NA ----> NA


Intron 1 GTAAGTAATA ... ATCTGTATAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A133.33303
A252.38538
A323.08503
A433.33431
A533.33110
A627.5291210
A728.3381317
A829.59692335
A922.54551319
A1025.81461418



>TRINITY_DN48405_c0_g1_i1 from sample A10 / Example spliced isoform
CAAACGTCTCTGTTGTGTTTTCTTGGAAGTGCTTTCATTGTGTGTATATCTGCTTGGGCGCCTCGGTCTAAGTCCTGAGTTTGTCTGTGTGTGGGTTTTAATGTCTGTCATGTGTCTGTATGCGATAGAAGAGGCTGGACTGAAGGGGAATTGTTTTTGGGAGCAGACAACTTTAAGGGACAGGCGGGCCGCGGAAGGAC
GCGGTCAGGTTGCTCGAGAGTGTTTTTTTGCTCTTTATATTTGCTTTGCCTTTGTCTTGGCGGGCTTGGCTTGGGTTGGCTTTCCTCTGTCCCGATGGAAAGCTAAGAAGAAAATAAAAACTGAGCATGAGGCTGGATTCGTTTCCCTTTCCTTTGGAAGGAAGGCATAATCAGATCGGGTAATCCGATTGGTTGTTCAA
AACGCTCGTCTTTCCCTGAACATGCTACTGAAACTCCAGGATTTCGATCTCAAATTCTGGATCTGCATTGTTTGATTAACCTGCTGACTCTGTTTTAGGGTTTGAGATCTGTTTTAGTAGGAGCTAGACTGGAAGGGAATTGATTTTGAGCCGCAAACAACTTCATTAAGGGAAGGCGCAAAAAGACGTGGTCGGGATTT
TAGCTTATGGATATTAGTGCCCTCTGTCAAATGGTGTGTATTTATTTAAAGATCTGCTCTGCTTTGCTCTGGTATGTATCCATTTAACGCTCTCTTTTCTTGTGTAAATTTATCAGGAATCTTGATTTAATCTGTGCGATCTCTCTATTTTAAATTTCATTCCCAATCATTTCTTTGTTTCTTCATTACACTTTCCTGAG
GGTTGGGTTTGACTTTGTTCACTTCCTATGGAGAGATGGGAAGAAAGTACTGAATCAGTCCAACGCGTGTTTGATTTAAGATTTGAGATGTATTTTAGATACACACATTTTGTTGTGATATATGGATTTGACGTCTATTTTATATAAAATGTTTTTTGAGATCTGTTATTAATAATTTTTAAACTTTTTTTTGCCTCTTC
CTATATTCTGGACAAGAGCCAGCAGAATCCAATCTGTTTGTGTTATAGTCTGTATCTCAAATCCCAGCGCTCTGTTTGTGTAGGTTTACTTCCATATTGTTATTGTGTTAGTCTGCATACATCCACCTCCACCTATTTTAAGATTGTTACAACATTTCTTTCTTAGTTTGTATATTATATATGCTTTAAGAATTTATATG
TCGACCTATGTATTTGCTCTCTGTTTATTTTTTATTTGTTATATACGATTCGGTCTCTTACTTCATATTTTTAAATGTTCTCTTACTATTTTATAGCAATGATGAAATGTGTTATCCCTTGCAACAATAAGTAAATAGTTTAAGTAAAAACGCTGGGGACC


>TRINITY_DN48405_c0_g1_i2 from sample A10 / Example unspliced isoform:
CAAACGTCTCTGTTGTGTTTTCTTGGAAGTGCTTTCATTGTGTGTATATCTGCTTGGGCGCCTCGGTCTAAGTCCTGAGTTTGTCTGTGTGTGGGTTTTAATGTCTGTCATGTGTCTGTATGCGATAGAAGAGGCTGGACTGAAGGGGAATTGTTTTTGGGAGCAGACAACTTTAAGGGACAGGCGGGCCGCGGAAGGAC
GCGGTCAGGTTGCTCGAGAGTGTTTTTTTGCTCTTTATATTTGCTTTGCCTTTGTCTTGGCGGGCTTGGCTTGGGTTGGCTTTCCTCTGTCCCGATGGAAAGCTAAGAAGAAAATAAAAACTGAGCATGAGGCTGGATTCGTTTCCCTTTCCTTTGGAAGGAAGGCATAATCAGATCGGGTAATCCGATTGGTTGTTCAA
AACGCTCGTCTTTCCCTGAACATGCTACTGAAACTCCAGGATTTCGATCTCAAATTCTGGATCTGCATTGTTTGATTAACCTGCTGACTCTGTTTTAGGGTTTGAGATCTGTTTTAGgtaagtaataaattttatgttgatcatatatgcctgagatctgttatgtttgagatctgtatagTAGGAGCTAGACTGGAAGG
GAATTGATTTTGAGCCGCAAACAACTTCATTAAGGGAAGGCGCAAAAAGACGTGGTCGGGATTTTAGCTTATGGATATTAGTGCCCTCTGTCAAATGGTGTGTATTTATTTAAAGATCTGCTCTGCTTTGCTCTG




Intron 2 GTATATATGT ... GTCTGTATAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A126.71592914
A240.21292514
A332.47261510
A440.19322419
A521.132887
A626.83155.58034
A726.38213.510053
A827.6819610050
A924.931436728
A1024.641828930



