sp|Q6YTW6|LFR_ORYSJ ----> Armadillo repeat-containing protein LFR


Intron 1 GTTGACTTGG ... TACATGGCAG

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A923.47587186174
A1023.8485148155



>TRINITY_DN131948_c9_g1_i1 from sample A1 / Example spliced isoform
CAATATACTGTATTGAATATCATTGCTCAGACCTTCTTTGCTTGCTCGGCAAACCTAAAATAAATCCCCAGACTCCTAAAATCTAATCCCCTGTCCACATGCACTCTCTTTCGCTCTGCGAGTTCCACCTACCATCCCTGAAGTCCAAATAGTTCGCACTAGTGCAAAAAAAACCAGTATTTAACGAGATTTGCAGTTGT
AATAGCTGATTCCTTCAAGAGGAAGAAAGGGCTCTTCGCTGCAAGCTCTTTTCCTCTTCCCGACTAGAGGGCTTTAGCATTATCGTCATCGAAGCTATGGGTAAACACTTATATTTCTTTCTTATTATATTTTTTGATGACTGATGATTGGTTGCTTATGATGTGAGCTGCCTTCTTCCATTCGATCTGGGTTTGTGCTT
TCAGTTGCAGAGGAGGGTTTTACCTTATTTTTTATAGTGTTCGTTCGTTCAAGGGGCCTCATTTATCGAAGGGCGATAATGATTGGCGGCTTTTCCGGGTTGTGGGTTTTGTATGCAAATTCTGGCTGGTGGTAGCCACTTGTGAAGGATTCTGAGGCGATCCCACGGCTTCAATTATAAAATTTTTCTTATCCTATCAG
AACAGCAAAAGAATTGTCATGGCACTACAGAGCGGGTTAAAGAGTGAGCTGACATGGGCCTTAAATACTCTTACAGTGCTGTCCTTCAAAGAAAAGGAGGATGTTCGAAAAGATGCTACTCCTCTTGCAAAGCTACCTGGAGTTTTGGATGCCCTTTTACAAGTTGTTGATGATTGGCGTGATATTGCACACCCAAGGGA
GGCTGCAAAAATGGCCAGGCCTAGGGTTTTGGGAGCAAATAATGTTTTCACGGGTTTTGGTTCTGAATATGAAATAACAAGCCCAAATGATCCACTTTCTCGGATCAGGTCAGTATCTGATGCTTTGACTTCAGAGGACTCAGGAGATGGTACTAAAAGTAGGGGTTCTGATTGGTGGTATGCTGAAGAGGGATTATTCA
ACCTCGATGAGGAGGGCCGAGCAGAGAGACAGCAATGTGCTGTTGCTGCTTCAAATGTTATACGCAATTTTTCCTTTATGCCAGATAATGAGACAATAATGGCTCAACATCGTCATTGCCTTGAAACAATTATTCAGTGCATGGAAGACCATGATACTGAGGACGAGGAACTTGTGACAAATGCAATCGAGACAATTGTC
AACCTGGCACCCTTTCTGAATTTGCGAATATTCAGTTCGTCCAAGCCATCACATGCTCCCATAACTGAGAAAAGGGCAGTTGAGGCAATCGTGGGCATGCTAGAGTCACCAGTTAAAGCTTGGCACTGTGCTGCTGCGGAGTTGGTTGGAAGATTGATTGTCAATCCAGATAATGAACCATATGTTCTTCCTTTTGCACC
TCAGGTGTATAAGCGCTTAGTTGACCTTCTGAGTTTCCCTGGAGCAGATGCGCAGGCAGCAGCTGTAGCTGCCCTCTACAATCTTGCCGAGGTCAATATGGACTGCCGATTGAGGCTTGCTAATGAACGCTGGGCAATAGGGAGACTTCTAAAGATAATTCAATCACCTCACCCTCTATCAGAAGTATGCCGGAAAGCTG
CATTGACGATAGAAAGTCTGGCATGCGAGCCTCAAAACAGAGCTCCACTCTTGACATATGAAAATAAGTTTGCCGAAATAGCTTTCACTGATGTACGTCTCTCTGATACCTTTGCAAGGATATTGTATGAGTTGACTTCAAGGGCCAACTCTAAACTGGGGGCAGTTCGTGGTGTATGGGGAGTGTAGTTTCTGGATTCT
