sp|P42158|CKL1_ARATH ----> Casein kinase 1-like protein 1
Intron 1 GTGGGTATTT ... TGGATGTCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 28.58 | 90 | 32 | 40 |
| A2 | 20.99 | 88.5 | 26 | 21 |
| A3 | 24.87 | 78.7 | 21 | 31 |
| A4 | 22.83 | 94.7 | 32 | 24 |
| A5 | 23.33 | 46 | 13 | 15 |
| A6 | 16.09 | 161.7 | 51 | 11 |
| A7 | 16.14 | 208 | 61 | 19 |
| A8 | 15.41 | 142.7 | 39 | 13 |
| A9 | 18.62 | 148.7 | 46 | 22 |
| A10 | 17.98 | 107.3 | 34 | 13 |
>TRINITY_DN101209_c0_g1_i11 from sample A4 / Example spliced isoformTTCACTTTAAAAAAAATACACGTTTACAGAAACACGAGTATAACATGGAGATTCGTATTTCTAGAAAACAAAAGATTACATCGGGAACCATCCAGTGGGAACTTACACCGTGGGCCGAGAGAAGGCAAGATGGACATGTACCCGGGTAGATAGGTGACCACTTGCCATTGAAGAGAGGGCTTACGGGTGAGCTGAGCTAT
TCAGTAGGTGGTGGTTTATGGTCCCACATCAAGGGTGGAAGGCAATATAAGCTTCAAATCGATACTACAAAGGATGTGGTGTAGAGGGTTTGAACCCATTATCATAGTTAGGTTCAGATAATCTTTGGTCTGTTTCTCCGAAAAAAGAAAAAGGACATGGACGACTGAAGAAGCCCAAGCCCTTTTGAGGCTACTGAAAT
GAAGCCCAGATGACTGAAAACTCACAATAATTAGGACAGGAATGATAAGATTGAAGGGTTCGATGATTGAAATCTAATACTGCAAAATGCTTGATTGATGTCGAGTGGGAATTTCAGGTGTGTTTTGTGCGAGGCATTTTGGAATAAGAATCATCCAATAACAGCTAAAAGCTGAGGTGGGCATCTTTGAAAATTGTCCC
AATGAGCCTACGAACGTGTTTACACTAGTGGGTTGCTGATATTGGTAAGTGGGTATACGATTTTCTTTGTGTTTGAGCTCAATATAGGCACTATACTCGATCAGTATCTGGGCAATGTATGAGTTCTGAGCTTATGGATCATGCCTGCCCGCTTTGAAAGGATCAAGCGGAGAAAAGATAAAACGAGGACATTTTAATTA
GGGTCAGATCGGATTGGAATTAGAGGATTTGGGTATACAGTCCGAGATAACAGAAACATCAGGAGATTATCACAGTATCTCTCGAGCCAGACATGGAGCCAAAGGTAGGGGAGAAATACAGACTGGGGAGAAAAATTGGCAGCGGTTCATTTGGTGAAATATACCTTGGAACCAATATTCTGACAGATGAGGAAGTTGGC
ATTAAACTGGAAAGTGTGAAAACTAAACATCCTCAGCTGTTGTATGAGTCTAAAGTTTACAGAATACTTCAAGGAGGTGGAGCAGAAGGTGGTATCCCAAATGTAAGATGGTTTGGCGTTGAAGGTGATTACAATGCTACGGTCCTTGATCTTCTTGGGCCAAGTCTTGAAGACTTATTTAATTACTGTAATAGAAAGCT
CTCATTGAAGACTGCATTGATGCTTGCTGATCAGCTAATTCGAAGAATTGAGTATGTACACAGCAAGAGCTTCCTTCATCGAGATATAAAACCTGATAATTTTCTCATGGGTCTTGGCCGGAAGGCAAATCAGGTTAATTTGCTATAAATTTTTTGATAAAATGCTCTTATTCTTTCTATATCCTAACGTAAGTTAAAGA
AAAATGACAAATTACATAAATTATTATTGAAAATATGACAAATTCCTTTTTCTTTCCAAGAAAAAAACTGTAACTTGTATTTCAAAAAGAAAAAGTTACGCTCAGTACATATCATTTAGCCAAAAACCATATATTCAAAAATGGATAACCTATATTATCCCCTTGAAAGAAACTAGCTGTGCCTGTCTGTAGTATGTACT
GACCCATATTTGCCTTTATATTATAAAAATTGGGACTATGCCATTTACAAAAAAGCTAGAAGCCTAAACCATCATGACTTGAGAAAACAACAGTAAAAAGACACTAGAATAACTGTCCAGGAAGGAAAAGAGCTACAAGGATCCTCATCATCAAACAAAACTGGCATACAGGGCCCCTCCAGCTAAACAGAACTAGCACA
TCAGCAGTGAAGAATCAAAGATACTCAGGTGTGTTACCTGGGTCTGTGCTTCTCCACTACTTTACATCCAATGATTCCAATCTGACCTGCGACAGGCAATTTTGAGAGTGCATCTGCCTCTGTGTTGAAAGATCTTTTTACATGCTTGAAATAAATTTCAGTGAAGGATCTAACAACAGTTTTAACCTGCTCCAGCAGAG
GTCTAAGAACACCTACAGCCTGCAATGCCCTTTTATGTGGCAAGTTGTAACAGATGTAATAATGCACGCAGTTCAACTCAATTAGTAGTACCTCTGCCCAGAGGTGCATTGAAAGTGACACAGTGATTCCCAGAAATGAATTAGACCCCCCCCCCACTCCCCGCTTCCCAGCACCACAAGAACTAGGATTCCTCTGACTT
GCTCCATCAAAGTATCCCCAAGAGTAAGATTTATCAATAACTAGGGGATCGGGCCTTAGGTCCTTCGGTTTTGGAGGTTGTTGGCTATCATTATAAATATATTTATATATGTTATACTGTAGAAAACCTCAAGTGGTGAGCACTTACCTTAGAATGGAATCTCATTCCTTATGATACACAAGGCTCAGGAGACTATGACT
GGTATTTCTATATGGAGTACCAAAGCTGGATTCTCCATCCACCTTCTGAAGTGATCAGTTGAGGTGTTTCCAGAATCCCATCCCAACTTCGTGCACCCCCTTCCAAACTTATAGCTTCTTTTTAAACTTCTTTTGCAAAGGGACATTCCATGAGAATTTGCTTTATATATTCACAATCATTTTTACGCAAAACACACATG
CTAGGACCCTGCTATGCGCTCATCTGAAATACCTCCCAGGTAAGTACTTGATTATTTATTGCCAGTAAAAGAGTGACAAATTACTAAACTGTGAATACTTCAAATTAAACAAATCTTGTAACCAACACATCAGAAATTGGTCAAGTTTCAGGGCTTTTTAGATACTTTATAGATGGGTTAAATATGCGAGGCAAATTAAC
