NA ----> NA


Intron 1 GTATTTCTCG ... CACTTTACAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A135.031028129
A238.68655428
A333.33896821
A442.27566319
A538.67464216
A635.04546432157
A736.21399297156
A835.54390284146
A938.25356283158
A1036.126920599



>TRINITY_DN120702_c0_g1_i11 from sample A1 / Example spliced isoform
CTTCTCCTTTCTTTGCCCAGCACAATACCAATTTAGTCTACCAAGCAAAGGTGTCGAATTCTTCATTGCTTTACCCCTAAGCAAATTCCTAACAAAATAAAAAAATGATTTTTTTAAAGCGATTTGATGCTTTACCCCTCTGCAATGGCGGTCAAAGCCGCCTCTGATTGCATCCAAGTCAACAGCGTGTATCCGCGTCG
GGAACAATCCATAAATGACTTCGCTCGCTCTTTCAGAAACTTCCACGCAACAGATCGCTCGTTCATTCACCTGCTGTTAAGCACACCAGATCGCATTTCTGGAGCAACAAGCAGCAGAAGAGCTTACAATGGAGACGGAAGCACAAGCCCTCCAGGTTCACACAATGTCTCTCCAGATCATTCTTGCTGTTGTAGCCCTC
GGCCTCATGTGGGCCTTGCAGGGCCTCCCGCGGTCCTTGATCTCCAAGCTCCGGGGCCGCAGCCGCTCTCGGGGGCAGTCCCGCCGCCACTTCGTGCAGGGCGCGCAGTTGCTTGGTCGCTCAAGGGCTGCAACCGCGCAGAACAGAGGCCGCTCCCTCGCCCGCGAGGCCGCCGCCGAGGCTGATAAGGCCATCTCCCT
GGATCCCATGGACGCCGCCTCCCACATTTTAAAGGCCCTTGCGCTTGAGCGACAGGGTCAGGAGACAGCCGCCATTGGCTGCCTGGATGCCGCCCTCTCGCCGCCCGTGAGCAAGAGCCTCTCTGCGTCCGAGAAGTCCGACGCGCTTTTAAAGCGGGCGGAGCTCGAACTCGGAACCTCCAATTCCAAGCGCCGCGGCC
TTGAGGCCGCCGTGGACGACCTCAAGGTCGCTGTGGGGTTCAATGCGCGGAATTTTAAAGCTATCTGTTTGTTGGCGACGTGTTATGAGAAGAAGGGGATGCTCGTCGAGGCCCGCAAGGCGTTCCAGGATGCGCTAGAATTAAATCCGTCGTTGCAGGAGGCCAAATCGGGCCTTGATCGCCTCTCTTGATTAAGGGAT
ATGCCACTGTATAGAATAGTTCGTATATCACATAGACACCGACCATTTCATAGAGGGCCAACAAAGCATGACCACCAATACCACCAGCTGTGTTAGTACTGGAGTGAGAGGATGCTATGCAGTAAGAGAATAATTGTTGCCTTTTGTTTTGTATCCAATACCTGCAAACTGATTTGACAAGCTTATTTGGATTTGTTTTG
GGTTCAGCGTTTGGGCTTCAGTTATGGTCCGATCAGATTTTTTCTGAAGAGAATTGTTGCTGTTTGAATTATGTTAAATGCTACAAGCTGATTTGATAAGCTTCCGTTTTCAATTTGTAGCTGTCTTCGTTTCTAGAGTTCAGGACTGATCAGATTTGCATGAAGAGCGCTGTTGCTTTGTGAATAATATCAAATACCCA
TGAGCTGATAAGCGTTTGTTTTGCATTTTTATCGTTCATTTTCTTGGGTGTGGGTTTTATCCTTCAATTAGATGTTTGAATGAATAAAGAAAGCAAAAAGCTGAATTTTTTTTCATGGAGACATTTGTTGCCATGTGAATTATGTCAAATACTTACAAGCTGATTTGATAAGTTTGTGTTTCCAAGTTTTATTTGTTTTT
