sp|Q08069|RS8_MAIZE ----> Small ribosomal subunit protein eS8

Intron 1 GTAAACATTT ... ATACGTGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	49.21	512	4	496
A2	48.94	508	7	487
A3	48.45	665	8	625
A4	49.61	384	6	378
A5	49.34	307	6	299
A6	48.62	2616	3	2475
A7	48.59	3382	0	3196
A8	48.71	2223	2	2111
A9	48.56	3269	0	3086
A10	48.61	3409	2	3225

>TRINITY_DN109829_c0_g1_i7 from sample A3 / Example spliced isoform

GTTAGATTCATGTTTGGAAATGATGGAGAGAGTATTTGTTTTGCTGGTGAACAATGTATGAGCTGGGAAGACAGCCTTCGATGACGAAACTGTCAAGTAATAAGACAGTGAGAAGGGTGCGTGTCAGAGGAGGTAATGTTAAATGGAGGGCTCTGAGGCTCGATACTGGTAACTATTCTTGGGGTTCCGAGGCTGTGACC
CGAAAGACTCGTATTTTAGACGTGGTTTACAATGCATCTAATAATGAGCTCGTCAGAACCCAGACTTTGGTGAGGAGTGCCATTGTTCAGGTTGATGCTGCCCCTTTCCGTCAGTGGTACGAACAGCACTACGGGCTAGATATTGGCAGAAAGAAGAAGGCTGCTGCTGCTGCCAAGAAAGAGACTACTGAGATTTATGG
AGAAGTCCGAGTATAGCTTACAACACCAAGTTTGATACCGATAATAGGAGGGAGAAGCTACTGCTGAGGAAGAGAAGAAGAAAAGTAAAAATCTTGTGAAGAAGCTTGAGAAGCGACAAGAAGGTCACAAACTTGATGCACATCTGGAAGAGCAATTTGCTAGCGGTCGATTAATGGCTGCAATTGCTTCACGCCCTGGC
CAGTGTGGACGTGCTGATGGGTATATTCTTGAGGGTCGGGAGCTTGAGTTCTACTTGAAAAAGATCCAGAGAAAGAAGGGCAAGGGAGCTGCTGCAGCTTAAGCAAACAATTTTGGCTTCTTGAAGTTCTTAACGATGTTAATAAATCTTATGTCAGAAATTTAGCATTGGCCCCAAGTAACTTCAAAAGAGCTTTATAG
CTAGGACAGAGGATATTTTTTTGTGGTAACTGATGAAGGTTCTTTTTGCTTCTGTTAGTTCTTTTTTACTCCTTGGAGTATATTTATTAGAAATTTTTTAGATGACTATTTTTTGATTTCTATTCCATCTCAAAATGGAATGTTATGCGTAAGGACCATTTTGTGTTAAGCTTTCAGTATACCTGTGTAAGTTAAGTTAA
TGTTTTCTTATGTGATATGTTGGGAGTGCAACATGGCTTGCATACATAAACAAGTTTTATTAAAATTATACCAGTGCCAATCTACGTTTATGTTGACTGGTTTCACAAGTGGACCTTTCAGATTTATCCAGGAATCTATTGATATTAAAGGGCCCTATCTGCAATATGGAGTTTTGAATAAGATCAACCTGTTCTTTACA
TTTACTTGTGAATTTTTGTTGCAGAAACTCTAATTTAAGTTTACTCTACTAGAGGGCTCTATCTGCAATATGGAGTTTTGAATAAGATCAACCTGTTCGTGACATTTACTTGTGAATTTTGTTGCACAAACTCTAAAATTTAAGTTTTAGTTTTAAAAACTGACGTAAATTTGTAAATATTGGATCAGTTCAGTGCCTTA
TCTTTATTGATTTTTCTGCAAGTGAGCACTGTTTGTGTCAAATTGCTCCCAGATGGACTCTATTTCCTCCTCCTCCAATACTTGATGAATGGATGCACCTCTTATGGTCTCTTGTTTTGTTTCACGAAGACTGTTTTGCTGTCATTCAATCTTAATTCCACTTTTAGTTAATTCAGTGAGAGATGTAGATTTTGTCTGAG
AGGCACCTGAAACCATGATTTGTATTCCTTAGATCTTGCATTTGTTTTTGGCTTCTTGTATTCTATAAGATTGAACAGATTTCTTCAATTGTCTCTGTTAAATTTTGATGTTTGAAATTAACTTGTATTGCTAGATTAGCCACGGAATCTTCTTGTGTTGTACCATTTGAGCCCTGAGGATATGATTGGGCTCTCAGTTA
TGAAGGCTAATGT

