NA ----> NA
Intron 1 GTGATTTTTC ... GTCGTCCTAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 58.82 | 21 | 29 | 31 |
| A2 | 61.19 | 13 | 19 | 22 |
| A3 | 50.65 | 19 | 27 | 12 |
| A4 | 48.65 | 19 | 15 | 21 |
| A5 | 51.22 | 10 | 13 | 8 |
| A6 | -1 | 0 | 0 | 0 |
| A7 | 28.42 | 34 | 18 | 9 |
| A8 | 8.57 | 32 | 5 | 1 |
| A9 | 12.82 | 17 | 4 | 1 |
| A10 | 25.93 | 10 | 5 | 2 |
>TRINITY_DN115354_c0_g1_i9 from sample A3 / Example spliced isoformTGTTATAACTTTAAGTTGCTTTGTTCTATTCGTATCTTAGTATCGGTGGTTTCTTAAGTCTCACAATAGCATAGTATCGGTGGTTTCTTAACTCTGTGTGAGACTGTGTGAGATAGAGGAGGAGACTTACATATTTACATTGGAGATAGAGGAGGAGACTGACATATTTACATTGGAGGTACTTAACTTCAGCGCCTTTT
TTGTGAAGAAGAATACTTTACCCTGTGTAAAAGCCAAATGACTTTTTTGGCAGGGAACCTATGGTCTTAGATCTAAGGTGGAGGCTAAACCCAAGACACTATCAAGCCGAAGAAACACAGTGCAGCCATGAAAAATGGTGAAGAGAATGCTACCTCTACAGAGAATTCCAATGTACCAAAGGTATGAATGAATTTAAAGT
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GGATAATTGCTACTCGAATGATAAATAATTCTAGCTTGGTTTACCTGAGTAAAATTAAAAGTTATGCCTATGTCACTAGGGTAGGGTTTAAAGGTGGTAACTATTAACCCCGCGATTATGATCAACGGTGAATCCAGTAATAACTGGTACAAAGGCTGACGGATTACTACCTTTGCTATCCTTGCATATACTATACTCGA
TAGGTAGGGCTGTGATATCAAGACCAGAC
>TRINITY_DN115354_c0_g1_i4 from sample A3 / Example unspliced isoform:GGAAATTTATCTAGAGAATGATTTATGAGTGATCTGTTTTTTCATGTATTAAATTTAATTTTTGAATAAACATTTTTAAGATCAGTTTGAGTTTTGTAAAGTTTTATGTTAACTTTACATTACTATTCGATGGTAAAAGTAGTCTTGGTCCAGTGAAAATTTTCGCATTTGGCTTGGGGGCTTGGGGTTTCGATTCTTAT
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GACTTACATATTTACATTGGAGATAGAGGAGGAGACTGACATATTTACATTGGAGGTACTTAACTTCAGCGCCTTTTTTGTGAAGAAGAATACTTTACCCTGTGTAAAAGCCAAATGACTTTTTTGGCAGGGAACCTATGGTCTTAGATCTAAGgtgatttttcaaaaaatttctctctaaatatgtttatcaaactggt
cttcgtgattatgattaattaaatcatgggtttccatagttttctgtaaattgacatcatgtatttgatatcgaacatgggcacgaatgccatattattccattttcatgtcgtcctagGTGGAGGCTAAACCCAAGACACTATCAAGCCGAAGAAACACAGTGCAGCCATGAAAAATGGTGAAGAGAATGCTACCTCTA
CAGAGAATTCCAATGTACCAAAGGTATGAATGAATTTAAATTTGATTGTAATATATAATATATGTTAGAATCATTTTTGAATTACGAAACTATTTATTAATTTAATTAATAATAAATACCTCATCCAGAAAACAAATAATATAGTTCACTGGAATTAATACAGGAATATTTTAATGAGTAGTACAAATACTATAGTTCAC
TGGAATTAATACAGGAATATTTTAATGAGTAGTGATCGTAGGATAGTTGTTACTCAGATGAATACAGGAATATTTTAATTAGCAGTGGCGGTAGGATAATTGCTACTCGAATGATAAATAATTCTAGCTTGGTTTACCTGAGTAAAATTAAAAGTTATGCCTATGTCACTAGGGTAGGGTTTAAAGGTGGTAACTATTAA
CCCCGCGATTATGATCAACGGTGAATCCAGTAATAACTGGTACAAAGGCTGACGGATTACTACCTTTGCTATCCTTGCATATACTATACTATTACTTTTTGAATTAGAGACAAATCTAATTCTACATGATTCCAGCATGTAAAATGACCCGTTCTTCCTTTTGG