TGTTTCTCGGGTTGATGGTTTAGGCTTCAGTTATGGGGTTTGAATTTGATAAAACCTATCAGATCTTTGCAATGTGAATTATAGCAAATATTAAAGCTGATTTGACAGGCTGCCATTTTCAATTTGTATCTGTTTTCGTTTCTTGCGTTTAGGGTGGCAGCTTATAATTCATAGGGCGGTCTACATTTTTAGGATGGCCG
TTTTGAATGGGGTGTACGTTCCTGCCTTTGCATCTTGCTCAGACTGCTTATCTTTTAAGATGGCTAGGGGAATACACGGGATCTTACCATTTCTGGGCAGCTGGGTTTCATCTCATGGCTATGTTAACGCAAGCTGATTTCATCAGTTGTATTCTATTTTAAAATGCTAAATTTATGGGTTTCCAAATGGTTACTACATT
GTGGAATTCAGCAAATCATACAAGCTGATTTGATCATTTACCCGTTCGTTTTTGCTGGAAAAATAAAATTATATTTTCGCTGGAAAAATAAAATTATATAAATAGAGAAGAAAGGATTGCTAAACTTTCAAACAGAGGTTTCATGAATTTTGGGAAGGTAACCTAAAAGAACACGTGGATACCAGAACACCTTTAGTTCC
AACATAGACTGCCTGTAGCTGCTAAAAGGACG


>TRINITY_DN120702_c0_g1_i2 from sample A1 / Example unspliced isoform:
CTTCTCCTTTCTTTGCCCAGCACAATACCAATTTAGTCTACCAAGCAAAGGTGTCGAATTCTTCATTGCTTTACCCCTAAGCAAATTCCTAACAAAATAAAAAAATGATTTTTTTAAAGCGATTTGATGCTTTACCCCTCTGCAATGGCGGTCAAAGCCGCCTCTGATTGCATCCAAGTCAACAGCGTGTATCCGCGTCG
GGAACAATCCATAAATGACTTCGCTCGCTCTTTCAGAAACTTCCACGCAACAGATCGCTCGTTCATTCACCTGCTGTTAAGCACACCAGATCGCATTTCTGGAGCAACAAGCAGCAGAAGAGCTTACAATGGAGACGGAAGCACAAGCCCTCCAGGTTCACACAATGTCTCTCCAGATCATTCTTGCTGTTGTAGCCCTC
GGCCTCATGTGGGCCTTGCAGGGCCTCCCGCGGTCCTTGATCTCCAAGCTCCGGGGCCGCAGCCGCTCTCGGGGGCAGTCCCGCCGCCACTTCGTGCAGGGCGCGCAGTTGCTTGGTCGCTCAAGGGCTGCAACCGCGCAGAACAGAGGCCGCTCCCTCGCCCGCGAGGCCGCCGCCGAGGCTGATAAGGCCATCTCCCT
GGATCCCATGGACGCCGCCTCCCACATTTTAAAGGCCCTTGCGCTTGAGCGACAGGGTCAGGAGACAGCCGCCATTGGCTGCCTGGATGCCGCCCTCTCGCCGCCCGTGAGCAAGAGCCTCTCTGCGTCCGAGAAGTCCGACGCGCTTTTAAAGCGGGCGGAGCTCGAACTCGGAACCTCCAATTCCAAGCGCCGCGGCC
TTGAGGCCGCCGTGGACGACCTCAAGGTCGCTGTGGGGTTCAATGCGCGGAATTTTAAAGCTATCTGTTTGTTGGCGACGTGTTATGAGAAGAAGGGGATGCTCGTCGAGGCCCGCAAGGCGTTCCAGGATGCGCTAGAATTAAATCCGTCGTTGCAGGAGGCCAAATCGGGCCTTGATCGCCTCTCTTGATTAAGgtat
ttctcgttttctcgtttctggttttttagggtttgattatggcgtttgaatttgaagaaataagatcagattttcatgcaaagaattatcgctccttgaaatgtatccaaattcacacaagttgatttgataatatactgttttcaatttgtatttgttttttgtttctcacggtttagggttcatttatggcgtttgga