TGTACAGATAATGTTGACTGTGTTGGTGTGTTAATTCAACTAATCTGAGTAGTTGAAGTACATGCATAATGTTTTTGGTAGGCAGACTTTCAGCATGAACTAAATGTTTTAGAAAATGAAAAACCATCCAAATGAGAAAAGGTAGCATATTGTGTTTCAAGGATGATATTTGTTTTTATCCTTAATCGGAATTTTAGTAG
GATGCCATAGTGGCTCAAAAAGTTAATATTTGAAGGTTTTAAAACTGTAAAATATTTATATTGGAAGGCTTAAGTAGTTTGCCATATGCTTCATTAGTTAGACATATTTGAAAGTCTCAAAACTCTAAAATTTTTCACATTGGAATGTCATAACGGATATCAAGGTGCTTTTCATAGCCATTTTATTAAAGATATTTGGG
CTTCACTGTATTGAAAAAGTGCGTTTTACAGGTATTGTTAAAGGTTTTAAAATCATAAAATATGGCTGTGAGGTTATAATATGATTTGGGTGCTTTTCATAGACATTCTATCAAGATAAGCTGGTTCATTGGATTGAGAAAGTCCAACTGACAAGTATTAATTTAATCTTTAACTGCACTCTTCTTTGCAACCATTTAAG
GGGTTTGTTCAGGACTCTGCATAGACAGTATCTAGAGAACCAAAGCCGGTCAAAAGTTTATCCCTTTTAAAATACAATATTCTATAATAGATATGCTATGGCTTTACTAATTTCTGTTCTCTCATTAATAAGGAACATACTCCACAACTTTGCTGGAGAGCAAATGTTGGCTACAAATACTTGTGTGTGAAATACACACA
TACACATGGCTGTTCATTCTTGATGAGGATATGGTTGAGTTCTATTGTTCTATGTTTTGGGTCACCTTGATATCCTTTTTTTTCCAGGTTATATGTCCTGGGAAAAACCTCCCGGGCACTTCTCCTCATTCTGAGGATGGTACCATAGTAAGCTCTAGATTCTTCAGGGCAAAAGGCCAGGTCAACAACTCATGACTAGA
TCGTATATAGCTCATCAACAATCAGATCACTAATAGCAAACATGTCACAAAGTGGGATTTGAACCTGG
>TRINITY_DN101209_c0_g1_i10 from sample A4 / Example unspliced isoform:ATTTGTTGACTCGTCAATGTTATCACAAGGGGTTGTTGTTGCTATATTAAGTTTTGTTTTTGGTTACATCTATCTTAATCATATTGTTGAATGAGCAGGTGGTATCCCAAATGTAAGATGGTTTGGCGTTGAAGGTGATTACAATGCTACGGTCCTTGATCTTCTTGGGCCAAGTCTTGAAGACTTATTTAATTACTGTA
ATAGAAAGCTCTCATTGAAGACTGCATTGATGCTTGCTGATCAGCTAgtgggtatttctttccttgaactctttaatgagttaaaatatgactggttacattcatttttttgttgtaaaatgctctcagtgtttagttgatagttgcaaagtacattgattgaatcacaatattctgaaattctgtcaggtggtgggatt
agtaccatgaaataaatgactaagatttgactctcattgtggatgtcagATTCGAAGAATTGAGTATGTACACAGCAAGAGCTTCCTTCATCGAGATATAAAACCTGATAATTTTCTCATGGGTCTTGGCCGGAAGGCAAATCAGGTTTACATGATAGATTTTGGGCTTGCCAAAAAGTATCGTGAGCCTACAACTCATA
AGCATATCCCTTACAGGGAAAACAAAAACCTCACAGGTACTGCACGCTATGCTAGTATCAATACTCATCTCGGAATAG
Intron 2 GTATGTAGAT ... TTGGTTTTAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 32.88 | 49 | 24 | 12 |
| A2 | 26.09 | 51 | 18 | 0 |
| A3 | 29.47 | 67 | 28 | 10 |
| A4 | 26.67 | 77 | 28 | 14 |
| A5 | 13.33 | 13 | 2 | 2 |
| A6 | 14.75 | 52 | 9 | 8 |
| A7 | 26.03 | 108 | 38 | 4 |
| A8 | 25.84 | 66 | 23 | 4 |
| A9 | 25.32 | 118 | 40 | 4 |
| A10 | 24.24 | 75 | 24 | 3 |
>TRINITY_DN101209_c0_g1_i10 from sample A4 / Example spliced isoformATTTGTTGACTCGTCAATGTTATCACAAGGGGTTGTTGTTGCTATATTAAGTTTTGTTTTTGGTTACATCTATCTTAATCATATTGTTGAATGAGCAGGTGGTATCCCAAATGTAAGATGGTTTGGCGTTGAAGGTGATTACAATGCTACGGTCCTTGATCTTCTTGGGCCAAGTCTTGAAGACTTATTTAATTACTGTA
ATAGAAAGCTCTCATTGAAGACTGCATTGATGCTTGCTGATCAGCTAGTGGGTATTTCTTTCCTTGAACTCTTTAATGAGTTAAAATATGACTGGTTACATTCATTTTTTTGTTGTAAAATGCTCTCAGTGTTTAGTTGATAGTTGCAAAGTACATTGATTGAATCACAATATTCTGAAATTCTGTCAGGTGGTGGGATT
AGTACCATGAAATAAATGACTAAGATTTGACTCTCATTGTGGATGTCAGATTCGAAGAATTGAGTATGTACACAGCAAGAGCTTCCTTCATCGAGATATAAAACCTGATAATTTTCTCATGGGTCTTGGCCGGAAGGCAAATCAGGTTTACATGATAGATTTTGGGCTTGCCAAAAAGTATCGTGAGCCTACAACTCATA
AGCATATCCCTTACAGGGAAAACAAAAACCTCACAGGTACTGCACGCTATGCTAGTATCAATACTCATCTCGGAATAG
>TRINITY_DN101209_c0_g1_i5 from sample A4 / Example unspliced isoform:GAGAATGATTTTTTTTAGAGTTTTAGCACCATGAGGAGGGTTTTGATCCCTCCTCCCAACCATTTCATATGGAACATAAACGTCCATTACATTGATCGAACCAGGGCATAGAGCGAACGCCTACTCCACATCCAACATGTGCATATCGAATCAAACCACACTGATTCGACATCCAAAATACTGGTGGGAGAATTTGTGCA
ATTGGGGTTATATTTTGGAATTTCAGGCATATCAACTGCAATTTCTATGCCCCCCAGGAAAGTGTGAAAACTAAACATCCTCAGTTGTTGTATGCGTCCAAAGTTTACAAGGAGGTGGAGCAGAAGGTGGTATCCCAAATGTAAGATGGTTTGGCGTTGAAGGTGATTACAATGCTACGGTCCTTGATCTTCTTGGGCCA
