sp|F4JZG9|TERC_ARATH ----> Thylakoid membrane protein TERC, chloroplastic
Intron 1 GTGAGTGTCA ... ATTTCCTTAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 26.32 | 28 | 10 | 10 |
| A2 | 25 | 33 | 8 | 14 |
| A3 | 34.55 | 18 | 15 | 4 |
| A4 | 15.62 | 27 | 8 | 2 |
| A5 | 18.18 | 9 | 4 | 0 |
| A6 | 21.27 | 174 | 48 | 46 |
| A7 | 21.71 | 119 | 33 | 33 |
| A8 | 17.74 | 211 | 45 | 46 |
| A9 | 20.55 | 172 | 40 | 49 |
| A10 | 22.36 | 92 | 25 | 28 |
>TRINITY_DN39613_c0_g1_i1 from sample A10 / Example spliced isoformATTCCCTCTTTTTATTTCGTTCACATATTCCTTCGGACGAAAGCAGGGCTCAGGTCGGACAGCAGGATAGGGAAAGCAGGGCAGGGACATTCGTTTCACATACGGGGCACTAGACCACATATGTTTGGGTTGTATTTGAAGTTGAGCATTTGTTGCAAAGCAAAACTTTCAATCAAAGACTGGATTTTATGAATTGAAGT
GGACATCATAAGAGCGAGAGCCTGTTGGAGTGGGATTTTTCGCTCATATGGCAAAGTCAGTTTGCACTTCTGAATTGAGGCCGTTGACATTGATGCAATCTAATAAGGATGGGGTAATTAAACAGAAAAGTGGTAAACAATTTAGTTGTGCTGATCTACATATATGTCATCTGGGGTTGAAGTTACGTAGTAAGTGGAGC
TCAGATAGAGGACTGCTGCCAAAGGCAGCATTTCCACATAATTTGCAGTTGGTTTACAAGTTCAAAGGCAAATGTCATAGTAGAGGATGGCAGCTACAGATGTTCTGCTCTAGACAAACAGAACAAGAGGACTCCAGGGTATCAGAACCCTATGGAATACAACATGATAACATGGAAAAAGAGTCGTGCAGTAAATCTGA
TAATTATGAAGGTGCAAATGGTGATGCACCAGAAGACGGCAACATGAGTACAATGATAATTGAAAAAGTCGAGAAAATTGTTGAAGGTGCTCTAGACATAGTTTCATCTGTTGGTGAACTCAAGGGCTCACCAACTTCTGAACAGTCTACGCAAGAACATGCAGCAGCTGTGAAAACAGTTGTCTTCTGGTAGCCTTTGG
GATCTTTATTGGGTTCAAAGATGGAACTAGCAAGGCTTCTGAGTTTTTTGCAGGATATCTGCTGGAGCAAAGTTTGTCGGTGGACAATCTTTTTGTATTCATTTTAATTTTCAAGTATTTTCAGGTTCCTCTAATGTATCAGAGTCGGGTTCTTTCCTATGGCATTGCTGGTGCAATAATATTTCGTGCAACGATGATTT
TGCTTGGAGCGGCTACTCTGCAGAGATTCGAGATTGTGAATTTATTTTTGGCGGGAATTCTTCTCTATTCAGCATTTAAGCTGTTTACTGCAGAAGACGAGGAAGAAGAGGATTTATCAAATAACTTTATTGTAAAGACATGCAGGAATTTTATTCCAGTGACATCAAGCTATGACGGAGATCGATTTATCACACTATCG
GATGGTGTCCGCAAAGCAACCCCTTTGCTTCTGACAGTGGCTGTTGTGGAGCTGAGTGATATTGCTTTTGCTGTAGATTCAATACCAGCAGTTTTTGGTGTCACAAGAGACACATTCATAGTTTTCTCTTCAAATATGTTTGCTATACTTGGTTTGCGATCACTATATACCTTGATTTCTGGAAGCTTGTCTGAACTGGA
GTACCTTCAGCCTGCTGTTGGTGCGGTTTTAGGCTTCATTGGCTGCAAAATGGTTGCAGATTTCTTTGGTTATCATACACCGACGGAGATTTCCTTGGGATTTGTAGCCACGATACTTGGTACAGGAGTTCTGTTAAGCTTCATGACAAAATCAGAAGACAAGAGATAGTTGCTGGTCAGCAGTAGTACATCTAATACTT
TTTATTTTGTATCTTGAATAGGAGGTGCAATTTTGTAGGCATTGTATATGTGGATTGATTAAAATTATCGAACATTTTCATCCCTTGTGATCATGTTCTTGTGGGCCAAGGAAATTGTGTTTTTATGACAAGTCTTCTATAGTCATCAAGAGATCTTTAATGAGAGAAATTACTATGCAATTTGGGATCTCAGAAATTGA
GCTATTTTTTTTTCATTTTGTCAAGATCTTTTCAAACAGATGAATAAAGTATCCCAATATCTTTGTATAATCTCCTTGTGCCGGACTATATTCATGTGGAGGAGTATATTCATGGGCAGGACCTGTTGCTGTATGTTGTTATTTTGGACAAGGATGCAATGTCTTTTGCCAAAAGTCAACTAGCAACTTTTATGAACTTT
TGCAATTAAGCCTGAAACTTTATGGATATGCCAGAGATTTTTCTTGCTCTAAAAAA
>TRINITY_DN39613_c0_g1_i2 from sample A10 / Example unspliced isoform:ATTCCCTCTTTTTATTTCGTTCACATATTCCTTCGGACGAAAGCAGGGCTCAGGTCGGACAGCAGGATAGGGAAAGCAGGGCAGGGACATTCGTTTCACATACGGGGCACTAGACCACATATGTTTGGGTTGTATTTGAAGTTGAGCATTTGTTGCAAAGCAAAACTTTCAATCAAAGACTGGATTTTATGAATTGAAGT
GGACATCATAAGAGCGAGAGCCTGTTGGAGTGGGATTTTTCGCTCATATGGCAAAGTCAGTTTGCACTTCTGAATTGAGGCCGTTGACATTGATGCAATCTAATAAGGATGGGGTAATTAAACAGAAAAGTGGTAAACAATTTAGTTGTGCTGATCTACATATATGTCATCTGGGGTTGAAGTTACGTAGTAAGTGGAGC
TCAGATAGAGGACTGCTGCCAAAGGCAGCATTTCCACATAATTTGCAGTTGGTTTACAAGTTCAAAGGCAAATGTCATAGTAGAGGATGGCAGCTACAGATGTTCTGCTCTAGACAAACAGAACAAGAGGACTCCAGGGTATCAGAACCCTATGGAATACAACATGATAACATGGAAAAAGAGTCGTGCAGTAAATCTGA
TAATTATGAAGGTGCAAATGGTGATGCACCAGAAGACGGCAACATGAGTACAATGATAATTGAAAAAGTCGAGAAAATTGTTGAAGGTGCTCTAGACATAGTTTCATCTGTTGGTGAACTCAAGGGCTCACCAACTTCTGAACAGTCTACGCAAGAACATGCAGCAGCTGTGAAAACAGTTGTCTTCTGGGTTTGTGCTG
CAGTAGCCTTTGGGATCTTTATTGGGTTCAAAGATGGAACTAGCAAGGCTTCTGAGTTTTTTGCAGGATATCTGCTGGAGCAAAGTTTGTCGGTGGACAATCTTTTTGTATTCATTTTAATTTTCAAGTATTTTCAGGTTCCTCTAATGTATCAGAGTCGGGTTCTTTCCTATGGCATTGCTGGTGCAATAATATTTCGT
GCAACGATGATTTTGCTTGGAGCGGCTACTCTGCAGAGATTCGAGATTGTGAATTTATTTTTGGCGGGAATTCTTCTCTATTCAGCATTTAAGCTGTTTACTGCAGAAGACGAGGAAGAAGAGGATTTATCAAATAACTTTATTGTAAAGACATGCAGGAATTTTATTCCAGTGACATCAAGCTATGACGGAGATCGATT
TATCACACTATCGGATGGTGTCCGCAAAGCAACCCCTTTGCTTCTGACAGTGGCTGTTGTGGAGCTGAGTGATATTGCTTTTGCTGTAGATTCAATACCAGCAGTTTTTGGTGTCACAAGAGACACATTCATAGTTTTCTCTTCAAATATGTTTGCTATACTTGGTTTGCGATCACTATATACCTTGATTTCTGGAAGCT
TGTCTGAACTGGAGTACCTTCAGCCTGCTGTTGGTGCGGTTTTAGGCTTCATTGGCTGCAAAATGGTTGCAGATTTCTTTGgtgagtgtcacatcattagcagctaacttggagaatcatccattttttgatatgcaacttctagtggttttgcatccctgcatattaaatttgctattgatgtaaacttttaagtgtgg
acatagttttcatataaccttaatatgaacctagtggagaattcagtgcatcagaataatatgtttttatgttatgctcttttcagaagtatcactaactatttttggataattttgctgtctctgatttccttagGTTATCATACACCGACGGAGATTTCCTTGGGATTTGTAGCCACGATACTTGGTACAGGAGTTCT
GTTAAGCTTCATGACAAAATCAGAAGACAAGAGATAGTTGCTGGTCAGCAGTAGTACATCTAATACTTTTTATTTTGTATCTTGAATAGGAGGTGCAATTTTGTAGGCATTGTATATGTGGATTGATTAAAATTATCGAACATTTTCATCCCTTGTGATCATGTTCTTGTGGGCCAAGGAAATTGTGTTTTTATGACAAG
TCTTCTATAGTCATCAAGAGATCTTTAATGAGAGAAATTACTATGCAATTTGGGATCTCAGAAATTGAGCTATTTTTTTTTCATTTTGTCAAGATCTTTTCAAACAGATGAATAAAGTATCCCAATATCTTTGTATAATCTCCTTGTGCCGGACTATATTCATGTGGAGGAGTATATTCATGGGCAGGACCTGTTGCTGT
ATGTTGTTATTTTGGACAAGGATGCAATGTCTTTTGCCAAAAGTCAACTAGCAACTTTTATGAACTTTTGCAATTAAGCCTGAAACTTTATGGATATGCCAGAGATTTTTCTTGCTCTAAAAAA
Intron 2 GTTTGGTTTA ... GGTTGCACAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 30.57 | 49 | 22 | 21.2 |
| A2 | 31.83 | 24 | 13.5 | 9.2 |
| A3 | 26.63 | 26.6 | 6.5 | 13.2 |
| A4 | 24.43 | 17 | 5.7 | 5.5 |
| A5 | 20.55 | 15 | 5 | 2.8 |
| A6 | 21.65 | 70 | 25.7 | 14.3 |
| A7 | 13.14 | 72 | 15 | 7.2 |
| A8 | 20.48 | 65.8 | 24.5 | 10.5 |
| A9 | 14.08 | 63 | 13.8 | 7.2 |
| A10 | 15.08 | 45 | 10.2 | 6.3 |
>TRINITY_DN125673_c7_g1_i5 from sample A1 / Example spliced isoformATTTCGTTCACATATTCCTTCGGACGAAAGCAGGGCTCAGGTCGGACAGCAGGATAGGGAAAGCAGGGCAGGGACATTCGTTTCACATACGGGGCACTAGACCACATATGTTTGGGTTGTATTTGAAGTTGAGCATTTGTTGCAAAGCAAAACTTTCAATCAAAGACTGGATTTTATGAATTGAAGTGGACATCATAAGA
GCGAGAGCCTGTTGGAGTGGGATTTTTCGCTCATATGGCAAAGTCAGTTTGCACTTCTGAATTGAGGCCGTTGACATTGATGCAATCTAATAAGGATGGGGTAATTAAACAGAAAAGTGGTAAACAATTTAGTTGTGCTGATCTACATATATGTCATCTGGGGTTGAAGTTACGTAGTAAGTGGAGCTCAGATAGAGGAC
TGCTGCCAAAGGCAGCATTTCCACATAATTTGCAGTTGGTTTACAAGTTCAAAGGCAAATGTCATAGTAGAGGATGGCAGCTACAGATGTTCTGCTCTAGACAAACAGAACAAGAGGACTCCAGGGTATCAGAACCCTATGGAATACAACATGATAACATGGAAAAAGAGTCGTGCAGTAAATCTGATAATTATGAAGGT
