sp|P51566|AFC1_ARATH ----> Serine/threonine-protein kinase AFC1
Intron 1 GTCAGTATTC ... GTAAAAACAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 70.42 | 21 | 39 | 61 |
| A2 | 65.45 | 19 | 21 | 51 |
| A3 | 62.05 | 20.5 | 20 | 47 |
| A4 | 61.55 | 21 | 19 | 48 |
| A5 | 51.92 | 13 | 12 | 16 |
| A6 | 46.07 | 24 | 10 | 31 |
| A7 | 56.66 | 16.5 | 10 | 33 |
| A8 | 71.72 | 7.5 | 17 | 21 |
| A9 | 51 | 12.5 | 9 | 17 |
| A10 | 50.94 | 13 | 7 | 20 |
>TRINITY_DN111949_c0_g1_i6 from sample A5 / Example spliced isoformAGGAACATTTGGTCAAGTTTTGGAATGTTGGGATCGAAAATTAAAAGATCTCGTGGCCATTAAAATCGTACGCGGCTTACAAAAGTACCGAGAGGCTGCAATGATAGAAGTTGATGTGCTTCGTCAAGTTGGCAAATACGATAGAAATGGCACACGTTGTGTGCAGATGCGCGAATGGTTTGACTATCGGAATCACACTT
GCATAGTCTTTGAGAAGCTTGGCCCAAGCTTATATGATTTCCTACGGAAAAACAATTACAGCCCATTTCCCATTGATCTTGTCCGGGAGGTTGGAAGGCAACTGTTGGAATCTGTAGCATACTATGTGAAGGTTCCAGATTGCAAGGGTGTGAAGGGATCTCCAGATGACTTTAAAAGGTTGCCAAAGTCAAGTGCAATA
AAGTTAATTGATTTTGGAAGCACCACATATGAAGATCAAGATCACACCTCAGTGGTCTCAACAAGGCATTATCGGGCCCCTGAAGTTATTTTGGGTCTTGGATGGAACTACCCTTGTGATATTTGGAGTGTAGGGTGCATACTTGTGGAGCTCTGCTCGGGTGAGACTTTGTTTCAAACCCATGAGAACTTGGAACATCT
TGCCATGATGGAAAGGGTCTTAGGGCCTTTGCCACATCATATGATTAAGAAATCAGATAGAAGATATGTGAAATATTTTAGACATGGAACACGATTGAATTGGCCTGAAGGAGCATCCTCTAGAGAGAGCATCAGAGCAGTCAGGAAGTTACCAAAACTTAGGGATTTAATAATGCAGCATGCAGATCACTCTGCAGGTT
TATTTATAGACTTGTTGCAGGGTCTTCTTAAGTTTGAACCATCAGAACGCTTGGAAGCTGCAGAGGCTTTAAGACATCCATTTTTCAGAGAAGATTCAAGAAGATTTGACTATTGCGCAAACAGTTAATGAGTATGCAAATCATGAAAAAATTCCATCTCAGCTTCTGACGCTTGTCTAGCTGGTCATGTATTATAAAAT
GGAGGTTTGGGGAATGGCTCAGTAGTAAACTGTGCAGTGATCATGCGGTGTTTGAGACGAAATGAGTCCTTGCTTCATAAAACTTTGTACCTTACAGATTTGGTTGAAAAATCCACATGTACAATTAGGAGGTCCTTCTCAAGTCCGAACATTTGGAACGCTTTGAAGCTTAAGAGGCTCTGAGACGTCATTTTTTCAGA
GAAGATTTCACGTGACAATTGTTCGGCTGCCCATCTGTGAATCCTATGATTATTGTATTTGTGGCCGAGGTTACTGTGAATGATTGTACACTGCACTTATAGAAATTCGTTCTCGTCTCCTGGAATTATCGAGTAGAATTGTTTGCACTGCTCGTATGGTGTTTGGGACGAAATGAGTCCTAAACATCAGAAAACTTTGT
ACATTAAAAAGTTGGTTCAATAATTGTATATACATACTGGATTGTGC
>TRINITY_DN111949_c0_g1_i10 from sample A5 / Example unspliced isoform:AGGAACATTTGGTCAAGTTTTGGAATGTTGGGATCGAAAATTAAAAGATCTCGTGGCCATTAAAATCGTACGCGGCTTACAAAAGTACCGAGAGGCTGCAATGATAGAAGTTGATGTGCTTCGTCAAGTTGGCAAATACGATAGAAATGGCACACGGTATGAGAGTATTTTCTTTTCTGATGCTGTACTTTGCTGTGCTA
TTTTCACATGCACAATTTAATAAATGGACATGTTGGGTAATATGCTATAAGGATTTCTTGATTTAAACATATATTCTTAGAACTTTCAAATGATCTTTATTTTCTTTATTCAAACCTGAGATGTATGGCCTTTCCCAATACAGTTGTGTGCAGATGCGCGAATGGTTTGACTATCGGAATCACACTTGCATAgtcagtat
tctgtagcaattcataccttaattcttttttctttacaaacgcctaagagtagtctgcattatgtatatggttgttagagtgtgtgtttaaggttgtggatggatgtaaaaacagGTCTTTGAGAAGCTTGGCCCAAGCTTATATGATTTCCTACGGAAAAACAATTACAGCCCATTTCCCATTGATCTTGTACGGGAGG
TTGGAAGGCAACTGTTGGAATCTGTAGCATGTGTGTAGACGATACTTGCACTTATCTTTACATTTGATGTGGGAGGGCTTAAACATATAATTTAATTTTTTAAGGATTGCTTGTCCACTGCCATAACTAGATTGCTTCGTTGGTCATGTTAGCTCACATTTTATGAGGCTAGATTGGGCCTTTATAAGGGTGTTCATAAC
ATCTGTCTAGGATTTTCTTCTCCTAATATTGCCAATGATCTGTGGCAGATATGCATGAGTTGAAACTCGTTCACACGGATTTAAAGCCTGAAAATATACTTTTTGTTTCTTCAGACTATGCGAAGGTTCCAGATTGCAAGGTAGATTGCTCGCGTGTTGTTACTGAATATAATTGAATTTGTCATGGTTGGCATATTATA
TGTTGCCGACATGGCTCAACTCAGTTGATAATATTGTTTATTATTATAGTAGCTCCAGCAAAAAGCTGGTGTATGAAATAACATATTGTTTCTTTGTATTTTTATGCCTTATACTGTTAACAATCGTTACGATCAAACATTTTAACATATTGCTAAGATCAACATTTTAACATGCATTTATCTCAATGAATGAACTCTGA
TAACATTATTGTTGTTCAAAAGGGTGTGAAGGGATCTCCAGATGACTTTAAAAGGTTGCCAAAGTCAAGTGCAATAAAGTTAATTGATTTTGGAAGCACCACATATGAAGATCAAGATCACACCTCAGTGGTCTCAACAAGGCATTATCGGGCCCCTGAAGTTATTTTGGGTGAGCTTAGAAAGATTGTTCTATGGTTTA
GCCAGCAGTTTGAAAGGACCAATGTCAATTCAATCATATGTTGAATCCAAACCCCTTTGTATTTACAATTTATGTTTTACAACAGGTCTTGGATGGAACTACCCTTGTGATATTTGGAGTGTAGGGTGCATACTTGTGGAGCTCTGCTCGGTAAACTTTTTAGACTAGTTTATCTTATGTTAAAATTTTACATAGATACC
TGCAGGAATGATATTTATGCTACCTGCATTTTAAATTTTCAGGGTGAGACTTTGTTTCAAACCCATGAGAACTTGGAACATCTTGCCATGATGGAAAGGGTCTTAGGGCCTTTGCCACATCATATGATTAAGAAATCAGATAGAAGATATGTGAAATATTTTAGACATGGAACACGATTGAATTGGCCTGAAGGAGCATC
CTCTAGAGAGAGCATCAGAGCAGTCAGGAAGTTACCAAAACTTAGGGATTTAATAATGCAGCATGCAGATCACTCTGCAGGTTTATTTATAGACTTGTTGCAGGGTCTTCTTAAGTTTGAACCATCAGAACGCTTGGAAGCTGCAGAGGCTTTAAGACATCCATTTTTCAGAGAAGATTCAAGAAGATTTGACTATTGCG
CAAACAGTTAATGAGTATGCAAATCATGAAAAAATTCCATCTCAGCTTCTGACGCTTGTCTAGCTGGTCATGTATTATAAAATGGAGGTTTGGGGAATGGCTCAGTAGTAAACTGTGCAGTGATCATGCGGTGTTTGAGACGAAATGAGTCCTTGCTTCATAAAACTTTGTACCTTACAGATTTGGTTGAAAAATCCACA
TGTACAATTAGGAGGTCCTTCTCAAGTCCGAACATTTGGAACGCTTTGAAGCTTAAGAGGCTCTGAGACGTCATTTTTTCAGAGAAGATTTCACGTGACAATTGTTCGGCTGCCCATCTGTGAATCCTATGATTATTGTATTTGTGGCCGAGGTTACTGTGAATGATTGTACACTGCACTTATAGAAATTCGTTCTCGTC
TCCTGGAATTATCGAGTAGAATTGTTTGCACTGCTCGTATGGTGTTTGGGACGAAATGAGTCCTAAACATCAGAAAACTTTGTACATTAAAAAGTTGGTTCAATAATTGTATATACATACTGGATTGTGC
Intron 2 GTATGCTTAT ... CTGTTTGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 52.31 | 25 | 22 | 32.9 |
| A2 | 30.43 | 26.2 | 7.9 | 15 |
| A3 | 50.63 | 15.6 | 11.1 | 21 |
| A4 | 74.3 | 8.4 | 19.9 | 28 |
| A5 | 18.01 | 26 | 1.1 | 10.3 |
| A6 | 35.28 | 29.5 | 8.1 | 24 |
| A7 | 49.14 | 28 | 21.1 | 33 |
| A8 | 54.97 | 22.9 | 20.7 | 35 |
| A9 | 46.35 | 22.4 | 16.7 | 22 |
| A10 | 50.96 | 15.9 | 12.7 | 20 |
>TRINITY_DN113022_c0_g1_i1 from sample A1 / Example spliced isoformCAGTAGAAGATATGTGAAATATTTTAGACATGGAACACGATTGAATTGGCCTGAAGGAGCATCCTCTAGAGAGAGCATCAGAGCAGTCAGGAAGTTACCAAAACTTAGGGATTTAATAATGCAGCATGCAGATCACTCTGCAGGTTTATTTATAGACTTGTTGCAGGGTCTTCTTAAGTTTGAACCATCAGAACGCTTGG
AAGCTGCAGAGGCTTTAAGACATCCATTTTTCAGAGAAGATTCAAGAAGATTTGACTATTGCGCAAACAGTTAATGAGTATGCAAATCATGAAAAAATTCCATCTCAGCTTCTGACGCTTGTCTAGCTGGTCATGTATTATAAAATGGAGGTTTGGGGAATGGCTCAGTAGTAAACTGTGCAGTGATCATGCGGTGTTTG
AGACGAAATGAGTCCTTGCTTCATAAAACTTTGTACCTTACAGATTTGGTTGAAAAATCCACATGTACAATTAGGAGGTCCTTCTCAAGTCCGAACATTTGGAACGCTTTGAAGCTTAAGAGGCTCTGAGACGTCATTTTTTCAGAGAAGATTTCACGTGACAATTGTTCGGCTGCCCATCTGTGAATCCTATGATTATT
GTATTTGTGGCCGAGGTTACTGTGAATGATTGTACACTGCACTTATAAAAATTCGTTCTCATCTCCTGGAATTATCGAGTAGAATTGTTTGCACTGCTCGAATGGTGTTTGGGACGAAATGAATCCTAAACATCAGAAAACTTTGTACATTAAAAAGTTGGTTCAATAATTGTATATACTGGATTGTGC
>TRINITY_DN113022_c0_g1_i2 from sample A1 / Example unspliced isoform:CAGTAGAAGATATGTGAAATATTTTAGACATGGAACACGATTGAATTGGCCTGAAGGAGCATCCTCTAGAGAGAGCATCAGAGCAGTCAGGAAGTTACCAAAACTTAGGgtatgcttattatatgactacctggatgcgcatgaaacgtcatcttgaaatattctcttgatgatttgcgatttgtttcatctagttgagt
tataacatgttactctcctgtttgcagGATTTAATAATGCAGCATGCAGATCACTCTGCAGGTTTATTTATAGACTTGTTGCAGGGTCTTCTTAAGTTTGAACCATCAGAACGCTTGGAAGCTGCAGAGGCTTTAAGACATCCATTTTTCAGAGAAGATTCAAGAAGATTTGACTATTGCGCAAACAGTTAATGAGTATG
CAAATCATGAAAAAATTCCATCTCAGCTTCTGACGCTTGTCTAGCTGGTCATGTATTATAAAATGGAGGTTTGGGGAATGGCTCAGTAGTAAACTGTGCAGTGATCATGCGGTGTTTGAGACGAAATGAGTCCTTGCTTCATAAAACTTTGTACCTTACAGATTTGGTTGAAAAATCCACATGTACAATTAGGAGGTCCT
TCTCAAGTCCGAACATTTGGAACGCTTTGAAGCTTAAGAGGCTCTGAGACGTCATTTTTTCAGAGAAGATTTCACGTGACAATTGTTCGGCTGCCCATCTGTGAATCCTATGATTATTGTATTTGTGGCCGAGGTTACTGTGAATGATTGTACACTGCACTTATAAAAATTCGTTCTCATCTCCTGGAATTATCGAGTAG
AATTGTTTGCACTGCTCGAATGGTGTTTGGGACGAAATGAATCCTAAACATCAGAAAACTTTGTACATTAAAAAGTTGGTTCAATAATTGTATATACTGGATTGTGC
Intron 3 GTTGTGTGCA ... CAAAACTTAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 51.4 | 26 | 30 | 25 |
| A2 | 47.2 | 33 | 33 | 26 |
| A3 | 62.5 | 15 | 31 | 19 |
| A4 | 46.34 | 11 | 12 | 7 |
| A5 | 54.02 | 20 | 21 | 26 |
| A6 | 50.52 | 24 | 16 | 33 |
| A7 | 49.33 | 19 | 11 | 26 |
| A8 | 41.86 | 25 | 15 | 21 |
| A9 | 53.12 | 15 | 15 | 19 |
| A10 | 42.34 | 32 | 34 | 13 |
>TRINITY_DN43358_c0_g3_i11 from sample A9 / Example spliced isoformGCCCTCCCAGGGTTTCAAGTCTCTAAAGAAGTGGCACGTTATCGCCTCATTGGTCAGCACCCTGATACAAAGGTTTTTTATGGCTGTTAAGTTAGGCCGGGTGGTCACATCCATAAAGCGTCTCAAAGTAGTGATACGATATGGCCTCATTTGTCAGCACCCTGACAAACGGTTTTTATGGCTGTTAAGCTAGGCCGTGT
GGTCACACCCAAAACGTGTGACAAGAAATCTCACCTCTTTAGTAGGTGAATGAATGGCTGGCACACTAAAGACTCAAGAGGCAAGATTCAGAGATATGTTTTAATTTTTAAAATTGAGAGCCTTTTTTTGGCTTTATATTATTATCGAATATGTCACAGGGGTTTCCTGTCTTTTTATTATTATCGAACATGCCACAGGG
GTTTCCTCTGTCGGTGAAAGAGGCGTTTTGTTATTGCCCTCCCAGGGTTTCAAGTCTCTAAATAAGTGACACGTTATTGCTTCATTGCTCAGCTCCCTGATAGAAAGGGTTTTTATGATAGAAAGGGTTTTTATGCCTGTTAAGTTAGGCCGGGTGGTCACACCCATAAAGTGTGACAAGAAATCTCACCTCTGTAATAG
GTGATGGATGGCTGGCACACTAGAGTCTCAAGGGGAAACATGTAGACATGTTTTAATTTTTGAAACTGGGAGCCTTATTTTGGCTTTTAATTATTAGCGAACATGTCGCAGGGGTTTTCTCTGTCGGTGAAGGAGGGGTTTTGTTATTGGCCTCCCAGGTTTTGAAGTCTCTGAAGAAGTGACACACGTTATCGCCTCAT
TGGTCATCACACTGATACAAAGGGTTTTTATGGCTGTTAAGTTAGGTCGTGCGGTCACACCCATAAATCTCATCTCTTTAATAGGTGATGGAGGGTTGGCACACTAGAGTCTCAAGAGGCAAACATGTAGAGACGTGTTTTAATTTCCGAAACTGAGCCTTTTTTTGTTTCTTGAATACGTAGATAAAATTTTGGGTGCT
TGAACATTGGATAAATTTTATATGACGGAAGCATGTTCAATGTTTACAGGAACATTTGGTCAAGTTTTGGAATGTTGGGATCGAAAATTAAAAGATCTCGTGGCCATTAAAATCGTACGCGGCTTACAAAAGTACCGAGAGGCTGCAATGATAGAAGTTGATGTGCTTCGTCAAGTTGGCAAATACGATAGAAATGGCAC
ACGGATTTAATAATGCAGCATGCAGACCACTCTGCAGGTTTATTTATAGACTTGTTGCAGGGTCTTCTTAAGTTTGAACCATCAGAACGCTTGGAAGCTGCAGAGGCTTTAAGACATCCATTTTTCAGAGAAGATTCAAGAAGATTTGACTATTGCGCAAACAGTTAATGAGTATGCAAATCATGAAAAAATTCCATCTC
AGCTTCTGACGCTTGTCTAGCTGGTCATGTATTATAAAATGGAGGTTTGGGGAATGGCTCAGTAGTAAACTGTGCAGTGATCATGCGGTGTTTGAGACGAAATGAGTCCTTGCTTCATAAAACTTTGTACCTTACAGATTTGGTTGAAAAATCCACATGTACAATTAGGAGGTCCTTCTCAAGTCCGAACATTTGGAACG
CTTTGAAGCTTAAGAGGCTCTGAGACGTCATTTTTTCAGAGAAGATTTCACGTGACAATTGTTCGGCTGCCCATCTGTGAATCCTATGATTATTGTATTTGTGGCCGAGGTTACTGTGAATGATTGTACACTGCACTTATAAAAATTCGTTCTCATCTCCTGGAATTATCGAGTAGAATTGTTTGCACTGCTCGAATGGT
GTTTGGGACGAAATGAATCCTAAACATCAGAAAACTTTGTACATTAAAAAGTTGGTTCAATAATTGTATATACATACTGGATTGTGCTTCTTTATGTTAAATTGCTCA
>TRINITY_DN43358_c0_g3_i13 from sample A9 / Example unspliced isoform:AAGGTCACTTGAGAGCGTTTGTTTCGGCAATCTGATAACGCTATTTTCTTATTCTTCTATCTACAAACCCTTGAAACCCTAGGCCCCAGCGATTAAATTTCTTCCGCAGGTGTTGCGACTCAAGGTTTCAGATCGAGTGCGGCAGCACGTTAGAGCGTTTATTTCGGCCCTCTGAAGCCCCATCTTATTATTCTACCTAC
AAACCCTTGAAACCCTAACCCCAGCGACTCAATATTCCCGGTGGGTGTTGCGACTGAAGGGTTCAGATTGCGAGCGGCGGCCATGGCTTGTGTTGCAAAATATCATCGTCCTCCTCACATGCTTGATGAAAATCCCAGGAAACGCCGCAAGTTAACTTCGTCGTGGGATGTGCTTCCTTCTCAACTCCAGGTCCAGCCAA
CACTGGTATTTACGGGCAAGGATTTTTGTATCGGAAAGATAAATGGAGAAGTGGAGGATACCCCTTTGTTAACAGGGGCGCAACCCTCCATATCCTCATCAGACTGTAGTCGGTCTACGTCTTCAAATGTAAAATCCAAAGAAGAGGGCTCTCGCACTGGCTCCCCACCATGGCGCAGTGATGACAAGGATGGGCATTAC
ATGTTTCAACTGGGAGAGAATTTGACGCCTCGATATAAAATACTCAGTAAAATGGGCGAAGGAACATTTGGTCAAGTTTTGGAATGTTGGGATCGAAAATTAAAAGATCTCGTGGCCATTAAAATCGTACGCGGCTTACAAAAGTACCGAGAGGCTGCAATGATAGAAGTTGATGTGCTTCGTCAAGTTGGCAAATACGA
TAGAAATGGCACACgttgtgtgcagatgcgcgaatggtttgactatcggaatcacacttgcatagtctttgagaagcttggcccaagcttatatgatttcctacggaaaaacaattacagcccatttcccattgatcttgtccgggaggttggaaggcaactgttggaatctgtagcatgtgtgtagacgatacttgcac
ttatctttacatttgatgtgggagggcttaaacatataatttaattttttaaggattgcttgtccactgccataactagattgcttcgttggtcatgttagctcacattttatgaggctagattgggcctttataagggtgttcataacatctgtctaggattttcttctcctaatattgccaatgatctgtggcagata
tgcatgagttgaaactcgttcacacggatttaaagcctgaaaatatactttttgtttcttcagactatgcgaaggttccagattgcaaggtagattgctcgcgtgttgttactgaatataattgaatttgtcatggttggcatattatatgttgccgacatggctcaactcagttgataatattgtttattattatagta
gctccagcaaaaagctggtgtatgaaataacatattgtttctttgtatttttatgccttctactgttaacaatcgttacgatcaaacattttaacatattgctaagatcaacattctaacatgcatttatctcaatgaatgaactctgataacattattgttgttcaaaagggtgtgaagggatctccagatgactttaa