>TRINITY_DN109829_c0_g1_i1 from sample A3 / Example unspliced isoform:

GTTAGATTCATGTTTGGAAATGATGGAGAGAGTATTTGTTTTGCTGGTGAACAATgtaaacattttcgctatattgcttggtttacgttttaaggggcatggaatctaatggcatattaaggggttgagctttggaacttctgtaaacgatggatatctacaattcgatgggatatattgtaaaccatacttttttgtga
gcagtctgtatttgaatagtagatattcatggcgatcttctttgtggaggttttggtggatgatgaagattgtttaattccatgagttttgtattagggttcctaattgccttgaaacgataaatggttttgatgtgaaggatcctgttgtaggtttttatttttgtaatgtgtttaggtttttgcaatacgtgcagGTA
TGAGCTGGGAAGACAGCCTTCGATGACGAAACTGTCAAGTAATAAGACAGTGAGAAGGGTGCGTGTCAGAGGAGGTAATGTTAAATGGAGGGCTCTGAGGCTCGATACTGGTAACTATTCTTGGGGTTCCGAGGCTGTGACCCGAAAGACTCGTATTTTAGACGTGGTTTACAATGCATCTAATAATGAGCTCGTCAGAA
CCCAGACTTTGGTGAGGAGTGCCATTGTTCAGGTTGATGCTGCCCCTTTCCGTCAGTGGTACGAACAGCACTACGGGCTAGATATTGGCAGAAAGAAGAAGGCTGCTGCTGCTGCCAAGAAAGAGACTACTGAGGTAGGTAGATGGAAAACTTTAGTCTGATTTATCTTTGCTAGCTTTTAAAAATTTAATTTAGTTGTA
TTCTTTCTTTGAGGCAGTTTCATTAACAGTTATATAAATCATGTCTGAGAGTACGGTCTTCCCTATTTGGCTTTTATGGACATATATGTGCTTAAATGCTTGACGTGGTATCCATCATCTGTCCTATGTTGGCTTAATTATAGACGTTTAATATGGTAGTTCTAAGTTGTTCTTAACAACAATATAAGTTTTATATTGGC
TGTCGACCTCGAACCGAGAGTAGACCATCCGCCATTTTACCTCGAATAACGTGGCTTGCAAGCTTGTCTCTGAAACTAAGATGCATTTGTAACTATGTTGTACTGGCATTGTCTCTGAAGCTGAACTTAGTATTGGGAGCTTAGTATTGGGAATCGTTTCATATGACCTGTGGCTTTCCAACAATATTAACCAATATTAC
ATTCGGTGATTGGATGAAATACCACACTTCTAGGAATTATTTTCATTTTCAAAATATATTTTACACCCGGGATTGGATGAAATACAATTCTAGGCATTATTTTCATTTCCA

Intron 2 GTAAGGGGTT ... ATACGCGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	27.18	1356	5	506
A2	25.33	1465	6	497
A3	25.59	1902	6	654
A4	26.91	1043	4	384
A5	23.02	1030	9	308
A6	24.85	7689	0	2543
A7	24.92	9886	0	3281
A8	26.79	5915.5	0	2164
A9	24.69	9685	2	3175
A10	25.03	10081	4	3366

