sp|Q9CAD5|YODA_ARATH ----> Mitogen-activated protein kinase kinase kinase YODA
Intron 1 GTAAGTAATT ... TTTGTTGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 22.45 | 95 | 40 | 15 |
| A2 | 28.28 | 52 | 26 | 15 |
| A3 | 23.3 | 79 | 29 | 19 |
| A4 | 18.88 | 58 | 22 | 5 |
| A5 | 23.29 | 28 | 14 | 3 |
| A6 | 22.77 | 229 | 90 | 45 |
| A7 | 21.72 | 310 | 109 | 63 |
| A8 | 23.54 | 531 | 190 | 137 |
| A9 | 21.11 | 342 | 128 | 55 |
| A10 | 22.22 | 217 | 79 | 45 |
>TRINITY_DN119895_c0_g2_i5 from sample A3 / Example spliced isoformAAGGCAGGCGGCGCAGCAACGAACTAAAAATGCTTTATTCTCTTAATTTAATGAATAACTTGTTTTGCATATTTTGTGGGAGTTGGGCAGTGCACACGTAATAATCTCATAAGCTCTTCTCTCATCAACTGTACCGTTTGTTTGTTTGCGTACTAGGGTTCGAACTTGGAACCTGCCCGAGCACAAAATTGCGTAATTCG
TGGGGGTATGATTGATTTGTATCCAAGGCATGCCGAGGTGCGGGGTTCAACTCTCGCTGACTGCATAGTCATCCAAATGCAGCTGCTGCTGGTGTTTTGCTAGACCTGCTGCGTGCGTGCTTGTGCGGGGTTCGAATCTCGGGGTCTTTGGAAATGCAGGTGTTAGCTTTGTAAGTAACAAGCGGACTGAGTGGTTTGCA
GGGGGCAGGATGCTATCATGGTGGAAATCGCCGTCGTCATCGTCGGCGAAGAAGAAGAATGCCAATAACAACATTAATAGTAGTGAGAAGAAAAAGAAGAACAAGGACAACGGCATTCTGCATTCGTTGAGTTTCAGGAAATTGAAGGGGAATTTCGCCTCTCCAGCATGTCGAAGAGAGTCTACGACGTTGAATCATGT
CGACGATTCGGATTTCGAAATCCCGTCTCCTTCGACTTCGAATTCGACGTCTGTGACAAGGTGCCAGAGCTTCTCCCATGCGCTCCCCCTGCCGTTGCCATGCATGCCGCCGGCCTCGATATTGGGTCGGACTGAATCTGGAATCAGTTTGAATAGATCTGGGCACTTTTTGCCGCTGCCTTCTCCTCAAGCAGTGTTGA
ATAGGTCGGAGAATGCTGCGGATGGCTCGGCTTTGTCGGGGTCGGATTCTGCTACGAGTTCGATGGTGGGCAGCGACGACCAGGCCGACAGAGATCCATCTGCCACTATTGGTTCCTGCATAACATTTGCAGGTTCAGCTCCTAAGAACAGCAAGAAAAATACAAAGCGTGAGATTCCAAAGCCCAATATCAGTTTGCTC
AGTAAGCATAATAATTTACCGATTCCACCAAAGAGAGGGTTTTCGAGTAACCGAGAACCCCCAAAACCCCTTCAGATTCCAGTGAATAGACAGCCGGTCGCTGCAACCGACAGTTCTACGTCTACGCCATCTAGTCCAATGAGGGGTTTCAGCTCGGAGCATTCCCCACGTGGTGGCTTGTGTATGGCGAAGCCGTATCT
GGATGGCGCTATGTTTGGATCCGGCAATTGCTCGAGCCCAGGTTCGGGTTACAATTCGGGACAGAATTCTATAGGCGGAGATATGGTGGGACAACCCTTTTGGCACAACAGGGGTGGTTCTCCCGTGCCAAGTCCGAGAATGAGGAGTCCAGGTCCAAGTTCACGAGCACAGAGTGCTGCTGTTTCTCCTCTTCATCCTC
GAGCCAGTGGATTAGGGACCGAATCTCCAACAGGCAGACAGGAAGAGGGAAAACAACAATGTCATCCATTGCCGCTGCCGCCACGGTCCCCTTCTAGTTCTTCACCCTTCACCACATCTGCCACATCTTCAGGAGGTCCACGAAGTCCTGGTGGCAAAGACAACCCTGCAAGTCCTGGGCAGCGATGGAAGAAGGGGAAA
TTGTTGGGAAGAGGGACCTTTGGCCATGTCTATGTCGGTTTCAACAATGAAAGTGGAGAAATGTGTGCAATGAAGGAAGTTACTCTTTTCTCTGATGATCCGAAGTCCAAGGAGAGTGTAAAGCAGCTAGCACAGGAGATATCTATGCTGAGTCACTTACGGCATCCAAACATAGTGCAATATTATGGAAGTGAAACGGT
GGATGACATGCTATATATTTACCTGGAGTATGTGTCTGGAGGTTCCATTCACAAACTGCTTCAAGAATATGGCCAGTTTGGAGAGCCAGTTGTTCGCAGCTATACACATCAGATACTTTGTGGGCTGGCATATCTGCATAACAGAAATACTGTTCACAGGGACGTCAAAGGCGCAAATATTCTTGTTGATCCCAATGGCC
ATGTGAAGCTTGCAGACTTTGGCATGGCAAAACATATCACAGCACATTCCTGTCTTTTGTCATTTAAAGGAAGTCCATACTGGATGGCCCCTGAGGTAATTAAAAATGTAAATGGCTATGACTTGGCAGTGGATATCTGGAGCCTTGGTTGTACAGTTTTGGAAATGGCTACGGCACAGCCTCCATGGAGCCAGTATGAA
GGGGTTGCTGCAATGTTTAAAATAGGGAACAGTAAGGAGCTACCAGCAATCCCTGACCATCTTTCAGAGGAAGGCAAGAATTTTGTGAAATTATGTCTGCAGAGAAATCCTGTAAACCGTCCCACAGCTACACAACTTTTGGAACACCCATTTGTGAAACTGGATCAAAGTGCAGAAGGCATAGAGTTGTTGCCATCATC
TGCTAATGGGTCAAGGCCTCTGCATGCTACACAATGTGCTGTACATTCAAGAAATTTCTCATCGCTAGAGATGGACTATTCAGCACTACATTCAAAGGGTTGGTCACCGTATCAACCTTCAAGTGACCATTTTTATGTGAAAGGAAACATATCCTTGCCAGTCTCTCCATCTGCAAGCCCATTGATCCAGCCACGATCTC
CCCATCATAGATACGGTGGGATGTCTCCTTCGCCTATATCAACACCACTGGCAAGCTCAGGTTCTTCAACTCCTTTAACAGGAGGTTATGGTGCTATCCCATTCCAGGCTAATGGAGCTGCAAAATCAGCAGTGCATTTGCAGGAGAATTTTGGAAACATGCCAAGATTGGCAAATGGACTACATACTAATTGTTCTGGT
GGCTATCTTGATCCTAGGCCTGATGTTTATGGGGGTGCACAGATAGTTCGTACTCCAGAAGGTTCCCCAAGATTTCAAAATCATATAGTTGCAGAAAGTGATGTATTGGGTAAAAATATTGGTAGAGTGATGAGAAATGAGCATGGACAGAGTCAAAGGCAATATAGTGGTCAAGGGGCTTTAGCAGAACATGTGTCACA
GCAGCTTCTAAAGACTCCTAAGCCTGTTGGAATTGATTTCATATCTGGTCCTCCCAAGTTTTACTAAAGGTAGTTTTTCATCAACATTCGGTCGAGTGCATATAACTAACCATTATTGACAGCTGATGGATCTTTTTTGTTAAGTAAACATGGAACTGAAATTATTGAACAACGGGTCGGCCTGTCTCACCGGGTGTGCC
TGATCAGGCCCAACAAACTGTACTATATTAAACAATTGGGTGGCTGTAATGGAGAGATGTGATCAGTGCATTTCCTGATTAAAAGATAGGAACAAAGGAAGACTGTTGCCACATATTGCTGAGGTGGATATTGTATAACTCTGTGACCTTTTTGTCACAAATTATTTTGTAACAATTATATCAACTATACAAAGGTGGAG
AAACTATTTTCTTCAATTCTATGTAGGGTGTTTTTGTCTAGAAAAATTGTTTTCGAGCTGACATTTCATTGGTTGGCTCTTTTCATCTGGCTTTTATCAAAGAAGCAGCTGAAATGCACAAATTGAAATGATGGATACCACATGTAACAGAAGAAAATTGAAAGTCTGAGGGCCTGTATTAATAATTTCCTGTGCAACAG
GTTTTCAGTATCCTGATGTAATGCAACGTAGTTTATGCTTTACAAGCTTACGACATATGGGTTGTTCTAGGTGTTTGGCATCTAGAGGAGTTGGATAGTTGAAAACCTGTGAATGTGATAGCTATGGTAAGCATATATTTGGGCTTATCCTTTCCATCTTACAGTATGCTAACAGTAGCTCTGCTAGTGCATCTTGTCTT
TCAGTCTTATCTTTTCCCTGCTCCTTTTTTGTAAATTAGTACCCAAAACAGAGAGGTTCTAGTTATGAAAGAATCCTCAATCAAATATGGATATACTATAGGGAAGTTCGCGACAATCTGCACAGAATTAGGGAGCCTGGAGTCATTTGTTTTCTTATCTTCCAAAATATTTTTTAAGAATGTGGGTTTGCATAACTCAA