AGTCTTGAAGACTTATTTAATTACTGTAATAGAAAGCTCTCATTGAAGACTGCATTGATGCTTGCTGATCAGCTAATTCGAAGAATTGAGTATGTACACAGCAAGAGCTTCCTTCATCGAGATATAAAACCTGATAATTTTCTCATGGGTCTTGGCCGGAAGGCAAATCAGGTTTACATGATAGATTTTGGGCTTGCCAA
AAAGTATCGTGAGCCTACAACTCATAAGCATATCCCTTACAGgtatgtagattataaagattatttgactataaagtagttaaggtgacgtgataggatttttttgtgtttaatatttatgtattgagttggagatttttggttttagGGAAAACAAAAACCTCACAGGTACTGCACGCTATGCTAGTATCAATACTCAT
CTCGGAATAGGTGAGTAGAACATTATTTATAAGGTTATTGGTGCTCTCTTTATTTTTTTTTAACCTGAGCTCTTTCAGTACATTTGGGAATCTACACGTTGTTTTTGCTCTTTAGAAATTTGTTTAGCAAGTACATTTGAGACATAATATTTCTTGGGCTTATGACACCATATTTAAGCTTTTGTATGGTATTCAGAGCA
AAGTAGGAGC
Intron 3 GTCAGTTGCC ... GTTGTATCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 19.15 | 114 | 27 | 1 |
| A2 | 21 | 79 | 21 | 0 |
| A3 | 13.64 | 76 | 12 | 2 |
| A4 | 26.67 | 66 | 24 | 6 |
| A5 | 22.5 | 31 | 9 | 0 |
| A6 | 12.64 | 76 | 11 | 2 |
| A7 | 16.74 | 184 | 37 | 2 |
| A8 | 15.79 | 144 | 27 | 2 |
| A9 | 13.74 | 182 | 29 | 0 |
| A10 | 14.2 | 145 | 24 | 0 |
>TRINITY_DN101209_c0_g1_i14 from sample A4 / Example spliced isoformTCATTTGGTGAAATATACCTTGGTATGTTTTACTTCTTCCGTGTTTGTGCATACCCAATTTGATTTTTAATGTGATCAAGGTCATTCTATACTTCGATGCTTTAGATTGGGTGCTTTCAGACTTTTGATTTCATTACCATTTTATGTATGTTTGGATGCATTTTTTTATTATCAACGGGAATATCTGCACCAGTCGGATG
AGAATATGTAGTTTTTCTATTTTTGAAAACTGTGTATATTGGTGGTTTTCCACAAACTTTTCTGTCGTGGCAATTGGCATTCCATGGGATCTGGATTGTTGCAGTGGGTTCGAAGCCATTATCATAGTTAGGTTCAAATAAACCTTGGCCCGTGTTTCCGAAAAAAAGAGAGAGGACATGGATCCTCGCGGTGAAGTTGA
ACCCTGCCATACGGTTCTCGGCCTGAGTGCCATTTATAGTAAAGATGTAGATATTCTTGAAGTTGGAACCGTAGCAGGCTTTGATTTTAAGCTGGCTAAGCTCAGGGTTCAAATGCAACCCACCTTCTCACCCTGGCGTTGGAGTCCACATCGTCTGCTTGCAAATTTTTGATGGTCATGCTTTCCCCGCTCATGATTTC
ACGATTTTGCTCACTGGTCCAACGTGTCCTAGGATCCGTGACCCCTCTCCATAAGCAGAGGGTTGAATGGTAAAAGCTCATTAGTTTGCCTCTGTATGCCTGGAAGAAAAGTCAGGTCCTATCTGTATAAGTGTAATCTCATTGGTCAATTGGACTTTCTCGTTCTCCTTTATGTAGGAAGGGAGATCTTGTATGACCTA
AGTTGTTTGATATAACATTCATTCTTTAAGTAACATGGCCTTCACTCTTCTGTCAATGAAGGGACAAAGAGCTTCTCTTTTATGGCATTGTGCACTTGGGTCAGAACTGCTTATAATGATTGTTATTTTTTATCTGTTTTACATTCTGTTCTGTTTGTGTTTTTCAGGAACCAATATTCTGACAGATGAGGAAGTTGGCA
TTAAACTTATGTTTTACTTCTTCCGTGTTTGTGCATACCCAATTTGATTTTTAATGTGATCAAGGTCATTCTATACTTAGATGCTTTAGATTGGGTGCTTGGTACGGTCTATTCTTTACTAGAAAAGTTATTGTAAACGTGAATTATAATTTATGGGTCAGTAAGCTGAATAGATCTCAAACTTCCAAAGCTCTTACCTT
TAGCCTTTTTGATTCAGTTTATTTGTATAAGTTCTTTGCGTCATTAACATGTTGGTGGCACTGTATCAAATTTATCTTCTTGTTCTTTACTTCAATTGTCTTGGATTTGTTTGAGACTCCAATCCAATAATTGCTTCAACAGATCTTGCAATAAGCATTTGCTGGCACAAAGTCTTTTAAAATTATCAAGATGCTGAAGG
AATTTAACAATTTAAAGTAATTTCCTGAAATACACCTGAAATTGATTGTCTGTTGCGAGACAAAGTGAAGCAGGATATACAAAATCATGTTGCCTGGACCAAGCTGTAGACTACTACTGCGTTCGTCTATATGCACATGAAACTTGAGAATACAATATTATATTAAGAAACCAAGAAAGCTTTGGCAATGTGCTTCATGG
CCAGATTAGGTAAAACTTATAAGTGAATTTCTTATGAGATAGAACCTTTTTGTAGACTTATATGTAAACTATAAAAGATATTTTTATGAGATAGAACCTTTTTGTAGACTTATATGCAAACCATAAAAGATAAGCAACATTGGAGTTCATTTAGGGTATGGCTTAAATAAATGTAACTGTCTAAAGTTTGTCAAGGAAGA
TTCATGAGCTCTTAATATGCACCTGTTGCTTCTGCAAATCATTCATGTACTTGCCCATTCGTATATTTCACACAAGAAATTCAAGACTGCTATTTTTAATATTCTTATGAGTTTTTGTTGAGTATCTTTTTCTTCTATAACTGTGTGTTTGTAATGTAATGTACAAACAACTTAATATCTAATCCAATGCCTCTTCCTTT
TATAGAATGCACCTTTTTTTGTTATTGTAGTTATCTAATGATCTTTTTTTTAATTAAACAGGAAAGTGTGAAAACTAAACATCCTCAGCTGTTGTATGAGTCTAAAGTTTACAGAATACTTCAAGGAGGTGGAGCAGAAGGTGGTATCCCAAATGTAAGATGGTTTGGCGTTGAAGGTGATTACAATGCTACGGTCCTTG
ATCTTCTTGGGCCAAGTCTTGAAGACTTATTTAATTACTGTAATAGAAAGCTCTCATTGAAGACTGCATTGATGCTTGCTGATCAGCTAATTCGAAGAATTGAGTATGTACACAGCAAGAGCTTCCTTCATCGAGATATAAAACCTGATAATTTTCTCATGGGTCTTGGCCGGAAGGCAAATCAGGTTTACATGATAGAT