GCAAATGGTGATGCACCAGAAGACGGCAACATGAGTACAATGATAATTGAAAAAGTCGAGAAAATTGTTGAAGGTGCTCTAGACATAGTTTCATCTGTTGGTGAACTCAAGGGCTCACCAACTTCTGAACAGTCTACGCAAGAACATGCAGCAGCTGTGAAAACAGTTGTCTTCTGGGTTTGTGCTGCAGTAGCCTTTGG
GATCTTTATTGGGTTCAAAGATGGAACTAGCAAGGCTTCTGAGTTTTTTGCAGGATATCTGCTGGAGCAAAGTTTGTCGGTGGACAATCTTTTTGTATTCATTTTAATTTTCAAGTATTTTCAGGTTCCTCTAATGTATCAGAGTCGGGTTCTTTCCTATGGCATTGCTGGTGCAATAATATTTCGTGCAACGATGATTT
TGCTTGGAGCGGCTACTCTGCAGAGATTCGAGATTGTGAATTTATTTTTGGCGGGAATTCTTCTCTATTCAGCATTTAAGCTGTTTACTGCAGAAGACGAGGAAGAAGAGGATTTATCAAATAACTTTATTGTAAAGACATGCAGGAATTTTATTCCAGTGACATCAAGCTATGACGGAGATCGATTTATCACACTATCG
GATGGTGTCCGCAAAGCAACCCCTTTGCTTCTGACAGTGGCTGTTGTGGAGCTGAGTGATATTGCTTTTGCTGTAGATTCAATACCAGCAGTTTTTGGTGTCACAAGAGACACATTCATAGTTTTCTCTTCAAATATGTTTGCTATACTTGGTTTGCGATCACTATATACCTTGATTTCTGGAAGCTTGTCTGAACTGGA
GTACCTTCAGCCTGCTGTTGGTGCGGTTTTAGGCTTCATTGGCTGCAAAATGGTTGCAGATTTCTTTGGTGAGTGTCACATCATTAGCAGCTAACTTGGAGAATCATCCATTTTTTGATATGCAACTTCTAGTGGTTTTGCATCCCC
>TRINITY_DN125673_c7_g1_i26 from sample A1 / Example unspliced isoform:ATTTCGTTCACATATTCCTTCGGACGAAAGCAGGGCTCAGGTCGGACAGCAGGATAGGGAAAGCAGGGCAGGGACATTCGTTTCACATACGGGGCACTAGACCACATATGTTTGGGTTGTATTTGAAGTTGAGCATTTGTTGCAAAGCAAAACTTTCAATCAAAGACTGGATTTTATGAATTGAAGTGGACATCATAAGA
GCGAGAGCCTGTTGGAGTGGGATTTTTCGCTCATATGGCAAAGTCAGTTTGCACTTCTGAATTGAGGCCGTTGACATTGATGCAATCTAATAAGGATGGGGTAATTAAACAGAAAAGTGGTAAACAATTTAGTTGTGCTGATCTACATATATGTCATCTGGGGTTGAAGTTACGTAGTAAGTGGAGCTCAGATAGAGGAC
TGCTGCCAAAGGCAGCATTTCCACATAATTTGCAGTTGGTTTACAAGTTCAAAGGTAAGATGTTATTTTAAAGCCACAAACATTTGGGTATGCTATCTATCTGACTTTCTTGGCACAGATTTTTGTTCTTTTGCTGTGGTTATGCTATTCTTTTTGGGTCCAATTTCAGGCAAATGTCATAGTAGAGGATGGCAGCTACA
GATGTTCTGCTCTAGACAAACAGAACAAGAGGACTCCAGGGTATCAGAACCCTATGGAATACAACATGATAACATGGAAAAAGAGTCGTGCAGTAAATCTGATAATTATGAAGGTGCAAATGGTGATGCACCAGAAGACGGCAACATGAGTACAATGATAATTGAAAAAGTCGAGAAAATTGTTGAAGGTGCTCTAGACA
TAGTTTCATCTGTTGGTGAACTCAAGGGCTCACCAACTTCTGAACAGTCTACGCAAGAACATGCAGCAGCTGTGAAAACAGTTGTCTTCTGGTAGCCTTTGGGATCTTTATTGGGTTCAAAGATGGAACTAGCAAGGCTTCTGAGTTTTTTGCAGGATATCTGCTGGAGCAAAGTTTGTCGGTGGACAATCTTTTTGTAT
TCATTTTAATTTTCAAGTATTTTCAGGTTCCTCTAATGTATCAGgtttggtttaattaccttgttgttatccttttcatgtacttgtattctatcaagtcgtacaacatgtgacagacaatatttgttgcatttttaggctgtgttgtgtaaaataagagcatcatgtttgtttgcttagatggaagtggtggagcaata
atctctcctttcgattctgcattccccttaattgtgtttaacaatgaactgttttcttttgtcactaagtgcttgtgctataaattataatgacataacgggttgcacagAGTCGGGTTCTTTCCTATGGCATTGCTGGTGCAATAATATTTCGTGCAACGATGATTTTGCTTGGAGCGGCTACTCTGCAGGTACTTTGT
TTAGTTGAACAAGTTGGTTTACACCTTGTTGCACTGCTGAAAGGCGTTTTACTTCTGGTTCTACTTTCAGTTTTTTGAATCTGTCGTTAAGTCATATCTCAATTTTCATTGGTTGGCTGTAGAGATTCGAGATTGTGAATTTATTTTTGGCGGGAATTCTTCTCTATTCAGCATTTAAGGTGCCATTTTGACCTCTTGAC
ATTTATGAAGGAAATTCTTCTTCTGAATTTTTCTTTTTTCGCATCAATTTTTAACCTTTAGAATTATGTCACATTATAATGTTATTTACCATGATTGGAGGATGAACTAAAATTGGCGAGTTTTTTACATTGCATTTGTGTAGAGGATACATGCTTGAATAAATTGTTGTGACGCCTTTGGTAGACAACTTGTAACATTT
TATGTGGAGTGTAAACAAACTGGCTAATCTACTGAGCGCAGAGTCCCTCCAAGCCCTGCAGCTTGGTTGAATTATTTGATGGGGATCATATATCACCATAAGGAAATGAAATCCTATGACATTAACTATCATGAACATAAAAGTAGC
Intron 3 GCAAGAGAAT ... TCTTTGTCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 40.82 | 53.8 | 16 | 37 |
| A2 | 35.99 | 46.3 | 4.3 | 26 |
| A3 | 28.7 | 35 | 9.4 | 14 |
| A4 | 33.51 | 65.8 | 12.8 | 33 |
| A5 | 33.49 | 16 | 7.3 | 8 |
| A6 | 20.68 | 85.1 | 11.9 | 22 |
| A7 | 18.2 | 109.7 | 18.6 | 24 |
| A8 | 21.75 | 65.9 | 9.8 | 18 |
| A9 | 23.74 | 103.4 | 14.6 | 32 |
| A10 | 23.29 | 96.9 | 15.8 | 29 |
>TRINITY_DN125673_c7_g1_i5 from sample A1 / Example spliced isoformATTTCGTTCACATATTCCTTCGGACGAAAGCAGGGCTCAGGTCGGACAGCAGGATAGGGAAAGCAGGGCAGGGACATTCGTTTCACATACGGGGCACTAGACCACATATGTTTGGGTTGTATTTGAAGTTGAGCATTTGTTGCAAAGCAAAACTTTCAATCAAAGACTGGATTTTATGAATTGAAGTGGACATCATAAGA
GCGAGAGCCTGTTGGAGTGGGATTTTTCGCTCATATGGCAAAGTCAGTTTGCACTTCTGAATTGAGGCCGTTGACATTGATGCAATCTAATAAGGATGGGGTAATTAAACAGAAAAGTGGTAAACAATTTAGTTGTGCTGATCTACATATATGTCATCTGGGGTTGAAGTTACGTAGTAAGTGGAGCTCAGATAGAGGAC
TGCTGCCAAAGGCAGCATTTCCACATAATTTGCAGTTGGTTTACAAGTTCAAAGGCAAATGTCATAGTAGAGGATGGCAGCTACAGATGTTCTGCTCTAGACAAACAGAACAAGAGGACTCCAGGGTATCAGAACCCTATGGAATACAACATGATAACATGGAAAAAGAGTCGTGCAGTAAATCTGATAATTATGAAGGT
GCAAATGGTGATGCACCAGAAGACGGCAACATGAGTACAATGATAATTGAAAAAGTCGAGAAAATTGTTGAAGGTGCTCTAGACATAGTTTCATCTGTTGGTGAACTCAAGGGCTCACCAACTTCTGAACAGTCTACGCAAGAACATGCAGCAGCTGTGAAAACAGTTGTCTTCTGGGTTTGTGCTGCAGTAGCCTTTGG
GATCTTTATTGGGTTCAAAGATGGAACTAGCAAGGCTTCTGAGTTTTTTGCAGGATATCTGCTGGAGCAAAGTTTGTCGGTGGACAATCTTTTTGTATTCATTTTAATTTTCAAGTATTTTCAGGTTCCTCTAATGTATCAGAGTCGGGTTCTTTCCTATGGCATTGCTGGTGCAATAATATTTCGTGCAACGATGATTT
TGCTTGGAGCGGCTACTCTGCAGAGATTCGAGATTGTGAATTTATTTTTGGCGGGAATTCTTCTCTATTCAGCATTTAAGCTGTTTACTGCAGAAGACGAGGAAGAAGAGGATTTATCAAATAACTTTATTGTAAAGACATGCAGGAATTTTATTCCAGTGACATCAAGCTATGACGGAGATCGATTTATCACACTATCG
GATGGTGTCCGCAAAGCAACCCCTTTGCTTCTGACAGTGGCTGTTGTGGAGCTGAGTGATATTGCTTTTGCTGTAGATTCAATACCAGCAGTTTTTGGTGTCACAAGAGACACATTCATAGTTTTCTCTTCAAATATGTTTGCTATACTTGGTTTGCGATCACTATATACCTTGATTTCTGGAAGCTTGTCTGAACTGGA
GTACCTTCAGCCTGCTGTTGGTGCGGTTTTAGGCTTCATTGGCTGCAAAATGGTTGCAGATTTCTTTGGTGAGTGTCACATCATTAGCAGCTAACTTGGAGAATCATCCATTTTTTGATATGCAACTTCTAGTGGTTTTGCATCCCC
>TRINITY_DN125673_c7_g1_i15 from sample A1 / Example unspliced isoform:ATTTCGTTCACATATTCCTTCGGACGAAAGCAGGGCTCAGGTCGGACAGCAGGATAGGGAAAGCAGGGCAGGGACATTCGTTTCACATACGGGGCACTAGACCACATATGTTTGGGTTGTATTTGAAGTTGAGCATTTGTTGCAAAGCAAAACTTTCAATCAAAGACTGGATTTTATGAATTGAAGTGGACATCATAAGA
GCGAGAGCCTGTTGGAGTGGGATTTTTCGCTCATATGGCAAAGTCAGTTTGCACTTCTGAATTGAGGCCGTTGACATTGATGCAATCTAATAAGGATGGGGTAATTAAACAGAAAAGTGGTAAACAATTTAGTTGTGCTGATCTACATATATGTCATCTGGGGTTGAAGTTACGTAGTAAGTGGAGCTCAGATAGAGGAC
TGCTGCCAAAGGCAGCATTTCCACATAATTTGCAGTTGGTTTACAAGTTCAAAGGTAAGATGTTATTTTAAAGCCACAAACATTTGGGTATGCTATCTATCTGACTTTCTTGGCACAGATTTTTGTTCTTTTGCTGTGGTTATGCTATTCTTTTTGGGTCCAATTTCAGGCAAATGTCATAGTAGAGGATGGCAGCTACA
GATGTTCTGCTCTAGACAAACAGAACAAGAGGACTCCAGGGTATCAGgcaagagaataaccttttgacctgactttaatgcattatattggtcactagatggtatttaatttctgagatacgttgtttgcattctatcatattgtactggataactacattagtgcaatccattgatcttggtttttagctattccatat
tgttgctggaagccttactgatttcatgattaaagtattctcatgtcattggatccctagctatagatgtttttaagcatgtgaaatgtattccaggggatttattcctttgaatggaccaaatgcaacatcgtaattctgaatatctcaacaaattcataataatattttgctaacagactgcataaacaatgagataa
gaaatacagattattatctctatatgtggaaattataaatcttttgacattgaactttgaagaacatgtctagtgctgcatggtattatttcttttttcaaatgtttgaatgcatttggagactactgtaccgacacttccttttctgtttgagataataagttgcactaaaataaattacatgtagaggattaaggaag
