sp|Q8GY84|RH10_ARATH ----> DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 10


Intron 1 GTAACTCCTT ... AAATTCACAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A147.47525341
A242.86342625
A360.49324751
A449.47484648
A556.63182522
A646.58393731
A758.686911086
A850.3634.54228
A953.1536753
A1058.4561.510964



>TRINITY_DN118777_c0_g1_i3 from sample A2 / Example spliced isoform
TAAGACCTAGACCAACCTCCCCACCAAGTCCACAAGCCTTCCTTCAGGCAGAAAACTTCAGCCAGGGATTGCTGTAGATTGCGGGTGGCGGGTTTCTGTGCGCGCGTGTCACAGCTTACCAATGCTGGAAAACGCAAGAAAAAACAGAAACCCTAACAGGGTCTGAATTAGAATCGAGCTCTGAACAGCTAAAAGGAAAT
TATGGCGGTCGTTGAAGAAGAAGAAGAGGAGGTTCACAGCTTTGCCAGTTTGGGCGTTTGTGAACAGCTAGCCGAAGCCTGCGATGCTTTGGGATGGAAGAAACCATCTGCAATTCAAGTCCAATCTCTTCCCCTCGCCCTGGAAGGCAGGGATTTGATTGGGCTGGCACAGACGGGTTCTGGGAAAACGGCAGCATTTG
CAATTCCAATTCTGCAGGCACTTCTTGACAAACCGCAGCCATTGTTTGCTTGTGTCCTTTCTCCAACGAGGGAACTGGCAATTCAGATTGCAGAGCAGTTTGAAGCACTGGGATCTGGCATTGGTGTAAAGTGTGTTGTGGTCGTTGGCGGTGTTGACATGATGGCACAAGCAATAGCTTTGGCCAAAAGGCCTCATATC
TTGGTAATTTCCAATGCCTATTTTAACAATTGTTATTGATTTTGAGCAATAAAAATAATTTCCTTTAGAAACAACGAAAACATATTTAAATAATTTGCCAATGCTCTCATTTATGGGCAAGGATAGTTAGCAACATAACATGATTCTATTGTTATACAAGCCACATCTTTCCAAGTAAGATAAGTTGATAATGGTTGTCT
AATTGAGTTAAGGGACTTGGTAGGCTAGTTAAGCATCTATCTAAAATAGTGTTTCATTGCTTAGATAAATGCTTGAATCTTGC


>TRINITY_DN118777_c0_g1_i2 from sample A2 / Example unspliced isoform:
TAAGACCTAGACCAACCTCCCCACCAAGTCCACAAGCCTTCCTTCAGGCAGAAAACTTCAGCCAGGGATTGCTGTAGATTGCGGGTGGCGGGTTTCTGTGCGCGCGTGTCACAGCTTACCAATGCTGgtaactccttttcatagcaattttcttaaaggaggtagggacttttgaagtcgtaatcacagttcaaattcac
ag
GAAAACGCAAGAAAAAACAGAAACCCTAACAGGGTCTGAATTAGAATCGAGCTCTGAACAGCTAAAAGGAAATTATGGCGGTCGTTGAAGAAGAAGAAGAGGAGGTTCACAGCTTTGCCAGTTTGGGCGTTTGTGAACAGCTAGCCGAAGCCTGCGATGCTTTGGGATGGAAGAAACCATCTGCAATTCAAGTCCAAT
CTCTTCCCCTCGCCCTGGAAGGCAGGGATTTGATTGGGCTGGCACAGACGGGTTCTGGGAAAACGGCAGCATTTGCAATTCCAATTCTGCAGGCACTTCTTGACAAACCGCAGCCATTGTTTGCTTGTGTCCTTTCTCCAACGAGGGAACTGGCAATTCAGATTGCAGAGCAGTTTGAAGCACTGGGATCTGGCATTGGT
GTAAAGTGTGTTGTGGTCGTTGGCGGTGTTGACATGATGGCACAAGCAATAGCTTTGGCCAAAAGGCCTCATATCTTGGTAATTTCCAATGCCTATTTTAACAATTGTTATTGATTTTGAGCAATAAAAATAATTTCCTTTAGAAACAACGAAAACATATTTAAATAATTTGCCAATGCTCTCATTTATGGGCAAGGATA
GTTAGCAACATAACATGATTCTATTGTTATACAAGCCACATCTTTCCAAGTAAGATAAGTTGATAATGGTTGTCTAATTGAGTTAAGGGACTTGGTAGGCTAGTTAAGCATCTATCTAAAATAGTGTTTCATTGCTTAGATAAATGCTTGAATCTTGC