sp|Q6H601|RH22_ORYSJ ----> DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 22
Intron 1 GTATTTGATG ... ATAATCCAAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 75.76 | 8 | 22 | 28 |
| A2 | 100 | 0 | 6 | 6 |
| A3 | 76.92 | 3 | 12 | 8 |
| A4 | 61.54 | 10 | 23 | 9 |
| A5 | 66.67 | 2 | 4 | 4 |
| A6 | 76.47 | 4 | 8 | 18 |
| A7 | 52.94 | 12 | 9 | 18 |
| A8 | 85.71 | 2 | 7 | 17 |
| A9 | 70.83 | 7 | 14 | 20 |
| A10 | 71.43 | 6 | 4 | 26 |
>TRINITY_DN123061_c5_g1_i4 from sample A3 / Example spliced isoformGTATTCTTCAGCAATTCAAAGTTGCAGAAGCCCTTTCTTACGTTTGATTTCACCTAGCACTTTTAATTCCTGTAAAATCCTTCGGCCTTTATTGTGCTTTACGAAGAGGCCGAGAACGAATCACTCTGCAGCTGAAATGTCAGCAAGCGTCCCGAGAACAAGTAAGACTGTTAAAAATGAGGTTAATAAGGGTGCGAATG
CAAGTAAATCCGTTCACAGCTTCACGGGCCATGATACTTTTTTCGTTGAAGAAGGAGTCACCTGGAAAACCTTAGGTGTATCGGGAGAACTAGAGAATGCTTTAATGGCAGCTGGTTTGAGCAGACCTTCGCTGGTACAGGCTGCTGCTATTCCGTCTATTCTGTCAGGCAAAGATGTTATAGTGGCAGCAGAAACTGGA
AGTGGTAAAACACATGGATACCTGGTACCTATTATTCATAATCTGCGTGGCATGTATGGACCCCTTGAAAATGGTATGAAGAAAGGTAGATCACAGACTCAAAAGTTTGCACTTGTTTTGTGCCCAAATGCAATGTTATGTGAGCAGGCAGCTCGCATGGCTAGCAATCTCCATGGCCCTCACGGTGATCCTCTCTTGAA
AGTGATGGCAGTCTGTGGGAGTCAGGGGTGGCCTGTTGTTCAACCCGATGTTTTGATTTCAACACCAGGTACTCTGCTTAATTGCCTTTTTGCTTTTGATCCCAGGAAAAGGCGCCGTACAGCATTTATTCGAGATATAAAATATGTGGTTGGAGCAGCGTTGGATAGAAGTCACAGTGGAGACACACGTTGAAACACTT
ATCAATTCAATTAAAGAGGGTTGGGCATTTAAACAGTCAGATTCAAGCGCTACTGTAAAGCGGACAATGGTTTTTGCAAACACTGTAAATGCAGTTGATTCAGTTGCTAAAATCTTGCTTAAAGCCGGTATTAAATGTATGTGTTATCATAGAGAGACTTCTTCAGAGGAGCGTGCAGAGACTTTAAAAGTTTTTCAAGA
GAAAGGAGGTGTGCTGGTGTGCACTGATGCTGCTGCACGTGGTCTTGACATCCAAAATGTTTCCCATATTATTCAGGCAGAGTTTGCAACTTCAGCAGTAGACTTTTTGCATAGAGTTGGTCGAACAGCACGTGCAGGTCAACCTGGATTGGTCACAAGTTTGTTCACAGAAGCCAATCGAGCTCTTGTAGAAGCAGTGC
GTCAGGCTAAAACCTTCGGCCAACCAGTGGAAGGAGCTTTCAGCAGGAAAAGAAGTTTTAGAAATAAGCTCAAGAAGGCTCGCAAGTTGACAGCATCTTGAAAGAATGGGCTTTTGAAGTTTCTTCTGTTATGGTGAAATCAGGCAAATCTTTTGCACCAACTCAACATTCTGAAGGGTTGCTATGTTAAAAATTGTGCA
