATCGAATTCTTTTCACAGAGGATATGAAGGTATTGAGGAGAATATTCATCGTGCAAAT
TGTTTAAAAAGTATATTTTCATCTCGGAGATTACTTTTTGCCAGTATGATATTTTCTTATTGGGCGCCACCCTTCAGGTACTTATCAGCACATGCTCTAGGGGATCCTACAGCGACTTTTGAAGAGGTGACACGACAGGTCTCACCCACGGGGAAACTTTTTCAATCCGAGGAAAGAACTGTGGAGATTTTTGAAAGGAA
CACCTATTCTGTGGTGAATATTTTTGATGTAACCCTACGCCCACAATTGAACATGACAGGAATGATTGAAGTTCCTGAAGGAAATGGTTCTGGAGTAGTCTGGGATGAGCAAGGGCATATTGTGACAAACTATCATGTGATTGGCAATGCCCTCTCAAAAAATCCCAGACCTGGTGAAGTGGTTGCCCGGGTTAATATTC
TTGCATTTGATGGGGTTCAAAAGAGTTTTGAGGGTACATTGGTTGGTGCAGACCGCACAAAGGATCTTGCTGTCTTGAAGGTGGATGCCCCTAAGGAAATCCTGCGGGCGGTAGACTCTGGGCAGTCCTCCAAACTTAAAGTAGGTCAACGATGTTTTGCAATTGGCAACCCATTTGGTTTTGATCACACTTTGACTGCT
GGGGTACTTAGTGGATTGAACCGTGAGATATTCAGTCAAGCGGGTGTGACTATAAGCGGTGGTATTCAGACTGATGCAGCCATCAATCCTGGAAATAGTGGTGGTCCGTTACTAGATTCCAAAGGAAAATTGATTGGGATCAACACAGCTATATTTACTCAAACAGGAACATCAGCAGGAGTAGGTTTTGCTATTCCAAG
TGACACAGTCCTCAAGATTGTGCCTCAATTGATCCAATCTGGGAAGGTAACGCGTCCAGGTTTGAATTTAGACATAGCCCCTGAGTTAATTGCAAATCAATTAAACGTCAGAAGTGGAGCTCTTGTTCTATCGGTTCCGGAAAAGAGTGCTGCAGCAAAGGCAGGGGTGATTCCAACAAAGAGAGGATTCGCTGGAAACA
TAATGCTTGGCGATGTGATTGTTGCTATTGATAATCGTACGATAAAAAATGTAGCAGAACTCTTTAAAATTGTGGATGACTACAATGTGGGGGACAAAATAGTCTTAAAGGTTCAGCGAAGCAATGGTGTAGCAGAAATACCAATTACATTGGAAGAGAGCATAATATAACAAGCCAAACTAGCCCATTTCAACTTGCTG
CAGTGGTGCTACAATAGCTGTTCCTCTTTCATTAATCAAGCACGAGAAGCATGCATATCACGATTTTAGATTTATTTTTCAATTTCAACTGTCATATTTCAGGAAAATTTACGTTTCTGGTGATATTATACTATTTCAGGACCATTTTCGTACTGTGGCACATTTGGTTGATGAGAAATCGAGAACATCTAATGAGAAAA
CTGTGCTTCTGCTGGATGAAATGAAAAGACAGGAACTATCTTGTAATTGCAGTTATTAAAGCTGTCTGTAGTTTTAACGGCAATCATTATTTTTTCATTGGAGCAGAGCATTGTATAAAATTGCAAGGGATACAAGAACCACTTTTCCTGGTCTATGTCAATACTCAGAATCTTTG

>TRINITY_DN46822_c0_g1_i5 from sample A7 / Example unspliced isoform:

TATTGATAATCGTACGgtatgagtccattccagaaccatttattttgcttttgggaaatgcatcttatatttcactaatgaacaaaattacagattacatcaactggtcaaagcttgggtatgcaaattaccccgagcctctcgggatccatttttccttttttcattcttaattgcattacctatttgtccatttctta
attacatatttaaatttgctgatgcagATAAAAAATGTAGCAGAACTCTTTAAAATTGTGGATGACTACAATGTGGGGGACAAAATAGTCTTAAAGGTTCAGCGAAGCAATGGTGTAGCAGAAATACCAATTACATTGGAAGAGAGCATAATATAACAAGCCAAACTAGCCCATTT