sp|Q42545|FTSZ1_ARATH ----> Cell division protein FtsZ homolog 1, chloroplastic

Intron 1 GTACTGGTGG ... AGTATCCCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	54.19	41	57	40
A2	62.32	21.5	44	27
A3	63.46	38	94	38
A4	58.49	33	48	45
A5	51.47	33	48	22
A6	56.01	108	151	124
A7	56.11	140	201	157
A8	58.72	84	94	145
A9	63.95	84	160	138
A10	58.35	116	212	113

>TRINITY_DN120218_c0_g3_i1 from sample A2 / Example spliced isoform

CGCATAAAGGTCGTCGGCATCGGTGGTGGAGGGAACAATGCTGTAAATCGAATGATTGCCGCCGGTCTCCATGGTGTTGAATTTTATGCCATAAATACAGATGCTCAAGCTCTGCTACAATCAGCTGCAGAGAACCCTGTTCAAATTGGAGAACAATTGACTCGTGGACTGGGTTGTTACTAGTTTGGCAGATCCATCAG
CAAATATCATATTTGGAGCTGTTGTTGATGATAGGTATGCAGGAGAAATACATGTAACTATCATTGCTACGGGATTTTCTCACACTTTTCAAAAAGCATTGGTAACAGATCCAAAGGTTGCCAAGCAAGAATATCAGGAGGCTAAAGGATTGGAGTCTAGTAGAAAAGGTTCAGCTCCTGTTTCTCCTAGGCCTTCTGGT
AGGAAGTGGCTTTTATGAAGGGGTGAAATATTTCAGTTTGGACTGCGGGTTGCTAGATCTATCAAAACCCAGAATTCAAGTTGGTTCATGATTGTCATGGATACTGTATATTATTGCCCTCATTATCATGCACAAGAGAACGGTGGCTTAAGCAGGAAGGTAAAATACTAAAAGCTCATTATATAGACCAGATTTTTTTC
ATGTAGGAGGCATAGTGAGAGGTTCTAATCGCTGGCAGTTTGCTTGATGCTCAGTGATTAATTAATATGAAGCACAGGACATGCAGTTTGAACTTGTTTCTTTCTTTGGAATGGTTGGATTCAAGTTTTTCTGCTGTAAGCATTTCTTTGTATGATTTATGCTGCAAGGTAACTATACTAAAAAATTGCAGAAACTTTCT
TGGATTCTGGGTCCTTGTTGATTTGATATTTTCAGAGATTAGTTCAGAAGATTAAGCCAACGGAAACGTAGGAGTGCTTAAATGTTGACATTGTAGTTGCAAGTGAAGCATAATGAATTCTATTTTATTATTATTTTTTTTTTGAATATATATAG

>TRINITY_DN120218_c0_g3_i3 from sample A2 / Example unspliced isoform:

CGCATAAAGGTCGTCGGCATCGGTGGTGGAGGGAACAATGCTGTAAATCGAATGATTGCCGCCGGTCTCCATGGTGTTGAATTTTATGCCATAAATACAGATGCTCAAGCTCTGCTACAATCAGCTGCAGAGAACCCTGTTCAAATTGGAGAACAATTGACTCGTGGACTGGgtactggtggaaatcctgaactcgggga
acaagctgcagaagaatcaaaggaagctataatcgaagttctaaaggaatcagatcttgtatttattacagctggaatgggtgggggtacagggtcaggtgcagctcctgttgttgcccgattatcaaaagaagcaggcaatctgactgtcggtgtggttacttatcctttcagttttgaaggtcgtaggagatctgtac
aggcattggaggcaattgagagattacagaaatgtgtggatactcttattgtcattccaaatgataggttactagatgttgttgaagagcagacgcctcttgaagatgctttcatccttgctgatgatgtcctacgtcaaggtgtacaaggaatttctgatataataacaattccaggtttagtgaacgtggactttgca
gatgtgaaggctgttatgagtaattcaggaactgcaatgcttggagtgggtgtgtcgtctggtaaaaaccgagcagaggaggctgcacagcaagctacttcagctcccctcattgaaagatcgatagagcgtgccaccggtgttgtgtacaacattactgggggaaaagaccttacattgcaagaagtaaacaaagtatc
ccagGTTGTTACTAGTTTGGCAGATCCATCAGCAAATATCATATTTGGAGCTGTTGTTGATGATAGGTATGCAGGAGAAATACATGTAACTATCATTGCTACGGGATTTTCTCACACTTTTCAAAAAGCATTGGTAACAGATCCAAAGGTTGCCAAGCAAGAATATCAGGAGGCTAAAGGATTGGAGTCTAGTAGAAAAG
GTTCAGCTCCTGTTTCTCCTAGGCCTTCTGGTAGGAAGTGGCTTTTATGAAGGGGTGAAATATTTCAGTTTGGACTGCGGGTTGCTAGATCTATCAAAACCCAGAATTCAAGTTGGTTCATGATTGTCATGGATACTGTATATTATTGCCCTCATTATCATGCACAAGAGAACGGTGGCTTAAGCAGGAAGGTAAAATAC
TAAAAGCTCATTATATAGACCAGATTTTTTTCATGTAGGAGGCATAGTGAGAGGTTCTAATCGCTGGCAGTTTGCTTGATGCTCAGTGATTAATTAATATGAAGCACAGGACATGCAGTTTGAACTTGTTTCTTTCTTTGGAATGGTTGGATTCAAGTTTTTCTGCTGTAAGCATTTCTTTGTATGATTTATGCTGCAAG
GTAACTATACTAAAAAATTGCAGAAACTTTCTTGGATTCTGGGTCCTTGTTGATTTGATATTTTCAGAGATTAGTTCAGAAGATTAAGCCAACGGAAACGTAGGAGTGCTTAAATGTTGACATTGTAGTTGCAAGTGAAGCATAATGAATTCTATTTTATTATTATTTTTTTTTTGAATATATATAG