>TRINITY_DN121661_c0_g1_i3 from sample A2 / Example spliced isoform
CCTCTATCAAATGTCTCTGTTGTGTTTTTTTGGAAGCGCTTCCATTGTGTGTTGGGCGTCTGGGTCTGAGTTCTGTGTTTGTCTGTGTTTGCGGTTTAATGTTTGTCATCTGTTTGTATGGGATAGAGGAGGCTGGCCTGAAAGAGAATTGTGTCTGGGAGCAAACAACTTCAAGGGACGGGCGGAAGGACGCGGTCAGG
TTGCTCAAGGGTTTTTTTGGTCAGAAAGATCTATGATCTTTATATTTGCTAGCTTCCTCTTTAATTTAGACATCAGATCTGCTTTGCCAAGGCCTGGTTTAGTTCTCTCTTTCTCTTGGTGAATTCATTTGAGGATTCTTTATTTAATTTCTTTGTCATTTCATCTTTGCCTTTTCCTTGGGGTTTGGGCTTGGCTTTCC
TCTGTTCTGATGGAAAGCTAAGAAGAAAAGAATAGCTGAGTACGAGGCCGAAGTCGTTGTCCTTGCTTTTGGAATGAAAGCATAATCAGATCGGCTAATCTGGTCCTTGCTGCAACTCCAGAATAGGGAGGATCTAGACTGGAGAGGGATTGATTTTGAGCCGCAAATAACTTCAAAGGAAGGGCAAAAAGACGTGGTCA
GGTTTTTAGCTGATGGAAATGAGTGCTCTCTGTCAAATGGTTAAAGATCTGCTCTGCTTTGCTCAGGTATGTATCGATCATAAAACTAAAACATAGACTTTGGATTATGTTCTCAGGCTACCACATACTTCAATACAAACTGAAAATTCAAATACCTAAAAATAAATCTCATTTAGTGATGAAAGAAGCACGATCCTCAA
AATCGTATTACAATCTAAAATCAAAATGCCGAAGTACTTATTCAGCGATCAGCTGCCACAGAAACCCTACTCAGCCTGCTCGGCTTTCTCTGGAAATTTCTTCTGCGGATCTTCTGAGAGCCCGAAGGACGGATCGATAACAGCAAAGCCCTCCGCGCAACTTCTCCCTGGACGGAAATTACTCCCGGC


>TRINITY_DN121661_c0_g1_i5 from sample A2 / Example unspliced isoform:
CCTCTATCAAATGTCTCTGTTGTGTTTTTTTGGAAGCGCTTCCATTGTGTGTTGGGCGTCTGGGTCTGAGTTCTGTGTTTGTCTGTGTTTGCGGTTTAATGTTTGTCATCTGTTTGTATGGGATAGAGGAGGCTGGCCTGAAAGAGAATTGTGTCTGGGAGCAAACAACTTCAAGGGACGGGCGGAAGGACGCGGTCAGG
TTGCTCAAGGGTTTTTTTGGTCAGAAAGATCTATGATCTTTATATTTGCTAGCTTCCTCTTTAATTTAGACATCAGATCTGCTTTGCCAAGGCCTGGTTTAGTTCTCTCTTTCTCTTGGTGAATTCATTTGAGGATTCTTTATTTAATTTCTTTGTCATTTCATCTTTGCCTTTTCCTTGGGGTTTGGGCTTGGCTTTCC
TCTGTTCTGATGGAAAGCTAAGAAGAAAAGAATAGCTGAGTACGAGGCCGAAGTCGTTGTCCTTGCTTTTGGAATGAAAGCATAATCAGATCGGCTAATCTGGTCCTTGCTGCAACTCCAGgtatatatgtatttcaatctcaaattatggatctgcattgtttgattaacctgctgactctgttttagggtttgagatc
tgttttaggtacgtaataaatttaatgtttgccatatgtctgtatag
AATAGGGAGGATCTAGACTGGAGAGGGATTGATTTTGAGCCGCAAATAACTTCAAAGGAAGGGCAAAAAGACGTGGTCGGGTTTTTATCTTATGGAAATCAATGCTCTCTGTCAAATGGTTAAAGATCTGCTCTGCTTTGCTCTGACTTGCCT
GAGGGTTGGGTTCGACTTTGTTCTGTTCCTATGGAGGACTGGGAAGAAAGTTCAAAGGACTGAATCAGATTTCGGAGGCTTGGGTTTGATTTAAGTTTG




Intron 3 GTATGTATCG ... GCTGCCACAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A133.33101
A262.56614
A342.86451
A433.33422
A531.031009
A651.48411572
A746.74492561
A844.33543155
A956.36363261
A1041.79391442



>TRINITY_DN44953_c0_g1_i7 from sample A9 / Example spliced isoform
GTCTCTGTTGTGTTTTCTTGGAAGTGCTTTCATTGTGTGTATATCTGCTTGGGCGCCTCGGTCTAAGTCCTGAGTTTGTCTGTGTGTGGGTTTTAATGTCTGTCATGTGTCTGTATGCGATAGAAGAGGCTGGACTGAAGGGGAATTGTTTTTGGGAGCAGACAACTTTAAGGGACAGGCGGGCCGCGGAAGGACGCGGT
CAGGTTGCTCGAGAGTGTTTTTTTGCTCTTTATATTTGCTTTGCCTTTGTCTTGGCGGGCTTGGCTTGGGTTGGCTTTCCTCTGTCCCGATGGAAAGCTAAGAAGAAAATAAAAACTGAGCATGAGGCTGGATTCGTTTCCCTTTCCTTTGGAAGGAAGGCATAATCAGATCGGGTAATCCGATTGGTTGTTCAAAACGC
TCGTCTTTCCCTGAACATGCTACTGAAACTCCAGGATTTCGATCTCAAATTCTGGATCTGCATTGTTTGATTAACCTGCTGACTCTGTTTTAGGGTTTGAGATCTGTTTTAGTAGGAGCTAGACTGGAAGGGAATTGATTTTGAGCCGCAAACAACTTCATTAAGGGAAGGCGCAAAAAGACGTGGTCGGGATTTTAGCT
TATGGATATTAGTGCCCTCTGTCAAATGGTGTGTATTTATTTAAAGATCTGCTCTGCTTTGCTCAGAAACCCTACTCAGCCTGCTCGGCTTTCTCTGGAAATTTCTTCTGCGGATCTTCTGAGAGCCCGAAGGACGGATCGATAACAGCAAAGCCCTCCGCGCAACTTCTCCCTGGACGGAAATTACTCCCGATCTCCGC
GCAGGCGACTGATCTGATCCCTCTTTCTTCCATGACCTGTTACCACTCAGCTGATGGCGTCTCAGCCCCTGGCCGCATCCCGTCTCAGGCATCGGAATTCTGGGCCTGTGGAGGCCACATCTCATCGAAGGAGAACACATGCATGCCGTTCTTGCCATTGATTTTCTTTGTCTGGACCGGCTTGATGATCTGACAAGCTA
TTAACTAGAACTAATGCGGCGCGGTTCGATCCCTAGACCTGCAGGAGCTCTTGACCGAAAGGAGATAATGTAAAAAGGAGAGAATACTGCGGAGTATTATAGCCATCGGATTATGAAATGCGTACGGGCGTTGAAGCCATCGAGAATGTGCGCGCTGAAGTGGCTTGCAGCCTGCAGGGTTTATGGAAAGCGTGAGGGGG
CCAAATTGCCAATGGCCATGGCGTGGTTGAATACCTAGTTTAAATTCTTAATGTCCTTAGGAGAATTATGTGGTTGGTAAATGTCTAATCAATTTTTCGGTTGGAGGGAGTTGTCGGAATGGGCGCGTTTTCAAAAGCTATTTCAAATCTTTTGTTTAGTCTAAAGTTTTCGGTGATAAATATGGTACAATAATTTTAAA
GTTTCAAGAGAGGGTTTTGAGGGTGTTACATTATTAGAAATCCCCAAAATTATTAATCGAAT