CTGGGATTCCGACTCTGCTTCTAGCATGTTATCTCTTTTGAAATTTGTGGACTTACGAGATTGTAACTGAGCCAAGTTGGAAAGTAATGTATTGAGTTTATTGGTATTTTTGAACTTTCCTCGTCTTTCCTGTCTTTAGATGTTGAAGCACACTTATTCACCAACAAAGAATGCTAAGGCATCTCTAGTTAAATAATTTT
CCTTTTTTGTTACTGATATGCAATAGTGCTACGTTTGCTGCTGTTCATTTGAAACTAAACTTTGTTATATTTTTCAAACTACGAACTTTCAATATGTATGCTGTAAATGGAAGATATCATCATCATGTCCTTTTTAGCAAACTCATCTCCTAAAAAATGAATGACAAATGTTTGTTCTTAGATTTTGTTAATTCAAAATC
ATATCGTGGTGTAT


>TRINITY_DN131948_c9_g1_i3 from sample A1 / Example unspliced isoform:
CAATATACTGTATTGAATATCATTGCTCAGACCTTCTTTGCTTGCTCGGCAAACCTAAAATAAATCCCCAGACTCCTAAAATCTAATCCCCTGTCCACATGCACTCTCTTTCGCTCTGCGAGTTCCACCTACCATCCCTGAAGTCCAAATAGTTCGCACTAGTGCAAAAAAAACCAGTATTTAACGAGATTTGCAGTTGT
AATAGCTGATTCCTTCAAGAGGAAGAAAGGGCTCTTCGCTGCAAGCTCTTTTCCTCTTCCCGACTAGAGGGCTTTAGCATTATCGTCATCGAAGCTATGGATCAGAACAGCAAAAGAATTGTCATGGCACTACAGAGCGGGTTAAAGAGTGAGCTGACATGGGCCTTAAATACTCTTACAGTGCTGTCCTTCAAAGAAAA
GGAGGATGTTCGAAAAGATGCTACTCCTCTTGCAAAGCTACCTGGAGTTTTGGATGCCCTTTTACAAGTTGTTGATGATTGGCGTGATATTGCACACCCAAGGGAGGCTGCAAAAATGGCCAGGCCTAGGGTTTTGGGAGCAAATAATGTTTTCACGGGTTTTGGTTCTGAATATGAAATAACAAGCCCAAATGATCCAC
TTTCTCGGATCAGGTCAGTATCTGATGCTTTGACTTCAGAGGACTCAGGAGATGGTACTAAAAGTAGGGGTTCTGATTGGTGGTATGCTGAAGAGGGATTATTCAACCTCGATGAGGAGGGCCGAGCAGAGAGACAGCAATGTGCTGTTGCTGCTTCAAATGTTATACGCAATTTTTCCTTTATGCCAGATAATGAGACA
ATAATGGCTCAACATCGTCATTGCCTTGAAACAATTATTCAGTGCATGGAAGACCATGATACTGAGGACGAGGAACTTGTGACAAATGCAATCGAGACAATTGTCAACCTGGCACCCTTTCTGAATTTGCGAATATTCAGTTCGTCCAAGCCATCACATGCTCCCATAACTGAGAAAAGGGCAGTTGAGGCAATCGTGGG
CATGCTAGAGTCACCAGTTAAAGCTTGGCACTGTGCTGCTGCGGAGTTGGTTGGAAGATTGATTGTCAATCCAGATAATGAACCATATGTTCTTCCTTTTGCACCTCAGgttgacttggttaagatattgcttcagttggagatttgcttcctccagatttggctttccaatggctgattatatggttcatctctacata
catggcagGTGTATAAGCGCTTAGTTGACCTTCTGAGTTTCCCTGGAGCAGATGCGCAGGCAGCAGCTGTAGCTGCCCTCTACAATCTTGCCGAGGTCAATATGGACTGCCGATTGAGGCTTGCTAATGAACGCTGGGCAATAGGGAGACTTCTAAAGATAATTCAATCACCTCACCCTCTATCAGAAGTATGCCGGAAA
