NA ----> NA
Intron 1 GTAATGTTTA ... GAAATGGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 36.84 | 12 | 6 | 8 |
| A2 | 16.67 | 15 | 3 | 3 |
| A3 | 52.94 | 4 | 7 | 2 |
| A4 | 33.33 | 4 | 4 | 0 |
| A5 | 25 | 3 | 2 | 0 |
| A6 | 28.12 | 23 | 7 | 11 |
| A7 | 16.67 | 25 | 5 | 5 |
| A8 | 16.96 | 93 | 27 | 11 |
| A9 | 18.84 | 56 | 12 | 14 |
| A10 | 25 | 24 | 11 | 5 |
>TRINITY_DN35243_c0_g1_i4 from sample A6 / Example spliced isoformCTTTTTTTCCATCAAACAGATTTTGTCTTCTATAAACTAATGCATTAATATGTTCATCCATCTGCAGGTGACACCTCCGTTTCCCACTGTACTTGCGGCCTGCCCTATTGTACAATTCGAGGATTCATGCCTTCCAGCTTCACTTCAGCAACGTGAACAATGTTCTCACTTCAGCTTTGGCAGCAAAGTGATATTGCCAC
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>TRINITY_DN35243_c0_g1_i2 from sample A6 / Example unspliced isoform:CTTTTTTTCCATCAAACAGATTTTGTCTTCTATAAACTAATGCATTAATATGTTCATCCATCTGCAGGTGACACCTCCGTTTCCCACTGTACTTGCGGCCTGCCCTATTGTACAATTCGAGGATTCATGCCTTCCAGCTTCACTTCAGCAACGTGAACAATGTTCTCACTTCAGCTTTGGCAGCAAAGTGATATTGCCAC
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GGAAAGGCAGGCTTCAAACAAAATAGGGCATCTTTTCTTGCACAAGCTTCTGTTCCTATGACAGTCTGCATGCCAGATGTCCCTCGAAACTTTTGCAGACAGATCTTTAGGCCGCATTTTACAGAGAGTTTCTCCTAGAGCTTGCCAGTCAGGGTTTATCTTCAAGAATTTCCTTTTCTAAATTAAAGTGAAGATCTCAA
TTGACAGgtaatgtttaaactttaaagctacttatagttcactgtcatttaatagcaggaatcatggagtgcatgtcctggggtttttattggatggtttccttggcatcatccattgcattgttcatttgcttggctcattgaatcatgataaagttgcttctactgaggcatattcatgattgaatcgaaatggcagG
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TGTTTCAATGTTTTGGGAAATGCTATTTTCTTCATGCATTGTAAGCAATGCACAAGATGTTAAACTTTTATTCTTGATTCCACTGGCTGAAAACAACTCCTAAGTTTTGGGAAAGATCCAGAGTTTAACAGCCTTGATTGATTGATATACAGCAAGTTCAGATCTTTTGTACACGTTCCTTTTATGTCTTTTCAATTATG
TGCTGCTGTTTTATTGGAGGCTTTTATTCAATTTTGCTACGGTTGCTTCCTTAATTTCTCACCTTTATTGGCAAT