sp|Q9SV68|QORH_ARATH ----> Chloroplast envelope quinone oxidoreductase homolog
Intron 1 GTATTGAAAG ... ATGGAAGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 57.14 | 6 | 8 | 8 |
| A2 | 89.47 | 1 | 6 | 11 |
| A3 | 75.76 | 4 | 9 | 16 |
| A4 | 64.71 | 3 | 2 | 9 |
| A5 | 91.67 | 1 | 10 | 12 |
| A6 | 87.5 | 2 | 10 | 18 |
| A7 | 81.25 | 3 | 17 | 9 |
| A8 | 64.1 | 7 | 12 | 13 |
| A9 | 85 | 3 | 11 | 23 |
| A10 | 76.47 | 4 | 13 | 13 |
>TRINITY_DN36180_c0_g1_i1 from sample A9 / Example spliced isoformCAAAAATATCACTACTATTGAAAACCGTGGCCTCTCCCGACTCGCGAGATAGGGTTTGGTTTAAGTCACTGGTCAACAAAATTCTGTTCTTTAATTAAGCCCTCGGACGCCGAGAAGATCTTTCTGAAAGTTCAGTATAGCACATACGGCGGGGGCGCTCAAGCTCTTCAGCATGTAGAGATTCCTGTTCCAACTCCAAA
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>TRINITY_DN36180_c0_g1_i4 from sample A9 / Example unspliced isoform:CAAAAATATCACTACTATTGAAAACCGTGGCCTCTCCCGACTCGCGAGATAGGGTTTGGTTTAAGTCACTGGTCAACAAAATTCTGTTCTTTAATTAAGCCCTCGGACGCCGAGAAGATCTTTCTGAAAGgtattgaaagtcaaattctgcagctctctgccataaaaaatccaattgccaagttaatttggtgtataag
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CCTCTGGGAAAGTGATTGATGTTACTCCGACTTTAAAGTCATTTTTAACCTCAGTTACAAAGAAAGTGACATTTTCCAAGAAGCAACTTATGCCATTGCTGTTGATACCAAGGGGTGAGAACCTTGAACTGTTGGTGGATTTGGTCAAGGAGCAGAAGCTGAGAATTGTTGTTGATTCAATGTACCCCTTGGCAAAGGCA
GAGGATGCATGGGCAAAGATCATGGATGGACATGCGACAGGAAAGGTTATAGTAAACATTTAAGAAGTAGTTTGTACATTCCTTAAGTTCTGTTGCTAGTTCTTATAACTAGTGTAAGGTTAGCACTGTTAATTTTGTAAACTTCTTTTCTTATGAGGATTTGAGGTTTTATCCTCTGATAATGAATACAACAAAACACA
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