GCTGCATTGACGATAGAAAGTCTGGCATGCGAGCCTCAAAACAGAGCTCCACTCTTGACATATGAAAATAAGTTTGCCGAAATAGCTTTCACTGATGTACGTCTCTCTGATACCTTTGCAAGGATATTGTATGAGTTGACTTCAAGGGCCAACTCTAAACTGGGGGCAGTTCGTGGTGTATGGGGAGTGTAGTTTCTGGA
TTCTCTGGGATTCCGACTCTGCTTCTAGCATGTTATCTCTTTTGAAATTTGTGGACTTACGAGATTGTAACTGAGCCAAGTTGGAAAGTAATGTATTGAGTTTATTGGTATTTTTGAACTTTCCTCGTCTTTCCTGTCTTTAGATGTTGAAGCACACTTATTCACCAACAAAGAATGCTAAGGCATCTCTAGTTAAATAA
TTTTCCTTTTTTGTTACTGATATGCAATAGTGCTACGTTTGCTGCTGTTCATTTGAAACTAAACTTTGTTATATTTTTCAAACTACGAACTTTCAATATGTATGCTGTAAATGGAAGATATCATCATCATGTCCTTTTTAGCAAACTCATCTCCTAAAAAATGAATGACAAATGTTTGTTCTTAGATTTTGTTAATTCAA
AATCATATCGTGGTGTAT



Intron 2 GTAAGAATGC ... TTTTGATAAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A124.721345335
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A320.841504930
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A621.8648818192
A721.9152420193
A822.4339614782
A920.7149416197
A1023.0538415872



>TRINITY_DN36381_c0_g1_i2 from sample A8 / Example spliced isoform
CTGTATTGAATATCATTGCTCAGACCTTCTTTGCTTGCTCGGCAAACCTAAAATAAATCCCCAGACTCCTAAAATCTAATCCCCTGTCCACATGCACTCTCTTTCGCTCTGCGAGTTCCACCTACCATCCCTGAAGTCCAAATAGTTCGCACTAGTGCAAAAAAAACCAGTATTTAACGAGATTTGCAGTTGTAATAGCT
GATTCCTTCAAGAGGAAGAAAGGGCTCTTCGCTGCAAGCTCTTTTCCTCTTCCCGACTAGAGGGCTTTAGCATTATCGTCATCGAAGCTATGGATCAGAACAGCAAAAGAATTGTCATGGCACTACAGAGCGGGTTAAAGAGTGAGCTGACATGGGCCTTAAATACTCTTACAGTGCTGTCCTTCAAAGAAAAGGAGGAT
GTTCGAAAAGATGCTACTCCTCTTGCAAAGCTACCTGGAGTTTTGGATGCCCTTTTACAAGTTGTTGATGATTGGCGTGATATTGCACACCCAAGGGAGGCTGCAAAAATGGCCAGGCCTAGGGTTTTGGGAGCAAATAATGTTTTCACGGGTTTTGGTTCTGAATATGAAATAACAAGCCCAAATGATCCACTTTCTCG
GATCAGGTCAGTATCTGATGCTTTGACTTCAGAGGACTCAGGAGATGGTACTAAAAGTAGGGGTTCTGATTGGTGGTATGCTGAAGAGGGATTATTCAACCTCGATGAGGAGGGCCGAGCAGAGAGACAGCAATGTGCTGTTGCTGCTTCAAATGTTATACGCAATTTTTCCTTTATGCCAGATAATGAGACAATAATGG
CTCAACATCGTCATTGCCTTGAAACAATTATTCAGTGCATGGAAGACCATGATACTGAGGACGAGGAACTTGTGACAAATGCAATCGAGACAATTGTCAACCTGGCACCCTTTCTGAATTTGCGAATATTCAGTTCGTCCAAGCCATCACATGCTCCCATAACTGAGAAAAGGGCAGTTGAGGCAATCGTGGGCATGCTA