aaggttgccaaagtcaagtgcaataaagttaattgattttggaagcaccacatatgaagatcaagatcacacctcagtggtctcaacaaggcattatcgggcccctgaagttattttgggtcttggatggaactacccttgtgatatttggagtgtagggtgcatacttgtggagctctgctcgggtgagactttgtttc
aaacccatgagaacttggaacatcttgccatgatggaaagggtcttagggcctttgccacatcatatgattaagaaatcagatagaagatatgtgaaatattttagacatggaacacgattgaattggcctgaaggagcatcctctagagagagcatcagagcagtcaggaagttaccaaaacttagGGATTTAATAATG
CAGCATGCAGACCACTCTGCAGGTTTATTTATAGACTTGTTGCAGGGTCTTCTTAAGTTTGAACCATCAGAACGCTTGGAAGCTGCAGAGGCTTTAAGACATCCATTTTTCAGAGAAGATTCAAGAAGATTTGACTATTGCGCAAACAGTTAATGAGTATGCAAATCATGAAAAAATTCCATCTCAGCTTCTGACGCTTG
TCTAGCTGGTCATGTATTATAAAATGGAGGTTTGGGGAATGGCTCAGTAGTAAACTGTGCAGTGATCATGCGGTGTTTGAGACGAAATGAGTCCTTGCTTCATAAAACTTTGTACCTTACAGATTTGGTTGAAAAATCCACATGTACAATTAGGAGGTCCTTCTCAAGTCCGAACATTTGGAACGCTTTGAAGCTTAAGA
GGCTCTGAGACGTCATTTTTTCAGAGAAGATTTCACGTGACAATTGTTCGGCTGCCCATCTGTGAATCCTATGATTATTGTATTTGTGGCCGAGGTTACTGTGAATGATTGTACACTGCACTTATAAAAATTCGTTCTCATCTCCTGGAATTATCGAGTAGAATTGTTTGCACTGCTCGAATGGTGTTTGGGACGAAATG
AATCCTAAACATCAGAAAACTTTGTACATTAAAAAGTTGGTTCAATAATTGTATATACATACTGGATTGTGCTTCTTTATGTTAAATTGCTCA
Intron 4 GTAAACTTTT ... AAATTTTCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 42.47 | 47.9 | 33 | 37.6 |
| A2 | 42.85 | 23.3 | 15.3 | 19.6 |
| A3 | 37.99 | 24.5 | 12 | 18 |
| A4 | 21.38 | 25.3 | 9 | 4.8 |
| A5 | 45.89 | 9.1 | 7.7 | 7.7 |
| A6 | 19.29 | 28.2 | 6 | 7.4 |
| A7 | 19.24 | 63.3 | 14 | 16.2 |
| A8 | 25.87 | 37.8 | 14 | 12.2 |
| A9 | 31.74 | 34.5 | 15 | 17.1 |
| A10 | 12.53 | 44.5 | 6 | 6.8 |
>TRINITY_DN108549_c0_g2_i1 from sample A4 / Example spliced isoformACCTACAAACCCTTGAAACCCTAGCCCCAGCGATTAAATTTCTTCCGCAGGTGTTGCGACTCAAGGTTTCAGATCGAGTGCGGCAGCACGTTAGAGCGTTTATTTCGGCCCTCTGAAGCTCCATCTTATTATTCTACCTACAAACCCTTGAAACCCTAGCCCCAGCGATTAAATTTCTTCCGCAGGTGTTCCGACTCAAG
GGTTCAGATCGAGTGCGTTCAAATCGAGTGCGGCAGCACATGGTTCAGATCGAGTGCGGCAGCACATTAGAGCGTTTATTTCGGCCCTCTGAAGCTCCATCTTATTATTCTACCTACAAACCCTTGAAACCCTAACCCCAGCGACTCAATATTCCCGGTGGGTGTTGCGACTGAAGGGTTCAGATTGCGAGCGGCGGCCA
TGGCTTGTGTTGCAAAATATCATCGTCCTCCTCACATGCTTGATGAAAATCCCAGGAAACGCCGCAAGTTAACTTCGTCGTGGGATGTCCTTCCTTCTCAACTCCAGGTCCAGCCAACACTGGTATTTACGGGCAAGGATTTTTGTATCGGAAAGATAAATGGAGAAGTGGAGGACACCCCTTTGTTAACAGGGGCGCAA
CCCTCCATATCCTCATCAGACTGTAGTCGGTCTACGTCTTCAAATGTAAAATCCAAAGAAGAGGGCTCTCGCACTGGCTCCCCACCATGGCGCAGTGATGACAAGGATGGGCATTACATGTTTCAACTGGGAGAGAATTTGACGCCTCGATATAAAATACTCAGTAAAATGGGCGAAGGAACATTTGGTCAAGTTTTGGA
ATGTTGGGATCGAAAATTAAAAGATCTCGTGGCCATTAAAATCGTACGCGGCTTACAAAAGTACCGAGAGGCTGCAATGATAGAAGTTGATGTGCTTCGTCAAGTTGGCAAATACGATAGAAATGGCACACGCTGTGTGCAGATGCGCGAATGGTTTGACTATCGGAATCACACTTGCATAGTCTTTGAGAAGCTTGGCC
CAAGCTTATATGATTTCCTACGGAAAAACAATTACAGCCCATTTCCCATTGATCTTGTACGGGAGGTTGGAAGGCAACTGTTGGAATCTGTAGCATATATGCATGAGTTGAAACTCGTTCACACGGATTTAAAGCCTGAAAATATACTTTTTGTTTCTTCAGACTATGTGAAGGTTCCAGATTGCAAGGGTGTGAAGGGA
TCTCCAGATGACTTTAAAAGGTTGCCAAAGTCAAGTGCAATAAAGTTAATTGATTTTGGAAGCACCACATATGAAGATCAAGATCACACCTCAGTGGTCTCAACAAGGCATTATCGGGCCCCTGAAGTTATTTTGGGTCTTGGATGGAACTACCCTTGTGATATTTGGAGTGTAGGGTGCATACTTGTGGAGCTCTGCTC
GGGTGAGACTTTGTTTCAAACCCATGAGAACTTGGAACATCTTGCCATGATGGAAAGGGTCTTAGGGCCTTTGCCACATCATATGATTAAGAAATCAGAGTGAGTATTTTTATGTTTGCCGAGGAACTGTTACCTCAATCAGATTATTAGACACGCTATAAAATTCAATATGCCCATGGTAAACCGTAATTTTCAATGTC
ATCCTGTCAACAGTAGAAGATATGTGAAATATTTTAGACATGGAACACGATTGAATTGGCCTGAAGGAGCATCCTCTAGAGAGAGCATCAGAGCAGTCAGGAAGTTACCAAAACTTAGGGTATGCTTATTATATGACTACCTGGATGCGCATGAAACGTCATCTTGAAATATTCTCTTGATGATTTGCGATTTGTTTCAT
CTAGTTGAGTTATAACATGTTACTCTCCTGTTTGCAGGATTTAATAATGCAGCATGCAGATCACTCTGCAGGTTTATTTATAGACTTGTTGCAGGGTCTTCTTAAGTTTGAACCATCAGAACGCTTGGAAGCTGCAGAGGCTTTAAGACATCCATTTTTCAGAGAAGATTCAAGAAGATTTGACTATTGCGCAAACAGTT
AATGAGTATGCAAATCAAGAAAAAATTCCATCTCAGCTTCTGACGCTTGTCTAGCTGGTCATGTATTATAAAATGGAGGTTTGGGGAATGGCTCAGTAGTAAACTGTGCAGTGATCATGCGGTGTTTGAGACGAAATGAGTCCTTGCTTCATAAAACTTTGTACCTTACAGATTTGGTTGAAAAATCCACATGTACAATT
AGGAGGTCCTTCTCAAGTCCGAACATTTGGAACGCTTTGAAGCTTAAGAGGCTCTGAGACGTCATTTTTTCAGAGAAGATTTCACGTGACAATTGTTCGGCTGCCCATCTGTGAATCCTATGATTATTGTATTTGTGGCCGAGGTTACTGTGAATGATTGTACACTGCACTTATAAAAATTCGTTCTCATCTCCTGGAAT
TATCGAGTAGAATTGTTTGCACTGCTCGAATGGTGTTTGGGACGAAATGAATCCTAAACATCAGAAAACTTTGTACATTAAAAAGTTGGTTCAATAATTGTATATACTGGA
>TRINITY_DN108549_c0_g2_i8 from sample A4 / Example unspliced isoform:ATAAAATACTCAGTAAAATGGGCGAAGGAACATTTGGTCAAGTTTTGGAATGTTGGGATCGAAAATTAAAAGATCTCGTGGCCATTAAAATCGTACGCGGCTTACAAAAGTACCGAGAGGCTGCAATGATAGAAGTTGATGTGCTTCGTCAAGTTGGCAAATACGATAGAAATGGCACACGCTGTGTGCAGATGCGCGAA
TGGTTTGACTATCGGAATCACACTTGCATAGTCTTTGAGAAGCTTGGCCCAAGCTTATATGATTTCCTACGGAAAAACAATTACAGCCCATTTCCCATTGATCTTGTCCGGGAGGTTGGAAGGCAACTGTTGGAATCTGTAGCATGTGTGTAGACGATACTTGCACTTATCTTTACATTTGATGTGGGAGGGCTTAAACA
TATAATTTAATTTTTTAAGGATTGCTTGCCCACTGCCATAACTAGATTGCTTCGTTGGTCATGTTAGCTCACATTTTATGAGGCTAGATTGGGCCTTTATAAGGGTGTTCATAACATCTGTCTAGGATTTTCTTCTCCTAATATTGCCAATGATCTGTGGCAGATATGCATGAGTTGAAACTCGTTCACACGGATTTAAA
GCCTGAAAATATACTTTTTGTTTCTTCAGACTATGTGAAGGTTCCAGATTGCAAGGTAGATTGCTCGCGTGTTGTTACTGAATATAATTGAATTTGTCATGGTTGGCATATTATATGTTGCCGACATGGCTCAACTCAGTTGATAATATTGTTTATTATTATAGTAGCTCCAGCAAAAAGCTGGTGTATGAAATAACATA
TTGTTTCTTTGTATTTTTATGCCTTATACTGTTAACAATCGTTACGATCAAACATTTTAACATATTGCTAAGATCAACATTTTAACATGCATTTATCTCAATGAATGAACTCTGATAACATTATTGTTGTTCAAAAGGGTGTGAAGGGATCTCCAGATGACTTTAAAAGGTTGCCAAAGTCAAGTGCAATAAAGTTAATT
GATTTTGGAAGCACCACATATGAAGATCAAGATCACACCTCAGTGGTCTCAACAAGGCATTATCGGGCCCCTGAAGTTATTTTGGGTGAGCTTAGAAAGATTGTTCTATGGTTTAGCCAGCAGTTTGAAAGGACCAATGTCAATTCAATCATGTTGAATCCAAACCCCTTTGTATTTACAATTTATGTTTTACAACAGGT
CTTGGATGGAACTACCCTTGTGATATTTGGAGTGTAGGGTGCATACTTGTGGAGCTCTGCTCGgtaaactttttagactagtttatcttatgttaaaattttacatagatacctgcaggaatgatatttatgctacctgcattttaaattttcagGGTGAGACTTTGTTTCAAACCCATGAGAACTTGGAACATCTTGCC
ATGATGGAAAGGGTCTTAGGGCCTTTGCCACATCATATGATTAAGAAATCAGAGTGAGTATTTTTATGTTTGCCGAGGAACTGTTACCTCAATCAGATTATTAGACACGCTATAAAATTCAATATGCCCATGGTAAACCGTAATTTTCAATGTCATCCTGTCAACAGTAGAAGATATGTGAAATATTTTAGACATGGAAC
ACGATTGAATTGGCCTGAAGGAGCATCCTCTAGAGAGAGCATCAGAGCAGTCAGGAAGTTACCAAAACTTAGGG
Intron 5 GTAGATTGCT ... TGTTCAAAAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 46.2 | 32.4 | 31 | 22 |
| A2 | 40.6 | 40.2 | 37 | 16 |
| A3 | 40.92 | 23.6 | 20 | 11 |
| A4 | 43.55 | 29.6 | 22 | 21 |
| A5 | 43.45 | 21.8 | 15 | 18 |
| A6 | 44.48 | 11.2 | 7 | 10 |
| A7 | 41.7 | 25.6 | 15 | 21 |
| A8 | 42.9 | 12.1 | 6 | 11.4 |
| A9 | 40.84 | 19.1 | 14.4 | 11 |
| A10 | 37.72 | 20 | 11 | 13 |
>TRINITY_DN108549_c0_g2_i1 from sample A4 / Example spliced isoformACCTACAAACCCTTGAAACCCTAGCCCCAGCGATTAAATTTCTTCCGCAGGTGTTGCGACTCAAGGTTTCAGATCGAGTGCGGCAGCACGTTAGAGCGTTTATTTCGGCCCTCTGAAGCTCCATCTTATTATTCTACCTACAAACCCTTGAAACCCTAGCCCCAGCGATTAAATTTCTTCCGCAGGTGTTCCGACTCAAG
GGTTCAGATCGAGTGCGTTCAAATCGAGTGCGGCAGCACATGGTTCAGATCGAGTGCGGCAGCACATTAGAGCGTTTATTTCGGCCCTCTGAAGCTCCATCTTATTATTCTACCTACAAACCCTTGAAACCCTAACCCCAGCGACTCAATATTCCCGGTGGGTGTTGCGACTGAAGGGTTCAGATTGCGAGCGGCGGCCA
TGGCTTGTGTTGCAAAATATCATCGTCCTCCTCACATGCTTGATGAAAATCCCAGGAAACGCCGCAAGTTAACTTCGTCGTGGGATGTCCTTCCTTCTCAACTCCAGGTCCAGCCAACACTGGTATTTACGGGCAAGGATTTTTGTATCGGAAAGATAAATGGAGAAGTGGAGGACACCCCTTTGTTAACAGGGGCGCAA
CCCTCCATATCCTCATCAGACTGTAGTCGGTCTACGTCTTCAAATGTAAAATCCAAAGAAGAGGGCTCTCGCACTGGCTCCCCACCATGGCGCAGTGATGACAAGGATGGGCATTACATGTTTCAACTGGGAGAGAATTTGACGCCTCGATATAAAATACTCAGTAAAATGGGCGAAGGAACATTTGGTCAAGTTTTGGA
ATGTTGGGATCGAAAATTAAAAGATCTCGTGGCCATTAAAATCGTACGCGGCTTACAAAAGTACCGAGAGGCTGCAATGATAGAAGTTGATGTGCTTCGTCAAGTTGGCAAATACGATAGAAATGGCACACGCTGTGTGCAGATGCGCGAATGGTTTGACTATCGGAATCACACTTGCATAGTCTTTGAGAAGCTTGGCC
CAAGCTTATATGATTTCCTACGGAAAAACAATTACAGCCCATTTCCCATTGATCTTGTACGGGAGGTTGGAAGGCAACTGTTGGAATCTGTAGCATATATGCATGAGTTGAAACTCGTTCACACGGATTTAAAGCCTGAAAATATACTTTTTGTTTCTTCAGACTATGTGAAGGTTCCAGATTGCAAGGGTGTGAAGGGA
TCTCCAGATGACTTTAAAAGGTTGCCAAAGTCAAGTGCAATAAAGTTAATTGATTTTGGAAGCACCACATATGAAGATCAAGATCACACCTCAGTGGTCTCAACAAGGCATTATCGGGCCCCTGAAGTTATTTTGGGTCTTGGATGGAACTACCCTTGTGATATTTGGAGTGTAGGGTGCATACTTGTGGAGCTCTGCTC
GGGTGAGACTTTGTTTCAAACCCATGAGAACTTGGAACATCTTGCCATGATGGAAAGGGTCTTAGGGCCTTTGCCACATCATATGATTAAGAAATCAGAGTGAGTATTTTTATGTTTGCCGAGGAACTGTTACCTCAATCAGATTATTAGACACGCTATAAAATTCAATATGCCCATGGTAAACCGTAATTTTCAATGTC
ATCCTGTCAACAGTAGAAGATATGTGAAATATTTTAGACATGGAACACGATTGAATTGGCCTGAAGGAGCATCCTCTAGAGAGAGCATCAGAGCAGTCAGGAAGTTACCAAAACTTAGGGTATGCTTATTATATGACTACCTGGATGCGCATGAAACGTCATCTTGAAATATTCTCTTGATGATTTGCGATTTGTTTCAT
CTAGTTGAGTTATAACATGTTACTCTCCTGTTTGCAGGATTTAATAATGCAGCATGCAGATCACTCTGCAGGTTTATTTATAGACTTGTTGCAGGGTCTTCTTAAGTTTGAACCATCAGAACGCTTGGAAGCTGCAGAGGCTTTAAGACATCCATTTTTCAGAGAAGATTCAAGAAGATTTGACTATTGCGCAAACAGTT
AATGAGTATGCAAATCAAGAAAAAATTCCATCTCAGCTTCTGACGCTTGTCTAGCTGGTCATGTATTATAAAATGGAGGTTTGGGGAATGGCTCAGTAGTAAACTGTGCAGTGATCATGCGGTGTTTGAGACGAAATGAGTCCTTGCTTCATAAAACTTTGTACCTTACAGATTTGGTTGAAAAATCCACATGTACAATT
AGGAGGTCCTTCTCAAGTCCGAACATTTGGAACGCTTTGAAGCTTAAGAGGCTCTGAGACGTCATTTTTTCAGAGAAGATTTCACGTGACAATTGTTCGGCTGCCCATCTGTGAATCCTATGATTATTGTATTTGTGGCCGAGGTTACTGTGAATGATTGTACACTGCACTTATAAAAATTCGTTCTCATCTCCTGGAAT
TATCGAGTAGAATTGTTTGCACTGCTCGAATGGTGTTTGGGACGAAATGAATCCTAAACATCAGAAAACTTTGTACATTAAAAAGTTGGTTCAATAATTGTATATACTGGA
>TRINITY_DN108549_c0_g2_i8 from sample A4 / Example unspliced isoform:ATAAAATACTCAGTAAAATGGGCGAAGGAACATTTGGTCAAGTTTTGGAATGTTGGGATCGAAAATTAAAAGATCTCGTGGCCATTAAAATCGTACGCGGCTTACAAAAGTACCGAGAGGCTGCAATGATAGAAGTTGATGTGCTTCGTCAAGTTGGCAAATACGATAGAAATGGCACACGCTGTGTGCAGATGCGCGAA
TGGTTTGACTATCGGAATCACACTTGCATAGTCTTTGAGAAGCTTGGCCCAAGCTTATATGATTTCCTACGGAAAAACAATTACAGCCCATTTCCCATTGATCTTGTCCGGGAGGTTGGAAGGCAACTGTTGGAATCTGTAGCATGTGTGTAGACGATACTTGCACTTATCTTTACATTTGATGTGGGAGGGCTTAAACA
TATAATTTAATTTTTTAAGGATTGCTTGCCCACTGCCATAACTAGATTGCTTCGTTGGTCATGTTAGCTCACATTTTATGAGGCTAGATTGGGCCTTTATAAGGGTGTTCATAACATCTGTCTAGGATTTTCTTCTCCTAATATTGCCAATGATCTGTGGCAGATATGCATGAGTTGAAACTCGTTCACACGGATTTAAA
GCCTGAAAATATACTTTTTGTTTCTTCAGACTATGTGAAGGTTCCAGATTGCAAGgtagattgctcgcgtgttgttactgaatataattgaatttgtcatggttggcatattatatgttgccgacatggctcaactcagttgataatattgtttattattatagtagctccagcaaaaagctggtgtatgaaataacata
ttgtttctttgtatttttatgccttatactgttaacaatcgttacgatcaaacattttaacatattgctaagatcaacattttaacatgcatttatctcaatgaatgaactctgataacattattgttgttcaaaagGGTGTGAAGGGATCTCCAGATGACTTTAAAAGGTTGCCAAAGTCAAGTGCAATAAAGTTAATT
GATTTTGGAAGCACCACATATGAAGATCAAGATCACACCTCAGTGGTCTCAACAAGGCATTATCGGGCCCCTGAAGTTATTTTGGGTGAGCTTAGAAAGATTGTTCTATGGTTTAGCCAGCAGTTTGAAAGGACCAATGTCAATTCAATCATGTTGAATCCAAACCCCTTTGTATTTACAATTTATGTTTTACAACAGGT
CTTGGATGGAACTACCCTTGTGATATTTGGAGTGTAGGGTGCATACTTGTGGAGCTCTGCTCGGTAAACTTTTTAGACTAGTTTATCTTATGTTAAAATTTTACATAGATACCTGCAGGAATGATATTTATGCTACCTGCATTTTAAATTTTCAGGGTGAGACTTTGTTTCAAACCCATGAGAACTTGGAACATCTTGCC
ATGATGGAAAGGGTCTTAGGGCCTTTGCCACATCATATGATTAAGAAATCAGAGTGAGTATTTTTATGTTTGCCGAGGAACTGTTACCTCAATCAGATTATTAGACACGCTATAAAATTCAATATGCCCATGGTAAACCGTAATTTTCAATGTCATCCTGTCAACAGTAGAAGATATGTGAAATATTTTAGACATGGAAC
ACGATTGAATTGGCCTGAAGGAGCATCCTCTAGAGAGAGCATCAGAGCAGTCAGGAAGTTACCAAAACTTAGGG
Intron 6 GCTGTGTGCA ... CAAAACTTAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 48.62 | 28 | 28 | 25 |
| A2 | 45.74 | 35 | 33 | 26 |
| A3 | 62.5 | 15 | 31 | 19 |
| A4 | 53.85 | 9 | 14 | 7 |
| A5 | 49.47 | 24 | 21 | 26 |
| A6 | 51.58 | 23 | 16 | 33 |
