sp|Q9LXC9|IPYR6_ARATH ----> Soluble inorganic pyrophosphatase 6, chloroplastic

Intron 1 GTTAACAATA ... TATTTCTCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	22.47	88	30	21
A2	17.37	107	35	10
A3	23.38	77	31	16
A4	12.57	73	12	9
A5	21.74	27	6	9
A6	15.2	633	112	115
A7	17.83	666	166	123
A8	17.15	770.5	185	134
A9	16.7	733	179	115
A10	15.45	520	116	74

>TRINITY_DN39867_c0_g1_i1 from sample A6 / Example spliced isoform

GTTGATTATGACCCGTCAGTATTCCAATTTTTGTTTTCATTTGAAACTTGAAAAAAAATTAGTTTTAGATTAACAGTGAAACTAGATTGTATGGATAGGTTGTATGTATTATGATCCTCCAAAGAAGGCGATACATGTGTATGTAATTTGTATCACTGGGCTAAGAGATTTGAGTCATTGTTCCCAATGGCAGCCCTGAG
AACTGTAGCTGCTGCTAATGTTATTCAGTCTCGATTGGCCTCCAACAATGTAAATTCTACTGTGGTAAGAAGGCCTGCTGTCCTTTCCCTGCGATGCACTTTTCCTCATGCGAAACCATTGAAGCAGCAGGGATGGTTGCGTGTGAAGCCAAGAGGTTTCACATGCAGGGCTCTCTACAGGCCAGAGATCGAGCATAAAG
AGGAGGGCACCCCACAAACTCTGGATTACAGAGTTTTCTTCTTTGAGAAGTCTGGGAAGAAGATATCACCATGGCATGATATTCCATTGCAATTAGGAGATGGAGTTTTCAATTTTGTAGCTGAAATACCAAAGGAATCAAGTGCAAAAATGGAAATTGCGACTGAAGAGCCATACACTCCAATCAAGCAGGACACAAAG
AAGGGAAAGCTTCGATATTACCCATATAACATAAATTGGAACTATGGATTGCTTCCTCAAACATGGGAAGATCCATCTCTTGCAAATGCAGAAGTTGAAGGAGCATTTGGTGATAATGATCCAGTTGATGTGGTTGAGATTGGGGAAAGGCAGGCTAAGATTGGAGAAGTTCTTAAAGTGAAGCCATTAGCTGCTTTAGC
AATGATTGATGAAGGTGAATTGGATTGGAAAATTGTGGCTATTTCTGTTGATGATCCCAAAGCATCGCTTGTCAATGATGTCGATGACGTTGAGAAGCACTTTCCGGGCACATTAACTGCAATACGGGACTGGTTTAGGGATTACAAGATTCCAGATGGAAAACCTGCTAATAAGTTTGGTCTTGGTGATAAGCCAGCAA
ATAAGGAGTATGCACTCAAGGTAATTGCGGAGACAAATGAATCTTGGTCAAAATTAGTGAAACGTTCTATTCCCGCGGGGGAGTTATCTCTAGCGTAATCAGGAAATCATTTCAAGACAATAAGATGAATCATCCACCAATCAAGCTGATCAACAAAGAAACATTTTTGGTAGTTTCTTCAAGCAAAATAGCTTCATTTA
CCCATGTAAAAAATTGACAAGGTTCACTTTTGCAAGCATTTTATAAGCTATTAAGTTTTTCCCAATTTCGCTTAGGATATAATGTGGGAGATTGAGAGGTGTTTCTTAAATATTCTATTTATTAGCTTCATTCTAAGTTCTTGTCACTATTCTTGTTCTTTTGGGAGGATTAATATTTCTGGATATAATATGTGTTTGTA
TATCTGGTCTTGTTATTTGTATTTTTCTGCATGAGTAAGATAGGTGTCATGATCCATGGGACTGATATCCATACATATAATTCAATCTGCAGAATTACCAGCAGGTTGTGTGAAATTGTTAGTTGTCCTTTCATACAGTTAGAGCTAGTTATATGCCAACACTGTGTGTAGTTTGAGCTTTGGCATATCTCTAGGTTTTT
TTGGGAAATGCTTTATACACAACAATGTGTTCTTACTTGAAAGTGTTTTTTTTATAATAAATTTAATTCTATGAATCTCATTGATAG