GAGTCACCAGTTAAAGCTTGGCACTGTGCTGCTGCGGAGTTGGTTGGAAGATTGATTGTCAATCCAGATAATGAACCATATGTTCTTCCTTTTGCACCTCAGGTGTATAAGCGCTTAGTTGACCTTCTGAGTTTCCCTGGAGCAGATGCGCAGGCAGCAGCTGTAGCTGCCCTCTACAATCTTGCCGAGGTCAATATGGA
CTGCCGATTGAGGCTTGCTAATGAACGCTGGGCAATAGGGAGACTTCTAAAGATAATTCAATCACCTCACCCTCTATCAGAAGTATGCCGGAAAGCTGCATTGACGATAGAAAGTCTGGCATGCGAGCCTCAAAACAGAGCTCCACTCTTGACATATGAAAATAAGTTTGCCGAAATAGCTTTCACTGATGTACGTCTCT
CTGATACCTTTGCAAGGATATTGTATGAGTTGACTTCAAGGGCCAACTCTAAACTGGGGGCAGTTCGTGGTGTATGGGGAGTGTAGTTTCTGGATTCTCTGGGATTCCGACTCTGCTTCTAGCATGTTATCTCTTTTGAAATTTGTGGACTTACGAGATTGTAACTGAGCCAAGTTGGAAAGTAATGTATTGAGTTTATT
GGTATTTTTGAACTTTCCTCGTCTTTCCTGTCTTTAGATGTTGAAGCACACTTATTCACCAACAAAGAATGCTAAGGCATCTCTAGTTAAATAATTTTCCTTTTTTGTTACTGATATGCAATAGTGCTACGTTTGCTGCTGTTCATTTGAAACTAAACTTTGTTATATTTTTCAAACTACGAACTTTCAATATGTATGCT
GTAAATGGAAGATATCATCATCATGTCCTTTTTAGCAAACTCATCTCCTAAAAAATGAATGACAAATGTTTGTTCTTAGATTTTGTTAATTCAAAATCATATCGTGGTGTAAAGTTGAAGTTATATCAATTGCACTGTTCTTTTGGGACTACTGCATTAAAAATCTCAATCATTGAGAACAAATGCCC


>TRINITY_DN36381_c0_g1_i6 from sample A8 / Example unspliced isoform:
CGAGTATTCTTAGCTCTTTTGGAAACCAAGGCCACATATTTCATTAATGGTGTTCTTGCATCTACAGAAATGCTTCTACTTTCTGCAGTTGGAGTAGTATTCAGTGCATTGGAGCCACCAACACTTTGGGAGGATGCCATATAAGCTGTGTTGCACAAGAGAATGAGGAATAACTTCAAAACCCTTTGAGAAAACTGAAA
TTATAACTGCTGCTGCTGGAAAAAACAAAGCTGCCTTAAAATTCGAGGTTGCAAAATTTGAACTTACGACTTCTCCCAGTATTATTATCTCTTTTGGAAACCAAGGTTGCATATTTCATTAAACAGATAGCTTCTACATTCTGCAGCTGGAGTAGGAGCCAGTACATTGGAGCCACTGACATGTTGGGAGGATGCCATGT
AAGCTGTGTTGTTTGAGAGAATGAGGAATAACTTCAAAACCCCCCTTTGAGAAATCTGAAATTATAACTGCTGCTGCTGGAAAAAAACAAAGAGAAATTAGAATCCTCCCTCAATGACAATGCTCTTCTTCAGAAGAAATCCCAAGCTAAATGTGTCCTCTTACTGACAAAAATTTGTTGCTGTTGTCCAGAAAGTGCTT
ATGTTAATATGAAAATGGCCAAATGAAGTGAAAAATGTTCTCTCCAACCCTCGATTTCTCTTTCTTTTCCCTTCTTTTCTGCTTTAGGGTCAATGTGGGGACAACCAAACACCCTTTTTTTCTATTTTAAGCTTTACAAAAAGAGAGAAGAAAAATACAGTGTGGCGCTGGAAACATCAAGGAGTTTGTGGCTAAGTTTT
CAGAAACTGCTGAGAAACAGCTGAAACGTTTCTGGAAAGTCCCAGGAACAGTTTCCAGGTGTCACTGAATAAATGTAACTTAAAATTCCAGAAGTCAGAATGATAAAGAGAAGTTACAGAATCACAATGCTGGCCTTTTTTGCTTTGAACTTTTCGTTCTTTCAAAATAAAATGCTATCAGTTCTGCCCATGAGACTTTA
