sp|Q41328|PTI1_SOLLC ----> Pto-interacting protein 1


Intron 1 GCAAGCATGC ... GGGTTGAGAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A122.961824860.5
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A817.151152324.6
A920.423046591
A1020.44263.964.371.3



>TRINITY_DN107837_c0_g1_i4 from sample A3 / Example spliced isoform
CATCATTTGAACAAACCCCAACGATAGTTTTGTGTAGCTGGAATGCTTCACATTCTCACACAACATTGGGCTCGACGTTCGCTGTCGGATCATGTGACCACAGGGGGGTTTGCGTGACTGTGGACGGTCGTCATAAATTAGACTTCGAACGATACAGCAGTCTAAGTCAATGCATCATGGTCACTGAAATTGCCATATAT
AGACGATCTGAGGCCGTTGATTGCAGGATTACGGAGTATTCATGGTATATATACAGATTTCTCTCTCCCTGTTGCGGTAAATTGGTTAAGGGCCCTCTGTTCTGTTGATTGCAGTGCTGTCTGCTTCTCTTTAAAGCGAGTTTGAAAAATTCAGGTTGTGGGAATCAGAGTCAGACACACTTCTGCTGGTAGAAGTTTAG
AACCATGGGGTGTTTTGGCTGCTGTGCAGAAGATGAAATTCAAAATGCAGCCGATGGCACGAGGCCTATTATGGTAAATGGAAATTTCCCAGGAAATGATGGAGTTTACGAAAATGCAAACACAGCTCTCAGGAGTGGTCAAAATCTAAAACTTCAGCCTATTGCTGTTCCTGAAATCACAGTGGATGAATTGAGGGAGG
TAACAGATAACTTCAGTCAAAATTCGTTGATTGGAGAGGGTTCTTATGGTCCAGTATATCATGGCATCTTAAAAAATGGCCGTGATTCAGCCATTAAAAAGTTGGATGCTAGAAAACAACCAGATCAGGAGTTACTTGCACAGGTTTCCATGGTTTCGAGGTTGAAGCATGAAAATGTAGTGGAACTGGTTGGGTATTGT
GTTGATGGGAGCCTGCGAGTGCTTGCTTATGAGTTTGCAACAATGGGATCGCTTCATGACATCCTTCATGGTAAGAAAGGTGTTAAAGGAGCACAACCAGGTCCAGTTCTCACTTGGACGCAGAGAGTAAAAATTGCAGTAGGTGCTGCAAAAGGGCTTGAGTACCTCCATGAGAAGGCACAACCATCTATCATTCACCG
TGATATCAAGTCTAGCAATGTCTTACTTTTTGATGACGTTACAGCAAAGATAGCTGATTTTGATCTATCAAACCAAGCTCCTGACATGTCAGCACGGCTTCATTCCACTCGTGTGCTTGGAACATTTGGTTATCATGCTCCAGAATATGCGATGACAGGACAATCAACTCAGAAGAGTGATGTTTACAGCTTTGGCATTG
TCCTCCTTGAGTTATTGACTGGCAGGAAACCAGTTGATCACACGTTGCCACGCGGTCAACAAAGCCTTGTTACATGGGCAACCCCAAGACTTAGTGAGGACAAAGTGAAGCAATGTGTGGATCCAAGGTTGAAAGGAGACTATCCACCTAAAGCAGTGGCTAAGATGGCAGCAGTTGCTGCCTTGTGTGTGCAGTATGAA
GCTGATTTTCGTGCAAACATGAGTATTATTGTGAAAGCTCTTCGACCTCTATTGAATGCACAATCAACTCCTGTTGGTGGGAGTGCGGCCGAGTAATCTGATGACAGTCATATTATACCTGACCTTATGATATTCCAAATTTGTGCGTTGTTTAGTTTGGCATATCTTCTATCTGCTTGCATATATCTCGACCTGGGATT
TGAATATCGTAAAGAATTGGATTACTAATCATGTGGAAACAGAAGGGAAGCAAGGCAACGAATGCATACAATTCGACATGGGCATTCAAATTTGCTGGCCCATGCTGAGTTTTCACGATATGCAAGTATGATGTCTACTGTGCTGCTTTCTATTAGGTTGTCATGATTCATGTTTGTATGTATATTCATACATAAGTATA
ATGTGTCATAAACATTAGTTTCGTTGTCTAGAAGTGTCCCAGGACTCAGTTACGAGAGGTATGGCTATTCTTCTTGGTTTACAGCACAATTGCTATTTAAATTGGTTTATTTTCAGTATTTTCTTATTATTTTCATAGCTGAAAGCATATGTTATTTGCATGGAGAAGATAATGGATCTCCC