>TRINITY_DN44953_c0_g1_i2 from sample A9 / Example unspliced isoform:
GTCTCTGTTGTGTTTTCTTGGAAGTGCTTTCATTGTGTGTATATCTGCTTGGGCGCCTCGGTCTAAGTCCTGAGTTTGTCTGTGTGTGGGTTTTAATGTCTGTCATGTGTCTGTATGCGATAGAAGAGGCTGGACTGAAGGGGAATTGTTTTTGGGAGCAGACAACTTTAAGGGACAGGCGGGCCGCGGAAGGACGCGGT
CAGGTTGCTCGAGAGTGTTTTTTTGCTCTTTATATTTGGTAGCTTCCTTTAACTGAGATATCAGATCTGCTTTTCCATGCCCTGGTTCAGCTCTCTCTTTCTTTATTTAGTTTCTCTGTCATTTCAGCTTTGCCTTTGTCTTGGGGAATTCATTTGAGGATTCTTGATTTAATTTCTGTGTCATTTCAGCTTTGCCTTTG
TCTTGGCGGGCTTGGCTTGGGTTGGCTTTCCTCTGTCCCGATGGAAAGCTAAGAAGAAAATAAAAACTGAGCATGAGGCTGGATTCGTTTCCCTTTCCTTTGGAAGGAAGGCATAATCAGATCGGGTAATCCGATTGGTTGTTCAAAACGCTCGTCTTTCCCTGAACATGCTACTGAAACTCCAGGATTTCGATCTCAAA
TTCTGGATCTGCATTGTTTGATTAACCTGCTGACTCTGTTTTAGGGTTTGAGATCTGTTTTAGTAGGAGCTAGACTGGAAGGGAATTGATTTTGAGCCGCAAACAACTTCATTAAGGGAAGGCGCAAAAAGACGTGGTCGGGATTTTAGCTTATGGATATTAGTGCCCTCTGTCAAATGGTGTGTATTTATTTAAAGATC
TGCTCTGCTTTGCTCAGgtatgtatcgatcataaaactaaaacatagactttggattatgttctcaggctaccacatacttcaatacaaactgaaaattcaaatacctaaaaataaatctcatttagtgatgaaagaagcacgatcctcaaaatcgtattacaatctaaaatcaaaatgccgaagtacttattcagcgat
cagctgccacag
AAACCCTACTCAGCCTGCTCGGCTTTCTCTGGAAATTTCTTCTGCGGATCTTCTGAGAGCCCGAAGGACGGATCGATAACAGCAAAGCCCTCCGCGCAACTTCTCCCTGGACGGAAATTACTCCCGATCTCCGCGCAGGCGACTGATCTGATCCCTCTTTCTTCCATGACCTGTTACCACTCAGCTGA
TGGCGTCTCAGCCCCTGGCCGCATCCCGTCTCAGGCATCGGAATTCTGGGCCTGTGGAGGCCACATCTCATCGAAGGAGAACACATGCATGCCGTTCTTGCCATTGATTTTCTTTGTCTGGACCGGCTTGATGATCTGACAAGCTATTAACTAGAACTAATGCGGCGCGGTTCGATCCCTAGACCTGCAGGAGCTCTTGA
CCGAAAGGAGATAATGTAAAAAGGAGAGAATACTGCGGAGTATTATAGCCATCGGATTATGAAATGCGTACGGGCGTTGAAGCCATCGAGAATGTGCGCGCTGAAGTGGCTTGCAGCCTGCAGGGTTTATGGAAAGCGTGAGGGGGCCAAATTGCCAATGGCCATGGCGTGGTTGAATACCTAGTTTAAATTCTTAATGT
CCTTAGGAGAATTATGTGGTTGGTAAATGTCTAATCAATTTTTCGGTTGGAGGGAGTTGTCGGAATGGGCGCGTTTTCAAAAGCTATTTCAAATCTTTTGTTTAGTCTAAAGTTTTCGGTGATAAATATGGTACAATAATTTTAAAGTTTCAAGAGAGGGTTTTGAGGGTGTTACATTATTAGAAATCCCCAAAATTATT
AATCGAAT




Intron 4 GTATGTATCA ... GTTTCTTCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A168.18357773
A254.91394649
A333.33622735
A445.05252120
A54414517
A629.28646166369
A741.44407234342
A835.54653241479
A929.12662167377
A1034.94365171221



>TRINITY_DN49031_c2_g1_i26 from sample A7 / Example spliced isoform
CTAGAATGGAAGGGATTTAATTTTGAGCCGCAAACAACTTCAAGGTTTGCTTATGCAAATCAATGCACTCTGTCAAATGGTTAAAGATCTGCTCTGCTTTGCTCTGTAGACTTGCCTGAGGGTTGGGTTAGACTTTGTTCTGTTCCTATGGAGGACTGGGAAGAAAGTTCAAAGGACTGAATCAGATTTCGGAGGCTTGG
GTTTGATTTAAGTTTGGGATCTATTTTAGATACACACATTTTGTTGTGATATATGGATTTGACGTCTATTTTATATAAAATGTTTTTTGAGATCTGTTATTAATAATTTTTAAACTTTTTTTTGCCTCTTCCTATATTCTGGACAAGAGCCAGCAGAATCCAATCTGTTTGTGTTATAGTCTGTATCTCAAATCCCAGCG
CTCTGTTTGTGTAGGTTTACTTCCATATTGTTATTGTGTTAGTCTGCATACATCCACCTCCACCTATTTTAAGATTGTTACAACATTTCTTTCTTAGTTTGTATAT