ttgggctaactcgaggctatggaagagttcatatttaatatctgtcatttttctttgtcagAACCCTATGGAATACAACATGATAACATGGAAAAAGAGTCGTGCAGTAAATCTGATAATTATGAAGGTGCAAATGGTGATGCACCAGAAGACGGCAACATGAGTACAATGATAATTGAAAAAGTCGAGAAAATTGTTGA
AGGTGCTCTAGACATAGTTTCATCTGTTGGTGAACTCAAGGGCTCACCAACTTCTGAACAGTCTACGCAAGAACATGCAGCAGCTGTGAAAACAGTTGTCTTCTGGGTTTGTGCTGCAGTAGCCTTTGGGATCTTTATTGGGTTCAAAGATGGAACTAGCAAGGCTTCTGAGTTTTTTGCAGGATATCTGCTGGAGCAAA
GTTTGTCGGTGGACAATCTTTTTGTATTCATTTTAATTTTCAAGTATTTTCAGAGTCGGGTTCTTTCCTATGGCATTGCTGGTGCAATAATATTTCGTGCAACGATGATTTTGCTTGGAGCGGCTACTCTGCAGAGATTCGAGATTGTGAATTTATTTTTGGCGGGAATTCTTCTCTATTCAGCATTTAAGCTGTTTACT
GCAGAAGACGAGGAAGAAGAGGATTTATCAAATAACTTTATTGTAAAGACATGCAGGAATTTTATTCCAGTGACATCAAGCTATGACGGAGATCGATTTATCACACTATCGGATGGTGTCCGCAAAGTATGGTATCTTTGTGCTTTTAGCCATCTGCTTGGTAGAGTCTTCCATAGCAGATAGTTGATTAAAAAAGTGGA
TTTTGATAGTTATTAGTCCTGGCCAGACTTTGGGAACAAACTTTTTGTCCTAGTCAATTGGTTAACAAAATCTGATAAGTAATAGAGTATTATGAGTAAGAGATGCATTTTAATCAACTTATAACAACATTTCAACTAATTTTTATGGCCTTTTCTCTAAGCAGGCAACCCCTTTGCTTCTGACAGTGGCTGTTGTGGAG
CTGAGTGATATTGCTTTTGCTGTAAGTAATCAATGTGTAACTGGTTGTTTTTACAGTTAAATAGAGTTGCCAGTAATGGCATGGTGGCGTTTTTATCAGTTTATGGCTTCTATTATCAGGGCTCTTCATGTAGAAATTGAATCTGACAGTTCAAAACTTGATGTATGTTCCAGGTAGATTCAATACCAGCAGTTTTTGGT
GTCACAAGAGACACATTCATAGTTTTCTCTTCAAATATGTTTGCTATACTTGGTTTGCGATCACTATATACCTTGATTTCTGGAAGCTTGTCTGAACTGGAGTACCTTCAGCCTGCTGTTGGTGCGGTTTTAGGCTTCATTGGCTGCAAAATGGTTGCAGATTTCTTTGGT
Intron 4 GTTCCTCTAA ... GGTTGCACAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 37.44 | 50.6 | 32 | 22 |
| A2 | 38.47 | 25.4 | 19 | 11 |
| A3 | 32.56 | 26.9 | 9 | 16 |
| A4 | 32.86 | 19.3 | 11 | 7 |
| A5 | 28.33 | 16 | 7 | 4 |
| A6 | 33.14 | 79.7 | 50 | 19 |
| A7 | 23.49 | 78.6 | 32 | 10 |
| A8 | 28.98 | 62.4 | 30 | 15 |
| A9 | 25.63 | 67 | 29 | 9 |
| A10 | 26.25 | 46.9 | 19 | 9 |
>TRINITY_DN125673_c7_g1_i12 from sample A1 / Example spliced isoformTGCACCTTCATAATTATCAGATTTACTGCACGACTCTTTTTCCATGTTATCATGTTGTATTCTCATGTCATTGGATCCCTAGCTATAGATGTTTTTAAGCATGTGAAATGTATTCCAGGGGATTTATTCCTTTGAATGGACCAAATGCAACATCGTAATTCTGAATATCTCAACAAATTCATAATAATATTTTGCTAACA
GACTGCATAAACAATGAGATAAGAAATACAGATTATTATCTCTATATGTGGAAATTATAAATCTTTTGACATTGAACTTTGAAGAACATGTCTAGTGCTGCATGGTATTATTTCTTTTTTCAAATGTTTGAATGCATTTGGAGACTACTGTACCGACACTTCCTTTTCTGTTTGAGATAATAAGTTGCACTAAAATAAAT
TACATGTAGAGGATTAAGGAAGTTGGGCTAACTCGAGGCTATGGAAGAGTTCATATTTAATATCTGTCATTTTTCTTTGTCAGAACCCTATGGAATACAACATGATAACATGGAAAAAGAGTCGTGCAGTAAATCTGATAATTATGAAGGTGCAAATGGTGATGCACCAGAAGACGGCAACATGAGTACAATGATAATTG
AAAAAGTCGAGAAAATTGTTGAAGGTGCTCTAGACATAGTTTCATCTGTTGGTGAACTCAAGGGCTCACCAACTTCTGAACAGTCTACGCAAGAACATGCAGCAGCTGTGAAAACAGTTGTCTTCTGGGTGAGTGCCATTTTGAACAATTTGTTGACATTAGCTAATGGTTAAAACTGGCAATGGGTCATTGAAGTGTCT
AGGCGACCTATGCCTATAATAATTTCTTTTTAATAAAATTATCTTATCTTATCTTATCTCTCCTCTTCGATAATTCTATTTTTTTGATGACCTTAAAACATATCCCTGGACATAATAAGTACAGGTTTGTGCTGCAGTAGCCTTTGGGATCTTTATTGGGTTCAAAGATGGAACTAGCAAGGCTTCTGAGTTTTTTGCAG
GATATCTGCTGGAGCAAAGTTTGTCGGTGGACAATCTTTTTGTATTCATTTTAATTTTCAAGTATTTTCAGAGTCGGGTTCTTTCCTATGGCATTGCTGGTGCAATAATATTTCGTGCAACGATGATTTTGCTTGGAGCGGCTACTCTGCAGAGATTCGAGATTGTGAATTTATTTTTGGCGGGAATTCTTCTCTATTCA
GCATTTAAG
>TRINITY_DN125673_c7_g1_i9 from sample A1 / Example unspliced isoform:ATTTCGTTCACATATTCCTTCGGACGAAAGCAGGGCTCAGGTCGGACAGCAGGATAGGGAAAGCAGGGCAGGGACATTCGTTTCACATACGGGGCACTAGACCACATATGTTTGGGTTGTATTTGAAGTTGAGCATTTGTTGCAAAGCAAAACTTTCAATCAAAGACTGGATTTTATGAATTGAAGTGGACATCATAAGA
GCGAGAGCCTGTTGGAGTGGGATTTTTCGCTCATATGGCAAAGTCAGTTTGCACTTCTGAATTGAGGCCGTTGACATTGATGCAATCTAATAAGGATGGGGTAATTAAACAGAAAAGTGGTAAACAATTTAGTTGTGCTGATCTACATATATGTCATCTGGGGTTGAAGTTACGTAGTAAGTGGAGCTCAGATAGAGGAC
TGCTGCCAAAGGCAGCATTTCCACATAATTTGCAGTTGGTTTACAAGTTCAAAGGCAAATGTCATAGTAGAGGATGGCAGCTACAGATGTTCTGCTCTAGACAAACAGAACAAGAGGACTCCAGGGTATCAGAACCCTATGGAATACAACATGATAACATGGAAAAAGAGTCGTGCAGTAAATCTGATAATTATGAAGGT
GCAAATGGTGATGCACCAGAAGACGGCAACATGAGTACAATGATAATTGAAAAAGTCGAGAAAATTGTTGAAGGTGCTCTAGACATAGTTTCATCTGTTGGTGAACTCAAGGGCTCACCAACTTCTGAACAGTCTACGCAAGAACATGCAGCAGCTGTGAAAACAGTTGTCTTCTGGTAGCCTTTGGGATCTTTATTGGG
TTCAAAGATGGAACTAGCAAGGCTTCTGAGTTTTTTGCAGGATATCTGCTGGAGCAAAGTTTGTCGGTGGACAATCTTTTTGTATTCATTTTAATTTTCAAGTATTTTCAGgttcctctaatgtatcaggtttggtttaattaccttgttgttatccttttcatgtacttgtattctatcaagtcgtacaacatgtgaca
gacaatatttgttgcatttttaggctgtgttgtgtaaaataagagcatcatgtttgtttggtggagcaataatctctcctttcgattctgcattccccttaattgtgtttaacaatgaactgttttcttttgtcactaagtgcttgtgctataaattataatgacataacgggttgcacagAGTCGGGTTCTTTCCTATG
GCATTGCTGGTGCAATAATATTTCGTGCAACGATGATTTTGCTTGGAGCGGCTACTCTGCAGAGATTCGAGATTGTGAATTTATTTTTGGCGGGAATTCTTCTCTATTCAGCATTTAAGGTGCCATTTTGACCTCTTGACATTTATGAAGGAAATTCTTCTTCTGAATTTTTCTTTTTTCGCATCAATTTTTAACCTTTA
GAATTATGTCACATTATAATGTTATTTACCATGATTGGAGGATGAACTAAAATTGGCGAGTTTTTTACATTGCATTTGTGTAGAGGATACATGCTTGAATAAATTGTTGTGACGCCTTTGGTAGACAACTTGTAACATTTTATGTGGAGTGTAAACAAACTGGCTAATCTACTGAGCGCAGAGTCCCTCCAAGCCCTGCA
GCTTGGTTGAATTATTTGATGGGGATCATATATCACCATAAGGAAATGAAATCCTATGACATTAACTATCATGAACATAAAAGTAGC
Intron 5 GTATGGTATC ... CTCTAAGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 33.33 | 34 | 17 | 10 |
| A2 | 32.5 | 27 | 13 | 6 |
| A3 | 20 | 32 | 8 | 2 |
| A4 | 16.13 | 26 | 5 | 0 |
| A5 | 0 | 5 | 0 | 2 |
| A6 | 20.75 | 168 | 44 | 0 |
| A7 | 13.67 | 120 | 19 | 0 |
| A8 | 16.11 | 125 | 24 | 1 |
| A9 | 14.37 | 143 | 24 | 0 |
| A10 | 7.5 | 74 | 6 | 0 |
>TRINITY_DN125673_c7_g1_i5 from sample A1 / Example spliced isoformATTTCGTTCACATATTCCTTCGGACGAAAGCAGGGCTCAGGTCGGACAGCAGGATAGGGAAAGCAGGGCAGGGACATTCGTTTCACATACGGGGCACTAGACCACATATGTTTGGGTTGTATTTGAAGTTGAGCATTTGTTGCAAAGCAAAACTTTCAATCAAAGACTGGATTTTATGAATTGAAGTGGACATCATAAGA
GCGAGAGCCTGTTGGAGTGGGATTTTTCGCTCATATGGCAAAGTCAGTTTGCACTTCTGAATTGAGGCCGTTGACATTGATGCAATCTAATAAGGATGGGGTAATTAAACAGAAAAGTGGTAAACAATTTAGTTGTGCTGATCTACATATATGTCATCTGGGGTTGAAGTTACGTAGTAAGTGGAGCTCAGATAGAGGAC
TGCTGCCAAAGGCAGCATTTCCACATAATTTGCAGTTGGTTTACAAGTTCAAAGGCAAATGTCATAGTAGAGGATGGCAGCTACAGATGTTCTGCTCTAGACAAACAGAACAAGAGGACTCCAGGGTATCAGAACCCTATGGAATACAACATGATAACATGGAAAAAGAGTCGTGCAGTAAATCTGATAATTATGAAGGT
GCAAATGGTGATGCACCAGAAGACGGCAACATGAGTACAATGATAATTGAAAAAGTCGAGAAAATTGTTGAAGGTGCTCTAGACATAGTTTCATCTGTTGGTGAACTCAAGGGCTCACCAACTTCTGAACAGTCTACGCAAGAACATGCAGCAGCTGTGAAAACAGTTGTCTTCTGGGTTTGTGCTGCAGTAGCCTTTGG