>TRINITY_DN39867_c0_g1_i3 from sample A6 / Example unspliced isoform:

GTTGATTATGACCCGTCAGTATTCCAATTTTTGTTTTCATTTGAAACTTGAAAAAAAATTAGTTTTAGATTAACAGTGAAACTAGATTGTATGGATAGGTTGTATGTATTATGATCCTCCAAAGAAGGCGATACATGTGTATGTAATTTGTATCACTGGGCTAAGAGATTTGAGTCATTGTTCCCAATGGCAGCCCTGAG
AACTGTAGCTGCTGCTAATGTTATTCAGTCTCGATTGGCCTCCAACAATGTAAATTCTACTGTGGTAAGAAGGCCTGCTGTCCTTTCCCTGCGATGCACTTTTCCTCATGCGAAACCATTGAAGCAGCAGGGATGGTTGCGTGTGAAGCCAAGAGGTTTCACATGCAGGGCTCTCTACAGGCCAGAGATCGAGCATAAAG
AGGAGGGCACCCCACAAACTCTGGATTACAGAGTTTTCTTCTTTGAGAAGTCTGGGAAGAAGATATCACCATGGCATGATATTCCATTGCAATTAGGAGATGGAGTTTTCAATTTTGTAGCTGAAATACCAAAGGAATCAAGTGCAAAAATGGAAATTGCGACTGAAGAGCCATACACTCCAATCAAGCAGGACACAAAG
AAGGGAAAGCTTCGATATTACCCATATAACATAAATTGGAACTATGGATTGCTTCCTCAAACATGGGAAGATCCATCTCTTGCAAATGCAGAAGTTGAAGGAGCATTTGGTGATAATGATCCAGTTGATGTGGTTGAGATTGGGGAAAGGCAGGCTAAGATTGGAGAAGTTCTTAAAGTGAAGCCATTAGCTGCTTTAGC
AATGATTGATGAAGGTGAATTGGATTGGAAAATTGTGGCTATTTCTGTTGATGATCCCAAAGCATCGCTTGTCAATGATGTCGATGACGTTGAGAAGCACTTTCCGGGCACATTAACTGCAATACGGGACTGGTTTAGGGATTACAAGATTCCAGATGGAAAACCTGCTAATAAGTTTGGTCTTGGTGATAAGCCAGCAA
ATAAGGAGTATGCACTCAAGGTAATTGCGGAGACAAATGAATCTTGGTCAAAATTAGTGAAACGTTCTATTCCCGCGGGGGAGTTATCTCTAGCGTAATCAGGAAATCATTTCAAGgttaacaatatacttacctcccttttgcacccaagccaaatgattttctagagctatttgtgtagtaagaaatgaaaaaactat
ttttcgacatttgctcattagacaatgtgtcaatatatctgctgagttccttgcagtttctaggaaaaaggaatttgatttattctataaagttaaagtttatataaagtttatttgcattattctcaaagagaaaaatattttaatagtttgaagtattgaaaggacttgacattcttctgtctttttatttctcagAC
AATAAGATGAATCATTCACCAATCAAGCTGATCAACAAAGAAACATTTTTGGTAGTTTCTTCAAGCAAAATAGCATCATTTACCCATGTAAAAAATGTTGATCGTTGTGACAAGGTTCACTTTTGCAAGCATTTTATAAGCTATTAAGTTTTTCTCATTTTCGCTTAGGATATAATGTGGGAGATTGAGAGGTGTTTCTT
AAATATTCTATTTATTAGCTTCATTCTAAGTTCTTGTCACTATTCTTGTTCTTTTGGGAGGATTAATATTTCTGGATATAATATGTGTTTGTATATCTGGTCTTGTTATTTGTATTTTTCTGCATGAGTAAGATAGGTGTCATGATCCATGGGACTGATATCCATACATATAATTCAATCTGCAGAATTACCAGCAGGTT
GTGTGAAATTGTTAGTTGTCCTTTCATACAGTTAGAGCTAGTTATATGCCAACACTGTGTGTAGTTTGAGCTTTGGCATATCTCTAGGTTTTTTTGGGAAATGCTTTATACACAACAATGTGTTCTTACTTGAAAGTGTTTTTTTTATAATAAATTTAATTCTATGAATCTCATTGATAG

