sp|B6EUA9|PR40A_ARATH ----> Pre-mRNA-processing protein 40A
Intron 1 GTAACTTTCC ... TCTGTGACAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 37.93 | 9 | 8 | 3 |
| A2 | 57.58 | 7 | 12 | 7 |
| A3 | 54.84 | 7 | 11 | 6 |
| A4 | 48.84 | 11 | 9 | 12 |
| A5 | 46.67 | 12 | 13 | 8 |
| A6 | 62.79 | 16 | 21 | 33 |
| A7 | 66.67 | 14 | 26 | 30 |
| A8 | 58.97 | 16 | 25 | 21 |
| A9 | 60.71 | 11 | 20 | 14 |
| A10 | 55.56 | 12 | 11 | 19 |
>TRINITY_DN45324_c1_g2_i1 from sample A8 / Example spliced isoformGTTGTGTTACATTTGCAATGAGAAATGTTATATGTTGAAACTTGAAGGTTGATGTTGTGGTTGATGATTGATCATTTGATGACAATGTTATAAGTTATAGCTGCTAGATGATTGATATCATATGTGTACTAAATGGTTGATGATTTAATGATGATCGTTAATCCAATGGTTAGATCTATGTTTTCATGTTTTATGTAGCT
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>TRINITY_DN45324_c1_g2_i2 from sample A8 / Example unspliced isoform:GTTGTGTTACATTTGCAATGAGAAATGTTATATGTTGAAACTTGAAGGTTGATGTTGTGGTTGATGATTGATCATTTGATGACAATGTTATAAGTTATAGCTGCTAGATGATTGATATCATATGTGTACTAAATGGTTGATGATTTAATGATGATCGTTAATCCAATGGTTAGATCTATGTTTTCATGTTTTATGTAGCT
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TTTTTACCTCTTGGTATGTGCTACCCAGGTGTATATGCTCTATAGCTTGAGATACATTTTTACCGAGTCCATATTACAGTAAAAGCTTGTTCCATTTTCTCCCTTTAGGAAGCCTTTATTTCTGACTTTGCTATATTTTGTTTGGTTTGGAAAGTATCTATACATTACAGGACATCTCAGTAGATATATTGATATTGTTT
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AAGCTGAGTGCAAATGAATGTAGAGAATTTTTTATGCTTTGCATATTGGATTCAGTGAACTGCAATGGAGTGATTAGAAGCATAAAGAACCATCGAATTTATTCGTGTATCTGATAAGGGCTACTTTGAGCTTTTCATGTATCAGTAGTTTCAACTTTCAGTTGCCAAAAGGACATTGGATTTAAAAGTTAAGTTTATGT
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