GATCTTTATTGGGTTCAAAGATGGAACTAGCAAGGCTTCTGAGTTTTTTGCAGGATATCTGCTGGAGCAAAGTTTGTCGGTGGACAATCTTTTTGTATTCATTTTAATTTTCAAGTATTTTCAGGTTCCTCTAATGTATCAGAGTCGGGTTCTTTCCTATGGCATTGCTGGTGCAATAATATTTCGTGCAACGATGATTT
TGCTTGGAGCGGCTACTCTGCAGAGATTCGAGATTGTGAATTTATTTTTGGCGGGAATTCTTCTCTATTCAGCATTTAAGCTGTTTACTGCAGAAGACGAGGAAGAAGAGGATTTATCAAATAACTTTATTGTAAAGACATGCAGGAATTTTATTCCAGTGACATCAAGCTATGACGGAGATCGATTTATCACACTATCG
GATGGTGTCCGCAAAGCAACCCCTTTGCTTCTGACAGTGGCTGTTGTGGAGCTGAGTGATATTGCTTTTGCTGTAGATTCAATACCAGCAGTTTTTGGTGTCACAAGAGACACATTCATAGTTTTCTCTTCAAATATGTTTGCTATACTTGGTTTGCGATCACTATATACCTTGATTTCTGGAAGCTTGTCTGAACTGGA
GTACCTTCAGCCTGCTGTTGGTGCGGTTTTAGGCTTCATTGGCTGCAAAATGGTTGCAGATTTCTTTGGTGAGTGTCACATCATTAGCAGCTAACTTGGAGAATCATCCATTTTTTGATATGCAACTTCTAGTGGTTTTGCATCCCC
>TRINITY_DN125673_c7_g1_i15 from sample A1 / Example unspliced isoform:ATTTCGTTCACATATTCCTTCGGACGAAAGCAGGGCTCAGGTCGGACAGCAGGATAGGGAAAGCAGGGCAGGGACATTCGTTTCACATACGGGGCACTAGACCACATATGTTTGGGTTGTATTTGAAGTTGAGCATTTGTTGCAAAGCAAAACTTTCAATCAAAGACTGGATTTTATGAATTGAAGTGGACATCATAAGA
GCGAGAGCCTGTTGGAGTGGGATTTTTCGCTCATATGGCAAAGTCAGTTTGCACTTCTGAATTGAGGCCGTTGACATTGATGCAATCTAATAAGGATGGGGTAATTAAACAGAAAAGTGGTAAACAATTTAGTTGTGCTGATCTACATATATGTCATCTGGGGTTGAAGTTACGTAGTAAGTGGAGCTCAGATAGAGGAC
TGCTGCCAAAGGCAGCATTTCCACATAATTTGCAGTTGGTTTACAAGTTCAAAGGTAAGATGTTATTTTAAAGCCACAAACATTTGGGTATGCTATCTATCTGACTTTCTTGGCACAGATTTTTGTTCTTTTGCTGTGGTTATGCTATTCTTTTTGGGTCCAATTTCAGGCAAATGTCATAGTAGAGGATGGCAGCTACA
GATGTTCTGCTCTAGACAAACAGAACAAGAGGACTCCAGGGTATCAGGCAAGAGAATAACCTTTTGACCTGACTTTAATGCATTATATTGGTCACTAGATGGTATTTAATTTCTGAGATACGTTGTTTGCATTCTATCATATTGTACTGGATAACTACATTAGTGCAATCCATTGATCTTGGTTTTTAGCTATTCCATAT
TGTTGCTGGAAGCCTTACTGATTTCATGATTAAAGTATTCTCATGTCATTGGATCCCTAGCTATAGATGTTTTTAAGCATGTGAAATGTATTCCAGGGGATTTATTCCTTTGAATGGACCAAATGCAACATCGTAATTCTGAATATCTCAACAAATTCATAATAATATTTTGCTAACAGACTGCATAAACAATGAGATAA
GAAATACAGATTATTATCTCTATATGTGGAAATTATAAATCTTTTGACATTGAACTTTGAAGAACATGTCTAGTGCTGCATGGTATTATTTCTTTTTTCAAATGTTTGAATGCATTTGGAGACTACTGTACCGACACTTCCTTTTCTGTTTGAGATAATAAGTTGCACTAAAATAAATTACATGTAGAGGATTAAGGAAG
TTGGGCTAACTCGAGGCTATGGAAGAGTTCATATTTAATATCTGTCATTTTTCTTTGTCAGAACCCTATGGAATACAACATGATAACATGGAAAAAGAGTCGTGCAGTAAATCTGATAATTATGAAGGTGCAAATGGTGATGCACCAGAAGACGGCAACATGAGTACAATGATAATTGAAAAAGTCGAGAAAATTGTTGA
AGGTGCTCTAGACATAGTTTCATCTGTTGGTGAACTCAAGGGCTCACCAACTTCTGAACAGTCTACGCAAGAACATGCAGCAGCTGTGAAAACAGTTGTCTTCTGGGTTTGTGCTGCAGTAGCCTTTGGGATCTTTATTGGGTTCAAAGATGGAACTAGCAAGGCTTCTGAGTTTTTTGCAGGATATCTGCTGGAGCAAA
GTTTGTCGGTGGACAATCTTTTTGTATTCATTTTAATTTTCAAGTATTTTCAGAGTCGGGTTCTTTCCTATGGCATTGCTGGTGCAATAATATTTCGTGCAACGATGATTTTGCTTGGAGCGGCTACTCTGCAGAGATTCGAGATTGTGAATTTATTTTTGGCGGGAATTCTTCTCTATTCAGCATTTAAGCTGTTTACT
GCAGAAGACGAGGAAGAAGAGGATTTATCAAATAACTTTATTGTAAAGACATGCAGGAATTTTATTCCAGTGACATCAAGCTATGACGGAGATCGATTTATCACACTATCGGATGGTGTCCGCAAAgtatggtatctttgtgcttttagccatctgcttggtagagtcttccatagcagatagttgattaaaaaagtgga
ttttgatagttattagtcctggccagactttgggaacaaactttttgtcctagtcaattggttaacaaaatctgataagtaatagagtattatgagtaagagatgcattttaatcaacttataacaacatttcaactaatttttatggccttttctctaagcagGCAACCCCTTTGCTTCTGACAGTGGCTGTTGTGGAG
CTGAGTGATATTGCTTTTGCTGTAAGTAATCAATGTGTAACTGGTTGTTTTTACAGTTAAATAGAGTTGCCAGTAATGGCATGGTGGCGTTTTTATCAGTTTATGGCTTCTATTATCAGGGCTCTTCATGTAGAAATTGAATCTGACAGTTCAAAACTTGATGTATGTTCCAGGTAGATTCAATACCAGCAGTTTTTGGT
GTCACAAGAGACACATTCATAGTTTTCTCTTCAAATATGTTTGCTATACTTGGTTTGCGATCACTATATACCTTGATTTCTGGAAGCTTGTCTGAACTGGAGTACCTTCAGCCTGCTGTTGGTGCGGTTTTAGGCTTCATTGGCTGCAAAATGGTTGCAGATTTCTTTGGT
Intron 6 GTGAGTGCCA ... ATAAGTACAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 39.77 | 53 | 35 | 15.8 |
| A2 | 44.34 | 29 | 23.1 | 3.2 |
| A3 | 40 | 33 | 22 | 6.9 |
| A4 | 37.62 | 35 | 21.1 | 5.7 |
| A5 | 47.06 | 9 | 8 | 6.9 |
| A6 | 31.01 | 70.4 | 31.6 | 3.5 |
| A7 | 28.47 | 98 | 39 | 8.1 |
| A8 | 23.53 | 65 | 20 | 5.8 |
| A9 | 23.76 | 77 | 24 | 7.9 |
| A10 | 21.88 | 50 | 14 | 0.6 |
>TRINITY_DN125673_c7_g1_i5 from sample A1 / Example spliced isoformATTTCGTTCACATATTCCTTCGGACGAAAGCAGGGCTCAGGTCGGACAGCAGGATAGGGAAAGCAGGGCAGGGACATTCGTTTCACATACGGGGCACTAGACCACATATGTTTGGGTTGTATTTGAAGTTGAGCATTTGTTGCAAAGCAAAACTTTCAATCAAAGACTGGATTTTATGAATTGAAGTGGACATCATAAGA
GCGAGAGCCTGTTGGAGTGGGATTTTTCGCTCATATGGCAAAGTCAGTTTGCACTTCTGAATTGAGGCCGTTGACATTGATGCAATCTAATAAGGATGGGGTAATTAAACAGAAAAGTGGTAAACAATTTAGTTGTGCTGATCTACATATATGTCATCTGGGGTTGAAGTTACGTAGTAAGTGGAGCTCAGATAGAGGAC
TGCTGCCAAAGGCAGCATTTCCACATAATTTGCAGTTGGTTTACAAGTTCAAAGGCAAATGTCATAGTAGAGGATGGCAGCTACAGATGTTCTGCTCTAGACAAACAGAACAAGAGGACTCCAGGGTATCAGAACCCTATGGAATACAACATGATAACATGGAAAAAGAGTCGTGCAGTAAATCTGATAATTATGAAGGT
GCAAATGGTGATGCACCAGAAGACGGCAACATGAGTACAATGATAATTGAAAAAGTCGAGAAAATTGTTGAAGGTGCTCTAGACATAGTTTCATCTGTTGGTGAACTCAAGGGCTCACCAACTTCTGAACAGTCTACGCAAGAACATGCAGCAGCTGTGAAAACAGTTGTCTTCTGGGTTTGTGCTGCAGTAGCCTTTGG
GATCTTTATTGGGTTCAAAGATGGAACTAGCAAGGCTTCTGAGTTTTTTGCAGGATATCTGCTGGAGCAAAGTTTGTCGGTGGACAATCTTTTTGTATTCATTTTAATTTTCAAGTATTTTCAGGTTCCTCTAATGTATCAGAGTCGGGTTCTTTCCTATGGCATTGCTGGTGCAATAATATTTCGTGCAACGATGATTT
TGCTTGGAGCGGCTACTCTGCAGAGATTCGAGATTGTGAATTTATTTTTGGCGGGAATTCTTCTCTATTCAGCATTTAAGCTGTTTACTGCAGAAGACGAGGAAGAAGAGGATTTATCAAATAACTTTATTGTAAAGACATGCAGGAATTTTATTCCAGTGACATCAAGCTATGACGGAGATCGATTTATCACACTATCG
GATGGTGTCCGCAAAGCAACCCCTTTGCTTCTGACAGTGGCTGTTGTGGAGCTGAGTGATATTGCTTTTGCTGTAGATTCAATACCAGCAGTTTTTGGTGTCACAAGAGACACATTCATAGTTTTCTCTTCAAATATGTTTGCTATACTTGGTTTGCGATCACTATATACCTTGATTTCTGGAAGCTTGTCTGAACTGGA
GTACCTTCAGCCTGCTGTTGGTGCGGTTTTAGGCTTCATTGGCTGCAAAATGGTTGCAGATTTCTTTGGTGAGTGTCACATCATTAGCAGCTAACTTGGAGAATCATCCATTTTTTGATATGCAACTTCTAGTGGTTTTGCATCCCC
>TRINITY_DN125673_c7_g1_i1 from sample A1 / Example unspliced isoform:TGCACCTTCATAATTATCAGATTTACTGCACGACTCTTTTTCCATGTTATCATGTTGTATTCTCATGTCATTGGATCCCTAGCTATAGATGTTTTTAAGCATGTGAAATGTATTCCAGGGGATTTATTCCTTTGAATGGACCAAATGCAACATCGTAATTCTGAATATCTCAACAAATTCATAATAATATTTTGCTAACA
GACTGCATAAACAATGAGATAAGAAATACAGATTATTATCTCTATATGTGGAAATTATAAATCTTTTGACATTGAACTTTGAAGAACATGTCTAGTGCTGCATGGTATTATTTCTTTTTTCAAATGTTTGAATGCATTTGGAGACTACTGTACCGACACTTCCTTTTCTGTTTGAGATAATAAGTTGCACTAAAATAAAT
TACATGTAGAGGATTAAGGAAGTTGGGCTAACTCGAGGCTATGGAAGAGTTCATATTTAATATCTGTCATTTTTCTTTGTCAGAACCCTATGGAATACAACATGATAACATGGAAAAAGAGTCGTGCAGTAAATCTGATAATTATGAAGGTGCAAATGGTGATGCACCAGAAGACGGCAACATGAGTACAATGATAATTG
