sp|Q9LDD5|PYRP2_ARATH ----> 5-amino-6-(5-phospho-D-ribitylamino)uracil phosphatase, chloroplastic
Intron 1 GTGCGGATCG ... TGACTCCTAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 74.42 | 11 | 32 | 32 |
| A2 | 78.57 | 6 | 29 | 15 |
| A3 | 66.67 | 13 | 32 | 20 |
| A4 | 60 | 11 | 18 | 15 |
| A5 | 68.31 | 6 | 16 | 9.9 |
| A6 | 61.32 | 12.6 | 16 | 24 |
| A7 | 56.52 | 15 | 19 | 20 |
| A8 | 52 | 6 | 2 | 11 |
| A9 | 70.63 | 4 | 1 | 18.3 |
| A10 | 58.49 | 22 | 20 | 42 |
>TRINITY_DN96497_c0_g1_i2 from sample A3 / Example spliced isoformCAATATCAGTAAATGCGCATCTGAGGGATCAGAGGAAATTCAACGGAGATTTATCGGGATTTAGATCGATTCCAGGGTTTAAAGGAATGGCAGGGTGTAGAGCAGCAATTGTTGTTGGACACTTACCAGTCCCCCGTGAAATACCCAATCATGGTACCAAGAGGGTAAATAATCATAGATACGGTGGGCAGAAAGTGGGA
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GAAAATAATGAACTGGTATGTTATACA
Intron 2 GTGCGGATCG ... GGAATGGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 73.81 | 11 | 32 | 30 |
| A2 | 71.83 | 10 | 29 | 22 |
| A3 | 60.82 | 19 | 32 | 27 |
| A4 | 58.62 | 12 | 18 | 16 |
| A5 | 65 | 7 | 16 | 10 |
| A6 | 56.1 | 18 | 16 | 30 |
| A7 | 66.67 | 10 | 19 | 21 |
| A8 | 47.06 | 9 | 2 | 14 |
| A9 | 53.49 | 10 | 1 | 22 |
| A10 | 53.57 | 26 | 20 | 40 |
>TRINITY_DN40797_c0_g1_i2 from sample A7 / Example spliced isoformATCAGTAAATGCGCATCTGAGGGATCAGAGGAAATTCAACGGAGATTTATCGGGATTTAGATCGATTCCAGGGTGTAGAGCAGCAATTGTTGTTGGACACTTACCAGTCCCCCGTGAAATACCCAATCATGGTACCAAGAGGGTAAATAATCATAGATACGGTGGGCAGAAAGTGGGAAAAATGCCAATACATAGTGAAA
GATGCAATTGTACAGGACCCGATGGTACCCCAGTAAGACTGGGTGCTGGCAATAGGTCTCCTGTTTTTACTGATGTGGGTAGAGGGCTGGTGTGGATTCATGGTGTAAATGTTTTGAAAAGAAATTTGAGTAAAAGCTCTCAGATGAAACCCTTTTCTCAAACAAGGGTCTATGCTATTCGGGCCCTTGCAATGGAAGTA
ACTGCTTTTCTACCAGATGAGGGAAAGTTGAGACCTTGGCAAGGAAGCCACTTAACTGGTTCTGGTATGGGCACGATACCGAGCCTACCTCCTAACAGGGCAGATGACCCATCCCTGGGCAATCCCCTTCAACGGTTCGAACACATGGGTTGTGGTTGGCTTGGGGTGATTATGGAGTGGGAAGGAGTGATTGTCGAAGA
TGATCCTTATATAGAGAGCAGGGCCTGGTTAGCTCTTGCAGAGGAGGAAGGTAAAAGACCACCTGCGACATTTATTTTGAAAAGAGTAGAAGGGATGAAAAATGAACATGCCATATCTGAGGTCCTATGCTGGTCTAGGGATCCTGTTAATGTCAGAAGATTGGCCTCCAGGAAAGAGGAGTTGTATCAAGAGATGCAGG
GTGGGTTATATCAGCTCAGGCCAGGTTCTCAGGAATTTCTGGTTACTTTGAAAAAACATAAGATACCGATTGCCCTGGCCTCTACGAGGCCAAGAAAGTACTTGGAAAAGGCAATTGAAGCTGTTGGTATGCAGGGATTCTTTGATGTTGTAGTGGCGGCTGAAGATGTATATAGGGGTAAACCAGACCCAGAGATGGTC
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GGCTGATCTCGATTCTCCAGAGTTTCAACCTCCAGAGCCAGAACCTGAACTTGAACTTGAAGAGGATGCAGATGAGGATAGATTTACTGCTGTTGCTGTCCAGGATATTTGGTAAGGTAACCTCATCCTAATAGCAGTCTTGTTGTATACTTATAAGTCTGAAAGTCCTCTTTCGGTGTCCGGTTTCACCGAGTCCCTGA