>TRINITY_DN49031_c2_g1_i23 from sample A7 / Example unspliced isoform:
CTAGAATGGAAGGGATTTAATTTTGAGCCGCAAACAACTTCAAGGTTTGCTTATGCAAATCAATGCACTCTGTCAAATGGTTAAAGATCTGCTCTGCTTTGCTCTGgtatgtatcatttaacgctctatttttctgtgtaaatttatcaggaatcttgatttaatctgtgagatccctctattttaaatttcattcccaa
tcaacctttatttgtttcttcag
TAGACTTGCCTGAGGGTTGGGTTAGACTTTGTTCTGTTCCTATGGAGGACTGGGAAGAAAGTTCAAAGGACTGAATCAGATTTCGGAGGCTTGGGTTTGATTTAAGTTTGGGATCTATTTTAGATACACACATTTTGTTGTGATATATGGATTTGACGTCTATTTTATATAAAATGT
TTTTTGAGATCTGTTATTAATAATTTTTAAACTTTTTTTTGCCTCTTCCTATATTCTGGACAAGAGCCAGCAGAATCCAATCTGTTTGTGTTATAGTCTGTATCTCAAATCCCAGCGCTCTGTTTGTGTAGGTTTACTTCCATATTGTTATTGTGTTAGTCTGCATACATCCACCTCCACCTATTTTAAGATTGTTACAA
CATTTCTTTCTTAGTTTGTATATTATATATGCTTTAAGAATTTATATGTCGACCTATGTATTTGCTCTCTCTTTATTTTTTATTTGTTATATTCGATTCGGTCTCTTACTTCATATTTTTAAATGTTCATTTATTATTTTATAGAATCTGGAATTACAATGATGAAATATGTGTAGTGTGACCTTATTTTTAGTTATCCC
CTCCTCCAGAATATTGCAACAATAAATAAATAGTTGCATGGGTTTTTTAAAACTTTGATGACATTCGCACTTCAACTTTAGTATTTTGTTTTGTTTTCGTTTCGTTGGCAGTGCAGTAGATTCAATGACAAAATACCACTTGGTGCGTCTCTATATTTTGCATTGATAAATCGATCCCAACTTGTCTTCTTTTTTCAAAT
GAAAATTTAGCTATACTTTATACACACAAAGCCACCAGCAATAAATGAAGCATATGCCGAGCATATAAAATGCCACCAGCAATAACCAGAAACAGTCCAAACTGGACAGAATACATGCCACAGAACCCAGCCCAACTTGTCTTCCTATTCGTATTCTCAGCGTCTTTGTTTTTCTCATTAGTTGTATGCCTTCATTTAAA
CTCCGATCATAGGAAGTTGATATTTAACACGAATTCAATAAGGTTTG




Intron 5 GTAGCTTCCT ... GTCATTTCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A156.16163011
A274.194158
A355.5610169
A482.6142117
A547.37572
A639.57716132
A753.44619050
A847.1739337
A937.651019230
A1058.396713058



>TRINITY_DN48405_c0_g1_i2 from sample A10 / Example spliced isoform
CAAACGTCTCTGTTGTGTTTTCTTGGAAGTGCTTTCATTGTGTGTATATCTGCTTGGGCGCCTCGGTCTAAGTCCTGAGTTTGTCTGTGTGTGGGTTTTAATGTCTGTCATGTGTCTGTATGCGATAGAAGAGGCTGGACTGAAGGGGAATTGTTTTTGGGAGCAGACAACTTTAAGGGACAGGCGGGCCGCGGAAGGAC
GCGGTCAGGTTGCTCGAGAGTGTTTTTTTGCTCTTTATATTTGCTTTGCCTTTGTCTTGGCGGGCTTGGCTTGGGTTGGCTTTCCTCTGTCCCGATGGAAAGCTAAGAAGAAAATAAAAACTGAGCATGAGGCTGGATTCGTTTCCCTTTCCTTTGGAAGGAAGGCATAATCAGATCGGGTAATCCGATTGGTTGTTCAA
AACGCTCGTCTTTCCCTGAACATGCTACTGAAACTCCAGGATTTCGATCTCAAATTCTGGATCTGCATTGTTTGATTAACCTGCTGACTCTGTTTTAGGGTTTGAGATCTGTTTTAGGTAAGTAATAAATTTTATGTTGATCATATATGCCTGAGATCTGTTATGTTTGAGATCTGTATAGTAGGAGCTAGACTGGAAGG
GAATTGATTTTGAGCCGCAAACAACTTCATTAAGGGAAGGCGCAAAAAGACGTGGTCGGGATTTTAGCTTATGGATATTAGTGCCCTCTGTCAAATGGTGTGTATTTATTTAAAGATCTGCTCTGCTTTGCTCTG


>TRINITY_DN48405_c0_g1_i5 from sample A10 / Example unspliced isoform:
CAAACGTCTCTGTTGTGTTTTCTTGGAAGTGCTTTCATTGTGTGTATATCTGCTTGGGCGCCTCGGTCTAAGTCCTGAGTTTGTCTGTGTGTGGGTTTTAATGTCTGTCATGTGTCTGTATGCGATAGAAGAGGCTGGACTGAAGGGGAATTGTTTTTGGGAGCAGACAACTTTAAGGGACAGGCGGGCCGCGGAAGGAC
GCGGTCAGGTTGCTCGAGAGTGTTTTTTTGCTCTTTATATTTGgtagcttcctttaactgagatatcagatctgcttttccatgccctggttcagctctctctttctttatttagtttctctgtcatttcagCTTTGCCTTTGTCTTGGGGAATTCATTTGAGGATTCTTGATTTAATTTCTGTGTCATTTCAGCTTTGC
CTTTGT




Intron 6 GTATGTATCC ... GTTTCTTCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A163.22489273
A251.96495848
A332.38713335
A441.61403720
A540.85211217
A630.1728259368
A740.97500342352
A835.73770377479
A930.62768290388
A1036.52398236222