>TRINITY_DN107837_c0_g1_i8 from sample A3 / Example unspliced isoform:
CATCATTTGAACAAACCCCAACGATAGTTTTGTGTAGCTGGAATGCTTCACATTCTCACACAACATTGGGCTCGACGTTCGCTGTCGGATCATGTGACCACAGGGGGGTTTGCGTGACTGTGGACGGTCGTCATAAATTAGACTTCGAACGATACAGCAGTCTAAGTCAATGCATCATGGTCACTGAAATTGCCATATAT
AGACGATCTGAGGCCGTTGATTGCAGGATTACGGAGTATTCATGGTATATATACAGATTTCTCTCTCCCTGTTGCGGTAAATTGGTTAAGGGCCCTCTGTTCTGTTGATTGCAGTGCTGTCTGCTTCTCTTTAAAGCGgcaagcatgcgcgcaaatcaatccgatgcattgaattggagggttgagagAGTTTGAAAAAT
TCAGGTTGTGGGAATCAGAGTCAGACACACTTCTGCTGGTAGAAGTTTAGAACCATGGGGTGTTTTGGCTGCTGTGCAGAAGATGAAATTCAAAATGCAGCCGATGGCACGAGGCCTATTATGGTAAATGGAAATTTCCCAGGAAATGATGGAGTTTACGAAAATGCAAACACAGCTCTCAGGAGTGGTCAAAATCTAAA
ACTTCAGCCTATTGCTGTTCCTGAAATCACAGTGGATGAATTGAGGGAGGTAACAGATAACTTCAGTCAAAATTCGTTGATTGGAGAGGGTTCTTATGGTCCAGTATATCATGGCATCTTAAAAAATGGCCGTGATTCAGCCATTAAAAAGTTGGATGCTAGAAAACAACCAGATCAGGAGTTACTTGCACAGGTTTCCA
TGGTTTCGAGGTTGAAGCATGAAAATGTAGTGGAACTGGTTGGGTATTGTGTTGATGGGAGCCTGCGAGTGCTTGCTTATGAGTTTGCAACAATGGGATCGCTTCATGACATCCTTCATGGTAAGAAAGGTGTTAAAGGAGCACAACCAGGTCCAGTTCTCACTTGGACGCAGAGAGTAAAAATTGCAGTAGGTGCTGCA
AAAGGGCTTGAGTACCTCCATGAGAAGGCACAACCATCTATCATTCACCGTGATATCAAGTCTAGCAATGTCTTACTTTTTGATGACGTTACAGCAAAGATAGCTGATTTTGATCTATCAAACCAAGCTCCTGACATGTCAGCACGGCTTCATTCCACTCGTGTGCTTGGAACATTTGGTTATCATGCTCCAGAATATGC
GATGACAGGACAATCAACTCAGAAGAGTGATGTTTACAGCTTTGGCATTGTCCTCCTTGAGTTATTGACTGGCAGGAAACCAGTTGATCACACGTTGCCACGCGGTCAACAAAGCCTTGTTACATGGGCAACCCCAAGACTTAGTGAGGACAAAGTGAAGCAATGTGTGGATCCAAGGTTGAAAGGAGACTATCCACCTA
AAGCAGTGGCTAAGATGGCAGCAGTTGCTGCCTTGTGTGTGCAGTATGAAGCTGATTTTCGTGCAAACATGAGTATTATTGTGAAAGCTCTTCGACCTCTATTGAATGCACAATCAACTCCTGTTGGTGGGAGTGCGGCCGAGTAATCTGATGACAGTCATATTATACCTGACCTTATGATATTCCAAATTTGTGCGTTG
TTTAGTTTGGCATATCTTCTATCTGCTTGCATATATCTCGACCTGGGATTTGAATATCGTAAAGAATTGGATTACTAATCATGTGGAAACAGAAGGGAAGCAAGGCAACGAATGCATACAATTCGACATGGGCATTCAAATTTGCTGGCCCATGCTGAGTTTTCACGATATGCAAGTATGATGTCTACTGTGCTGCTTTC
TATTAGGTTGTCATGATTCATGTTTGTATGTATATTCATACATAAGTATAATGTGTCATAAACATTAGTTTCGTTGTCTAGAAGTGTCCCAGGACTCAGTTACGAGAGGTATGGCTATTCTTCTTGGTTTACAGCACAATTGCTATTTAAATTGGTTTATTTTCAGTATTTTCTTATTATTTTCATAGCTGAAAGCATAT
GTTATTTGCATGGAGAAGATAATGGATCTCCC




Intron 2 GCAAGCATGC ... AATTTCCCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
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A775.6911468355
A879.175523209
A976.7911765387
A1072.6912464330