TTCACAAGCTGCAAGTTTGAATGCTTACCAAGGCTACTGTATAAAACAACAGAGTCAATTCTTATATTTGAATCTTGTAGCATCAGTCCCAACCTTTTGCATCAGAAGACTGGTTACTGCAAAGAACATCGTATATGCCATCTGAGATTTTTTTTTGATATTTGCATATTTTGTCAATTTGCCATCTGAGAATTTCTTTT
GATATTTCGGATTGTGTCTGTGATTGACACTATCTATATGAGGTATAAATACTCTGCAATGGCTAACAGCTTCCAAGGACGGAGAGGTACATACACACATAAGTAGTTTAAACTTTATTACATTAGCGTTGATGTAGTATGTGAATAATATTTTCATTATATCACGGGCTTTTTGTTTCAAAAAAAAAAAAAAAAAATAA
AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
>TRINITY_DN123061_c5_g1_i1 from sample A3 / Example unspliced isoform:GTATTCTTCAGCAATTCAAAGTTGCAGAAGCCCTTTCTTACGTTTGATTTCACCTAGCACTTTTAATTCCTGTAAAATCCTTCGGCCTTTATTGTGCTTTACGAAGAGGCCGAGAACGAATCACTCTGCAGCTGAAATGTCAGCAAGCGTCCCGAGAACAAGTAAGACTGTTAAAAATGAGGTTAATAAGGGTGCGAATG
CAAGTAAATCCGTTCACAGCTTCACGGGCCATGATACTTTTTTCGTTGAAGAAGGAGTCACCTGGAAAACCTTAGGTGTATCGGGAGAACTAGAGAATGCTTTAATGGCAGCTGGTTTGAGCAGACCTTCGCTGGTACAGGCTGCTGCTATTCCGTCTATTCTGTCAGGCAAAGATGTTATAGTGGCAGCAGAAACTGGA
AGTGGTAAAACACATGGATACCTGGTACCTATTATTCATAATCTGCGTGGCATGTATGGACCCCTTGAAAATGGTATGAAGAAAGGTAGATCACAGACTCAAAAGTTTGCACTTGTTTTGTGCCCAAATGCAATGTTATGTGAGCAGGCAGCTCGCATGGCTAGCAATCTCCATGGCCCTCACGGTGATCCTCTCTTGAA
AGTGATGGCAGTCTGTGGGAGTCAGGGGTGGCCTGTTGTTCAACCCGATGTTTTGATTTCAACACCAGGTACTCTGCTTAATTGCCTTTTTGCTTTTGATCCCAGGAAAAGGCGCCGTACAGCATTTATTCGAGATATAAAATATGTGgtatttgatgaggcagacatgcttttgtgtggaagcttccaaaatcaaattg
tacgcctgattaatatgtttcgcttggaagagaagcaactctctaaagcaatggaatcagggcttgactgttccgctgaagcagattccatgtcttggatagatttcaagccagaagaagatgagcagttgagttcagtctcagattcagaaagtgcagatttacatgatgagtttaatgatgaagatgacctcagtgaa
gagaaggttgatgtccctgataagagaaaagattggttgcggtcaagaaaaatatacaagcggagtaagcaatatatatttgttgctgcgactttaccagaaagtggtaagaagactgcaggaggtgtgttgaaacgcctctatccacaggccacttgggtcagcgggagtttccttcaccggcataatccaagGTTGGA
GCAGCGTTGGATAGAAGTCACAGTGGAGACACACGTTGAAACACTTATCAATTCAATTAAAGAGGGTTGGGCATTTAAACAGTCAGATTCAAGCGCTACTGTAAAGCGGACAATGGTTTTTGCAAACACTGTAAATGCAGTTGATTCAGTTGCTAAAATCTTGCTTAAAGCCGGTATTAAATGTATGTGTTATCATAGAG