AAAAAGTCGAGAAAATTGTTGAAGGTGCTCTAGACATAGTTTCATCTGTTGGTGAACTCAAGGGCTCACCAACTTCTGAACAGTCTACGCAAGAACATGCAGCAGCTGTGAAAACAGTTGTCTTCTGGgtgagtgccattttgaacaatttgttgacattagctaatggttaaaactggcaatgggtcattgaagtgtct
aggcgacctatgcctataataatttctttttaataaaattatcttatcttatcttatctctcctcttcgataattctatttttttgatgaccttaaaacatatccctggacataataagtacagGTTTGTGCTGCAGTAGCCTTTGGGATCTTTATTGGGTTCAAAGATGGAACTAGCAAGGCTTCTGAGTTTTTTGCAG
GGTAAGTGGAGGGCACTCTTGTAATCCATTAGTCATATTTCAATTCTTTCAGATAAAATTCCATTGAAAACATTAGCTTTTTGTATGTTAAATGTCTGAAGCTATGAATCTATAGATATATTTATTATTTCCAAGCTAATTTTTCCACACGAAGTTAACTTGTGTCAATTTGCTGTACCAGAGGTGTAGTTTGAGTAGTG
AAATCAGTGGGGTTTGTGCACTAAAAGCTATATAGTATAAAGGGAGTTCATAATGCATATACCAGCAAAGAAATGAAATGAAATTATATCAAGGGCTGCTGCTTAGGCCTTCATGCTGCATTATGTAACCATTTTTTTCCCTGGTGATAGATCTTTGTTTTATAAATAGTAGTTTCTGGAAATTTCAGTCCAGTTTGGGC
TCAACTGATTTTAGATTGTTTCTTAACCAAACCGACCAGTTCGGCACCCAGCCCGACCTGTGGCCCCCAAACAAAGAAATATAAAAAAAGTACAACCCCTCCAACCCTCATCCTACCTTAAAGATGACCCCCACTTTTGACTCATGCTCTTCTCATTGAGAGTTTGTGAGCATGTGAAGATTTGGAGCTGTAGCAAAGGG
AGC
Intron 7 GTAAGTAATC ... TATGTTCCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 38.03 | 44 | 8 | 27 |
| A2 | 20 | 24 | 3 | 6 |
| A3 | 28 | 36 | 1 | 14 |
| A4 | 29.17 | 34 | 0 | 14 |
| A5 | 25 | 9 | 1 | 3 |
| A6 | 28.46 | 186 | 0 | 74 |
| A7 | 18.87 | 129 | 0 | 30 |
| A8 | 24.22 | 122 | 0 | 39 |
| A9 | 26.96 | 168 | 0 | 62 |
| A10 | 19.1 | 72 | 0 | 17 |
>TRINITY_DN125673_c7_g1_i5 from sample A1 / Example spliced isoformATTTCGTTCACATATTCCTTCGGACGAAAGCAGGGCTCAGGTCGGACAGCAGGATAGGGAAAGCAGGGCAGGGACATTCGTTTCACATACGGGGCACTAGACCACATATGTTTGGGTTGTATTTGAAGTTGAGCATTTGTTGCAAAGCAAAACTTTCAATCAAAGACTGGATTTTATGAATTGAAGTGGACATCATAAGA
GCGAGAGCCTGTTGGAGTGGGATTTTTCGCTCATATGGCAAAGTCAGTTTGCACTTCTGAATTGAGGCCGTTGACATTGATGCAATCTAATAAGGATGGGGTAATTAAACAGAAAAGTGGTAAACAATTTAGTTGTGCTGATCTACATATATGTCATCTGGGGTTGAAGTTACGTAGTAAGTGGAGCTCAGATAGAGGAC
TGCTGCCAAAGGCAGCATTTCCACATAATTTGCAGTTGGTTTACAAGTTCAAAGGCAAATGTCATAGTAGAGGATGGCAGCTACAGATGTTCTGCTCTAGACAAACAGAACAAGAGGACTCCAGGGTATCAGAACCCTATGGAATACAACATGATAACATGGAAAAAGAGTCGTGCAGTAAATCTGATAATTATGAAGGT
GCAAATGGTGATGCACCAGAAGACGGCAACATGAGTACAATGATAATTGAAAAAGTCGAGAAAATTGTTGAAGGTGCTCTAGACATAGTTTCATCTGTTGGTGAACTCAAGGGCTCACCAACTTCTGAACAGTCTACGCAAGAACATGCAGCAGCTGTGAAAACAGTTGTCTTCTGGGTTTGTGCTGCAGTAGCCTTTGG
GATCTTTATTGGGTTCAAAGATGGAACTAGCAAGGCTTCTGAGTTTTTTGCAGGATATCTGCTGGAGCAAAGTTTGTCGGTGGACAATCTTTTTGTATTCATTTTAATTTTCAAGTATTTTCAGGTTCCTCTAATGTATCAGAGTCGGGTTCTTTCCTATGGCATTGCTGGTGCAATAATATTTCGTGCAACGATGATTT
TGCTTGGAGCGGCTACTCTGCAGAGATTCGAGATTGTGAATTTATTTTTGGCGGGAATTCTTCTCTATTCAGCATTTAAGCTGTTTACTGCAGAAGACGAGGAAGAAGAGGATTTATCAAATAACTTTATTGTAAAGACATGCAGGAATTTTATTCCAGTGACATCAAGCTATGACGGAGATCGATTTATCACACTATCG
GATGGTGTCCGCAAAGCAACCCCTTTGCTTCTGACAGTGGCTGTTGTGGAGCTGAGTGATATTGCTTTTGCTGTAGATTCAATACCAGCAGTTTTTGGTGTCACAAGAGACACATTCATAGTTTTCTCTTCAAATATGTTTGCTATACTTGGTTTGCGATCACTATATACCTTGATTTCTGGAAGCTTGTCTGAACTGGA
GTACCTTCAGCCTGCTGTTGGTGCGGTTTTAGGCTTCATTGGCTGCAAAATGGTTGCAGATTTCTTTGGTGAGTGTCACATCATTAGCAGCTAACTTGGAGAATCATCCATTTTTTGATATGCAACTTCTAGTGGTTTTGCATCCCC
>TRINITY_DN125673_c7_g1_i15 from sample A1 / Example unspliced isoform:ATTTCGTTCACATATTCCTTCGGACGAAAGCAGGGCTCAGGTCGGACAGCAGGATAGGGAAAGCAGGGCAGGGACATTCGTTTCACATACGGGGCACTAGACCACATATGTTTGGGTTGTATTTGAAGTTGAGCATTTGTTGCAAAGCAAAACTTTCAATCAAAGACTGGATTTTATGAATTGAAGTGGACATCATAAGA
GCGAGAGCCTGTTGGAGTGGGATTTTTCGCTCATATGGCAAAGTCAGTTTGCACTTCTGAATTGAGGCCGTTGACATTGATGCAATCTAATAAGGATGGGGTAATTAAACAGAAAAGTGGTAAACAATTTAGTTGTGCTGATCTACATATATGTCATCTGGGGTTGAAGTTACGTAGTAAGTGGAGCTCAGATAGAGGAC
TGCTGCCAAAGGCAGCATTTCCACATAATTTGCAGTTGGTTTACAAGTTCAAAGGTAAGATGTTATTTTAAAGCCACAAACATTTGGGTATGCTATCTATCTGACTTTCTTGGCACAGATTTTTGTTCTTTTGCTGTGGTTATGCTATTCTTTTTGGGTCCAATTTCAGGCAAATGTCATAGTAGAGGATGGCAGCTACA
GATGTTCTGCTCTAGACAAACAGAACAAGAGGACTCCAGGGTATCAGGCAAGAGAATAACCTTTTGACCTGACTTTAATGCATTATATTGGTCACTAGATGGTATTTAATTTCTGAGATACGTTGTTTGCATTCTATCATATTGTACTGGATAACTACATTAGTGCAATCCATTGATCTTGGTTTTTAGCTATTCCATAT
TGTTGCTGGAAGCCTTACTGATTTCATGATTAAAGTATTCTCATGTCATTGGATCCCTAGCTATAGATGTTTTTAAGCATGTGAAATGTATTCCAGGGGATTTATTCCTTTGAATGGACCAAATGCAACATCGTAATTCTGAATATCTCAACAAATTCATAATAATATTTTGCTAACAGACTGCATAAACAATGAGATAA
GAAATACAGATTATTATCTCTATATGTGGAAATTATAAATCTTTTGACATTGAACTTTGAAGAACATGTCTAGTGCTGCATGGTATTATTTCTTTTTTCAAATGTTTGAATGCATTTGGAGACTACTGTACCGACACTTCCTTTTCTGTTTGAGATAATAAGTTGCACTAAAATAAATTACATGTAGAGGATTAAGGAAG
TTGGGCTAACTCGAGGCTATGGAAGAGTTCATATTTAATATCTGTCATTTTTCTTTGTCAGAACCCTATGGAATACAACATGATAACATGGAAAAAGAGTCGTGCAGTAAATCTGATAATTATGAAGGTGCAAATGGTGATGCACCAGAAGACGGCAACATGAGTACAATGATAATTGAAAAAGTCGAGAAAATTGTTGA
AGGTGCTCTAGACATAGTTTCATCTGTTGGTGAACTCAAGGGCTCACCAACTTCTGAACAGTCTACGCAAGAACATGCAGCAGCTGTGAAAACAGTTGTCTTCTGGGTTTGTGCTGCAGTAGCCTTTGGGATCTTTATTGGGTTCAAAGATGGAACTAGCAAGGCTTCTGAGTTTTTTGCAGGATATCTGCTGGAGCAAA
GTTTGTCGGTGGACAATCTTTTTGTATTCATTTTAATTTTCAAGTATTTTCAGAGTCGGGTTCTTTCCTATGGCATTGCTGGTGCAATAATATTTCGTGCAACGATGATTTTGCTTGGAGCGGCTACTCTGCAGAGATTCGAGATTGTGAATTTATTTTTGGCGGGAATTCTTCTCTATTCAGCATTTAAGCTGTTTACT
GCAGAAGACGAGGAAGAAGAGGATTTATCAAATAACTTTATTGTAAAGACATGCAGGAATTTTATTCCAGTGACATCAAGCTATGACGGAGATCGATTTATCACACTATCGGATGGTGTCCGCAAAGTATGGTATCTTTGTGCTTTTAGCCATCTGCTTGGTAGAGTCTTCCATAGCAGATAGTTGATTAAAAAAGTGGA
TTTTGATAGTTATTAGTCCTGGCCAGACTTTGGGAACAAACTTTTTGTCCTAGTCAATTGGTTAACAAAATCTGATAAGTAATAGAGTATTATGAGTAAGAGATGCATTTTAATCAACTTATAACAACATTTCAACTAATTTTTATGGCCTTTTCTCTAAGCAGGCAACCCCTTTGCTTCTGACAGTGGCTGTTGTGGAG
CTGAGTGATATTGCTTTTGCTgtaagtaatcaatgtgtaactggttgtttttacagttaaatagagttgccagtaatggcatggtggcgtttttatcagtttatggcttctattatcagggctcttcatgtagaaattgaatctgacagttcaaaacttgatgtatgttccagGTAGATTCAATACCAGCAGTTTTTGGT
GTCACAAGAGACACATTCATAGTTTTCTCTTCAAATATGTTTGCTATACTTGGTTTGCGATCACTATATACCTTGATTTCTGGAAGCTTGTCTGAACTGGAGTACCTTCAGCCTGCTGTTGGTGCGGTTTTAGGCTTCATTGGCTGCAAAATGGTTGCAGATTTCTTTGGT
Intron 8 GTTCCTCTAA ... GGTTGCACAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 31.44 | 57 | 26.5 | 19.5 |
| A2 | 35.22 | 28 | 15.5 | 5.5 |
| A3 | 19.2 | 29 | 7 | 7.5 |
| A4 | 25.19 | 21 | 7.5 | 2.5 |
| A5 | 26.5 | 18 | 6.5 | 0.5 |
| A6 | 19.47 | 90 | 26.5 | 5 |
| A7 | 16.02 | 88 | 18.5 | 1.5 |
| A8 | 17.7 | 70 | 17 | 1.5 |
| A9 | 15.71 | 76 | 16 | 3.5 |
| A10 | 13.2 | 53 | 9.5 | 1 |
>TRINITY_DN125673_c7_g1_i12 from sample A1 / Example spliced isoformTGCACCTTCATAATTATCAGATTTACTGCACGACTCTTTTTCCATGTTATCATGTTGTATTCTCATGTCATTGGATCCCTAGCTATAGATGTTTTTAAGCATGTGAAATGTATTCCAGGGGATTTATTCCTTTGAATGGACCAAATGCAACATCGTAATTCTGAATATCTCAACAAATTCATAATAATATTTTGCTAACA