Intron 2 GTTAACAATA ... TATTTCTCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	8.37	88	20	8.7
A2	2.32	107	23.3	2.7
A3	5.13	77	23.7	4.7
A4	6.88	73	8	6.3
A5	6.9	27	5	2
A6	4.26	632	77.7	30.7
A7	5.88	666.3	114.3	47.3
A8	5.08	770	126.3	45
A9	5.08	733.3	122	43.7
A10	5.25	519	78	31

>TRINITY_DN103064_c0_g1_i2 from sample A5 / Example spliced isoform

TTTGTTTTCATTAGAAACTTGAAAAAAAATTAGTTTTAGATTAACAGTGAAACTAGATTGTATGGATAGGTTGTATGTATTATGATCCTCCAAAGAAGGCGATACATGTGTATGTAATTTGTATCACTGGGCTAAGAGATTTGAGTCATTGTTCCCAATGGCAGCCCTGAGAACTGTAGCTGCTGCTAATGTTATTCAGT
CTCGATTGGCCTCCAACAATGTAAATTCTACTGTGGTAAGAAGGCCTGCTGTCCTTTCCCTGCGATGCACTTTTCCTCATGCGAAACCATTGAAGCAGCAGGGATGGTTGCGTGTGAAGCCAAGAGGTTTCACATGCAGGGCTCTCTACAGGCCAGAGATCGAGCATAAAGAGGAGGGCACCCCACAAACTCTGGATTAC
AGAGTTTTCTTCTTTGAGAAGTCTGGGAAGAAGATATCACCATGGCATGATATTCCATTGCAATTAGGAGATGGAGTTTTCAATTTTGTAGCTGAAATACCAAAGGAATCAAGTGCAAAAATGGAAATTGCGACTGAAGAGCCATACACTCCAATCAAGCAGGACACAAAGAAGGGAAAGCTTCGATATTACCCATATAA
CATAAATTGGAACTATGGATTGCTTCCTCAAACATGGGAAGATCCATCTCTTGCAAATGCAGAAGTTGAAGGAGCATTTGGTGATAATGATCCAGTTGATGTGGTTGAGATTGGGGAAAGGCAGGTTAAGATTGGAGAAGTTCTTAAAGTGAAGCCATTAGCTGCTTTAGCAATGATTGATGAAGGTGAATTGGATTGGA
AAATTGTGGCTATTTCTGTTGATGATCCCAAAGCATCGCTTGTCAATGATGTCGACGACGTTGAGAAGCACTTTCCGGGCACATTAACTGCAATACGGGATTGGTTTAGGGATTACAAGATTCCAGATGGAAAACCTGCTAATAAGTTTGGTCTTGGTGATAAGCCAGCAAATAAGGAGTATGCACTCAAGGTAATTGCG
GAGACAAATGAATCTTGGTCAAAATTAGTGAAACGTTCTATTCCCGCGGGGGAGTTATCTCTAGCGTAATCAGGAAATCATTTCAAGACAATAAGATGAATCATTCACCAATCAAGCTGATCAACAAAGAAACATTTTTGGTAGTTTCTTCAAGCAAAATAGCATCATTTACCCATGTAAAAAATGTTGATCGTTGTGAC
AAGGTTCACTTTTGCAAGCATTTTATAAGCTATTAAGTTTTTCTCATTTTCGCTTAGGATATAATGTGGGAGATTGAGAGGTGTTTCTTAAATATTCTATTTATTAGCTTCATTCTAAGTTCTTGTCACTATTCTTGTTCTTTTGGGAGGATTAATATTTCTGGATATAATATGTATTTGTATATCTGGTCTTGTTATTT
GTATTTTTCTGCATGAGTAAGATAGGTGTCATGATCCATGGGACTGATATCCATACATATAATTCAATCTGCAGAATTACCAGCAGGTTGTGTGAAATTGTTAGTTGTCCTTTCATACAGTTAGAGCTAGTTATATGCCAACACTGTGTGTAGTTTGAGCTTTGGCATATCTCTAGG

