sp|Q93YR2|BASS1_ARATH ----> Probable sodium/metabolite cotransporter BASS1, chloroplastic

Intron 1 GTAAGCAGAT ... TGTCCTGGAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	100	0	0.5	2
A2	100	0	3	3
A3	100	0	1.5	2.5
A4	100	0	0.5	2
A5	100	0	5	6
A6	100	0	21.5	26
A7	100	0	13	16
A8	100	0	13.5	18
A9	100	0	20	29
A10	100	0	20.5	27.5

>TRINITY_DN42533_c0_g2_i2 from sample A6 / Example spliced isoform

TATATGTGGCAATGCATTATTTGATGTTGTTGTTACTTTAGATGTTTAATAAATTGAAAAAAAGAATCTTTTTATAATTTTTCTAAGGTTGCGGATATATCTGATAAGTTTCTTTCTGGACCTTTGACGATATTCATCGGCACAATATTTCAGAAGACCTGACAAAGGGGAAGTGGAGTTCTATGACCTTGAGGAATCGC
TCCATCATTTTTGTTTTTATCTGCTTGTGATGCCAACTGCAGGAGCATTGGAACTGCAAGTAATGTGGTAACTTATATAGCACGGGGTAATGTAGCACTTTCTGTTCTAATGACGGCTGCTAGCACCTTCCTGGCTGTGGACAATATGTTGCTGTTGATGCCAGTGGTCTGTTTGCCTCAGCACTGCAGGTCGTTCTTCT
CCCAGTCCTGACTGGCGCCCTTATAAATCAGTATATGCCAACCTTAGTGAGCAAAATTTCTCCATTTACTCCTCTTGTAGCTGTTGTGACTGTATCAGCACTCTGTGCGAGTGCAATTGCACAGAGTGCCTCAGCTATTCTGTCTTCTGGTGGACGAGTGGTACTGGCAGTGTGTGCTCTTCATTCAGCTGGATACTTCT
TTGGTTATTTACTTTCTAAACTTCTTGGCTTTGACAGCTGCACGTCACGTACCATTTCTATAGAAGTTGGGATGCAGAATTCTGTGCTTGGAGTGGTCCTTGCGGGTCAGCATTTTAGCAATCCCTTGTCAGCAGTACCCTGTGCTGTCTCCAGTGTCTGCCAGTCAATATTTGGCAGTGCTCTAGCTGGATTTTGGCGT
CTAACATCTGGAAATGAAGTCAAAGATTAAGGCATAAGTTCTACAACTTGCAGTGAGTTGGATGATGTTTAATTTGATACTATGGTAAACTGGTAGATGTATGGGAGAGATTGTCTACCAAAAATTCAATTTCCAGAGCATTATCAACGTTAGCTATTCCTGCTGAAAGTTGCCTTTTCACAGGAATGTTCCTCTGCAAA
CTTTTGTCCTGTTGTTGACTGCATGCAGGTCTCTGACTCGTACCTTTTAAACCTTAAATTGCTCTCTTCTTCCCGCAGGGCATACATGATACAGATAGAATCTTATACACTGGGTTCATTTGATAATGCACTTCTGCCTTTCCCCTCTATACTGGGTGAACGAAGCATCTGAAATTTTACTTAAAACCATCCTCAAAGAA
ACATTTGAAATTTGACGTAAAAACCATTCCTCTTCATTTCTTATTTTTGTTCTGAAGGTTTGCCAGGAACTATTGTAGTCTAATAGTTGTG

>TRINITY_DN42533_c0_g2_i3 from sample A6 / Example unspliced isoform:

TATATGTGGCAATGCATTATTTGATGTTGTTGTTACTTTAGATGTTTAATAAATTGAAAAAAAGAATCTTTTTATAATTTTTCTAAGGTTGCGGATATATCTGATAAGTTTCTTTCTGGACCTTTGACGATATTCATCGGCACAATATTTCAGAAGACCTGACAAAGGGGAAGTGGAGTTCTATGACCTTGAGGAATCGC
TCCATCATTTTTGTTTTTATCTGCTTGTATGTCAAACTAGCCATAGCATATTGTGGTACTTTTTGTTTTCCTTTTACTAATGTTGAATGCTTTAGAATGGTGGAATCTTCTAACATTCATTGGGCTGGTTCTAGGTGATGCCAACTGCAGGAGCATTGgtaagcagattattaaacttaccttcccattatgcggcagga
ttagtcttggttgcttgctgtcctggagGAACTGCAAGTAATGTGGTAACTTATATAGCACGGGGTAATGTAGCACTTTCTGTTCTAATGACGGCTGCTAGCACCTTCTTGGCTGTGGTGATGACACCACTTCTAACAGCAAAACTTGCAGGACAATATGTTGCTGTTGATGCCAGTGGTCTGTTTGCCTCAGCACTGCA
GGTCGTTCTTCTCCCAGTCCTGACTGGCGCCCTTATAAATCAGTATATGCCAACCTTAGTGAGCAAAATTTCTCCATTTACTCCTCTTGTAGCTGTTGTGACTGTATCAGCACTCTGTGCGAGTGCAATTGCACAGAGTGCCTCAGCTATTCTGTCTTCTGGTGGACGAGTGGTACTGGCAGTGTGTGCTCTTCATTCAG
CTGGATACTTCTTTGGTTATTTACTTTCTAAACTTCTTGGCTTTGACAGCTGCACGTCACGTACCATTTCTATAGAAGTTGGGATGCAGAATTCTGTGCTTGGAGTGGTCCTTGCGGGTCAGCATTTTAGCAATCCCTTGTCAGCAGTACCCTGTGCTGTCTCCAGTGTCTGCCAGTCAATATTTGGCAGTGCTCTAGCT
GGATTTTGGCGTCTAACATCTGGAAATGAAGTCAAAGATTAAGGCATAAGTTCTACAACTTGCAGTGAGTTGGATGATGTTTAATTTGATACTATGGTAAACTGGTAGATGTATGGGAGAGATTGTCTACCAAAAATTCAATTTCCAGAGCATTATCAACGTTAGCTATTCCTGCTGAAAGTTGCCTTTTCACAGGAATG
TTCCTCTGCAAACTTTTGTCCTGTTGTTGACTGCATGCAGGTCTCTGACTCGTACCTTTTAAACCTTAAATTGCTCTCTTCTTCCCGCAGGGCATACATGATACAGATAGAATCTTATACACTGGGTTCATTTGATAATGCACTTCTGCCTTTCCCCTCTATACTGGGTGAACGAAGCATCTGAAATTTTACTTAAAACC
ATCCTCAAAGAAACATTTGAAATTTGACGTAAAAACCATTCCTCTTCATTTCTTATTTTTGTTCTGAAGGTTTGCCAGGAACTATTGTAGTCTAATAGTTGTG

Intron 2 GTGTGGACTT ... TGTTGTGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	37.5	5	0	3
A2	40	9	0	6
A3	61.54	5	2	8
A4	0	2	0	0
A5	0	6	0	0
A6	29.41	36	0	15
A7	35.48	20	0	11
A8	40	24	0	16
A9	23.81	32	0	10
A10	12.9	27	0	4

>TRINITY_DN102382_c3_g1_i2 from sample A3 / Example spliced isoform

TGTAAACCATCTGGTTATCGGAAGCTGTCTTTTGAGACATTCAGGCATGTTGGTTGTGCAAACCAAGAGAGACCATTGGTCTCTGATGTTGAGAACGAGGAAGGGTGGATGAATGGGCTTCACCAGGTGGGAGAGGTTCTTTCTACGGCGTTTCCTGTGTGGATTGCATTGGCTTGCTTTGCAGGATTGGTTCGACCCTC
GGCCTTTCTCTGGATTCGAGGCAACTGGCAAATTGCTGGACTTACCGTCACAATGCTAGGAATGGGCATGACACTTTCCTTGAAGGATTTGCAAGGTGCATTGGCAATGCCCAAAGAAGTTCTGGGAGGAGTGTTGCTACAGTATACAGTGATGCCAACTGCAGGAGCATTGGTAAGCAGATTATTAAACTTACCTTCCC
ATTATGCGGCAGGATTAGTCTTGGTTGCTTGCTGTCCTGGAGGAACTGCAAGTAATGTGGTAACTTATATAGCACGGGGTAATGTAGCACTTTCTATTCTAATGACGGCTGCTAGCACCTTCCTGGCTGTGGTGATGACACCACTTCTAACAGCAAAACTTGCAGGACAATATGTTGCTGTTGATGCCAGTGGTCTGTTT
GCCTCAGCACTGCAGGTCGTTCTTCTCCCAGTCCTGACTGGCGCCCTTATAAATCAGTATATGCCAACCTTAGTGAGCAAAATTTCTCCATTTACTCCTCTTGTAGCTGTTGTGACTGTATCAGCACTCTGTGCGAGTGCAATTGCACAGAGTGCCTCAGCTATTCTGTCTTCTGGTGGACGAGTGGTACTGGCAGTGTG
TGCTCTTCATTCAGCTGGATACTTCTTTGGTTATTTACTTTCTAAACTTCTTGGCTTTGACAGCTGCACGTCACGTACCATTTCTATAGAAG