TGGTGTCCAAGGGTTGCTGGAGACGCACACAAGTACTTTGTCTGTTGATTATTCTGTCATTGTAAATATATGAAGGAAACTGTCTGCATTGGACTTCCTTCTGTTACTGGCTGTAAGATAACTTGGTATAGTAGATTGCTGATGCAATAGCTAAAGCTTTGAAAATCTTCTCTGTATTGTAAAGTACCCGCACTTGCTGA
TCTGTTTTAGTCGTATATTTTAGATTTTTCTGCTCTTTTAGTCCTATATTTTAGTAAGGACTATGTTACTGGTAAAATGGATTTCTTTGTAAAACATCTGCTCTTTTTAAGCAGAGCAATTAGAATACAGAGATTGACTGATGGGTACTCATCATTTCTCCACAACCAATGTTGTTTTGGAATTGTTTTTTATACGGGGT
TAATAGAAAATAATGAACTGGTATGTTATACAG
>TRINITY_DN40797_c0_g1_i1 from sample A7 / Example unspliced isoform:ATCAGTAAATGCGCATCTGAGGGATCAGAGGAAATTCAACGGAGATTTATCGGGATTTAGATCGATTCCAGgtgcggatcgtattaagaaatgtattcatatatatgccgttctgaaaaatagaaatttatcctggttttgtacataatttcaacgttagttaggttattttcctctattttcttgaggatctcagtcga
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GTACAGGACCCGATGGTACCCCAGTAAGACTGGGTGCTGGCAATAGGTCTCCTGTTTTTACTGATGTGGGTAGAGGGCTGGTGTGGATTCATGGTGTAAATGTTTTGAAAAGAAATTTGAGTAAAAGCTCTCAGATGAAACCCTTTTCTCAAACAAGGGTCTATGCTATTCGGGCCCTTGCAATGGAAGTAACTGCTTTT
CTACCAGATGAGGGAAAGTTGAGACCTTGGCAAGGAAGCCACTTAACTGGTTCTGGTATGGGCACGATACCGAGCCTACCTCCTAACAGGGCAGATGACCCATCCCTGGGCAATCCCCTTCAACGGTTCGAACACATGGGTTGTGGTTGGCTTGGGGTGATTATGGAGTGGGAAGGAGTGATTGTCGAAGATGATCCTTA
TATAGAGAGCAGGGCCTGGTTAGCTCTTGCAGAGGAGGAAGGTAAAAGACCACCTGCGACATTTATTTTGAAAAGAGTAGAAGGGATGAAAAATGAACATGCCATATCTGAGGTCCTATGCTGGTCTAGGGATCCTGTTAATGTCAGAAGATTGGCCTCCAGGAAAGAGGAGTTGTATCAAGAGATGCAGGGTGGGTTAT
ATCAGCTCAGGCCAGGTTCTCAGGAATTTCTGGTTACTTTGAAAAAACATAAGATACCGATTGCCCTGGCCTCTACGAGGCCAAGAAAGTACTTGGAAAAGGCAATTGAAGCTGTTGGTATGCAGGGATTCTTTGATGTTGTAGTGGCGGCTGAAGATGTATATAGGGGTAAACCAGACCCAGAGATGGTCATGTATGCA
GCGCAGCTTCTTAACATTATATCAGAAAGATGTATTGTGTTTGGAAATTCTAACTCCAGTGTCGAAGCGAGCCATGATATTTGCATGAAATGTGTGGCTGTTGCTGGCAAGCATCCTGTGTTTGAACTCGGAGCTGCAGACATGGTGGTGAGAAGATTAGATGATCTTTCTCTTGTAGACCTGAAGAACTTGGCTGATCT
CGATTCTCCAGAGTTTCAACCTCCAGAGCCAGAACCTGAACTTGAACTTGAAGAGGATGCAGATGAGGATAGATTTACTGCTGTTGCTGTCCAGGATATTTGGTAAGGTAACCTCATCCTAATAGCAGTCTTGTTGTATACTTATAAGTCTGAAAGTCCTCTTTCGGTGTCCGGTTTCACCGAGTCCCTGATGGTGTCCA
AGGGTTGCTGGAGACGCACACAAGTACTTTGTCTGTTGATTATTCTGTCATTGTAAATATATGAAGGAAACTGTCTGCATTGGACTTCCTTCTGTTACTGGCTGTAAGATAACTTGGTATAGTAGATTGCTGATGCAATAGCTAAAGCTTTGAAAATCTTCTCTGTATTGTAAAGTACCCGCACTTGCTGATCTGTTTTA
GTCGTATATTTTAGATTTTTCTGCTCTTTTAGTCCTATATTTTAGTAAGGACTATGTTACTGGTAAAATGGATTTCTTTGTAAAACATCTGCTCTTTTTAAGCAGAGCAATTAGAATACAGAGATTGACTGATGGGTACTCATCATTTCTCCACAACCAATGTTGTTTTGGAATTGTTTTTTATACGGGGTTAATAGAAA
ATAATGAACTGGTATGTTATACAG