GACTGCATAAACAATGAGATAAGAAATACAGATTATTATCTCTATATGTGGAAATTATAAATCTTTTGACATTGAACTTTGAAGAACATGTCTAGTGCTGCATGGTATTATTTCTTTTTTCAAATGTTTGAATGCATTTGGAGACTACTGTACCGACACTTCCTTTTCTGTTTGAGATAATAAGTTGCACTAAAATAAAT
TACATGTAGAGGATTAAGGAAGTTGGGCTAACTCGAGGCTATGGAAGAGTTCATATTTAATATCTGTCATTTTTCTTTGTCAGAACCCTATGGAATACAACATGATAACATGGAAAAAGAGTCGTGCAGTAAATCTGATAATTATGAAGGTGCAAATGGTGATGCACCAGAAGACGGCAACATGAGTACAATGATAATTG
AAAAAGTCGAGAAAATTGTTGAAGGTGCTCTAGACATAGTTTCATCTGTTGGTGAACTCAAGGGCTCACCAACTTCTGAACAGTCTACGCAAGAACATGCAGCAGCTGTGAAAACAGTTGTCTTCTGGGTGAGTGCCATTTTGAACAATTTGTTGACATTAGCTAATGGTTAAAACTGGCAATGGGTCATTGAAGTGTCT
AGGCGACCTATGCCTATAATAATTTCTTTTTAATAAAATTATCTTATCTTATCTTATCTCTCCTCTTCGATAATTCTATTTTTTTGATGACCTTAAAACATATCCCTGGACATAATAAGTACAGGTTTGTGCTGCAGTAGCCTTTGGGATCTTTATTGGGTTCAAAGATGGAACTAGCAAGGCTTCTGAGTTTTTTGCAG
GATATCTGCTGGAGCAAAGTTTGTCGGTGGACAATCTTTTTGTATTCATTTTAATTTTCAAGTATTTTCAGAGTCGGGTTCTTTCCTATGGCATTGCTGGTGCAATAATATTTCGTGCAACGATGATTTTGCTTGGAGCGGCTACTCTGCAGAGATTCGAGATTGTGAATTTATTTTTGGCGGGAATTCTTCTCTATTCA
GCATTTAAG
>TRINITY_DN125673_c7_g1_i13 from sample A1 / Example unspliced isoform:CACATTTTTCTAAACTGAAAACATCACATTTGGTCCAAAGCATCTTGGATGGTTTCGATTCTCGAATGAACTTTAGAATTCATATTTGAATAGAAATGTTGATTTTGCTTAATAATTTGAAAGCTAAAAATGAAAACTTGTAAGCATCACGGGATTCAATAAATTGTCTTGAGACCAAAATTAGAACCTATGTTAGTTTC
TTATCTTCTCTTTGAGTTAGGACTACTGCTGTCTGTTCTATGGGGACTATGTATTAAAATTGTTTTATCCTTTAGTCTTCTTTTGGGTCCATGCTTGAGGGCTAAAGGTGCAAAATGGTTGTTTAAGGTAAGCTATGAAAATACGCTTTAGGAGTTTTATTAGCAAGCTAGCAATGGGATTGAATATGTGAGCCAATAGT
AATCTTGTGCATTGATTTGTCTTGTTTCAGATATCTGCTGGAGCAAAGTTTGTCGGTGGACAATCTTTTTGTATTCATTTTAATTTTCAAGTATTTTCAGgttcctctaatgtatcaggtttggtttaattaccttgttgttatccttttcatgtacttgtattctatcaagtcgtacaacatgtgacagacaatatttg
ttgcatttttaggctgtgttgtgtaaaataagagcatcatgtttgtttgcttagatggaagtggtggagcaataatctctcctttcgattctgcattccccttaattgtgtttaacaatgaactgttttcttttgtcactaagtgcttgtgctataaattataatgacataacgggttgcacagAGTCGGGTTCTTTCCT
ATGGCATTGCTGGTGCAATAATATTTCGTGCAACGATGATTTTGCTTGGAGCGGCTACTCTGCAG
Intron 9 GTAAGATGTT ... CCAATTTCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 32.85 | 60 | 29.6 | 27.1 |
| A2 | 37.05 | 66.7 | 39.8 | 17.6 |
| A3 | 35.42 | 59.2 | 32.7 | 21.5 |
| A4 | 22.01 | 71.4 | 20.2 | 14.8 |
| A5 | 28.57 | 27.3 | 11 | 8.4 |
| A6 | 22.47 | 124.7 | 37.6 | 18.9 |
| A7 | 24.46 | 176.4 | 58.4 | 19.7 |
| A8 | 24.34 | 93.6 | 30.6 | 13.6 |
| A9 | 27.3 | 146 | 55.6 | 25.5 |
| A10 | 12.76 | 118.5 | 17.6 | 10.1 |
>TRINITY_DN125673_c7_g1_i5 from sample A1 / Example spliced isoformATTTCGTTCACATATTCCTTCGGACGAAAGCAGGGCTCAGGTCGGACAGCAGGATAGGGAAAGCAGGGCAGGGACATTCGTTTCACATACGGGGCACTAGACCACATATGTTTGGGTTGTATTTGAAGTTGAGCATTTGTTGCAAAGCAAAACTTTCAATCAAAGACTGGATTTTATGAATTGAAGTGGACATCATAAGA
GCGAGAGCCTGTTGGAGTGGGATTTTTCGCTCATATGGCAAAGTCAGTTTGCACTTCTGAATTGAGGCCGTTGACATTGATGCAATCTAATAAGGATGGGGTAATTAAACAGAAAAGTGGTAAACAATTTAGTTGTGCTGATCTACATATATGTCATCTGGGGTTGAAGTTACGTAGTAAGTGGAGCTCAGATAGAGGAC
TGCTGCCAAAGGCAGCATTTCCACATAATTTGCAGTTGGTTTACAAGTTCAAAGGCAAATGTCATAGTAGAGGATGGCAGCTACAGATGTTCTGCTCTAGACAAACAGAACAAGAGGACTCCAGGGTATCAGAACCCTATGGAATACAACATGATAACATGGAAAAAGAGTCGTGCAGTAAATCTGATAATTATGAAGGT
GCAAATGGTGATGCACCAGAAGACGGCAACATGAGTACAATGATAATTGAAAAAGTCGAGAAAATTGTTGAAGGTGCTCTAGACATAGTTTCATCTGTTGGTGAACTCAAGGGCTCACCAACTTCTGAACAGTCTACGCAAGAACATGCAGCAGCTGTGAAAACAGTTGTCTTCTGGGTTTGTGCTGCAGTAGCCTTTGG
GATCTTTATTGGGTTCAAAGATGGAACTAGCAAGGCTTCTGAGTTTTTTGCAGGATATCTGCTGGAGCAAAGTTTGTCGGTGGACAATCTTTTTGTATTCATTTTAATTTTCAAGTATTTTCAGGTTCCTCTAATGTATCAGAGTCGGGTTCTTTCCTATGGCATTGCTGGTGCAATAATATTTCGTGCAACGATGATTT
TGCTTGGAGCGGCTACTCTGCAGAGATTCGAGATTGTGAATTTATTTTTGGCGGGAATTCTTCTCTATTCAGCATTTAAGCTGTTTACTGCAGAAGACGAGGAAGAAGAGGATTTATCAAATAACTTTATTGTAAAGACATGCAGGAATTTTATTCCAGTGACATCAAGCTATGACGGAGATCGATTTATCACACTATCG
GATGGTGTCCGCAAAGCAACCCCTTTGCTTCTGACAGTGGCTGTTGTGGAGCTGAGTGATATTGCTTTTGCTGTAGATTCAATACCAGCAGTTTTTGGTGTCACAAGAGACACATTCATAGTTTTCTCTTCAAATATGTTTGCTATACTTGGTTTGCGATCACTATATACCTTGATTTCTGGAAGCTTGTCTGAACTGGA
GTACCTTCAGCCTGCTGTTGGTGCGGTTTTAGGCTTCATTGGCTGCAAAATGGTTGCAGATTTCTTTGGTGAGTGTCACATCATTAGCAGCTAACTTGGAGAATCATCCATTTTTTGATATGCAACTTCTAGTGGTTTTGCATCCCC
>TRINITY_DN125673_c7_g1_i25 from sample A1 / Example unspliced isoform:AGCTGGGTCCTTCGACATCAATGGTCGCAAATGGGTGCACTTCGCTGCCATCATGGCAAGGATTGATCAGTTAGATTATTATTGATCTCATTTGAATTGCCTCCCTCTCTTTTGGCTGCAATGATGGCAGGGATTGATCAGTTAGATTAGTATTGATCTCATATGAATTGCCTTCCCCTCTTTTGGCTGCAATCAGTTAG
TTCATATCTGTTAGCATCTTACTCATCCACATGTCACCAGGTAGGTCTCTTGCCATCTCTTGATTTCCCAAGGCATTAGCGCCACATAGGTGTAGTTCTAGTCTCAACTTCTGCTAGTGTTTCTAGAATTTAATAACTCTCGGATGATACTCGTTTGGAGGTATCATAATCTTAAAGTTGCAACTAAAGAAGCATTTAGA
TAATAACATACTATTGCTTGTTAGAGAAGCACTTCTAGGCTTTTCGTTAGAGTGTGCTGGTGCAGAAGCTGAGGCCATATTTTAATTAGACCAGCCTTTCTTGGAGATTGAAATTTTGCACTTTATTCTTGTATGGTATATATTTAATAATATTGGACTACTTACAAATTATCACTCCTGCAATTTGAAGACAACTGTTT
TCAGTGTTGCAATAGGTTAGGCACAATCACTGATCATGGAAATGTTGCAGGGGTTGAAGTTACGTAGTAAGTGGAGCTCAGATAGAGGACTGCTGCCAAAGGCAGCATTTCCACATAATTTGCAGTTGGTTTACAAGTTCAAAGgtaagatgttattttaaagccacaaacatttgggtatgctatctatctgactttct
tggcacagatttttgttcttttgctgtggttatgctattctttttgggtccaatttcagGCAAATGTCATAGTAGAGGATGGCAGCTACAGATGTTCTGCTCTAGACAAACAGAACAAGAGGACTCCAGGGTATCAGGCAAGAGAATAACCTTTTGACCTGACTTTAATGCATTATATTGGTCACTAGATGGTATTTAAT
TTCTGAGATACGTTGTTTGCATTCTATCATATTGTACTGGATAACTACATTAGTGCAATCCATTGATCTTGGTTTTTAGCTATTCCATATTGTTGCTGGAAGCCTTACTGATTTCATGATTAAAGTATTCTCATGTCATTGGATCCCTAGCTATAGATGTTTTTAAGCATGTGAAATGTATTCCAGGGGATTTATTCCTT
TGAATGGACCAAATGCAACATCGTAATTCTGAATATCTCAACAAATTCATAATAATATTTTGCTAACAGACTGCATAAACAATGAGATAAGAAATACAGATTATTATCTCTATATGTGGAAATTATAAATCTTTTGACATTGAACTTTGAAGAACATGTCTAGTGCTGCATGGTATTATTTCTTTTTTCAAATGTTTGAA
TGCATTTGGAGACTACTGTACCGACACTTCCTTTTCTGTTTGAGATAATAAGTTGCACTAAAATAAATTACATGTAGAGGATTAAGGAAGTTGGGCTAACTCGAGGCTATGGAAGAGTTCATATTTAATATCTGTCATTTTTCTTTGTCAGAACCCTATGGAATACAACATGATAACATGGAAAAAGAGTCGTGCAGTAA
ATCTGATAATTATGAAGGTGCAAATGGTGATGCACCAGAAGACGGCAACATGAGTACAATGATAATTGAAAAAGTCGAGAAAATTGTTGAAGGTGCTCTAGACATAGTTTCATCTGTTGGTGAACTCAAGGGCTCACCAACTTCTGAACAGTCTACGCAAGAACATGCAGCAGCTGTGAAAACAGTTGTCTTCTGGGTTT
GTGCTGCAGTAGCCTTTGGGATCTTTATTGGGTTCAAAGATGGAACTAGCAAGGCTTCTGAGTTTTTTGCAGGATATCTGCTGGAGCAAAGTTTGTCGGTGGACAATCTTTTTGTATTCATTTTAATTTTCAAGTATTTTCAGGTTCCTCTAATGTATCAGAGTCGGGTTCTTTCCTATGGCATTGCTGGTGCAATAATA