ATTTTGAAAGACCGAGCAAGAATATGGGTATAACACTTGTTGGAGATCTCATGTTTAGGAGGCTACTGACTTTTTATATAAAATGATTGTTGGATGGTTTTGATAGGTCAGTATCTGATGCTTTGACTTCAGAGGACTCAGGAGATGGTACTAAAAGTAGGGGTTCTGATTGGTGGTATGCTGAAGAGGGATTATTCAAC
CTCGATGAGGAGGGCCGAGCAGAGAGACAGCAATGTGCTGTTGCTGCTTCAAATGTTATACGCAATTTTTCCTTTATGCCAGATAATGAGACAATAATGGCTCAACATCGTCATTGCCTTGAAACAATTATTCAGTGCATGGAAGACCATGATACTGgtaagaatgctgtaactttaaaaggctttttctggcctgcgtt
aaattttataatgggtgatataacattcttctaaagaaaaggaaacaagttgtatttatcatctgtaatgtttgtctcacgattgctactctttcttgcagttaattgtacggtatctttttcccagatcactcttatgattacattatcttatcttcttttcttcatgttcatcatcattgtcattactactagtattt
tatttatcttttgacacgtatatttatattcttttcagattttatgaggttcctattttttaagaagtgttcattaatgaaatatagtctagttttatgcaacccattctttttgatgggcagacaggcatctgagtttcttttgtactttttcttttgataagAGGACGAGGAACTTGTGACAAATGCAATCGAGACAA
TTGTCAACCTGGCACCCTTTCTGAATTTGCGAATATTCAGTTCGTCCAAGCCATCACATGCTCCCATAACTGAGAAAAGGGCAGTTGAGGCAATCGTGGGCATGCTAGAGTCACCAGTTAAAGCTTGGCACTGTGCTGCTGCGGAGTTGGTTGGAAGATTGATTGTCAATCCAGATAATGAACCATATGTTCTTCCTTTT
GCACCTCAGGTGTATAAGCGCTTAGTTGACCTTCTGAGTTTCCCTGGAGCAGATGCGCAGGCAGCAGCTGTAGCTGCCCTCTACAATCTTGCCGAGGTCAATATGGACTGCCGATTGAGGCTTGCTAATGAACGCTGGGCAATAGGGAGACTTCTAAAGATAATTCAATCACCTCACCCTCTATCAGAAGTATGCCGGAA
AGCTGCATTGACGATAGAAAGTCTGGCATGCGAGCCTCAAAACAGAGCTCCACTCTTGACATATGAAAATAAGTTTGCCGAAATAGCTTTCACTGATGTACGTCTCTCTGATACCTTTGCAAGGATATTGTATGAGTTGACTTCAAGGGCCAACTCTAAACTGGGGGCAGTTCGTGGTGTATGGGGAGTGTAGTTTCTGG
ATTCTCTGGGATTCCGACTCTGCTTCTAGCATGTTATCTCTTTTGAAATTTGTGGACTTACGAGATTGTAACTGAGCCAAGTTGGAAAGTAATGTATTGAGTTTATTGGTATTTTTGAACTTTCCTCGTCTTTCCTGTCTTTAGATGTTGAAGCACACTTATTCACCAACAAAGAATGCTAAGGCATCTCTAGTTAAATA
ATTTTCCTTTTTTGTTACTGATATGCAATAGTGCTACGTTTGCTGCTGTTCATTTGAAACTAAACTTTGTTATATTTTTCAAACTACGAACTTTCAATATGTATGCTGTAAATGGAAGATATCATCATCATGTCCTTTTTAGCAAACTCATCTCCTAAAAAATGAATGACAAATGTTTGTTCTTAGATTTTGTTAATTCA
AAATCATATCGTGGTGTAAAGTTGAAGTTATATCAATTGCACTGTTCTTTTGGGACTACTGCATTAAAAATCTCAATCATTGAGAACAAATGCCC