TCAAATGATACAACATGATTATGCAGTTCATAGGCTGACGGTACACCACATGTATCTTATAGCCAGGTTAATTCAATTATTCCACTTTGCTCTTTCATAGTATCATACAAGCAGTGGCCGATCTGTATATTAAAGACATGAACAGTGAACATTCAAGATAAACATGGACTGCATATGCAAGTTATTGTCTGAAATGAAAG
AGGATTCAGAATGACCATATTTCTCAGTTCTGACCAATTTGATTATTGTAAATCATTCACAAAAGTGTTATGGGCCTACATTCCTTTTGCAGAGCATTCTGGAATTTGAGATGTTAGAATATTGAAAGTTACTGAAATGCTAAAGTTAACG
>TRINITY_DN119895_c0_g2_i6 from sample A3 / Example unspliced isoform:AAGGCAGGCGGCGCAGCAACGAACTAAAAATGCTTTATTCTCTTAATTTAATGAATAACTTGTTTTGCATATTTTGTGGGAGTTGGGCAGTGCACACGTAATAATCTCATAAGCTCTTCTCTCATCAACTGTACCGTTTGTTTGTTTGCGTACTAGGGTTCGAACTTGGAACCTGCCCGAGCACAAAATTGCGTAATTCG
TGGGGGTATGATTGATTTGTATCCAAGGCATGCCGAGGTGCGGGGTTCAACTCTCGCTGACTGCATAGTCATCCAAATGCAGCTGCTGCTGGTGTTTTGCTAGACCTGCTGCGTGCGTGCTTGTGCGGGGTTCGAATCTCGGGGTCTTTGGAAATGCAGGTGTTAGCTTTGTAAGTAACAAGCGGACTGAGTGGTTTGCA
GGGGGCAGGATGCTATCATGGTGGAAATCGCCGTCGTCATCGTCGGCGAAGAAGAAGAATGCCAATAACAACATTAATAGTAGTGAGAAGAAAAAGAAGAACAAGGACAACGGCATTCTGCATTCGTTGAGTTTCAGGAAATTGAAGGGGAATTTCGCCTCTCCAGCATGTCGAAGAGAGTCTACGACGTTGAATCATGT
CGACGATTCGGATTTCGAAATCCCGTCTCCTTCGACTTCGAATTCGACGTCTGTGACAAGGTGCCAGAGCTTCTCCCATGCGCTCCCCCTGCCGTTGCCATGCATGCCGCCGGCCTCGATATTGGGTCGGACTGAATCTGGAATCAGTTTGAATAGATCTGGGCACTTTTTGCCGCTGCCTTCTCCTCAAGCAGTGTTGA
ATAGGTCGGAGAATGCTGCGGATGGCTCGGCTTTGTCGGGGTCGGATTCTGCTACGAGTTCGATGGTGGGCAGCGACGACCAGGCCGACAGAGATCCATCTGCCACTATTGGTTCCTGCATAACATTTGCAGGTTCAGCTCCTAAGAACAGCAAGAAAAATACAAAGCGTGAGATTCCAAAGCCCAATATCAGTTTGCTC
AGTAAGCATAATAATTTACCGATTCCACCAAAGAGAGGGTTTTCGAGTAACCGAGAACCCCCAAAACCCCTTCAGATTCCAGTGAATAGACAGCCGGTCGCTGCAACCGACAGTTCTACGTCTACGCCATCTAGTCCAATGAGGGGTTTCAGCTCGGAGCATTCCCCACGTGGTGGCTTGTGTATGGCGAAGCCGTATCT
GGATGGCGCTATGTTTGGATCCGGCAATTGCTCGAGCCCAGGTTCGGGTTACAATTCGGGACAGAATTCTATAGGCGGAGATATGGTGGGACAACCCTTTTGGCACAACAGGGGTGGTTCTCCCGTGCCAAGTCCGAGAATGAGGAGTCCAGGTCCAAGTTCACGAGCACAGAGTGCTGCTGTTTCTCCTCTTCATCCTC
GAGCCAGTGGATTAGGGACCGAATCTCCAACAGGCAGACAGGAAGAGGGAAAACAACAATGTCATCCATTGCCGCTGCCGCCACGGTCCCCTTCTAGTTCTTCACCCTTCACCACATCTGCCACATCTTCAGGAGGTCCACGAAGTCCTGGTGGCAAAGACAACCCTGCAAGTCCTGGGCAGCGATGGAAGAAGGGGAAA
TTGTTGGGAAGAGGGACCTTTGGCCATGTCTATGTCGGTTTCAACAATGAAAGTGGAGAAATGTGTGCAATGAAGGAAGTTACTCTTTTCTCTGATGATCCGAAGTCCAAGGAGAGTGTAAAGCAGCTAGCACAGGAGATATCTATGCTGAGTCACTTACGGCATCCAAACATAGTGCAATATTATGGAAGTGAAACGGT
GGATGACATGCTATATATTTACCTGGAGTATGTGTCTGGAGGTTCCATTCACAAACTGCTTCAAGAATATGGCCAGTTTGGAGAGCCAGTTGTTCGCAGCTATACACATCAGATACTTTGTGGGCTGGCATATCTGCATAACAGAAATACTGTTCACAGGGACGTCAAAGGCGCAAATATTCTTGTTGATCCCAATGGCC
ATGTGAAGCTTGCAGACTTTGGCATGGCAAAACATATCACAGCACATTCCTGTCTTTTGTCATTTAAAGGAAGTCCATACTGGATGGCCCCTGAGGTAATTAAAAATGTAAATGGCTATGACTTGGCAGTGGATATCTGGAGCCTTGGTTGTACAGTTTTGGAAATGGCTACGGCACAGCCTCCATGGAGCCAGTATGAA
GGGGTTGCTGCAATGTTTAAAATAGGGAACAGTAAGGAGCTACCAGCAATCCCTGACCATCTTTCAGAGGAAGGCAAGAATTTTGTGAAATTATGTCTGCAGAGAAATCCTGTAAACCGTCCCACAGCTACACAACTTTTGGAACACCCATTTGTGAAACTGGATCAAAGTGCAGAAGGCATAGAGTTGTTGCCATCATC
TGCTAATGGGTCAAGGCCTCTGCATGCTACACAATGTGCTGTACATTCAAGAAATTTCTCATCGCTAGAGATGGACTATTCAGCACTACATTCAAAGGGTTGGTCACCGTATCAACCTTCAAGTGACCATTTTTATGTGAAAGGAAACATATCCTTGCCAGTCTCTCCATCTGCAAGCCCATTGATCCAGCCACGATCTC
CCCATCATAGATACGGTGGGATGTCTCCTTCGCCTATATCAACACCACTGGCAAGCTCAGGTTCTTCAACTCCTTTAACAGGAGGTTATGGTGCTATCCCATTCCAGGCTAATGGAGCTGCAAAATCAGCAGTGCATTTGCAGGAGAATTTTGGAAACATGCCAAGATTGGCAAATGGACTACATACTAATTGTTCTGGT
GGCTATCTTGATCCTAGGCCTGATGTTTATGGGGGTGCACAGATAGTTCGTACTCCAGAAGGTTCCCCAAGATTTCAAAATCATATAGTTGCAGAAAGTGATGTATTGGGTAAAAATATTGGTAGAGTGATGAGAAATGAGCATGGACAGAGTCAAAGGCAATATAGTGGTCAAGGGGCTTTAGCAGAACATGTGTCACA
GCAGCTTCTAAAGACTCCTAAGCCTGTTGGAATTGATTTCATATCTGGTCCTCCCAAGTTTTACTAAAGGTAGTTTTTCATCAACATTCGGTCGAGTGCATATAACTAACCATTATTGACAGCTGATGGATCTTTTTTGTTAAGTAAACATGGAACTGAAATTATTGAACAACGGGTCGGCCTGTCTCACCGGGTGTGCC
TGATCAGGCCCAACAAACTGTACTATATTAAACAATTGGGTGGCTGTAATGGAGAGATGTGATCAGTGCATTTCCTGATTAAAAGATAGGAACgtaagtaatttttttatacttctgctcatttcaggagttatgttgtttatgagaatagaagaaaaaaaattgctatatgtgactcttgtaaaaagcccttcaaactc
taaattcagtggctacctggtttgttgcagAAAGGAAGACTGTTGCCACATATTGCTGAGGTGGATATTGTATAACTCTGTGACCTTTTTGTCACAAATTATTTTGTAACAATTATATCAACTATACAAAGGTGGAGAAACTATTTTCTTCAATTCTATGTAGGGTGTTTTTGTCTAGAAAAATTGTTTTCGAGCTGACA
TTTCATTGGTTGGCTCTTTTCATCTGGCTTTTATCAAAGAAGCAGCTGAAATGCACAAATTGAAATGATGGATACCACATGTAACAGAAGAAAATTGAAAGTCTGAGGGCCTGTATTAATAATTTCCTGTGCAACAGGTTTTCAGTATCCTGATGTAATGCAACGTAGTTTATGCTTTACAAGCTTACGACATATGGGTT
GTTCTAGGTGTTTGGCATCTAGAGGAGTTGGATAGTTGAAAACCTGTGAATGTGATAGCTATGGTAAGCATATATTTGGGCTTATCCTTTCCATCTTACAGTATGCTAACAGTAGCTCTGCTAGTGCATCTTGTCTTTCAGTCTTATCTTTTCCCTGCTCCTTTTTTGTAAATTAGTACCCAAAACAGAGAGGTTCTAGT