>TRINITY_DN103064_c0_g1_i3 from sample A5 / Example unspliced isoform:

TTTGTTTTCATTAGAAACTTGAAAAAAAATTAGTTTTAGATTAACAGTGAAACTAGATTGTATGGATAGGTTGTATGTATTATGATCCTCCAAAGAAGGCGATACATGTGTATGTAATTTGTATCACTGGGCTAAGAGATTTGAGTCATTGTTCCCAATGGCAGCCCTGAGAACTGTAGCTGCTGCTAATGTTATTCAGT
CTCGATTGGCCTCCAACAATGTAAATTCTACTGTGGTAAGAAGGCCTGCTGTCCTTTCCCTGCGATGCACTTTTCCTCATGCGAAACCATTGAAGCAGCAGGGATGGTTGCGTGTGAAGCCAAGAGGTTTCACATGCAGGGCTCTCTACAGGCCAGAGATCGAGCATAAAGAGGAGGGCACCCCACAAACTCTGGATTAC
AGAGTTTTCTTCTTTGAGAAGTCTGGGAAGAAGATATCACCATGGCATGATATTCCATTGCAATTAGGAGATGGAGTTTTCAATTTTGTAGCTGAAATACCAAAGGAATCAAGTGCAAAAATGGAAATTGCGACTGAAGAGCCATACACTCCAATCAAGCAGGACACAAAGAAGGGAAAGCTTCGATATTACCCATATAA
CATAAATTGGAACTATGGATTGCTTCCTCAAACATGGGAAGATCCATCTCTTGCAAATGCAGAAGTTGAAGGAGCATTTGGTGATAATGATCCAGTTGATGTGGTTGAGATTGGGGAAAGGCAGGTTAAGATTGGAGAAGTTCTTAAAGTGAAGCCATTAGCTGCTTTAGCAATGATTGATGAAGGTGAATTGGATTGGA
AAATTGTGGCTATTTCTGTTGATGATCCCAAAGCATCGCTTGTCAATGATGTCGACGACGTTGAGAAGCACTTTCCGGGCACATTAACTGCAATACGGGATTGGTTTAGGGATTACAAGATTCCAGATGGAAAACCTGCTAATAAGTTTGGTCTTGGTGATAAGCCAGCAAATAAGGAGTATGCACTCAAGGTAATTGCG
GAGACAAATGAATCTTGGTCAAAATTAGTGAAACGTTCTATTCCCGCGGGGGAGTTATCTCTAGCGTAATCAGGAAATCATTTCAAGgttaacaatatacttacctccctttgcacccaagccaaatgattttctagagctatttgtgttgtaagaaatgaaaaaactatttttcgacatttgctcgttagacaatgtgt
caatatatctgctgagttccttgcagtttctaggaaaaaggaatttgatttattctataaagttaaagttcatataaagtttatttgcattattctcaaagagaaaaatattttaatagtttgaagtattgaaaggacttgacattcttctgtctttttatttctcagACAATAAGATGAATCATCCACCAATCAAGCTG
ATCAACAAAGAAACATTTTTGGTAGTTTCTTCAAGCAAAATAGC