NA ----> NA
Intron 1 GTATACTCAG ... TGTGTCATAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 31.25 | 11 | 4 | 6 |
| A2 | 23.81 | 24 | 8 | 7 |
| A3 | 17.95 | 16 | 2 | 5 |
| A4 | 14.29 | 15 | 0 | 5 |
| A5 | 25.93 | 10 | 0 | 7 |
| A6 | 20.31 | 153 | 34 | 44 |
| A7 | 19.32 | 119 | 26 | 31 |
| A8 | 23.03 | 132 | 34 | 45 |
| A9 | 17.96 | 137 | 26 | 34 |
| A10 | 22.94 | 126 | 46 | 29 |
>TRINITY_DN108051_c0_g1_i1 from sample A2 / Example spliced isoformAACTCATCACTCTTGTCCATGGAAAAAAATATCGTTCAAGTTAAATAATATCAAATATCAGACAGGATAATTCTGAAATTAAGAGTAAGTTCGAATTTCGAGTGCAAGTGTATACAGCAACACAGAGGGGAAAATGGCGATGGCGGTAGCAGCAATTGGTTCGATTGCTCTTAACACAGTCCACTCCTCGGATTATATGG
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TTTACATTCATTAGATGATCCATTATCTTCTAATGGTGTTTCTAGTCCTTGCCTTTGGTCAGGTAGGCAATGACCTGGCCTACCTTCCTTCGC
>TRINITY_DN108051_c0_g1_i2 from sample A2 / Example unspliced isoform:AACTCATCACTCTTGTCCATGGAAAAAAATATCGTTCAAGTTAAATAATATCAAATATCAGACAGGATAATTCTGAAATTAAGAGTAAGTTCGAATTTCGAGTGCAAGTGTATACAGCAACACAGAGGGGAAAATGGCGATGGCGGTAGCAGCAATTGGTTCGATTGCTCTTAACACAGTCCACTCCTCGGATTATATGG
TTGCATCTGGCCTCAAAACCCGAGGGTTTAAACATTTTTCTGTACCTGCGACCACTTCTTTCGGGAGAGATTCGAACTCAAGCCTTCCCAGTTCTAAATCACTAAAGAAATTGAGATTATTCTCGTCTCAAACAGAGGCAGATACTGCCACCACCAGCGCCCAAGGCAAGACACCATTTGGGTATACAAGAAAGGATGTT
TTGCTGATTGGCCTTGGGTTGACAGCTTTTGGTTTCGGACTGAAATCGGGACTAGAGgtatactcagagctatgcatacctcattgcttgagtgtttaatgtttattttttttcccttttcaattgtagtggatggaatctcacttgctaacattctgaacatctatcagattcaaagttttatctcttactatcttttg
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CTGTTATTCATTACCCTGCCCATGCATATGTAAAGTTTGGGCATTTAACTGATCTATATGCATTTTCATTTTGTTCATTCAATATTCTATGTTTAATTCATCTTTAGTTGTTCTCCAACCATTTATAGGGAGATATGTTCAGTGCTAGATGTTTTGCTTACTTCCTAATGCCCAGCCCTATTTCAATACAAGATTGTGTG