>TRINITY_DN48405_c0_g1_i6 from sample A10 / Example spliced isoform
ATTGTTTGATTAACCTGCTGACTGTATTTTAGGGTTTGAGATCTGTTCTATGTACGTAATAAATTTTGTGTTGGTCATATATGTCTGTATAGATTATAGCAGGAGCTAGAATGGAAGGGATTTAATTTTGAGCCGCAAACAACTTCAAGGTTTGCTTATGGAAATCAATGCTCTCTGTCAAATGGTTAAAGATCTGCTCT
GCTTTGCTCTGTAGACTTGCCTGAGGGTTGGGTTCGACTTTGTTCTGTTCCTATGGAGGACTGGGAAGAAAGTTCAAAGGACTGAATCAGATTTCGGAGGCTTGGGTTTGATTTAAGTTTGAGATCTATTTTAGATACACACATTTTGTTGTGATATATGGATTTGACGTCTATTTTATATAAAATGTTTTTTGAGATCT
GTTATTAATAATTTTTAAACTTTTTTTTGCCTCTTCCTATATTCTGGACAAGAGCCAGCAGAATCCAATCTGTTTGTGTTATAGTCTGTATCTCAAATCCCAGCGCTCTGTTTGTGTAGGTTTACTTCCATATTGTTATTGTGTTAGTCTGCATACATCCACCTCCACCTATTTTAAGATTGTTACAACATTTCTTTCTT
AGTTTGTATATTATATATGCTTTAAGAATTTATATGTCGACCTATGTATTTGCTCTCTGTTTATTTTTTATTTGTTATATACGATTCGGTCTCTTACTTCATATTTTTAAATGTTCTCTTACTATTTTATAGCAATGATGAAATGTGTTATCCCTTGCAACAATAAGTAAATAGTTTAAGTAAAAACGCTGGGGACC


>TRINITY_DN48405_c0_g1_i7 from sample A10 / Example unspliced isoform:
ATTGTTTGATTAACCTGCTGACTGTATTTTAGGGTTTGAGATCTGTTCTATGTACGTAATAAATTTTGTGTTGGTCATATATGTCTGTATAGATTATAGCAGGAGCTAGAATGGAAGGGATTTAATTTTGAGCCGCAAACAACTTCAAGGTTTGCTTATGGAAATCAATGCTCTCTGTCAAATGGTTAAAGATCTGCTCT
GCTTTGCTCTGgtatgtatccatttaacgctctatttttctgtgtaaatttatcaggaatcttgatttaatctgtgagatccctctattttaaatttcattcccaatcaacctttatttgtttcttcagTAGACTTGCCTGAGGGTTGGGTTCGACTTTGTTCTGTTCCTATGGAGGACTGGGAAGAAAGTTCAAAGGAC
TGAATCAGATTTCGGAGGCTTGGGTTTGATTTAAGTTTGAGATCTATTTTAGATACACACATTTTGTTGTGATATATGGATTTGACGTCTATTTTATATAAAATGTTTTTTGAGATCTGTTATTAATAATTTTTAAACTTTTTTTTGCCTCTTCCTATATTCTGGACAAGAGCCAGCAGAATCCAATCTGTTTGTGTTAT
AGTCTGTATCTCAAATCCCAGCGCTCTGTTTGTGTAGGTTTACTTCCATATTGTTATTGTGTTAGTCTGCATACATCCACCTCCACCTATTTTAAGATTGTTACAACATTTCTTTCTTAGTTTGTATATTATATATGCTTTAAGAATTTATATGTCGACCTATGTATTTGCTCTCTGTTTATTTTTTATTTGTTATATAC
GATTCGGTCTCTTACTTCATATTTTTAAATGTTCTCTTACTATTTTATAGCAATGATGAAATGTGTTATCCCTTGCAACAATAAGTAAATAGTTTAAGTAAAAACGCTGGGGACC




Intron 7 GTAGCTTCCT ... GTCATTTCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A165.2216303
A278.954152
A361.5410164
A48442119
A558.33572
A646.21716115
A759.6619030
A856.02739336
A947.671019222
A1066.166713119



>TRINITY_DN49031_c2_g1_i15 from sample A7 / Example spliced isoform
CCACAAGTGTGTATATATACTATTTCTTAACACAACTTCAAATCACTTTCTCCCAAACGTCTCTGTTGTGTTTTCTTGGAAGTGCTTTCATTGTGTGTATATCTGCTTGGGCGCCTCGGTCTAAGTCCTGAGTTTGTCTGTGTGTGGGTTTTAATGTCTGTCATGTGTCTGTATGCGATAGAAGAGGCTGGACTGAAGGG
GAATTGTTTTTGGGAGCAGACAACTTTAAGGGACAGGCGGGCCGCGGAAGGACGCGGTCAGGTTGCTCGAGAGTGTTTTTTTGCTCTTTATATTTGCTTTGCCTTTGTCTTGGCGGGCTTGGCTTGGGTTGGCTTTCCTCTGTCCCGATGGAAAGCTAAGAAGAAAATAAAAACTGAGCATGAGGCTGGATTCGTTTCCC
TTTCCTTTGGAAGGAAGGCATAATCAGATCGGGTAATCCGATTGGTTGTTCAAAACGCTCGTCTTTCCCTGAACATGCTACTGAAACTCCAGGATTTCGATCTCAAATTCTGGATCTGCATTGTTTGATTAACCTGCTGACTCTGTTTTAGGGTTTGAGATCTGTTTTAGTAGGAGCTAGACTGGAAGGGAATTGATTTT
GAGCCGCAAACAACTTCATTAAGGGAAGGCGCAAAAAGACGTGGTCGGGATTTTAGCTTATGGATATTAGTGCCCTCTGTCAAATGGTGTGTATTTATTTAAAGATCTGCTCTGCTTTGCTCTGGTATGTATCCATTTAACGCTCTCTTTTCTTGTGTAAATTTATCAGGAATCTTGATTTAATCTGTGCGATCCCTCTA
TTTTAAATTTCATTCCCAATCATTTCTTTGTTTCTTCATTACACTTTCCTGAGGGTTGGGTTTGACTTTGTTCACTTCCTATGGAGAGATGGGAAGAAAGTACTGAATCAGTCCAACGCGTGTTTGATTTAAGATTTGAGATGTATTTTAGATACACACATTTTGTTGTGATATATGGATTTGACGTCTATTTTATATAA
AATGTTTTTTGAGATCTGTTATTAATAATTTTTAAACTTTTTTTTGCCTCTTCCTATATTCTGGACAAG