| A7 | 50 | 19 | 12 | 26 |
| A8 | 42.53 | 25 | 16 | 21 |
| A9 | 53.12 | 15 | 15 | 19 |
| A10 | 41.82 | 32 | 34 | 12 |
>TRINITY_DN108549_c0_g2_i3 from sample A4 / Example spliced isoformTCCCAGGGTTTCAAGTCTCTAAAGAAGTGACACGTTATTGCTTCATTGCTCAGCTCCCTGATAGAAAGGGTTTTTATGCCTGTTAAGTTAGGCCGGGTGGTCACACCCATAAAGTGTGACAAGAAATCTCACCTCTGTAATAGGTGATGGATGGCTGGCACACTAGAGTCTCAAGGGGAAACATGTAGACATGTTTTAAT
TTTTGAAACTGGGAGCCTTATTTTGGCTTTTAATTATTAGTGAACATGTCGCAGGGGTTTTCTCTGTCGGTGAAGGAGGGGTTTTGTTATTGGCCTCCCAGGGTTTGAAGTCTCTAAAGAAGTGACACACGTTATCGCCTCATTGGTCATCACACTGATACAAAGGGTTTTTATGGCTGTTAAGTTAGGTCGTGCGGTCA
CACCCATAAATCTCATCTCTTTAATAGGTGATGGAGGGTTGGCACACTAGAGTCTCAAGAGGCAAACATGTAGAGACGTGTTTTAATTTCTGAAACTGAGCCTTTTTTTGTTTCTCGAATACGTAGATAAAATTTTGGGTGCTTGAACATTGGATAAATTTTATATGACGGAAGCATGTTCAATGTTTACAGGAACATTT
GGTCAAGTTTTGGAATGTTGGGATCGAAAATTAAAAGATCTCGTGGCCATTAAAATCGTACGCGGCTTACAAAAGTACCGAGAGGCTGCAATGATAGAAGTTGATGTGCTTCGTCAAGTTGGCAAATACGATAGAAATGGCACACGGATTTAATAATGCAGCATGCAGATCACTCTGCAGGTTTATTTATAGACTTGTTG
CAGGGTCTTCTTAAGTTTGAACCATCAGAACGCTTGGAAGCTGCAGAGGCTTTAAGACATCCATTTTTCAGAGAAGATTCAAGAAGATTTGACTATTGCGCAAACAGTTAATGAGTATGCAAATCAAGAAAAAATTCCATCTCAGCTTCTGACGCTTGTCTAGCTGGTCATGTATTATAAAATGGAGGTTTGGGGAATGG
CTCAGTAGTAAACTGTGCAGTGATCATGCGGTGTTTGAGACGAAATGAGTCCTTGCTTCATAAAACTTTGTACCTTACAGATTTGGTTGAAAAATCCACATGTACAATTAGGAGGTCCTTCTCAAGTCCGAACATTTGGAACGCTTTGAAGCTTAAGAGGCTCTGAGACGTCATTTTTTCAGAGAAGATTTCACGTGACA
ATTGTTCGGCTGCCCATCTGTGAATCCTATGATTATTGTATTTGTGGCCGAGGTTACTGTGAATGATTGTACACTGCACTTATAAAAATTCGTTCTCATCTCCTGGAATTATCGAGTAGAATTGTTTGCACTGCTCGAATGGTGTTTGGGACGAAATGAATCCTAAACATCAGAAAACTTTGTACATTAAAAAGTTGGTT
CAATAATTGTATATACTGGA
>TRINITY_DN108549_c0_g2_i10 from sample A4 / Example unspliced isoform:ACCTACAAACCCTTGAAACCCTAGCCCCAGCGATTAAATTTCTTCCGCAGGTGTTGCGACTCAAGGTTTCAGATCGAGTGCGGCAGCACGTTAGAGCGTTTATTTCGGCCCTCTGAAGCTCCATCTTATTATTCTACCTACAAACCCTTGAAACCCTAGCCCCAGCGATTAAATTTCTTCCGCAGGTGTTCCGACTCAAG
GGTTCAGATCGAGTGCGTTCAAATCGAGTGCGGCAGCACATGGTTCAGATCGAGTGCGGCAGCACATTAGAGCGTTTATTTCGGCCCTCTGAAGCTCCATCTTATTATTCTACCTACAAACCCTTGAAACCCTAACCCCAGCGACTCAATATTCCCGGTGGGTGTTGCGACTGAAGGGTTCAGATTGCGAGCGGCGGCCA
TGGCTTGTGTTGCAAAATATCATCGTCCTCCTCACATGCTTGATGAAAATCCCAGGAAACGCCGCAAGTTAACTTCGTCGTGGGATGTCCTTCCTTCTCAACTCCAGGTCCAGCCAACACTGGTATTTACGGGCAAGGATTTTTGTATCGGAAAGATAAATGGAGAAGTGGAGGACACCCCTTTGTTAACAGGGGCGCAA
CCCTCCATATCCTCATCAGACTGTAGTCGGTCTACGTCTTCAAATGTAAAATCCAAAGAAGAGGGCTCTCGCACTGGCTCCCCACCATGGCGCAGTGATGACAAGGATGGGCATTACATGTTTCAACTGGGAGAGAATTTGACGCCTCGATATAAAATACTCAGTAAAATGGGCGAAGGAACATTTGGTCAAGTTTTGGA
ATGTTGGGATCGAAAATTAAAAGATCTCGTGGCCATTAAAATCGTACGCGGCTTACAAAAGTACCGAGAGGCTGCAATGATAGAAGTTGATGTGCTTCGTCAAGTTGGCAAATACGATAGAAATGGCACACgctgtgtgcagatgcgcgaatggtttgactatcggaatcacacttgcatagtctttgagaagcttggcc
caagcttatatgatttcctacggaaaaacaattacagcccatttcccattgatcttgtacgggaggttggaaggcaactgttggaatctgtagcatatatgcatgagttgaaactcgttcacacggatttaaagcctgaaaatatactttttgtttcttcagactatgtgaaggttccagattgcaagggtgtgaaggga
tctccagatgactttaaaaggttgccaaagtcaagtgcaataaagttaattgattttggaagcaccacatatgaagatcaagatcacacctcagtggtctcaacaaggcattatcgggcccctgaagttattttgggtcttggatggaactacccttgtgatatttggagtgtagggtgcatacttgtggagctctgctc
gggtgagactttgtttcaaacccatgagaacttggaacatcttgccatgatggaaagggtcttagggcctttgccacatcatatgattaagaaatcagatagaagatatgtgaaatattttagacatggaacacgattgaattggcctgaaggagcatcctctagagagagcatcagagcagtcaggaagttaccaaaac
ttagGGATTTAATAATGCAGCATGCAGATCACTCTGCAGGTTTATTTATAGACTTGTTGCAGGGTCTTCTTAAGTTTGAACCATCAGAACGCTTGGAAGCTGCAGAGGCTTTAAGACATCCATTTTTCAGAGAAGATTCAAGAAGATTTGACTATTGCGCAAACAGTTAATGAGTATGCAAATCAAGAAAAAATTCCATC
TCAGCTTCTGACGCTTGTCTAGCTGGTCATGTATTATAAAATGGAGGTTTGGGGAATGGCTCAGTAGTAAACTGTGCAGTGATCATGCGGTGTTTGAGACGAAATGAGTCCTTGCTTCATAAAACTTTGTACCTTACAGATTTGGTTGAAAAATCCACATGTACAATTAGGAGGTCCTTCTCAAGTCCGAACATTTGGAA
CGCTTTGAAGCTTAAGAGGCTCTGAGACGTCATTTTTTCAGAGAAGATTTCACGTGACAATTGTTCGGCTGCCCATCTGTGAATCCTATGATTATTGTATTTGTGGCCGAGGTTACTGTGAATGATTGTACACTGCACTTATAAAAATTCGTTCTCATCTCCTGGAATTATCGAGTAGAATTGTTTGCACTGCTCGAATG
GTGTTTGGGACGAAATGAATCCTAAACATCAGAAAACTTTGTACATTAAAAAGTTGGTTCAATAATTGTATATACTGGA
Intron 7 GTATGAGAGT ... CTGTTTGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 56.2 | 30 | 42 | 35 |
| A2 | 40.68 | 35 | 33 | 15 |
| A3 | 58.9 | 15 | 22 | 21 |
| A4 | 76.92 | 9 | 32 | 28 |
| A5 | 43.53 | 24 | 26 | 11 |
| A6 | 41.03 | 23 | 8 | 24 |
| A7 | 52.27 | 21 | 13 | 33 |
| A8 | 45.26 | 26 | 8 | 35 |
| A9 | 45.45 | 18 | 8 | 22 |
| A10 | 44.72 | 34 | 35 | 20 |
>TRINITY_DN108549_c0_g2_i3 from sample A4 / Example spliced isoformTCCCAGGGTTTCAAGTCTCTAAAGAAGTGACACGTTATTGCTTCATTGCTCAGCTCCCTGATAGAAAGGGTTTTTATGCCTGTTAAGTTAGGCCGGGTGGTCACACCCATAAAGTGTGACAAGAAATCTCACCTCTGTAATAGGTGATGGATGGCTGGCACACTAGAGTCTCAAGGGGAAACATGTAGACATGTTTTAAT
TTTTGAAACTGGGAGCCTTATTTTGGCTTTTAATTATTAGTGAACATGTCGCAGGGGTTTTCTCTGTCGGTGAAGGAGGGGTTTTGTTATTGGCCTCCCAGGGTTTGAAGTCTCTAAAGAAGTGACACACGTTATCGCCTCATTGGTCATCACACTGATACAAAGGGTTTTTATGGCTGTTAAGTTAGGTCGTGCGGTCA
CACCCATAAATCTCATCTCTTTAATAGGTGATGGAGGGTTGGCACACTAGAGTCTCAAGAGGCAAACATGTAGAGACGTGTTTTAATTTCTGAAACTGAGCCTTTTTTTGTTTCTCGAATACGTAGATAAAATTTTGGGTGCTTGAACATTGGATAAATTTTATATGACGGAAGCATGTTCAATGTTTACAGGAACATTT
GGTCAAGTTTTGGAATGTTGGGATCGAAAATTAAAAGATCTCGTGGCCATTAAAATCGTACGCGGCTTACAAAAGTACCGAGAGGCTGCAATGATAGAAGTTGATGTGCTTCGTCAAGTTGGCAAATACGATAGAAATGGCACACGGATTTAATAATGCAGCATGCAGATCACTCTGCAGGTTTATTTATAGACTTGTTG
CAGGGTCTTCTTAAGTTTGAACCATCAGAACGCTTGGAAGCTGCAGAGGCTTTAAGACATCCATTTTTCAGAGAAGATTCAAGAAGATTTGACTATTGCGCAAACAGTTAATGAGTATGCAAATCAAGAAAAAATTCCATCTCAGCTTCTGACGCTTGTCTAGCTGGTCATGTATTATAAAATGGAGGTTTGGGGAATGG
CTCAGTAGTAAACTGTGCAGTGATCATGCGGTGTTTGAGACGAAATGAGTCCTTGCTTCATAAAACTTTGTACCTTACAGATTTGGTTGAAAAATCCACATGTACAATTAGGAGGTCCTTCTCAAGTCCGAACATTTGGAACGCTTTGAAGCTTAAGAGGCTCTGAGACGTCATTTTTTCAGAGAAGATTTCACGTGACA
ATTGTTCGGCTGCCCATCTGTGAATCCTATGATTATTGTATTTGTGGCCGAGGTTACTGTGAATGATTGTACACTGCACTTATAAAAATTCGTTCTCATCTCCTGGAATTATCGAGTAGAATTGTTTGCACTGCTCGAATGGTGTTTGGGACGAAATGAATCCTAAACATCAGAAAACTTTGTACATTAAAAAGTTGGTT
CAATAATTGTATATACTGGA
>TRINITY_DN108549_c0_g2_i12 from sample A4 / Example unspliced isoform:TCCCAGGGTTTCAAGTCTCTAAAGAAGTGACACGTTATTGCTTCATTGCTCAGCTCCCTGATAGAAAGGGTTTTTATGCCTGTTAAGTTAGGCCGGGTGGTCACACCCATAAAGTGTGACAAGAAATCTCACCTCTGTAATAGGTGATGGATGGCTGGCACACTAGAGTCTCAAGGGGAAACATGTAGACATGTTTTAAT
TTTTGAAACTGGGAGCCTTATTTTGGCTTTTAATTATTAGTGAACATGTCGCAGGGGTTTTCTCTGTCGGTGAAGGAGGGGTTTTGTTATTGGCCTCCCAGGGTTTGAAGTCTCTAAAGAAGTGACACACGTTATCGCCTCATTGGTCATCACACTGATACAAAGGGTTTTTATGGCTGTTAAGTTAGGTCGTGCGGTCA
CACCCATAAATCTCATCTCTTTAATAGGTGATGGAGGGTTGGCACACTAGAGTCTCAAGAGGCAAACATGTAGAGACGTGTTTTAATTTCTGAAACTGAGCCTTTTTTTGTTTCTCGAATACGTAGATAAAATTTTGGGTGCTTGAACATTGGATAAATTTTATATGACGGAAGCATGTTCAATGTTTACAGGAACATTT
GGTCAAGTTTTGGAATGTTGGGATCGAAAATTAAAAGATCTCGTGGCCATTAAAATCGTACGCGGCTTACAAAAGTACCGAGAGGCTGCAATGATAGAAGTTGATGTGCTTCGTCAAGTTGGCAAATACGATAGAAATGGCACACGgtatgagagtattttcttttctgatgctgtactttgctgtgctattttcacatg
cacaatttaataaatggacatgttgggtaatatgctataaggatttcttgatttaaacatatattcttagaactttcaaatgatctttattttctttattcaaacctgagatgtatggcctttcccaatacagctgtgtgcagatgcgcgaatggtttgactatcggaatcacacttgcatagtcagtattctgtagcaa
ttcataccttaattctttttttctttacaaacgcctaagagtagtctgcattatgtatatggttgttagagtgtgtgtttaaggttgtggatggatgtaaaaacaggtctttgagaagcttggcccaagcttatatgatttcctacggaaaaacaattacagcccatttcccattgatcttgtccgggaggttggaaggc
aactgttggaatctgtagcatgtgtgtagacgatacttgcacttatctttacatttgatgtgggagggcttaaacatataatttaattttttaaggattgcttgcccactgccataactagattgcttcgttggtcatgttagctcacattttatgaggctagattgggcctttataagggtgttcataacatctgtcta
ggattttcttctcctaatattgccaatgatctgtggcagatatgcatgagttgaaactcgttcacacggatttaaagcctgaaaatatactttttgtttcttcagactatgtgaaggttccagattgcaaggtagattgctcgcgtgttgttactgaatataattgaatttgtcatggttggcatattatatgttgccga
catggctcaactcagttgataatattgtttattattatagtagctccagcaaaaagctggtgtatgaaataacatattgtttctttgtatttttatgccttatactgttaacaatcgttacgatcaaacattttaacatattgctaagatcaacattttaacatgcatttatctcaatgaatgaactctgataacattat
tgttgttcaaaagggtgtgaagggatctccagatgactttaaaaggttgccaaagtcaagtgcaataaagttaattgattttggaagcaccacatatgaagatcaagatcacacctcagtggtctcaacaaggcattatcgggcccctgaagttattttgggtgagcttagaaagattgttctatggtttagccagcagt
ttgaaaggaccaatgtcaattcaatcatatgttgaatccaaacccctttgtatttacaatttatgttttacaacaggtcttggatggaactacccttgtgatatttggagtgtagggtgcatacttgtggagctctgctcgggtgagactttgtttcaaacccatgagaacttggaacatcttgccatgatggaaagggt
cttagggcctttgccacatcatatgattaagaaatcagagtgagtatttttatgtttgccgaggaactgttacctcaatcagattattagacacgctataaaattcaatatgcccatggtaaaccgtaattttcaatgtcatcctgtcaacagtagaagatatgtgaaatattttagacatggaacacgattgaattggc
ctgaaggagcatcctctagagagagcatcagagcagtcaggaagttaccaaaacttagggtatgcttattatatgactacctggatgcgcatgaaacgtcatcttgaaatattctcttgatgatttgcgatttgtttcatctagttgagttataacatgttactctcctgtttgcagGATTTAATAATGCAGCATGCAGA
TCACTCTGCAGGTTTATTTATAGACTTGTTGCAGGGTCTTCTTAAGTTTGAACCATCAGAACGCTTGGAAGCTGCAGAGGCTTTAAGACATCCATTTTTCAGAGAAGATTCAAGAAGATTTGACTATTGCGCAAACAGTTAATGAGTATGCAAATCAAGAAAAAATTCCATCTCAGCTTCTGACGCTTGTCTAGCTGGTC
ATGTATTATAAAATGGAGGTTTGGGGAATGGCTCAGTAGTAAACTGTGCAGTGATCATGCGGTGTTTGAGACGAAATGAGTCCTTGCTTCATAAAACTTTGTACCTTACAGATTTGGTTGAAAAATCCACATGTACAATTAGGAGGTCCTTCTCAAGTCCGAACATTTGGAACGCTTTGAAGCTTAAGAGGCTCTGAGAC
GTCATTTTTTCAGAGAAGATTTCACGTGACAATTGTTCGGCTGCCCATCTGTGAATCCTATGATTATTGTATTTGTGGCCGAGGTTACTGTGAATGATTGTACACTGCACTTATAAAAATTCGTTCTCATCTCCTGGAATTATCGAGTAGAATTGTTTGCACTGCTCGAATGGTGTTTGGGACGAAATGAATCCTAAACA
TCAGAAAACTTTGTACATTAAAAAGTTGGTTCAATAATTGTATATACTGGA
Intron 8 GTGAGCCAGA ... TTCTTAACAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 51.35 | 18 | 20 | 18 |
| A2 | 55.13 | 17.5 | 19 | 24 |
| A3 | 45.45 | 24 | 20 | 20 |
| A4 | 63.08 | 12 | 26 | 15 |
| A5 | 65.16 | 3.5 | 10 | 3 |
| A6 | 44 | 14 | 11 | 11 |
| A7 | 54.84 | 14 | 17 | 17 |
| A8 | 63.33 | 11 | 24 | 14 |
| A9 | 54.1 | 14 | 19 | 14 |
| A10 | 50.62 | 20 | 22 | 19 |
>TRINITY_DN108549_c0_g2_i5 from sample A4 / Example spliced isoformCTGTGTGCAGATGCGCGAATGGTTTGACTATCGGAACCACACTTGCATTGTCAGTATTCTGTGGCAATTTATATCTCTGTTCTTTTTGGCTTACAAACACTTTAAAATACTCTACATCATGTATACGGTTGCTAGCGTGTGTGTTTAAGGTTGTGGATGGATGTAAAAGCAGGTTTTTGAGAAGCTTGGGCCAAGCTTAT
ATGATTTTCTACGGAAAAACAATTACCGCCCATTTCCAATTGATCTTGTCCGGGAGGTTGGAAGGCAACTGTTGGAATCTGTTGCATATATGCATGAGTTGAAACTCGTTCACACGGATTTAAAGCCTGAAAATATACTTTTTGTTTCATCAGACTATGTGAAGGTTCCGGATTGCAAGGGTGTTAAGGGATCTCCAGAT
GAGTTCAAACGGTTGCCAAAGTCAAGTGCAATTAAGATAATTGATTTTGGGAGCACTACATTTGAATATCAAAATCACACCTCAGTTGTTGCTACTCGGCATTATCGAGCTCCTGAAGTTATTTTGGGACTTGGATGGAATTACCCTTGTGATATTTGGAGTATAGGATGCATACTTTTTGAAATCTGCTCGGTAACCTT
TTACATTAGTTTCCCTTATGTTTGAATATTATATACAAACCTGTGAAAATGGTATTTATGTTACCTGCATCTTAACATTGCAGGGAGATACTTTATTTCAGACCCATGAAAACATGGAACATCTTGCTATGATGGAAAGGGTTTTAGGACCTTTGCCTTATCATATGATAAAGAAAGCAGA
>TRINITY_DN108549_c0_g2_i6 from sample A4 / Example unspliced isoform:CTGTGTGCAGATGCGCGAATGGTTTGACTATCGGAACCACACTTGCATTGTCAGTATTCTGTGGCAATTTATATCTCTGTTCTTTTTGGCTTACAAACACTTTAAAATACTCTACATCATGTATACGGTTGCTAGCGTGTGTGTTTAAGGTTGTGGATGGATGTAAAAGCAGGTTTTTGAGAAGCTTGGGCCAAGCTTAT
ATGATTTTCTACGGAAAAACAATTACCGCCCATTTCCAATTGATCTTGTCCGGGAGGTTGGAAGGCAACTGTTGGAATCTGTTGCATGTGTGTAATTATTTTATAAATGCTTTTGTCTGTGTCCCTTCGCTAGATTACTTAATTGGTTGGTTTCTTATAGTGCTGCTCCATTTGTTGAAAGTTGCCAGCTTTTTTAAACT