TATGAAAGAATCCTCAATCAAATATGGATATACTATAGGGAAGTTCGCGACAATCTGCACAGAATTAGGGAGCCTGGAGTCATTTGTTTTCTTATCTTCCAAAATATTTTTTAAGAATGTGGGTTTGCATAACTCAATCAAATGATACAACATGATTATGCAGTTCATAGGCTGACGGTACACCACATGTATCTTATAGC
CAGGTTAATTCAATTATTCCACTTTGCTCTTTCATAGTATCATACAAGCAGTGGCCGATCTGTATATTAAAGACATGAACAGTGAACATTCAAGATAAACATGGACTGCATATGCAAGTTATTGTCTGAAATGAAAGAGGATTCAGAATGACCATATTTCTCAGTTCTGACCAATTTGATTATTGTAAATCATTCACAAA
AGTGTTATGGGCCTACATTCCTTTTGCAGAGCATTCTGGAATTTGAGATGTTAGAATATTGAAAGTTACTGAAATGCTAAAGTTAACG
Intron 2 GTGAGTTTTT ... GTGGATGTAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 22.89 | 128 | 9 | 38 |
| A2 | 24.41 | 96 | 7 | 31 |
| A3 | 21.79 | 122 | 6 | 34 |
| A4 | 23.31 | 102 | 3.5 | 31 |
| A5 | 2.82 | 69 | 3.5 | 2 |
| A6 | 15.38 | 22 | 1.5 | 4 |
| A7 | 10.26 | 105 | 5.5 | 12 |
| A8 | 23.2 | 26.5 | 0.5 | 8 |
| A9 | 12.94 | 74 | 2.5 | 11 |
| A10 | 9.33 | 136 | 8.5 | 14 |
>TRINITY_DN110065_c0_g1_i9 from sample A2 / Example spliced isoformATTTTGTGGGAGTTGGGCAGTGCACACGTAATAATCTCATAAGCTCTTCTCTCATCAACTGTACCGTTTGTTTGTTTGCGTACTAGGGTTCGAACTTGGAACCTGCCCGAGCACAAAATTGCGTAATTCGTGGGGGTATGATTGATTTGTATCCAAGGCATGCCGAGGTGCGGGGTTCAACTCTCGCTGACTGCATAGTC
ATCCAAATGCAGCTGCTGCTGGTGTTTTGCTAGACCTGCTGCGTGCGTGCTTGTGCGGGGTTCGAATCTCGGGGTCTTTGGAAATGCAGGTGTTAGCTTTGTAAGTAACAAGCGGACTGAGTGGTTTGCAGGGGGCAGGATGCTATCATGGTGGAAATCGCCGTCGTCATCGTCGGCGAAGAAGAAGAATGCCAATAACA
ACATTAATAGTAGTGAGAAGAAAAAGAAGAACAAGGACAACGGCATTCTGCATTCGTTGAGTTTCAGGAAATTGAAGGGGAATTTCGCCTCTCCAGCATGTCGAAGAGAGTCTACGACGTTGAATCATGTCGACGATTCGGATTTCGAAATCCCGTCTCCTTCGACTTCGAATTCGACGTCTGTGACAAGGTGCCAGAGC
TTCTCCCATGCGCTCCCCCTGCCGTTGCCATGCATGCCGCCGGCCTCGATATTGGGTCGGACTGAATCTGGAATCAGTTTGAATAGATCTGGGCACTTTTTGCCGCTGCCTTCTCCTCAAGCAGTGTTGAATAGGTCGGAGAATGCTGCGGATGGCTCGGCTTTGTCGGGGTCGGATTCTGCTACGAGTTCGATGGTGGG
CAGCGACGACCAGGCCGACCGAGATCCATCTGCCACTATTGGTTCCTGCATAACATTTGCAGGTTCAGCTCCTAAGAACAGCAAGAAAAATACAAAGCGTGAGATTCCAAAGCCCAATATCAGTTTGCTCAGTAAGCATAATAATTTACCGATTCCACCAAAGAGAGGGTTTTCGAGTAACCGAGAACCCCCAAAACCCC
TTCAGATTCCAGTGAATAGACAGCCGGTCGCTGCAACCGACAGTTCTACGTCTACGCCATCTAGTCCAATGAGGGGTTTCAGCTCGGAGCATTCCCCACGTGGTGGCTTGTGTATGGCGAAGCCGTATCTGGATGGCGCTATGTTTGGATCCGGCAATTGCTCGAGCCCAGGTTCGGGTTACAATTCGGGACAGAATTCT
ATAGGCGGAGATATGGTGGGACAACCCTTTTGGCACAACAGGGGTGGTTCTCCCGTGCCAAGTCCGAGAATGAGGAGTCCAGGTCCAAGTTCACGAGCACAGAGTGCTGCTGTTTCTCCTCTTCATCCTCGAGCCAGTGGATTAGGGACCGAATCTCCAACAGGCAGACAGGAAGAGGGAAAACAACAATGTCATCCATT
GCCGCTGCCGCCACGGTCCCCTTCTAGTTCTTCACCCTTCACCACATCTGCCACATCTTCAGGAGGTCCACGAAGTCCTGGTGGCAAAGACAACCCTGCAAGTCCTGGGCAGCGATGGAAGAAGGGGAAATTGTTGGGAAGAGGGACCTTTGGCCATGTCTATGTCGGTTTCAACAATGAAAGTGGAGAAATGTGTGCAA
TGAAGGAAGTTACTCTTTTCTCTGATGATCCGAAGTCCAAGGAGAGTGTAAAGCAGCTAGCACAGGAGATATCTATGCTGAGTCACTTACGGCATCCAAACATAGTGCAATATTATGGAAGTGAAACGGTATGTGGACATTTTGGCTATTCCTTGTCAAGCACTTATTTTATAATTTTTCAGCATCTTTTACCTGTGTAC
CGCAAGCTTTAAACCTGCAGGGTTCATGTAATATGATCTTTCCCAGGCCAAATTGGTTTTTGCTAGGCTTTTGGTGAATGGACTATATAATTTCTTTCATTTGTGGGTTCCATTCTGACTACACATTAAACTCGCAAGAGTGCTACTGGGGTAAAATGTTATATTAGATGAAATACTCACTTGTACGGAGAAGAGACGGA
ACCCTGCTATTGTCATGAACCTACAATACCCCAATGCCAAATGATGCTGTCTTGACATTTACTAACCCTTGTTTTTTCTTCACAATTTCAATGAATAATGATGCAACATTTTCTACTCGCAGTTGGTTGTTTTCAAAACAAATAAAATAACATGATAGGAGACAATAATAAGAAAAGGAAGCAACTACAGTAGTAAGTAG
CTGCAGCAGAAAATGGTAACATGTTTATTTTCAGGTTAGTCAACAATAATTTCTTATCAGAAATAACACCTGTGAGTCATTACACGATTACAAGTCATTGCTTGTTGCATTCTAGAAGTATTGCATACATGAAGAAACCAGTGCGCTAGAGTGTATGCAAAAACATATTCATAGTACTGGTGGTGTATAAACTCATCAAA
CTGAATTAATCCTTGGGATGTGAATTTAATCATGTACTTATTCTTTAATATTTCTCTGACACTGAATCATTGCCATTTTCTAGGGATGACATGCTATATATTTACCTGGAGTATGTGTCTGGAGGTTCCATTCACAAACTGCTTCAAGAATATGGCCAGTTTGGAGAGCCAGTTGTTCGCAGCTATACACATCAGATACT
TTGTGGGCTGGCATATCTGCATAACAGAAATACTGTTCACAGTACAATTGCAAAGTGAAGAGCATTTTGGATGCTTTTCAAGAAGCTTGCTTGTGTATGATACATATTATGATCCGGTTTTCTTGGTTTCAAGCTAAGTCCTAATTCTTGTATTATCTGGACGTCAAAGGCGCAAATATTCTTGTTGATCCCAATGGCCA
TGTGAAGCTTGCAGACTTTGGCATGGCAAAACATATCACAGCACATTCCTGTCTTTTGTCATTTAAAGGAAGTCCATACTGGATGGCCCCTGAGGTAATTAAAAATGTAAATGGCTATGACTTGGCAGTGGATATCTGGAGCCTTGGTTGTACAGTTTTGGAAATGGCTACGGCACAGCCTCCATGGAGCCAGTATGAAG
GGGTTGCTGCAATGTTTAAAATAGGGAACAGTAAGGAGCTACCAGCAATCCCTGACCATCTTTCAGAGGAAGGCAAGAATTTTGTGAAATTATGTCTGCAGAGAAATCCTGTAAACCGTCCCACAGCTACACAACTTTTGGAACACCCATTTGTGAAACTGGATCAAAGTGCAGAAGGCATAGAGTTGTTGCCATCATCT
GCTAATGGGTCAAGGCCTCTGCATGCTACACAATGTGCTGTACATTCAAGAAATTTCTCATCGCTAGAGATGGACTATTCAGCACTACATTCAAAGGGTTGGTCACCGTATCAACCTTCAAGTGACCATTTTTATGTGAAAGGAAACATATCCTTGCCAGTCTCTCCATCTGCAAGCCCATTGATCCAGCCACGATCTCC
CCATCATAGATACGGTGGGATGTCTCCTTCGCCTATATCAACACCACTGGCAAGCTCAGGTTCTTCAACTCCTTTAACAGGAGGTTATGGTGCTATCCCATTCCAGGCTAATGGAGCTGCAAAATCAGCAGTGCATTTGCAGGAGAATTTTGGAAACATGCCAAGATTGGCAAATGGACTACATACTAATTGTTCTGGTG