>TRINITY_DN110179_c0_g1_i1 from sample A2 / Example spliced isoform

GGTTTTAACACTGATAAGTTCAGTTTCATTCCTCTATTTTTTCAGAGAGGCGTTGTGAGGTGAAGCGGAGAGAGGGGAGTAGCTAAGGCCAGGCGGCGGTGCGGTCCGATCTTGCAAGCGATCTACAGGCGTTCAAGCCGATTCTGAAACCATGGGTATCTCTCGGGATTCACTCCACAAAAAACGTGCGACTGGAGGGA
AGAAGAAGTCCTGGAGGAAGAAGCGAAAGTATGAGCTGGGAAGACAGCCTTCGATGACGAAACTGTCAAGTAATAAGACAGTGAGAAGGGTGCGTGTCAGAGGAGGTAATGTTAAATGGAGGGCTCTGAGGCTCGATACTGGTAACTATTCTTGGGGTTCCGAGGCTGTGACCCGAAAGACTCGTATTTTAGACGTGGTT
TACAATGCATCTAATAATGAGCTCGTCAGAACCCAGACTTTGGTGAGGAGTGCCATTGTTCAGGTTGATGCTGCCCCTTTCCGTCAGTGGTACGAACAGCACTACGGGCTAGATATTGGCAGAAAGAAGAAGGCTGCTGCTGCTGCCAAGAAAGAGACTACTGAGGAGGGAGAAGCTACTGCTGAGGAAGAGAAGAAGAA
AAGTAAAAATCTTGTGAAGAAGCTTGAGAAGCGACAAGAAGGTCACAAACTTGATGCACATCTGGAAGAGCAATTTGCTAGCGGTCGATTAATGGCTGCAATTGCTTCACGCCCTGGCCAGTGTGGACGTGCTGATGGGTATATTCTTGAGGGTCGGGAGCTTGAGTTCTACTTGAAAAAGATCCAGAGAAAGAAGGGCA
AGGGAGCTGCTGCAGCTTAAGCAAACAATTTTGGCTTCTTGAAGTTCTTAACGATGTTAATAAATCTTATGTCAGAAATTTAGCATTGGCCCCAAGTAACTTCAAAAGAGCTTTATAGCTAGGACAGAGGATATTTTTTTGTGGTAACTGATGAAGGTTCTTTTTGCTTCTGTTAGTTCTTTTTTACTCCTTGGAGTATA
TTTATTAGAAATTTTTTAGATGACTATTTTTTGATTTCTATTCCATCTCAAAATGGAATGTTATGCGTAAGGACCATTTTGTGTTAAGCTTTCAGTATACCTGTGTAAGTTAAGTTAATGTTTTCTTATGTGATATGTTGGGAGTGCAACATGGCTTGCATACATAAACAAGTTTTATTAAAATTATACCAGTGCTAATC
TACGTTTATGTTGACTGGTTTCACAAGTGGACCTTTCAGATTTATCCAGGAATCTATTGATATTAAAGGGCCCTATCTGCAATATGGAGTTTTGAATAAGATCAACCTGTTCTTTACATTTACTTGTGAATTTTTGTTGCAGAAACTCTAATTTAAGTTTACTCTACTAGAGGGCTCTATCTGCAATATGGAGTTTTGAA
TAAGATCAACCTGTTCGTGACATTTACTTGTGAATTTTGTTGCACAAACTCTAAAATTTAAGTTTTAGTTTTAAAAACTGACGTAAATTTGTAAATATTGGATCAGTTCAGTGCCTTATCTTTATTGATTTTTCTGCAAGTGAGCACTGTTTGTGTCAAATTGCTCCCAGATGGACTCTATTTCCTCCTCCTCCAATACT
TGATGAATGGATGCACCTCTTATGGTCTCTTGTTTTGTTTCACGAAGACTGTTTTGCTGTCATTCAATCTTAATTCCACTTTTAGTTAATTCAGTGAGAGATGTAGATTTTGTCTCAGGCCTTGTATACCGAGAGGCACCCGAAACCATGATTTGTATTCCCTAGATCTTGCATTTGTTTTTGGCTTCTTGTATTCCTAT
AAGATTGAACAGATTTCTTCAATTGTCTCTGTTAAATTTTGATGTTTGAAATTAACTTGTATTGCTAGATTAGCCACGGAATCTTCTTGTGTTGTACCATTTGAGC

>TRINITY_DN110179_c0_g1_i3 from sample A2 / Example unspliced isoform:

GGTTTTAACACTGATAAGTTCAGTTTCATTCCTCTATTTTTTCAGAGAGGCGTTGTGAGGTGAAGCGGAGAGAGGGGAGTAGCTAAGGCCAGGCGGCGGTGCGGTCCGATCTTGCAAGCGATCTACAGGCGTTCAAGCCGATTCTGAAACCATGGGTACGAGTCGTGCTGCCATGGATTTCCACAGTCTCAATGCATATT
TCATCTATCTGTATGAACTATTTTGGCTGAAGAATGCTGCTGGTACTCTACTGTTATTATTCAGTGACTTGTCACTATAATCTTTACCCTGTTAATGTAATGATACAGGTATCTCTCGGGATTCACTCCACAAAAAACGTGCGACTGGAGGGAAGAAGAAGTCCTGGAGGAAGAAGCGAAAgtaaggggtttcaaccttg
attagtcgagtactatttactttcaatacaagtaaatttgttgatttgtgttttttaaggttagggaggcttttttacaatgtctggttttgctagatgctgacttattaatctatgtttttagggtttaaaagtttctgtgaatacctaaaaagttttacaattttcgttatgttatttctagagtattgatttttttt
ccaaatagaattttgttctctagatttataaccttggggttttgcggatcttgaaataaatgcagtttgaagggttagattcatgtttggaaatgatggagagagtatttgttttgctggtgaacaatgtaaacattttcgctatattgcttggtttacgttttaaggggcatggaatctaatggcatattaaggggttg
agctttggaacttctgtaaacgatggatatctacaattcgatgggatatattgtaaaccatacttttttgtgagcagtctgtatttgaatagtagatattcatggcgatcttctttgtggaggttttggtggatgatgaagattgtttaattccataagttttgtattagggttcctaattgccttgaaacgataaatgg
ttttgatgtgaaggatcctgttgtaggtttttatttttgtaatgtgtttaggtttttgcaatacgcgcagGTATGAGCTGGGAAGACAGCCTTCGATGACGAAACTGTCAAGTAATAAGACAGTGAGAAGGGTGCGTGTCAGAGGAGGTAATGTTAAATGGAGGGCTCTGAGGCTCGATACTGGTAACTATTCTTGGGGT
TCCGAGGCTGTGACCCGAAAGACTCGTATTTTAGACGTGGTTTACAATGCATCTAATAATGAGCTCGTCAGAACCCAGACTTTGGTGAGGAGTGCCATTGTTCAGGTTGATGCTGCCCCTTTCCGTCAGTGGTACGAACAGCACTACGGGCTAGATATTGGCAGAAAGAAGAAGGCTGCTGCTGCTGC

Intron 3 GTACACTAAT ... ATACACACAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	50.96	154	0	160
A2	50.16	159	7	160
A3	50.53	139	10	142
A4	51.02	120	2	125
A5	50	83	7	83
A6	49.71	856	1	846
A7	49.88	844	3	840
A8	49.8	859	5	852
A9	49.97	961	6	960
A10	49.94	778	0	776