AGACTTCTTCAGAGGAGCGTGCAGAGACTTTAAAAGTTTTTCAAGAGAAAGGAGGTGTGCTGGTGTGCACTGATGCTGCTGCACGTGGTCTTGACATCCAAAATGTTTCCCATATTATTCAGGCAGAGTTTGCAACTTCAGCAGTAGACTTTTTGCATAGAGTTGGTCGAACAGCACGTGCAGGTCAACCTGGATTGGTC
ACAAGTTTGTTCACAGAAGCCAATCGAGCTCTTGTAGAAGCAGTGCGTCAGGCTAAAACCTTCGGCCAACCAGTGGAAGGAGCTTTCAGCAGGAAAAGAAGTTTTAGAAATAAGCTCAAGAAGGCTCGCAAGTTGACAGCATCTTGAAAGAATGGGCTTTTGAAGTTTCTTCTGTTATGGTGAAATCAGGCAAATCTTTT
GCACCAACTCAACATTCTGAAGGGTTGCTATGTTAAAAATTGTGCATTCACAAGCTGCAAGTTTGAATGCTTACCAAGGCTACTGTATAAAACAACAGAGTCAATTCTTATATTTGAATCTTGTAGCATCAGTCCCAACCTTTTGCATCAGAAGACTGGTTACTGCAAAGAACATCGTATATGCCATCTGAGATTTTTTT
TTGATATTTGCATATTTTGTCAATTTGCCATCTGAGAATTTCTTTTGATATTTCGGATTGTGTCTGTGATTGACACTATCTATATGAGGTATAAATACTCTGCAATGGCTAACAGCTTCCAAGGACGGAGAGGTACATACACACATAAGTAGTTTAAACTTTATTACATTAGCGTTGATGTAGTATGTGAATAATATTTT
CATTATATCACGGGCTTTTTGTTTCAAAAAAAAAAAAAAAAAATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
Intron 2 GTATGATATA ... ACCTTTGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 39.09 | 19 | 5.5 | 12.3 |
| A2 | 50 | 4 | 0.8 | 4 |
| A3 | 59.09 | 9 | 0 | 13 |
| A4 | 50 | 3 | 0 | 3 |
| A5 | 42.86 | 4 | 1 | 3 |
| A6 | 32.57 | 46 | 10.8 | 22.3 |
| A7 | 32.93 | 55 | 12.8 | 27 |
| A8 | 29.26 | 55 | 12.8 | 22.8 |
| A9 | 27.27 | 50 | 12.3 | 18.8 |
| A10 | 41.77 | 18 | 5.3 | 13 |
>TRINITY_DN40179_c0_g1_i1 from sample A6 / Example spliced isoformCCCCGGGACACTTCAAATAACCAATACCCAGAGAAATGCAGATATATATATACAATTAGTGTAAATTTGTTCTGTTGTAAATCAAAATTAGTTGCGCAGTAGCCATGTATTCATCAGCAATTCAAAGTTGCAGAAGCCCTTTCTTACGTTTGATTTCACCCAGCACTTTTAATTCCTGTAAAATCCTTCGGCCTTTATTG
TGCTTTACGAAGAGGCCGAGAACGAATCACTCTGCAGCTGAAATGTCAGCAAGCGTCCCGAGAACAAGTAAGACTGTTAAAAATGAGGTTAATAAGGGTGCGAATGCAAGTAAATCCGTTCACAGCTTCACGGGCCATGATACTTTTTTCGTTGAAGAAGGAGTCACCTGGAAAACCTTAGGTGTATCGGAAGAACTAGA
GAATGCTTTAATGGCAGCTGGTTTGAGCAGACCTTCGCTGGTACAGGCTGCTGCTATTCCGTCTATTCTGTCAGGCAAAGATGTTATAGTGGCAGCAGAAACTGGAAGTGGTAAAACACATGGATACCTGGTACCTATTATTCATAATCTGCGTGGCATGTATGGACCCCTTGAAAATGGTATGAAGAAAGGTAGATCAC