GCTATCTTGATCCTAGGCCTGATGTTTATGGGGGTGCACAGATAGTTCGTACTCCAGAAGGTTCCCCAAGATTTCAAAATCATATAGTTGCAGAAAGTGATGTATTGGGTAAAAATATTGGTAGAGTGATGAGAAATGAGCATGGACAGAGTCAAAGGCAATATAGTGGTCAAGGGGCTTTAGCAGAACATGTGTCACAG
CAGCTTCTAAAGACTCCTAAGCCTGTTGGAATTGATTTCATATCTGGTCCTCCCAAGTTTTACTAAAGGTAGTTTTTCATCAACATTCGGTCGAGTGCATATAACTAACCATTATTGACAGCTGATGGATCTTTTTTGTTAAGTAAACATGGAACTGAAATTATTGAACAACGGGTCGGCCTGTCTCACCGGGTGTGCCT
GATCAGGCCCAACAAACTGTACTATATTAAACAATTGGGTGGCTGTAATGGAGAGATGTGATCAGTGCATTTCCTGATTAAAAGATAGGAACAAAGGAAGACTGTTGCCACATATTGCTGAGGTGGATATTGTATAACTCTGTGACCTTTTTGTCACAAATTATTTTGTAACAATTATATCAACTATACAAAGGTGGAGA
AACTATTTTCTTCAATTCTATGTAGGGTGTTTTTGTCTAGAAAAATTGTTTTCGAGCTGACATTTCATTGGTTGGCTCTTTTCATCTGGCTTTTATCAAAGAAGCAGCTGAAATGCACAAATTGAAATGATGGATACCACATGTAACAGAAGAAAATTGAAAGTCTGAGGGCCTGTATTAATAATTTCCTGTGCAACAGG
TTTTCAGTATCCTGATGTAATGCAACGTAGTTTATGCTTTACAAGCTTACGACATATGGGTTGTTCTAGGTGTTTGGCATCTAGAGGAGTTGGATAGTTGAAAACCTGTGTATGTGATAGCTATGGTAAGCATATATTTGGGCTTATCCTTTCCATCTTACAGTATGCTAACAGTAGCTCTGCTAGTGCATCTTGTCTTT
CAGTCTTATCTTTTCCCTGCTCCTTTTTTGTAAATTAGTACCCAAAACAGAGAGGTTCTAGTTATGAAAGAATCCTCAATCAAATATGGATATACTATAGGGAAGTTCGCGACAATCTGCACAGAATTAGGGAGCCTGGAGTCATTTGTTTTCTTATCTTCCAAAATATTTTTTAAGAATGTGGGTTTGCATAACTCAAT
CAAATGATACAACATGATTATGCAGTTCATAGGCTGACGGTACACCACATGTATCTTATAGCCAGGTTAATTCAATTATTCCACTTTGCTCTTTCATAGTATCATACAAGCAGTGGCCGATCTGTATATTAAAGACATGAACAGTGAACATTCAAGATAAACATGGACTGCATATGCAAGC
>TRINITY_DN110065_c0_g1_i13 from sample A2 / Example unspliced isoform:ATTTTGTGGGAGTTGGGCAGTGCACACGTAATAATCTCATAAGCTCTTCTCTCATCAACTGTACCGTTTGTTTGTTTGCGTACTAGGGTTCGAACTTGGAACCTGCCCGAGCACAAAATTGCGTAATTCGTGGGGGTATGATTGATTTGTATCCAAGGCATGCCGAGGTGCGGGGTTCAACTCTCGCTGACTGCATAGTC
ATCCAAATGCAGCTGCTGCTGGTGTTTTGCTAGACCTGCTGCGTGCGTGCTTGTGCGGGGTTCGAATCTCGGGGTCTTTGGAAATGCAGGTGTTAGCTTTGTAAGTAACAAGCGGACTGAGTGGTTTGCAGGGGGCAGGATGCTATCATGGTGGAAATCGCCGTCGTCATCGTCGGCGAAGAAGAAGAATGCCAATAACA
ACATTAATAGTAGTGAGAAGAAAAAGAAGAACAAGGACAACGGCATTCTGCATTCGTTGAGTTTCAGGAAATTGAAGGGGAATTTCGCCTCTCCAGCATGTCGAAGAGAGTCTACGACGTTGAATCATGTCGACGATTCGGATTTCGAAATCCCGTCTCCTTCGACTTCGAATTCGACGTCTGTGACAAGGTGCCAGAGC
TTCTCCCATGCGCTCCCCCTGCCGTTGCCATGCATGCCGCCGGCCTCGATATTGGGTCGGACTGAATCTGGAATCAGTTTGAATAGATCTGGGCACTTTTTGCCGCTGCCTTCTCCTCAAGCAGTGTTGAATAGGTCGGAGAATGCTGCGGATGGCTCGGCTTTGTCGGGGTCGGATTCTGCTACGAGTTCGATGGTGGG
CAGCGACGACCAGGCCGACCGAGATCCATCTGCCACTATTGGTTCCTGgtgagtttttccatcattctcttttttctttcaaaagcaaacaatgtagcgtcaaatgcgatctgcgttgactaactaattatatgaaggagcttgtctaggttttttagggcttataaatggaaaattctgtctatggcaagggttttttg
ggcttatcaattggtaattctgggtatgcatttgtctgacttatcaattgacaattttgggtatggctagggttttttggcttatcagttgacaattttggatatggcgaaggaaatttggcttataaattgaaaattatgggtatgcctagggtttttatcttagcaattgacaattctgcgtatgtggatgtagCATA
ACATTTGCAGGTTCAGCTCCTAAGAACAGCAAGAAAAATACAAAGCGTGAGATTCCAAAGCCCAATATCAGTTTGCTCAGTAAGCATAATAATTTACCGATTCCACCAAAGAGAGGGTTTTCGAGTAACCGAGAACCCCCAAAACCCCTTCAGATTCCAGTGAATAGACAGCCGGTCGCTGCAACCGACAGTTCTACGTC
TACGCCATCTAGTCCAATGAGGGGTTTCAGCTCGGAGCATTCCCCACGTGGTGGCTTGTGTATGGCGAAGCCGTATCTGGATGGCGCTATGTTTGGATCCGGCAATTGCTCGAGCCCAGGTTCGGGTTACAATTCGGGACAGAATTCTATAGGCGGAGATATGGTGGGACAACCCTTTTGGCACAACAGGGGTGGTTCTC
CCGTGCCAAGTCCGAGAATGAGGAGTCCAGGTCCAAGTTCACGAGCACAGAGTGCTGCTGTTTCTCCTCTTCATCCTCGAGCCAGTGGATTAGGGACCGAATCTCCAACAGGCAGACAGGAAGAGGGAAAACAACAATGTCATCCATTGCCGCTGCCGCCACGGTCCCCTTCTAGTTCTTCACCCTTCACCACATCTGCC
ACATCTTCAGGAGGTCCACGAAGTCCTGGTGGCAAAGACAACCCTGCAAGTCCTGGGCAGCGATGGAAGAAGGGGAAATTGTTGGGAAGAGGGACCTTTGGCCATGTCTATGTCGGTTTCAACAATGAAAGTGGAGAAATGTGTGCAATGAAGGAAGTTACTCTTTTCTCTGATGATCCGAAGTCCAAGGAGAGTGTAAA
GCAGCTAGCACAGGAGATATCTATGCTGAGTCACTTACGGCATCCAAACATAGTGCAATATTATGGAAGTGAAACGGTATGTGGACATTTTGGCTATTCCTTGTCAAGCACTTATTTTATAATTTTTCAGCATCTTTTACCTGTGTACCGCAAGCTTTAAACCTGCAGGGTTCATGTAATATGATCTTTCCCAGGCCAAA
TTGGTTTTTGCTAGGCTTTTGGTGAATGGACTATATAATTTCTTTCATTTGTGGGTTCCATTCTGACTACACATTAAACTCGCAAGAGTGCTACTGGGGTAAAATGTTATATTAGATGAAATACTCACTTGTACGGAGAAGAGACGGAACCCTGCTATTGTCATGAACCTACAATACCCCAATGCCAAATGATGCTGTCT
TGACATTTACTAACCCTTGTTTTTTCTTCACAATTTCAATGAATAATGATGCAACATTTTCTACTCGCAGTTGGTTGTTTTCAAAACAAATAAAATAACATGATAGGAGACAATAATAAGAAAAGGAAGCAACTACAGTAGTAAGTAGCTGCAGCAGAAAATGGTAACATGTTTATTTTCAGGTTAGTCAACAATAATTT
CTTATCAGAAATAACACCTGTGAGTCATTACACGATTACAAGTCATTGCTTGTTGCATTCTAGAAGTATTGCATACATGAAGAAACCAGTGCGCTAGAGTGTATGCAAAAACATATTCATAGTACTGGTGGTGTATAAACTCATCAAACTGAATTAATCCTTGGGATGTGAATTTAATCATGTACTTATTCTTTAATATT
TCTCTGACACTGAATCATTGCCATTTTCTAGGGATGACATGCTATATATTTACCTGGAGTATGTGTCTGGAGGTTCCATTCACAAACTGCTTCAAGAATATGGCCAGTTTGGAGAGCCAGTTGTTCGCAGCTATACACATCAGATACTTTGTGGGCTGGCATATCTGCATAACAGAAATACTGTTCACAGTACAATTGCA
AAGTGAAGAGCATTTTGGATGCTTTTCAAGAAGCTTGCTTGTGTATGATACATATTATGATCCGGTTTTCTTGGTTTCAAGCTAAGTCCTAATTCTTGTATTATCTGGACGTCAAAGGCGCAAATATTCTTGTTGATCCCAATGGCCATGTGAAGCTTGCAGACTTTGGCATGGCAAAACATATCACAGCACATTCCTGT