TTTCGTGCAACGATGATTTTGCTTGGAGCGGCTACTCTGCAGAGATTCGAGATTGTGAATTTATTTTTGGCGGGAATTCTTCTCTATTCAGCATTTAAGCTGTTTACTGCAGAAGACGAGGAAGAAGAGGATTTATCAAATAACTTTATTGTAAAGACATGCAGGAATTTTATTCCAGTGACATCAAGCTATGACGGAGA
TCGATTTATCACACTATCGGATGGTGTCCGCAAAGCAACCCCTTTGCTTCTGACAGTGGCTGTTGTGGAGCTGAGTGATATTGCTTTTGCTGTAGATTCAATACCAGCAGTTTTTGGTGTCACAAGAGACACATTCATAGTTTTCTCTTCAAATATGTTTGCTATACTTGGTTTGCGATCACTATATACCTTGATTTCTG
GAAGCTTGTCTGAACTGGAGTACCTTCAGCCTGCTGTTGGTGCGGTTTTAGGCTTCATTGGCTGCAAAATGGTTGCAGATTTCTTTGGTTATCATACACCGACGGAGATTTCCTTGGGATTTGTAGCCACGATACTTGGTACAGGAGTTCTGTTAAGCTTCATGACAAAATCAGAAGACAAGAGATAGTTGCTGGTCAGC
AGTAGTACATCTAATACTTTTTATTTTGTATCTTGAATAGGAGGTGCAATTTTGTAGGCATTGTATATGTGGATTGATTAAAATTATCGAACATTTTCATCCCTTGTGATCATGTTCTTGTGGGCCAAGGAAATTGTGTTTTTATGACAAGTCTTCTATAGTCATCAAGAGATCTTTAATGAGAGAAATTACTATGCAAT
TTGGGATCTCAGAAATTGAGCTATTTTTTTTTCATTTTGTCAAGATCTTTTCAAACAGATGAATAAAGTATCCCAATATCTTTGTATAATCTCCTTGTGCCGGACTATATTCATGTGGAGGAGTATATTCATGGGCAGGACCTGTTGCTGTATGTTGTTATTTTGGACAAGGATGCAATGTCTTTTGCCAAAAGTCAACT
AGCAACTTTTATGAACTTTTGCAATTAAGCCC
Intron 10 GTACTTTGTT ... TTGGCTGTAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 19.35 | 40.3 | 12 | 7 |
| A2 | 15.81 | 24.8 | 7 | 2 |
| A3 | 9 | 36.1 | 3 | 4 |
| A4 | 10.78 | 27 | 3 | 3 |
| A5 | 1.97 | 30 | 1 | 0 |
| A6 | 0.97 | 56.6 | 1 | 0 |
| A7 | 1.77 | 63 | 2 | 0 |
| A8 | 0.94 | 57.8 | 1 | 0 |
| A9 | 0.96 | 63.9 | 1 | 0 |
| A10 | 1.2 | 45.3 | 1 | 0 |
>TRINITY_DN125673_c7_g1_i5 from sample A1 / Example spliced isoformATTTCGTTCACATATTCCTTCGGACGAAAGCAGGGCTCAGGTCGGACAGCAGGATAGGGAAAGCAGGGCAGGGACATTCGTTTCACATACGGGGCACTAGACCACATATGTTTGGGTTGTATTTGAAGTTGAGCATTTGTTGCAAAGCAAAACTTTCAATCAAAGACTGGATTTTATGAATTGAAGTGGACATCATAAGA
GCGAGAGCCTGTTGGAGTGGGATTTTTCGCTCATATGGCAAAGTCAGTTTGCACTTCTGAATTGAGGCCGTTGACATTGATGCAATCTAATAAGGATGGGGTAATTAAACAGAAAAGTGGTAAACAATTTAGTTGTGCTGATCTACATATATGTCATCTGGGGTTGAAGTTACGTAGTAAGTGGAGCTCAGATAGAGGAC
TGCTGCCAAAGGCAGCATTTCCACATAATTTGCAGTTGGTTTACAAGTTCAAAGGCAAATGTCATAGTAGAGGATGGCAGCTACAGATGTTCTGCTCTAGACAAACAGAACAAGAGGACTCCAGGGTATCAGAACCCTATGGAATACAACATGATAACATGGAAAAAGAGTCGTGCAGTAAATCTGATAATTATGAAGGT
GCAAATGGTGATGCACCAGAAGACGGCAACATGAGTACAATGATAATTGAAAAAGTCGAGAAAATTGTTGAAGGTGCTCTAGACATAGTTTCATCTGTTGGTGAACTCAAGGGCTCACCAACTTCTGAACAGTCTACGCAAGAACATGCAGCAGCTGTGAAAACAGTTGTCTTCTGGGTTTGTGCTGCAGTAGCCTTTGG
GATCTTTATTGGGTTCAAAGATGGAACTAGCAAGGCTTCTGAGTTTTTTGCAGGATATCTGCTGGAGCAAAGTTTGTCGGTGGACAATCTTTTTGTATTCATTTTAATTTTCAAGTATTTTCAGGTTCCTCTAATGTATCAGAGTCGGGTTCTTTCCTATGGCATTGCTGGTGCAATAATATTTCGTGCAACGATGATTT
TGCTTGGAGCGGCTACTCTGCAGAGATTCGAGATTGTGAATTTATTTTTGGCGGGAATTCTTCTCTATTCAGCATTTAAGCTGTTTACTGCAGAAGACGAGGAAGAAGAGGATTTATCAAATAACTTTATTGTAAAGACATGCAGGAATTTTATTCCAGTGACATCAAGCTATGACGGAGATCGATTTATCACACTATCG
GATGGTGTCCGCAAAGCAACCCCTTTGCTTCTGACAGTGGCTGTTGTGGAGCTGAGTGATATTGCTTTTGCTGTAGATTCAATACCAGCAGTTTTTGGTGTCACAAGAGACACATTCATAGTTTTCTCTTCAAATATGTTTGCTATACTTGGTTTGCGATCACTATATACCTTGATTTCTGGAAGCTTGTCTGAACTGGA
GTACCTTCAGCCTGCTGTTGGTGCGGTTTTAGGCTTCATTGGCTGCAAAATGGTTGCAGATTTCTTTGGTGAGTGTCACATCATTAGCAGCTAACTTGGAGAATCATCCATTTTTTGATATGCAACTTCTAGTGGTTTTGCATCCCC
>TRINITY_DN125673_c7_g1_i26 from sample A1 / Example unspliced isoform:ATTTCGTTCACATATTCCTTCGGACGAAAGCAGGGCTCAGGTCGGACAGCAGGATAGGGAAAGCAGGGCAGGGACATTCGTTTCACATACGGGGCACTAGACCACATATGTTTGGGTTGTATTTGAAGTTGAGCATTTGTTGCAAAGCAAAACTTTCAATCAAAGACTGGATTTTATGAATTGAAGTGGACATCATAAGA
GCGAGAGCCTGTTGGAGTGGGATTTTTCGCTCATATGGCAAAGTCAGTTTGCACTTCTGAATTGAGGCCGTTGACATTGATGCAATCTAATAAGGATGGGGTAATTAAACAGAAAAGTGGTAAACAATTTAGTTGTGCTGATCTACATATATGTCATCTGGGGTTGAAGTTACGTAGTAAGTGGAGCTCAGATAGAGGAC
TGCTGCCAAAGGCAGCATTTCCACATAATTTGCAGTTGGTTTACAAGTTCAAAGGTAAGATGTTATTTTAAAGCCACAAACATTTGGGTATGCTATCTATCTGACTTTCTTGGCACAGATTTTTGTTCTTTTGCTGTGGTTATGCTATTCTTTTTGGGTCCAATTTCAGGCAAATGTCATAGTAGAGGATGGCAGCTACA
GATGTTCTGCTCTAGACAAACAGAACAAGAGGACTCCAGGGTATCAGAACCCTATGGAATACAACATGATAACATGGAAAAAGAGTCGTGCAGTAAATCTGATAATTATGAAGGTGCAAATGGTGATGCACCAGAAGACGGCAACATGAGTACAATGATAATTGAAAAAGTCGAGAAAATTGTTGAAGGTGCTCTAGACA
TAGTTTCATCTGTTGGTGAACTCAAGGGCTCACCAACTTCTGAACAGTCTACGCAAGAACATGCAGCAGCTGTGAAAACAGTTGTCTTCTGGTAGCCTTTGGGATCTTTATTGGGTTCAAAGATGGAACTAGCAAGGCTTCTGAGTTTTTTGCAGGATATCTGCTGGAGCAAAGTTTGTCGGTGGACAATCTTTTTGTAT
TCATTTTAATTTTCAAGTATTTTCAGGTTCCTCTAATGTATCAGGTTTGGTTTAATTACCTTGTTGTTATCCTTTTCATGTACTTGTATTCTATCAAGTCGTACAACATGTGACAGACAATATTTGTTGCATTTTTAGGCTGTGTTGTGTAAAATAAGAGCATCATGTTTGTTTGCTTAGATGGAAGTGGTGGAGCAATA
ATCTCTCCTTTCGATTCTGCATTCCCCTTAATTGTGTTTAACAATGAACTGTTTTCTTTTGTCACTAAGTGCTTGTGCTATAAATTATAATGACATAACGGGTTGCACAGAGTCGGGTTCTTTCCTATGGCATTGCTGGTGCAATAATATTTCGTGCAACGATGATTTTGCTTGGAGCGGCTACTCTGCAGgtactttgt
ttagttgaacaagttggtttacaccttgttgcactgctgaaaggcgttttacttctggttctactttcagttttttgaatctgtcgttaagtcatatctcaattttcattggttggctgtagAGATTCGAGATTGTGAATTTATTTTTGGCGGGAATTCTTCTCTATTCAGCATTTAAGGTGCCATTTTGACCTCTTGAC
ATTTATGAAGGAAATTCTTCTTCTGAATTTTTCTTTTTTCGCATCAATTTTTAACCTTTAGAATTATGTCACATTATAATGTTATTTACCATGATTGGAGGATGAACTAAAATTGGCGAGTTTTTTACATTGCATTTGTGTAGAGGATACATGCTTGAATAAATTGTTGTGACGCCTTTGGTAGACAACTTGTAACATTT
TATGTGGAGTGTAAACAAACTGGCTAATCTACTGAGCGCAGAGTCCCTCCAAGCCCTGCAGCTTGGTTGAATTATTTGATGGGGATCATATATCACCATAAGGAAATGAAATCCTATGACATTAACTATCATGAACATAAAAGTAGC
Intron 11 GTTTGGTTTA ... GGTTGCACAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 30.95 | 49.1 | 22 | 22 |
| A2 | 34.02 | 23.9 | 13.6 | 11 |
| A3 | 30.24 | 26.1 | 6.6 | 16 |
| A4 | 27.3 | 17 | 5.7 | 7 |
| A5 | 23.13 | 15 | 5 | 4 |
| A6 | 24.95 | 69.1 | 27.2 | 19 |
| A7 | 15.1 | 71.4 | 15.5 | 10 |
| A8 | 23.4 | 65.5 | 25.3 | 15 |
| A9 | 15.66 | 62.6 | 14.3 | 9 |
| A10 | 17.86 | 44.8 | 10.6 | 9 |
>TRINITY_DN125673_c7_g1_i5 from sample A1 / Example spliced isoformATTTCGTTCACATATTCCTTCGGACGAAAGCAGGGCTCAGGTCGGACAGCAGGATAGGGAAAGCAGGGCAGGGACATTCGTTTCACATACGGGGCACTAGACCACATATGTTTGGGTTGTATTTGAAGTTGAGCATTTGTTGCAAAGCAAAACTTTCAATCAAAGACTGGATTTTATGAATTGAAGTGGACATCATAAGA
GCGAGAGCCTGTTGGAGTGGGATTTTTCGCTCATATGGCAAAGTCAGTTTGCACTTCTGAATTGAGGCCGTTGACATTGATGCAATCTAATAAGGATGGGGTAATTAAACAGAAAAGTGGTAAACAATTTAGTTGTGCTGATCTACATATATGTCATCTGGGGTTGAAGTTACGTAGTAAGTGGAGCTCAGATAGAGGAC
TGCTGCCAAAGGCAGCATTTCCACATAATTTGCAGTTGGTTTACAAGTTCAAAGGCAAATGTCATAGTAGAGGATGGCAGCTACAGATGTTCTGCTCTAGACAAACAGAACAAGAGGACTCCAGGGTATCAGAACCCTATGGAATACAACATGATAACATGGAAAAAGAGTCGTGCAGTAAATCTGATAATTATGAAGGT