AGACTCAAAAGTTTGCACTTGTTTTGTGCCCAAATGCAATGTTATGTGAGCAGGCAGCTCGCATGGCTAGCAATCTCCATGGCCCTCACGGTGATCCTCTCTTGAAAGTGATGGCAGTCTGTGGGAGTCAGGGGTGGCCTGTTGTTCAACCCGATGTTTTGATTTCAACACCAGGTACTCTGCTTAATTGCCTTTTTGCT
TTTGATCCCAGGAAAAGGCGCCGTACAGCATTTATTCGAGATATAAAATATGTGGTATTTGATGAGGCAGACATGCTTTTGTGTGGAAGCTTCCAAAATCAAATTGTACGCCTGATTAATATGTTTCGCTTGGAAGAGAAGCAACTCTCTAAAGCAATGGAATCAGGGCTTGACTGTTCCGCTGAAGCAGATTCCATGTC
TTGGATAGATTTCAAGCCAGAAGAAGATGAGCAGTTGAGTTCAGTCTCAGATTCAGAAAGTGCAGATTTACATGATGAGTTTAATGATGAAGATGACCTCAGTGAAGAGAAGGTTGATGTCCCTGATAAGAGAAAAGATTGGTTGCGGTCAAGAAAAATATACAAGCGGAGTAAGCAATATATATTTGTTGCTGCGACTT
TACCAGAAAGTGGTAAGAAGACTGCAGGAGGTGTGTTGAAACGCCTCTATCCACAGGCCACTTGGGTCAGCGGGAGTTTCCTTCACCGGCATAATCCAAGGTTGGAGCAGCGTTGGATAGAAGTCACAGTGGAGACACACGTTGAAACACTTATCAATTCAATTAAAGAGGGTTGGGCATTTAAACAGTCAGATTCAAGC
GCTACTGTAAAGCGGACAATGGTTTTTGCAAACACTGTAAATGCAGTTGATTCAGTTGCTAAAATCTTGCTTAAAGCCGGTATTAAATGTATGTGTTATCATAGAGAGACTTCTTCAGAGGAGCGTGCAGAGACTTTAAAAGTTTTTCAAGAGAAAGGAGGTGTGCTGGTGTGCACTGATGCTGCTGCACGTGGTCTTGA
CATCCAAAATGTTTCCCATATTATTCAGGCAGAGTTTGCAACTTCAGCAGTAGACTTTTTGCATAGAGTTGGTCGAACAGCACGTGCAGGTCAACCTGGATTGGTCACAAGTTTGTTCACAGAAGCCAATCGAGCTCTTGTAGAAGCAGTGCGTCAGGCTAAAACCTTCGGCCAACCAGTGGAAGGAGCTTTCAGCAGGA
AAAGAAGTTTTAGAAATAAGCTCAAGAAGGCTCGCAAGTTGACAGCATCTTGAAAGAATGGGCTTTTGAAGTTTCTTCTGTTATGGTGAAATCAGGCAAATCTTTTGCACCAACTCAACATTCTGAAGGGTTGCTATGTTAAAAATTGTGCATTCACAAGCTGCAAGTTTGAATGCTTACCAAGGCTACTGTATAAAACA
ACAGAGTCAATTCTTATATTTGAATCTTGTAGCATCAGTCCCAACCTTTTGCATCAGAAGACTGGTTACTGCAAAGAACATCGTATATGCCATCTGAGATTTTTTTTTGATATTTGCATATTTTGTCAATTTGCCATCTGAGAATTTCTTTTGATATTTCGGATTGTGTCTGTGATTGACACTATCTATATGAGGTATAA
ATACTCTGCAATGGCTAACAGCTTCCAAGGACGGAGAGGTACATACACACATAAGTAGTTTAAACTTTATTACATTAGCGTTGATGTAGTATGTGAATAATATTTTCATTATATCACGGGCTTTTTGTTTCTGTGCATTCTTCAGGAATCATGAAATTGAAATATAGATCATACTTATATTTAAACTGTTACATTTTCTG
CTTAGAAGCTTC