taaatataaagagaaggaaaggctgataatattttcatgaagagtaatgctattaatgcataatgaaatcactttacagGGATATGCCACTGTATAGAATAGTTCGTATATCACATAGACACCGACCATTTCATAGAGGGCCAACAAAGCATGACCACCAATACCACCAGCTGTGTTAGTACTGGAGTGAGAGGATGCTA
TGCAGTAAGAGAATAATTGTTGCCTTTTGTTTTGTATCCAATACCTGCAAACTGATTTGACAAGCTTATTTGGATTTGTTTTGGGTTCAGCGTTTGGGCTTCAGTTATGGTCCGATCAGATTTTTTCTGAAGAGAATTGTTGCTGTTTGAATTATGTTAAATGCTACAAGCTGATTTGATAAGCTTCCGTTTTCAATTTG
TAGCTGTCTTCGTTTCTAGAGTTCAGGACTGATCAGATTTGCATGAAGAGCGCTGTTGCTTTGTGAATAATATCAAATACCCATGAGCTGATAAGCGTTTGTTTTGCATTTTTATCGTTCATTTTCTTGGGTGTGGGTTTTATCCTTCAATTAGATGTTTGAATGAATAAAGAAAGCAAAAAGCTGAATTTTTTTTCATG
GAGACATTTGTTGCCATGTGAATTATGTCAAATACTTACAAGCTGATTTGATAAGTTTGTGTTTCCAAGTTTTATTTGTTTTTTGTTTCTCGGGTTGATGGTTTAGGCTTCAGTTATGGGGTTTGAATTTGATAAAACCTATCAGATCTTTGCAATGTGAATTATAGCAAATATTAAAGCTGATTTGACAGGCTGCCATT
TTCAATTTGTATCTGTTTTCGTTTCTTGCGTTTAGGGTGGCAGCTTATAATTCATAGGGCGGTCTACATTTTTAGGATGGCCGTTTTGAATGGGGTGTACGTTCCTGCCTTTGCATCTTGCTCAGACTGCTTATCTTTTAAGATGGCTAGGGGAATACACGGGATCTTACCATTTCTGGGCAGCTGGGTTTCATCTCATG
GCTATGTTAACGCAAGCTGATTTCATCAGTTGTATTCTATTTTAAAATGCTAAATTTATGGGTTTCCAAATGGTTACTACATTGTGGAATTCAGCAAATCATACAAGCTGATTTGATCATTTACCCGTTCGTTTTTGCTGGAAAAATAAAATTATATTTTCGCTGGAAAAATAAAATTATATAAATAGAGAAGAAAGGAT
TGCTAAACTTTCAAACAGAGGTTTCATGAATTTTGGGAAGGTAACCTAAAAGAACACGTGGATACCAGAACACCTTTAGTTCCAACATAGACTGCCTGTAGCTGCTAAAAGGACG



Intron 2 GTGCGCTAAT ... ACAATTACAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A146.8911193103
A246.42866782
A344.91007588
A441.111015685
A543.13604843
A644.8741533670
A744.79509375451
A846.61539342599
A946.1484345483
A1044.19353257302



>TRINITY_DN44861_c0_g1_i5 from sample A8 / Example spliced isoform
TAGTCTACCAAGCAAAGGTGTCGAATTCTTCATTGCTTTACCCCTAAGCAAATTCCTAACAAAATAAAAAAATGATTTTTTTAAAGCGATTTGATGCTTTACCCCTCTGCAATGGCGGTCAAAGCCGCCTCTGATTGCATCCAAGTCAACAGCGTGTATCCGCGTCGGGAACAATCCATAAATGACTTCGCTCGCTCTTT
