sp|Q8RXP6|WAV2_ARATH ----> Alpha/beta hydrolase domain-containing protein WAV2

Intron 1 GTACCAACAA ... TTTGATGAAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	100	0	7	6
A2	100	0	12	5
A3	80	1	6	2
A4	100	0	11	11
A5	100	0	4	4
A6	92.68	3	43	33
A7	92.98	2	31	22
A8	100	0	33	46
A9	95.92	1	31	16
A10	100	0	20	9

>TRINITY_DN36666_c0_g2_i3 from sample A9 / Example spliced isoform

AAAATGGTCAGCAAAGACAAAGAAAGGGCAGTTGAAGACTATTTCAGCCTCCTCATGGAAACGGTATTGTAATTTTTACATGGAACTTGTTTCTGCACAAATTGAACAAACTGGAAACATTAGCTATCTTGCTTGTATTTCTATAGGCCTCTCACTGAGGCTTGCATCATTGATGGTTGATAGTTTATAAGTTTTACAAT
TTCTCATTCAAGGTATAACAGTCTGATGACTGAGATGTCTTCTATGGTGGAATTGAGGGGTG

>TRINITY_DN36666_c0_g2_i5 from sample A9 / Example unspliced isoform:

GTTGGTATGATTCAGAACTATCACAAAATGTCTGACAATCCCGGGGAACTTTTTCCCTGGGAAAAAGTTGAATCCTGTAAAAAAGACTGAAAGCTCATTTGTAAGATAATGCTGGTTATAATGAACAGGCAACTGAATACAACACATACTCAGACATTGAAGCAGTGTACCAATGTTTGACAACAGAGTATGGAGTGAAG
CAGGAGGACTTGATTTTATATGGCCAGTCTGTTGGTAGTGGCCCTACATTACACTTGGCAGCTCGCTTACCAAGGTTGAGAGCAGTTGTTCTTCACAGTGCTATACTTTCAGGCCTCCGTGTACTTTATCCTCTCAAAATCACTTTCTGGTTTGATATCTACAAAAATATTGACAAGATTCGACATGTGAAATGTCCTGC
ACTTGTGATACACGGAACAGCTGATGATGTTGTTGATTGGTCCCATGGAAAAAGACTATGGGAGCTAAGCAAAGAAAAATACGAGCCTCTATGGATTAAAGGGGGTGGCCACTGCAATTTGGAGCTCTATCCCGAGTATATCCAACATATGCGCAGATTTATCAAAGCAATGGAAAATCTAGAGGCAGGAAATAATGCAG
AAAATGGTCAGCAAAGgtaccaacaaacaaaatgtaccatgtgcttgaagttcagatggaacatgtaatttgctcgattcttggtgttgaattgtgttctctcttttgatgaagACAAAGAAAGGGCAGTTGAAGACTATTTCAGCCTCCTCATGGAAACGGTATTGTAATTTTTACATGGAACTTGTTTCTGCACAAAT
TGAACAAACTGGAAACATTAGCTATCTTGCTTGTATTTCTATAGGCCTCTCACTGAGGCTTGCATCATTGATGGTTGATAGTTTATAAGTTTTACAATTTCTCATTCAAGGTATAACAGTCTGATGACTGAGATGTCTTCTATGGTGGAATTGAGGGGTG

Intron 2 GTAAGTGATG ... GGCTCTGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	27.27	4	1	2
A2	14.29	6	1	1
A3	20	2	1	0
A4	6.67	7	0	1
A5	0	6	0	0
A6	33.33	13	3	10
A7	27.27	12	1	8
A8	20	10	1	4
A9	0	3	0	0
A10	25.71	13	3	6