ACTCCTTAGGTGATCTTTGGCCTCAATTTAGGAGATGAGATTGTCATGGCCCTTGAAAATGTATAAACAAATCGATTTAGGATTTTGTTTTCCTAATTTTGCCAATGATCTGTGACAGATATGCATGAGTTGAAACTCGTTCACACGGATTTAAAGCCTGAAAATATACTTTTTGTTTCATCAGACTATGTGAAGGTTCC
GGATTGCAAGGTAGTTTACCAGCGTGGTGTGTTAGTGGTTATGATTATGATTATGATTAATGGCACATCTAGCCTATCTTGATTAGTGAGCATTAGATAATACTGATTTGTACGGTATTAGAGTGCCATAGCAAAAGACTGAATTGTAGATTATAAAACAACATAATCTTTTGTCAAGGTTTTGGGATGATCTGTGATAT
GTGTAATGGCTATAGTCAACGTTTGAACCTTTCCATCCGTGGTTCATCATCTGGACAATAAATGTTCGTCCTGATGATGAAATTCAGGTGGAAGGGTTTGAGACGTTGATTACAAACACATGGCACATTTAGTAGATCATCCCAAAATCAGGCCTAATGACTGTCACTGTGGGTGACTAATTGAACGTATTTGTCTGTGT
TGTCAATTCATATATCTGTTTTGATGCCCTATATCCACATCATTTTAATTTCTATATTTCAAGACATTTATGTAAAGAAATCCACTCTGATAGTATGGTTGTTGTTCAAAAGGGTGTTAAGGGATCTCCAGATGAGTTCAAACGGTTGCCAAAGTCAAGTGCAATTAAGATAATTGATTTTGGGAGCACTACATTTGAAT
ATCAAAATCACACCTCAGTTGTTGCTACTCGGCATTATCGAGCTCCTGAAGTTATTTTGGgtgagccagaaacattgtttagtggtttagcaagcacattgaaggaccaatgacaattccttcttattgaatctaagccccttttgtattttctatttatgcttcttaacagGACTTGGATGGAATTACCCTTGTGATAT
TTGGAGTATAGGATGCATACTTTTTGAAATCTGCTCGGTAACCTTTTACATTAGTTTCCCTTATGTTTGAATATTATATACAAACCTGTGAAAATGGTATTTATGTTACCTGCATCTTAACATTGCAGGGAGATACTTTATTTCAGACCCATGAAAACATGGAACATCTTGCTATGATGGAAAGGGTTTTAGGACCTTTG
CCTTATCATATGATAAAGAAAGCAGATAGAAGATATGCAAAATATTTTAGACATGGAACAAGACTGAATTGGCCCGAAGGAGCATC
Intron 9 GTGAGTATTT ... CTGTCAACAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 43.13 | 26.8 | 25.5 | 15.5 |
| A2 | 62.51 | 8.9 | 21.8 | 7.9 |
| A3 | 40.29 | 20.8 | 11.2 | 17 |
| A4 | 47.57 | 14.3 | 8.8 | 17.1 |
| A5 | 21.19 | 17 | 1.8 | 7.3 |
| A6 | 31.67 | 22.5 | 9.3 | 11.7 |
| A7 | 43.4 | 17.3 | 15.9 | 10.5 |
| A8 | 49.61 | 15.3 | 12.8 | 17.3 |
| A9 | 53.77 | 18.2 | 18 | 24.3 |
| A10 | 63.49 | 10 | 14.8 | 19.9 |
>TRINITY_DN115041_c1_g3_i1 from sample A2 / Example spliced isoformTTGTGATATTTGGAGTGTAGGGTGCATACTTGTGGAGCTCTGCTCGGGTGAGACTTTGTTTCAAACCCATGAGAACTTGGAACATCTTGCCATGATGGAAAGGGTCTTAGGGCCTTTGCCACATCATATGATTAAGAAATCAGATAGAAGATATGTGAAATATTTTAGACATGGAACACGATTGAATTGGCCTGAAGGAG
CATCCTCTAGAGAGAGCATCAGAGCAGTCAGGAAGTTACCAAAACTTAGGGATTTAATAATGCAGCATGCAGATCACTCTGCAGGTTTATTTATAGACTTGTTGCAGGGTCTTCTTAAGTTTGAACCATCAGAACGCTTGGAAGCTTCAGAGGCTTTAAGACATCCATTTTTCAGAGAAGATTCAAGAAGATTTGACTAT
TGCGCAAACAGTTAATGAGTATGCAAATCAAGAAAAAATTCCATCTCAGCTTCTGACGCTTGTCTAGCTGGTCATGTATTATAAAATGGAGGTTTGGGGAATGGCTCAGTAGTAAACTGTGCAGTGATCATGCGGTGTTTGAGACGAAATGAGTCCTTGCTTCATAAAACTTTGTACATTACAGATTTGGTTGAAAAATC
CACATGTACAATTAGGAGGTCCTTCTCAAGTCCGAACATTTGGAACGCTTTGAAGCTTAAGAGGCTCTGAGACGTCATTTTTTCAGAGAAGATTTCACGTGACAATTGTTCGGCTGCCCATCTGTGAATCCTATGATTATTGTATTTGTGGCCGAGGTTACTGTGAATGATTGTACACTGCACTTATAGAAATTCGTTCT
CGTCTCCTGGAATTATCGAGTAGAATTGTTTGCACTGCTCGTATGGTGTTTGGGACGAAATGAGTCCTAAACATCAGAAAACTTTGTACATTAAAAAGTTGGTTCAATAATTGTATATACATACTGGATTGTGCTTCTTTATGTTAAATTGCTCTTTAGTTATTATATTTTGTCACGATGAATTGCGAAGTCTTCACCAT
AGTTTCATAGCCGTTACTGCCTGGTAATATTCAG
>TRINITY_DN115041_c1_g3_i3 from sample A2 / Example unspliced isoform:AGATACCTGCAGGAATGATATTTATGCTACCTGCATTTTAAATTTTCAGGGTGAGACTTTGTTTCAAACCCATGAGAACTTGGAACATCTTGCCATGATGGAAAGGGTCTTAGGGCCTTTGCCACATCATATGATTAAGAAATCAGAgtgagtatttttttgtttgccgaggaactgttacctcaatcagattattagac
acgctataaaattcaatatgcccatggtaaaccgtaattttcaatgtcatcctgtcaacagTAGAAGATATGTGAAATATTTTAGACATGGAACACGATTGAATTGGCCTGAAGGAGCATCCTCTAGAGAGAGCATCAGAGCAGTCAGGAAGTTACCAAAACTTAGGGTATGCTTATTATATGACTACCTGGATGCGCAT
GAAACGTCATCTTGAAATATTCTCTTGTTGATTTGCGATTTGTTTCACCTAGTTGAGTTATAACATGTTACTCTCCTGTTTGCAGGATTTAATAATGCAGCATGCAGATCACTCTGCAGGTTTATTTATAGACTTGTTGCAGGGTCTTCTTAAGTTTGAACCATCAGAACGCTTGGAAGCTTCAGAGGCTTTAAGACATC
CATTTTTCAGAGAAGATTCAAGAAGATTTGACTATTGCGCAAACAGTTAATGAGTATGCAAATCAAGAAAAAATTCCATCTCAGCTTCTGACGCTTGTCTAGCTGGTCATGTATTATAAAATGGAGGTTTGGGGAATGGCTCAGTAGTAAACTGTGCAGTGATCATGCGGTGTTTGAGACGAAATGAGTCCTTGCTTCAT
AAAACTTTGTACATTACAGATTTGGTTGAAAAATCCACATGTACAATTAGGAGGTCCTTCTCAAGTCCGAACATTTGGAACGCTTTGAAGCTTAAGAGGCTCTGAGACGTCATTTTTTCAGAGAAGATTTCACGTGACAATTGTTCGGCTGCCCATCTGTGAATCCTATGATTATTGTATTTGTGGCCGAGGTTACTGTG
AATGATTGTACACTGCACTTATAGAAATTCGTTCTCGTCTCCTGGAATTATCGAGTAGAATTGTTTGCACTGCTCGTATGGTGTTTGGGACGAAATGAGTCCTAAACATCAGAAAACTTTGTACATTAAAAAGTTGGTTCAATAATTGTATATACATACTGGATTGTGCTTCTTTATGTTAAATTGCTCTTTAGTTATTA
TATTTTGTCACGATGAATTGCGAAGTCTTCACCATAGTTTCATAGCCGTTACTGCCTGGTAATATTCAG
Intron 10 GTGTGTAGAC ... TCTGTGGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 63.65 | 25 | 41.6 | 46.1 |
| A2 | 56.01 | 24 | 30.8 | 30.4 |
| A3 | 60.6 | 18.5 | 30.6 | 26.3 |
| A4 | 54.91 | 28 | 38.4 | 29.8 |
| A5 | 54.66 | 12 | 16.8 | 12.2 |
| A6 | 43.9 | 15.5 | 17.2 | 7.3 |
| A7 | 37.86 | 31.5 | 21.1 | 17.4 |
| A8 | 50.82 | 8.5 | 11.3 | 6.3 |
| A9 | 58.98 | 10 | 10.8 | 17.8 |
| A10 | 60.78 | 9.5 | 16.4 | 13 |
>TRINITY_DN108549_c0_g2_i1 from sample A4 / Example spliced isoformACCTACAAACCCTTGAAACCCTAGCCCCAGCGATTAAATTTCTTCCGCAGGTGTTGCGACTCAAGGTTTCAGATCGAGTGCGGCAGCACGTTAGAGCGTTTATTTCGGCCCTCTGAAGCTCCATCTTATTATTCTACCTACAAACCCTTGAAACCCTAGCCCCAGCGATTAAATTTCTTCCGCAGGTGTTCCGACTCAAG
GGTTCAGATCGAGTGCGTTCAAATCGAGTGCGGCAGCACATGGTTCAGATCGAGTGCGGCAGCACATTAGAGCGTTTATTTCGGCCCTCTGAAGCTCCATCTTATTATTCTACCTACAAACCCTTGAAACCCTAACCCCAGCGACTCAATATTCCCGGTGGGTGTTGCGACTGAAGGGTTCAGATTGCGAGCGGCGGCCA
TGGCTTGTGTTGCAAAATATCATCGTCCTCCTCACATGCTTGATGAAAATCCCAGGAAACGCCGCAAGTTAACTTCGTCGTGGGATGTCCTTCCTTCTCAACTCCAGGTCCAGCCAACACTGGTATTTACGGGCAAGGATTTTTGTATCGGAAAGATAAATGGAGAAGTGGAGGACACCCCTTTGTTAACAGGGGCGCAA
CCCTCCATATCCTCATCAGACTGTAGTCGGTCTACGTCTTCAAATGTAAAATCCAAAGAAGAGGGCTCTCGCACTGGCTCCCCACCATGGCGCAGTGATGACAAGGATGGGCATTACATGTTTCAACTGGGAGAGAATTTGACGCCTCGATATAAAATACTCAGTAAAATGGGCGAAGGAACATTTGGTCAAGTTTTGGA
ATGTTGGGATCGAAAATTAAAAGATCTCGTGGCCATTAAAATCGTACGCGGCTTACAAAAGTACCGAGAGGCTGCAATGATAGAAGTTGATGTGCTTCGTCAAGTTGGCAAATACGATAGAAATGGCACACGCTGTGTGCAGATGCGCGAATGGTTTGACTATCGGAATCACACTTGCATAGTCTTTGAGAAGCTTGGCC
CAAGCTTATATGATTTCCTACGGAAAAACAATTACAGCCCATTTCCCATTGATCTTGTACGGGAGGTTGGAAGGCAACTGTTGGAATCTGTAGCATATATGCATGAGTTGAAACTCGTTCACACGGATTTAAAGCCTGAAAATATACTTTTTGTTTCTTCAGACTATGTGAAGGTTCCAGATTGCAAGGGTGTGAAGGGA
TCTCCAGATGACTTTAAAAGGTTGCCAAAGTCAAGTGCAATAAAGTTAATTGATTTTGGAAGCACCACATATGAAGATCAAGATCACACCTCAGTGGTCTCAACAAGGCATTATCGGGCCCCTGAAGTTATTTTGGGTCTTGGATGGAACTACCCTTGTGATATTTGGAGTGTAGGGTGCATACTTGTGGAGCTCTGCTC
GGGTGAGACTTTGTTTCAAACCCATGAGAACTTGGAACATCTTGCCATGATGGAAAGGGTCTTAGGGCCTTTGCCACATCATATGATTAAGAAATCAGAGTGAGTATTTTTATGTTTGCCGAGGAACTGTTACCTCAATCAGATTATTAGACACGCTATAAAATTCAATATGCCCATGGTAAACCGTAATTTTCAATGTC
ATCCTGTCAACAGTAGAAGATATGTGAAATATTTTAGACATGGAACACGATTGAATTGGCCTGAAGGAGCATCCTCTAGAGAGAGCATCAGAGCAGTCAGGAAGTTACCAAAACTTAGGGTATGCTTATTATATGACTACCTGGATGCGCATGAAACGTCATCTTGAAATATTCTCTTGATGATTTGCGATTTGTTTCAT
CTAGTTGAGTTATAACATGTTACTCTCCTGTTTGCAGGATTTAATAATGCAGCATGCAGATCACTCTGCAGGTTTATTTATAGACTTGTTGCAGGGTCTTCTTAAGTTTGAACCATCAGAACGCTTGGAAGCTGCAGAGGCTTTAAGACATCCATTTTTCAGAGAAGATTCAAGAAGATTTGACTATTGCGCAAACAGTT
AATGAGTATGCAAATCAAGAAAAAATTCCATCTCAGCTTCTGACGCTTGTCTAGCTGGTCATGTATTATAAAATGGAGGTTTGGGGAATGGCTCAGTAGTAAACTGTGCAGTGATCATGCGGTGTTTGAGACGAAATGAGTCCTTGCTTCATAAAACTTTGTACCTTACAGATTTGGTTGAAAAATCCACATGTACAATT
AGGAGGTCCTTCTCAAGTCCGAACATTTGGAACGCTTTGAAGCTTAAGAGGCTCTGAGACGTCATTTTTTCAGAGAAGATTTCACGTGACAATTGTTCGGCTGCCCATCTGTGAATCCTATGATTATTGTATTTGTGGCCGAGGTTACTGTGAATGATTGTACACTGCACTTATAAAAATTCGTTCTCATCTCCTGGAAT
TATCGAGTAGAATTGTTTGCACTGCTCGAATGGTGTTTGGGACGAAATGAATCCTAAACATCAGAAAACTTTGTACATTAAAAAGTTGGTTCAATAATTGTATATACTGGA
>TRINITY_DN108549_c0_g2_i12 from sample A4 / Example unspliced isoform:TCCCAGGGTTTCAAGTCTCTAAAGAAGTGACACGTTATTGCTTCATTGCTCAGCTCCCTGATAGAAAGGGTTTTTATGCCTGTTAAGTTAGGCCGGGTGGTCACACCCATAAAGTGTGACAAGAAATCTCACCTCTGTAATAGGTGATGGATGGCTGGCACACTAGAGTCTCAAGGGGAAACATGTAGACATGTTTTAAT
TTTTGAAACTGGGAGCCTTATTTTGGCTTTTAATTATTAGTGAACATGTCGCAGGGGTTTTCTCTGTCGGTGAAGGAGGGGTTTTGTTATTGGCCTCCCAGGGTTTGAAGTCTCTAAAGAAGTGACACACGTTATCGCCTCATTGGTCATCACACTGATACAAAGGGTTTTTATGGCTGTTAAGTTAGGTCGTGCGGTCA
CACCCATAAATCTCATCTCTTTAATAGGTGATGGAGGGTTGGCACACTAGAGTCTCAAGAGGCAAACATGTAGAGACGTGTTTTAATTTCTGAAACTGAGCCTTTTTTTGTTTCTCGAATACGTAGATAAAATTTTGGGTGCTTGAACATTGGATAAATTTTATATGACGGAAGCATGTTCAATGTTTACAGGAACATTT
GGTCAAGTTTTGGAATGTTGGGATCGAAAATTAAAAGATCTCGTGGCCATTAAAATCGTACGCGGCTTACAAAAGTACCGAGAGGCTGCAATGATAGAAGTTGATGTGCTTCGTCAAGTTGGCAAATACGATAGAAATGGCACACGGTATGAGAGTATTTTCTTTTCTGATGCTGTACTTTGCTGTGCTATTTTCACATG
CACAATTTAATAAATGGACATGTTGGGTAATATGCTATAAGGATTTCTTGATTTAAACATATATTCTTAGAACTTTCAAATGATCTTTATTTTCTTTATTCAAACCTGAGATGTATGGCCTTTCCCAATACAGCTGTGTGCAGATGCGCGAATGGTTTGACTATCGGAATCACACTTGCATAGTCAGTATTCTGTAGCAA
TTCATACCTTAATTCTTTTTTTCTTTACAAACGCCTAAGAGTAGTCTGCATTATGTATATGGTTGTTAGAGTGTGTGTTTAAGGTTGTGGATGGATGTAAAAACAGGTCTTTGAGAAGCTTGGCCCAAGCTTATATGATTTCCTACGGAAAAACAATTACAGCCCATTTCCCATTGATCTTGTCCGGGAGGTTGGAAGGC
AACTGTTGGAATCTGTAGCATgtgtgtagacgatacttgcacttatctttacatttgatgtgggagggcttaaacatataatttaattttttaaggattgcttgcccactgccataactagattgcttcgttggtcatgttagctcacattttatgaggctagattgggcctttataagggtgttcataacatctgtcta
ggattttcttctcctaatattgccaatgatctgtggcagATATGCATGAGTTGAAACTCGTTCACACGGATTTAAAGCCTGAAAATATACTTTTTGTTTCTTCAGACTATGTGAAGGTTCCAGATTGCAAGGTAGATTGCTCGCGTGTTGTTACTGAATATAATTGAATTTGTCATGGTTGGCATATTATATGTTGCCGA
CATGGCTCAACTCAGTTGATAATATTGTTTATTATTATAGTAGCTCCAGCAAAAAGCTGGTGTATGAAATAACATATTGTTTCTTTGTATTTTTATGCCTTATACTGTTAACAATCGTTACGATCAAACATTTTAACATATTGCTAAGATCAACATTTTAACATGCATTTATCTCAATGAATGAACTCTGATAACATTAT
TGTTGTTCAAAAGGGTGTGAAGGGATCTCCAGATGACTTTAAAAGGTTGCCAAAGTCAAGTGCAATAAAGTTAATTGATTTTGGAAGCACCACATATGAAGATCAAGATCACACCTCAGTGGTCTCAACAAGGCATTATCGGGCCCCTGAAGTTATTTTGGGTGAGCTTAGAAAGATTGTTCTATGGTTTAGCCAGCAGT
TTGAAAGGACCAATGTCAATTCAATCATATGTTGAATCCAAACCCCTTTGTATTTACAATTTATGTTTTACAACAGGTCTTGGATGGAACTACCCTTGTGATATTTGGAGTGTAGGGTGCATACTTGTGGAGCTCTGCTCGGGTGAGACTTTGTTTCAAACCCATGAGAACTTGGAACATCTTGCCATGATGGAAAGGGT
CTTAGGGCCTTTGCCACATCATATGATTAAGAAATCAGAGTGAGTATTTTTATGTTTGCCGAGGAACTGTTACCTCAATCAGATTATTAGACACGCTATAAAATTCAATATGCCCATGGTAAACCGTAATTTTCAATGTCATCCTGTCAACAGTAGAAGATATGTGAAATATTTTAGACATGGAACACGATTGAATTGGC
CTGAAGGAGCATCCTCTAGAGAGAGCATCAGAGCAGTCAGGAAGTTACCAAAACTTAGGGTATGCTTATTATATGACTACCTGGATGCGCATGAAACGTCATCTTGAAATATTCTCTTGATGATTTGCGATTTGTTTCATCTAGTTGAGTTATAACATGTTACTCTCCTGTTTGCAGGATTTAATAATGCAGCATGCAGA
TCACTCTGCAGGTTTATTTATAGACTTGTTGCAGGGTCTTCTTAAGTTTGAACCATCAGAACGCTTGGAAGCTGCAGAGGCTTTAAGACATCCATTTTTCAGAGAAGATTCAAGAAGATTTGACTATTGCGCAAACAGTTAATGAGTATGCAAATCAAGAAAAAATTCCATCTCAGCTTCTGACGCTTGTCTAGCTGGTC
ATGTATTATAAAATGGAGGTTTGGGGAATGGCTCAGTAGTAAACTGTGCAGTGATCATGCGGTGTTTGAGACGAAATGAGTCCTTGCTTCATAAAACTTTGTACCTTACAGATTTGGTTGAAAAATCCACATGTACAATTAGGAGGTCCTTCTCAAGTCCGAACATTTGGAACGCTTTGAAGCTTAAGAGGCTCTGAGAC
GTCATTTTTTCAGAGAAGATTTCACGTGACAATTGTTCGGCTGCCCATCTGTGAATCCTATGATTATTGTATTTGTGGCCGAGGTTACTGTGAATGATTGTACACTGCACTTATAAAAATTCGTTCTCATCTCCTGGAATTATCGAGTAGAATTGTTTGCACTGCTCGAATGGTGTTTGGGACGAAATGAATCCTAAACA
TCAGAAAACTTTGTACATTAAAAAGTTGGTTCAATAATTGTATATACTGGA
Intron 11 GTGAGTTTTT ... CTGTCAACAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 51.52 | 16 | 20 | 14 |
| A2 | 42.86 | 18 | 16 | 11 |
| A3 | 30.56 | 25 | 17 | 5 |
| A4 | 35.48 | 20 | 14 | 8 |
| A5 | 40 | 9 | 4 | 8 |
| A6 | 42.11 | 22 | 10 | 22 |
| A7 | 42.86 | 24 | 11 | 25 |
| A8 | 47.95 | 19 | 12 | 23 |