CTTTTGTCATTTAAAGGAAGTCCATACTGGATGGCCCCTGAGGTAATTAAAAATGTAAATGGCTATGACTTGGCAGTGGATATCTGGAGCCTTGGTTGTACAGTTTTGGAAATGGCTACGGCACAGCCTCCATGGAGCCAGTATGAAGGGGTTGCTGCAATGTTTAAAATAGGGAACAGTAAGGAGCTACCAGCAATCCC
TGACCATCTTTCAGAGGAAGGCAAGAATTTTGTGAAATTATGTCTGCAGAGAAATCCTGTAAACCGTCCCACAGCTACACAACTTTTGGAACACCCATTTGTGAAACTGGATCAAAGTGCAGAAGGCATAGAGTTGTTGCCATCATCTGCTAATGGGTCAAGGCCTCTGCATGCTACACAATGTGCTGTACATTCAAGAA
ATTTCTCATCGCTAGAGATGGACTATTCAGCACTACATTCAAAGGGTTGGTCACCGTATCAACCTTCAAGTGACCATTTTTATGTGAAAGGAAACATATCCTTGCCAGTCTCTCCATCTGCAAGCCCATTGATCCAGCCACGATCTCCCCATCATAGATACGGTGGGATGTCTCCTTCGCCTATATCAACACCACTGGCA
AGCTCAGGTTCTTCAACTCCTTTAACAGGAGGTTATGGTGCTATCCCATTCCAGGCTAATGGAGCTGCAAAATCAGCAGTGCATTTGCAGGAGAATTTTGGAAACATGCCAAGATTGGCAAATGGACTACATACTAATTGTTCTGGTGGCTATCTTGATCCTAGGCCTGATGTTTATGGGGGTGCACAGATAGTTCGTAC
TCCAGAAGGTTCCCCAAGATTTCAAAATCATATAGTTGCAGAAAGTGATGTATTGGGTAAAAATATTGGTAGAGTGATGAGAAATGAGCATGGACAGAGTCAAAGGCAATATAGTGGTCAAGGGGCTTTAGCAGAACATGTGTCACAGCAGCTTCTAAAGACTCCTAAGCCTGTTGGAATTGATTTCATATCTGGTCCTC
CCAAGTTTTACTAAAGGTAGTTTTTCATCAACATTCGGTCGAGTGCATATAACTAACCATTATTGACAGCTGATGGATCTTTTTTGTTAAGTAAACATGGAACTGAAATTATTGAACAACGGGTCGGCCTGTCTCACCGGGTGTGCCTGATCAGGCCCAACAAACTGTACTATATTAAACAATTGGGTGGCTGTAATGGA
GAGATGTGATCAGTGCATTTCCTGATTAAAAGATAGGAACAAAGGAAGACTGTTGCCACATATTGCTGAGGTGGATATTGTATAACTCTGTGACCTTTTTGTCACAAATTATTTTGTAACAATTATATCAACTATACAAAGGTGGAGAAACTATTTTCTTCAATTCTATGTAGGGTGTTTTTGTCTAGAAAAATTGTTTT
CGAGCTGACATTTCATTGGTTGGCTCTTTTCATCTGGCTTTTATCAAAGAAGCAGCTGAAATGCACAAATTGAAATGATGGATACCACATGTAACAGAAGAAAATTGAAAGTCTGAGGGCCTGTATTAATAATTTCCTGTGCAACAGGTTTTCAGTATCCTGATGTAATGCAACGTAGTTTATGCTTTACAAGCTTACGA
CATATGGGTTGTTCTAGGTGTTTGGCATCTAGAGGAGTTGGATAGTTGAAAACCTGTGTATGTGATAGCTATGGTAAGCATATATTTGGGCTTATCCTTTCCATCTTACAGTATGCTAACAGTAGCTCTGCTAGTGCATCTTGTCTTTCAGTCTTATCTTTTCCCTGCTCCTTTTTTGTAAATTAGTACCCAAAACAGAG
AGGTTCTAGTTATGAAAGAATCCTCAATCAAATATGGATATACTATAGGGAAGTTCGCGACAATCTGCACAGAATTAGGGAGCCTGGAGTCATTTGTTTTCTTATCTTCCAAAATATTTTTTAAGAATGTGGGTTTGCATAACTCAATCAAATGATACAACATGATTATGCAGTTCATAGGCTGACGGTACACCACATGT
ATCTTATAGCCAGGTTAATTCAATTATTCCACTTTGCTCTTTCATAGTATCATACAAGCAGTGGCCGATCTGTATATTAAAGACATGAACAGTGAACATTCAAGATAAACATGGACTGCATATGCAAGC
Intron 3 GTATGTGGAC ... CTGTTCACAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 33.91 | 51 | 49.2 | 26.2 |
| A2 | 32.47 | 52 | 49.3 | 25 |
| A3 | 32.81 | 43 | 39.8 | 21 |
| A4 | 29.51 | 43 | 42.7 | 18 |
| A5 | 33.33 | 24 | 32.8 | 12 |
| A6 | 30 | 42 | 39.7 | 18 |
| A7 | 26.42 | 78 | 69.3 | 28 |
| A8 | 20.29 | 55 | 48.8 | 14 |
| A9 | 35.79 | 61 | 53.3 | 34 |
| A10 | 30.21 | 67 | 60.8 | 29 |
>TRINITY_DN110065_c0_g1_i7 from sample A2 / Example spliced isoformATTTTGTGGGAGTTGGGCAGTGCACACGTAATAATCTCATAAGCTCTTCTCTCATCAACTGTACCGTTTGTTTGTTTGCGTACTAGGGTTCGAACTTGGAACCTGCCCGAGCACAAAATTGCGTAATTCGTGGGGGTATGATTGATTTGTATCCAAGGCATGCCGAGGTGCGGGGTTCAACTCTCGCTGACTGCATAGTC
ATCCAAATGCAGCTGCTGCTGGTGTTTTGCTAGACCTGCTGCGTGCGTGCTTGTGCGGGGTTCGAATCTCGGGGTCTTTGGAAATGCAGGTGTTAGCTTTGTAAGTAACAAGCGGACTGAGTGGTTTGCAGGGGGCAGGATGCTATCATGGTGGAAATCGCCGTCGTCATCGTCGGCGAAGAAGAAGAATGCCAATAACA
ACATTAATAGTAGTGAGAAGAAAAAGAAGAACAAGGACAACGGCATTCTGCATTCGTTGAGTTTCAGGAAATTGAAGGGGAATTTCGCCTCTCCAGCATGTCGAAGAGAGTCTACGACGTTGAATCATGTCGACGATTCGGATTTCGAAATCCCGTCTCCTTCGACTTCGAATTCGACGTCTGTGACAAGGTGCCAGAGC
TTCTCCCATGCGCTCCCCCTGCCGTTGCCATGCATGCCGCCGGCCTCGATATTGGGTCGGACTGAATCTGGAATCAGTTTGAATAGATCTGGGCACTTTTTGCCGCTGCCTTCTCCTCAAGCAGTGTTGAATAGGTCGGAGAATGCTGCGGATGGCTCGGCTTTGTCGGGGTCGGATTCTGCTACGAGTTCGATGGTGGG
CAGCGACGACCAGGCCGACCGAGATCCATCTGCCACTATTGGTTCCTGCATAACATTTGCAGGTTCAGCTCCTAAGAACAGCAAGAAAAATACAAAGCGTGAGATTCCAAAGCCCAATATCAGTTTGCTCAGTAAGCATAATAATTTACCGATTCCACCAAAGAGAGGGTTTTCGAGTAACCGAGAACCCCCAAAACCCC
TTCAGATTCCAGTGAATAGACAGCCGGTCGCTGCAACCGACAGTTCTACGTCTACGCCATCTAGTCCAATGAGGGGTTTCAGCTCGGAGCATTCCCCACGTGGTGGCTTGTGTATGGCGAAGCCGTATCTGGATGGCGCTATGTTTGGATCCGGCAATTGCTCGAGCCCAGGTTCGGGTTACAATTCGGGACAGAATTCT
ATAGGCGGAGATATGGTGGGACAACCCTTTTGGCACAACAGGGGTGGTTCTCCCGTGCCAAGTCCGAGAATGAGGAGTCCAGGTCCAAGTTCACGAGCACAGAGTGCTGCTGTTTCTCCTCTTCATCCTCGAGCCAGTGGATTAGGGACCGAATCTCCAACAGGCAGACAGGAAGAGGGAAAACAACAATGTCATCCATT
GCCGCTGCCGCCACGGTCCCCTTCTAGTTCTTCACCCTTCACCACATCTGCCACATCTTCAGGAGGTCCACGAAGTCCTGGTGGCAAAGACAACCCTGCAAGTCCTGGGCAGCGATGGAAGAAGGGGAAATTGTTGGGAAGAGGGACCTTTGGCCATGTCTATGTCGGTTTCAACAATGAAAGTGGAGAAATGTGTGCAA
TGAAGGAAGTTACTCTTTTCTCTGATGATCCGAAGTCCAAGGAGAGTGTAAAGCAGCTAGCACAGGAGATATCTATGCTGAGTCACTTACGGCATCCAAACATAGTGCAATATTATGGAAGTGAAACGTACAATTGCAAAGTGAAGAGCATTTTGGATGCTTTTCAAGAAGCTTGCTTGTGTATGATACATATTATGATC
CGGTTTTCTTGGTTTCAAGCTAAGTCCTAATTCTTGTATTATCT