CAGAAACTTCCACGCAACAGATCGCTCGTTCATTCACCTGCTGTTAAGCACACCAGATCGCATTTCTGGAGCAACAAGCAGCAGAAGAGCTTACAATGGAGACGGAAGCACAAGCCCTCCAGGTTCACACAATGTCTCTCCAGATCATTCTTGCTGTTGTAGCCCTCGGCCTCATGTGGGCCTTGCAGGGCCTCCCGCGG
TCCTTGATCTCCAAGCTCCGGGGCCGCAGCCGCTCTCGGGGGCAGTCCCGCCGCCACTTCGTGCAGGGCGCGCAGTTGCTTGGTCGCTCAAGGGCTGCAACCGCGCAGAACAGAGGCCGCTCCCTCGCCCGCGAGGCCGCCGCCGAGGCTGATAAGGCCATCTCCCTGGATCCCATGGACGCCGCCTCCCACATTTTAAA
GGCCCTTGCGCTTGAGCGACAGGGTCAGGAGACAGCCGCCATTGGCTGCCTGGATGCCGCCCTCTCGCCGCCCGTGAGCAAGAGCCTCTCTGCGTCCGAGAAGTCCGACGCGCTTTTAAAGCGGGCGGAGCTCGAACTCGGAACCTCCAATTCCAAGCGCCGCGGCCTTGAGGCCGCCGTGGACGACCTCAAGGTCGCTG
TGGGGTTCAATGCGCGGAATTTTAAAGCTATCTGTTTGTTGGCGACGTGTTATGAGAAGAAGGGGATGCTCGTCGAGGCCCGCAAGGCGTTCCAGGATGCGCTAGAATTAAATCCGTCGTTGCAGGAGGCCAAATCGGGCCTTGATCGCCTCTCTTGATTAAGAGATCTGGCAGAACATTGTGAGCATTTGTGTAGATCA
TATGCATGTCTCCAAAAAGAGGATGACAGGTGTCTCCCAGTTGGGAGGACAAACGTCTTTTTGAAGATTACGGAGGAAAACGTTTGAAGCCTACTGTTTGTAAGCTCTTTGAGTCGCTGGACATAGCAAATATGGGATATAAATTACACTAATTCACAAAAATGTGTTGGGGGTTGCTGGACTCGTATTATGATGTATTT
GATTGTGTAAGATGCCTTGGACCAAGAATAACTTCATGCACATAGTATGGGAATTTTTGTTTTTAAAAATAGTTAAATTGGCAAAGTAGTAGGATACTGTTGGTAGGAAACAACACAAAGTGTTGCATAGTGACCCATTTATTTGCAAATGGCTATTGGCAAGTGAATTCTTCTAAATAAATATATTTTGCTGTAAATTC
TGAATATCAAAGACTACGATAGACAGTTATGAAATTTGGCACATGCCTTGCATGAAGTCAAGTTATGCTCGAGGCCTTGCTTCTATCATACTCTGGTAGAAAAAACACAGTTATGAAAGCATTGCAAGGCATGTTAGTGTTCCATAATGCAAAGTGTGTAAACAGTGGTTTCTACATGTTGGATTTGACTTGCGGCATCC
AATGGATATTAAAATGGGGAAGAGTTTACACTCTTGACCCACTTGGTTAGGTTTAGTTTTAGATTAAACTCTTGACCTACTTGGTTAGGTTTTGTTTTAGATTTTAGTATTTAATCGTGTTTATGGTTTTCGTTCTAGATTTGGATTTATACTATCTAATTGTGTTTATAGGTTTCATTTTAGGTTTGGGATTGCGTTAT
TTAATTGTGTTAACCGTCTTTGTTGATCTTGAACACGGAGGTGGATTTGAAACTCCTCTACGTTATCATTTTCCAAGGTTTATAACAAAAAAGTGCG


>TRINITY_DN44861_c0_g1_i8 from sample A8 / Example unspliced isoform:
TAGTCTACCAAGCAAAGGTGTCGAATTCTTCATTGCTTTACCCCTAAGCAAATTCCTAACAAAATAAAAAAATGATTTTTTTAAAGCGATTTGATGCTTTACCCCTCTGCAATGGCGGTCAAAGCCGCCTCTGATTGCATCCAAGTCAACAGCGTGTATCCGCGTCGGGAACAATCCATAAATGACTTCGCTCGCTCTTT
