NA ----> NA
Intron 1 GTTCAGTTTA ... TGAAAAAAAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 55.56 | 4 | 3 | 7 |
| A2 | 61.29 | 6 | 10 | 9 |
| A3 | 30.43 | 8 | 2 | 5 |
| A4 | 100 | 0 | 1 | 1 |
| A5 | 50 | 1 | 2 | 0 |
| A6 | 48.84 | 66 | 50 | 76 |
| A7 | 67.73 | 66 | 134 | 143 |
| A8 | 61.42 | 65 | 108 | 99 |
| A9 | 67.57 | 119 | 253 | 243 |
| A10 | 75.27 | 70 | 208 | 218 |
>TRINITY_DN118936_c1_g1_i8 from sample A2 / Example spliced isoformTATATACATTGCGAAGGGTGAGGAGGTCGAGATACAGATGTCATGACTCATAAGTCTTTGAATTCCAAATATTTAAGGCGAATGGTCTTCCCATTCCTATATGCTCATGAATTCCAAATATTGAAGGCGGCTTACTCTCCCTCGATTTCTTAAATTTTTGTTTCATCATGGACTGATTTTGTAGCTGGCAAATCATCGAA
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GCTGCTCCTTTGGTGGTGTCGCTCAGTTCCAGGTGATCCTGCTGCAGATATTCCTGTTTCCCTTGCAGCACCTGCTCCACAGCGAAGAGTTGAACGACTGCAAAGGGAATATTGATGAACCCGAAGGGTCAAAATTCAAAGAACGTCCGCTTTGCATCCATATAATTAATTCATTAATTCATTGTGAGACGGCCGGGACA
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>TRINITY_DN118936_c1_g1_i2 from sample A2 / Example unspliced isoform:TATATACATTGCGAAGGGTGAGGAGGTCGAGATACAGATGTCATGACTCATAAGTCTTTGAATTCCAAATATTTAAGGCGAATGGTCTTCCCATTCCTATATGCTCATGAATTCCAAATATTGAAGGCGGCTTACTCTCCCTCGATTTCTTAAATTTTTGTTTCATCATGGACTGATTTTGTAGCTGGCAAATCATCGAA
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CTTGGCGTTTTCGTGACTGGAGTCCCGATATGTGTGCTGCTCCTTTGGTGGTGTCGCTCAGTTCCAGGTGATCCTGCTGCAGATATTCCTGTTTCCCTTGCAGCACCTGCTCCACAGCGAAGAGTTGAACGACTGCAAAGGGAATATTGATGAACCCGAAGGGTCAAAATTCAAAGAACGTCCGCTTTGCATCCATATAA
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ATGAGATGTCTGTAGCTGATTTCCCATTGCAGTATTGAACATCTTACTTTTGAAAAGATATGGGCAACAGTCATTTTCTGGTCACTGCTCGAATCGTTCTTGCTTTCTGCTTATTTTCTTGTTCTTCGAACGCTCTGTAAAACTATTTTCTTGTTCTTCGACTCCGTGTATATCTAATGACTCCGTTAAAATACTGCGAC
TGTTTGATAATAATATGTTACAATAATCTGAGGGTGTATGTATATATATGCTGGCCATTTATGTTTATCTTGTATTTCCCAATGGTTCATGGCAACTTTAAAACGATGGTTTAACTACGTTACCAATATTCTTTTTGAGTTCAAATTACTGAGCAAAGGATTTTTCATCGTGAATTATAGTCACAAGAATTA