| A9 | 46.39 | 26 | 20 | 25 |
| A10 | 54.13 | 25 | 30 | 29 |
>TRINITY_DN111949_c0_g1_i5 from sample A5 / Example spliced isoformATCAGACTATGTGAAGGTTCCGGATTGCAAGGGTGTTAAGGGATCTCCAGATGAGTTCAAACGGTTGCCAAAGTCAAGTGCAATTAAGATAATTGATTTTGGGAGCACTACATTTGAATATCAAAATCACACCTCAGTTGTTGCTACTCGGCATTATCGAGCTCCTGAAGTTATTTTGGGACTTGGATGGAATTACCCTT
GTGATATTTGGAGTATAGGATGCATACTTTTTGAAATCTGCTCGGTAACCTTTTACATTAGTTTCCCTTATGTTTGAATATTATATACAAACCTGTGAAAATGGTATTTATGTTACCTGCATCTTAACATTGCAGGGAGATACTTTATTTCAGACCCATGAAAACATGGAACATCTTGCTATGATGGAAAGGGTTTTAGG
ACCTTTGCCTTATCATATGATAAAGAAAGCAGATAGAAGATATGCAAAATATTTTAGACATGGAACAAGATTGAATTGGCCCGAAGGAGCATCTTCTAGAGAGAGCATCAGAACAGTGAGGAAATTACCAAAGCTTAGGGATTTGATAATGCAGCATGTAGACCATTCCACAGGTCCTTTTATAGACTTGTTGCAAGGCC
TTCTCAAGTTTGAAC
>TRINITY_DN111949_c0_g1_i7 from sample A5 / Example unspliced isoform:AGTATTCTGTAGCAATTCATACCTTAATTCTTTTTTCTTTACAAACGCCTAAGAGTAGTCTGCATTATGTATATGGTTGTTAGAGTGTGTGTTTAAGGTTGTGGATGGATGTAAAAGCAGGTTTTTGAGAAGCTTGGGCCAAGCTTATATGATTTTCTACGGAAAAACAATTACCGCCCATTTCCAATTGATCTTGTCCG
GGAGGTTGGAAGGCAACTGTTGGAATCTGTTGCATGTGTGTAATTATTTTATAAATGCTTTTGTCTGTGTCCCTTCGCTAGATTACTTAATTGGTTGGTTTCTTATAGTGCTGCTCCATTTGTTGAAAGTTGCCAGCTTTTTTAAACTACTCCTTAGGTGATCTTTGGCCTCAATTTAGGAGATGAGATTGTCATGGCCC
TTGAAAATGTATAAACAAATCGATTTAGGATTTTGTTTTCCTAATTTTGCCAATGATCTGTGACAGATATGCATGAGTTGAAACTCGTTCACACGGATTTAAAGCCTGAAAATATACTTTTTGTTTCATCAGACTATGTGAAGGTTCCGGATTGCAAGGTAGTTTACCAGCGTGGTGTGTTAGTGGTTATGATTATGATT
ATGATTAATGGCACATCTAGCCTATCTTGATTAGTGAGCATTAGATAATACTGATTTGTACGGTATTAGAGTGCCATAGCAAAAGACTGAATTGTAGATTATAAAACAACATAATCTTTTGTCAAGGTTTTGGGATGATCTGTGATATGTGTAATGGCTATAGTCAACGTTTGAACCTTTCCATCCGTGGTTCATCATCT
GGACAATAAATGTTCGTCCTGATGATGAAATTCAGGTGGAAGGGTTTGAGACGTTGATTACAAACACATGGCACATTTAGTAGATCATCCCAAAATCAGGCCTAATGACTGTCACTGTGGGTGACTAATTGAACGTATTTGTCTGTGTTGTCAATTCATATATCTGTTTTGATGCCCTATATCCACATCATTTTAATTTC
TATATTTCAAGGCATTTATGTAAAGAAATCCACTCTGATAGTATGGTTGTTGTTCAAAAGGGTGTTAAGGGATCTCCAGATGAGTTCAAACGGTTGCCAAAGTCAAGTGCAATTAAGATAATTGATTTTGGGAGCACTACATTTGAATATCAAAATCACACCTCAGTTGTTGCTACTCGGCATTATCGAGCTCCTGAAGT
TATTTTGGGTGAGCCAGAAACATTGTTTAGTGGTTTAGCAAGCACATTGAAGGACCAATGACAATTCCTTCTTATTGAATCTAAGCCCCTTTTGTATTTTCTATTTATGCTTCTTAACAGGACTTGGATGGAATTACCCTTGTGATATTTGGAGTATAGGATGCATACTTTTTGAAATCTGCTCGGTAACCTTTTACATT
AGTTTCCCTTATGTTTGAATATTATATACAAACCTGTGAAAATGGTATTTATGTTACCTGCATCTTAACATTGCAGGGAGATACTTTATTTCAGACCCATGAAAACATGGAACATCTTGCTATGATGGAAAGGGTTTTAGGACCTTTGCCTTATCATATGATAAAGAAAGCAGAgtgagttttttgatgtttgccaaggg
gtgttaccctaatcagattagatactgtaaaaggccaaatacttacattaaaccataactttcaatgttatcctgtcaacagTAGAAGATATGCAAAATATTTTAGACATGGAACAAGATTGAATTGGCCCGAAGGAGCATCTTCTAGAGAGAGCATCAGAACAGTGAGGAAATTACCAAAGCTTAGGGATTTGATAATG
CAGCATGTAGACCATTCCACAGGTCCTTTTATAGACTTGTTGCAAGGCCTTCTCAAGTTTGAAC
Intron 12 GTATGAGAGT ... CCCAATACAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 54.17 | 33 | 42 | 35 |
| A2 | 42.03 | 32.4 | 33 | 14 |
| A3 | 34.88 | 28.4 | 22 | 8 |
| A4 | 63.56 | 11.6 | 32 | 8 |
| A5 | 50.29 | 19.9 | 26 | 14 |
| A6 | 34.9 | 16.9 | 8 | 10 |
| A7 | 51.98 | 12.1 | 13 | 13 |
| A8 | 42.5 | 14.2 | 8 | 13 |
| A9 | 35.74 | 14.4 | 8 | 8 |
| A10 | 40.03 | 31.1 | 35 | 6 |
>TRINITY_DN108549_c0_g2_i1 from sample A4 / Example spliced isoformACCTACAAACCCTTGAAACCCTAGCCCCAGCGATTAAATTTCTTCCGCAGGTGTTGCGACTCAAGGTTTCAGATCGAGTGCGGCAGCACGTTAGAGCGTTTATTTCGGCCCTCTGAAGCTCCATCTTATTATTCTACCTACAAACCCTTGAAACCCTAGCCCCAGCGATTAAATTTCTTCCGCAGGTGTTCCGACTCAAG
GGTTCAGATCGAGTGCGTTCAAATCGAGTGCGGCAGCACATGGTTCAGATCGAGTGCGGCAGCACATTAGAGCGTTTATTTCGGCCCTCTGAAGCTCCATCTTATTATTCTACCTACAAACCCTTGAAACCCTAACCCCAGCGACTCAATATTCCCGGTGGGTGTTGCGACTGAAGGGTTCAGATTGCGAGCGGCGGCCA
TGGCTTGTGTTGCAAAATATCATCGTCCTCCTCACATGCTTGATGAAAATCCCAGGAAACGCCGCAAGTTAACTTCGTCGTGGGATGTCCTTCCTTCTCAACTCCAGGTCCAGCCAACACTGGTATTTACGGGCAAGGATTTTTGTATCGGAAAGATAAATGGAGAAGTGGAGGACACCCCTTTGTTAACAGGGGCGCAA
CCCTCCATATCCTCATCAGACTGTAGTCGGTCTACGTCTTCAAATGTAAAATCCAAAGAAGAGGGCTCTCGCACTGGCTCCCCACCATGGCGCAGTGATGACAAGGATGGGCATTACATGTTTCAACTGGGAGAGAATTTGACGCCTCGATATAAAATACTCAGTAAAATGGGCGAAGGAACATTTGGTCAAGTTTTGGA
ATGTTGGGATCGAAAATTAAAAGATCTCGTGGCCATTAAAATCGTACGCGGCTTACAAAAGTACCGAGAGGCTGCAATGATAGAAGTTGATGTGCTTCGTCAAGTTGGCAAATACGATAGAAATGGCACACGCTGTGTGCAGATGCGCGAATGGTTTGACTATCGGAATCACACTTGCATAGTCTTTGAGAAGCTTGGCC
CAAGCTTATATGATTTCCTACGGAAAAACAATTACAGCCCATTTCCCATTGATCTTGTACGGGAGGTTGGAAGGCAACTGTTGGAATCTGTAGCATATATGCATGAGTTGAAACTCGTTCACACGGATTTAAAGCCTGAAAATATACTTTTTGTTTCTTCAGACTATGTGAAGGTTCCAGATTGCAAGGGTGTGAAGGGA
TCTCCAGATGACTTTAAAAGGTTGCCAAAGTCAAGTGCAATAAAGTTAATTGATTTTGGAAGCACCACATATGAAGATCAAGATCACACCTCAGTGGTCTCAACAAGGCATTATCGGGCCCCTGAAGTTATTTTGGGTCTTGGATGGAACTACCCTTGTGATATTTGGAGTGTAGGGTGCATACTTGTGGAGCTCTGCTC
GGGTGAGACTTTGTTTCAAACCCATGAGAACTTGGAACATCTTGCCATGATGGAAAGGGTCTTAGGGCCTTTGCCACATCATATGATTAAGAAATCAGAGTGAGTATTTTTATGTTTGCCGAGGAACTGTTACCTCAATCAGATTATTAGACACGCTATAAAATTCAATATGCCCATGGTAAACCGTAATTTTCAATGTC
ATCCTGTCAACAGTAGAAGATATGTGAAATATTTTAGACATGGAACACGATTGAATTGGCCTGAAGGAGCATCCTCTAGAGAGAGCATCAGAGCAGTCAGGAAGTTACCAAAACTTAGGGTATGCTTATTATATGACTACCTGGATGCGCATGAAACGTCATCTTGAAATATTCTCTTGATGATTTGCGATTTGTTTCAT
CTAGTTGAGTTATAACATGTTACTCTCCTGTTTGCAGGATTTAATAATGCAGCATGCAGATCACTCTGCAGGTTTATTTATAGACTTGTTGCAGGGTCTTCTTAAGTTTGAACCATCAGAACGCTTGGAAGCTGCAGAGGCTTTAAGACATCCATTTTTCAGAGAAGATTCAAGAAGATTTGACTATTGCGCAAACAGTT
AATGAGTATGCAAATCAAGAAAAAATTCCATCTCAGCTTCTGACGCTTGTCTAGCTGGTCATGTATTATAAAATGGAGGTTTGGGGAATGGCTCAGTAGTAAACTGTGCAGTGATCATGCGGTGTTTGAGACGAAATGAGTCCTTGCTTCATAAAACTTTGTACCTTACAGATTTGGTTGAAAAATCCACATGTACAATT
AGGAGGTCCTTCTCAAGTCCGAACATTTGGAACGCTTTGAAGCTTAAGAGGCTCTGAGACGTCATTTTTTCAGAGAAGATTTCACGTGACAATTGTTCGGCTGCCCATCTGTGAATCCTATGATTATTGTATTTGTGGCCGAGGTTACTGTGAATGATTGTACACTGCACTTATAAAAATTCGTTCTCATCTCCTGGAAT
TATCGAGTAGAATTGTTTGCACTGCTCGAATGGTGTTTGGGACGAAATGAATCCTAAACATCAGAAAACTTTGTACATTAAAAAGTTGGTTCAATAATTGTATATACTGGA
>TRINITY_DN108549_c0_g2_i12 from sample A4 / Example unspliced isoform:TCCCAGGGTTTCAAGTCTCTAAAGAAGTGACACGTTATTGCTTCATTGCTCAGCTCCCTGATAGAAAGGGTTTTTATGCCTGTTAAGTTAGGCCGGGTGGTCACACCCATAAAGTGTGACAAGAAATCTCACCTCTGTAATAGGTGATGGATGGCTGGCACACTAGAGTCTCAAGGGGAAACATGTAGACATGTTTTAAT
TTTTGAAACTGGGAGCCTTATTTTGGCTTTTAATTATTAGTGAACATGTCGCAGGGGTTTTCTCTGTCGGTGAAGGAGGGGTTTTGTTATTGGCCTCCCAGGGTTTGAAGTCTCTAAAGAAGTGACACACGTTATCGCCTCATTGGTCATCACACTGATACAAAGGGTTTTTATGGCTGTTAAGTTAGGTCGTGCGGTCA
CACCCATAAATCTCATCTCTTTAATAGGTGATGGAGGGTTGGCACACTAGAGTCTCAAGAGGCAAACATGTAGAGACGTGTTTTAATTTCTGAAACTGAGCCTTTTTTTGTTTCTCGAATACGTAGATAAAATTTTGGGTGCTTGAACATTGGATAAATTTTATATGACGGAAGCATGTTCAATGTTTACAGGAACATTT
GGTCAAGTTTTGGAATGTTGGGATCGAAAATTAAAAGATCTCGTGGCCATTAAAATCGTACGCGGCTTACAAAAGTACCGAGAGGCTGCAATGATAGAAGTTGATGTGCTTCGTCAAGTTGGCAAATACGATAGAAATGGCACACGgtatgagagtattttcttttctgatgctgtactttgctgtgctattttcacatg
cacaatttaataaatggacatgttgggtaatatgctataaggatttcttgatttaaacatatattcttagaactttcaaatgatctttattttctttattcaaacctgagatgtatggcctttcccaatacagCTGTGTGCAGATGCGCGAATGGTTTGACTATCGGAATCACACTTGCATAGTCAGTATTCTGTAGCAA
TTCATACCTTAATTCTTTTTTTCTTTACAAACGCCTAAGAGTAGTCTGCATTATGTATATGGTTGTTAGAGTGTGTGTTTAAGGTTGTGGATGGATGTAAAAACAGGTCTTTGAGAAGCTTGGCCCAAGCTTATATGATTTCCTACGGAAAAACAATTACAGCCCATTTCCCATTGATCTTGTCCGGGAGGTTGGAAGGC
AACTGTTGGAATCTGTAGCATGTGTGTAGACGATACTTGCACTTATCTTTACATTTGATGTGGGAGGGCTTAAACATATAATTTAATTTTTTAAGGATTGCTTGCCCACTGCCATAACTAGATTGCTTCGTTGGTCATGTTAGCTCACATTTTATGAGGCTAGATTGGGCCTTTATAAGGGTGTTCATAACATCTGTCTA
GGATTTTCTTCTCCTAATATTGCCAATGATCTGTGGCAGATATGCATGAGTTGAAACTCGTTCACACGGATTTAAAGCCTGAAAATATACTTTTTGTTTCTTCAGACTATGTGAAGGTTCCAGATTGCAAGGTAGATTGCTCGCGTGTTGTTACTGAATATAATTGAATTTGTCATGGTTGGCATATTATATGTTGCCGA
CATGGCTCAACTCAGTTGATAATATTGTTTATTATTATAGTAGCTCCAGCAAAAAGCTGGTGTATGAAATAACATATTGTTTCTTTGTATTTTTATGCCTTATACTGTTAACAATCGTTACGATCAAACATTTTAACATATTGCTAAGATCAACATTTTAACATGCATTTATCTCAATGAATGAACTCTGATAACATTAT
TGTTGTTCAAAAGGGTGTGAAGGGATCTCCAGATGACTTTAAAAGGTTGCCAAAGTCAAGTGCAATAAAGTTAATTGATTTTGGAAGCACCACATATGAAGATCAAGATCACACCTCAGTGGTCTCAACAAGGCATTATCGGGCCCCTGAAGTTATTTTGGGTGAGCTTAGAAAGATTGTTCTATGGTTTAGCCAGCAGT
TTGAAAGGACCAATGTCAATTCAATCATATGTTGAATCCAAACCCCTTTGTATTTACAATTTATGTTTTACAACAGGTCTTGGATGGAACTACCCTTGTGATATTTGGAGTGTAGGGTGCATACTTGTGGAGCTCTGCTCGGGTGAGACTTTGTTTCAAACCCATGAGAACTTGGAACATCTTGCCATGATGGAAAGGGT
CTTAGGGCCTTTGCCACATCATATGATTAAGAAATCAGAGTGAGTATTTTTATGTTTGCCGAGGAACTGTTACCTCAATCAGATTATTAGACACGCTATAAAATTCAATATGCCCATGGTAAACCGTAATTTTCAATGTCATCCTGTCAACAGTAGAAGATATGTGAAATATTTTAGACATGGAACACGATTGAATTGGC
CTGAAGGAGCATCCTCTAGAGAGAGCATCAGAGCAGTCAGGAAGTTACCAAAACTTAGGGTATGCTTATTATATGACTACCTGGATGCGCATGAAACGTCATCTTGAAATATTCTCTTGATGATTTGCGATTTGTTTCATCTAGTTGAGTTATAACATGTTACTCTCCTGTTTGCAGGATTTAATAATGCAGCATGCAGA
TCACTCTGCAGGTTTATTTATAGACTTGTTGCAGGGTCTTCTTAAGTTTGAACCATCAGAACGCTTGGAAGCTGCAGAGGCTTTAAGACATCCATTTTTCAGAGAAGATTCAAGAAGATTTGACTATTGCGCAAACAGTTAATGAGTATGCAAATCAAGAAAAAATTCCATCTCAGCTTCTGACGCTTGTCTAGCTGGTC
ATGTATTATAAAATGGAGGTTTGGGGAATGGCTCAGTAGTAAACTGTGCAGTGATCATGCGGTGTTTGAGACGAAATGAGTCCTTGCTTCATAAAACTTTGTACCTTACAGATTTGGTTGAAAAATCCACATGTACAATTAGGAGGTCCTTCTCAAGTCCGAACATTTGGAACGCTTTGAAGCTTAAGAGGCTCTGAGAC
GTCATTTTTTCAGAGAAGATTTCACGTGACAATTGTTCGGCTGCCCATCTGTGAATCCTATGATTATTGTATTTGTGGCCGAGGTTACTGTGAATGATTGTACACTGCACTTATAAAAATTCGTTCTCATCTCCTGGAATTATCGAGTAGAATTGTTTGCACTGCTCGAATGGTGTTTGGGACGAAATGAATCCTAAACA
TCAGAAAACTTTGTACATTAAAAAGTTGGTTCAATAATTGTATATACTGGA
Intron 13 GTCAGTATTC ... GTAAAAACAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 69.32 | 23.7 | 37.9 | 68.1 |
| A2 | 63.34 | 21.4 | 22.1 | 51 |
| A3 | 61.77 | 21.4 | 21.1 | 47.9 |
| A4 | 60.4 | 22.3 | 17.4 | 49.8 |
| A5 | 52.63 | 12.9 | 10.9 | 17.8 |
| A6 | 50.28 | 23.8 | 11.1 | 37.2 |
| A7 | 59.95 | 15.8 | 9.5 | 37.4 |
| A8 | 67.98 | 8.6 | 14.4 | 21.9 |
| A9 | 51.43 | 13.1 | 9.5 | 17.9 |
| A10 | 46.76 | 13.7 | 4.9 | 19.1 |
>TRINITY_DN108549_c0_g2_i1 from sample A4 / Example spliced isoformACCTACAAACCCTTGAAACCCTAGCCCCAGCGATTAAATTTCTTCCGCAGGTGTTGCGACTCAAGGTTTCAGATCGAGTGCGGCAGCACGTTAGAGCGTTTATTTCGGCCCTCTGAAGCTCCATCTTATTATTCTACCTACAAACCCTTGAAACCCTAGCCCCAGCGATTAAATTTCTTCCGCAGGTGTTCCGACTCAAG
GGTTCAGATCGAGTGCGTTCAAATCGAGTGCGGCAGCACATGGTTCAGATCGAGTGCGGCAGCACATTAGAGCGTTTATTTCGGCCCTCTGAAGCTCCATCTTATTATTCTACCTACAAACCCTTGAAACCCTAACCCCAGCGACTCAATATTCCCGGTGGGTGTTGCGACTGAAGGGTTCAGATTGCGAGCGGCGGCCA
TGGCTTGTGTTGCAAAATATCATCGTCCTCCTCACATGCTTGATGAAAATCCCAGGAAACGCCGCAAGTTAACTTCGTCGTGGGATGTCCTTCCTTCTCAACTCCAGGTCCAGCCAACACTGGTATTTACGGGCAAGGATTTTTGTATCGGAAAGATAAATGGAGAAGTGGAGGACACCCCTTTGTTAACAGGGGCGCAA
CCCTCCATATCCTCATCAGACTGTAGTCGGTCTACGTCTTCAAATGTAAAATCCAAAGAAGAGGGCTCTCGCACTGGCTCCCCACCATGGCGCAGTGATGACAAGGATGGGCATTACATGTTTCAACTGGGAGAGAATTTGACGCCTCGATATAAAATACTCAGTAAAATGGGCGAAGGAACATTTGGTCAAGTTTTGGA
ATGTTGGGATCGAAAATTAAAAGATCTCGTGGCCATTAAAATCGTACGCGGCTTACAAAAGTACCGAGAGGCTGCAATGATAGAAGTTGATGTGCTTCGTCAAGTTGGCAAATACGATAGAAATGGCACACGCTGTGTGCAGATGCGCGAATGGTTTGACTATCGGAATCACACTTGCATAGTCTTTGAGAAGCTTGGCC
CAAGCTTATATGATTTCCTACGGAAAAACAATTACAGCCCATTTCCCATTGATCTTGTACGGGAGGTTGGAAGGCAACTGTTGGAATCTGTAGCATATATGCATGAGTTGAAACTCGTTCACACGGATTTAAAGCCTGAAAATATACTTTTTGTTTCTTCAGACTATGTGAAGGTTCCAGATTGCAAGGGTGTGAAGGGA
TCTCCAGATGACTTTAAAAGGTTGCCAAAGTCAAGTGCAATAAAGTTAATTGATTTTGGAAGCACCACATATGAAGATCAAGATCACACCTCAGTGGTCTCAACAAGGCATTATCGGGCCCCTGAAGTTATTTTGGGTCTTGGATGGAACTACCCTTGTGATATTTGGAGTGTAGGGTGCATACTTGTGGAGCTCTGCTC