>TRINITY_DN40179_c0_g1_i2 from sample A6 / Example unspliced isoform:CCCCGGGACACTTCAAATAACCAATACCCAGAGAAATGCAGATATATATATACAATTAGTGTAAATTTGTTCTGTTGTAAATCAAAATTAGTTGCGCAGTAGCCATGTATTCATCAGCAATTCAAAGTTGCAGAAGCCCTTTCTTACGTTTGATTTCACCCAGCACTTTTAATTCCTGTAAAATCCTTCGGCCTTTATTG
TGCTTTACGAAGAGGCCGAGAACGAATCACTCTGCAGCTGAAATGTCAGCAAGCGTCCCGAGAACAAGTAAGACTGTTAAAAATGAGGTTAATAAGGGTGCGAATGCAAGTAAATCCGTTCACAGCTTCACGGGCCATGATACTTTTTTCGTTGAAGAAGGAGTCACCTGGAAAACCTTAGGTGTATCGGAAGAACTAGA
GAATGCTTTAATGGCAGCTGGTTTGAGCAGACCTTCGCTGGTACAGGCTGCTGCTATTCCGTCTATTCTGTCAGGCAAAGATGTTATAGTGGCAGCAGAAACTGGAAGTGGTAAAACACATGGATACCTGGTACCTATTATTCATAATCTGCGTGGCATGTATGGACCCCTTGAAAATGGTATGAAGAAAGGTAGATCAC
AGACTCAAAAGTTTGCACTTGTTTTGTGCCCAAATGCAATGTTATGTGAGCAGGCAGCTCGCATGGCTAGCAATCTCCATGGCCCTCACGGTGATCCTCTCTTGAAAGTGATGGCAGTCTGTGGGAGTCAGGGGTGGCCTGTTGTTCAACCCGATGTTTTGATTTCAACACCAGGTACTCTGCTTAATTGCCTTTTTGCT
TTTGATCCCAGGAAAAGGCGCCGTACAGCATTTATTCGAGATATAAAATATGTGGTATTTGATGAGGCAGACATGCTTTTGTGTGGAAGCTTCCAAAATCAAATTGTACGCCTGATTAATATGTTTCGCTTGGAAGAGAAGCAACTCTCTAAAGCAATGGAATCAGGGCTTGACTGTTCCGCTGAAGCAGATTCCATGTC
TTGGATAGATTTCAAGCCAGAAGAAGATGAGCAGTTGAGTTCAGTCTCAGATTCAGAAAGTGCAGATTTACATGATGAGTTTAATGATGAAGATGACCTCAGTGAAGAGAAGGTTGATGTCCCTGATAAGAGAAAAGATTGGTTGCGGTCAAGAAAAATATACAAGCGGAGTAAGCAATATATATTTGTTGCTGCGACTT
TACCAGAAAGTGGTAAGAAGACTGCAGGAGGTGTGTTGAAACGCCTCTATCCACAGGCCACTTGGGTCAGCGGGAGTTTCCTTCACCGGCATAATCCAAGGTTGGAGCAGCGTTGGATAGAAGTCACAGTGGAGACACACGTTGAAACACTTATCAATTCAATTAAAGAGGGTTGGGCATTTAAACAGTCAGATTCAAGC
GCTACTGTAAAGCGGACAATGGTTTTTGCAAACACTGTAAATGCAGTTGATTCAGTTGCTAAAATCTTGCTTAAAGCCGGTATTAAATGTATGTGTTATCATAGAGAGACTTCTTCAGAGGAGCGTGCAGAGACTTTAAAAGTTTTTCAAGAGAAAGGAGGTGTGCTGGTGTGCACTGATGCTGCTGCACGTGGTCTTGA
CATCCAAAATGTTTCCCATATTATTCAGGCAGAGTTTGCAACTTCAGCAGTAGACTTTTTGCATAGAGTTGGTCGAACAGCACGTGCAGGTCAACCTGGATTGGTCACAAGTTTGTTCACAGAAGCCAATCGAGCTCTTGTAGAAGCAGTGCGTCAGGCTAAAACCTTCGGCCAACCAGTGGAAGGAGCTTTCAGCAGGA
AAAGAAGTTTTAGAAATAAGCTCAAGAAGGCTCGCAAGTTGACAGCATCTTGAAAGAATGGGCTTTTGAAGTTTCTTCTGTTATGGTGAAATCAGGCAAATCTTTTGCACCAACTCAACATTCTGAAGgtatgatatatatgttcttaaaatgccatctctagatgtcttattgcggttgaattacataataccttttga