CAGAAACTTCCACGCAACAGATCGCTCGTTCATTCACCTGCTGTTAAGCACACCAGATCGCATTTCTGGAGCAACAAGCAGCAGAAGAGCTTACAATGGAGACGGAAGCACAAGCCCTCCAGGTTCACACAATGTCTCTCCAGATCATTCTTGCTGTTGTAGCCCTCGGCCTCATGTGGGCCTTGCAGGGCCTCCCGCGG
TCCTTGATCTCCAAGCTCCGGGGCCGCAGCCGCTCTCGGGGGCAGTCCCGCCGCCACTTCGTGCAGGGCGCGCAGTTGCTTGGTCGCTCAAGGGCTGCAACCGCGCAGAACAGAGGCCGCTCCCTCGCCCGCGAGGCCGCCGCCGAGGCTGATAAGGCCATCTCCCTGGATCCCATGGACGCCGCCTCCCACATTTTAAA
GGCCCTTGCGCTTGAGCGACAGGGTCAGGAGACAGCCGCCATTGGCTGCCTGGATGCCGCCCTCTCGCCGCCCGTGAGCAAGAGCCTCTCTGCGTCCGAGAAGTCCGACGCGCTTTTAAAGCGGGCGGAGCTCGAACTCGGAACCTCCAATTCCAAGCGCCGCGGCCTTGAGGCCGCCGTGGACGACCTCAAGGTCGCTG
TGGGGTTCAATGCGCGGAATTTTAAAGCTATCTGTTTGTTGGCGACGTGTTATGAGAAGAAGGGGATGCTCGTCGAGGCCCGCAAGGCGTTCCAGGATGCGCTAGAATTAAATCCGTCGTTGCAGGAGGCCAAATCGGGCCTTGATCGCCTCTCTTGATTAAGgtgcgctaatgaagtaaggatcactgtttgttaaact
tggggtaaattcaaagggtccatagatggattggtgaacttaaaagcaataattcggtactgtttataatggaagtcgatgtgtctaggattcggacagaaatcaaaacttttttcttttattgcaacaaaaggaagcatgtggatgcttgttaaaattgttgaaggttgtatgaaattactaaaatatataaatgatgt
acaattacagAGATCTGGCAGAACATTGTGAGCATTTGTGTAGATCATATGCATGTCTCCAAAAAGAGGATGACAGGTGTCTCCCAGTTGGGAGGACAAACGTCTTTTTGAAGATTACGGAGGAAAACGTTTGAAGCCTACTGTTTGTAAGCTCTTTGAGTCGCTGGACATAGCAAATATGGGATATAAATTACACTAAT
TCACAAAAATGTGTTGGGGGTTGCTGGACTCGTATTATGATGTATTTGATTGTGTAAGATGCCTTGGACCAAGAATAACTTCATGCACATAGTATGGGAATTTTTGTTTTTAAAAATAGTTAAATTGGCAAAGTAGTAGGATACTGTTGGTAGGAAACAACACAAAGTGTTGCATAGTGACCCATTTATATTGCAAATGG
CTATTGGCAAGTGAATTCTTCTAAATAAATATATTTTGCTGTAAATTCTGAATATCAAAGACTACGATAGACAGTTATGAAATTTGGCACATGCCTTGCATGAAGTCAAGTTATGCTCGAGGCCTTGCTTCTATCATACTCTGGTAGAAAAAACACAGTTATGAAAGCATTGCAAGGCATGTTAGTGTTCCATAATGCAA
AGTGTGTAAACAGTGGTTTCTACATGTTGGATTTGACTTGCGGCATCCAATGGATATTAAAATGGGGAAGAGTTTACACTCTTGACCCACTTGGTTAGGTTTAGTTTTAGATTAAACTCTTGACCTACTTGGTTAGGTTTTGTTTTAGATTTTAGTATTTAATCGTGTTTATGGTTTTCGTTCTAGATTTGGATTTATAC
TATCTAATTGTGTTTATAGGTTTCATTTTAGGTTTGGGATTGCGTTATTTAATTGTGTTAACCGTCTTTGTTGATCTTGAACACGGAGGTGGATTTGAAACTCCTCTACGTTATCATTTTCCAAGGTTTATAACAAAAAAGTGCG