GGGTGAGACTTTGTTTCAAACCCATGAGAACTTGGAACATCTTGCCATGATGGAAAGGGTCTTAGGGCCTTTGCCACATCATATGATTAAGAAATCAGAGTGAGTATTTTTATGTTTGCCGAGGAACTGTTACCTCAATCAGATTATTAGACACGCTATAAAATTCAATATGCCCATGGTAAACCGTAATTTTCAATGTC
ATCCTGTCAACAGTAGAAGATATGTGAAATATTTTAGACATGGAACACGATTGAATTGGCCTGAAGGAGCATCCTCTAGAGAGAGCATCAGAGCAGTCAGGAAGTTACCAAAACTTAGGGTATGCTTATTATATGACTACCTGGATGCGCATGAAACGTCATCTTGAAATATTCTCTTGATGATTTGCGATTTGTTTCAT
CTAGTTGAGTTATAACATGTTACTCTCCTGTTTGCAGGATTTAATAATGCAGCATGCAGATCACTCTGCAGGTTTATTTATAGACTTGTTGCAGGGTCTTCTTAAGTTTGAACCATCAGAACGCTTGGAAGCTGCAGAGGCTTTAAGACATCCATTTTTCAGAGAAGATTCAAGAAGATTTGACTATTGCGCAAACAGTT
AATGAGTATGCAAATCAAGAAAAAATTCCATCTCAGCTTCTGACGCTTGTCTAGCTGGTCATGTATTATAAAATGGAGGTTTGGGGAATGGCTCAGTAGTAAACTGTGCAGTGATCATGCGGTGTTTGAGACGAAATGAGTCCTTGCTTCATAAAACTTTGTACCTTACAGATTTGGTTGAAAAATCCACATGTACAATT
AGGAGGTCCTTCTCAAGTCCGAACATTTGGAACGCTTTGAAGCTTAAGAGGCTCTGAGACGTCATTTTTTCAGAGAAGATTTCACGTGACAATTGTTCGGCTGCCCATCTGTGAATCCTATGATTATTGTATTTGTGGCCGAGGTTACTGTGAATGATTGTACACTGCACTTATAAAAATTCGTTCTCATCTCCTGGAAT
TATCGAGTAGAATTGTTTGCACTGCTCGAATGGTGTTTGGGACGAAATGAATCCTAAACATCAGAAAACTTTGTACATTAAAAAGTTGGTTCAATAATTGTATATACTGGA
>TRINITY_DN108549_c0_g2_i12 from sample A4 / Example unspliced isoform:TCCCAGGGTTTCAAGTCTCTAAAGAAGTGACACGTTATTGCTTCATTGCTCAGCTCCCTGATAGAAAGGGTTTTTATGCCTGTTAAGTTAGGCCGGGTGGTCACACCCATAAAGTGTGACAAGAAATCTCACCTCTGTAATAGGTGATGGATGGCTGGCACACTAGAGTCTCAAGGGGAAACATGTAGACATGTTTTAAT
TTTTGAAACTGGGAGCCTTATTTTGGCTTTTAATTATTAGTGAACATGTCGCAGGGGTTTTCTCTGTCGGTGAAGGAGGGGTTTTGTTATTGGCCTCCCAGGGTTTGAAGTCTCTAAAGAAGTGACACACGTTATCGCCTCATTGGTCATCACACTGATACAAAGGGTTTTTATGGCTGTTAAGTTAGGTCGTGCGGTCA
CACCCATAAATCTCATCTCTTTAATAGGTGATGGAGGGTTGGCACACTAGAGTCTCAAGAGGCAAACATGTAGAGACGTGTTTTAATTTCTGAAACTGAGCCTTTTTTTGTTTCTCGAATACGTAGATAAAATTTTGGGTGCTTGAACATTGGATAAATTTTATATGACGGAAGCATGTTCAATGTTTACAGGAACATTT
GGTCAAGTTTTGGAATGTTGGGATCGAAAATTAAAAGATCTCGTGGCCATTAAAATCGTACGCGGCTTACAAAAGTACCGAGAGGCTGCAATGATAGAAGTTGATGTGCTTCGTCAAGTTGGCAAATACGATAGAAATGGCACACGGTATGAGAGTATTTTCTTTTCTGATGCTGTACTTTGCTGTGCTATTTTCACATG
CACAATTTAATAAATGGACATGTTGGGTAATATGCTATAAGGATTTCTTGATTTAAACATATATTCTTAGAACTTTCAAATGATCTTTATTTTCTTTATTCAAACCTGAGATGTATGGCCTTTCCCAATACAGCTGTGTGCAGATGCGCGAATGGTTTGACTATCGGAATCACACTTGCATAgtcagtattctgtagcaa
ttcataccttaattctttttttctttacaaacgcctaagagtagtctgcattatgtatatggttgttagagtgtgtgtttaaggttgtggatggatgtaaaaacagGTCTTTGAGAAGCTTGGCCCAAGCTTATATGATTTCCTACGGAAAAACAATTACAGCCCATTTCCCATTGATCTTGTCCGGGAGGTTGGAAGGC
AACTGTTGGAATCTGTAGCATGTGTGTAGACGATACTTGCACTTATCTTTACATTTGATGTGGGAGGGCTTAAACATATAATTTAATTTTTTAAGGATTGCTTGCCCACTGCCATAACTAGATTGCTTCGTTGGTCATGTTAGCTCACATTTTATGAGGCTAGATTGGGCCTTTATAAGGGTGTTCATAACATCTGTCTA
GGATTTTCTTCTCCTAATATTGCCAATGATCTGTGGCAGATATGCATGAGTTGAAACTCGTTCACACGGATTTAAAGCCTGAAAATATACTTTTTGTTTCTTCAGACTATGTGAAGGTTCCAGATTGCAAGGTAGATTGCTCGCGTGTTGTTACTGAATATAATTGAATTTGTCATGGTTGGCATATTATATGTTGCCGA
CATGGCTCAACTCAGTTGATAATATTGTTTATTATTATAGTAGCTCCAGCAAAAAGCTGGTGTATGAAATAACATATTGTTTCTTTGTATTTTTATGCCTTATACTGTTAACAATCGTTACGATCAAACATTTTAACATATTGCTAAGATCAACATTTTAACATGCATTTATCTCAATGAATGAACTCTGATAACATTAT
TGTTGTTCAAAAGGGTGTGAAGGGATCTCCAGATGACTTTAAAAGGTTGCCAAAGTCAAGTGCAATAAAGTTAATTGATTTTGGAAGCACCACATATGAAGATCAAGATCACACCTCAGTGGTCTCAACAAGGCATTATCGGGCCCCTGAAGTTATTTTGGGTGAGCTTAGAAAGATTGTTCTATGGTTTAGCCAGCAGT
TTGAAAGGACCAATGTCAATTCAATCATATGTTGAATCCAAACCCCTTTGTATTTACAATTTATGTTTTACAACAGGTCTTGGATGGAACTACCCTTGTGATATTTGGAGTGTAGGGTGCATACTTGTGGAGCTCTGCTCGGGTGAGACTTTGTTTCAAACCCATGAGAACTTGGAACATCTTGCCATGATGGAAAGGGT
CTTAGGGCCTTTGCCACATCATATGATTAAGAAATCAGAGTGAGTATTTTTATGTTTGCCGAGGAACTGTTACCTCAATCAGATTATTAGACACGCTATAAAATTCAATATGCCCATGGTAAACCGTAATTTTCAATGTCATCCTGTCAACAGTAGAAGATATGTGAAATATTTTAGACATGGAACACGATTGAATTGGC
CTGAAGGAGCATCCTCTAGAGAGAGCATCAGAGCAGTCAGGAAGTTACCAAAACTTAGGGTATGCTTATTATATGACTACCTGGATGCGCATGAAACGTCATCTTGAAATATTCTCTTGATGATTTGCGATTTGTTTCATCTAGTTGAGTTATAACATGTTACTCTCCTGTTTGCAGGATTTAATAATGCAGCATGCAGA
TCACTCTGCAGGTTTATTTATAGACTTGTTGCAGGGTCTTCTTAAGTTTGAACCATCAGAACGCTTGGAAGCTGCAGAGGCTTTAAGACATCCATTTTTCAGAGAAGATTCAAGAAGATTTGACTATTGCGCAAACAGTTAATGAGTATGCAAATCAAGAAAAAATTCCATCTCAGCTTCTGACGCTTGTCTAGCTGGTC
ATGTATTATAAAATGGAGGTTTGGGGAATGGCTCAGTAGTAAACTGTGCAGTGATCATGCGGTGTTTGAGACGAAATGAGTCCTTGCTTCATAAAACTTTGTACCTTACAGATTTGGTTGAAAAATCCACATGTACAATTAGGAGGTCCTTCTCAAGTCCGAACATTTGGAACGCTTTGAAGCTTAAGAGGCTCTGAGAC
GTCATTTTTTCAGAGAAGATTTCACGTGACAATTGTTCGGCTGCCCATCTGTGAATCCTATGATTATTGTATTTGTGGCCGAGGTTACTGTGAATGATTGTACACTGCACTTATAAAAATTCGTTCTCATCTCCTGGAATTATCGAGTAGAATTGTTTGCACTGCTCGAATGGTGTTTGGGACGAAATGAATCCTAAACA
TCAGAAAACTTTGTACATTAAAAAGTTGGTTCAATAATTGTATATACTGGA
Intron 14 GTAGTTTACC ... TGTTCAAAAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 67.5 | 19 | 53 | 19 |
| A2 | 55.5 | 29 | 48 | 19 |
| A3 | 60.15 | 17.8 | 36 | 15.5 |
| A4 | 58.77 | 21.8 | 34 | 22 |
| A5 | 43.45 | 18 | 15 | 11 |
| A6 | 40.6 | 16.8 | 6 | 16 |
| A7 | 54.13 | 17 | 21 | 17 |
| A8 | 62.63 | 12.3 | 15 | 25 |
| A9 | 61.67 | 10.8 | 20 | 14 |
| A10 | 43.56 | 28.3 | 14 | 29 |
>TRINITY_DN108549_c0_g2_i5 from sample A4 / Example spliced isoformCTGTGTGCAGATGCGCGAATGGTTTGACTATCGGAACCACACTTGCATTGTCAGTATTCTGTGGCAATTTATATCTCTGTTCTTTTTGGCTTACAAACACTTTAAAATACTCTACATCATGTATACGGTTGCTAGCGTGTGTGTTTAAGGTTGTGGATGGATGTAAAAGCAGGTTTTTGAGAAGCTTGGGCCAAGCTTAT
ATGATTTTCTACGGAAAAACAATTACCGCCCATTTCCAATTGATCTTGTCCGGGAGGTTGGAAGGCAACTGTTGGAATCTGTTGCATATATGCATGAGTTGAAACTCGTTCACACGGATTTAAAGCCTGAAAATATACTTTTTGTTTCATCAGACTATGTGAAGGTTCCGGATTGCAAGGGTGTTAAGGGATCTCCAGAT
GAGTTCAAACGGTTGCCAAAGTCAAGTGCAATTAAGATAATTGATTTTGGGAGCACTACATTTGAATATCAAAATCACACCTCAGTTGTTGCTACTCGGCATTATCGAGCTCCTGAAGTTATTTTGGGACTTGGATGGAATTACCCTTGTGATATTTGGAGTATAGGATGCATACTTTTTGAAATCTGCTCGGTAACCTT
TTACATTAGTTTCCCTTATGTTTGAATATTATATACAAACCTGTGAAAATGGTATTTATGTTACCTGCATCTTAACATTGCAGGGAGATACTTTATTTCAGACCCATGAAAACATGGAACATCTTGCTATGATGGAAAGGGTTTTAGGACCTTTGCCTTATCATATGATAAAGAAAGCAGA
>TRINITY_DN108549_c0_g2_i6 from sample A4 / Example unspliced isoform:CTGTGTGCAGATGCGCGAATGGTTTGACTATCGGAACCACACTTGCATTGTCAGTATTCTGTGGCAATTTATATCTCTGTTCTTTTTGGCTTACAAACACTTTAAAATACTCTACATCATGTATACGGTTGCTAGCGTGTGTGTTTAAGGTTGTGGATGGATGTAAAAGCAGGTTTTTGAGAAGCTTGGGCCAAGCTTAT
ATGATTTTCTACGGAAAAACAATTACCGCCCATTTCCAATTGATCTTGTCCGGGAGGTTGGAAGGCAACTGTTGGAATCTGTTGCATGTGTGTAATTATTTTATAAATGCTTTTGTCTGTGTCCCTTCGCTAGATTACTTAATTGGTTGGTTTCTTATAGTGCTGCTCCATTTGTTGAAAGTTGCCAGCTTTTTTAAACT
ACTCCTTAGGTGATCTTTGGCCTCAATTTAGGAGATGAGATTGTCATGGCCCTTGAAAATGTATAAACAAATCGATTTAGGATTTTGTTTTCCTAATTTTGCCAATGATCTGTGACAGATATGCATGAGTTGAAACTCGTTCACACGGATTTAAAGCCTGAAAATATACTTTTTGTTTCATCAGACTATGTGAAGGTTCC
GGATTGCAAGgtagtttaccagcgtggtgtgttagtggttatgattatgattatgattaatggcacatctagcctatcttgattagtgagcattagataatactgatttgtacggtattagagtgccatagcaaaagactgaattgtagattataaaacaacataatcttttgtcaaggttttgggatgatctgtgatat
gtgtaatggctatagtcaacgtttgaacctttccatccgtggttcatcatctggacaataaatgttcgtcctgatgatgaaattcaggtggaagggtttgagacgttgattacaaacacatggcacatttagtagatcatcccaaaatcaggcctaatgactgtcactgtgggtgactaattgaacgtatttgtctgtgt
tgtcaattcatatatctgttttgatgccctatatccacatcattttaatttctatatttcaagacatttatgtaaagaaatccactctgatagtatggttgttgttcaaaagGGTGTTAAGGGATCTCCAGATGAGTTCAAACGGTTGCCAAAGTCAAGTGCAATTAAGATAATTGATTTTGGGAGCACTACATTTGAAT
ATCAAAATCACACCTCAGTTGTTGCTACTCGGCATTATCGAGCTCCTGAAGTTATTTTGGGTGAGCCAGAAACATTGTTTAGTGGTTTAGCAAGCACATTGAAGGACCAATGACAATTCCTTCTTATTGAATCTAAGCCCCTTTTGTATTTTCTATTTATGCTTCTTAACAGGACTTGGATGGAATTACCCTTGTGATAT
TTGGAGTATAGGATGCATACTTTTTGAAATCTGCTCGGTAACCTTTTACATTAGTTTCCCTTATGTTTGAATATTATATACAAACCTGTGAAAATGGTATTTATGTTACCTGCATCTTAACATTGCAGGGAGATACTTTATTTCAGACCCATGAAAACATGGAACATCTTGCTATGATGGAAAGGGTTTTAGGACCTTTG
CCTTATCATATGATAAAGAAAGCAGATAGAAGATATGCAAAATATTTTAGACATGGAACAAGACTGAATTGGCCCGAAGGAGCATC
Intron 15 GTATGAGAGT ... CTGTTTGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 56.92 | 28 | 42 | 32 |
| A2 | 42.11 | 33 | 33 | 15 |
| A3 | 58.9 | 15 | 22 | 21 |
| A4 | 73.17 | 11 | 32 | 28 |
| A5 | 47.37 | 20 | 26 | 10 |
| A6 | 40 | 24 | 8 | 24 |
| A7 | 52.27 | 21 | 13 | 33 |
| A8 | 45.26 | 26 | 8 | 35 |
| A9 | 45.45 | 18 | 8 | 22 |
| A10 | 44.72 | 34 | 35 | 20 |
>TRINITY_DN43358_c0_g3_i11 from sample A9 / Example spliced isoformGCCCTCCCAGGGTTTCAAGTCTCTAAAGAAGTGGCACGTTATCGCCTCATTGGTCAGCACCCTGATACAAAGGTTTTTTATGGCTGTTAAGTTAGGCCGGGTGGTCACATCCATAAAGCGTCTCAAAGTAGTGATACGATATGGCCTCATTTGTCAGCACCCTGACAAACGGTTTTTATGGCTGTTAAGCTAGGCCGTGT
GGTCACACCCAAAACGTGTGACAAGAAATCTCACCTCTTTAGTAGGTGAATGAATGGCTGGCACACTAAAGACTCAAGAGGCAAGATTCAGAGATATGTTTTAATTTTTAAAATTGAGAGCCTTTTTTTGGCTTTATATTATTATCGAATATGTCACAGGGGTTTCCTGTCTTTTTATTATTATCGAACATGCCACAGGG
GTTTCCTCTGTCGGTGAAAGAGGCGTTTTGTTATTGCCCTCCCAGGGTTTCAAGTCTCTAAATAAGTGACACGTTATTGCTTCATTGCTCAGCTCCCTGATAGAAAGGGTTTTTATGATAGAAAGGGTTTTTATGCCTGTTAAGTTAGGCCGGGTGGTCACACCCATAAAGTGTGACAAGAAATCTCACCTCTGTAATAG
GTGATGGATGGCTGGCACACTAGAGTCTCAAGGGGAAACATGTAGACATGTTTTAATTTTTGAAACTGGGAGCCTTATTTTGGCTTTTAATTATTAGCGAACATGTCGCAGGGGTTTTCTCTGTCGGTGAAGGAGGGGTTTTGTTATTGGCCTCCCAGGTTTTGAAGTCTCTGAAGAAGTGACACACGTTATCGCCTCAT
TGGTCATCACACTGATACAAAGGGTTTTTATGGCTGTTAAGTTAGGTCGTGCGGTCACACCCATAAATCTCATCTCTTTAATAGGTGATGGAGGGTTGGCACACTAGAGTCTCAAGAGGCAAACATGTAGAGACGTGTTTTAATTTCCGAAACTGAGCCTTTTTTTGTTTCTTGAATACGTAGATAAAATTTTGGGTGCT
TGAACATTGGATAAATTTTATATGACGGAAGCATGTTCAATGTTTACAGGAACATTTGGTCAAGTTTTGGAATGTTGGGATCGAAAATTAAAAGATCTCGTGGCCATTAAAATCGTACGCGGCTTACAAAAGTACCGAGAGGCTGCAATGATAGAAGTTGATGTGCTTCGTCAAGTTGGCAAATACGATAGAAATGGCAC
ACGGATTTAATAATGCAGCATGCAGACCACTCTGCAGGTTTATTTATAGACTTGTTGCAGGGTCTTCTTAAGTTTGAACCATCAGAACGCTTGGAAGCTGCAGAGGCTTTAAGACATCCATTTTTCAGAGAAGATTCAAGAAGATTTGACTATTGCGCAAACAGTTAATGAGTATGCAAATCATGAAAAAATTCCATCTC
AGCTTCTGACGCTTGTCTAGCTGGTCATGTATTATAAAATGGAGGTTTGGGGAATGGCTCAGTAGTAAACTGTGCAGTGATCATGCGGTGTTTGAGACGAAATGAGTCCTTGCTTCATAAAACTTTGTACCTTACAGATTTGGTTGAAAAATCCACATGTACAATTAGGAGGTCCTTCTCAAGTCCGAACATTTGGAACG
CTTTGAAGCTTAAGAGGCTCTGAGACGTCATTTTTTCAGAGAAGATTTCACGTGACAATTGTTCGGCTGCCCATCTGTGAATCCTATGATTATTGTATTTGTGGCCGAGGTTACTGTGAATGATTGTACACTGCACTTATAAAAATTCGTTCTCATCTCCTGGAATTATCGAGTAGAATTGTTTGCACTGCTCGAATGGT
GTTTGGGACGAAATGAATCCTAAACATCAGAAAACTTTGTACATTAAAAAGTTGGTTCAATAATTGTATATACATACTGGATTGTGCTTCTTTATGTTAAATTGCTCA
>TRINITY_DN43358_c0_g3_i5 from sample A9 / Example unspliced isoform:GCCCTCCCAGGGTTTCAAGTCTCTAAAGAAGTGGCACGTTATCGCCTCATTGGTCAGCACCCTGATACAAAGGTTTTTTATGGCTGTTAAGTTAGGCCGGGTGGTCACATCCATAAAGCGTCTCAAAGTAGTGATACGATATGGCCTCATTTGTCAGCACCCTGACAAACGGTTTTTATGGCTGTTAAGCTAGGCCGTGT
GGTCACACCCAAAACGTGTGACAAGAAATCTCACCTCTTTAGTAGGTGAATGAATGGCTGGCACACTAAAGACTCAAGAGGCAAGATTCAGAGATATGTTTTAATTTTTAAAATTGAGAGCCTTTTTTTGGCTTTATATTATTATCGAATATGTCACAGGGGTTTCCTGTCTTTTTATTATTATCGAACATGCCACAGGG
GTTTCCTCTGTCGGTGAAAGAGGCGTTTTGTTATTGCCCTCCCAGGGTTTCAAGTCTCTAAATAAGTGACACGTTATTGCTTCATTGCTCAGCTCCCTGATAGAAAGGGTTTTTATGATAGAAAGGGTTTTTATGCCTGTTAAGTTAGGCCGGGTGGTCACACCCATAAAGTGTGACAAGAAATCTCACCTCTGTAATAG
GTGATGGATGGCTGGCACACTAGAGTCTCAAGGGGAAACATGTAGACATGTTTTAATTTTTGAAACTGGGAGCCTTATTTTGGCTTTTAATTATTAGCGAACATGTCGCAGGGGTTTTCTCTGTCGGTGAAGGAGGGGTTTTGTTATTGGCCTCCCAGGTTTTGAAGTCTCTGAAGAAGTGACACACGTTATCGCCTCAT