>TRINITY_DN109829_c0_g1_i7 from sample A3 / Example spliced isoform

GTTAGATTCATGTTTGGAAATGATGGAGAGAGTATTTGTTTTGCTGGTGAACAATGTATGAGCTGGGAAGACAGCCTTCGATGACGAAACTGTCAAGTAATAAGACAGTGAGAAGGGTGCGTGTCAGAGGAGGTAATGTTAAATGGAGGGCTCTGAGGCTCGATACTGGTAACTATTCTTGGGGTTCCGAGGCTGTGACC
CGAAAGACTCGTATTTTAGACGTGGTTTACAATGCATCTAATAATGAGCTCGTCAGAACCCAGACTTTGGTGAGGAGTGCCATTGTTCAGGTTGATGCTGCCCCTTTCCGTCAGTGGTACGAACAGCACTACGGGCTAGATATTGGCAGAAAGAAGAAGGCTGCTGCTGCTGCCAAGAAAGAGACTACTGAGATTTATGG
AGAAGTCCGAGTATAGCTTACAACACCAAGTTTGATACCGATAATAGGAGGGAGAAGCTACTGCTGAGGAAGAGAAGAAGAAAAGTAAAAATCTTGTGAAGAAGCTTGAGAAGCGACAAGAAGGTCACAAACTTGATGCACATCTGGAAGAGCAATTTGCTAGCGGTCGATTAATGGCTGCAATTGCTTCACGCCCTGGC
CAGTGTGGACGTGCTGATGGGTATATTCTTGAGGGTCGGGAGCTTGAGTTCTACTTGAAAAAGATCCAGAGAAAGAAGGGCAAGGGAGCTGCTGCAGCTTAAGCAAACAATTTTGGCTTCTTGAAGTTCTTAACGATGTTAATAAATCTTATGTCAGAAATTTAGCATTGGCCCCAAGTAACTTCAAAAGAGCTTTATAG
CTAGGACAGAGGATATTTTTTTGTGGTAACTGATGAAGGTTCTTTTTGCTTCTGTTAGTTCTTTTTTACTCCTTGGAGTATATTTATTAGAAATTTTTTAGATGACTATTTTTTGATTTCTATTCCATCTCAAAATGGAATGTTATGCGTAAGGACCATTTTGTGTTAAGCTTTCAGTATACCTGTGTAAGTTAAGTTAA
TGTTTTCTTATGTGATATGTTGGGAGTGCAACATGGCTTGCATACATAAACAAGTTTTATTAAAATTATACCAGTGCCAATCTACGTTTATGTTGACTGGTTTCACAAGTGGACCTTTCAGATTTATCCAGGAATCTATTGATATTAAAGGGCCCTATCTGCAATATGGAGTTTTGAATAAGATCAACCTGTTCTTTACA
TTTACTTGTGAATTTTTGTTGCAGAAACTCTAATTTAAGTTTACTCTACTAGAGGGCTCTATCTGCAATATGGAGTTTTGAATAAGATCAACCTGTTCGTGACATTTACTTGTGAATTTTGTTGCACAAACTCTAAAATTTAAGTTTTAGTTTTAAAAACTGACGTAAATTTGTAAATATTGGATCAGTTCAGTGCCTTA
TCTTTATTGATTTTTCTGCAAGTGAGCACTGTTTGTGTCAAATTGCTCCCAGATGGACTCTATTTCCTCCTCCTCCAATACTTGATGAATGGATGCACCTCTTATGGTCTCTTGTTTTGTTTCACGAAGACTGTTTTGCTGTCATTCAATCTTAATTCCACTTTTAGTTAATTCAGTGAGAGATGTAGATTTTGTCTGAG
AGGCACCTGAAACCATGATTTGTATTCCTTAGATCTTGCATTTGTTTTTGGCTTCTTGTATTCTATAAGATTGAACAGATTTCTTCAATTGTCTCTGTTAAATTTTGATGTTTGAAATTAACTTGTATTGCTAGATTAGCCACGGAATCTTCTTGTGTTGTACCATTTGAGCCCTGAGGATATGATTGGGCTCTCAGTTA
TGAAGGCTAATGT

>TRINITY_DN109829_c0_g1_i3 from sample A3 / Example unspliced isoform:

ATATTCTGGCTATCTTATATAGATCCCATTAGAAGCTAGGTGTGAGGAATATCGTTATAGAATTGCTGTAGGTGAGGAACATGCCTATATTGTCAAATTACTTTGAACCTCATACTGATATTCCTTATTGATGGAATCAACCTACATGGATCCCTGCCAATGGACAATACTGTTTCTCCAAATATTATTAATGATATTTA
AAATTAAGAGCCCATTTGTGGAAGTCCATTTTGTGTATTTTCTTAGGCATTTTTAGGTCATTTTTCTCAGAAAAAAGAATTTGTATTGTAGATTTATGGAGAAGTCCGAGTATAGCTTACAACACCAAGTTTGATACCGATAATAGgtacactaattaaactgtgattttccattcagtgtctacatgtgctctaaataa
accataatttaccagtcacagtgcttctggtggggcatctaaatttacatgtgttctaaataatttagatgccccaccacacttcttgatgctatagtgtaaaactgcccttgtgttttccttttttatctgcaaatgatttagtttaaaaaaactgttaacataattttgccaagaacttagtgtcaacgttattctcg
atacttttgaattgcccttacttgggtgttacatttatacacacagGAGGGAGAAGCTACTGCTGAGGAAGAGAAGAAGAAAAGTAAAAATCTTGTGAAGAAGCTTGAGAAGCGACAAGAAGGTCACAAACTTGATGCACATCTGGAAGAGCAATTTGCTAGCGGTCGATTAATGGCTGCAATTGCTTCACGCCCTGGCC
AGTGTGGACGTGCTGATGGGTATATTCTTGAGGGTCGGGAGCTTGAGTTCTACTTGAAAAAGATCCAGAGAAAGAAGGGCAAGGGAGCTGCTGCAGCTTAAGCAAACAATTTTGGCTTCTTGAAGTTCTTAACGATGTTAATAAATCTTATGTCAGAAATTTAGCATTGGCCCCAAGTAACTTCAAAAGAGCTTTATAGC
TAGGACAGAGGATATTTTTTTGTGGTAACTGATGAAGGTTCTTTTTGCTTCTGTTAGTTCTTTTTTACTCCTTGGAGTATATTTATTAGAAATTTTTTAGATGACTATTTTTTGATTTCTATTCCATCTCAAAATGGAATGTTATGCGTAAGGACCATTTTGTGTTAAGCTTTCAGTATACCTGTGTAAGTTAAGTTAAT
GTTTTCTTATGTGATATGTTGGGAGTGCAACATGGCTTGCATACATAAACAAGTTTTATTAAAATTATACCAGTGCCAATCTACGTTTATGTTGACTGGTTTCACAAGTGGACCTTTCAGATTTATCCAGGAATCTATTGATATTAAAGGGCCCTATCTGCAATATGGAGTTTTGAATAAGATCAACCTGTTCTTTACAT
TTACTTGTGAATTTTTGTTGCAGAAACTCTAATTTAAGTTTACTCTACTAGAGGGCTCTATCTGCAATATGGAGTTTTGAATAAGATCAACCTGTTCGTGACATTTACTTGTGAATTTTGTTGCACAAACTCTAAAATTTAAGTTTTAGTTTTAAAAACTGACGTAAATTTGTAAATATTGGATCAGTTCAGTGCCTTAT
CTTTATTGATTTTTCTGCAAGTGAGCACTGTTTGTGTCAAATTGCTCCCAGATGGACTCTATTTCCTCCTCCTCCAATACTTGATGAATGGATGCACCTCTTATGGTCTCTTGTTTTGTTTCACGAAGACTGTTTTGCTGTCATTCAATCTTAATTCCACTTTTAGTTAATTCAGTGAGAGATGTAGATTTTGTCTGAGA
GGCACCTGAAACCATGATTTGTATTCCTTAGATCTTGCATTTGTTTTTGGCTTCTTGTATTCTATAAGATTGAACAGATTTCTTCAATTGTCTCTGTTAAATTTTGATGTTTGAAATTAACTTGTATTGCTAGATTAGCCACGGAATCTTCTTGTGTTGTACCATTTGAGCCCTGAGGATATGATTGGGCTCTCAGTTAT
GAAGGCTAATGTTATTTCCAGATTTATTTCTATTTCTATACCGGGGTCTTAGAGAGGCCAGTAATTTGGGAATCCCTTAATACTTTTCTGCTGTCTAGAGTAATGCTTTCCAGCAACTGTGGCCCTTTATATAAGGTAGAGTTTGACCAGATTGTTTGTGGCTTCTGAGATTCACTGCATATATCTCCTCCAGTAGTCTC
CACCCAAGCCCGCGTCTTGGATTTATTTTTTATTCCCATTAAATACTTAAGGTTTTACCTCTGTTTACCTTATGCTAATCTTAAATCA

Intron 4 GTACGAGTCG ... AATGATACAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	2.63	1269.3	34.3	70.7
A2	1.58	1455	23.3	82.7
A3	1.33	1895.3	25.7	103
A4	1.81	1046.7	19.3	60.7
A5	2.76	988.3	28	60.3
A6	1.55	7141.3	112.7	344
A7	1.21	9101.3	111.3	444.7
A8	1.54	5081	79.3	252.7
A9	1.39	9262.7	131	481.3
A10	1.59	9728.7	157.3	496