>TRINITY_DN110065_c0_g1_i12 from sample A2 / Example unspliced isoform:ATTTTGTGGGAGTTGGGCAGTGCACACGTAATAATCTCATAAGCTCTTCTCTCATCAACTGTACCGTTTGTTTGTTTGCGTACTAGGGTTCGAACTTGGAACCTGCCCGAGCACAAAATTGCGTAATTCGTGGGGGTATGATTGATTTGTATCCAAGGCATGCCGAGGTGCGGGGTTCAACTCTCGCTGACTGCATAGTC
ATCCAAATGCAGCTGCTGCTGGTGTTTTGCTAGACCTGCTGCGTGCGTGCTTGTGCGGGGTTCGAATCTCGGGGTCTTTGGAAATGCAGGTGTTAGCTTTGTAAGTAACAAGCGGACTGAGTGGTTTGCAGGGGGCAGGATGCTATCATGGTGGAAATCGCCGTCGTCATCGTCGGCGAAGAAGAAGAATGCCAATAACA
ACATTAATAGTAGTGAGAAGAAAAAGAAGAACAAGGACAACGGCATTCTGCATTCGTTGAGTTTCAGGAAATTGAAGGGGAATTTCGCCTCTCCAGCATGTCGAAGAGAGTCTACGACGTTGAATCATGTCGACGATTCGGATTTCGAAATCCCGTCTCCTTCGACTTCGAATTCGACGTCTGTGACAAGGTGCCAGAGC
TTCTCCCATGCGCTCCCCCTGCCGTTGCCATGCATGCCGCCGGCCTCGATATTGGGTCGGACTGAATCTGGAATCAGTTTGAATAGATCTGGGCACTTTTTGCCGCTGCCTTCTCCTCAAGCAGTGTTGAATAGGTCGGAGAATGCTGCGGATGGCTCGGCTTTGTCGGGGTCGGATTCTGCTACGAGTTCGATGGTGGG
CAGCGACGACCAGGCCGACCGAGATCCATCTGCCACTATTGGTTCCTGCATAACATTTGCAGGTTCAGCTCCTAAGAACAGCAAGAAAAATACAAAGCGTGAGATTCCAAAGCCCAATATCAGTTTGCTCAGTAAGCATAATAATTTACCGATTCCACCAAAGAGAGGGTTTTCGAGTAACCGAGAACCCCCAAAACCCC
TTCAGATTCCAGTGAATAGACAGCCGGTCGCTGCAACCGACAGTTCTACGTCTACGCCATCTAGTCCAATGAGGGGTTTCAGCTCGGAGCATTCCCCACGTGGTGGCTTGTGTATGGCGAAGCCGTATCTGGATGGCGCTATGTTTGGATCCGGCAATTGCTCGAGCCCAGGTTCGGGTTACAATTCGGGACAGAATTCT
ATAGGCGGAGATATGGTGGGACAACCCTTTTGGCACAACAGGGGTGGTTCTCCCGTGCCAAGTCCGAGAATGAGGAGTCCAGGTCCAAGTTCACGAGCACAGAGTGCTGCTGTTTCTCCTCTTCATCCTCGAGCCAGTGGATTAGGGACCGAATCTCCAACAGGCAGACAGGAAGAGGGAAAACAACAATGTCATCCATT
GCCGCTGCCGCCACGGTCCCCTTCTAGTTCTTCACCCTTCACCACATCTGCCACATCTTCAGGAGGTCCACGAAGTCCTGGTGGCAAAGACAACCCTGCAAGTCCTGGGCAGCGATGGAAGAAGGGGAAATTGTTGGGAAGAGGGACCTTTGGCCATGTCTATGTCGGTTTCAACAATGAAAGTGGAGAAATGTGTGCAA
TGAAGGAAGTTACTCTTTTCTCTGATGATCCGAAGTCCAAGGAGAGTGTAAAGCAGCTAGCACAGGAGATATCTATGCTGAGTCACTTACGGCATCCAAACATAGTGCAATATTATGGAAGTGAAACGgtatgtggacattttggctattccttgtcaagcacttattttataatttttcagcatcttttacctgtgtac
cgcaagctttaaacctgcagggttcatgtaatatgatctttcccaggccaaattggtttttgctaggcttttggtgaatggactatataatttctttcatttgtgggttccattctgactacacattaaactcgcaagagtgctactggggtaaaatgttatattagatgaaatactcacttgtacggagaagagacgga
accctgctattgtcatgaacctacaataccccaatgccaaatgatgctgtcttgacatttactaacccttgttttttcttcacaatttcaatgaataatgatgcaacattttctactcgcagttggttgttttcaaaacaaataaaataacatgataggagacaataataagaaaaggaagcaactacagtagtaagtag
ctgcagcagaaaatggtaacatgtttattttcaggttagtcaacaataatttcttatcagaaataacacctgtgagtcattacacgattacaagtcattgcttgttgcattctagaagtattgcatacatgaagaaaccagtgcgctagagtgtatgcaaaaacatattcatagtactggtggtgtataaactcatcaaa
ctgaattaatccttgggatgtgaatttaatcatgtacttattctttaatatttctctgacactgaatcattgccattttctagggatgacatgctatatatttacctggagtatgtgtctggaggttccattcacaaactgcttcaagaatatggccagtttggagagccagttgttcgcagctatacacatcagatact
ttgtgggctggcatatctgcataacagaaatactgttcacagTACAATTGCAAAGTGAAGAGCATTTTGGATGCTTTTCAAGAAGCTTGCTTGTGTATGATACATATTATGATCCGGTTTTCTTGGTTTCAAGCTAAGTCCTAATTCTTGTATTATCTATCACAGCACATTCCTGTCTTTTGTCATTTAAAGGAAGTCCA
TACTGGATGGCCCCTGAGGTAATTAAAAATGTAAATGGCTATGACTTGGCAGTGGATATCTGGAGCCTTGGTTGTACAGTTTTGGAAATGGCTACGGCACAGCCTCCATGGAGCCAGTATGAAGGGGTTGCTGCAATGTTTAAAATAGGGAACAGTAAGGAGCTACCAGCAATCCCTGACCATCTTTCAGAGGAAGGCAA
GAATTTTGTGAAATTATGTCTGCAGAGAAATCCTGTAAACCGTCCCACAGCTACACAACTTTTGGAACACCCATTTGTGAAACTGGATCAAAGTGCAGAAGGCATAGAGTTGTTGCCATCATCTGCTAATGGGTCAAGGCCTCTGCATGCTACACAATGTGCTGTACATTCAAGAAATTTCTCATCGCTAGAGATGGACT
ATTCAGCACTACATTCAAAGGGTTGGTCACCGTATCAACCTTCAAGTGACCATTTTTATGTGAAAGGAAACATATCCTTGCCAGTCTCTCCATCTGCAAGCCCATTGATCCAGCCACGATCTCCCCATCATAGATACGGTGGGATGTCTCCTTCGCCTATATCAACACCACTGGCAAGCTCAGGTTCTTCAACTCCTTTA
ACAGGAGGTTATGGTGCTATCCCATTCCAGGCTAATGGAGCTGCAAAATCAGCAGTGCATTTGCAGGAGAATTTTGGAAACATGCCAAGATTGGCAAATGGACTACATACTAATTGTTCTGGTGGCTATCTTGATCCTAGGCCTGATGTTTATGGGGGTGCACAGATAGTTCGTACTCCAGAAGGTTCCCCAAGATTTCA
AAATCATATAGTTGCAGAAAGTGATGTATTGGGTAAAAATATTGGTAGAGTGATGAGAAATGAGCATGGACAGAGTCAAAGGCAATATAGTGGTCAAGGGGCTTTAGCAGAACATGTGTCACAGCAGCTTCTAAAGACTCCTAAGCCTGTTGGAATTGATTTCATATCTGGTCCTCCCAAGTTTTACTAAAGGTAGTTTT
TCATCAACATTCGGTCGAGTGCATATAACTAACCATTATTGACAGCTGATGGATCTTTTTTGTTAAGTAAACATGGAACTGAAATTATTGAACAACGGGTCGGCCTGTCTCACCGGGTGTGCCTGATCAGGCCCAACAAACTGTACTATATTAAACAATTGGGTGGCTGTAATGGAGAGATGTGATCAGTGCATTTCCTG
ATTAAAAGATAGGAACAAAGGAAGACTGTTGCCACATATTGCTGAGGTGGATATTGTATAACTCTGTGACCTTTTTGTCACAAATTATTTTGTAACAATTATATCAACTATACAAAGGTGGAGAAACTATTTTCTTCAATTCTATGTAGGGTGTTTTTGTCTAGAAAAATTGTTTTCGAGCTGACATTTCATTGGTTGGC
TCTTTTCATCTGGCTTTTATCAAAGAAGCAGCTGAAATGCACAAATTGAAATGATGGATACCACATGTAACAGAAGAAAATTGAAAGTCTGAGGGCCTGTATTAATAATTTCCTGTGCAACAGGTTTTCAGTATCCTGATGTAATGCAACGTAGTTTATGCTTTACAAGCTTACGACATATGGGTTGTTCTAGGTGTTTG
