sp|Q9FT73|RECQ2_ARATH ----> ATP-dependent DNA helicase Q-like 2


Intron 1 GTATGCCTTT ... TCTTCTGCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
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A102044418



>TRINITY_DN115631_c1_g1_i5 from sample A3 / Example spliced isoform
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GACACTTGCGATGTATGCGAAATTGGATTTTATAGGCCTGCATTACAAAATTCTAACCAAAAAACAAATTCATCGTGTTTGCCGTCATGGCCAACTCGATACAATGAAGTAGAATGCTCTGCTCCTTCTTCAAGCACAGCAAACGAAACAAATCATTTGCTGTCTTCTTCCAGGAAGTGATTCAACCAGTTGGCTGGTGT
ACCTCGCCAACGGAATAACACACCATGGAAGAAGAATTTGAGCAGCAGCTTCAGATTGTTGAAGAAGAACTTGAACAAGTCCAAGTCCAGATAAATGATTTGCTTGAGCAGCAGGAGAAGCTAAATCGGCAGAAATCAGAGTTGCAAAGCTTGTTAAAAGCTTGTAGAGTATCAACAGTCCATGGTCAAAATGCTAACAT
TGTGGCAGCTGAAGGACATGCAGAATACTGGGCAGGATCATTTGAGTGGGATCAGCAGGCTAATGATATTCGATTAAATGTGTTTGGTATTCCTACGTATCGTGTAAACCAGCGAGAGATAATAAATGCTGTCATGAGTGGAAGAGATGTTGTTGTAATAATGGCCGCAGGTGGTGGCAAGAGTCTTTGTTACCAGCTTC
CTGCCTTCCTTTGGCCTGGGACTGCCCTTGTTGTGAGCCCCTTACTTTCACTTATACAGGATCAGGTGATGGGACTTACTGCTCTAAAAATTCCAGCAGGCATGTTGACATCTACAACCTCAAAAGAAAATGAAAAGTCGATCTATAAGGCTCTTGAAAAGGGTGAAGGGGAACTTAAGGTTTTGTACGTGACACCAGAA
AAGATATCAAAGAGTAAGCGGTTTATGTCAAAACTTGAAAAATGCAACCATGCAGGCCGCCTTTCTTTGATAGCAATTGATGAGGCACATTGCTGTAGCCAATGGGGACATGATTTTCGACCTGATTATAAAAAGCTTGGTATTATGAAAACTCAATTTCCAAAGGTGCCGATGATTGCATTAACGGCTACCGCCACTCA
GCGGGTTCAGACAGATTTGAAAGAGATGTTGCAAGTTTCCAGGTGTGTTACATTTGTGAGTAGTGTGAACAGGCCGAACCTATTTTATGAGGTCCGCGAGAAGTCCTCAAATGCCATGGTAGTCATTGATGATGTAGCAAGTTTTATACGTGGATCCTACCAGAACAAGGAGTCTGGAATTGTCTACTGCTTTACACGAA
AAGAATGTGAACAGGTCGCTAAGGAATTGCGGCAGCGTGGTATATTGGCGGATTATTATCATGCAGATATGGATGCAAAGGCTCGTGAAAGTGTTCATCTTCGTTGGAGTACAAACAAGTTACAAGTTATAGTAGGCACGGTTGCATTTGGCATGGGTATTAACAAGCCAGATGTCAGATTTGTCATTCACCACAGTATT
AGCAAATCATTGGAGACATATTATCAGGAAAGTGGCCGAGCAGGTCGTGATGGCCTTCCATCACATTGTTTGCTATACTTCAGGCCAGCTGATCTTCCTCGACAGAGTTCAATGGTCTTCTATGAGCATGCTGGCTTGGAAAATCTTTATGCTATTGCTCGTTTTTGTCAGTCAAAAAGTAGTTGCCGCCGTGCAGCATT
TTTCCGTCACTTTGGCGAGCCATTACAAGAATGCAATGGCATGTGTGATAACTGTTCTTTTTCAAAGGAGATAAAGGATGTTGATATCACTCCTCATGCAAGATCTCTGGTATCCTTAGTGAATGAAATGCAAAGTAATGATCAACGGGCTACTTTGTTGCAACTGGTTGATAATTGGAAGACAAAGTGCCGACAAGCAG
GGACAGATGCATCTACAAAAGAGCTTGCCAAAGATATGAAGAAAGAGGATGTGGAGCAAATGATTGTTCAACTTATATTACATGGAGTGTTGCAAGAAGAGTTCCAACATACAGCATATGCCACAAATGCATACATTGTACCTGGACCATTATCAAAGAGGTTGCTACAAGGACAAAAGGTGGTGAAGTTGGAGATGATT
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TGTGTGTATCTAGTAGTGATAATGAGTCAAAAGACCTAGATGGAACCAAAGATGATGATGACTTTGAAATCTCCACCATTAAAAGATCAAAAAAGACTTGAGTAGTCATCCTTGAAGGGAGATCGCGACCTTCATTGGCTTTGACACAAACATAAGCACCGCATTGCTGCTTATTTTATTATTTTACCACCTTACATCAT
TGTAAAGGAGATGTTTCAAGGAAAATGCAGGTAAAATAACAAATTTTTACGAGTCAATACACCTTTTGTTTGTAATTAAACACTCTTTTGTCTGCAGTCAACTTAGAAAAAATAAGTTTTTTCCTTCAACTCTTCAAGGAGAATATGACATCATGTAACAATATTTTAATCAAATCAACAAAAACACAGATGACAAAAAA
ATCACTGAAGAA