TGGTCATCACACTGATACAAAGGGTTTTTATGGCTGTTAAGTTAGGTCGTGCGGTCACACCCATAAATCTCATCTCTTTAATAGGTGATGGAGGGTTGGCACACTAGAGTCTCAAGAGGCAAACATGTAGAGACGTGTTTTAATTTCCGAAACTGAGCCTTTTTTTGTTTCTTGAATACGTAGATAAAATTTTGGGTGCT
TGAACATTGGATAAATTTTATATGACGGAAGCATGTTCAATGTTTACAGGAACATTTGGTCAAGTTTTGGAATGTTGGGATCGAAAATTAAAAGATCTCGTGGCCATTAAAATCGTACGCGGCTTACAAAAGTACCGAGAGGCTGCAATGATAGAAGTTGATGTGCTTCGTCAAGTTGGCAAATACGATAGAAATGGCAC
ACGgtatgagagtattttcttttctgatgctgtactttgctgtgctattttcacatgcacaatttaataaatggacatgttgggtaatatgctataaggatttcttgatttaaacatatattcttagaactttcaaatgatctttattttctttattcaaacctgagatgtatggcctttcccaatacagttgtgtgcag
atgcgcgaatggtttgactatcggaatcacacttgcatagtcagtattctgtagcaattcataccttaattctttttttctttacaaacgcctaagagtagtctgcattatgtatatggttgttagagtgtgtgtttaaggttgtggatggatgtaaaaacaggtctttgagaagcttggcccaagcttatatgatttcc
tacggaaaaacaattacagcccatttcccattgatcttgtccgggaggttggaaggcaactgttggaatctgtagcatgtgtgtagacgatacttgcacttatctttacatttgatgtgggagggcttaaacatataatttaattttttaaggattgcttgtccactgccataactagattgcttcgttggtcatgttag
ctcacattttatgaggctagattgggcctttataagggtgttcataacatctgtctaggattttcttctcctaatattgccaatgatctgtggcagatatgcatgagttgaaactcgttcacacggatttaaagcctgaaaatatactttttgtttcttcagactatgcgaaggttccagattgcaaggtagattgctcg
cgtgttgttactgaatataattgaatttgtcatggttggcatattatatgttgccgacatggctcaactcagttgataatattgtttattattatagtagctccagcaaaaagctggtgtatgaaataacatattgtttctttgtatttttatgccttctactgttaacaatcgttacgatcaaacattttaacatattg
ctaagatcaacattctaacatgcatttatctcaatgaatgaactctgataacattattgttgttcaaaagggtgtgaagggatctccagatgactttaaaaggttgccaaagtcaagtgcaataaagttaattgattttggaagcaccacatatgaagatcaagatcacacctcagtggtctcaacaaggcattatcggg
cccctgaagttattttgggtgagcttagaaagattgttctatggtttagccagcagtttgaaaggaccaatgtcaattcaatcatatgttgaatccaaacccctttgtatttacaatttatgttttacaacaggtcttggatggaactacccttgtgatatttggagtgtagggtgcatacttgtggagctctgctcggt
aaactttttagactagtttatcttatgttaaaattttacatagatacctgcaggaatgatatttatgctacctgcattttaaattttcagggtgagactttgtttcaaacccatgagaacttggaacatcttgccatgatggaaagggtcttagggcctttgccacatcatatgattaagaaatcagagtgagtattttt
atgtttgccgaggaactgttacctcaatcagattattagacacgctataaaattcaatatgcccatggtaaaccgtaattttcaatgtcatcctgtcaacagtagaagatatgtgaaatattttagacatggaacacgattgaattggcctgaaggagcatcctctagagagagcatcagagcagtcaggaagttaccaa
aacttagggtatgcttattatatgactacctggatgcgcatgaaacgtcatcttgaaatattctcttgttgatttgcgatttgtttcacctagttgagttataacatgttactctcctgtttgcagGATTTAATAATGCAGCATGCAGACCACTCTGCAGGTTTATTTATAGACTTGTTGCAGGGTCTTCTTAAGTTTGA
ACCATCAGAACGCTTGGAAGCTGCAGAGGCTTTAAGACATCCATTTTTCAGAGAAGATTCAAGAAGATTTGACTATTGCGCAAACAGTTAATGAGTATGCAAATCATGAAAAAATTCCATCTCAGCTTCTGACGCTTGTCTAGCTGGTCATGTATTATAAAATGGAGGTTTGGGGAATGGCTCAGTAGTAAACTGTGCAG
TGATCATGCGGTGTTTGAGACGAAATGAGTCCTTGCTTCATAAAACTTTGTACCTTACAGATTTGGTTGAAAAATCCACATGTACAATTAGGAGGTCCTTCTCAAGTCCGAACATTTGGAACGCTTTGAAGCTTAAGAGGCTCTGAGACGTCATTTTTTCAGAGAAGATTTCACGTGACAATTGTTCGGCTGCCCATCTG
TGAATCCTATGATTATTGTATTTGTGGCCGAGGTTACTGTGAATGATTGTACACTGCACTTATAAAAATTCGTTCTCATCTCCTGGAATTATCGAGTAGAATTGTTTGCACTGCTCGAATGGTGTTTGGGACGAAATGAATCCTAAACATCAGAAAACTTTGTACATTAAAAAGTTGGTTCAATAATTGTATATACATAC
TGGATTGTGCTTCTTTATGTTAAATTGCTCA
Intron 16 GTAAGAACAT ... CGTTTCGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 45.95 | 30 | 29 | 22 |
| A2 | 50 | 33 | 28 | 38 |
| A3 | 35.71 | 27 | 18 | 12 |
| A4 | 39.76 | 25 | 19 | 14 |
| A5 | 48.65 | 19 | 10 | 26 |
| A6 | 9.68 | 14 | 2 | 1 |
| A7 | 8.57 | 16 | 3 | 0 |
| A8 | 8 | 23 | 3 | 1 |
| A9 | 28.89 | 16 | 8 | 5 |
| A10 | 12.33 | 32 | 5 | 4 |
>TRINITY_DN108549_c0_g2_i1 from sample A4 / Example spliced isoformACCTACAAACCCTTGAAACCCTAGCCCCAGCGATTAAATTTCTTCCGCAGGTGTTGCGACTCAAGGTTTCAGATCGAGTGCGGCAGCACGTTAGAGCGTTTATTTCGGCCCTCTGAAGCTCCATCTTATTATTCTACCTACAAACCCTTGAAACCCTAGCCCCAGCGATTAAATTTCTTCCGCAGGTGTTCCGACTCAAG
GGTTCAGATCGAGTGCGTTCAAATCGAGTGCGGCAGCACATGGTTCAGATCGAGTGCGGCAGCACATTAGAGCGTTTATTTCGGCCCTCTGAAGCTCCATCTTATTATTCTACCTACAAACCCTTGAAACCCTAACCCCAGCGACTCAATATTCCCGGTGGGTGTTGCGACTGAAGGGTTCAGATTGCGAGCGGCGGCCA
TGGCTTGTGTTGCAAAATATCATCGTCCTCCTCACATGCTTGATGAAAATCCCAGGAAACGCCGCAAGTTAACTTCGTCGTGGGATGTCCTTCCTTCTCAACTCCAGGTCCAGCCAACACTGGTATTTACGGGCAAGGATTTTTGTATCGGAAAGATAAATGGAGAAGTGGAGGACACCCCTTTGTTAACAGGGGCGCAA
CCCTCCATATCCTCATCAGACTGTAGTCGGTCTACGTCTTCAAATGTAAAATCCAAAGAAGAGGGCTCTCGCACTGGCTCCCCACCATGGCGCAGTGATGACAAGGATGGGCATTACATGTTTCAACTGGGAGAGAATTTGACGCCTCGATATAAAATACTCAGTAAAATGGGCGAAGGAACATTTGGTCAAGTTTTGGA
ATGTTGGGATCGAAAATTAAAAGATCTCGTGGCCATTAAAATCGTACGCGGCTTACAAAAGTACCGAGAGGCTGCAATGATAGAAGTTGATGTGCTTCGTCAAGTTGGCAAATACGATAGAAATGGCACACGCTGTGTGCAGATGCGCGAATGGTTTGACTATCGGAATCACACTTGCATAGTCTTTGAGAAGCTTGGCC
CAAGCTTATATGATTTCCTACGGAAAAACAATTACAGCCCATTTCCCATTGATCTTGTACGGGAGGTTGGAAGGCAACTGTTGGAATCTGTAGCATATATGCATGAGTTGAAACTCGTTCACACGGATTTAAAGCCTGAAAATATACTTTTTGTTTCTTCAGACTATGTGAAGGTTCCAGATTGCAAGGGTGTGAAGGGA
TCTCCAGATGACTTTAAAAGGTTGCCAAAGTCAAGTGCAATAAAGTTAATTGATTTTGGAAGCACCACATATGAAGATCAAGATCACACCTCAGTGGTCTCAACAAGGCATTATCGGGCCCCTGAAGTTATTTTGGGTCTTGGATGGAACTACCCTTGTGATATTTGGAGTGTAGGGTGCATACTTGTGGAGCTCTGCTC
GGGTGAGACTTTGTTTCAAACCCATGAGAACTTGGAACATCTTGCCATGATGGAAAGGGTCTTAGGGCCTTTGCCACATCATATGATTAAGAAATCAGAGTGAGTATTTTTATGTTTGCCGAGGAACTGTTACCTCAATCAGATTATTAGACACGCTATAAAATTCAATATGCCCATGGTAAACCGTAATTTTCAATGTC
ATCCTGTCAACAGTAGAAGATATGTGAAATATTTTAGACATGGAACACGATTGAATTGGCCTGAAGGAGCATCCTCTAGAGAGAGCATCAGAGCAGTCAGGAAGTTACCAAAACTTAGGGTATGCTTATTATATGACTACCTGGATGCGCATGAAACGTCATCTTGAAATATTCTCTTGATGATTTGCGATTTGTTTCAT
CTAGTTGAGTTATAACATGTTACTCTCCTGTTTGCAGGATTTAATAATGCAGCATGCAGATCACTCTGCAGGTTTATTTATAGACTTGTTGCAGGGTCTTCTTAAGTTTGAACCATCAGAACGCTTGGAAGCTGCAGAGGCTTTAAGACATCCATTTTTCAGAGAAGATTCAAGAAGATTTGACTATTGCGCAAACAGTT
AATGAGTATGCAAATCAAGAAAAAATTCCATCTCAGCTTCTGACGCTTGTCTAGCTGGTCATGTATTATAAAATGGAGGTTTGGGGAATGGCTCAGTAGTAAACTGTGCAGTGATCATGCGGTGTTTGAGACGAAATGAGTCCTTGCTTCATAAAACTTTGTACCTTACAGATTTGGTTGAAAAATCCACATGTACAATT
AGGAGGTCCTTCTCAAGTCCGAACATTTGGAACGCTTTGAAGCTTAAGAGGCTCTGAGACGTCATTTTTTCAGAGAAGATTTCACGTGACAATTGTTCGGCTGCCCATCTGTGAATCCTATGATTATTGTATTTGTGGCCGAGGTTACTGTGAATGATTGTACACTGCACTTATAAAAATTCGTTCTCATCTCCTGGAAT
TATCGAGTAGAATTGTTTGCACTGCTCGAATGGTGTTTGGGACGAAATGAATCCTAAACATCAGAAAACTTTGTACATTAAAAAGTTGGTTCAATAATTGTATATACTGGA
>TRINITY_DN108549_c0_g2_i2 from sample A4 / Example unspliced isoform:ACCTACAAACCCTTGAAACCCTAGCCCCAGCGATTAAATTTCTTCCGCAGGTGTTGCGACTCAAGGTTTCAGATCGAGTGCGGCAGCACGTTAGAGCGTTTATTTCGGCCCTCTGAAGCTCCATCTTATTATTCTACCTACAAACCCTTGAAACCCTAGCCCCAGCGATTAAATTTCTTCCGCAGGTGTTCCGACTCAAG
GGTTCAGATCGAGTGCGTTCAAATCGAGTGCGGCAGCACATGGTTCAGATCGAGTGCGGCAGCACATTAGAGCGTTTATTTCGGCCCTCTGAAGCTCCATCTTATTATTCTACCTACAAACCCTTGAAACCCTAACCCCAGCGACTCAATATTCCCGGTGGGTGTTGCGACTGAAGGGTTCAGATTGCGAGCGGCGGCCA
TGGCTTGTGTTGCAAAATATCATCGTCCTCCTCACATGCTTGATGAAAATCCCAGGAAACGCCGCAAGTTAACTTCGTCGTGGGATGTCCTTCCTTCTCAACTCCAGGTCCAGCCAACACTGGTATTTACGGGCAAGGATTTTTGTATCGGAAAGATAAATGGAGAAGTGGAGGACACCCCTTTGTTAACAGGGGCGCAA
CCCTCCATATCCTCATCAGACTGTAGTCGGTCTACGTCTTCAAATGTAAAATCCAAAGAAGAGGGCTCTCGCACTGGCTCCCCACCATGGCGCAGTGATGACAAGGATGGGCATTACATGTTTCAACTGGGAGAGAATTTGACGCCTCGATgtaagaacatatatttcaccgctctcttttttattttgattttgagggt
ttttgccctttttggagtcttagatctaaacgagggttttactgatgatatcaaaacgttctttacaaattatcctttaacctgatctattcttctaatctggtgaaaatattttctgctgtcgtttcgcagATAAAATACTCAGTAAAATGGGCGAAGGTAAGCATCTATTAGTCCGGATTTGTTGGCTTTTTGTTGGT
TTTTCATTATTATCGAACATGTCACAGTGGTTTCATCTGTCGGTGAAGGAGGGGGTTTTATTATTGCCCTCCCAGGGTTTCAAGTCTCAAAGTAGTGATACGATATGGCCTCATTTGTCAGCACCCTGACAAACGGTTTTTATGGCTGTTAAGCTAGGCCGTGTGGTCACACCCAAAACGTGTGACAAGAAATCTCACCT
CTTTAATAGGTGATGGATAGCTGGCACACTAGAGTCTTAAGTGGCATCATGTAGAGACATGACTGAGAGCCTTTTTTTGGCTTTTATTATTATCGAACATGTCACAGGGGTTTCATCTGTCGGTGAAGGAGGGGGTTTTATTATTGCCCTCCCAGGGTTTCAAGTCTCAAAGTAGTGACACGATATCGCCTCATTCATCA
GCACCCTGACAAAGGGTTTTTATGGCTGCTAAGCTAGGATGTGTGGTCACACCCAAAACGTGTGACAAGAAATCTCACCTCTTTAATAGGTGATGGATAGCTGGCACACTAGAGTCTCAAGTGGCAACATGTAGAGATATGACTGAGAGCCTTTTTGTTGGTTTTTTCTTATTATCGAACATGCCACAGGGTTTTCCTCT
GGGTGAACGAGGGGTTTTGTTATTACCCTCCCAGGGTTTCAAGTCTCTAAA
Intron 17 GTGAGCTTAG ... TTTACAACAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 49.23 | 33 | 33 | 31 |
| A2 | 33.33 | 25 | 13 | 12 |
| A3 | 32.5 | 27 | 16 | 10 |
| A4 | 61.54 | 10 | 18 | 14 |
| A5 | 68.25 | 10 | 26 | 17 |
| A6 | 28.4 | 29 | 15 | 8 |
| A7 | 33.88 | 40 | 30 | 11 |
| A8 | 38.78 | 30 | 22 | 16 |
| A9 | 35.48 | 20 | 15 | 7 |
| A10 | 36.23 | 22 | 13 | 12 |
>TRINITY_DN108549_c0_g2_i1 from sample A4 / Example spliced isoformACCTACAAACCCTTGAAACCCTAGCCCCAGCGATTAAATTTCTTCCGCAGGTGTTGCGACTCAAGGTTTCAGATCGAGTGCGGCAGCACGTTAGAGCGTTTATTTCGGCCCTCTGAAGCTCCATCTTATTATTCTACCTACAAACCCTTGAAACCCTAGCCCCAGCGATTAAATTTCTTCCGCAGGTGTTCCGACTCAAG
GGTTCAGATCGAGTGCGTTCAAATCGAGTGCGGCAGCACATGGTTCAGATCGAGTGCGGCAGCACATTAGAGCGTTTATTTCGGCCCTCTGAAGCTCCATCTTATTATTCTACCTACAAACCCTTGAAACCCTAACCCCAGCGACTCAATATTCCCGGTGGGTGTTGCGACTGAAGGGTTCAGATTGCGAGCGGCGGCCA
TGGCTTGTGTTGCAAAATATCATCGTCCTCCTCACATGCTTGATGAAAATCCCAGGAAACGCCGCAAGTTAACTTCGTCGTGGGATGTCCTTCCTTCTCAACTCCAGGTCCAGCCAACACTGGTATTTACGGGCAAGGATTTTTGTATCGGAAAGATAAATGGAGAAGTGGAGGACACCCCTTTGTTAACAGGGGCGCAA
CCCTCCATATCCTCATCAGACTGTAGTCGGTCTACGTCTTCAAATGTAAAATCCAAAGAAGAGGGCTCTCGCACTGGCTCCCCACCATGGCGCAGTGATGACAAGGATGGGCATTACATGTTTCAACTGGGAGAGAATTTGACGCCTCGATATAAAATACTCAGTAAAATGGGCGAAGGAACATTTGGTCAAGTTTTGGA
ATGTTGGGATCGAAAATTAAAAGATCTCGTGGCCATTAAAATCGTACGCGGCTTACAAAAGTACCGAGAGGCTGCAATGATAGAAGTTGATGTGCTTCGTCAAGTTGGCAAATACGATAGAAATGGCACACGCTGTGTGCAGATGCGCGAATGGTTTGACTATCGGAATCACACTTGCATAGTCTTTGAGAAGCTTGGCC
CAAGCTTATATGATTTCCTACGGAAAAACAATTACAGCCCATTTCCCATTGATCTTGTACGGGAGGTTGGAAGGCAACTGTTGGAATCTGTAGCATATATGCATGAGTTGAAACTCGTTCACACGGATTTAAAGCCTGAAAATATACTTTTTGTTTCTTCAGACTATGTGAAGGTTCCAGATTGCAAGGGTGTGAAGGGA
TCTCCAGATGACTTTAAAAGGTTGCCAAAGTCAAGTGCAATAAAGTTAATTGATTTTGGAAGCACCACATATGAAGATCAAGATCACACCTCAGTGGTCTCAACAAGGCATTATCGGGCCCCTGAAGTTATTTTGGGTCTTGGATGGAACTACCCTTGTGATATTTGGAGTGTAGGGTGCATACTTGTGGAGCTCTGCTC
GGGTGAGACTTTGTTTCAAACCCATGAGAACTTGGAACATCTTGCCATGATGGAAAGGGTCTTAGGGCCTTTGCCACATCATATGATTAAGAAATCAGAGTGAGTATTTTTATGTTTGCCGAGGAACTGTTACCTCAATCAGATTATTAGACACGCTATAAAATTCAATATGCCCATGGTAAACCGTAATTTTCAATGTC
ATCCTGTCAACAGTAGAAGATATGTGAAATATTTTAGACATGGAACACGATTGAATTGGCCTGAAGGAGCATCCTCTAGAGAGAGCATCAGAGCAGTCAGGAAGTTACCAAAACTTAGGGTATGCTTATTATATGACTACCTGGATGCGCATGAAACGTCATCTTGAAATATTCTCTTGATGATTTGCGATTTGTTTCAT
CTAGTTGAGTTATAACATGTTACTCTCCTGTTTGCAGGATTTAATAATGCAGCATGCAGATCACTCTGCAGGTTTATTTATAGACTTGTTGCAGGGTCTTCTTAAGTTTGAACCATCAGAACGCTTGGAAGCTGCAGAGGCTTTAAGACATCCATTTTTCAGAGAAGATTCAAGAAGATTTGACTATTGCGCAAACAGTT
AATGAGTATGCAAATCAAGAAAAAATTCCATCTCAGCTTCTGACGCTTGTCTAGCTGGTCATGTATTATAAAATGGAGGTTTGGGGAATGGCTCAGTAGTAAACTGTGCAGTGATCATGCGGTGTTTGAGACGAAATGAGTCCTTGCTTCATAAAACTTTGTACCTTACAGATTTGGTTGAAAAATCCACATGTACAATT
AGGAGGTCCTTCTCAAGTCCGAACATTTGGAACGCTTTGAAGCTTAAGAGGCTCTGAGACGTCATTTTTTCAGAGAAGATTTCACGTGACAATTGTTCGGCTGCCCATCTGTGAATCCTATGATTATTGTATTTGTGGCCGAGGTTACTGTGAATGATTGTACACTGCACTTATAAAAATTCGTTCTCATCTCCTGGAAT
TATCGAGTAGAATTGTTTGCACTGCTCGAATGGTGTTTGGGACGAAATGAATCCTAAACATCAGAAAACTTTGTACATTAAAAAGTTGGTTCAATAATTGTATATACTGGA
>TRINITY_DN108549_c0_g2_i8 from sample A4 / Example unspliced isoform:ATAAAATACTCAGTAAAATGGGCGAAGGAACATTTGGTCAAGTTTTGGAATGTTGGGATCGAAAATTAAAAGATCTCGTGGCCATTAAAATCGTACGCGGCTTACAAAAGTACCGAGAGGCTGCAATGATAGAAGTTGATGTGCTTCGTCAAGTTGGCAAATACGATAGAAATGGCACACGCTGTGTGCAGATGCGCGAA