>TRINITY_DN49031_c2_g1_i9 from sample A7 / Example unspliced isoform:
CCACAAGTGTGTATATATACTATTTCTTAACACAACTTCAAATCACTTTCTCCCAAACGTCTCTGTTGTGTTTTCTTGGAAGTGCTTTCATTGTGTGTATATCTGCTTGGGCGCCTCGGTCTAAGTCCTGAGTTTGTCTGTGTGTGGGTTTTAATGTCTGTCATGTGTCTGTATGCGATAGAAGAGGCTGGACTGAAGGG
GAATTGTTTTTGGGAGCAGACAACTTTAAGGGACAGGCGGGCCGCGGAAGGACGCGGTCAGGTTGCTCGAGAGTGTTTTTTTGCTCTTTATATTTGgtagcttcctttaactgagatatcagatctgcttttccatgccctgtttcagctctctctttctttaattaatttctctgtcatttcagctttgcctttgtctt
ggggaattcatttgaggattcttgatttaatttctgtgtcatttcag
CTTTGCCTTTGTCTTGGCGGGCTTGGCTTGGGTTGGCTTTCCTCTGTCCCGATGGAAAGCTAAGAAGAAAATAAAAACTGAGCATGAGGCTGGATTCGTTTCCCTTTCCTTTGGAAGGAAGGCATAATCAGATCGGGTAATCCGATTGGTTGT
TCAAAACGCTCGTCTTTCCCTGAACATGCTACTGAAACTCCAGGATTTCGATCTCAAATTCTGGATCTGCATTGTTTGATTAACCTGCTGACTCTGTTTTAGGGTTTGAGATCTGTTTTAGTAGGAGCTAGACTGGAAGGGAATTGATTTTGAGCCGCAAACAACTTCATTAAGGGAAGGCGCAAAAAGACGTGGTCGGG
ATTTTAGCTTATGGATATTAGTGCCCTCTGTCAAATGGTGTGTATTTATTTAAAGATCTGCTCTGCTTTGCTCTGGTATGTATCCATTTAACGCTCTCTTTTCTTGTGTAAATTTATCAGGAATCTTGATTTAATCTGTGCGATCCCTCTATTTTAAATTTCATTCCCAATCATTTCTTTGTTTCTTCATTACACTTTCC
TGAGGGTTGGGTTTGACTTTGTTCACTTCCTATGGAGAGATGGGAAGAAAGTACTGAATCAGTCCAACGCGTGTTTGATTTAAGATTTGAGATGTATTTTAGATACACACATTTTGTTGTGATATATGGATTTGACGTCTATTTTATATAAAATGTTTTTTGAGATCTGTTATTAATAATTTTTAAACTTTTTTTTGCCT
CTTCCTATATTCTGGACAAG




Intron 8 GTAAGTAATA ... ATCTGTATAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A150303
A266.675210
A337.5503
A420421
A5010.70
A629.27291212
A735.59389.321
A833.656917.335
A926.4955.51220
A1028.13469.318



>TRINITY_DN49031_c2_g1_i9 from sample A7 / Example spliced isoform
CCACAAGTGTGTATATATACTATTTCTTAACACAACTTCAAATCACTTTCTCCCAAACGTCTCTGTTGTGTTTTCTTGGAAGTGCTTTCATTGTGTGTATATCTGCTTGGGCGCCTCGGTCTAAGTCCTGAGTTTGTCTGTGTGTGGGTTTTAATGTCTGTCATGTGTCTGTATGCGATAGAAGAGGCTGGACTGAAGGG
GAATTGTTTTTGGGAGCAGACAACTTTAAGGGACAGGCGGGCCGCGGAAGGACGCGGTCAGGTTGCTCGAGAGTGTTTTTTTGCTCTTTATATTTGGTAGCTTCCTTTAACTGAGATATCAGATCTGCTTTTCCATGCCCTGTTTCAGCTCTCTCTTTCTTTAATTAATTTCTCTGTCATTTCAGCTTTGCCTTTGTCTT
GGGGAATTCATTTGAGGATTCTTGATTTAATTTCTGTGTCATTTCAGCTTTGCCTTTGTCTTGGCGGGCTTGGCTTGGGTTGGCTTTCCTCTGTCCCGATGGAAAGCTAAGAAGAAAATAAAAACTGAGCATGAGGCTGGATTCGTTTCCCTTTCCTTTGGAAGGAAGGCATAATCAGATCGGGTAATCCGATTGGTTGT
TCAAAACGCTCGTCTTTCCCTGAACATGCTACTGAAACTCCAGGATTTCGATCTCAAATTCTGGATCTGCATTGTTTGATTAACCTGCTGACTCTGTTTTAGGGTTTGAGATCTGTTTTAGTAGGAGCTAGACTGGAAGGGAATTGATTTTGAGCCGCAAACAACTTCATTAAGGGAAGGCGCAAAAAGACGTGGTCGGG
ATTTTAGCTTATGGATATTAGTGCCCTCTGTCAAATGGTGTGTATTTATTTAAAGATCTGCTCTGCTTTGCTCTGGTATGTATCCATTTAACGCTCTCTTTTCTTGTGTAAATTTATCAGGAATCTTGATTTAATCTGTGCGATCCCTCTATTTTAAATTTCATTCCCAATCATTTCTTTGTTTCTTCATTACACTTTCC
TGAGGGTTGGGTTTGACTTTGTTCACTTCCTATGGAGAGATGGGAAGAAAGTACTGAATCAGTCCAACGCGTGTTTGATTTAAGATTTGAGATGTATTTTAGATACACACATTTTGTTGTGATATATGGATTTGACGTCTATTTTATATAAAATGTTTTTTGAGATCTGTTATTAATAATTTTTAAACTTTTTTTTGCCT
CTTCCTATATTCTGGACAAG