>TRINITY_DN40619_c0_g2_i3 from sample A6 / Example spliced isoform

GTGGGTTTGAATGAGAGGGAAGGCATGGAGGAGGCAAGGAGCCAATGGCCAAAGCATTGGCTGCCTCGTTGATTCCTCAACTGATATGATGTTGAAATGGATTCCACTTCCAGTGCCTGGAGAATTGCACTGCGCCCTGCCGGTGAAGGCGGATGACTCCTTTTTAAGCTACCAACTAGCTTCCGACACTGGCCGTCCTT
GGACGCAGTTATTAAAGAAATAATGCCGTCGGAGAAAAATAGCTCCGTTGATTGAGGTTTGAATCAAGGGGAATACCCTGAAAAAATGTGGCGAGTCTCGACCCTCCCAGTGCTCTAAGGCTTCGGTTCGAGTCCCGGGTGAGACGATCTGATCTAAAAACCCAGGAAATGATGGGCTTAAGGCGCGTTTACCTTTGATC
AGCTGAAGCGGGCCATTCCGAAATCTTTAAAGAAAGGGGGAAATGGGAAGCCTAGTGTCTAATGTGGCTGCGAAGTTTGCATTTTTCCCACCGCAGCCTCCGACGTATAATATCCAGACAGAGGGCGCCAAGATCACTTTTGCCAGGATCCGCAGCGAGAAGAATATACACGTTCACCTGCTGGACACCAAGCGGGGCAA
CCGGATCGTTGCAATGTATTGGCGTCACCCTTATGCCAGGTTTACAGTGCTCTATTCACACGGGAACGCCGCGGATTTGGGGCAGATGTATGACTTATTTGTCCAGCTAAGGAAACATCTTCGCATCAACTTAATGGCTTACGATTACTCTGGATATGGAGCTTCTACTGGCAAGGCAACTGAATACAACACATACTCAG
ACATTGAAGCAGTGTACCAATGTTTGACAACAGAGTATGGAGTGAAGCAGGAGGACTTGATTTTATATGGCCAGTCTGTTGGTAGTGGCCCTACATTACACTTGGCAGCTCGCTTACCAAGGTTGAGAGCAGTTGTTCTTCACAGTGCTATACTTTCAGGCCTCCGTGTACTTTATCCTCTCAAAATCACTTTCTGGTTT
GATATCTACAAAAATATTGACAAGATTCGACATGTGAAATGTCCTGCACTTGTGATACACGGAACAGCTGATGATGTTGTTGATTGGTCCCATGGAAAAAGACTATGGGAGCTAAGCAAAGAAAAATACGAGCCTCTATGGATTAAAGGGGGTGGCCACTGCAATTTGGAGCTCTATCCCGAGTATATCCAACATATGCG
CAGATTTATCAAAGCAATGGAAAATCTAGAGGCAGGAAATAATGCAGAAAATGGTCAGCAAAGGTACCAACAAACAAAATGTACCATGTGCTTGAAGTTCAGATGGAACATGTAATTTGCTCGATTCTTGGTGTTGAATTGTGTTCTCTCTTTTGATGAAGACAAAGAAAGGGCAGTTGAAGACTATTTCAGCCTCCTCA
TGGAAACGGTATTGTAATTTTTACATGGAACTTGTTTCTGCACAAATTGAACAAACTGGAAACATTAGCTATCTTGCTTGTATTTCTATAGGCCTCTCACTGAGGCTTGCATCATTGATGGTTGATAGTTTATAAGTTTTACAATTTCTCATTCAAGGTATAACAGTCTGATGACTGAGATGTCTTCTATGGTGGAATTG
AGGGGTGAACAATGCACCCCTACACTAATGATTTTACATATTACAGTTTGAAGTACAGGCAAATTTTCTCACTCAGGTGTCCTGTAAGGTATGTTAAAGTGATTCATAGAACTCTGGAGCAAAAATTGATGAATGAACTAGTTCTTTCAAAATGCATCATGAATATGCATATTACAAGGTGATGTCGTGCATGCGTGCTG
ACCTTCTGTAATCATTAGATAGCCTGGGATGACTTCATTATTGAACATCAGATTGTAAAACTAACTTGGAGACTTGTCAGTTGTACTGCATTTTCCTTGTAGTAAAAGATGAATTTTGGTAATACTTCTTAAATATTTGATTGTCTACAAGAAATGACATTTGTGTACTCCATACATGCAGAAATGTCCTATGGAGAAAG
GAAGTTCATTTATTTTTCATAAATTAATGATGATGAATATGTGAGTCAAGTCCTGGAAAAATCAGTTTGAGATGGTTTTATGGTTTTACCAACTGTGAACACAGTGGATACAGATGGCCATTATGTCAAACTGATTTTTGATGAATTCTGGACGCC

>TRINITY_DN40619_c0_g2_i1 from sample A6 / Example unspliced isoform:

TTACGATTACTCTGGATATGGAGCTTCTACTGGCAAGAGTATGGAGTGAAGCAGGAGGACTTGATTTTATATGGCCAGTCTGTTGGTAGTGGCCCTACATTACACTTGGCAGCTCGCTTACCAAGGTTGAGAGCAGTTGTTCTTCACAGTGCTATACTTTCAGGCCTCCGTGTACTTTATCCTCTCAAAATCACTTTCTG
GTTTGATATCTACAAAgtaagtgatgggaacaataagctgatttatgttaaacatctgatatttttctattcatgttcctttttgaagattgtgttttcacaccaaacatgatcagcagtgttaagtagaggtatttggctctgcagAATATTGACAAGATTCGACATGTGAAATGTCCTGCACTTGTGATACACGGAAC
AGCTGATGATGTTGTTGATTGGTCCCATGGAAAAAGACTATGGGAGCTAAGCAAAGAAAAATACGAGCCTCTATGGATTAAAGGGGGTGGCCACTGCAATTTGGAGCTCTATCCCGAGTATATCCAACATATGCGCAGATTTATCAAAGCAATGGAAAATCTAGAGGCAGGAAATAATGCAGAAAATGGTCAGCAAAGGT
ACCAACAAACAAAATGTACCATGTGCTTGAAGTTCAGATGGAACATGTAATTTGCTCGATTCTTGGTGTTGAATTGTGTTCTCTCTTTTGATGAAGACAAAGAAAGGGCAGTTGAAGACTATTTCAGCCTCCTCATGGAAACGGTATTGTAATTTTTACATGGAACTTGTTTCTGCACAAATTGAACAAACTGGAAACAT
TAGCTATCTTGCTTGTATTTCTATAGGCCTCTCACTGAGGCTTGCATCATTGATGGTTGATAGTTTATAAGTTTTACAATTTCTCATTCAAGGTATAACAGTCTGATGACTGAGATGTCTTCTATGGTGGAATTGAGGGGTGAACAATGCACCCCTACACTAATGATTTTACATATTACAGTTTGAAGTACAGGCAAATT
TTCTCACTCAGGTGTCCTGTAAGGTATGTTAAAGTGATTCATAGAACTCTGGAGCAAAAATTGATGAATGAACTAGTTCTTTCAAAATGCATCATGAATATGCATATTACAAGGTGATGTCGTGCATGCGTGCTGACCTTCTGTAATCATTAGATAGCCTGGGATGACTTCATTATTGAACATCAGATTGTAAAACTAAC
TTGGAGACTTGTCAGTTGTACTGCATTTTCCTTGTAGTAAAAGATGAATTTTGGTAATACTTCTTAAATATTTGATTGTCTACAAGAAATGACATTTGTGTACTCCATACATGCAGAAATGTCCTATGGAGAAAGGAAGTTCATTTATTTTTCATAAATTAATGATGATGAATATGTGAGTCAAGTCCTGGAAAAATCAG
TTTGAGATGGTTTTATGGTTTTACCAACTGTGAACACAGTGGATACAGATGGCCATTATGTCAAACTGATTTTTGATGAATTCTGGACGCC

Intron 3 GCAACTGAAT ... TTGACAACAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	52.52	7	6.5	9
A2	59.82	6	7	11
A3	60.41	5	8.5	7
A4	69.19	4	8	10
A5	69.21	3	6.5	7
A6	61.66	6	9.5	10
A7	66.13	7	15.5	17
A8	54.79	7	7	10
A9	52.38	4	6	3.5
A10	57.02	5	5.5	9