>TRINITY_DN41766_c0_g1_i4 from sample A9 / Example spliced isoform
TTTCACATAAAACCACTTAGTTTGACCTGTAACACTTTCAAGAAAACCATTACCGTACAAAGTGTTGATACTAGTTGCTACCCTTACCGCCAACCTATATTGATCCTTATCATCATTTGAACAAACCCCAACGATAGTTTTGTGTAGCTGGAATGCTTCACATTCTCACACAACATTGGGCTCGACGTTCGCTGTCGGAT
CATGTGACCACAGGGGGGTTTGCGTGACTGTGGACGGTCGTCATAAATTAGACTTTGAACGATACAGCAGTCTAAGTCAATGCATCATGGTCACTGAAATTGCCATATATAGACGATCTGAGACCGTTGATTGCAGGATTACGGAGTATTCATGGTATATATACAGATTTCTCTCTCCCTGTTGCGGTAAATTGGTTAAG
GGCCCTCTGTTCTGTTGATTGCAGTGCTGTCTGCTTCTCTTTAAAGCGGAAATGATGGAGTTTACGAAAATGCAAACACAGCTCTCAGGAGTGGTCAAAATCTAAAACTTCAGCCTATTGCTGTTCCTGAAATCACAGTGGATGAATTGAGGGAGGTAACAGATAACTTCAGTCAAAATTCGTTGATTGGAGAGGGTTCT
TATGGTCCAGTATATCATGGCATCTTAAAAAATGGCCGTGATTCAGCCATTAAAAAGTTGGATGCTAGAAAACAACCAGATCAGGAGTTACTTGCACAGGTTTCCATGGTTTCGAGGTTGAAGCATGAAAATGTAGTGGAACTGGTTGGGTATTGTGTTGATGGGAGCCTGCGAGTGCTTGCTTATGAGTTTGCAACAAT
GGGATCGCTTCATGACATCCTTCATGGTAAGAAAGGTGTTAAAGGAGCACAACCAGGTCCAGTTCTCACTTGGACGCAGAGAGTAAAAATTGCAGTAGGTGCTGCAAAAGGGCTTGAGTACCTCCATGAGAAGGCACAACCATCTATCATTCACCGTGATATCAAGTCTAGCAATGTCTTACTTTTTGATGACTTTACAG
CAAAGATAGCTGATTTTGATCTATCAAACCAAGCTCCTGACATGTCAGCACGGCTTCATTCCACTCGTGTGCTTGGAACATTTGGTTATCATGCTCCAGAATATGCGATGACAGGACAGTCAACTCAGAAGAGTGATGTTTACAGCTTTGGCATTGTCCTCCTTGAGTTATTGACTGGCAGGAAACCAGTTGATCACACG
TTGCCACGCGGTCAACAAAGCCTTGTTACATGGGCAACCCCAAGACTTAGTGAGGACAAAGTGAAGCAGTGTGTGGATCCAAGGTTGAAAGGAGACTATCCACCTAAAGCAGTGGCTAAGATGGCAGCAGTTGCTGCCTTGTGTGTGCAGTATGAAGCTGATTTTCGTGCAAACATGAGTATTATTGTGAAAGCTCTTCG
ACCTCTATTGAATGCACAATCAACTCCTGTTGGTGGGAGTGCGGCCGAGTAATCTGATGACAGTCATATTATACCTGACCTTATGATATTCCAAATTTGTGCGTTGTTTAGTTTGGCATATCTTCTATCTGCTTGCATATATCTCGACCTGGGATTTGAATATCGTAAAGAATTGGATTACTAATCATGTGGAAACAGAA
GGGAAGCAAGGCAACGAATGCATACAATTCGACATGGGCATTCAAATTTGCTGGCCCATGCTGAGTTTTCACGATATGCAAGTATGATGTCTACTGTGCTGCTTTCTATTAGGTTGTCATGATTCATGTTTGTATGTATATTCATACATAAGTATAATGTGTCATAAACATTAGTTTCGTTGTCTAGAAGTGTCCCAGGA
CTCAGTTACGAGAGGTATGGCTATTCTTCTTGGTTTACAGCACAATTGCTATTTAAATTGGTTTATTTTCAGTATTTTCTTATTATTTTCATAGCTGAAAGCATATGTTATTTGCATGGAGAAGATAATGGATCTCCAAGAAACACATTGCGAACCATGGCATTACTACATCCGCTACAATATTATGTTTCTGATAAATA
ATGATTGGTCTTGGAATAACAATTGCACTAGATGGGTATTGTTACAAGCTCA


>TRINITY_DN41766_c0_g1_i3 from sample A9 / Example unspliced isoform:
TTTCACATAAAACCACTTAGTTTGACCTGTAACACTTTCAAGAAAACCATTACCGTACAAAGTGTTGATACTAGTTGCTACCCTTACCGCCAACCTATATTGATCCTTATCATCATTTGAACAAACCCCAACGATAGTTTTGTGTAGCTGGAATGCTTCACATTCTCACACAACATTGGGCTCGACGTTCGCTGTCGGAT
CATGTGACCACAGGGGGGTTTGCGTGACTGTGGACGGTCGTCATAAATTAGACTTTGAACGATACAGCAGTCTAAGTCAATGCATCATGGTCACTGAAATTGCCATATATAGACGATCTGAGACCGTTGATTGCAGGATTACGGAGTATTCATGGTATATATACAGATTTCTCTCTCCCTGTTGCGGTAAATTGGTTAAG
GGCCCTCTGTTCTGTTGATTGCAGTGCTGTCTGCTTCTCTTTAAAGCGgcaagcatgcgcgcaaatcaatccgatgcattgaattggagggttgagagagtttgaaaaattcaggttgtgggaatcagagtcagacacacttctgctggtagaagtttagaaccatggggtgttttggctgctgtgcagaagatgaaatt
caaaatgcagccgatggcacgaggcctattatggtaaatggaaatttcccag
GAAATGATGGAGTTTACGAAAATGCAAACACAGCTCTCAGGAGTGGTCAAAATCTAAAACTTCAGCCTATTGCTGTTCCTGAAATCACAGTGGATGAATTGAGGGAGGTAACAGATAACTTCAGTCAAAATTCGTTGATTGGAGAGGG
TTCTTATGGTCCAGTATATCATGGCATCTTAAAAAATGGCCGTGATTCAGCCATTAAAAAGTTGGATGCTAGAAAACAACCAGATCAGGAGTTACTTGCACAGGTTTCCATGGTTTCGAGGTTGAAGCATGAAAATGTAGTGGAACTGGTTGGGTATTGTGTTGATGGGAGCCTGCGAGTGCTTGCTTATGAGTTTGCAA
CAATGGGATCGCTTCATGACATCCTTCATGGTAAGAAAGGTGTTAAAGGAGCACAACCAGGTCCAGTTCTCACTTGGACGCAGAGAGTAAAAATTGCAGTAGGTGCTGCAAAAGGGCTTGAGTACCTCCATGAGAAGGCACAACCATCTATCATTCACCGTGATATCAAGTCTAGCAATGTCTTACTTTTTGATGACTTT
ACAGCAAAGATAGCTGATTTTGATCTATCAAACCAAGCTCCTGACATGTCAGCACGGCTTCATTCCACTCGTGTGCTTGGAACATTTGGTTATCATGCTCCAGAATATGCGATGACAGGACAGTCAACTCAGAAGAGTGATGTTTACAGCTTTGGCATTGTCCTCCTTGAGTTATTGACTGGCAGGAAACCAGTTGATCA
CACGTTGCCACGCGGTCAACAAAGCCTTGTTACATGGGCAACCCCAAGACTTAGTGAGGACAAAGTGAAGCAGTGTGTGGATCCAAGGTTGAAAGGAGACTATCCACCTAAAGCAGTGGCTAAGATGGCAGCAGTTGCTGCCTTGTGTGTGCAGTATGAAGCTGATTTTCGTGCAAACATGAGTATTATTGTGAAAGCTC
TTCGACCTCTATTGAATGCACAATCAACTCCTGTTGGTGGGAGTGCGGCCGAGTAATCTGATGACAGTCATATTATACCTGACCTTATGATATTCCAAATTTGTGCGTTGTTTAGTTTGGCATATCTTCTATCTGCTTGCATATATCTCGACCTGGGATTTGAATATCGTAAAGAATTGGATTACTAATCATGTGGAAAC
AGAAGGGAAGCAAGGCAACGAATGCATACAATTCGACATGGGCATTCAAATTTGCTGGCCCATGCTGAGTTTTCACGATATGCAAGTATGATGTCTACTGTGCTGCTTTCTATTAGGTTGTCATGATTCATGTTTGTATGTATATTCATACATAAGTATAATGTGTCATAAACATTAGTTTCGTTGTCTAGAAGTGTCCC
AGGACTCAGTTACGAGAGGTATGGCTATTCTTCTTGGTTTACAGCACAATTGCTATTTAAATTGGTTTATTTTCAGTATTTTCTTATTATTTTCATAGCTGAAAGCATATGTTATTTGCATGGAGAAGATAATGGATCTCCAAGAAACACATTGCGAACCATGGCATTACTACATCCGCTACAATATTATGTTTCTGATA
AATAATGATTGGTCTTGGAATAACAATTGCACTAGATGGGTATTGTTACAAGCTCA