TGGTTTGACTATCGGAATCACACTTGCATAGTCTTTGAGAAGCTTGGCCCAAGCTTATATGATTTCCTACGGAAAAACAATTACAGCCCATTTCCCATTGATCTTGTCCGGGAGGTTGGAAGGCAACTGTTGGAATCTGTAGCATGTGTGTAGACGATACTTGCACTTATCTTTACATTTGATGTGGGAGGGCTTAAACA
TATAATTTAATTTTTTAAGGATTGCTTGCCCACTGCCATAACTAGATTGCTTCGTTGGTCATGTTAGCTCACATTTTATGAGGCTAGATTGGGCCTTTATAAGGGTGTTCATAACATCTGTCTAGGATTTTCTTCTCCTAATATTGCCAATGATCTGTGGCAGATATGCATGAGTTGAAACTCGTTCACACGGATTTAAA
GCCTGAAAATATACTTTTTGTTTCTTCAGACTATGTGAAGGTTCCAGATTGCAAGGTAGATTGCTCGCGTGTTGTTACTGAATATAATTGAATTTGTCATGGTTGGCATATTATATGTTGCCGACATGGCTCAACTCAGTTGATAATATTGTTTATTATTATAGTAGCTCCAGCAAAAAGCTGGTGTATGAAATAACATA
TTGTTTCTTTGTATTTTTATGCCTTATACTGTTAACAATCGTTACGATCAAACATTTTAACATATTGCTAAGATCAACATTTTAACATGCATTTATCTCAATGAATGAACTCTGATAACATTATTGTTGTTCAAAAGGGTGTGAAGGGATCTCCAGATGACTTTAAAAGGTTGCCAAAGTCAAGTGCAATAAAGTTAATT
GATTTTGGAAGCACCACATATGAAGATCAAGATCACACCTCAGTGGTCTCAACAAGGCATTATCGGGCCCCTGAAGTTATTTTGGgtgagcttagaaagattgttctatggtttagccagcagtttgaaaggaccaatgtcaattcaatcatgttgaatccaaacccctttgtatttacaatttatgttttacaacagGT
CTTGGATGGAACTACCCTTGTGATATTTGGAGTGTAGGGTGCATACTTGTGGAGCTCTGCTCGGTAAACTTTTTAGACTAGTTTATCTTATGTTAAAATTTTACATAGATACCTGCAGGAATGATATTTATGCTACCTGCATTTTAAATTTTCAGGGTGAGACTTTGTTTCAAACCCATGAGAACTTGGAACATCTTGCC
ATGATGGAAAGGGTCTTAGGGCCTTTGCCACATCATATGATTAAGAAATCAGAGTGAGTATTTTTATGTTTGCCGAGGAACTGTTACCTCAATCAGATTATTAGACACGCTATAAAATTCAATATGCCCATGGTAAACCGTAATTTTCAATGTCATCCTGTCAACAGTAGAAGATATGTGAAATATTTTAGACATGGAAC
ACGATTGAATTGGCCTGAAGGAGCATCCTCTAGAGAGAGCATCAGAGCAGTCAGGAAGTTACCAAAACTTAGGG
Intron 18 GTGTGTAATT ... TCTGTGACAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 52.6 | 41 | 40 | 51 |
| A2 | 57.14 | 33 | 57 | 31 |
| A3 | 51.72 | 21 | 19 | 26 |
| A4 | 48.15 | 35 | 31 | 34 |
| A5 | 39.13 | 21 | 19 | 8 |
| A6 | 42.31 | 30 | 35 | 9 |
| A7 | 44.36 | 37 | 29 | 30 |
| A8 | 61.9 | 16 | 33 | 19 |
| A9 | 67.44 | 14 | 35 | 23 |
| A10 | 71.43 | 9 | 29 | 16 |
>TRINITY_DN108549_c0_g2_i5 from sample A4 / Example spliced isoformCTGTGTGCAGATGCGCGAATGGTTTGACTATCGGAACCACACTTGCATTGTCAGTATTCTGTGGCAATTTATATCTCTGTTCTTTTTGGCTTACAAACACTTTAAAATACTCTACATCATGTATACGGTTGCTAGCGTGTGTGTTTAAGGTTGTGGATGGATGTAAAAGCAGGTTTTTGAGAAGCTTGGGCCAAGCTTAT
ATGATTTTCTACGGAAAAACAATTACCGCCCATTTCCAATTGATCTTGTCCGGGAGGTTGGAAGGCAACTGTTGGAATCTGTTGCATATATGCATGAGTTGAAACTCGTTCACACGGATTTAAAGCCTGAAAATATACTTTTTGTTTCATCAGACTATGTGAAGGTTCCGGATTGCAAGGGTGTTAAGGGATCTCCAGAT
GAGTTCAAACGGTTGCCAAAGTCAAGTGCAATTAAGATAATTGATTTTGGGAGCACTACATTTGAATATCAAAATCACACCTCAGTTGTTGCTACTCGGCATTATCGAGCTCCTGAAGTTATTTTGGGACTTGGATGGAATTACCCTTGTGATATTTGGAGTATAGGATGCATACTTTTTGAAATCTGCTCGGTAACCTT
TTACATTAGTTTCCCTTATGTTTGAATATTATATACAAACCTGTGAAAATGGTATTTATGTTACCTGCATCTTAACATTGCAGGGAGATACTTTATTTCAGACCCATGAAAACATGGAACATCTTGCTATGATGGAAAGGGTTTTAGGACCTTTGCCTTATCATATGATAAAGAAAGCAGA
>TRINITY_DN108549_c0_g2_i4 from sample A4 / Example unspliced isoform:CTGTGTGCAGATGCGCGAATGGTTTGACTATCGGAACCACACTTGCATTGTCAGTATTCTGTGGCAATTTATATCTCTGTTCTTTTTGGCTTACAAACACTTTAAAATACTCTACATCATGTATACGGTTGCTAGCGTGTGTGTTTAAGGTTGTGGATGGATGTAAAAGCAGGTTTTTGAGAAGCTTGGGCCAAGCTTAT
ATGATTTTCTACGGAAAAACAATTACCGCCCATTTCCAATTGATCTTGTCCGGGAGGTTGGAAGGCAACTGTTGGAATCTGTTGCATgtgtgtaattattttataaatgcttttgtctgtgtcccttcgctagattacttaattggttggtttcttatagtgctgctccatttgttgaaagttgccagcttttttaaact
actccttaggtgatctttggcctcaatttaggagatgagattgtcatggcccttgaaaatgtataaacaaatcgatttaggattttgttttcctaattttgccaatgatctgtgacagATATGCATGAGTTGAAACTCGTTCACACGGATTTAAAGCCTGAAAATATACTTTTTGTTTCATCAGACTATGTGAAGGTTCC
GGATTGCAAGGTAGTTTACCAGCGTGGTGTGTTAGTGGTTATGATTATGATTATGATTAATGGCACATCTAGCCTATCTTGATTAGTGAGCATTAGATAATACTGATTTGTACGGTATTAGAGTGCCATAGCAAAAGACTGAATTGTAGATTATAAAACAACATAATCTTTTGTCAAGGTTTTGGGATGATCTGTGATAT
GTGTAATGGCTATAGTCAACGTTTGAACCTTTCCATCCGTGGTTCATCATCTGGACAATAAATGTTCGTCCTGATGATGAAATTCAGGTGGAAGGGTTTGAGACGTTGATTACAAACACATGGCACATTTAGTAGATCATCCCAAAATCAGGCCTAATGACTGTCACTGTGGGTGACTAATTGAACGTATTTGTCTGTGT
TGTCAATTCATATATCTGTTTTGATGCCCTATATCCACATCATTTTAATTTCTATATTTCAAGACATTTATGTAAAGAAATCCACTCTGATAGTATGGTTGTTGTTCAAAAGGGTGTTAAGGGATCTCCAGATGAGTTCAAACGGTTGCCAAAGTCAAGTGCAATTAAGATAATTGATTTTGGGAGCACTACATTTGAAT
ATCAAAATCACACCTCAGTTGTTGCTACTCGGCATTATCGAGCTCCTGAAGTTATTTTGGGTGAGCCAGAAACATTGTTTAGTGGTTTAGCAAGCACATTGAAGGACCAATGACAATTCCTTCTTATTGAATCTAAGCCCCTTTTGTATTTTCTATTTATGCTTCTTAACAGGACTTGGATGGAATTACCCTTGTGATAT
TTGGAGTATAGGATGCATACTTTTTGAAATCTGCTCGGTAACCTTTTACATTAGTTTCCCTTATGTTTGAATATTATATACAAACCTGTGAAAATGGTATTTATGTTACCTGCATCTTAACATTGCAGGGAGATACTTTATTTCAGACCCATGAAAACATGGAACATCTTGCTATGATGGAAAGGGTTTTAGGACCTTTG
CCTTATCATATGATAAAGAAAGCAGAGTGAGTTTTTTGATGTTTGCCAAGGGGTGTTACCCTAATCAGATTAGATACTGTAAAAGGCCAAATACTTACATTAAACCATAACTTTCAATGTTATCCTGTC
Intron 19 GTGAGCTTAG ... TTTACAACAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 48.65 | 33 | 33 | 29.6 |
| A2 | 32.24 | 25 | 13 | 10.8 |
| A3 | 31.29 | 27 | 16 | 8.6 |
| A4 | 61.23 | 10 | 18 | 13.6 |
| A5 | 65.86 | 10 | 22 | 16.6 |
| A6 | 28.22 | 29 | 15 | 7.8 |
| A7 | 34.7 | 40 | 30 | 12.6 |
| A8 | 38.26 | 30 | 22 | 15.2 |
| A9 | 35.05 | 20 | 15 | 6.6 |
| A10 | 36.76 | 22 | 13 | 12.6 |
>TRINITY_DN108549_c0_g2_i1 from sample A4 / Example spliced isoformACCTACAAACCCTTGAAACCCTAGCCCCAGCGATTAAATTTCTTCCGCAGGTGTTGCGACTCAAGGTTTCAGATCGAGTGCGGCAGCACGTTAGAGCGTTTATTTCGGCCCTCTGAAGCTCCATCTTATTATTCTACCTACAAACCCTTGAAACCCTAGCCCCAGCGATTAAATTTCTTCCGCAGGTGTTCCGACTCAAG
GGTTCAGATCGAGTGCGTTCAAATCGAGTGCGGCAGCACATGGTTCAGATCGAGTGCGGCAGCACATTAGAGCGTTTATTTCGGCCCTCTGAAGCTCCATCTTATTATTCTACCTACAAACCCTTGAAACCCTAACCCCAGCGACTCAATATTCCCGGTGGGTGTTGCGACTGAAGGGTTCAGATTGCGAGCGGCGGCCA
TGGCTTGTGTTGCAAAATATCATCGTCCTCCTCACATGCTTGATGAAAATCCCAGGAAACGCCGCAAGTTAACTTCGTCGTGGGATGTCCTTCCTTCTCAACTCCAGGTCCAGCCAACACTGGTATTTACGGGCAAGGATTTTTGTATCGGAAAGATAAATGGAGAAGTGGAGGACACCCCTTTGTTAACAGGGGCGCAA
CCCTCCATATCCTCATCAGACTGTAGTCGGTCTACGTCTTCAAATGTAAAATCCAAAGAAGAGGGCTCTCGCACTGGCTCCCCACCATGGCGCAGTGATGACAAGGATGGGCATTACATGTTTCAACTGGGAGAGAATTTGACGCCTCGATATAAAATACTCAGTAAAATGGGCGAAGGAACATTTGGTCAAGTTTTGGA
ATGTTGGGATCGAAAATTAAAAGATCTCGTGGCCATTAAAATCGTACGCGGCTTACAAAAGTACCGAGAGGCTGCAATGATAGAAGTTGATGTGCTTCGTCAAGTTGGCAAATACGATAGAAATGGCACACGCTGTGTGCAGATGCGCGAATGGTTTGACTATCGGAATCACACTTGCATAGTCTTTGAGAAGCTTGGCC
CAAGCTTATATGATTTCCTACGGAAAAACAATTACAGCCCATTTCCCATTGATCTTGTACGGGAGGTTGGAAGGCAACTGTTGGAATCTGTAGCATATATGCATGAGTTGAAACTCGTTCACACGGATTTAAAGCCTGAAAATATACTTTTTGTTTCTTCAGACTATGTGAAGGTTCCAGATTGCAAGGGTGTGAAGGGA
TCTCCAGATGACTTTAAAAGGTTGCCAAAGTCAAGTGCAATAAAGTTAATTGATTTTGGAAGCACCACATATGAAGATCAAGATCACACCTCAGTGGTCTCAACAAGGCATTATCGGGCCCCTGAAGTTATTTTGGGTCTTGGATGGAACTACCCTTGTGATATTTGGAGTGTAGGGTGCATACTTGTGGAGCTCTGCTC
GGGTGAGACTTTGTTTCAAACCCATGAGAACTTGGAACATCTTGCCATGATGGAAAGGGTCTTAGGGCCTTTGCCACATCATATGATTAAGAAATCAGAGTGAGTATTTTTATGTTTGCCGAGGAACTGTTACCTCAATCAGATTATTAGACACGCTATAAAATTCAATATGCCCATGGTAAACCGTAATTTTCAATGTC
ATCCTGTCAACAGTAGAAGATATGTGAAATATTTTAGACATGGAACACGATTGAATTGGCCTGAAGGAGCATCCTCTAGAGAGAGCATCAGAGCAGTCAGGAAGTTACCAAAACTTAGGGTATGCTTATTATATGACTACCTGGATGCGCATGAAACGTCATCTTGAAATATTCTCTTGATGATTTGCGATTTGTTTCAT
CTAGTTGAGTTATAACATGTTACTCTCCTGTTTGCAGGATTTAATAATGCAGCATGCAGATCACTCTGCAGGTTTATTTATAGACTTGTTGCAGGGTCTTCTTAAGTTTGAACCATCAGAACGCTTGGAAGCTGCAGAGGCTTTAAGACATCCATTTTTCAGAGAAGATTCAAGAAGATTTGACTATTGCGCAAACAGTT
AATGAGTATGCAAATCAAGAAAAAATTCCATCTCAGCTTCTGACGCTTGTCTAGCTGGTCATGTATTATAAAATGGAGGTTTGGGGAATGGCTCAGTAGTAAACTGTGCAGTGATCATGCGGTGTTTGAGACGAAATGAGTCCTTGCTTCATAAAACTTTGTACCTTACAGATTTGGTTGAAAAATCCACATGTACAATT
AGGAGGTCCTTCTCAAGTCCGAACATTTGGAACGCTTTGAAGCTTAAGAGGCTCTGAGACGTCATTTTTTCAGAGAAGATTTCACGTGACAATTGTTCGGCTGCCCATCTGTGAATCCTATGATTATTGTATTTGTGGCCGAGGTTACTGTGAATGATTGTACACTGCACTTATAAAAATTCGTTCTCATCTCCTGGAAT
TATCGAGTAGAATTGTTTGCACTGCTCGAATGGTGTTTGGGACGAAATGAATCCTAAACATCAGAAAACTTTGTACATTAAAAAGTTGGTTCAATAATTGTATATACTGGA
>TRINITY_DN108549_c0_g2_i12 from sample A4 / Example unspliced isoform:TCCCAGGGTTTCAAGTCTCTAAAGAAGTGACACGTTATTGCTTCATTGCTCAGCTCCCTGATAGAAAGGGTTTTTATGCCTGTTAAGTTAGGCCGGGTGGTCACACCCATAAAGTGTGACAAGAAATCTCACCTCTGTAATAGGTGATGGATGGCTGGCACACTAGAGTCTCAAGGGGAAACATGTAGACATGTTTTAAT
TTTTGAAACTGGGAGCCTTATTTTGGCTTTTAATTATTAGTGAACATGTCGCAGGGGTTTTCTCTGTCGGTGAAGGAGGGGTTTTGTTATTGGCCTCCCAGGGTTTGAAGTCTCTAAAGAAGTGACACACGTTATCGCCTCATTGGTCATCACACTGATACAAAGGGTTTTTATGGCTGTTAAGTTAGGTCGTGCGGTCA
CACCCATAAATCTCATCTCTTTAATAGGTGATGGAGGGTTGGCACACTAGAGTCTCAAGAGGCAAACATGTAGAGACGTGTTTTAATTTCTGAAACTGAGCCTTTTTTTGTTTCTCGAATACGTAGATAAAATTTTGGGTGCTTGAACATTGGATAAATTTTATATGACGGAAGCATGTTCAATGTTTACAGGAACATTT
GGTCAAGTTTTGGAATGTTGGGATCGAAAATTAAAAGATCTCGTGGCCATTAAAATCGTACGCGGCTTACAAAAGTACCGAGAGGCTGCAATGATAGAAGTTGATGTGCTTCGTCAAGTTGGCAAATACGATAGAAATGGCACACGGTATGAGAGTATTTTCTTTTCTGATGCTGTACTTTGCTGTGCTATTTTCACATG
CACAATTTAATAAATGGACATGTTGGGTAATATGCTATAAGGATTTCTTGATTTAAACATATATTCTTAGAACTTTCAAATGATCTTTATTTTCTTTATTCAAACCTGAGATGTATGGCCTTTCCCAATACAGCTGTGTGCAGATGCGCGAATGGTTTGACTATCGGAATCACACTTGCATAGTCAGTATTCTGTAGCAA
TTCATACCTTAATTCTTTTTTTCTTTACAAACGCCTAAGAGTAGTCTGCATTATGTATATGGTTGTTAGAGTGTGTGTTTAAGGTTGTGGATGGATGTAAAAACAGGTCTTTGAGAAGCTTGGCCCAAGCTTATATGATTTCCTACGGAAAAACAATTACAGCCCATTTCCCATTGATCTTGTCCGGGAGGTTGGAAGGC
AACTGTTGGAATCTGTAGCATGTGTGTAGACGATACTTGCACTTATCTTTACATTTGATGTGGGAGGGCTTAAACATATAATTTAATTTTTTAAGGATTGCTTGCCCACTGCCATAACTAGATTGCTTCGTTGGTCATGTTAGCTCACATTTTATGAGGCTAGATTGGGCCTTTATAAGGGTGTTCATAACATCTGTCTA
GGATTTTCTTCTCCTAATATTGCCAATGATCTGTGGCAGATATGCATGAGTTGAAACTCGTTCACACGGATTTAAAGCCTGAAAATATACTTTTTGTTTCTTCAGACTATGTGAAGGTTCCAGATTGCAAGGTAGATTGCTCGCGTGTTGTTACTGAATATAATTGAATTTGTCATGGTTGGCATATTATATGTTGCCGA
CATGGCTCAACTCAGTTGATAATATTGTTTATTATTATAGTAGCTCCAGCAAAAAGCTGGTGTATGAAATAACATATTGTTTCTTTGTATTTTTATGCCTTATACTGTTAACAATCGTTACGATCAAACATTTTAACATATTGCTAAGATCAACATTTTAACATGCATTTATCTCAATGAATGAACTCTGATAACATTAT
TGTTGTTCAAAAGGGTGTGAAGGGATCTCCAGATGACTTTAAAAGGTTGCCAAAGTCAAGTGCAATAAAGTTAATTGATTTTGGAAGCACCACATATGAAGATCAAGATCACACCTCAGTGGTCTCAACAAGGCATTATCGGGCCCCTGAAGTTATTTTGGgtgagcttagaaagattgttctatggtttagccagcagt
ttgaaaggaccaatgtcaattcaatcatatgttgaatccaaacccctttgtatttacaatttatgttttacaacagGTCTTGGATGGAACTACCCTTGTGATATTTGGAGTGTAGGGTGCATACTTGTGGAGCTCTGCTCGGGTGAGACTTTGTTTCAAACCCATGAGAACTTGGAACATCTTGCCATGATGGAAAGGGT
CTTAGGGCCTTTGCCACATCATATGATTAAGAAATCAGAGTGAGTATTTTTATGTTTGCCGAGGAACTGTTACCTCAATCAGATTATTAGACACGCTATAAAATTCAATATGCCCATGGTAAACCGTAATTTTCAATGTCATCCTGTCAACAGTAGAAGATATGTGAAATATTTTAGACATGGAACACGATTGAATTGGC
CTGAAGGAGCATCCTCTAGAGAGAGCATCAGAGCAGTCAGGAAGTTACCAAAACTTAGGGTATGCTTATTATATGACTACCTGGATGCGCATGAAACGTCATCTTGAAATATTCTCTTGATGATTTGCGATTTGTTTCATCTAGTTGAGTTATAACATGTTACTCTCCTGTTTGCAGGATTTAATAATGCAGCATGCAGA
TCACTCTGCAGGTTTATTTATAGACTTGTTGCAGGGTCTTCTTAAGTTTGAACCATCAGAACGCTTGGAAGCTGCAGAGGCTTTAAGACATCCATTTTTCAGAGAAGATTCAAGAAGATTTGACTATTGCGCAAACAGTTAATGAGTATGCAAATCAAGAAAAAATTCCATCTCAGCTTCTGACGCTTGTCTAGCTGGTC
ATGTATTATAAAATGGAGGTTTGGGGAATGGCTCAGTAGTAAACTGTGCAGTGATCATGCGGTGTTTGAGACGAAATGAGTCCTTGCTTCATAAAACTTTGTACCTTACAGATTTGGTTGAAAAATCCACATGTACAATTAGGAGGTCCTTCTCAAGTCCGAACATTTGGAACGCTTTGAAGCTTAAGAGGCTCTGAGAC
GTCATTTTTTCAGAGAAGATTTCACGTGACAATTGTTCGGCTGCCCATCTGTGAATCCTATGATTATTGTATTTGTGGCCGAGGTTACTGTGAATGATTGTACACTGCACTTATAAAAATTCGTTCTCATCTCCTGGAATTATCGAGTAGAATTGTTTGCACTGCTCGAATGGTGTTTGGGACGAAATGAATCCTAAACA
TCAGAAAACTTTGTACATTAAAAAGTTGGTTCAATAATTGTATATACTGGA