GCATCTAGAGGAGTTGGATAGTTGAAAACCTGTGTATGTGATAGCTATGGTAAGCATATATTTGGGCTTATCCTTTCCATCTTACAGTATGCTAACAGTAGCTCTGCTAGTGCATCTTGTCTTTCAGTCTTATCTTTTCCCTGCTCCTTTTTTGTAAATTAGTACCCAAAACAGAGAGGTTCTAGTTATGAAAGAATCCT
CAATCAAATATGGATATACTATAGGGAAGTTCGCGACAATCTGCACAGAATTAGGGAGCCTGGAGTCATTTGTTTTCTTATCTTCCAAAATATTTTTTAAGAATGTGGGTTTGCATAACTCAATCAAATGATACAACATGATTATGCAGTTCATAGGCTGACGGTACACCACATGTATCTTATAGCCAGGTTAATTCAAT
TATTCCACTTTGCTCTTTCATAGTATCATACAAGCAGTGGCCGATCTGTATATTAAAGACATGAACAGTGAACATTCAAGATAAACATGGACTGCATATGCAAGC
Intron 4 GTAAGTGTCT ... TATCTTGTAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 22.37 | 151 | 42 | 45 |
| A2 | 11.02 | 105 | 15 | 11 |
| A3 | 17.54 | 134 | 27 | 30 |
| A4 | 24.6 | 95 | 21 | 41 |
| A5 | 17.39 | 57 | 17 | 7 |
| A6 | 10 | 63 | 9 | 5 |
| A7 | 17.96 | 137 | 30 | 30 |
| A8 | 14.62 | 73 | 6 | 19 |
| A9 | 12.29 | 132 | 21 | 16 |
| A10 | 14.87 | 146 | 29 | 22 |
>TRINITY_DN118710_c1_g1_i10 from sample A1 / Example spliced isoformCATATTTTGTGGGAGTTGGGCAGTGCACACGTAATAATCTCATAAGCTCTTCTCTCATCAACTGTACCGTTTGTTTGTTTGCGTACTAGGGTTCGAACTTGGAACCTGCCCGAGCACAAAATTGCGTAATTCGTGGGGGTATGATTGATTTGTATCCAAGGCATGCCGAGGTGCGGGGTTCAACTCTCGCTGACTGCATA
GTCATCCAAATGCAGCTGCTGCTGGTGTTTTGCTAGACCTGCTGCGTGCGTGCTTGTGCGGGGTTCGAATCTCGGGGTCTTTGGAAATGCAGGTGTTAGCTTTGTAAGTAACAAGCGGACTGAGTGGTTTGCAGGGGGCAGGATGCTATCATGGTGGAAATCGCCGTCGTCATCGTCGGCGAAGAAGAAGAATGCCAATA
ACAACATTAATAGTAGTGAGAAGAAAAAGAAGAACAAGGACAACGGCATTCTGCATTCGTTGAGTTTCAGGAAATTGAAGGGGAATTTCGCCTCTCCAGCATGTCGAAGAGAGTCTACGACGTTGAATCATGTCGACGATTCGGATTTCGAAATCCCGTCTCCTTCGACTTCGAATTCGACGTCTGTGACAAGGTGCCAG
AGCTTCTCCCATGCGCTCCCCCTGCCGTTGCCATGCATGCCGCCGGCCTCGATATTGGGTCGGACTGAATCTGGAATCAGTTTGAATAGATCTGGGCACTTTTTGCCGCTGCCTTCTCCTCAAGCAGTGTTGAATAGGTCGGAGAATGCTGCGGATGGCTCGGCTTTGTCGGGGTCGGATTCTGCTACGAGTTCGATGGT
GGGCAGCGACGACCAGGCCGACAGAGATCCATCTGCCACTATTGGTTCCTGCATAACATTTGCAGGTTCAGCTCCTAAGAACAGCAAGAAAAATACAAAGCGTGAGATTCCAAAGCCCAATATCAGTTTGCTCAGTAAGCATAATAATTTACCGATTCCACCAAAGAGAGGGTTTTCGAGTAACCGAGAACCCCCAAAAC
CCCTTCAGATTCCAGTGAATAGACAGCCGGTCGCTGCAACCGACAGTTCTACGTCTACGCCATCTAGTCCAATGAGGGGTTTCAGCTCGGAGCATTCCCCACGTGGTGGCTTGTGTATGGCGAAGCCGTATCTGGATGGCGCTATGTTTGGATCCGGCAATTGCTCGAGCCCAGGTTCGGGTTACAATTCGGGACAGAAT
TCTATAGGCGGAGATATGGTGGGACAACCCTTTTGGCACAACAGGGGTGGTTCTCCCGTGCCAAGTCCGAGAATGAGGAGTCCAGGTCCAAGTTCACGAGCACAGAGTGCTGCTGTTTCTCCTCTTCATCCTCGAGCCAGTGGATTAGGGACCGAATCTCCAACAGGCAGACAGGAAGAGGGAAAACAACAATGTCATCC
ATTGCCGCTGCCGCCACGGTCCCCTTCTAGTTCTTCACCCTTCACCACATCTGCCACATCTTCAGGAGGTCCACGAAGTCCTGGTGGCAAAGACAACCCTGCAAGTCCTGGGCAGCGATGGAAGAAGGGGAAATTGTTGGGAAGAGGGACCTTTGGCCATGTCTATGTCGGTTTCAACAATGAAAGTGGAGAAATGTGTG
CAATGAAGGAAGTTACTCTTTTCTCTGATGATCCGAAGTCCAAGGAGAGTGTAAAGCAGCTAGCACAGGAGATATCTATGCTGAGTCACTTACGGCATCCAAACATAGTGCAATATTATGGAAGTGAAACGGTATGTGGACATTTTGGCTATTCCTTGTCAAGCACTTATTTTATAATTTTTCAGCATCTTTTACCTGTG
TACCGCAAGCTTTAAACCTGCAGGGTTCATGTAATATGATCTTTCCCAGGCCAAATTGGTTTTTGCTAGGCTTTTGGTGAATGGACTATATAATTTCTTTCATTTGTGGGTTCCATTCTGACTACACATTAAACTCGCAAGAGTGCTACTGGGGTAAAATGTTATATTAGATGAAATACTCACTTGTACGGAGAAGAGAC
GGAACCCTGCTATTGTCATGAACCTACAATACCCCAATGCCAAATGATGCTGTCTTGACATTTACTAACCCTTGTTTTTTCTTCACAATTTCAATGAATAATGATGCAACATTTTCTACTCGCAGTTGGTTGTTTTCAAAACAAATAAAATAACATGATAGGAGACAATAATAAGAAAAGGAAGCAACTACAGTAGTAAG
TAGCTGCAGCAGAAAATGGTAACATGTTTATTTTCAGGTTAGTCAACAATAATTTCTTATCAGAAATAACACCTGTGAGTCATTACACGATTACAAGTCATTGCTTGTTGCATTCTAGAAGTATTGCATACATGAAGAAACCAGTGCGCTAGAGTGTATGCAAAAACATATTCATAGTACTGGTGGTGTATAAACTCATC
AAACTGAATTAATCCTTGGGATGTGAATTTAATCATGTACTTATTCTTTAATATTTCTCTGACACTGAATCATTGCCATTTTCTAGTACAATTGCAAAGTGAAGAGCATTTTGGATGCTTTTCAAGAAGCTTGCTTGTGTATGATACATATTATGATCCGGTTTTCTTGGTTTCAAGCTAAGTCCTAATTCTTGTATTAT
CTCCAAATAATTTAAAATTATCTCTATAATAGGGGCATAATGGTGATTGTATGTGCATTTTTTGTATTATTATTTGAAAGAATAGTTGTTACGCAATTGTGTTATGGTGTGTAGAAGATGCTAGCCATCATTGTTTGGGATTTGTTCTATGGATTCTAAGAGAAACCAGGATAGCAATCTAATACCTCATTTTCTTTCTG
TGTCTCACTCTCTTTAAGTAAAGTTATTTAAGATTTGAATTCTGTCTTATTTGTAATAATCTGAGAGATTCGTTTATAATTCAGCTTGCATTGGCAAAGGTTGATCCTGCAGATCCATATTGTTAATTTTTCCATTATATGTAAACTTGTAGAGCCATTTTTATCTCATTATGAATTTTACTTTGAAATTATGCATAGGA
CTGAGTTTACAATTGGAAACTATGGTTGGTGTTCTGGTAAAATTAGCTTGGTCTGGAAATTAAATCCAATTAGTAGACTTTTTTATTTCATTTTATGTTTTTTGTAATTTTTGAGGGGAAAATGTTTTTTATAGTTTCTATAAAACGATTTGCATATTTACATTGGATGATCAACCCCTAAAATCTAGATCTATATCTAG
GAGGATTCAATTAAGCTGGCCAATATTTGACTAGTCAAAGGAAGAAGGCATTTGAAGATTGACTTGAGCTTTTGGGACTTTCAACCCCTAAAATCTTGATCTATATCTAGGAGGATTCAATTAAGCTGGCCAATATTTGACTAGTCAAAGGAAGAATGCATTTGAAAATTGACTTGAACTTTAGGTCTTTGTATTTTGTG
AAAGTCAAACTAACACCCAGAATTTGAAGGAAATTAGAGATTTGAAGGAAATTAGAGATTTTAAGCTAGTCAAAAAGTCA
>TRINITY_DN118710_c1_g1_i14 from sample A1 / Example unspliced isoform:CATATTTTGTGGGAGTTGGGCAGTGCACACGTAATAATCTCATAAGCTCTTCTCTCATCAACTGTACCGTTTGTTTGTTTGCGTACTAGGGTTCGAACTTGGAACCTGCCCGAGCACAAAATTGCGTAATTCGTGGGGGTATGATTGATTTGTATCCAAGGCATGCCGAGGTGCGGGGTTCAACTCTCGCTGACTGCATA