Intron 3 GTGAGTATTA ... AAATTGTCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A18.5648254.5
A214.2839236.5
A326.95352413
A411.2755247
A512.724143.5
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A74.8568293.5
A802311.50
A92.996530.52
A101.516429.51



>TRINITY_DN107837_c0_g1_i8 from sample A3 / Example spliced isoform
CATCATTTGAACAAACCCCAACGATAGTTTTGTGTAGCTGGAATGCTTCACATTCTCACACAACATTGGGCTCGACGTTCGCTGTCGGATCATGTGACCACAGGGGGGTTTGCGTGACTGTGGACGGTCGTCATAAATTAGACTTCGAACGATACAGCAGTCTAAGTCAATGCATCATGGTCACTGAAATTGCCATATAT
AGACGATCTGAGGCCGTTGATTGCAGGATTACGGAGTATTCATGGTATATATACAGATTTCTCTCTCCCTGTTGCGGTAAATTGGTTAAGGGCCCTCTGTTCTGTTGATTGCAGTGCTGTCTGCTTCTCTTTAAAGCGGCAAGCATGCGCGCAAATCAATCCGATGCATTGAATTGGAGGGTTGAGAGAGTTTGAAAAAT
TCAGGTTGTGGGAATCAGAGTCAGACACACTTCTGCTGGTAGAAGTTTAGAACCATGGGGTGTTTTGGCTGCTGTGCAGAAGATGAAATTCAAAATGCAGCCGATGGCACGAGGCCTATTATGGTAAATGGAAATTTCCCAGGAAATGATGGAGTTTACGAAAATGCAAACACAGCTCTCAGGAGTGGTCAAAATCTAAA
ACTTCAGCCTATTGCTGTTCCTGAAATCACAGTGGATGAATTGAGGGAGGTAACAGATAACTTCAGTCAAAATTCGTTGATTGGAGAGGGTTCTTATGGTCCAGTATATCATGGCATCTTAAAAAATGGCCGTGATTCAGCCATTAAAAAGTTGGATGCTAGAAAACAACCAGATCAGGAGTTACTTGCACAGGTTTCCA
TGGTTTCGAGGTTGAAGCATGAAAATGTAGTGGAACTGGTTGGGTATTGTGTTGATGGGAGCCTGCGAGTGCTTGCTTATGAGTTTGCAACAATGGGATCGCTTCATGACATCCTTCATGGTAAGAAAGGTGTTAAAGGAGCACAACCAGGTCCAGTTCTCACTTGGACGCAGAGAGTAAAAATTGCAGTAGGTGCTGCA
AAAGGGCTTGAGTACCTCCATGAGAAGGCACAACCATCTATCATTCACCGTGATATCAAGTCTAGCAATGTCTTACTTTTTGATGACGTTACAGCAAAGATAGCTGATTTTGATCTATCAAACCAAGCTCCTGACATGTCAGCACGGCTTCATTCCACTCGTGTGCTTGGAACATTTGGTTATCATGCTCCAGAATATGC
GATGACAGGACAATCAACTCAGAAGAGTGATGTTTACAGCTTTGGCATTGTCCTCCTTGAGTTATTGACTGGCAGGAAACCAGTTGATCACACGTTGCCACGCGGTCAACAAAGCCTTGTTACATGGGCAACCCCAAGACTTAGTGAGGACAAAGTGAAGCAATGTGTGGATCCAAGGTTGAAAGGAGACTATCCACCTA
AAGCAGTGGCTAAGATGGCAGCAGTTGCTGCCTTGTGTGTGCAGTATGAAGCTGATTTTCGTGCAAACATGAGTATTATTGTGAAAGCTCTTCGACCTCTATTGAATGCACAATCAACTCCTGTTGGTGGGAGTGCGGCCGAGTAATCTGATGACAGTCATATTATACCTGACCTTATGATATTCCAAATTTGTGCGTTG
TTTAGTTTGGCATATCTTCTATCTGCTTGCATATATCTCGACCTGGGATTTGAATATCGTAAAGAATTGGATTACTAATCATGTGGAAACAGAAGGGAAGCAAGGCAACGAATGCATACAATTCGACATGGGCATTCAAATTTGCTGGCCCATGCTGAGTTTTCACGATATGCAAGTATGATGTCTACTGTGCTGCTTTC
TATTAGGTTGTCATGATTCATGTTTGTATGTATATTCATACATAAGTATAATGTGTCATAAACATTAGTTTCGTTGTCTAGAAGTGTCCCAGGACTCAGTTACGAGAGGTATGGCTATTCTTCTTGGTTTACAGCACAATTGCTATTTAAATTGGTTTATTTTCAGTATTTTCTTATTATTTTCATAGCTGAAAGCATAT
GTTATTTGCATGGAGAAGATAATGGATCTCCC