GCAAATGGTGATGCACCAGAAGACGGCAACATGAGTACAATGATAATTGAAAAAGTCGAGAAAATTGTTGAAGGTGCTCTAGACATAGTTTCATCTGTTGGTGAACTCAAGGGCTCACCAACTTCTGAACAGTCTACGCAAGAACATGCAGCAGCTGTGAAAACAGTTGTCTTCTGGGTTTGTGCTGCAGTAGCCTTTGG
GATCTTTATTGGGTTCAAAGATGGAACTAGCAAGGCTTCTGAGTTTTTTGCAGGATATCTGCTGGAGCAAAGTTTGTCGGTGGACAATCTTTTTGTATTCATTTTAATTTTCAAGTATTTTCAGGTTCCTCTAATGTATCAGAGTCGGGTTCTTTCCTATGGCATTGCTGGTGCAATAATATTTCGTGCAACGATGATTT
TGCTTGGAGCGGCTACTCTGCAGAGATTCGAGATTGTGAATTTATTTTTGGCGGGAATTCTTCTCTATTCAGCATTTAAGCTGTTTACTGCAGAAGACGAGGAAGAAGAGGATTTATCAAATAACTTTATTGTAAAGACATGCAGGAATTTTATTCCAGTGACATCAAGCTATGACGGAGATCGATTTATCACACTATCG
GATGGTGTCCGCAAAGCAACCCCTTTGCTTCTGACAGTGGCTGTTGTGGAGCTGAGTGATATTGCTTTTGCTGTAGATTCAATACCAGCAGTTTTTGGTGTCACAAGAGACACATTCATAGTTTTCTCTTCAAATATGTTTGCTATACTTGGTTTGCGATCACTATATACCTTGATTTCTGGAAGCTTGTCTGAACTGGA
GTACCTTCAGCCTGCTGTTGGTGCGGTTTTAGGCTTCATTGGCTGCAAAATGGTTGCAGATTTCTTTGGTGAGTGTCACATCATTAGCAGCTAACTTGGAGAATCATCCATTTTTTGATATGCAACTTCTAGTGGTTTTGCATCCCC
>TRINITY_DN125673_c7_g1_i9 from sample A1 / Example unspliced isoform:ATTTCGTTCACATATTCCTTCGGACGAAAGCAGGGCTCAGGTCGGACAGCAGGATAGGGAAAGCAGGGCAGGGACATTCGTTTCACATACGGGGCACTAGACCACATATGTTTGGGTTGTATTTGAAGTTGAGCATTTGTTGCAAAGCAAAACTTTCAATCAAAGACTGGATTTTATGAATTGAAGTGGACATCATAAGA
GCGAGAGCCTGTTGGAGTGGGATTTTTCGCTCATATGGCAAAGTCAGTTTGCACTTCTGAATTGAGGCCGTTGACATTGATGCAATCTAATAAGGATGGGGTAATTAAACAGAAAAGTGGTAAACAATTTAGTTGTGCTGATCTACATATATGTCATCTGGGGTTGAAGTTACGTAGTAAGTGGAGCTCAGATAGAGGAC
TGCTGCCAAAGGCAGCATTTCCACATAATTTGCAGTTGGTTTACAAGTTCAAAGGCAAATGTCATAGTAGAGGATGGCAGCTACAGATGTTCTGCTCTAGACAAACAGAACAAGAGGACTCCAGGGTATCAGAACCCTATGGAATACAACATGATAACATGGAAAAAGAGTCGTGCAGTAAATCTGATAATTATGAAGGT
GCAAATGGTGATGCACCAGAAGACGGCAACATGAGTACAATGATAATTGAAAAAGTCGAGAAAATTGTTGAAGGTGCTCTAGACATAGTTTCATCTGTTGGTGAACTCAAGGGCTCACCAACTTCTGAACAGTCTACGCAAGAACATGCAGCAGCTGTGAAAACAGTTGTCTTCTGGTAGCCTTTGGGATCTTTATTGGG
TTCAAAGATGGAACTAGCAAGGCTTCTGAGTTTTTTGCAGGATATCTGCTGGAGCAAAGTTTGTCGGTGGACAATCTTTTTGTATTCATTTTAATTTTCAAGTATTTTCAGGTTCCTCTAATGTATCAGgtttggtttaattaccttgttgttatccttttcatgtacttgtattctatcaagtcgtacaacatgtgaca
gacaatatttgttgcatttttaggctgtgttgtgtaaaataagagcatcatgtttgtttggtggagcaataatctctcctttcgattctgcattccccttaattgtgtttaacaatgaactgttttcttttgtcactaagtgcttgtgctataaattataatgacataacgggttgcacagAGTCGGGTTCTTTCCTATG
GCATTGCTGGTGCAATAATATTTCGTGCAACGATGATTTTGCTTGGAGCGGCTACTCTGCAGAGATTCGAGATTGTGAATTTATTTTTGGCGGGAATTCTTCTCTATTCAGCATTTAAGGTGCCATTTTGACCTCTTGACATTTATGAAGGAAATTCTTCTTCTGAATTTTTCTTTTTTCGCATCAATTTTTAACCTTTA
GAATTATGTCACATTATAATGTTATTTACCATGATTGGAGGATGAACTAAAATTGGCGAGTTTTTTACATTGCATTTGTGTAGAGGATACATGCTTGAATAAATTGTTGTGACGCCTTTGGTAGACAACTTGTAACATTTTATGTGGAGTGTAAACAAACTGGCTAATCTACTGAGCGCAGAGTCCCTCCAAGCCCTGCA
GCTTGGTTGAATTATTTGATGGGGATCATATATCACCATAAGGAAATGAAATCCTATGACATTAACTATCATGAACATAAAAGTAGC
Intron 12 GTGAGTGCCA ... TGTGCTGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 36.84 | 60 | 35 | 16.2 |
| A2 | 43.61 | 30 | 23.2 | 2.9 |
| A3 | 40 | 33 | 22 | 5.2 |
| A4 | 35.21 | 39 | 21.2 | 7.1 |
| A5 | 42.11 | 11 | 8 | 4.6 |
| A6 | 26.54 | 87.5 | 31.6 | 10.1 |
| A7 | 27.27 | 104 | 39 | 8.8 |
| A8 | 22.47 | 69 | 20 | 6.2 |
| A9 | 22.22 | 84 | 24 | 8.4 |
| A10 | 21.54 | 51 | 14 | 1.8 |
>TRINITY_DN125673_c7_g1_i9 from sample A1 / Example spliced isoformATTTCGTTCACATATTCCTTCGGACGAAAGCAGGGCTCAGGTCGGACAGCAGGATAGGGAAAGCAGGGCAGGGACATTCGTTTCACATACGGGGCACTAGACCACATATGTTTGGGTTGTATTTGAAGTTGAGCATTTGTTGCAAAGCAAAACTTTCAATCAAAGACTGGATTTTATGAATTGAAGTGGACATCATAAGA
GCGAGAGCCTGTTGGAGTGGGATTTTTCGCTCATATGGCAAAGTCAGTTTGCACTTCTGAATTGAGGCCGTTGACATTGATGCAATCTAATAAGGATGGGGTAATTAAACAGAAAAGTGGTAAACAATTTAGTTGTGCTGATCTACATATATGTCATCTGGGGTTGAAGTTACGTAGTAAGTGGAGCTCAGATAGAGGAC
TGCTGCCAAAGGCAGCATTTCCACATAATTTGCAGTTGGTTTACAAGTTCAAAGGCAAATGTCATAGTAGAGGATGGCAGCTACAGATGTTCTGCTCTAGACAAACAGAACAAGAGGACTCCAGGGTATCAGAACCCTATGGAATACAACATGATAACATGGAAAAAGAGTCGTGCAGTAAATCTGATAATTATGAAGGT
GCAAATGGTGATGCACCAGAAGACGGCAACATGAGTACAATGATAATTGAAAAAGTCGAGAAAATTGTTGAAGGTGCTCTAGACATAGTTTCATCTGTTGGTGAACTCAAGGGCTCACCAACTTCTGAACAGTCTACGCAAGAACATGCAGCAGCTGTGAAAACAGTTGTCTTCTGGTAGCCTTTGGGATCTTTATTGGG
TTCAAAGATGGAACTAGCAAGGCTTCTGAGTTTTTTGCAGGATATCTGCTGGAGCAAAGTTTGTCGGTGGACAATCTTTTTGTATTCATTTTAATTTTCAAGTATTTTCAGGTTCCTCTAATGTATCAGGTTTGGTTTAATTACCTTGTTGTTATCCTTTTCATGTACTTGTATTCTATCAAGTCGTACAACATGTGACA
GACAATATTTGTTGCATTTTTAGGCTGTGTTGTGTAAAATAAGAGCATCATGTTTGTTTGGTGGAGCAATAATCTCTCCTTTCGATTCTGCATTCCCCTTAATTGTGTTTAACAATGAACTGTTTTCTTTTGTCACTAAGTGCTTGTGCTATAAATTATAATGACATAACGGGTTGCACAGAGTCGGGTTCTTTCCTATG
GCATTGCTGGTGCAATAATATTTCGTGCAACGATGATTTTGCTTGGAGCGGCTACTCTGCAGAGATTCGAGATTGTGAATTTATTTTTGGCGGGAATTCTTCTCTATTCAGCATTTAAGGTGCCATTTTGACCTCTTGACATTTATGAAGGAAATTCTTCTTCTGAATTTTTCTTTTTTCGCATCAATTTTTAACCTTTA
GAATTATGTCACATTATAATGTTATTTACCATGATTGGAGGATGAACTAAAATTGGCGAGTTTTTTACATTGCATTTGTGTAGAGGATACATGCTTGAATAAATTGTTGTGACGCCTTTGGTAGACAACTTGTAACATTTTATGTGGAGTGTAAACAAACTGGCTAATCTACTGAGCGCAGAGTCCCTCCAAGCCCTGCA
GCTTGGTTGAATTATTTGATGGGGATCATATATCACCATAAGGAAATGAAATCCTATGACATTAACTATCATGAACATAAAAGTAGC
>TRINITY_DN125673_c7_g1_i12 from sample A1 / Example unspliced isoform:TGCACCTTCATAATTATCAGATTTACTGCACGACTCTTTTTCCATGTTATCATGTTGTATTCTCATGTCATTGGATCCCTAGCTATAGATGTTTTTAAGCATGTGAAATGTATTCCAGGGGATTTATTCCTTTGAATGGACCAAATGCAACATCGTAATTCTGAATATCTCAACAAATTCATAATAATATTTTGCTAACA
GACTGCATAAACAATGAGATAAGAAATACAGATTATTATCTCTATATGTGGAAATTATAAATCTTTTGACATTGAACTTTGAAGAACATGTCTAGTGCTGCATGGTATTATTTCTTTTTTCAAATGTTTGAATGCATTTGGAGACTACTGTACCGACACTTCCTTTTCTGTTTGAGATAATAAGTTGCACTAAAATAAAT
TACATGTAGAGGATTAAGGAAGTTGGGCTAACTCGAGGCTATGGAAGAGTTCATATTTAATATCTGTCATTTTTCTTTGTCAGAACCCTATGGAATACAACATGATAACATGGAAAAAGAGTCGTGCAGTAAATCTGATAATTATGAAGGTGCAAATGGTGATGCACCAGAAGACGGCAACATGAGTACAATGATAATTG
AAAAAGTCGAGAAAATTGTTGAAGGTGCTCTAGACATAGTTTCATCTGTTGGTGAACTCAAGGGCTCACCAACTTCTGAACAGTCTACGCAAGAACATGCAGCAGCTGTGAAAACAGTTGTCTTCTGGgtgagtgccattttgaacaatttgttgacattagctaatggttaaaactggcaatgggtcattgaagtgtct
aggcgacctatgcctataataatttctttttaataaaattatcttatcttatcttatctctcctcttcgataattctatttttttgatgaccttaaaacatatccctggacataataagtacaggtttgtgctgcagTAGCCTTTGGGATCTTTATTGGGTTCAAAGATGGAACTAGCAAGGCTTCTGAGTTTTTTGCAG
GATATCTGCTGGAGCAAAGTTTGTCGGTGGACAATCTTTTTGTATTCATTTTAATTTTCAAGTATTTTCAGAGTCGGGTTCTTTCCTATGGCATTGCTGGTGCAATAATATTTCGTGCAACGATGATTTTGCTTGGAGCGGCTACTCTGCAGAGATTCGAGATTGTGAATTTATTTTTGGCGGGAATTCTTCTCTATTCA
GCATTTAAG