>TRINITY_DN49031_c2_g1_i8 from sample A7 / Example unspliced isoform:
ATCATATATGCCTGAGATCTGTTTTAGgtaagtaataaattttatgttgatcatatatgcctgagatctgttttaggtaagtaataaattttatgttgatcatatatgcctgagatctgttatgtttgagatctgtatagTAGGAGCTAGACTGGAAGGGAATTGATTTTGAGCCGCAAACAACTTCATTAAGGGAAGGC
GCAAAAAGACGTGGTCGGGATTTTAGCTTATGGATATTAGTGCCCTCTGTCAAATGGTGTGTATTTATTTAAAGATCTGCTCTGCTTTGCTCTGGTATGTATCCATTTAACGCTCTCTTTTCTTGTGTAAATTTATCAGGAATCTTGATTTAATCTGTGCGATCCCTCTATTTTAAATTTCATTCCCAATCATTTCTTTG
TTTCTTCATTACACTTTCCTGAGGGTTGGGTTTGACTTTGTTCACTTCCTATGGAGAGATGGGAAGAAAGTACTGAATCAGTCCAACGCGTGTTTGATTTAAGATTTGAGATGTATTTTAGATACACACATTTTGTTGTGATATATGGATTTGACGTCTATTTTATATAAAATGTTTTTTGAGATCTGTTATTAATAATT
TTTAAACTTTTTTTTGCCTCTTCCTATATTCTGGACAAG




Intron 9 GTGTGTATTT ... AATTTATCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A191.4331747
A271.15152153
A310001117
A490.481712
A5100047
A683.582267157
A781.1941116238
A877.2158139254
A980.1637109190
A1084.342286151



>TRINITY_DN49031_c2_g1_i6 from sample A7 / Example spliced isoform
ATCATATATGCCTGAGATCTGTTTTAGGTAAGTAATAAATTTTATGTTGATCATATATGCCTGAGATCTGTTTTAGGTAAGTAATAAATTTTATGTTGATCATATATGCCTGAGATCTGTTATGTTTGAGATCTGTATAGTAGGAGCTAGACTGGAAGGGAATTGATTTTGAGCCGCAAACAACTTCATTAAGGGAAGGC
GCAAAAAGACGTGGTCGGGATTTTAGCTTATGGATATTAGTGCCCTCTGTCAAATGGAATCTTGATTTAATCTGTGCGATCCCTCTATTTTAAATTTCATTCCCAATCATTTCTTTGTTTCTTCATTACACTTTCCTGAGGGTTGGGTTTGACTTTGTTCACTTCCTATGGAGAGATGGGAAGAAAGTACTGAATCAGTC
CAACGCGTGTTTGATTTAAGATTTGAGATGTATTTTAGATACACACATTTTGTTGTGATATATGGATTTGACGTCTATTTTATATAAAATGTTTTTTGAGATCTGTTATTAATAATTTTTAAACTTTTTTTTGCCTCTTCCTATATTCTGGACAAG


>TRINITY_DN49031_c2_g1_i15 from sample A7 / Example unspliced isoform:
CCACAAGTGTGTATATATACTATTTCTTAACACAACTTCAAATCACTTTCTCCCAAACGTCTCTGTTGTGTTTTCTTGGAAGTGCTTTCATTGTGTGTATATCTGCTTGGGCGCCTCGGTCTAAGTCCTGAGTTTGTCTGTGTGTGGGTTTTAATGTCTGTCATGTGTCTGTATGCGATAGAAGAGGCTGGACTGAAGGG
GAATTGTTTTTGGGAGCAGACAACTTTAAGGGACAGGCGGGCCGCGGAAGGACGCGGTCAGGTTGCTCGAGAGTGTTTTTTTGCTCTTTATATTTGCTTTGCCTTTGTCTTGGCGGGCTTGGCTTGGGTTGGCTTTCCTCTGTCCCGATGGAAAGCTAAGAAGAAAATAAAAACTGAGCATGAGGCTGGATTCGTTTCCC
TTTCCTTTGGAAGGAAGGCATAATCAGATCGGGTAATCCGATTGGTTGTTCAAAACGCTCGTCTTTCCCTGAACATGCTACTGAAACTCCAGGATTTCGATCTCAAATTCTGGATCTGCATTGTTTGATTAACCTGCTGACTCTGTTTTAGGGTTTGAGATCTGTTTTAGTAGGAGCTAGACTGGAAGGGAATTGATTTT
GAGCCGCAAACAACTTCATTAAGGGAAGGCGCAAAAAGACGTGGTCGGGATTTTAGCTTATGGATATTAGTGCCCTCTGTCAAATGgtgtgtatttatttaaagatctgctctgctttgctctggtatgtatccatttaacgctctcttttcttgtgtaaatttatcagGAATCTTGATTTAATCTGTGCGATCCCTCTA
TTTTAAATTTCATTCCCAATCATTTCTTTGTTTCTTCATTACACTTTCCTGAGGGTTGGGTTTGACTTTGTTCACTTCCTATGGAGAGATGGGAAGAAAGTACTGAATCAGTCCAACGCGTGTTTGATTTAAGATTTGAGATGTATTTTAGATACACACATTTTGTTGTGATATATGGATTTGACGTCTATTTTATATAA
AATGTTTTTTGAGATCTGTTATTAATAATTTTTAAACTTTTTTTTGCCTCTTCCTATATTCTGGACAAG




Intron 10 GTATATATGT ... GTCTGTATAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A128.657.52422
A225.2492013
A318.06591511
A429.8532223
A519.7734.5710
A620.8852318987
A723.38485181115
A822.14533175128
A919.88610.5198105
A1021.26370.513565