>TRINITY_DN107837_c0_g1_i3 from sample A3 / Example unspliced isoform:
CATCATTTGAACAAACCCCAACGATAGTTTTGTGTAGCTGGAATGCTTCACATTCTCACACAACATTGGGCTCGACGTTCGCTGTCGGATCATGTGACCACAGGGGGGTTTGCGTGACTGTGGACGGTCGTCATAAATTAGACTTCGAACGATACAGCAGTCTAAGTCAATGCATCATGGTCACTGAAATTGCCATATAT
AGACGATCTGAGGCCGTTGATTGCAGGATTACGGAGTATTCATGGTATATATACAGATTTCTCTCTCCCTGTTGCGGTAAATTGGTTAAGGGCCCTCTGTTCTGTTGATTGCAGTGCTGTCTGCTTCTCTTTAAAGCGgtgagtattataatcttcatttcattagtctgccaacttgcatggcgtggctgtttttatga
cctagctttagctttagctttggtttatttgattctacccaccaaacactcagaaacattttgtcttcttaaatccttgtttttgagcataattgtgaatttgtatatggtaaacacctccgggtttctcttctttcaataaaattgtcag
GCAAGCATGCGCGCAAATCAATCCGATGCATTGAATTGGAGGGTTGAGA
GGTGGGTAGTCTTTGGTTAAGCTTAATTTTGAACATCCAGTTGTTTTTCCGGTAAACTACTTTGCTTTGTAAACCCATCTTGTTTTTTCTTTATGCTAGCTGCTTAGCTTAAGACCGCCTGTTATACTCTTATGTCAAGGGAAATTTTACACTGCACGGAGCAATGGAGATCTCGTTCCTACCACTCTGCCCCAAATGGC
GGCTTTTCGTTTTGTTTTGTTTATATTATTGTTGTAGTCATCTTCGAAGATGAACA




Intron 4 GTGAGTATTA ... GGGTTGAGAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A124.17182058
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A322.73153045
A421.53164045
A522.37118134
A622.55182053
A721.49285078
A817.39114024
A922.65304089
A1021.19264071