gttcaacagtattgtataatggttttttttaacttatatatctacaaaaaatatttacattaagggaaaacaaaaagcggaagggtatgtacaatggattggataacgtatatttttactaatgttactaaggaagaggattgtataaagctgcttataaatataaaggcctaactagaacatacggcttgtaatgaagg
atcttagcgagagtattgatggaagaaataaccaaatttgcactgtatatacctttgcagGGTTGCTATGTTAAAAATTGTGCATTCACAAGCTGCAAGTTTGAATGCTTACCAAGGCTACTGTATAAAACAACAGAGTCAATTCTTATATTTGAATCTTGTAGCATCAGTCCCAACCTTTTGCATCAGAAGACTGGTTA
CTGCAAAGAACATCGTATATGCCATCTGAGATTTTTTTTTGATATTTGCATATTTTGTCAATTTGCCATCTGAGAATTTCTTTTGATATTTCGGATTGTGTCTGTGATTGACACTATCTATATGAGGTATAAATACTCTGCAATGGCTAACAGCTTCCAAGGACGGAGAGGTACATACACACATAAGTAGTTTAAACTTT
ATTACATTAGCGTTGATGTAGTATGTGAATAATATTTTCATTATATCACGGGCTTTTTGTTTCTGTGCATTCTTCAGGAATCATGAAATTGAAATATAGATCATACTTATATTTAAACTGTTACATTTTCTGCTTAGAAGCTTC
Intron 3 GTTGGGCATT ... GTTATCATAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 74.8 | 7 | 16 | 26 |
| A2 | 70.33 | 6 | 6.5 | 22 |
| A3 | 57.13 | 12 | 9 | 23 |
| A4 | 64.19 | 9 | 12.5 | 20 |
| A5 | 70.33 | 4 | 3 | 16 |
| A6 | 73.84 | 13 | 20.5 | 53 |
| A7 | 59.58 | 29 | 21.5 | 64 |
| A8 | 54.75 | 26 | 19 | 44 |
| A9 | 62.81 | 26 | 21 | 67 |
| A10 | 67.06 | 21 | 34 | 52 |
>TRINITY_DN123061_c5_g1_i3 from sample A3 / Example spliced isoformGTATTCTTCAGCAATTCAAAGTTGCAGAAGCCCTTTCTTACGTTTGATTTCACCTAGCACTTTTAATTCCTGTAAAATCCTTCGGCCTTTATTGTGCTTTACGAAGAGGCCGAGAACGAATCACTCTGCAGCTGAAATGTCAGCAAGCGTCCCGAGAACAAGTAAGACTGTTAAAAATGAGGTTAATAAGGGTGCGAATG
CAAGTAAATCCGTTCACAGCTTCACGGGCCATGATACTTTTTTCGTTGAAGAAGGAGTCACCTGGAAAACCTTAGGTGTATCGGGAGAACTAGAGAATGCTTTAATGGCAGCTGGTTTGAGCAGACCTTCGCTGGTACAGGCTGCTGCTATTCCGTCTATTCTGTCAGGCAAAGATGTTATAGTGGCAGCAGAAACTGGA
AGTGGTAAAACACATGGATACCTGGTACCTATTATTCATAATCTGCGTGGCATGTATGGACCCCTTGAAAATGGTATGAAGAAAGGTAGATCACAGACTCAAAAGTTTGCACTTGTTTTGTGCCCAAATGCAATGTTATGTGAGCAGGCAGCTCGCATGGCTAGCAATCTCCATGGCCCTCACGGTGATCCTCTCTTGAA
AGTGATGGCAGTCTGTGGGAGTCAGGGGTGGCCTGTTGTTCAACCCGATGTTTTGATTTCAACACCAGGTACTCTGCTTAATTGCCTTTTTGCTTTTGATCCCAGGAAAAGGCGCCGTACAGCATTTATTCGAGATATAAAATATGTGGTATTTGATGAGGCAGACATGCTTTTGTGTGGAAGCTTCCAAAATCAAATTG