TTTGGGCTTGCCAAAAAGTATCGTGAGCCTACAACTCATAAGCATATCCCTTACAGGGAAAACAAAAACCTCACAGGTACTGCACGCTATGCTAGTATCAATACTCATCTCGGAATAGAGCAAAGTAGGAGAGATGATCTAGAGTCCTTGGGATACATGCTTATGTACTTCTTAAGGGGAAGCCTTCCATGGCAGGGATT
GAAAGCTGGGACCAAAAAGCAGAAGTATGAGAAAATAAG
>TRINITY_DN101209_c0_g1_i15 from sample A4 / Example unspliced isoform:TCATTTGGTGAAATATACCTTGGTATGTTTTACTTCTTCCGTGTTTGTGCATACCCAATTTGATTTTTAATGTGATCAAGGTCATTCTATACTTCGATGCTTTAGATTGGGTGCTTTCAGACTTTTGATTTCATTACCATTTTATGTATGTTTGGATGCATTTTTTTATTATCAACGGGAATATCTGCACCAGTCGGATG
AGAATATGTAGTTTTTCTATTTTTGAAAACTGTGTATATTGGTGGTTTTCCACAAACTTTTCTGTCGTGGCAATTGGCATTCCATGGGATCTGGATTGTTGCAGTGGGTTCGAAGCCATTATCATAGTTAGGTTCAAATAAACCTTGGCCCGTGTTTCCGAAAAAAAGAGAGAGGACATGGATCCTCGCGGTGAAGTTGA
ACCCTGCCATACGGTTCTCGGCCTGAGTGCCATTTATAGTAAAGATGTAGATATTCTTGAAGTTGGAACCGTAGCAGGCTTTGATTTTAAGCTGGCTAAGCTCAGGGTTCAAATGCAACCCACCTTCTCACCCTGGCGTTGGAGGTCCACATCGGCTGCTTGCAAAATTTTGATGGTCATGTTTTCCCCGCTCACGTTTT
CACGATTTTGCTCAGTGGTCCAACGTGACCTAGGATGCGTGACCCCTCTCCATAAGCAGAGGGTTGAATGGTAAAAGCTCATTAGTTTGCCTCTGTATGCCTGGAAGAAAAGTCAGGTCCTATCTGTATAAGTGTAATCTCATTGGTCAATTGGACTTTCTCGTTCTCCTTTATGTAGGAAGGGAGATCTTGTATGACCT
AAGTTGTTTGATATAACATTCATTCTTTAAGTAACATGGCCTTCACTCTTCTGTCAATGAAGGGACAAAGAGCTTCTCTTTTATGGCATTGTGCACTTGGGTCAGAACTGCTTATAATGATTGTTATTTTTTATCTGTTTTACATTCTGTTCTGTTTGTGTTTTTCAGGAACCAATATTCTGACAGATGAGGAAGTTGGC
ATTAAACTTATGTTTTACTTCTTCCGTGTTTGTGCATACCCAATTTGATTTTTAATGTGATCAAGGTCATTCTATACTTAGATGCTTTAGATTGGGTGCTTGGTACGGTCTATTCTTTACTAGAAAAGTTATTGTAAACGTGAATTATAATTTATGGGTCAGTAAGCTGAATAGATCTCAAACTTCCAAAGCTCTTACCT
TTAGCCTTTTTGATTCAGTTTATTTGTATAAGTTCTTTGCGTCATTAACATGTTGGTGGCACTGTATCAAATTTATCTTCTTGTTCTTTACTTCAATTGTCTTGGATTTGTTTGAGACTCCAATCCAATAATTGCTTCAACAGATCTTGCAATAAGCATTTGCTGGCACAAAGTCTTTTAAAATTATCAAGATGCTGAAG
GAATTTAACAATTTAAAGTAATTTCCTGAAATACACCTGAAATTGATTGTCTGTTGCGAGACAAAGTGAAGCAGGATATACAAAATCATGTTGCCTGGACCAAGCTGTAGACTACTACTGCGTTCGTCTATATGCACATGAAACTTGAGAATACAATATTATATTAAGAAACCAAGAAAGCTTTGGCAATGTGCTTCATG
GCCAGATTAGGTAAAACTTATAAGTGAATTTCTTATGAGATAGAACCTTTTTGTAGACTTATATGTAAACTATAAAAGATATTTTTATGAGATAGAACCTTTTTGTAGACTTATATGCAAACCATAAAAGATAAGCAACATTGGAGTTCATTTAGGGTATGGCTTAAATAAATGTAACTGTCTAAAGTTTGTCAAGGAAG
ATTCATGAGCTCTTAATATGCACCTGTTGCTTCTGCAAATCATTCATGTACTTGCCCATTCGTATATTTCACACAAGAAATTCAAGACTGCTATTTTTAATATTCTTATGAGTTTTTGTTGAGTATCTTTTTCTTCTATAACTGTGTGTTTGTAATGTAATGTACAAACAACTTAATATCTAATCCAATGCCTCTTCCTT
TTATAGAATGCACCTTTTTTTGTTATTGTAGTTATCTAATGATCTTTTTTTTAATTAAACAGGAAAGTGTGAAAACTAAACATCCTCAGCTGTTGTATGAGTCTAAAGTTTACAGAATACTTCAAGGAGGTGGAGCAGAAGGTGGTATCCCAAATGTAAGATGGTTTGGCGTTGAAGGTGATTACAATGCTACGGTCCTT
GATCTTCTTGGGCCAAGTCTTGAAGACTTATTTAATTACTGTAATAGAAAGCTCTCATTGAAGACTGCATTGATGCTTGCTGATCAGCTAATTCGAAGAATTGAGTATGTACACAGCAAGAGCTTCCTTCATCGAGATATAAAACCTGATAATTTTCTCATGGGTCTTGGCCGGAAGGCAAATCAGGTTTACATGATAGA
TTTTGGGCTTGCCAAAAAGTATCGTGAGCCTACAACTCATAAGCATATCCCTTACAGGGAAAACAAAAACCTCACAGGTACTGCACGCTATGCTAGTATCAATACTCATCTCGGAATAGAGCAAAGTAGGAGAGATGATCTAGAGTCCTTGGGATACATGCTTATGTACTTCTTAAGGGGAAGgtcagttgcccattgat
tttttttttttgaattttctggtttgtctgctatgaactttctggtttgtctagtactatatatgctgtagttttttttggttgtatcagCCTTCCATGGCAGGGA
Intron 4 GTATGTTTTA ... TGTTTTTCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 0 | 112 | 2 | 0 |
| A2 | 0 | 118 | 0 | 0 |
| A3 | 0.83 | 119 | 0 | 1 |
| A4 | 7.27 | 102 | 0 | 8 |
| A5 | 0 | 48 | 0 | 0 |
| A6 | 0 | 67 | 0 | 0 |
| A7 | 0 | 216 | 0 | 0 |
| A8 | 0 | 98 | 0 | 0 |
| A9 | 0 | 159 | 0 | 0 |
| A10 | 0 | 187 | 0 | 0 |