>TRINITY_DN43581_c0_g2_i5 from sample A7 / Example spliced isoform
CATAAAACCACTTAGTTTGACCCGTAACACTTTCAAGAAAACCATTACAGTACAAAGTGTTGATACTAGTTGCTACCCTTACCGCCAACCTATATTGATCCTTATCATCATTTGAACAAACCCCAACGATAGTTTTGTGTAGCTGGAATGCTTCACATTCTCACACAACATTGGGCTCGACGTTCGCTGTCGGATCATGT
GACCACAGGGGGGTTTGCGTGACTGTGGACGGTCGTCATAAATTAGACTTTGAACGATACAGCAGTCTAAGTCAATGCATCATGGTCACTGAAATTGCCATATATAGACGATCTGAGGCCGTTGATTGCAGGATTACGGAGTATTCATGGTATATATACAGATTTCTCTCTCCCTGTTGCGGTAAATTGGTTAAGGGCCC
TCTGTTCTGTTGATTGCAGTGCTGTCTGCTTCTCTTTAAAGCGAGTTTGAAAAATTCAGGTTGTGGGAATCAGAGTCAGACACACTTCTGCTGGTAGAAGTTTAGAACCATGGGGTGTTTTGGCTGCTGTGCAGAAGATGAAATTCAAAATGCAGCCGATGGCACGAGGCCTATTATGGTAAATGGAAATTTCCCAGGAA
ATGATGGAGTTTACGAAAATGCAAACACAGCTCTCAGGAGTGGTCAAAATCTAAAACTTCAGCCTATTGCTGTTCCTGAAATCACAGTGGATGAATTGAGGGAGGTAACAGATAACTTCAGTCAAAATTCGTTGATTGGAGAGGGTTCTTATGGTCCAGTATATCATGGCATCTTAAAAAATGGCCGTGATTCAGCCATT
AAAAAGTTGGATGCTAGAAAACAACCAGATCAGGAGTTACTTGCACAGGTTTCCATGGTTTCGAGGTTGAAGCATGAAAATGTAGTGGAACTGGTTGGGTATTGTGTTGATGGGAGCCTGCGAGTGCTTGCTTATGAGTTTGCAACAATGGGATCGCTTCATGACATCCTTCATGGTAAGAAAGGTGTTAAAGGAGCACA
ACCAGGTCCAGTTCTCACTTGGACGCAGAGAGTAAAAATTGCAGTAGGTGCTGCAAAAGGGCTTGAGTACCTCCATGAGAAGGCACAACCATCTATCATTCACCGTGATATCAAGTCTAGCAATGTCTTACTTTTTGATGACGTTACAGCAAAGATAGCTGATTTTGATCTATCAAACCAAGCTCCTGACATGTCAGCAC
GGCTTCATTCCACTCGTGTGCTTGGAACATTTGGTTATCATGCTCCAGAATATGCGATGACAGGACAGTCAACTCAGAAGAGTGATGTTTACAGCTTTGGCATTGTCCTCCTTGAGTTATTGACTGGCAGGAAACCAGTTGATCACACGTTGCCACGCGGTCAACAAAGCCTTGTTACATGGGCAACCCCAAGACTTAGT
GAGGACAAAGTGAAGCAGTGTGTGGATCCAAGGTTGAAAGGAGACTATCCACCTAAAGCAGTGGCTAAGATGGCAGCAGTTGCTGCCTTGTGTGTGCAGTATGAAGCTGATTTTCGTGCAAACATGAGTATTATTGTGAAAGCTCTTCGACCTCTATTGAATGCACAATCAACTCCTGTTGGTGGGAGTGCGGCCGAGTA
ATCTGATGACAGTCATATTATACCTGACCTTATGATATTCCAAATTTGTGCGTTGTTTAGTTTGGCATATCTTCTATCTGCTTGCATATATCTCGACCTGGGATTTGAATATCGTAAAGAATTGGATTACTAATCATGTGGAAACAGAAGGGAAGCAAGGCAACGAATGCATACAATTCGACATGGGCATTCAAATTTGC
TGGCCCATGCTGAGTTTTCACGATATGCAAGTATGATGTCTACTGTGCTGCTTTCTATTAGGTTGTCATGATTCATGTTTGTATGTATATTCATACATAAGTATAATGTGTCATAAACATTAGTTTCGTTGTCTAGAAGTGTCCCAGGACTCAGTTACGAGAGGTATGGCTATTCTTCTTGGTTTACAGCACAATTGCTA
TTTAAATTGGTTTATTTTCAGTATTTTCTTATTATTTTCATAGCTGAAAGCATATGTTATTTGCATGGAGAAGATAATGGATCTCCAAGAAACACATTGCGAACCATGGCATTACTACATCCGCTACAATATTATGTTTCTGATAAATAATGATTGGTCTTGGAATAACAATTGCACTAGATGGGTATTGTTACAAGCTC
TG


>TRINITY_DN43581_c0_g2_i2 from sample A7 / Example unspliced isoform:
CTGTCTGCTTCTCTTTAAAGCGgtgagtattataatcttcatttcattagtctgccaacttgcatggcgtggctgtttttatgacctagctttagctttagctttggtttatttgattctacccaccaaacactcagaaacattttgtcttcttaaatccttgtttttgagcataattgtgaatttgtatatggtaaaca
cctccgggtttctcttctttcaataaaattgtcaggcaagcatgcgcgcaaatcaatccgatgcattgaattggagggttgagag
AGTTTGAAAAATTCAGGTTGTGGGAATCAGAGTCAGACACACTTCTGCTGGTAGAAGTTTAGAACCATGGGGTGTTTTGGCTGCTGTGCAGAAGATGAAATTCAAAATGCAGCCG
ATGGCACGAGGCCTATTATGGTAAATGGAAATTTCCCAGGAAATGATGGAGTTTACGAAAATGCAAACACAGCTCTCAGGAGTGGTCAAAATCTAAAACTTCAGCCTATTGCTGTTCCTGAAATCACAGTGGATGAATTGAGGGAGGTAACAGATAACTTCAGTCAAAATTCGTTGATTGGAGAGGGTTCTTATGGTCCA
GTATATCATGGCATCTTAAAAAATGGCCGTGATTCAGCCATTAAAAAGTTGGATGCTAGAAAACAACCAGATCAGGAGTTACTTGCACAGGTTTCCATGGTTTCGAGGTTGAAGCATGAAAATGTAGTGGAACTGGTTGGGTATTGTGTTGATGGGAGCCTGCGAGTGCTTGCTTATGAGTTTGCAACAATGGGATCGCT
TCATGACATCCTTCATGGTAAGAAAGGTGTTAAAGGAGCACAACCAGGTCCAGTTCTCACTTGGACGCAGAGAGTAAAAATTGCAGTAGGTGCTGCAAAAGGGCTTGAGTACCTCCATGAGAAGGCACAACCATCTATCATTCACCGTGATATCAAGTCTAGCAATGTCTTACTTTTTGATGACGTTACAGCAAAGATAG
CTGATTTTGATCTATCAAACCAAGCTCCTGACATGTCAGCACGGCTTCATTCCACTCGTGTGCTTGGAACATTTGGTTATCATGCTCCAGAATATGCGATGACAGGACAGTCAACTCAGAAGAGTGATGTTTACAGCTTTGGCATTGTCCTCCTTGAGTTATTGACTGGCAGGAAACCAGTTGATCACACGTTGCCACGC
GGTCAACAAAGCCTTGTTACATGGGCAACCCCAAGACTTAGTGAGGACAAAGTGAAGCAGTGTGTGGATCCAAGGTTGAAAGGAGACTATCCACCTAAAGCAGTGGCTAAGATGGCAGCAGTTGCTGCCTTGTGTGTGCAGTATGAAGCTGATTTTCGTGCAAACATGAGTATTATTGTGAAAGCTCTTCGACCTCTATT
GAATGCACAATCAACTCCTGTTGGTGGGAGTGCGGCCGAGTAATCTGATGACAGTCATATTATACCTGACCTTATGATATTCCAAATTTGTGCGTTGTTTAGTTTGGCATATCTTCTATCTGCTTGCATATATCTCGACCTGGGATTTGAATATCGTAAAGAATTGGATTACTAATCATGTGGAAACAGAAGGGAAGCAA
GGCAACGAATGCATACAATTCGACATGGGCATTCAAATTTGCTGGCCCATGCTGAGTTTTCACGATATGCAAGTATGATGTCTACTGTGCTGCTTTCTATTAGGTTGTCATGATTCATGTTTGTATGTATATTCATACATAAGTATAATGTGTCATAAACATTAGTTTCGTTGTCTAGAAGTGTCCCAGGACTCAGTTAC
GAGAGGTATGGCTATTCTTCTTGGTTTACAGCACAATTGCTATTTAAATTGGTTTATTTTCAGTATTTTCTTATTATTTTCATAGCTGAAAGCATATGTTATTTGCATGGAGAAGATAATGGATCTCCAAGAAACACATTGCGAACCATGGCATTACTACATCCGCTACAATATTATGTTTCTGATAAATAATGATTGGT
CTTGGAATAACAATTGCACTAGATGGGTATTGTTACAAGCTCTG