>TRINITY_DN115631_c1_g1_i6 from sample A3 / Example unspliced isoform:
GATATAACATCACGCTGCAACATATTCCTTCGGTTTAAGTGCAATGTCCAAGAACATAACATCACATAGAAGTTCCATCGACCTAACTATTCCTTTTGATGTACCCATAATAAAAACAACTGTCTTTCATACTTGCAACACTTCGGTGGACCTCGCTACCGAGGGCTGGCTGTTTTTCTTGAAGTAAAAATTTCGCGGGA
GACACTTGCGATGTATGCGAAATTGGATTTTATAGGCCTGCATTACAAAATTCTAACCAAAAAACAAATTCATCGTGTTTGCCGTCATGGCCAACTCGATACAATGAAGTAGAATGCTCTGCTCCTTCTTCAAGCACAGCAAACGAAACAAATCATTTGCTGTCTTCTTCCAGGAAGTGATTCAACCAGTTGGCTGGTGT
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TGTGGCAGCTGAAGGACATGCAGAATACTGGGCAGGATCATTTGAGTGGGATCAGCAGGCTAATGATATTCGATTAAATGTGTTTGGTATTCCTACGTATCGTGTAAACCAGCGAGAGATAATAAATGCTGTCATGAGTGGAAGAGATGTTGTTGTAATAATGGCCGCAGGTGGTGGCAAGAGTCTTTGTTACCAGCTTC
CTGCCTTCCTTTGGCCTGGGACTGCCCTTGTTGTGAGCCCCTTACTTTCACTTATACAGGATCAGGTGATGGGACTTACTGCTCTAAAAATTCCAGCAGGCATGTTGACATCTACAACCTCAAAAGAAAATGAAAAGTCGATCTATAAGGCTCTTGAAAAGGGTGAAGGGGAACTTAAGGTTTTGTACGTGACACCAGAA
AAGATATCAAAGAGTAAGCGGTTTATGTCAAAACTTGAAAAATGCAACCATGCAGGCCGCCTTTCTTTGATAGCAATTGATGAGGCACATTGCTGTAGCCAATGGGGACATGATTTTCGACCTGATTATAAAAAGCTTGGTATTATGAAAACTCAATTTCCAAAGGTGCCGATGATTGCATTAACGGCTACCGCCACTCA
GCGGGTTCAGACAGATTTGAAAGAGATGTTGCAAGTTTCCAGGTGTGTTACATTTGTGAGTAGTGTGAACAGGCCGAACCTATTTTATGAGgtatgccttttttttgctattgttataatgccattactgaaatcgactttaaaatggtcactgcgttacctaattgcatatactgaatgatagcctaaaggctaggatc
tgagaacctgtttcacattcatcttctgcagGTCCGCGAGAAGTCCTCAAATGCCATGGTAGTCATTGATGATGTAGCAAGTTTTATACGTGGATCCTACCAGAACAAGGAGTCTGGAATTGTCTACTGCTTTACACGAAAAGAATGTGAACAGGTCGCTAAGGAATTGCGGCAGCGTGGTATATTGGCGGATTATTATC
ATGCAGATATGGATGCAAAGGCTCGTGAAAGTGTTCATCTTCGTTGGAGTACAAACAAGTTACAAGTTATAGTAGGCACGGTTGCATTTGGCATGGGTATTAACAAGCCAGATGTCAGATTTGTCATTCACCACAGTATTAGCAAATCATTGGAGACATATTATCAGGAAAGTGGCCGAGCAGGTCGTGATGGCCTTCCA
TCACATTGTTTGCTATACTTCAGGCCAGCTGATCTTCCTCGACAGAGTTCAATGGTCTTCTATGAGCATGCTGGCTTGGAAAATCTTTATGCTATTGCTCGTTTTTGTCAGTCAAAAAGTAGTTGCCGCCGTGCAGCATTTTTCCGTCACTTTGGCGAGCCATTACAAGAATGCAATGGCATGTGTGATAACTGTTCTTT
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TGATTGTTCAACTTATATTACATGGAGTGTTGCAAGAAGAGTTCCAACATACAGCATATGCCACAAATGCATACATTGTACCTGGACCATTATCAAAGAGGTTGCTACAAGGACAAAAGGTGGTGAAGTTGGAGATGATTCAAGGACCGAAGGTTGACAGTCAAAATGCTAAGAAGGGAGCATTTCTTGATAATAAGAGC
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ACCTTTTGTTTGTAATTAAACACTCTTTTGTCTGCAGTCAACTTAGAAAAAATAAGTTTTTTCCTTCAACTCTTCAAGGAGAATATGACATCATGTAACAATATTTTAATCAAATCAACAAAAACACAGATGACAAAAAAATCACTGAAGAA