TACGCCTGATTAATATGTTTCGCTTGGAAGAGAAGCAACTCTCTAAAGCAATGGAATCAGGGCTTGACTGTTCCGCTGAAGCAGATTCCATGTCTTGGATAGATTTCAAGCCAGAAGAAGATGAGCAGTTGAGTTCAGTCTCAGATTCAGAAAGTGCAGATTTACATGATGAGTTTAATGATGAAGATGACCTCAGTGAA
GAGAAGGTTGATGTCCCTGATAAGAGAAAAGATTGGTTGCGGTCAAGAAAAATATACAAGCGGAGTAAGCAATATATATTTGTTGCTGCGACTTTACCAGAAAGTGGTAAGAAGACTGCAGGAGGTGTGTTGAAACGCCTCTATCCACAGGCCACTTGGGTCAGCGGGAGTTTCCTTCACCGGCATAATCCAAGGTTGGA
GCAGCGTTGGATAGAAGTCACAGTGGAGACACACGTTGAAACACTTATCAATTCAATTAAAGAGGAGAGACTTCTTCAGAGGAGCGTGCAGAGACTTTAAAAGTTTTTCAAGAGAAAGGAGGTGTGCTGGTGTGCACTGATGCTGCTGCACGTGGTCTTGACATCCAAAATGTTTCCCATATTATTCAGGCAGAGTTTGC
AACTTCAGCAGTAGACTTTTTGCATAGAGTTGGTCGAACAGCACGTGCAGGTCAACCTGGATTGGTCACAAGTTTGTTCACAGAAGCCAATCGAGCTCTTGTAGAAGCAGTGCGTCAGGCTAAAACCTTCGGCCAACCAGTGGAAGGAGCTTTCAGCAGGAAAAGAAGTTTTAGAAATAAGCTCAAGAAGGCTCGCAAGT
TGACAGCATCTTGAAAGAATGGGCTTTTGAAGTTTCTTCTGTTATGGTGAAATCAGGCAAATCTTTTGCACCAACTCAACATTCTGAAGGGTTGCTATGTTAAAAATTGTGCATTCACAAGCTGCAAGTTTGAATGCTTACCAAGGCTACTGTATAAAACAACAGAGTCAATTCTTATATTTGAATCTTGTAGCATCAGT
CCCAACCTTTTGCATCAGAAGACTGGTTACTGCAAAGAACATCGTATATGCCATCTGAGATTTTTTTTTGATATTTGCATATTTTGTCAATTTGCCATCTGAGAATTTCTTTTGATATTTCGGATTGTGTCTGTGATTGACACTATCTATATGAGGTATAAATACTCTGCAATGGCTAACAGCTTCCAAGGACGGAGAGG
TACATACACACATAAGTAGTTTAAACTTTATTACATTAGCGTTGATGTAGTATGTGAATAATATTTTCATTATATCACGGGCTTTTTGTTTCAAAAAAAAAAAAAAAAAATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAAAAAAAAAAAAA
AAAAAAAAAA
>TRINITY_DN123061_c5_g1_i1 from sample A3 / Example unspliced isoform:GTATTCTTCAGCAATTCAAAGTTGCAGAAGCCCTTTCTTACGTTTGATTTCACCTAGCACTTTTAATTCCTGTAAAATCCTTCGGCCTTTATTGTGCTTTACGAAGAGGCCGAGAACGAATCACTCTGCAGCTGAAATGTCAGCAAGCGTCCCGAGAACAAGTAAGACTGTTAAAAATGAGGTTAATAAGGGTGCGAATG
CAAGTAAATCCGTTCACAGCTTCACGGGCCATGATACTTTTTTCGTTGAAGAAGGAGTCACCTGGAAAACCTTAGGTGTATCGGGAGAACTAGAGAATGCTTTAATGGCAGCTGGTTTGAGCAGACCTTCGCTGGTACAGGCTGCTGCTATTCCGTCTATTCTGTCAGGCAAAGATGTTATAGTGGCAGCAGAAACTGGA