>TRINITY_DN101209_c0_g1_i11 from sample A4 / Example spliced isoformTTCACTTTAAAAAAAATACACGTTTACAGAAACACGAGTATAACATGGAGATTCGTATTTCTAGAAAACAAAAGATTACATCGGGAACCATCCAGTGGGAACTTACACCGTGGGCCGAGAGAAGGCAAGATGGACATGTACCCGGGTAGATAGGTGACCACTTGCCATTGAAGAGAGGGCTTACGGGTGAGCTGAGCTAT
TCAGTAGGTGGTGGTTTATGGTCCCACATCAAGGGTGGAAGGCAATATAAGCTTCAAATCGATACTACAAAGGATGTGGTGTAGAGGGTTTGAACCCATTATCATAGTTAGGTTCAGATAATCTTTGGTCTGTTTCTCCGAAAAAAGAAAAAGGACATGGACGACTGAAGAAGCCCAAGCCCTTTTGAGGCTACTGAAAT
GAAGCCCAGATGACTGAAAACTCACAATAATTAGGACAGGAATGATAAGATTGAAGGGTTCGATGATTGAAATCTAATACTGCAAAATGCTTGATTGATGTCGAGTGGGAATTTCAGGTGTGTTTTGTGCGAGGCATTTTGGAATAAGAATCATCCAATAACAGCTAAAAGCTGAGGTGGGCATCTTTGAAAATTGTCCC
AATGAGCCTACGAACGTGTTTACACTAGTGGGTTGCTGATATTGGTAAGTGGGTATACGATTTTCTTTGTGTTTGAGCTCAATATAGGCACTATACTCGATCAGTATCTGGGCAATGTATGAGTTCTGAGCTTATGGATCATGCCTGCCCGCTTTGAAAGGATCAAGCGGAGAAAAGATAAAACGAGGACATTTTAATTA
GGGTCAGATCGGATTGGAATTAGAGGATTTGGGTATACAGTCCGAGATAACAGAAACATCAGGAGATTATCACAGTATCTCTCGAGCCAGACATGGAGCCAAAGGTAGGGGAGAAATACAGACTGGGGAGAAAAATTGGCAGCGGTTCATTTGGTGAAATATACCTTGGAACCAATATTCTGACAGATGAGGAAGTTGGC
ATTAAACTGGAAAGTGTGAAAACTAAACATCCTCAGCTGTTGTATGAGTCTAAAGTTTACAGAATACTTCAAGGAGGTGGAGCAGAAGGTGGTATCCCAAATGTAAGATGGTTTGGCGTTGAAGGTGATTACAATGCTACGGTCCTTGATCTTCTTGGGCCAAGTCTTGAAGACTTATTTAATTACTGTAATAGAAAGCT
CTCATTGAAGACTGCATTGATGCTTGCTGATCAGCTAATTCGAAGAATTGAGTATGTACACAGCAAGAGCTTCCTTCATCGAGATATAAAACCTGATAATTTTCTCATGGGTCTTGGCCGGAAGGCAAATCAGGTTAATTTGCTATAAATTTTTTGATAAAATGCTCTTATTCTTTCTATATCCTAACGTAAGTTAAAGA
AAAATGACAAATTACATAAATTATTATTGAAAATATGACAAATTCCTTTTTCTTTCCAAGAAAAAAACTGTAACTTGTATTTCAAAAAGAAAAAGTTACGCTCAGTACATATCATTTAGCCAAAAACCATATATTCAAAAATGGATAACCTATATTATCCCCTTGAAAGAAACTAGCTGTGCCTGTCTGTAGTATGTACT
GACCCATATTTGCCTTTATATTATAAAAATTGGGACTATGCCATTTACAAAAAAGCTAGAAGCCTAAACCATCATGACTTGAGAAAACAACAGTAAAAAGACACTAGAATAACTGTCCAGGAAGGAAAAGAGCTACAAGGATCCTCATCATCAAACAAAACTGGCATACAGGGCCCCTCCAGCTAAACAGAACTAGCACA
TCAGCAGTGAAGAATCAAAGATACTCAGGTGTGTTACCTGGGTCTGTGCTTCTCCACTACTTTACATCCAATGATTCCAATCTGACCTGCGACAGGCAATTTTGAGAGTGCATCTGCCTCTGTGTTGAAAGATCTTTTTACATGCTTGAAATAAATTTCAGTGAAGGATCTAACAACAGTTTTAACCTGCTCCAGCAGAG
GTCTAAGAACACCTACAGCCTGCAATGCCCTTTTATGTGGCAAGTTGTAACAGATGTAATAATGCACGCAGTTCAACTCAATTAGTAGTACCTCTGCCCAGAGGTGCATTGAAAGTGACACAGTGATTCCCAGAAATGAATTAGACCCCCCCCCCACTCCCCGCTTCCCAGCACCACAAGAACTAGGATTCCTCTGACTT
GCTCCATCAAAGTATCCCCAAGAGTAAGATTTATCAATAACTAGGGGATCGGGCCTTAGGTCCTTCGGTTTTGGAGGTTGTTGGCTATCATTATAAATATATTTATATATGTTATACTGTAGAAAACCTCAAGTGGTGAGCACTTACCTTAGAATGGAATCTCATTCCTTATGATACACAAGGCTCAGGAGACTATGACT
GGTATTTCTATATGGAGTACCAAAGCTGGATTCTCCATCCACCTTCTGAAGTGATCAGTTGAGGTGTTTCCAGAATCCCATCCCAACTTCGTGCACCCCCTTCCAAACTTATAGCTTCTTTTTAAACTTCTTTTGCAAAGGGACATTCCATGAGAATTTGCTTTATATATTCACAATCATTTTTACGCAAAACACACATG
CTAGGACCCTGCTATGCGCTCATCTGAAATACCTCCCAGGTAAGTACTTGATTATTTATTGCCAGTAAAAGAGTGACAAATTACTAAACTGTGAATACTTCAAATTAAACAAATCTTGTAACCAACACATCAGAAATTGGTCAAGTTTCAGGGCTTTTTAGATACTTTATAGATGGGTTAAATATGCGAGGCAAATTAAC
TGTACAGATAATGTTGACTGTGTTGGTGTGTTAATTCAACTAATCTGAGTAGTTGAAGTACATGCATAATGTTTTTGGTAGGCAGACTTTCAGCATGAACTAAATGTTTTAGAAAATGAAAAACCATCCAAATGAGAAAAGGTAGCATATTGTGTTTCAAGGATGATATTTGTTTTTATCCTTAATCGGAATTTTAGTAG
GATGCCATAGTGGCTCAAAAAGTTAATATTTGAAGGTTTTAAAACTGTAAAATATTTATATTGGAAGGCTTAAGTAGTTTGCCATATGCTTCATTAGTTAGACATATTTGAAAGTCTCAAAACTCTAAAATTTTTCACATTGGAATGTCATAACGGATATCAAGGTGCTTTTCATAGCCATTTTATTAAAGATATTTGGG
CTTCACTGTATTGAAAAAGTGCGTTTTACAGGTATTGTTAAAGGTTTTAAAATCATAAAATATGGCTGTGAGGTTATAATATGATTTGGGTGCTTTTCATAGACATTCTATCAAGATAAGCTGGTTCATTGGATTGAGAAAGTCCAACTGACAAGTATTAATTTAATCTTTAACTGCACTCTTCTTTGCAACCATTTAAG