GTCATCCAAATGCAGCTGCTGCTGGTGTTTTGCTAGACCTGCTGCGTGCGTGCTTGTGCGGGGTTCGAATCTCGGGGTCTTTGGAAATGCAGGTGTTAGCTTTGTAAGTAACAAGCGGACTGAGTGGTTTGCAGGGGGCAGGATGCTATCATGGTGGAAATCGCCGTCGTCATCGTCGGCGAAGAAGAAGAATGCCAATA
ACAACATTAATAGTAGTGAGAAGAAAAAGAAGAACAAGGACAACGGCATTCTGCATTCGTTGAGTTTCAGGAAATTGAAGGGGAATTTCGCCTCTCCAGCATGTCGAAGAGAGTCTACGACGTTGAATCATGTCGACGATTCGGATTTCGAAATCCCGTCTCCTTCGACTTCGAATTCGACGTCTGTGACAAGGTGCCAG
AGCTTCTCCCATGCGCTCCCCCTGCCGTTGCCATGCATGCCGCCGGCCTCGATATTGGGTCGGACTGAATCTGGAATCAGTTTGAATAGATCTGGGCACTTTTTGCCGCTGCCTTCTCCTCAAGCAGTGTTGAATAGGTCGGAGAATGCTGCGGATGGCTCGGCTTTGTCGGGGTCGGATTCTGCTACGAGTTCGATGGT
GGGCAGCGACGACCAGGCCGACAGAGATCCATCTGCCACTATTGGTTCCTGCATAACATTTGCAGGTTCAGCTCCTAAGAACAGCAAGAAAAATACAAAGCGTGAGATTCCAAAGCCCAATATCAGTTTGCTCAGTAAGCATAATAATTTACCGATTCCACCAAAGAGAGGGTTTTCGAGTAACCGAGAACCCCCAAAAC
CCCTTCAGATTCCAGTGAATAGACAGCCGGTCGCTGCAACCGACAGTTCTACGTCTACGCCATCTAGTCCAATGAGGGGTTTCAGCTCGGAGCATTCCCCACGTGGTGGCTTGTGTATGGCGAAGCCGTATCTGGATGGCGCTATGTTTGGATCCGGCAATTGCTCGAGCCCAGGTTCGGGTTACAATTCGGGACAGAAT
TCTATAGGCGGAGATATGGTGGGACAACCCTTTTGGCACAACAGGGGTGGTTCTCCCGTGCCAAGTCCGAGAATGAGGAGTCCAGGTCCAAGTTCACGAGCACAGAGTGCTGCTGTTTCTCCTCTTCATCCTCGAGCCAGTGGATTAGGGACCGAATCTCCAACAGGCAGACAGGAAGAGGGAAAACAACAATGTCATCC
ATTGCCGCTGCCGCCACGGTCCCCTTCTAGTTCTTCACCCTTCACCACATCTGCCACATCTTCAGGAGGTCCACGAAGTCCTGGTGGCAAAGACAACCCTGCAAGTCCTGGGCAGCGATGGAAGAAGGGGAAATTGTTGGGAAGAGGGACCTTTGGCCATGTCTATGTCGGTTTCAACAAgtaagtgtctaagtgtcatg
cagcaacttatggaccttataacactcttttgaatatataggacacaactacacacttttgaatatataggacacaactgaacagtaaaacaggcaagcatgctctctgatcttcatggcacctttcttggtgttttaactctactaaccatgctttggctgtctgcttgttactaaatgatttgtaaggtggatcactt
tagccatttgctgaaatattttgttgtacctaggtaagcctaacatggcaggttcctctgttatgctccactttgtgcatacaactatatttttcctctcttatgctttttagaatttattggtaaataaactattggttggacatggtacaatgctaataatttgtattcttttattgttcttgttgtgcaattcttct
tggtgagagtgacttggtcatgtgtttgttcagtttgtgggttgtttctttaattgttgctcatatcgagcctacattgcgttcattctttaaagatgtaggcaaacaattgctgacattattctttcattacattcatactctatcttgtagTGAAAGTGGAGAAATGTGTGCAATGAAGGAAGTTACTCTTTTCTCTG
ATGATCCGAAGTCCAAGGAGAGTGTAAAGCAGCTAGCACAGGAGATATCTATGCTGAGTCACTTACGGCATCCAAACATAGTGCAATATTATGGAAGTGAAACGGTGGATGACATGCTATATATTTACCTGGAGTATGTGTCTGGAGGTTCCATTCACAAACTGCTTCAAGAATATGGCCAGTTTGGAGAGCCAGTTGTT
CGCAGCTATACACATCAGATACTTTGTGGGCTGGCATATCTGCATAACAGAAATACTGTTCACAGGGACGTCAAAGGCGCAAATATTCTTGTTGATCCCAATGGCCATGTGAAGCTTGCAGACTTTGGCATGGCAAAACATATCACAGCACATTCCTGTCTTTTGTCATTTAAAGGAAGTCCATACTGGATGGCCCCTGA
GGTAATTAAAAATGTAAATGGCTATGACTTGGCAGTGGATATCTGGAGCCTTGGTTGTACAGTTTTGGAAATGGCTACGGCACAGCCTCCATGGAGCCAGTATGAAGGGGTTGCTGCAATGTTTAAAATAGGGAACAGTAAGGAGCTACCAGCAATCCCTGACCATCTTTCAGAGGAAGGCAAGAATTTTGTGAAATTAT
GTCTGCAGAGAAATCCTGTAAACCGTCCCACAGCTACACAACTTTTGGAACACCCATTTGTGAAACTGGATCAAAGTGCAGAAGGCATAGAGTTGTTGCCATCATCTGCTAATGGGTCAAGGCCTCTGCATGCTACACAATGTGCTGTACATTCAAGAAATTTCTCATCGCTAGAGATGGACTATTCAGCACTACATTCA
AAGGGTTGGTCACCGTATCAACCTTCAAGTGACCATTTTTATGTGAAAGGAAACATATCCTTGCCAGTCTCTCCATCTGCAAGCCCATTGATCCAGCCACGATCTCCCCATCATAGATACGGTGGGATGTCTCCTTCGCCTATATCAACACCACTGGCAAGCTCAGGTTCTTCAACTCCTTTAACAGGAGGTTATGGTGC
TATCCCATTCCAGGCTAATGGAGCTGCAAAATCAGCAGTGCATTTGCAGGAGAATTTTGGAAACATGCCAAGATTGGCAAATGGACTACATACTAATTGTTCTGGTGGCTATCTTGATCCTAGGCCTGATGTTTATGGGGGTGCACAGATAGTTCGTACTCCAGAAGGTTCCCCAAGATTTCAAAATCATATAGTTGCAG
AAAGTGATGTATTGGGTAAAAATATTGGTAGAGTGATGAGAAATGAGCATGGACAGAGTCAAAGGCAATATAGTGGTCAAGGGGCTTTAGCAGAACATGTGTCACAGCAGCTTCTAAAGACTCCTAAGCCTGTTGGAATTGATTTCATATCTGGTCCTCCCAAGTTTTACTAAAGGTAGTTTTTCATCAACATTCGGTCG
AGTGCATATAACTAACCATTATTGACAGCTGATGGATCTTTTTTGTTAAGTAAACATGGAACTGAAATTATTGAACAACGGGTCGGCCTGTCTCACCGGGTGTGCCTGATCAGGCCCAACAAACTGTACTATATTAAACAATTGGGTGGCTGTAATGGAGAGATGTGATCAGTGCATTTCCTGATTAAAAGATAGGAACA
AAGGAAGACTGTTGCCACATATTGCTGAGGTGGATATTGTATAACTCTGTGACCTTTTTGTCACAAATTATTTTGTAACAATTATATCAACTATACAAAGGTGGAGAAACTATTTTCTTCAATTCTATGTAGGGTGTTTTTGTCTAGAAAAATTGTTTTCGAGCTGACATTTCATTGGTTGGCTCTTTTCATCTGGCTTT
TATCAAAGAAGCAGCTGAAATGCACAAATTGAAATGATGGATACCACATGTAACAGAAGAAAATTGAAAGTCTGAGGGCCTGTATTAATAATTTCCTGTGCAACAGGTTTTCAGTATCCTGATGTAATGCAACGTAGTTTATGCTTTACAAGCTTACGACATATGGGTTGTTCTAGGTGTTTGGCATCTAGAGGAGTTGG
ATAGTTGAAAACCTGTGAATGTGATAGCTATGGTAAGCATATATTTGGGCTTATCCTTTCCATCTTACAGTATGCTAACAGTAGCTCTGCTAGTGCATCTTGTCTTTCAGTCTTATCTTTTCCCTGCTCCTTTTTTGTAAATTAGTACCCAAAACAGAGAGGTTCTAGTTATGAAAGAATCCTCAATCAAATATGGATAT
ACTATAGGGAAGTTCGCGACAATCTGCACAGAATTAGGGAGCCTGGAGTCATTTGTTTTCTTATCTTCCAAAATATTTTTTAAGAATGTCCATTTGCATAACTCAATCAAATGATACAACATGATTATGCAGTTCATAGGCTGACGGTACACCACATGTATCTTATAGCCAGGTTAATTCAATTATTCCACTTTGCTCTT
TCATAGTATCATACAAGCAGTGGCCGA