Intron 5 GTCGGAAATA ... CGTTTTATAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A128.091927527
A227.222308610
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A630.1228312225
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A821.721915324
A923.042948842
A1024.633410931



>TRINITY_DN107837_c0_g1_i4 from sample A3 / Example spliced isoform
CATCATTTGAACAAACCCCAACGATAGTTTTGTGTAGCTGGAATGCTTCACATTCTCACACAACATTGGGCTCGACGTTCGCTGTCGGATCATGTGACCACAGGGGGGTTTGCGTGACTGTGGACGGTCGTCATAAATTAGACTTCGAACGATACAGCAGTCTAAGTCAATGCATCATGGTCACTGAAATTGCCATATAT
AGACGATCTGAGGCCGTTGATTGCAGGATTACGGAGTATTCATGGTATATATACAGATTTCTCTCTCCCTGTTGCGGTAAATTGGTTAAGGGCCCTCTGTTCTGTTGATTGCAGTGCTGTCTGCTTCTCTTTAAAGCGAGTTTGAAAAATTCAGGTTGTGGGAATCAGAGTCAGACACACTTCTGCTGGTAGAAGTTTAG
AACCATGGGGTGTTTTGGCTGCTGTGCAGAAGATGAAATTCAAAATGCAGCCGATGGCACGAGGCCTATTATGGTAAATGGAAATTTCCCAGGAAATGATGGAGTTTACGAAAATGCAAACACAGCTCTCAGGAGTGGTCAAAATCTAAAACTTCAGCCTATTGCTGTTCCTGAAATCACAGTGGATGAATTGAGGGAGG
TAACAGATAACTTCAGTCAAAATTCGTTGATTGGAGAGGGTTCTTATGGTCCAGTATATCATGGCATCTTAAAAAATGGCCGTGATTCAGCCATTAAAAAGTTGGATGCTAGAAAACAACCAGATCAGGAGTTACTTGCACAGGTTTCCATGGTTTCGAGGTTGAAGCATGAAAATGTAGTGGAACTGGTTGGGTATTGT
GTTGATGGGAGCCTGCGAGTGCTTGCTTATGAGTTTGCAACAATGGGATCGCTTCATGACATCCTTCATGGTAAGAAAGGTGTTAAAGGAGCACAACCAGGTCCAGTTCTCACTTGGACGCAGAGAGTAAAAATTGCAGTAGGTGCTGCAAAAGGGCTTGAGTACCTCCATGAGAAGGCACAACCATCTATCATTCACCG
TGATATCAAGTCTAGCAATGTCTTACTTTTTGATGACGTTACAGCAAAGATAGCTGATTTTGATCTATCAAACCAAGCTCCTGACATGTCAGCACGGCTTCATTCCACTCGTGTGCTTGGAACATTTGGTTATCATGCTCCAGAATATGCGATGACAGGACAATCAACTCAGAAGAGTGATGTTTACAGCTTTGGCATTG
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GCTGATTTTCGTGCAAACATGAGTATTATTGTGAAAGCTCTTCGACCTCTATTGAATGCACAATCAACTCCTGTTGGTGGGAGTGCGGCCGAGTAATCTGATGACAGTCATATTATACCTGACCTTATGATATTCCAAATTTGTGCGTTGTTTAGTTTGGCATATCTTCTATCTGCTTGCATATATCTCGACCTGGGATT
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>TRINITY_DN107837_c0_g1_i7 from sample A3 / Example unspliced isoform:
GCTTATTAGTTAGTTTTCTTTGTGAGAATGTTAGGGGTTTGATGTATCTTTCAACTTTGGTTTCTTGATTAATAACTTTATTTTTTGAGTTCCTGTATTACTGCTGCTTGCTTCCATATACAAGGAGTTTCATGTTCTATGAAGTGTAAAAGATTTAGAGCCCATCTGTGTGTTTTTAGACACGAGTCTTTTGTATTGCT
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Intron 6 GCAAGCATGC ... AAAAATTCAG