>TRINITY_DN102382_c3_g1_i1 from sample A3 / Example unspliced isoform:

CTTATATAGCACGgtgtggacttgtctttattacttttctgatttccttttttctcatgcatatttttgcagccatgggcccattggagtttaaataagaatatctagtattctgttctttggactgttgtgcagGGGTAATGTAGCACTTTCTATTCTAATGACGGCTGCTAGCACCTTCCTGGCTGTGGTGATGACAC
CACTTCTAACAGCAAAACTTGCAGGACAATATGTTGCTGTTGATGCCAGTGGTCTGTTTGCCTCAGCACTGCAGGTCGTTCTTCTCCCAGTCCTGACTGGCGCCCTTATAAATCAGTATATGCCAACCTTAGTGAGCAAAATTTCTCCATTTACTCCTCTTGTAGCTGTTGTGACTGTATCAGCACTCTGTGCGAGTGCA
ATTGCACAGAGTGCCTCAGCTATTCTGTCTTCTGGTGGACGAGTGGTACTGGCAGTGTGTGCTCTTCATTCAGCTGGATACTTCTTTGGTTATTTACTTTCTAAACTTCTTGGCTTTGACAGCTGCACGTCACGTACCATTTCTATAGAAG

Intron 3 GTGATGACAC ... AAACTTGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	59.09	4.2	7	5
A2	60	8	8	16
A3	100	0	6	6
A4	44.44	2.3	1.7	2
A5	100	0	3	3
A6	81.49	8.3	33.5	39.8
A7	66.31	18	28.8	42
A8	54.27	33.5	27.5	52
A9	73.3	10.5	26.5	31
A10	76.67	9	26.2	33

>TRINITY_DN105353_c0_g1_i4 from sample A2 / Example spliced isoform

TGCCAACTGCAGGAGCATTGGTAAGCAGATTATTAAACTTACCTTCCCATTATGCGGCAGGATTAGTCTTGGTTGCTTGCTGTCCTGGAGGAACTGCAAGTAATGTGGTAACTTATATAGCACGGGGTAATGTAGCACTTTCTGTTCTAATGACGGCTGCTAGCACCTTCTTGGCTGTGGACAATATGTTGCTGTTGATG
CCAGTGGTCTGTTTGCCTCAGCACTGCAGGTCGTTCTTCTCCCAGTCCTGACTGGCGCCCTTATAAATCAGTATATGCCAACCTTAGTGAGCAAAATTTCTCCATTTACTCCTCTTGTAGCTGTTGTGACTGTATCAGCACTCTGTGCGAGTGCAATTGCACAGAGTGCCTCAGCTATTCTGTCTTCTGGTGGACGAGTG
GTACTGGCAGTGTGTGCTCTTCATTCAGCTGGATACTTCTTTGGTTATTTACTTTCTAAACTTCTTGGCTTTGACAGCTGCACGTCACGTACCATTTCTATAGAAGTTGGGATGCAGAATTCTGTGCTTGGAGTGGTCCTTGCGGGTCAGCATTTTAGCAATCCCTTGTCAGCAGTACCCTGTGCTGTCTCCAGTGTCTG
CCAGTCAATATTTGGCAGTGCTCTAGCTGGATTTTGGCGTCTAACATCTGGG