GGGTTTGTTCAGGACTCTGCATAGACAGTATCTAGAGAACCAAAGCCGGTCAAAAGTTTATCCCTTTTAAAATACAATATTCTATAATAGATATGCTATGGCTTTACTAATTTCTGTTCTCTCATTAATAAGGAACATACTCCACAACTTTGCTGGAGAGCAAATGTTGGCTACAAATACTTGTGTGTGAAATACACACA
TACACATGGCTGTTCATTCTTGATGAGGATATGGTTGAGTTCTATTGTTCTATGTTTTGGGTCACCTTGATATCCTTTTTTTTCCAGGTTATATGTCCTGGGAAAAACCTCCCGGGCACTTCTCCTCATTCTGAGGATGGTACCATAGTAAGCTCTAGATTCTTCAGGGCAAAAGGCCAGGTCAACAACTCATGACTAGA
TCGTATATAGCTCATCAACAATCAGATCACTAATAGCAAACATGTCACAAAGTGGGATTTGAACCTGG
>TRINITY_DN101209_c0_g1_i14 from sample A4 / Example unspliced isoform:TCATTTGGTGAAATATACCTTGgtatgttttacttcttccgtgtttgtgcatacccaatttgatttttaatgtgatcaaggtcattctatacttcgatgctttagattgggtgctttcagacttttgatttcattaccattttatgtatgtttggatgcatttttttattatcaacgggaatatctgcaccagtcggatg
agaatatgtagtttttctatttttgaaaactgtgtatattggtggttttccacaaacttttctgtcgtggcaattggcattccatgggatctggattgttgcagtgggttcgaagccattatcatagttaggttcaaataaaccttggcccgtgtttccgaaaaaaagagagaggacatggatcctcgcggtgaagttga
accctgccatacggttctcggcctgagtgccatttatagtaaagatgtagatattcttgaagttggaaccgtagcaggctttgattttaagctggctaagctcagggttcaaatgcaacccaccttctcaccctggcgttggagtccacatcgtctgcttgcaaatttttgatggtcatgctttccccgctcatgatttc
acgattttgctcactggtccaacgtgtcctaggatccgtgacccctctccataagcagagggttgaatggtaaaagctcattagtttgcctctgtatgcctggaagaaaagtcaggtcctatctgtataagtgtaatctcattggtcaattggactttctcgttctcctttatgtaggaagggagatcttgtatgaccta
agttgtttgatataacattcattctttaagtaacatggccttcactcttctgtcaatgaagggacaaagagcttctcttttatggcattgtgcacttgggtcagaactgcttataatgattgttattttttatctgttttacattctgttctgtttgtgtttttcagGAACCAATATTCTGACAGATGAGGAAGTTGGCA
TTAAACTTATGTTTTACTTCTTCCGTGTTTGTGCATACCCAATTTGATTTTTAATGTGATCAAGGTCATTCTATACTTAGATGCTTTAGATTGGGTGCTTGGTACGGTCTATTCTTTACTAGAAAAGTTATTGTAAACGTGAATTATAATTTATGGGTCAGTAAGCTGAATAGATCTCAAACTTCCAAAGCTCTTACCTT
TAGCCTTTTTGATTCAGTTTATTTGTATAAGTTCTTTGCGTCATTAACATGTTGGTGGCACTGTATCAAATTTATCTTCTTGTTCTTTACTTCAATTGTCTTGGATTTGTTTGAGACTCCAATCCAATAATTGCTTCAACAGATCTTGCAATAAGCATTTGCTGGCACAAAGTCTTTTAAAATTATCAAGATGCTGAAGG
AATTTAACAATTTAAAGTAATTTCCTGAAATACACCTGAAATTGATTGTCTGTTGCGAGACAAAGTGAAGCAGGATATACAAAATCATGTTGCCTGGACCAAGCTGTAGACTACTACTGCGTTCGTCTATATGCACATGAAACTTGAGAATACAATATTATATTAAGAAACCAAGAAAGCTTTGGCAATGTGCTTCATGG
CCAGATTAGGTAAAACTTATAAGTGAATTTCTTATGAGATAGAACCTTTTTGTAGACTTATATGTAAACTATAAAAGATATTTTTATGAGATAGAACCTTTTTGTAGACTTATATGCAAACCATAAAAGATAAGCAACATTGGAGTTCATTTAGGGTATGGCTTAAATAAATGTAACTGTCTAAAGTTTGTCAAGGAAGA
TTCATGAGCTCTTAATATGCACCTGTTGCTTCTGCAAATCATTCATGTACTTGCCCATTCGTATATTTCACACAAGAAATTCAAGACTGCTATTTTTAATATTCTTATGAGTTTTTGTTGAGTATCTTTTTCTTCTATAACTGTGTGTTTGTAATGTAATGTACAAACAACTTAATATCTAATCCAATGCCTCTTCCTTT
TATAGAATGCACCTTTTTTTGTTATTGTAGTTATCTAATGATCTTTTTTTTAATTAAACAGGAAAGTGTGAAAACTAAACATCCTCAGCTGTTGTATGAGTCTAAAGTTTACAGAATACTTCAAGGAGGTGGAGCAGAAGGTGGTATCCCAAATGTAAGATGGTTTGGCGTTGAAGGTGATTACAATGCTACGGTCCTTG
ATCTTCTTGGGCCAAGTCTTGAAGACTTATTTAATTACTGTAATAGAAAGCTCTCATTGAAGACTGCATTGATGCTTGCTGATCAGCTAATTCGAAGAATTGAGTATGTACACAGCAAGAGCTTCCTTCATCGAGATATAAAACCTGATAATTTTCTCATGGGTCTTGGCCGGAAGGCAAATCAGGTTTACATGATAGAT
TTTGGGCTTGCCAAAAAGTATCGTGAGCCTACAACTCATAAGCATATCCCTTACAGGGAAAACAAAAACCTCACAGGTACTGCACGCTATGCTAGTATCAATACTCATCTCGGAATAGAGCAAAGTAGGAGAGATGATCTAGAGTCCTTGGGATACATGCTTATGTACTTCTTAAGGGGAAGCCTTCCATGGCAGGGATT
GAAAGCTGGGACCAAAAAGCAGAAGTATGAGAAAATAAG
Intron 5 GTATGTTTTA ... TGTTTTTCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 0 | 112 | 2 | 0 |
| A2 | 0 | 118 | 0 | 0 |
| A3 | 0.83 | 119 | 0 | 1 |
| A4 | 7.27 | 102 | 0 | 8 |
| A5 | 0 | 48 | 0 | 0 |
| A6 | 0 | 67 | 0 | 0 |