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>TRINITY_DN43536_c0_g2_i1 from sample A10 / Example spliced isoform
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GTGCTTGGAACATTTGGTTATCATGCTCCAGAATATGCGATGACAGGACAATCAACTCAGAAGAGTGATGTTTACAGCTTTGGCATTGTCCTCCTTGAGTTATTGACTGGCAGGAAACCAGTTGATCACACGTTGCCACGCGGTCAACAAAGCCTTGTTACATGGGCAACCCCAAGACTTAGTGAGGACAAAGTGAAGCA
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TCAGTATTTTCTTATTATTTTCATAGCTGAAAGCATATGTTATTTGCATGGAGAAGATAATGGATCTCCAAGAAACACATTGCGAACCATGGCATTACTACATCCGCTA


>TRINITY_DN43536_c0_g2_i3 from sample A10 / Example unspliced isoform:
ATAAAACCACTTAGTTTGACCTGTAACACTTTCAAGAAAACCATTACCGTACAAAGTGTTGATACTAGTTGCTACCCTTACCGCCAACCTATATTGATCCTTATCATCATTTGAACAAACCCCAACGATAGTTTTGTGTAGCTGGAATGCTTCACATTCTCACACAACATTGGGCTCGACGTTCGCTGTCGGATCATGTG
ACCACAGGGGGGTTTGCGTGACTGTGGACGGTCGTCATAAATTAGACTTTGAACGATACAGCAGTCTAAGTCAATGCATCATGGTCACTGAAATTGCCATATATAGACGATCTGAGACCGTTGATTGCAGGATTACGGAGTATTCATGGTATATATACAGATTTCTCTCTCCCTGTTGCGGTAAATTGGTTAAGGGCCCT
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GCAGCCGATGGCACGAGGCCTATTATGGTAAATGGAAATTTCCCAGGAAATGATGGAGTTTACGAAAATGCAAACACAGCTCTCAGGAGTGGTCAAAATCTAAAACTTCAGCCTATTGCTGTTCCTGAAATCACAGTGGATGAATTGAGGGAGGTAACAGATAACTTCAGTCAAAATTCGTTGATTGGAGAGGGTTCTTA
TGGTCCAGTATATCATGGCATCTTAAAAAATGGCCGTGATTCAGCCATTAAAAAGTTGGATGCTAGAAAACAACCAGATCAGGAGTTACTTGCACAGGTTTCCATGGTTTCGAGGTTGAAGCATGAAAATGTAGTGGAACTGGTTGGGTATTGTGTTGATGGGAGCCTGCGAGTGCTTGCTTATGAGTTTGCAACAATGG
GATCGCTTCATGACATCCTTCATGGTAAGAAAGGTGTTAAAGGAGCACAACCAGGTCCAGTTCTCACTTGGACGCAGAGAGTAAAAATTGCAGTAGGTGCTGCAAAAGGGCTTGAGTACCTCCATGAGAAGGCACAACCATCTATCATTCACCGTGATATCAAGTCTAGCAATGTCTTACTTTTTGATGACTTTACAGCA
AAGATAGCTGATTTTGATCTATCAAACCAAGCTCCTGACATGTCAGCACGGCTTCATTCCACTCGTGTGCTTGGAACATTTGGTTATCATGCTCCAGAATATGCGATGACAGGACAATCAACTCAGAAGAGTGATGTTTACAGCTTTGGCATTGTCCTCCTTGAGTTATTGACTGGCAGGAAACCAGTTGATCACACGTT
GCCACGCGGTCAACAAAGCCTTGTTACATGGGCAACCCCAAGACTTAGTGAGGACAAAGTGAAGCAATGTGTGGATCCAAGGTTGAAAGGAGACTATCCACCTAAAGCAGTGGCTAAGATGGCAGCAGTTGCTGCCTTGTGTGTGCAGTATGAAGCTGATTTTCGTGCAAACATGAGTATTATTGTGAAAGCTCTTCGAC
CTCTATTGAATGCACAATCAACTCCTGTTGGTGGGAGTGCGGCCGAGTAATCTGATGACAGTCATATTATACCTGACCTTATGATATTCCAAATTTGTGCGTTGTTTAGTTTGGCATATCTTCTATCTGCTTGCATATATCTCGACCTGGGATTTGAATATCGTAAAGAATTGGATTACTAATCATGTGGAAACAGAAGG
GAAGCAAGGCAACGAATGCATACAATTCGACATGGGCATTCAAATTTGCTGGCCCATGCTGAGTTTTCACGATATGCAAGTATGATGTCTACTGTGCTGCTTTCTATTAGGTTGTCATGATTCATGTTTGTATGTATATTCATACATAAGTATAATGTGTCATAAACATTAGTTTCGTTGTCTAGAAGTGTCCCAGGACT
CAGTTACGAGAGGTATGGCTATTCTTCTTGGTTTACAGCACAATTGCTATTTAAATTGGTTTATTTTCAGTATTTTCTTATTATTTTCATAGCTGAAAGCATATGTTATTTGCATGGAGAAGATAATGGATCTCCAAGAAACACATTGCGAACCATGGCATTACTACATCCGCTA