>TRINITY_DN121661_c0_g1_i11 from sample A2 / Example spliced isoform
CCTCATCTTCCTCAAGCGCTTCCATTATGTGTATATGTCTGCTTGGGCGTCTGGGTATAAGTCCTGAGTTTGTCTGTTTGTGGGCTTTAATGCCTGTCATGTCTCTGCAGTATGTGATAGATAGATGAGGCTGGACTGAAGGGGAATTGCATTTGGGAGCAAACAACTTCAAGGGACGGGCTGAAGGACGCAGTCAGGTT
GCTCAATGGTTTTCTTTGGTCACAAAGATAAATGCTCTTTATATTTACTAGCTTCCTTTAATTTAGACATCAGATCTGCTTTGCCATGGCTTGGTTTAGCTCTCTCTTTCTCTTGGTGAATTCATTTGAGGTTTCTTTATTTGATTTCTGTCATTTCATCTTTGCCTTTGCCTTGGGATTTGGGCTTGGATTTCCTCTTT
TCTGATGGAAAGCCAAGAAGAAAATAATAATTGAGTACGAGGCCGAAGTCATTGCCCAGCTTGCCTTTTCTTGGCTTCTGAAGGAAGCCAAGAAAATAATAATTGAGTACTCTGCTGAACTCCAGATTATAGCAGGAGCTAGAATGGAAGGGATTTAATTTTGAGCCGCAAACAACTTCAAGGTTTGCTTATGGAAATCA
ATGCTCTCTGTCAAATGGTTAAAGATCTGCTCTGCTTTGCTCTGTAGACTTGCCTGAGGGTTGGGTTCGACTTTGTTCTGTTCCTATGGAGGACTGGGAAGAAAGTTCAAAGGACTGAATCAGATTTCGGAGGCTTGGGTTTGATTTAAGTTTGAGATCTATTTTAGATACACACATTTTGTTGTGATATATGGATTTGA
CGTCTATTTTATATAAAATGTTTTTTTGAGATCTGTTATTAATAATTTTTAAACTTTTTTTTGCCTCTTCCTATATTCTGGACAAGAGCCAGCAGAATCCAATCTGTTTGTGTTATAGTCTGTATCTCAAATCCCAGCGCTCTGTTTGTGTAGGTTTACTTCCATATTGTTATTGTGTTAGTCTGCATACATCCACCTCC
ACCTATTTTAAGATTGTTACAACATTTCTTTCTTAGTTTGTATATTATATATGCTTTAAGAATTTATATGTCGACCTATGTATTTGCTCTCTGTTTATTTTTTATTTGTTATATTCGATTCGGTCTCTTACTTCATATTTTTAAATGTTCATTTATTATTTTATAGAATCTGGAATTACAATGATGAAATATGTGTAGTG
TGACCTTATTTTTAGTTATCCCCTCCTCCAGAATATTGCAACAATAAGTAAATAGTTGCATGGGTTTTTCAAAACTTTGATGACATTCGCTCTTCAACTTTAGTATTTTGTTTTGTTTTCGTTTCGTTGGCAGTGCAGTAGATTCAATGACAAAATACCACTTGGTGCGTCTCTATATTTTTGCATTGATAAATCGATCC
CAACTTGTCTTCGTTTTTTTAAATGAAAATTTAGCTATACTTTATACACACAAAGCCACCAGCAATAAATGAAGCATATGCCGAGCATATAAAATGCCACCAGCAATAACCAGAAACAGTCCAAACTGGTCAGAATACATGCCACAGAACCCAGCCCAAATTGTCTTCCTATTCGTATTCTCAGCGTCTTTGTTTTTCTC
ATTAGTTGTATGCCTTCATTTAAACTCCGATCATAGGAAGTTGATATTTAACACGAATTCAATAAGGTTTGTTGAGATTTGTTTGAAGCCTTTTTTTTAACCTTTTTTTAGGTGTTATATATATATATAGATATATATATATATTCAAATTAAACACGTGTATTCATAAATTTTGACATAGAATTGAAGTATTATGTGTT
TTGTCTTATCTTGGTTTTGATTTTATGTGTGTGTTTATATACAAATTACAAAATATATAAAATAAAAAAAACACACATGTATATATAAATCCATTTAATTTAAG


>TRINITY_DN121661_c0_g1_i13 from sample A2 / Example unspliced isoform:
CCTCATCTTCCTCAAGCGCTTCCATTATGTGTATATGTCTGCTTGGGCGTCTGGGTATAAGTCCTGAGTTTGTCTGTTTGTGGGCTTTAATGCCTGTCATGTCTCTGCAGTATGTGATAGATAGATGAGGCTGGACTGAAGGGGAATTGCATTTGGGAGCAAACAACTTCAAGGGACGGGCTGAAGGACGCAGTCAGGTT
GCTCAATGGTTTTCTTTGGTCACAAAGATAAATGCTCTTTATATTTACTAGCTTCCTTTAATTTAGACATCAGATCTGCTTTGCCATGGCTTGGTTTAGCTCTCTCTTTCTCTTGGTGAATTCATTTGAGGTTTCTTTATTTGATTTCTGTCATTTCATCTTTGCCTTTGCCTTGGGATTTGGGCTTGGATTTCCTCTTT
TCTGATGGAAAGCCAAGAAGAAAATAATAATTGAGTACGAGGCCGAAGTCATTGCCCAGCTTGCCTTTTCTTGGCTTCTGAAGGAAGCCAAGAAAATAATAATTGAGTACTCTGCTGAACTCCAGgtatatatgtatttcaatctcaaattctgcatctgcattgtttgattaacctgctgactgtattttagggtttga
gatctgttctatgtacgtaataaattttgtgttggtcatatatgtctgtatag
ATTATAGCAGGAGCTAGAATGGAAGGGATTTAATTTTGAGCCGCAAACAACTTCAAGGTTTGCTTATGCAAATCAATGCACTCTGTCAAATGGTTAAAGATCTGCTCTGCTTTGCTCTGGTATGTATCATTTAACGCTCTATTTTTC
TGTATAAATTTATCAGGAATCTTGATTTAATCTGTGAGATCCCTCTATTTTAAATTTCATTCCCAATCAACCTTTATTTGTTTCTTCAGCTTTGTTTCTTCATAGACTTGTAGCCTTAGGGTTGGGTTTGACTTTGTTTTGTTCCTATGGAGAGCTACTTGCCTGAGGGTTGGGTTAGACTTTGTTCTGTTCCTATGGAG
GACTGGGAAGAAAGTTCAAAGGACTGAATCAGATTTCGGAGGCTTGGGTTTGATTTAAGTTTGGAATCTATTTTAGATACACACATTTTGTTGAGATATATGG