NA ----> NA
Intron 1 GTATGAGGAT ... AAAGCAAAAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 16.67 | 10 | 2 | 2 |
| A2 | 31.58 | 13 | 2 | 6 |
| A3 | 62.5 | 3 | 0 | 5 |
| A4 | 50 | 5 | 1 | 5 |
| A5 | 25 | 3 | 0 | 1 |
| A6 | 41.03 | 23 | 2 | 16 |
| A7 | 36.36 | 28 | 3 | 16 |
| A8 | 16.44 | 61 | 2 | 12 |
| A9 | 30.95 | 29 | 4 | 13 |
| A10 | 17.86 | 23 | 0 | 5 |
>TRINITY_DN34943_c0_g1_i4 from sample A9 / Example spliced isoformTTTCAGTTTTAATTCTCGTTGCACTAAAGCACAATTTCAATTTCATTTTCACTTGTTAATGTTTGTGTTTTTATGCCTATAGTAGGAGTGTGATATGTTTTGTCATGTATACCGAATGTAAATTTTTTGCAAATTCCTGTTGATTTTGCAGGTCCTTAGCAATCCAGAATTGACACCTCTACATACTTTTATGTGCAACT
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GATGGTTTGGTTATCTTTAGTCTCTCATTCTGAAAAGTATTGCCGATCCTTTGACTATTATTTCTTTTCTTCACTGCCATCCCTAGTCTACATAATGTACCGT
>TRINITY_DN34943_c0_g1_i1 from sample A9 / Example unspliced isoform:ATTCAGATGCAGATGAAGGCAAGgtatgaggattgctatgctctttctttgagtaaacattttactcatgctatcaattttggtttcatgaaaattttgaaaaatccaattttgcttgtatttgttatggaatataatttaatatatatattttgtgtgtttttgaaagcaaaagCAAGTTGAACCAGTATGGTCTGTAT
AGTAGGGCCAAAAACAGTGGAAAGGTTGTGTTTAGCTAGTGTTCTTAAAATGTAAAGATAAAGAATCAAATTTACTCAATGCAAATGCTGATATATAAATCAATTTGAGGTAGATGCACTAGAAGGAAGGGTTCTTCCCTAATGAATGAAATTTATGCAATGCTATGCTGATATAGAATCAATTCAAGATGGATGCACTA
GAAGAAAGGGTTCTTCCCTGTGGGAATATGCAGTTGTTTCTATAGTTTCAATGGCATAAGAATTCCTCACTTGATTGATCATAATTGATGTAAAGGAGTTGTAGCATTTAGGGTTCCTGTGATTATATGTCGAAAACTATTCAGTCACAAGTGTATATAATTTGAGTTGCAGTTTAATTATTTCTCGAAAAATTCTGAGG
CATGATCTACATGTGGGATCCGTTTATATCATATCTCATATGTTATAGTTCGATTGTAGCTCAGACTATATGACGGAAGTTAATATATTTCATATTGAATTATATAGTTTTTAAAGGTTTTAACTTGTGTGACTACACATTATCTGGTTTGAAACAAAAAGAGGGGCTGGCATACAATTATTTTCCTATTTGTCAACTGC
AATTTGTTTGTGCCAGTAATGGCAAAAACACTTTGGACCAGTTTTAGTCTGTAAATAGTGGTAAAGGTTGATGCAGAAAGATATTTTAGTGCATAACTTATGTTCCTCCACTGAATGTTGGGTGTATCTTCTTTGCTATGGTTTTTTATTTGGTATGGATTAGTATTGTGTAATACACAGATGATCATTGTATAGAGTAA
AGTTGCAGATTTTAGCAGGAATGATGGTTTGGTTATCTTTAGTCTCTCATTCTGAAAAGTATTGCCGATCCTTTGACTATTATTTCTTTTCTTCACTGCCATCCCTAGTCTACATAATGTACCGT