>TRINITY_DN40325_c0_g2_i4 from sample A8 / Example spliced isoform

GAAAAACTGTTTGGGACCCCGTGGGTTTGAATGAGAGGGAAGGCATGGAGGAGGCAAGGAGCCAATGGCCAAAGCATTGGCTGCCTCGTTGATTCCTCAACTGATATGATGTTGAAATGGATTCCACTTCCAGTGCCTGGAGAATTGCACTGCGCCCTGCCGGTGAAGGCGGATGACTCCTTTTTAAGCTACCAACTAGC
TTCCGACACTGGCCGTCCTTGGACGCAGTTATTAAAGAAATAATGCCGTCGGAGAAAAATAGCTCCGTTGATTGAGGTTTGAATCAAGGGGAATACCCTGAAAAAATGTGGCGAGTCTCGACCCTCCCAGTGCTCTAAGGCTTCGGTTCGAGTCCCGGGTGAGACGATCTGATCTAAAAACCTGAGAAATGATGGGCTTA
AGGCGCGTTTACCTTTGATCAGCTGAAGCGGGCCATTCCGAAATCTTTAAAGAAAGGGGGAAATGGGAAGCCTAGTGTCTAATGTGGCTGCGAAGTTTGCATTTTTCCCACCGCAGCCTCCGACGTATAATATCCAGACAGAGGGCGCCAAGATCACTTTTGCCAGGATCCGCAGCGAGAAGAATATACACGTTCACCTG
CTGGACACCAAGCGGGGCAACCGGATCGTTGCAATGTATTGGCGTCACCCTTATGCCAGGTTTACAGTGCTCTATTCACACGGGAACGCCGCGGATTTGGGGCAGATGTATGACTTATTTGTCCAGCTAAGGAAACATCTTCGCATCAACTTAATGGCTTACGATTACTCTGGATATGGAGCTTCTACTGGCAAGAGTAT
GGAGTGAAGCAGGAGGACTTGATTTTATATGGCCAGTCTGTTGGTAGTGGCCCTACATTACACTTGGCAGCTCGCTTACCAAGGTTGAGAGCAGTTGTTCTTCACAGTGCTATACTTTCAGGCCTCCGTGTACTTTATCCTCTCAAAATCACTTTCTGGTTTGATATCTACAAAAATATTGACAAGATTCGACATGTGAA
ATGTCCTGCACTTGTGATACACGGAACAGCTGATGATGTTGTTGATTGGTCCCATGGAAAAAGACTATGGGAGCTAAGCAAAGAAAAATACGAGCCTCTATGGATTAAAGGGGGTGGCCACTGCAATTTGGAGCTCTATCCCGAGTATATCCAACATATGCGCAGATTTATCAAAGCAATGGAAAATCTAGAGGCAGGAA
ATAATGCAGAAAATGGTCAGCAAAGGTACCAACAAACAAAATGTACCATGTGCTTGAAGTTCAGATGGAACATGTAATTTGCTCGATTCTTGGTGTTGAATTGTGTTCTCTCTTTTGATGAAGACAAAGAAAGGGCAGTTGAAGACTATTTCAGCCTCCTCATGGAAACGGTATTGTAATTTTTACATGGAACTTGTTTC
TGCACAAATTGAACAAACTGGAAACATTAGCTATCTTGCTTGTATTTCTATAGGCCTCTCACTGAGGCTTGCATCATTGATGGTTGATAGTTTATAAGTTTTACAATTTCTCATTCAAGGTATAACAGTCTGATGACTGAGATGTCTTCTATGGTGGAATTGAGGGGTGAACAATGCACCCCTACACTAATGATTTTACA
TATTACAGTTTGAAGTACAGGCAAATTTTCTCACTCAGGTGTCCTGTAAGGTATGTTAAAGTGATTCATAGAACTCTGGAGCAAAAATTGATGAATGAACTAGTTCTTTCAAAATGCATCATGAATATGCATATTACAAGGTGATGTCGTGCATGCGTGCTGACCTTCTGTAATCATTAGATAGCCTGGGATGACTTCAT
TATTGAACATCAGATTGTAAAACTAACTTGGAGACTTGTCAGTTGTACTGCATTTTCCTTGTAGTAAAAGATGAATTTTGGTAATACTTCTTAAATATTTGATTGTCTACAAGAAATGACATTTGTGTACTCCATACATGCAGAAATGTCCTATGGAGAAAGGAAGTTCATTTATTTTTCATAAATTAATGATGATGAAT
ATGTGAGTCAAGTCCTGGA

>TRINITY_DN40325_c0_g2_i3 from sample A8 / Example unspliced isoform:

GAAAAACTGTTTGGGACCCCGTGGGTTTGAATGAGAGGGAAGGCATGGAGGAGGCAAGGAGCCAATGGCCAAAGCATTGGCTGCCTCGTTGATTCCTCAACTGATATGATGTTGAAATGGATTCCACTTCCAGTGCCTGGAGAATTGCACTGCGCCCTGCCGGTGAAGGCGGATGACTCCTTTTTAAGCTACCAACTAGC
TTCCGACACTGGCCGTCCTTGGACGCAGTTATTAAAGAAATAATGCCGTCGGAGAAAAATAGCTCCGTTGATTGAGGTTTGAATCAAGGGGAATACCCTGAAAAAATGTGGCGAGTCTCGACCCTCCCAGTGCTCTAAGGCTTCGGTTCGAGTCCCGGGTGAGACGATCTGATCTAAAAACCTGAGAAATGATGGGCTTA
AGGCGCGTTTACCTTTGATCAGCTGAAGCGGGCCATTCCGAAATCTTTAAAGAAAGGGGGAAATGGGAAGCCTAGTGTCTAATGTGGCTGCGAAGTTTGCATTTTTCCCACCGCAGCCTCCGACGTATAATATCCAGACAGAGGGCGCCAAGATCACTTTTGCCAGGATCCGCAGCGAGAAGAATATACACGTTCACCTG
CTGGACACCAAGCGGGGCAACCGGATCGTTGCAATGTATTGGCGTCACCCTTATGCCAGGTTTACAGTGCTCTATTCACACGGGAACGCCGCGGATTTGGGGCAGATGTATGACTTATTTGTCCAGCTAAGGAAACATCTTCGCATCAACTTAATGGCGTATGTTTCTGCTCTCCACTTGTACCTTTAATTTACGATTAC
TCTGGATATGGAGCTTCTACTGGCAAGgcaactgaatacaacacatactcagacattgaagcagtgtaccaatgtttgacaacagAGTATGGAGTGAAGCAGGAGGACTTGATTTTATATGGCCAGTCTGTTGGTAGTGGCCCTACATTACACTTGGCAGCTCGCTTACCAAGGTTGAGAGCAGTTGTTCTTCACAGTGC
TATACTTTCAGGCCTCCGTGTACTTTATCCTCTCAAAATCACTTTCTGGTTTGATATCTACAAAAATATTGACAAGATTCGACATGTGAAATGTCCTGCACTTGTGATACACGGAACAGCTGATGATGTTGTTGATTGGTCCCATGGAAAAAGACTATGGGAGCTAAGCAAAGAAAAATACGAGCCTCTATGGATTAAAG
GGGGTGGCCACTGCAATTTGGAGCTCTATCCCGAGTATATCCAACATATGCGCAGATTTATCAAAGCAATGGAAAATCTAGAGGCAGGAAATAATGCAGAAAATGGTCAGCAAAGGTACCAACAAACAAAATGTACCATGTGCTTGAAGTTCAGATGGAACATGTAATTTGCTCGATTCTTGGTGTTGAATTGTGTTCTC
TCTTTTGATGAAGACAAAGAAAGGGCAGTTGAAGACTATTTCAGCCTCCTCATGGAAACGGTATTGTAATTTTTACATGGAACTTGTTTCTGCACAAATTGAACAAACTGGAAACATTAGCTATCTTGCTTGTATTTCTATAGGCCTCTCACTGAGGCTTGCATCATTGATGGTTGATAGTTTATAAGTTTTACAATTTC
TCATTCAAGGTATAACAGTCTGATGACTGAGATGTCTTCTATGGTGGAATTGAGGGGTGAACAATGCACCCCTACACTAATGATTTTACATATTACAGTTTGAAGTACAGGCAAATTTTCTCACTCAGGTGTCCTGTAAGGTATGTTAAAGTGATTCATAGAACTCTGGAGCAAAAATTGATGAATGAACTAGTTCTTTC
AAAATGCATCATGAATATGCATATTACAAGGTGATGTCGTGCATGCGTGCTGACCTTCTGTAATCATTAGATAGCCTGGGATGACTTCATTATTGAACATCAGATTGTAAAACTAACTTGGAGACTTGTCAGTTGTACTGCATTTTCCTTGTAGTAAAAGATGAATTTTGGTAATACTTCTTAAATATTTGATTGTCTAC
AAGAAATGACATTTGTGTACTCCATACATGCAGAAATGTCCTATGGAGAAAGGAAGTTCATTTATTTTTCATAAATTAATGATGATGAATATGTGAGTCAAGTCCTGGA