>TRINITY_DN105353_c0_g1_i1 from sample A2 / Example unspliced isoform:

GGTGGATGAATGGGCTTCACCAGGTGGGAGAAGTTCTTTCTACGGCGTTTCCTGTGTGGATTGCATTGGCTTGCCTTGCAGGATTGGTTCGACCCTCGGCCTTTCTCTGGATTCGAGGCAACTGGCAAATTGCTGGACTTACCGTCACAATGCTAGGAATGGGCATGACACTTTCCTTGAAGGATTTGCAAGGTGCATTG
GCAATGCCCAAAGAAGTTCTGGGAGGAGTGTTGCTACAGTATACAGTGATGCCAACTGCAGGAGCATTGGTAAGCAGATTATTAAACTTACCTTCCCATTATGCGGCAGGATTAGTCTTGGTTGCTTGCTGTCCTGGAGGAACTGCAAGTAATGTGGTAACTTATATAGCACGGGGTAATGTAGCACTTTCTGTTCTAAT
GACGGCTGCTAGCACCTTCTTGGCTGTGgtgatgacaccacttctaacagcaaaacttgcagGACAATATGTTGCTGTTGATGCCAGTGGTCTGTTTGCCTCAGCACTGCAGGTCGTTCTTCTCCCAGTCCTGACTGGCGCCCTTATAAATCAGTATATGCCAACCTTAGTGAGCAAAATTTCTCCATTTACTCCTCTTG
TAGCTGTTGTGACTGTATCAGCACTCTGTGCGAGTGCAATTGCACAGAGTGCCTCAGCTATTCTGTCTTCTGGTGGACGAGTGGTACTGGCAGTGTGTGCTCTTCATTCAGCTGGATACTTCTTTGGTTATTTACTTTCTAAACTTCTTGGCTTTGACAGCTGCACGTCACGTACCATTTCTATAGAAGTTGGGATGCAG
AATTCTGTGCTTGGAGTGGTCCTTGCGGGTCAGCATTTTAGCAATCCCTTGTCAGCAGTACCCTGTGCTGTCTCCAGTGTCTGCCAGTCAATATTTGGCAGTGCTCTAGCTGGATTTTGGCGTCTAACATCTGGG

Intron 4 GTATGTCAAA ... CTGGTTCTAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	-1	0.5	1.5	0
A2	83.34	0.5	0	2.5
A3	66.66	1	1	1.5
A4	100	0	0	1
A5	50	2.5	0	1
A6	58.98	7	2.5	10.5
A7	70	1.5	1	3
A8	59.52	2.5	4.5	4
A9	66.66	5	3	10
A10	71.88	4.5	3	10

>TRINITY_DN42533_c0_g2_i2 from sample A6 / Example spliced isoform

TATATGTGGCAATGCATTATTTGATGTTGTTGTTACTTTAGATGTTTAATAAATTGAAAAAAAGAATCTTTTTATAATTTTTCTAAGGTTGCGGATATATCTGATAAGTTTCTTTCTGGACCTTTGACGATATTCATCGGCACAATATTTCAGAAGACCTGACAAAGGGGAAGTGGAGTTCTATGACCTTGAGGAATCGC
TCCATCATTTTTGTTTTTATCTGCTTGTGATGCCAACTGCAGGAGCATTGGAACTGCAAGTAATGTGGTAACTTATATAGCACGGGGTAATGTAGCACTTTCTGTTCTAATGACGGCTGCTAGCACCTTCCTGGCTGTGGACAATATGTTGCTGTTGATGCCAGTGGTCTGTTTGCCTCAGCACTGCAGGTCGTTCTTCT
CCCAGTCCTGACTGGCGCCCTTATAAATCAGTATATGCCAACCTTAGTGAGCAAAATTTCTCCATTTACTCCTCTTGTAGCTGTTGTGACTGTATCAGCACTCTGTGCGAGTGCAATTGCACAGAGTGCCTCAGCTATTCTGTCTTCTGGTGGACGAGTGGTACTGGCAGTGTGTGCTCTTCATTCAGCTGGATACTTCT
TTGGTTATTTACTTTCTAAACTTCTTGGCTTTGACAGCTGCACGTCACGTACCATTTCTATAGAAGTTGGGATGCAGAATTCTGTGCTTGGAGTGGTCCTTGCGGGTCAGCATTTTAGCAATCCCTTGTCAGCAGTACCCTGTGCTGTCTCCAGTGTCTGCCAGTCAATATTTGGCAGTGCTCTAGCTGGATTTTGGCGT
CTAACATCTGGAAATGAAGTCAAAGATTAAGGCATAAGTTCTACAACTTGCAGTGAGTTGGATGATGTTTAATTTGATACTATGGTAAACTGGTAGATGTATGGGAGAGATTGTCTACCAAAAATTCAATTTCCAGAGCATTATCAACGTTAGCTATTCCTGCTGAAAGTTGCCTTTTCACAGGAATGTTCCTCTGCAAA
CTTTTGTCCTGTTGTTGACTGCATGCAGGTCTCTGACTCGTACCTTTTAAACCTTAAATTGCTCTCTTCTTCCCGCAGGGCATACATGATACAGATAGAATCTTATACACTGGGTTCATTTGATAATGCACTTCTGCCTTTCCCCTCTATACTGGGTGAACGAAGCATCTGAAATTTTACTTAAAACCATCCTCAAAGAA
ACATTTGAAATTTGACGTAAAAACCATTCCTCTTCATTTCTTATTTTTGTTCTGAAGGTTTGCCAGGAACTATTGTAGTCTAATAGTTGTG

>TRINITY_DN42533_c0_g2_i3 from sample A6 / Example unspliced isoform:

TATATGTGGCAATGCATTATTTGATGTTGTTGTTACTTTAGATGTTTAATAAATTGAAAAAAAGAATCTTTTTATAATTTTTCTAAGGTTGCGGATATATCTGATAAGTTTCTTTCTGGACCTTTGACGATATTCATCGGCACAATATTTCAGAAGACCTGACAAAGGGGAAGTGGAGTTCTATGACCTTGAGGAATCGC
TCCATCATTTTTGTTTTTATCTGCTTgtatgtcaaactagccatagcatattgtggtactttttgttttccttttactaatgttgaatgctttagaatggtggaatcttctaacattcattgggctggttctagGTGATGCCAACTGCAGGAGCATTGGTAAGCAGATTATTAAACTTACCTTCCCATTATGCGGCAGGA
TTAGTCTTGGTTGCTTGCTGTCCTGGAGGAACTGCAAGTAATGTGGTAACTTATATAGCACGGGGTAATGTAGCACTTTCTGTTCTAATGACGGCTGCTAGCACCTTCTTGGCTGTGGTGATGACACCACTTCTAACAGCAAAACTTGCAGGACAATATGTTGCTGTTGATGCCAGTGGTCTGTTTGCCTCAGCACTGCA
GGTCGTTCTTCTCCCAGTCCTGACTGGCGCCCTTATAAATCAGTATATGCCAACCTTAGTGAGCAAAATTTCTCCATTTACTCCTCTTGTAGCTGTTGTGACTGTATCAGCACTCTGTGCGAGTGCAATTGCACAGAGTGCCTCAGCTATTCTGTCTTCTGGTGGACGAGTGGTACTGGCAGTGTGTGCTCTTCATTCAG
CTGGATACTTCTTTGGTTATTTACTTTCTAAACTTCTTGGCTTTGACAGCTGCACGTCACGTACCATTTCTATAGAAGTTGGGATGCAGAATTCTGTGCTTGGAGTGGTCCTTGCGGGTCAGCATTTTAGCAATCCCTTGTCAGCAGTACCCTGTGCTGTCTCCAGTGTCTGCCAGTCAATATTTGGCAGTGCTCTAGCT
GGATTTTGGCGTCTAACATCTGGAAATGAAGTCAAAGATTAAGGCATAAGTTCTACAACTTGCAGTGAGTTGGATGATGTTTAATTTGATACTATGGTAAACTGGTAGATGTATGGGAGAGATTGTCTACCAAAAATTCAATTTCCAGAGCATTATCAACGTTAGCTATTCCTGCTGAAAGTTGCCTTTTCACAGGAATG
TTCCTCTGCAAACTTTTGTCCTGTTGTTGACTGCATGCAGGTCTCTGACTCGTACCTTTTAAACCTTAAATTGCTCTCTTCTTCCCGCAGGGCATACATGATACAGATAGAATCTTATACACTGGGTTCATTTGATAATGCACTTCTGCCTTTCCCCTCTATACTGGGTGAACGAAGCATCTGAAATTTTACTTAAAACC
ATCCTCAAAGAAACATTTGAAATTTGACGTAAAAACCATTCCTCTTCATTTCTTATTTTTGTTCTGAAGGTTTGCCAGGAACTATTGTAGTCTAATAGTTGTG

Intron 5 GTAGCTAACT ... CTTTTTGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	75	2	2	6
A2	40	3	0	2
A3	0	2.3	1	0
A4	50	2	0	2
A5	40	6	0	4
A6	16.13	26	0	5
A7	44.94	16	4	13
A8	28	18	2	7
A9	27.74	28.7	4	11
A10	33.6	27.7	3	14

>TRINITY_DN43081_c0_g1_i5 from sample A9 / Example spliced isoform

ATCCAACCTTGGATCAATTTAATTCATCCTAAATTGCCCTCTAATTCCTTTAATTTCCTTCTCTAATTCCTTTAATTTCCTTCTGAATTGCCCTCTAATTCCTTTAATTTCCTTCTCTAATTCCTTTAATTTCCTTCTGAATGGTTTACATCCTCAACTCCTTACGGACAGGAATTGAAGAACTCAACTCCTTACGGACA
GTACTTCGTTTAATTTCCTTCTGAATGGTTTACATCCTCAAACTCCTTACGGACAGGAATTGAAGAATTGAATAGATGACTGATGACTTAAGCTCCACAATTACCTCAACTCCTTACGGACAGTACTTCGTTTAATTTCCCTACTTGCTAAATAACTTTATATTCTTACTCTTTAACCTGAACTCTGTACTTTTACCCTT
TAACCTGAACTCTGTACTAAAGCTCTACTTGTAAAGCTCAACTTCTTATTTTACCCTTTAACCTGAACTCTGTACTAAAGCTCTACTTGTAAAGCTCATCTTCTTATTGTAACCACTCTATCTTTGGATCCTCTGGGAAAATTGAACTGCTATGCAATCCGGAAAACTTAATTCAAAAAACTTCAATTCTGTCATCATGG
TAGTGTAACTTTCAATAATAACAATTGCCGCTATTTGTTTATTTGGCTTCATACCCAACAATATTCTCCAGCCCTACCATTCTCTTCCGACTACAGGAAAGCATTTACAGTATTTTTGAATCTGGCTGCCCATTTCTTCTGTTCGTTGGATCGAATCCTTGGGCTCATTGGAGACAATGACTGGAACCTGCTTGTCATCC
CCTCTTTCTTCGTATGATTTGCACAATGCCTCAATCCCATGTTCATTAAGGTCTCCGATCAGGCATTCAATCTTCATCTCGCGTTCTGTGCATCCTCTGAAGGTTAGGGGCACACCAATTTCCTACTCGCTTAACAATTTCGATGCTTCTCTGCAAACGACCGGTATTTTCTCATGTAAACCATCTGGTTATCGGAAGCT
GTCTTTTGAGACATTCAAGCATGTTGGTTGTGCAAACCAAGAGAGACCATTGGTCTCTGATGTTGAGAACGAGGAAGGGTGGATGAATGGGCTTCACCAGGTGGGAGAGGTTCTTTCTACGGCGTTTCCTGTGTGGATTGCATTGGCTTGCTTTGCAGGATTGGTTCGACCCTCGGCCTTTCTCTGGATTCGAGGCAACT
GGCAAATTGCTGGACTTACCGTCACAATGCTAGGAATGGGCATGACACTTTCCTTGAAGGATTTGCAAGGTGCATTGGCAATGCCCAAAGAAGTTCTGGGAGGAGTGTTGCTACAGTATACAGTGATGCCAACTGCAGGAGCATTGGTAAGCAGATTATTAAACTTACCTTCCCATTATGCGGCAGGATTAGTCTTGGTT
GCTTGCTGTCCTGGAGGAACTGCAAGTAATGTGGTAACTTATATAGCACGGGGTAATGTAGCACTTTCTGTTCTAATGACGGCTGCTAGCACCTTCCTGGCTGTGGTGATGACACCACTTCTAACAGCAAAACTTGCAGGACAATATGTTGCTGTTGATGCCAGTGGTCTGTTTGCCTCAGCACTGCAGGTCGTTCTTCT
CCCAGTCCTGACTGGCGCCCTTATAAATCAGTATATGCCAACCTTAGTGAGCAAAATTTCTCCATTTACTCCTCTTGTAGCTGTTGTGACTGTATCAGCACTCTGTGCGAGTGCAATTGCACAGAGTGCCTCAGCTATTCTGTCTTCTGGTGGACGAGTGGTACTGGCAGTGTGTGCTCTTCATTCAGCTGGATACTTCT
TTGGTTATTTACTTTCTAAACTTCTTGGCTTTGACAGCTGCACGTCACGTACCATTTCTATAGAAGTTGGGATGCAGAATTCTGTGCTTGGAGTGGTCCTTGCGGGTCAGCATTTTAGCAATCCCTTGTCAGCAGTACCCTGTGCTGTCTCCAGTGTCTGCCAGTCAATATTTGGCAGTGCTCTAGCTGGATTTTGGCGT
CTAACATCTGGAAATGAAGTCAAAGATTAAGGCATAAGTTCTACAACTTGCAGTGAGTTGGATGATGTTTAATTTGATACTATGGTAAACTGGTAGATGTATGGGAGAGATTGTCTACCAAAAATTCAATTTCCAGAGCATTATCAATGTTAGCTATTCCTGCTGAAAGTTGCCTTTTCACAGGAATGTTCCTCTGCAAA
CTTTTGTCCTGTTGTTGACTGCATGCAGGTCTCTGACTCGTACCTTTTAAACCTTAAATTGCTCTCTTCTTCCCGCAGGGCATACATGATACAGATAGAATCTTATACACTGGGTTCATTTGATAATGCACTTCTGCCTTTCCCCTCTATACTGGGTGAACGAAGCATCTGAAATTTTACTTAAAACCATCCTCAAAGAA
ACATTTGAAATTTGACGTAAAAACCATTCCTCTTCATTTCTTATTTTTGTTCTGAAGGTTTGCCAGGAACTATTGTAGTCTAATAGTTGTGCACTAGTGTTAGGTTTAAACTGAAGTCTAGCGAGCCTCCATTTAAGTGAATAGATGCAAGGATTTGGCCTTAGCAACTGTCATGTAAGTTTCTATATCCCAATTAATGT
GTGG