>TRINITY_DN118482_c1_g1_i6 from sample A1 / Example spliced isoform

GGCGTTGTGAGGTGAAGCGGAGAGAGGGGAGTAGCTAAGGCCAGGCGGCGGTGCGGTCCGATCTTGCAAGCGATCTACAGGCGTTCAAGCCGATTCTGAAACCATGGGTATCTCTCGGGATTCACTCCACAAAAAACGTGCGACTGGAGGGAAGAAGAAGTCCTGGAGGAAGAAGCGAAAGTATGAGCTGGGAAGACAGC
CTTCGATGACGAAACTGTCAAGTAATAAGACAGTGAGAAGGGTGCGTGTCAGAGGAGGTAATGTTAAATGGAGGGCTCTGAGGCTCGATACTGGTAACTATTCTTGGGGTTCCGAGGCTGTGACCCGAAAGACTCGTATTTTAGACGTGGTTTACAATGCATCTAATAATGAGCTCGTCAGAACCCAGACTTTGGTGAGG
AGTGCCATTGTTCAGGTTGATGCTGCCCCTTTCCGTCAGTGGTACGAACAGCACTACGGGCTAGATATTGGCAGAAAGAAGAAGGCTGCTGCTGCTGCCAAGAAAGAGACTACTGAGGAGGGAGAAGCTACTGCTGAGGAAGAGAAGAAGAAAAGTAAAAATCTTGTGAAGAAGCTTGAGAAGCGACAAGAAGGTCACAA
ACTTGATGCACATCTGGAAGAGCAATTTGCTAGCGGTCGATTAATGGCTGCAATTGCTTCACGCCCTGGCCAGTGTGGACGTGCTGATGGGTATATTCTTGAGGGTCGGGAGCTTGAATTCTACTTGAAAAAGATCAAGAGAAAGAAGGGCAAGGGAGCTGCTGCAGCTTAAGCAAACAATTTTGGCTTCTTGAAGTTCT
TAACGATGTTAATAAATCTTATGTCAGAAATTTAGCATTGGCCCCAAGTAACTTCAAAAGAGCTTTATAGCTAGGACAGAGGATATTTTTTTGTGGTAACTGATGAAGGTTCTTTTTGCTTCTGTTAGTTCTTTTTTACTCCTTGGAGTATATTTATTAGAAATTTTTTAGATGACTATTTTTTGATTTCTATTCCATCT
CAAAATGGAATGTTATGCGTAAGGACCATTTTGTGTTAAGCTTTCAGTATACCTGTGTAAGTTAAGTTAATGTTTTCTTATGTGATATGTTGGGAGTGCAACATGGCTTGCATACATAAACAAGTTTTATTAAAATTATACCAGTGCCAATCTACGTTTATGTTGACTGGTTTCACAAGTGGACCTTTCAGATTTATCCA
GGAATCTATTGATATTAAAGGGCCCTATCTGCAATATGGAGTTTTGAATAAGATCAACCTGTTCTTGACATTTACTCGTGAATTTTGTTGCAGAAACTCTAATTTAAGTTTACTCTACTAGAGGGCTCTATCTGCAATATGGAGTTTTGAATAAGATCAACCTGTTCGTGACATTTACTTGTGAATTTTGTTGCACAAAC
TCTAAAATTTAAGTTTTAGTTTTAAAAACTGACGTAAATTTGTAAATATTGGATCAGTTCAGTGCCTTATCTTTATTGATTTTTCTGCAAGTGAGCACTGTTTGTGTCAAATTGCTCCC

>TRINITY_DN118482_c1_g1_i1 from sample A1 / Example unspliced isoform:

GGCGTTGTGAGGTGAAGCGGAGAGAGGGGAGTAGCTAAGGCCAGGCGGCGGTGCGGTCCGATCTTGCAAGCGATCTACAGGCGTTCAAGCCGATTCTGAAACCATGGgtacgagtcctgctgccatggatttccacagtctcaatgcatatttcatctatctgtatgaactattttggctgaagaatgctgctggtactc
tactgttattattcagtgacttgtcactataatctttaccctgttaatgtaatgatacagGTATCTCTCGGGATTCACTCCACAAAAAACGTGCGACTGGAGGGAAGAAGAAGTCCTGGAGGAAGAAGCGAAAGTATGAGCTGGGAAGACAGCCTTCGATGACGAAACTGTCAAGTAATAAGACAGTGAGAAGGGTGCGT
GTCAGAGGAGGTAATGTTAAATGGAGGGCTCTGAGGCTCGATACTGGTAACTATTCTTGGGGTTCCGAGGCTGTGACCCGAAAGACTCGTATTTTAGACGTGGTTTACAATGCATCTAATAATGAGCTCGTCAGAACCCAGACTTTGGTGAGGAGTGCCATTGTTCAGGTTGATGCTGCCCCTTTCCGTCAGTGGTACGA
ACAGCACTACGGGCTAGATATTGGCAGAAAGAAGAAGGCTGCTGCTGCTGCCAAGAAAGAGACTACTG