AGTGGTAAAACACATGGATACCTGGTACCTATTATTCATAATCTGCGTGGCATGTATGGACCCCTTGAAAATGGTATGAAGAAAGGTAGATCACAGACTCAAAAGTTTGCACTTGTTTTGTGCCCAAATGCAATGTTATGTGAGCAGGCAGCTCGCATGGCTAGCAATCTCCATGGCCCTCACGGTGATCCTCTCTTGAA
AGTGATGGCAGTCTGTGGGAGTCAGGGGTGGCCTGTTGTTCAACCCGATGTTTTGATTTCAACACCAGGTACTCTGCTTAATTGCCTTTTTGCTTTTGATCCCAGGAAAAGGCGCCGTACAGCATTTATTCGAGATATAAAATATGTGGTATTTGATGAGGCAGACATGCTTTTGTGTGGAAGCTTCCAAAATCAAATTG
TACGCCTGATTAATATGTTTCGCTTGGAAGAGAAGCAACTCTCTAAAGCAATGGAATCAGGGCTTGACTGTTCCGCTGAAGCAGATTCCATGTCTTGGATAGATTTCAAGCCAGAAGAAGATGAGCAGTTGAGTTCAGTCTCAGATTCAGAAAGTGCAGATTTACATGATGAGTTTAATGATGAAGATGACCTCAGTGAA
GAGAAGGTTGATGTCCCTGATAAGAGAAAAGATTGGTTGCGGTCAAGAAAAATATACAAGCGGAGTAAGCAATATATATTTGTTGCTGCGACTTTACCAGAAAGTGGTAAGAAGACTGCAGGAGGTGTGTTGAAACGCCTCTATCCACAGGCCACTTGGGTCAGCGGGAGTTTCCTTCACCGGCATAATCCAAGGTTGGA
GCAGCGTTGGATAGAAGTCACAGTGGAGACACACGTTGAAACACTTATCAATTCAATTAAAGAGGgttgggcatttaaacagtcagattcaagcgctactgtaaagcggacaatggtttttgcaaacactgtaaatgcagttgattcagttgctaaaatcttgcttaaagccggtattaaatgtatgtgttatcatagAG
AGACTTCTTCAGAGGAGCGTGCAGAGACTTTAAAAGTTTTTCAAGAGAAAGGAGGTGTGCTGGTGTGCACTGATGCTGCTGCACGTGGTCTTGACATCCAAAATGTTTCCCATATTATTCAGGCAGAGTTTGCAACTTCAGCAGTAGACTTTTTGCATAGAGTTGGTCGAACAGCACGTGCAGGTCAACCTGGATTGGTC
ACAAGTTTGTTCACAGAAGCCAATCGAGCTCTTGTAGAAGCAGTGCGTCAGGCTAAAACCTTCGGCCAACCAGTGGAAGGAGCTTTCAGCAGGAAAAGAAGTTTTAGAAATAAGCTCAAGAAGGCTCGCAAGTTGACAGCATCTTGAAAGAATGGGCTTTTGAAGTTTCTTCTGTTATGGTGAAATCAGGCAAATCTTTT
GCACCAACTCAACATTCTGAAGGGTTGCTATGTTAAAAATTGTGCATTCACAAGCTGCAAGTTTGAATGCTTACCAAGGCTACTGTATAAAACAACAGAGTCAATTCTTATATTTGAATCTTGTAGCATCAGTCCCAACCTTTTGCATCAGAAGACTGGTTACTGCAAAGAACATCGTATATGCCATCTGAGATTTTTTT
TTGATATTTGCATATTTTGTCAATTTGCCATCTGAGAATTTCTTTTGATATTTCGGATTGTGTCTGTGATTGACACTATCTATATGAGGTATAAATACTCTGCAATGGCTAACAGCTTCCAAGGACGGAGAGGTACATACACACATAAGTAGTTTAAACTTTATTACATTAGCGTTGATGTAGTATGTGAATAATATTTT
CATTATATCACGGGCTTTTTGTTTCAAAAAAAAAAAAAAAAAATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA