sp|F4IXW2|BIG5_ARATH ----> Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 5

Intron 1 GTAGGCACTA ... ATCTTTGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	14.86	34.4	9	3
A2	3.88	25	0	2
A3	1.48	67	0	2
A4	5.25	27.1	2	1
A5	1.99	25.4	0	1
A6	0	1	0	0
A7	0	8	0	0
A8	0	2.3	0	0
A9	0	7.3	0	0
A10	0	6	0	0

>TRINITY_DN125164_c5_g1_i3 from sample A1 / Example spliced isoform

CTCCCATCATTCTTTTACTTTTCTATACTACAAAAGACCAAAAACATTTTGCTAAAGCTATCTCTTCATATCACCTTGTGCCTCATTGTCTAAGCTAACCTAAAGTGAGAGAGGGAGTTATTGAGGTGACAGTGGGTAGTCCCTCTAGATTTCCTTTGGGCTAGCATTGTTCTTTTGGAGTTTTATCACACTCTAGTTTG
GGAGGTAACACCTATGACATGATATTTTACTGACACCATGAATCTCTGTAGGTTAGCAGGCCAAACTTAAACCTTGAAGCTCCCTATAGTCAATATTTGTAGCTATATGCTAATGGCTTTATGCTTGGTTCTTTATTTTTTACATTTTGCTGTTGGGAGATAAGAAGGAAGATTTACTAAAAAGTTCATTAAACTTTATT
TTTAACTGAAATAATGAGATATAGTTTGTGTTAACACATGTTTTCTTTTTTGAAAATGCTTCATATATTAACTCAAAGTATAAAGTTCAAGATAGTTACATCAGAAGTGATTGATAGTCCTGGTCCAGGAAAGCCCAGTCCCCCACAGGGAGGGACTCAACAACATGGCCGAAAGCTCATTACTGTGTGTGGTGCAGCTG
AGTTGCTCATGGTTTCAGGCTGAATTTCAGTCTCTGTTTTTACTTTAGTACACTTGTCTTGTCCTTTTTGGGTGACTTGGTACAAAATGATCACTCACCTACCTTCTGTATTTTGATATTTTATAGAAGTCTTGGTCAGAGATGATCACTCTCCAGTAGCTTTGTACTCCTATATAGTCTAATTCATTATTGGTTGTATA
GCATGAATACAGTTTGGCAGTTTCGTCTTATACTTGTTTCTCCTCTCTTGTTTCTTCCTTGTATGAGTATTTCAGATTGCTGTTATTGTGTTCATATCAAGTGGAGAGATGACACTGGATAGTTTGTTATGGATGCATTGGTTTCAATTTCTAAACTAGTTGTCTAAGGAAGAAACACAAAATGAGTCCGAATTCCTTCA
AACTACTTTCTTTTACTTTTTATCTGTTGGCATTTTTTAAGATGAGGTTCATCTGTAGAAGACAAAAGAAATCCCAGTTCATTTATCCTTAGTTTCGTCTTCTTTTAACCTTTTGAAATTGATTATTGGTAACCTTTGCAGGTTTTCCTTAGCATGCTGGTTAAAATCACAAGTCTTGACTTGCCGTTATGGCATCGCAT
AATGGTGCTTGAAGTTTTGAGGAGTTTTTGTGTGGAAGCACGTATTCTACGTCTTCTCTTTCAAACTTTTGACATGCAACGAGGGAGCACAAATGTAGTGGCTGGAATGATTAAAACACTTGCACAAGTTGTCACTAATGTACAGATTCCAGATGCCAGTGAAGAGAGCTTAGCGGCTGTTGCTGGCATGTTTAACAGCA
AAGCAAGAGATTTGTTCTTTCAAATTATGTATCCGTTTTCAGAACCTTGTTGCCCTATGAACAGGTAACTAATTTTGAGTTATTTCTAGCATTGGAACAATAGGAAAATTAATAATGTAACTGAAACAGAATATATGATCAGGTTTTGCGGCGTCAGGTATGCTCATTGCTAATGACTTCACTGCGGGCGACGGGTGAGC
TTGAAGGTGAGGTAGGAGAGCCAGCTTTCCGTCGTCTGGTCTTAAGATCAGTGGCACATGTCATTAGACTTTACAGCTCAGCTCTGGTAACAGAATGCGAGGTTTTCCTTAGCATGCTGGTTAAAATCACAAGTCTTGACTTGCCGTTATGGCATCGCATAATGGTGCTTGAAGTTTTGAGGAGTTTTTGTGTGGAAGCA
CGTATTCTACGTCTTCTCTTTCAAACTTTTGACATGCAACGAGGGAGCACAAATGTAGTGGCTGGAATGATTAAAACACTTGCACAAGTTGTCACTAATGTACAGATTCCAGATGCCAGTGAAGAGAGCTTAGCGGCTGTTGCTGGCATGTTTAACAGCAAAGCAAGAG

>TRINITY_DN125164_c5_g1_i8 from sample A1 / Example unspliced isoform:

TTGTGGTCTATCAAGTTTCAAGTTGAATCTTGTGATATTTTCATGTCTTCAAAGATAAGCATGTCTATGTTTGCTGACGAGAAGATATTTGTTTCTCATAATTGCAGGTTTTCCTTAGCATGCTGGTTAAAATCACAAGTCTTGACTTGCCGTTATGGCATCGCATAATGGTGCTTGAAGTTTTGAGGgtaggcactaat
tataagcttgttatattggggatcatagtggcatattgggtgcatggttttcattcttgttgattgctatttgtatcttctaatttgcatttcttcaagatattgcttttctgatggagacaactttggatatctttgcagAGTTTTTGTGTGGAAGCACGTATTCTACGTCTTCTCTTTCAAACTTTTGACATGTAAGT
TAATCAAACTTTTTACCATTGTCTGCCTCTAACCATTGTAAAATTCAGCTTAGGCAGAAAAGGAGATATTTACATAAAAACTACAAAAGGCACACCAAGAGGTTCACCCAGTTCACATTTGCATTGCGATGGAATAGTATTGTATTCTAATTGTTGGGAATAATTCTGTCAATAGCAACATCAATTTATTTTGAATGCAA
TTTATCCACTTTGCTGTTGGAAGTACAAGGCTCTACTGTTCTAGAATAAAACTTCAGTAGATGCGAACTTAGTCACAGTGTTTGAAATCAATTTTGAGTCGTCAAAAAGGAAAAGAAATTCTTTAAAAATAAAAAGTTTAACAAATTTTGACATAAAATCTACTGAGAATCTCTGGCACTAATGTATGCAAGTTCTAAAC
CTTTGATTGGGATATGGTTTTGAAAATGTCATATTTCCTGAG

Intron 2 GTATGTGGCA ... CTGATGGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	39.26	32.4	33	9.1
A2	41.46	21.1	16	13.9
A3	37.28	51.1	40	20.7
A4	39.99	11.4	9	6.2
A5	35.55	8.6	4	5.4
A6	-1	0	0	0
A7	0	2	0	0
A8	-1	0.4	0	0.1
A9	2.04	2.1	0	0.1
A10	33.33	2	2	0

>TRINITY_DN125164_c5_g1_i6 from sample A1 / Example spliced isoform

CGGGGCGGCAATAGATTTGACAGGGAAAGGAAGGGACGGGAAAATGATGAATCCATCGTCCATTATTTGCTTGTACTAGCAGTGTCGGTCTATCTGGCAGCAGAGGAGTTTACTCCGGAACCCTGAGCAGCTATTTCAGCTTCTTCATCAACAAAACACATGGATATAAATAGATTGATCCAGTAATGAGATCCAGACTG
GGTGACCGATAATAAGGCGGAGATGATGACCGCGACAAACTTTAATTAATGAGATCCAACACAACACATCATTATAGAGATCCAGCGTTTTCTTCAGCGGATCCCTCGGAGAAATCTAATTTTGGAGTACTAATGGCGTTCATGGCCGTGCTCGAAGCCGATTTACGCGCCCTGTCTACTGAAGCAAGGCGAAAATACCC
GGCTGTAAAGGACGCAGCCGAGCACGCTATATTGAAGCTTCGATCACTTTCTGATCCCAGCGACATTGCACAGAATGATGACATAATACGCATCTTTTTGCTGGCTTGTGAAGTCAAGACTGTAAAGCTGAGTGTTCTAGGTCTGTCGTGCCTCCAAAAACTCATTGCACATGATGCAGTTGCACCTACTGCATTGAGAG
AGATTCTTACTACACTGAAAGAACATGCAGAAATGAATGATGAAAGTGTGCAGCTGAAGACACTACAAACTATATTGATTATATTCCAGTCGCGGTTACATCCAGAAGATGAGGATGATATGGCAATAGCACTGGGTATCAGTCTGAGGCTTTTGGAAAATAGTCGATGTCCAGATAGTGTCCGCAACACTGCTGCAGCA
ACATTACGGCAAGCGGTGGCCTTGATTTTTAATTGTGTTATAGCTGCCGAGTCCTTACCTGTCAGTAAGGTTGGCACAAACAGACACGTTTCTCCAACCAACTCTGTTACAGGGGATGTCAGCCGGAGTATTAGCACAACTATACCTATGGAGAGTGAAATAGGTCCTGGAGTATCACTTTCATCCAAAGAGAGTTTAAC
TCAAGCAGGAAAGCTCGGCCTTCTTCTATTTGAAGACCTGACAGCTCTTGCTGCAGGTGGATCTGCTACATGGTTGCGCGTCACTACACTGCAGAGAACATTTGCCTTGGATATCCTAGAGTGAGGGTTTATCTCCAACATTTTGTCTAAGATATTGATATGGTTGAATATTAGAATATTCTAAAATGCATTTTACCTTG
TGATTTGCTTAATTTTTTTTGAAGGGTGACTTGTACAGGGTGCAATATTCATTAATTTTTTTCTATGTTTGTTTATATTATCAAATTAATAATAGATCTTGAATGTGTGTTGTTAAAACATCTCTTGAGGGACACAAATCGTATTGTGGGATAATTGCTAGAAAGGTATCAGATTTTTTTTGAAACATCTATAATTGGGA
TGTTAAAATGTCATAACTCATGACCCCAACCTAGTTCTAGCAATGATTTGAGAAAGCATACTGGCCTCTTGTGCCTTTCAGAGAGCATCACATGCCATTGGAAACATTACCAAACATTTCTAGTTGGAATTTTAAGACCAAGCAATATTTGTCAAGGTTTCTACACTTTTTTTGGAAGCTAGCAATTACCTTCTATTACT
TCGTAAAATACATATGATACCAAAAATGTCGATTGGCTGGTCTGTCACTTGAGAAACCCGATCATCTAAAAGGACTAATATCAGTTCGGATTTGACAAAATTAACCAAGAGAGAACAACATTAACAAAGGGTAGAAAAAAAGTCTGCCCAAAAAGTGTGGGAAGCCAGAGCTTTTTGCCTTGTTGACGTTGTAGTCTAGT
TGAGAACAAATAATTTGTTTCCATGAGTAACATGACAACAAAACTCAAAGGAAAAATATTACATAGGATATTCAATGACCAGACACAAAGACCAGAATGTTTTAACCTTGTTGTTCATCATCCGAGGAAATTAAGATT

>TRINITY_DN125164_c5_g1_i12 from sample A1 / Example unspliced isoform:

GTAAGTTATTTTCTAATTAGATTCTACATTCCCTTCCGAAATTTCATTTTCAACTTTTGCTGATTTAATCACTTTTTTAATGGTTTTCCTAAGCCTCACTGTCTCACTAGTTTTATTGCAGTTTCGGGTTCTAATTTGGCTGGACACTCTGTTCTTGAATTTTTAGTTTTTTAACTTTTGTTGATTTTATCCTTATCTAA
TTGGTTTTCCAGCATGCAGAAATGAATGATGAAAGTGTGCAGCTGAAGACACTACAAACTATATTGATTATATTCCAGTCGCGGTTACATCCAGAAGATGAGGATGATATGGCAATAGCACTGGGTATCAGTCTGAGGCTTTTGGAAAATAGTCGATGTCCAGATAGTGTCCGCAACACTGCTGCAGCAACATTACGGCA
AGCGGTGGCCTTGATTTTTAATTGTGTTATAGCTGCCGAGTCCTTACCTGTCAGTAAGGTTGGCACAAACAGACACGTTTCTCCAACCAACTCTGTTACAGGGGATGTCAGCCGGAGTATTAGCACAACTATACCTATGGAGAGTGAAATAGGTCCTGGAGTATCACTTTCATCCAAAGAGAGTTTAACTCAAGCAGGAA
AGCTCGGCCTTCTTCTATTTGAAGACCTGACAGCTCTTGCTGCAGGTGGATCTgtatgtggcaaatacaatcttctagtttttaaattgcaagcttcttcatgttttatccatttaaagttgttgcatgtagtttgttcattttcaaatgacaggataaagcctttcttgggatgtttatttgctgatgtttaaaccttg
gagggttagtttaggggatttgtatttgtaaaattcttgattgcattctgatggcagGCTACATGGTTGCGCGTCACTACACTGCAGAGAACATTTGCCTTGGATATCCTAGA

Intron 3 GTTTTCCTTA ... AAAGCAAGAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	70.49	9	21	22
A2	76.74	5	13	20
A3	71.93	8	25	16
A4	67.27	9	12	25
A5	76.47	2	8	5
A6	100	0	1	0
A7	71.43	1	1	4
A8	100	0	2	3
A9	100	0	1	3
A10	100	0	3	3

>TRINITY_DN125164_c5_g1_i14 from sample A1 / Example spliced isoform

CTCCCATCATTCTTTTACTTTTCTATACTACAAAAGACCAAAAACATTTTGCTAAAGCTATCTCTTCATATCACCTTGTGCCTCATTGTCTAAGCTAACCTAAAGTGAGAGAGGGAGTTATTGAGGTGACAGTGGGTAGTCCCTCTAGATTTCCTTTGGGCTAGCATTGTTCTTTTGGAGTTTTATCACACTCTAGTTTG
GGAGGTAACACCTATGACATGATATTTTACTGACACCATGAATCTCTGTAGGTTAGCAGGCCAAACTTAAACCTTGAAGCTCCCTATAGTCAATATTTGTAGCTATATGCTAATGGCTTTATGCTTGGTTCTTTATTTTTTACATTTTGCTGTTGGGAGATAAGAAGGAAGATTTACTAAAAAGTTCATTAAACTTTATT
TTTAACTGAAATAATGAGATATAGTTTGTGTTAACACATGTTTTCTTTTTTGAAAATGCTTCATATATTAACTCAAAGTATAAAGTTCAAGATAGTTACATCAGAAGTGATTGATAGTCCTGGTCCAGGAAAGCCCAGTCCCCCACAGGGAGGGACTCAACAACATGGCCGAAAGCTCATTACTGTGTGTGGTGCAGCTG
AGTTGCTCATGGTTTCAGGCTGAATTTCAGTCTCTGTTTTTACTTTAGTACACTTGTCTTGTCCTTTTTGGGTGACTTGGTACAAAATGATCACTCACCTACCTTCTGTATTTTGATATTTTATAGAAGTCTTGGTCAGAGATGATCACTCTCCAGTAGCTTTGTACTCCTATATAGTCTAATTCATTATTGGTTGTATA
GCATGAATACAGTTTGGCAGTTTCGTCTTATACTTGTTTCTCCTCTCTTGTTTCTTCCTTGTATGAGTATTTCAGATTGCTGTTATTGTGTTCATATCAAGTGGAGAGATGACACTGGATAGTTTGTTATGGATGCATTGGTTTCAATTTCTAAACTAGTTGTCTAAGGAAGAAACACAAAATGAGTCCGAATTCCTTCA
AACTACTTTCTTTTACTTTTTATCTGTTGGCATTTTTTAAGATGAGGTTCATCTGTAGAAGACAAAAGAAATCCCAGTTCATTTATCCTTAGTTTCGTCTTCTTTTAACCTTTTGAAATTGATTATTGGTAACCTTTGCAGATTTGTTCTTTCAAATTATGTATCCGTTTTCAGAACCTTGTTGCCCTATGAACAGGTAA
CTAATTTTGAGTTATTTCTAGCATTGGAACAATAGGAAAATTAATAATGTAACTGAAACAGAATATATGATCAGGTTTTGCGGCGTCAGGTATGCTCATTGCTAATGACTTCACTGCGGGCGACGGGTGAGCTTGAAGGTGAGGTAGGAGAGCCAGCTTTCCGTCGTCTGGTCTTAAGATCAGTGGCACATGTCATTAGA
CTTTACAGCTCAGCTCTGGTAACAGAATGCGAGGTAAAAATGGGATTGATATCATATTTATAAGAATTTCCTAAGTACAATCAATTTCTGAAAGAAATGAGCTTCAGTAGACAAGCTTTTAGGTGACATATTGAATATAGTTTTGCTTCCAGTGGTCTTAAGTTTTTACAACATGTTTGTGCTGATTGGCTCCATGCACG
TGTTTGAAGGAACAAGTCACTTGCATTTCTGTAATGTCCATTCGTATTAAAGCAAGCAGTTCAACCAGGAGAAGATTAAAAACCAACTGCAAATGGCTATGACAGTATAAATTAATACTCTTATTTTTTGGGAAATACATATTCTAGAATCCCTTTGGCTAAGAAGCCATGCTATGAGGGGCATATATATGCTGTCAAAG
TCACCCAGGAATTGCAGTAGGCCTCATCCACAC

>TRINITY_DN125164_c5_g1_i3 from sample A1 / Example unspliced isoform:

CTCCCATCATTCTTTTACTTTTCTATACTACAAAAGACCAAAAACATTTTGCTAAAGCTATCTCTTCATATCACCTTGTGCCTCATTGTCTAAGCTAACCTAAAGTGAGAGAGGGAGTTATTGAGGTGACAGTGGGTAGTCCCTCTAGATTTCCTTTGGGCTAGCATTGTTCTTTTGGAGTTTTATCACACTCTAGTTTG
GGAGGTAACACCTATGACATGATATTTTACTGACACCATGAATCTCTGTAGGTTAGCAGGCCAAACTTAAACCTTGAAGCTCCCTATAGTCAATATTTGTAGCTATATGCTAATGGCTTTATGCTTGGTTCTTTATTTTTTACATTTTGCTGTTGGGAGATAAGAAGGAAGATTTACTAAAAAGTTCATTAAACTTTATT
TTTAACTGAAATAATGAGATATAGTTTGTGTTAACACATGTTTTCTTTTTTGAAAATGCTTCATATATTAACTCAAAGTATAAAGTTCAAGATAGTTACATCAGAAGTGATTGATAGTCCTGGTCCAGGAAAGCCCAGTCCCCCACAGGGAGGGACTCAACAACATGGCCGAAAGCTCATTACTGTGTGTGGTGCAGCTG
AGTTGCTCATGGTTTCAGGCTGAATTTCAGTCTCTGTTTTTACTTTAGTACACTTGTCTTGTCCTTTTTGGGTGACTTGGTACAAAATGATCACTCACCTACCTTCTGTATTTTGATATTTTATAGAAGTCTTGGTCAGAGATGATCACTCTCCAGTAGCTTTGTACTCCTATATAGTCTAATTCATTATTGGTTGTATA
GCATGAATACAGTTTGGCAGTTTCGTCTTATACTTGTTTCTCCTCTCTTGTTTCTTCCTTGTATGAGTATTTCAGATTGCTGTTATTGTGTTCATATCAAGTGGAGAGATGACACTGGATAGTTTGTTATGGATGCATTGGTTTCAATTTCTAAACTAGTTGTCTAAGGAAGAAACACAAAATGAGTCCGAATTCCTTCA
AACTACTTTCTTTTACTTTTTATCTGTTGGCATTTTTTAAGATGAGGTTCATCTGTAGAAGACAAAAGAAATCCCAGTTCATTTATCCTTAGTTTCGTCTTCTTTTAACCTTTTGAAATTGATTATTGGTAACCTTTGCAGgttttccttagcatgctggttaaaatcacaagtcttgacttgccgttatggcatcgcat
aatggtgcttgaagttttgaggagtttttgtgtggaagcacgtattctacgtcttctctttcaaacttttgacatgcaacgagggagcacaaatgtagtggctggaatgattaaaacacttgcacaagttgtcactaatgtacagattccagatgccagtgaagagagcttagcggctgttgctggcatgtttaacagca
aagcaagagATTTGTTCTTTCAAATTATGTATCCGTTTTCAGAACCTTGTTGCCCTATGAACAGGTAACTAATTTTGAGTTATTTCTAGCATTGGAACAATAGGAAAATTAATAATGTAACTGAAACAGAATATATGATCAGGTTTTGCGGCGTCAGGTATGCTCATTGCTAATGACTTCACTGCGGGCGACGGGTGAGC
TTGAAGGTGAGGTAGGAGAGCCAGCTTTCCGTCGTCTGGTCTTAAGATCAGTGGCACATGTCATTAGACTTTACAGCTCAGCTCTGGTAACAGAATGCGAGgttttccttagcatgctggttaaaatcacaagtcttgacttgccgttatggcatcgcataatggtgcttgaagttttgaggagtttttgtgtggaagca
cgtattctacgtcttctctttcaaacttttgacatgcaacgagggagcacaaatgtagtggctggaatgattaaaacacttgcacaagttgtcactaatgtacagattccagatgccagtgaagagagcttagcggctgttgctggcatgtttaacagcaaagcaagag

Intron 4 GTAACTAATT ... ATATGATCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	46.84	12.6	7.2	11.4
A2	40.75	20.4	4.8	14
A3	50.98	27	8.8	28
A4	13.46	17.4	2	3
A5	9.16	10.2	2	1
A6	-1	0	0	0
A7	0	5.8	0	0
A8	0	1.8	0	0
A9	38.57	9.6	2	6
A10	43.34	6.6	0	5

>TRINITY_DN125164_c5_g1_i9 from sample A1 / Example spliced isoform

CGGGGCGGCAATAGATTTGACAGGGAAAGGAAGGGACGGGAAAATGATGAATCCATCGTCCATTATTTGCTTGTACTAGCAGTGTCGGTCTATCTGGCAGCAGAGGAGTTTACTCCGGAACCCTGAGCAGCTATTTCAGCTTCTTCATCAACAAAACACATGGATATAAATAGATTGATCCAGTAATGAGATCCAGACTG
GGTGACCGATAATAAGGCGGAGATGATGACCGCGACAAACTTTAATTAATGAGATCCAACACAACACATCATTATAGAGATCCAGCGTTTTCTTCAGCGGATCCCTCGGAGAAATCTAATTTTGGAGTACTAATGGCGTTCATGGCCGTGCTCGAAGCCGATTTACGCGCCCTGTCTACTGAAGCAAGGCGAAAATACCC
GGCTGTAAAGGACGCAGCCGAGCACGCTATATTGAAGAGGTTTTCCTTAGCATGCTGGTTAAAATCACAAGTCTTGACTTGCCGTTATGGCATCGCATAATGGTGCTTGAAGTTTTGAGGCTTCGATCACTTTCTGATCCCAGCGACATTGCACAGAATGATGACATAATACGCATCTTTTTGCTGGCTTGTGAAGTCAA
GACTGTAAAGCTGAGTGTTCTAGGTCTGTCGTGCCTCCAAAAACTCATTGCACATGATGCAGTTGCACCTACTGCATTGAGAGAGATTCTTACTACACTGAAAGAAAGTTTTTGTGTGGAAGCACGTATTCTACGTCTTCTCTTTCAAACTTTTGACATGCAACGAGGGAGCACAAATGTAGTGGCTGGAATGATTAAAA
CACTTGCACAAGTTGTCACTAATGTACAGATTCCAGATGCCAGTGAAGAGAGCTTAGCGGCTGTTGCTGGCATGTTTAACAGCAAAGCAAGCATGCAGAAATGAATGAAGCGAAAGTGTGCAGCTGAAGACACTACAAACTATATTGATTATATTCCAGTCGCGGTTACATCCAGAAGATGAGGATGATATGGCAATAGC
ACTGGGTATCAGTCTGAGGCTTTTGGAAAATAGTCGATGTCCAGATAGTGTCCGCAACACTGCTGCAGCAACATTACGGCAAGCGGTGGCCTTGATTTTTAATTGTGTTATAGCTGCCGAGTCCTTACCTGTCAGTAAGGTTGGCACAAACAGACACGTTTCTCCAACCAACTCTGTTACAGGGGATGTCAGCCGGAGTA
TTAGCACAACTATACCTATGGAGAGTGAAATAGGTCCTGGAGTATCACTTTCATCCAAAGAGAGTTTAACTCAAGCAGGAAAGCTCGGCCTTCTTCTATTTGAAGACCTGACAGCTCTTGCTGCAGGTGGATCTGCTACATGGTTGCGCGTCACTACACTGCAGAGAACATTTGCCTTGGATATCCTAGAATTTGTTCTT
TCAAATTATGTATCCGTTTTCAGAACCTTGTTGCCCTATGAACAGGTTTTGCGGCGTCAGGTATGCTCATTGCTAATGACTTCACTGCGGGCGACGGGTGAGCTTGAAGGTGAGGTAGGAGAGCCAGCTTTCCGTCGTCTGGTCTTAAGATCAGTGGCACATGTCATTAGACTTTACAGCTCAGCTCTGGTAACAGAATG
CGAGGTTTTCCTTAGCATGCTGGTTAAAATCACAAGTCTTGACTTGCCGTTATGGCATCGCATAATGGTGCTTGAAGTTTTGAGGAGTTTTTGTGTGGAAGCACGTATTCTACGTCTTCTCTTTCAAACTTTTGACATGCAACGAGGGAGCACAAATGTAGTGGCTGGAATGATTAAAACACTTGCACAAGTTGTCACTA
ATGTACAGATTCCAGATGCCAGTGAAGAGAGCTTAGCGGCTGTTGCTGGCATGTTTAACAGCAAAGCAAGAG

>TRINITY_DN125164_c5_g1_i3 from sample A1 / Example unspliced isoform:

CTCCCATCATTCTTTTACTTTTCTATACTACAAAAGACCAAAAACATTTTGCTAAAGCTATCTCTTCATATCACCTTGTGCCTCATTGTCTAAGCTAACCTAAAGTGAGAGAGGGAGTTATTGAGGTGACAGTGGGTAGTCCCTCTAGATTTCCTTTGGGCTAGCATTGTTCTTTTGGAGTTTTATCACACTCTAGTTTG
GGAGGTAACACCTATGACATGATATTTTACTGACACCATGAATCTCTGTAGGTTAGCAGGCCAAACTTAAACCTTGAAGCTCCCTATAGTCAATATTTGTAGCTATATGCTAATGGCTTTATGCTTGGTTCTTTATTTTTTACATTTTGCTGTTGGGAGATAAGAAGGAAGATTTACTAAAAAGTTCATTAAACTTTATT
TTTAACTGAAATAATGAGATATAGTTTGTGTTAACACATGTTTTCTTTTTTGAAAATGCTTCATATATTAACTCAAAGTATAAAGTTCAAGATAGTTACATCAGAAGTGATTGATAGTCCTGGTCCAGGAAAGCCCAGTCCCCCACAGGGAGGGACTCAACAACATGGCCGAAAGCTCATTACTGTGTGTGGTGCAGCTG
AGTTGCTCATGGTTTCAGGCTGAATTTCAGTCTCTGTTTTTACTTTAGTACACTTGTCTTGTCCTTTTTGGGTGACTTGGTACAAAATGATCACTCACCTACCTTCTGTATTTTGATATTTTATAGAAGTCTTGGTCAGAGATGATCACTCTCCAGTAGCTTTGTACTCCTATATAGTCTAATTCATTATTGGTTGTATA
GCATGAATACAGTTTGGCAGTTTCGTCTTATACTTGTTTCTCCTCTCTTGTTTCTTCCTTGTATGAGTATTTCAGATTGCTGTTATTGTGTTCATATCAAGTGGAGAGATGACACTGGATAGTTTGTTATGGATGCATTGGTTTCAATTTCTAAACTAGTTGTCTAAGGAAGAAACACAAAATGAGTCCGAATTCCTTCA
AACTACTTTCTTTTACTTTTTATCTGTTGGCATTTTTTAAGATGAGGTTCATCTGTAGAAGACAAAAGAAATCCCAGTTCATTTATCCTTAGTTTCGTCTTCTTTTAACCTTTTGAAATTGATTATTGGTAACCTTTGCAGGTTTTCCTTAGCATGCTGGTTAAAATCACAAGTCTTGACTTGCCGTTATGGCATCGCAT
AATGGTGCTTGAAGTTTTGAGGAGTTTTTGTGTGGAAGCACGTATTCTACGTCTTCTCTTTCAAACTTTTGACATGCAACGAGGGAGCACAAATGTAGTGGCTGGAATGATTAAAACACTTGCACAAGTTGTCACTAATGTACAGATTCCAGATGCCAGTGAAGAGAGCTTAGCGGCTGTTGCTGGCATGTTTAACAGCA
AAGCAAGAGATTTGTTCTTTCAAATTATGTATCCGTTTTCAGAACCTTGTTGCCCTATGAACAGgtaactaattttgagttatttctagcattggaacaataggaaaattaataatgtaactgaaacagaatatatgatcagGTTTTGCGGCGTCAGGTATGCTCATTGCTAATGACTTCACTGCGGGCGACGGGTGAGC
TTGAAGGTGAGGTAGGAGAGCCAGCTTTCCGTCGTCTGGTCTTAAGATCAGTGGCACATGTCATTAGACTTTACAGCTCAGCTCTGGTAACAGAATGCGAGGTTTTCCTTAGCATGCTGGTTAAAATCACAAGTCTTGACTTGCCGTTATGGCATCGCATAATGGTGCTTGAAGTTTTGAGGAGTTTTTGTGTGGAAGCA
CGTATTCTACGTCTTCTCTTTCAAACTTTTGACATGCAACGAGGGAGCACAAATGTAGTGGCTGGAATGATTAAAACACTTGCACAAGTTGTCACTAATGTACAGATTCCAGATGCCAGTGAAGAGAGCTTAGCGGCTGTTGCTGGCATGTTTAACAGCAAAGCAAGAG