| A7 | 0 | 216 | 0 | 0 |
| A8 | 0 | 98 | 0 | 0 |
| A9 | 0 | 159 | 0 | 0 |
| A10 | 0 | 187 | 0 | 0 |
>TRINITY_DN101209_c0_g1_i11 from sample A4 / Example spliced isoformTTCACTTTAAAAAAAATACACGTTTACAGAAACACGAGTATAACATGGAGATTCGTATTTCTAGAAAACAAAAGATTACATCGGGAACCATCCAGTGGGAACTTACACCGTGGGCCGAGAGAAGGCAAGATGGACATGTACCCGGGTAGATAGGTGACCACTTGCCATTGAAGAGAGGGCTTACGGGTGAGCTGAGCTAT
TCAGTAGGTGGTGGTTTATGGTCCCACATCAAGGGTGGAAGGCAATATAAGCTTCAAATCGATACTACAAAGGATGTGGTGTAGAGGGTTTGAACCCATTATCATAGTTAGGTTCAGATAATCTTTGGTCTGTTTCTCCGAAAAAAGAAAAAGGACATGGACGACTGAAGAAGCCCAAGCCCTTTTGAGGCTACTGAAAT
GAAGCCCAGATGACTGAAAACTCACAATAATTAGGACAGGAATGATAAGATTGAAGGGTTCGATGATTGAAATCTAATACTGCAAAATGCTTGATTGATGTCGAGTGGGAATTTCAGGTGTGTTTTGTGCGAGGCATTTTGGAATAAGAATCATCCAATAACAGCTAAAAGCTGAGGTGGGCATCTTTGAAAATTGTCCC
AATGAGCCTACGAACGTGTTTACACTAGTGGGTTGCTGATATTGGTAAGTGGGTATACGATTTTCTTTGTGTTTGAGCTCAATATAGGCACTATACTCGATCAGTATCTGGGCAATGTATGAGTTCTGAGCTTATGGATCATGCCTGCCCGCTTTGAAAGGATCAAGCGGAGAAAAGATAAAACGAGGACATTTTAATTA
GGGTCAGATCGGATTGGAATTAGAGGATTTGGGTATACAGTCCGAGATAACAGAAACATCAGGAGATTATCACAGTATCTCTCGAGCCAGACATGGAGCCAAAGGTAGGGGAGAAATACAGACTGGGGAGAAAAATTGGCAGCGGTTCATTTGGTGAAATATACCTTGGAACCAATATTCTGACAGATGAGGAAGTTGGC
ATTAAACTGGAAAGTGTGAAAACTAAACATCCTCAGCTGTTGTATGAGTCTAAAGTTTACAGAATACTTCAAGGAGGTGGAGCAGAAGGTGGTATCCCAAATGTAAGATGGTTTGGCGTTGAAGGTGATTACAATGCTACGGTCCTTGATCTTCTTGGGCCAAGTCTTGAAGACTTATTTAATTACTGTAATAGAAAGCT
CTCATTGAAGACTGCATTGATGCTTGCTGATCAGCTAATTCGAAGAATTGAGTATGTACACAGCAAGAGCTTCCTTCATCGAGATATAAAACCTGATAATTTTCTCATGGGTCTTGGCCGGAAGGCAAATCAGGTTAATTTGCTATAAATTTTTTGATAAAATGCTCTTATTCTTTCTATATCCTAACGTAAGTTAAAGA
AAAATGACAAATTACATAAATTATTATTGAAAATATGACAAATTCCTTTTTCTTTCCAAGAAAAAAACTGTAACTTGTATTTCAAAAAGAAAAAGTTACGCTCAGTACATATCATTTAGCCAAAAACCATATATTCAAAAATGGATAACCTATATTATCCCCTTGAAAGAAACTAGCTGTGCCTGTCTGTAGTATGTACT
GACCCATATTTGCCTTTATATTATAAAAATTGGGACTATGCCATTTACAAAAAAGCTAGAAGCCTAAACCATCATGACTTGAGAAAACAACAGTAAAAAGACACTAGAATAACTGTCCAGGAAGGAAAAGAGCTACAAGGATCCTCATCATCAAACAAAACTGGCATACAGGGCCCCTCCAGCTAAACAGAACTAGCACA
TCAGCAGTGAAGAATCAAAGATACTCAGGTGTGTTACCTGGGTCTGTGCTTCTCCACTACTTTACATCCAATGATTCCAATCTGACCTGCGACAGGCAATTTTGAGAGTGCATCTGCCTCTGTGTTGAAAGATCTTTTTACATGCTTGAAATAAATTTCAGTGAAGGATCTAACAACAGTTTTAACCTGCTCCAGCAGAG
GTCTAAGAACACCTACAGCCTGCAATGCCCTTTTATGTGGCAAGTTGTAACAGATGTAATAATGCACGCAGTTCAACTCAATTAGTAGTACCTCTGCCCAGAGGTGCATTGAAAGTGACACAGTGATTCCCAGAAATGAATTAGACCCCCCCCCCACTCCCCGCTTCCCAGCACCACAAGAACTAGGATTCCTCTGACTT
GCTCCATCAAAGTATCCCCAAGAGTAAGATTTATCAATAACTAGGGGATCGGGCCTTAGGTCCTTCGGTTTTGGAGGTTGTTGGCTATCATTATAAATATATTTATATATGTTATACTGTAGAAAACCTCAAGTGGTGAGCACTTACCTTAGAATGGAATCTCATTCCTTATGATACACAAGGCTCAGGAGACTATGACT
GGTATTTCTATATGGAGTACCAAAGCTGGATTCTCCATCCACCTTCTGAAGTGATCAGTTGAGGTGTTTCCAGAATCCCATCCCAACTTCGTGCACCCCCTTCCAAACTTATAGCTTCTTTTTAAACTTCTTTTGCAAAGGGACATTCCATGAGAATTTGCTTTATATATTCACAATCATTTTTACGCAAAACACACATG
CTAGGACCCTGCTATGCGCTCATCTGAAATACCTCCCAGGTAAGTACTTGATTATTTATTGCCAGTAAAAGAGTGACAAATTACTAAACTGTGAATACTTCAAATTAAACAAATCTTGTAACCAACACATCAGAAATTGGTCAAGTTTCAGGGCTTTTTAGATACTTTATAGATGGGTTAAATATGCGAGGCAAATTAAC
TGTACAGATAATGTTGACTGTGTTGGTGTGTTAATTCAACTAATCTGAGTAGTTGAAGTACATGCATAATGTTTTTGGTAGGCAGACTTTCAGCATGAACTAAATGTTTTAGAAAATGAAAAACCATCCAAATGAGAAAAGGTAGCATATTGTGTTTCAAGGATGATATTTGTTTTTATCCTTAATCGGAATTTTAGTAG
GATGCCATAGTGGCTCAAAAAGTTAATATTTGAAGGTTTTAAAACTGTAAAATATTTATATTGGAAGGCTTAAGTAGTTTGCCATATGCTTCATTAGTTAGACATATTTGAAAGTCTCAAAACTCTAAAATTTTTCACATTGGAATGTCATAACGGATATCAAGGTGCTTTTCATAGCCATTTTATTAAAGATATTTGGG