>TRINITY_DN43081_c0_g1_i7 from sample A9 / Example unspliced isoform:

ACCCTTTAACCTGAACTCTGTACTAAAGCTCTACTTGTAAAGCTCATCTTCTTATTGTAACCACTCTATCTTTGGATCCTCTGGGAAAATTGAACTGCTATGCAATCCGGAAAACTTAATTCAAAAAACTTCAATTCTGTCATCATGGTAGTGTAACTTTCAATAATAACAATTGCCGCTATTTGTTTATTTGGCTTCAT
ACCCAACAATATTCTCCAGCCCTACCATTCTCTTCCGACTACAGGAAAGCATTTACAGTATTTTTGAATCTGGCTGCCCATTTCTTCTGTTCGTTGGATCGAATCCTTGGGCTCATTGGAGACAATGACTGGAACCTGCTTGTCATCCCCTCTTTCTTCGTATGATTTGCACAATGCCTCAATCCCATGTTCATTAAGGT
CTCCGATCAGGCATTCAATCTTCATCTCGCGTTCTGTGCATCCTCTGAAGGTTAGGGGCACACCAATTTCCTACTCGCTTAACAATTTCGATGCTTCTCTGCAAACGACCGGTATTTTCTCATGTAAACCATCTGGTTATCGGAAGCTGTCTTTTGAGACATTCAAGCATGTTGGTTGTGCAAACCAAGAGAGACCATTG
GTCTCTGATGTTGAGAACGAGGAAGGGTGGATGAATGGGCTTCACCAGGTGGGAGAGGTTCTTTCTACGGCGTTTCCTGTGTGGATTGCATTGGCTTGCTTTGCAGGATTGGTTCGACCCTCGGCCTTTCTCTGGATTCGAGGCAACTGGCAAATTGCTGGACTTACCGTCACAATGCTAGGAATGGGCATGACACTTTC
CTTGAAGGATTTGCAAGGTGCATTGGCAATGCCCAAAGAAGTTCTGGGAGGAGTGTTGCTACAGTATACAAAGACCTGACAAAGGGGAAGTGGAGTTCTATGACCTTGAGGAATCGCTCCATCATTTTTGTTTTTATCTGCTTGTATGTCAAACTAGCCATAGCATATTGTGGTACTTTTTGTTTTCCTTTTACTAATGT
TGAATGCTTTAGAATGGTGGAATCTTCTAACATTCATTGGGCTGGTTCTAGGTGATGCCAACTGCAGGAGCATTGGTAAGCAGATTATTAAACTTACCTTCCCATTATGCGGCAGGATTAGTCTTGGTTGCTTGCTGTCCTGGAGgtagctaactgttttgacattggtcttgaaaggatttgcgttttgtcccttgtga
tcatcatattttcagtttttctggaatgcttttataaatataggagtcctgctcaaaattagtatcgatgttttattactgtgggatctgtaactcaattttggtagtaatcttcactattccaaaaggcatattgaaatgggaagaccttaaactgaagaggaacttctttttgcagGAACTGCAAGTAATGTGGTAAC
TTATATAGCACGGGGTAATGTAGCACTTTCTGTTCTAATGACGGCTGCTAGCACCTTCTTGGCTGTGGTGATGACACCACTTCTAACAGCAAAACTTGCAGGACAATATGTTGCTGTTGATGCCAGTGGTCTGTTTGCCTCAGCACTGCAGGTCGTTCTTCTCCCAGTCCTGACTGGCGCCCTTATAAATCAGTATATGC
CAACCTTAGTGAGCAAAATTTCTCCATTTACTCCTCTTGTAGCTGTTGTGACTGTATCAGCACTCTGTGCGAGTGCAATTGCACAGAGTGCCTCAGCTATTCTGTCTTCTGGTGGACGAGTGGTACTGGCAGTGTGTGCTCTTCATTCAGCTGGATACTTCTTTGGTTATTTACTTTCTAAACTTCTTGGCTTTGACAGC
TGCACGTCACGTACCATTTCTATAGAAGTTGGGATGCAGAATTCTGTGCTTGGAGTGGTCCTTGCGGGTCAGCATTTTAGCAATCCCTTGTCAGCAGTACCCTGTGCTGTCTCCAGTGTCTGCCAGTCAATATTTGGCAGTGCTCTAGCTGGATTTTGGCGTCTAACATCTGGAAATGAAGTCAAAGATTAAGGCATAAG
TTCTACAACTTGCAGTGAGTTGGATGATGTTTAATTTGATACTATGGTAAACTGGTAGATGTATGGGAGAGATTGTCTACCAAAAATTCAATTTCCAGAGCATTATCAATGTTAGCTATTCCTGCTGAAAGTTGCCTTTTCACAGGAATGTTCCTCTGCAAACTTTTGTCCTGTTGTTGACTGCATGCAGGTCTCTGACT
CGTACCTTTTAAACCTTAAATTGCTCTCTTCTTCCCGCAGGGCATACATGATACAGATAGAATCTTATACACTGGGTTCATTTGATAATGCACTTCTGCCTTTCCCCTCTATACTGGGTGAACGAAGCATCTGAAATTTTACTTAAAACCATCCTCAAAGAAACATTTGAAATTTGACGTAAAAACCATTCCTCTTCATT
TCTTATTTTTGTTCTGAAGGTTTGCCAGGAACTATTGTAGTCTAATAGTTGTGCACTAGTGTTAGGTTTAAACTGAAGTCTAGCGAGCCTCCATTTAAGTGAATAGATGCAAGGATTTGGCCTTAGCAACTGTCATGTAAGTTTCTATATCCCAATTAATGTGTGG