CTTCACTGTATTGAAAAAGTGCGTTTTACAGGTATTGTTAAAGGTTTTAAAATCATAAAATATGGCTGTGAGGTTATAATATGATTTGGGTGCTTTTCATAGACATTCTATCAAGATAAGCTGGTTCATTGGATTGAGAAAGTCCAACTGACAAGTATTAATTTAATCTTTAACTGCACTCTTCTTTGCAACCATTTAAG
GGGTTTGTTCAGGACTCTGCATAGACAGTATCTAGAGAACCAAAGCCGGTCAAAAGTTTATCCCTTTTAAAATACAATATTCTATAATAGATATGCTATGGCTTTACTAATTTCTGTTCTCTCATTAATAAGGAACATACTCCACAACTTTGCTGGAGAGCAAATGTTGGCTACAAATACTTGTGTGTGAAATACACACA
TACACATGGCTGTTCATTCTTGATGAGGATATGGTTGAGTTCTATTGTTCTATGTTTTGGGTCACCTTGATATCCTTTTTTTTCCAGGTTATATGTCCTGGGAAAAACCTCCCGGGCACTTCTCCTCATTCTGAGGATGGTACCATAGTAAGCTCTAGATTCTTCAGGGCAAAAGGCCAGGTCAACAACTCATGACTAGA
TCGTATATAGCTCATCAACAATCAGATCACTAATAGCAAACATGTCACAAAGTGGGATTTGAACCTGG
>TRINITY_DN101209_c0_g1_i15 from sample A4 / Example unspliced isoform:TCATTTGGTGAAATATACCTTGgtatgttttacttcttccgtgtttgtgcatacccaatttgatttttaatgtgatcaaggtcattctatacttcgatgctttagattgggtgctttcagacttttgatttcattaccattttatgtatgtttggatgcatttttttattatcaacgggaatatctgcaccagtcggatg
agaatatgtagtttttctatttttgaaaactgtgtatattggtggttttccacaaacttttctgtcgtggcaattggcattccatgggatctggattgttgcagtgggttcgaagccattatcatagttaggttcaaataaaccttggcccgtgtttccgaaaaaaagagagaggacatggatcctcgcggtgaagttga
accctgccatacggttctcggcctgagtgccatttatagtaaagatgtagatattcttgaagttggaaccgtagcaggctttgattttaagctggctaagctcagggttcaaatgcaacccaccttctcaccctggcgttggaggtccacatcggctgcttgcaaaattttgatggtcatgttttccccgctcacgtttt
cacgattttgctcagtggtccaacgtgacctaggatgcgtgacccctctccataagcagagggttgaatggtaaaagctcattagtttgcctctgtatgcctggaagaaaagtcaggtcctatctgtataagtgtaatctcattggtcaattggactttctcgttctcctttatgtaggaagggagatcttgtatgacct
aagttgtttgatataacattcattctttaagtaacatggccttcactcttctgtcaatgaagggacaaagagcttctcttttatggcattgtgcacttgggtcagaactgcttataatgattgttattttttatctgttttacattctgttctgtttgtgtttttcagGAACCAATATTCTGACAGATGAGGAAGTTGGC
ATTAAACTTATGTTTTACTTCTTCCGTGTTTGTGCATACCCAATTTGATTTTTAATGTGATCAAGGTCATTCTATACTTAGATGCTTTAGATTGGGTGCTTGGTACGGTCTATTCTTTACTAGAAAAGTTATTGTAAACGTGAATTATAATTTATGGGTCAGTAAGCTGAATAGATCTCAAACTTCCAAAGCTCTTACCT
TTAGCCTTTTTGATTCAGTTTATTTGTATAAGTTCTTTGCGTCATTAACATGTTGGTGGCACTGTATCAAATTTATCTTCTTGTTCTTTACTTCAATTGTCTTGGATTTGTTTGAGACTCCAATCCAATAATTGCTTCAACAGATCTTGCAATAAGCATTTGCTGGCACAAAGTCTTTTAAAATTATCAAGATGCTGAAG
GAATTTAACAATTTAAAGTAATTTCCTGAAATACACCTGAAATTGATTGTCTGTTGCGAGACAAAGTGAAGCAGGATATACAAAATCATGTTGCCTGGACCAAGCTGTAGACTACTACTGCGTTCGTCTATATGCACATGAAACTTGAGAATACAATATTATATTAAGAAACCAAGAAAGCTTTGGCAATGTGCTTCATG
GCCAGATTAGGTAAAACTTATAAGTGAATTTCTTATGAGATAGAACCTTTTTGTAGACTTATATGTAAACTATAAAAGATATTTTTATGAGATAGAACCTTTTTGTAGACTTATATGCAAACCATAAAAGATAAGCAACATTGGAGTTCATTTAGGGTATGGCTTAAATAAATGTAACTGTCTAAAGTTTGTCAAGGAAG
ATTCATGAGCTCTTAATATGCACCTGTTGCTTCTGCAAATCATTCATGTACTTGCCCATTCGTATATTTCACACAAGAAATTCAAGACTGCTATTTTTAATATTCTTATGAGTTTTTGTTGAGTATCTTTTTCTTCTATAACTGTGTGTTTGTAATGTAATGTACAAACAACTTAATATCTAATCCAATGCCTCTTCCTT
TTATAGAATGCACCTTTTTTTGTTATTGTAGTTATCTAATGATCTTTTTTTTAATTAAACAGGAAAGTGTGAAAACTAAACATCCTCAGCTGTTGTATGAGTCTAAAGTTTACAGAATACTTCAAGGAGGTGGAGCAGAAGGTGGTATCCCAAATGTAAGATGGTTTGGCGTTGAAGGTGATTACAATGCTACGGTCCTT
GATCTTCTTGGGCCAAGTCTTGAAGACTTATTTAATTACTGTAATAGAAAGCTCTCATTGAAGACTGCATTGATGCTTGCTGATCAGCTAATTCGAAGAATTGAGTATGTACACAGCAAGAGCTTCCTTCATCGAGATATAAAACCTGATAATTTTCTCATGGGTCTTGGCCGGAAGGCAAATCAGGTTTACATGATAGA
TTTTGGGCTTGCCAAAAAGTATCGTGAGCCTACAACTCATAAGCATATCCCTTACAGGGAAAACAAAAACCTCACAGGTACTGCACGCTATGCTAGTATCAATACTCATCTCGGAATAGAGCAAAGTAGGAGAGATGATCTAGAGTCCTTGGGATACATGCTTATGTACTTCTTAAGGGGAAGGTCAGTTGCCCATTGAT
TTTTTTTTTTTGAATTTTCTGGTTTGTCTGCTATGAACTTTCTGGTTTGTCTAGTACTATATATGCTGTAGTTTTTTTTGGTTGTATCAGCCTTCCATGGCAGGGA