sp|O24412|PSD7A_ARATH ----> 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 7 homolog A

Intron 1 GTAAATATTG ... CAAGTTACAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	12.41	43.5	2	10
A2	0	35	0	0
A3	2.04	49.5	1	1
A4	19.22	27.5	10	3
A5	10.41	18	0	4
A6	2.56	192.5	6	4
A7	1.36	236.5	2.5	4
A8	1.77	395.5	2	12
A9	2.19	249	6	5
A10	2.3	172.5	5	3

>TRINITY_DN41516_c2_g4_i5 from sample A6 / Example spliced isoform

ATTTGTGTCATAATTATAGCTATAAATATCCTTAAACAGAATGGGAGCTTGTTTCTCAGTTGAGGAAAGCAAGTGAAGGATTTTGCAGCGAAAACAAATGACATGATGCTGGTCATCTATCTCTTCTCCCTTATTCGGAGTGTCATTGCTATGCATAATCTCATAAACAAGGAGATGATAAACAAGGAGCATGAGAAAAC
TTGCAGATGCTTTAGCGTCACCATAATATCTGCAACAGGGAGTTAAGTAGATGCTTCTGCATCCTTGTTAGGAAGAAAGATTGTAGCTGATTCTTTCCAGAGGTTGTCTTTTGCAGCTTAAAATATTCAAGAGTCGTGAAAATCATGTACTGCCCATTTTTTATCTCAATTGTGGCATTTGACTACCAATTGGCAAGCAG
TAAGGTGTTTTACCAGCTGCAGTCGCAGGAACTAGATACTGCTCTTGCTTGGAACCTATTGGTAGCCAGCAGTTTCTTCCCTTTTATAAGAGTATTACGTGCTGAAAAGTTCTGGCATTTTTTCTTCCATCATTATATCCTATGCCATTTTTATTTATCATAGTTTGTAGATGTCAAGCTATCTGAATTAGTAGCTTATT
AGTGACATGTTCGAAGTGAATAAAAAGCATTGGAGTATTTATGCTCATTTATCTTTGTTTTAGAGCACTTCAAATAGGAAAAGCAATGGAGTAATTTTGTTCAGTTGTGACCTTTATTTACAGGTTGCGACGTTTGATTTTTCTTCACATTACTGAAGCTTGTTAGGTTTGATTATTTTCTTTAATAGTCTCTAA

>TRINITY_DN41516_c2_g4_i3 from sample A6 / Example unspliced isoform:

ATTTGTGTCATAATTATAGCTATAAATATCCTTAAACAGAATGGGAGCTTGTTTCTCAGTTGAGGAAAGCAAGTGAAGGATTTTGCAGCGAAAACAAATGACATGATGCTGGTCATCTATCTCTTCTCCCTTATTCGGAGTGTCATTGCTATGCATAATCTCATAAACAAGGAGgtaaatattgaaacaatatctttttt
ctttagtggtaagtaaaataactgcctgaagttttaatgtgtggtttggcttacttacaagttacagATGATAAACAAGGAGCATGAGAAAACTTGCAGATGCTTTAGCGTCACCATAATATCTGCAACAGGGAGTTAAGTAGATGCTTCTGCATCCTTGTTAGGAAGAAAGATTGTAGCTGATTCTTTCCAGAGGTTGT
CTTTTGCAGCTTAAAATATTCAAGAGTCGTGAAAATCATGTACTGCCCATTTTTTATCTCAATTGTGGCATTTGACTACCAATTGGCAAGCAGTAAGGTGTTTTACCAGCTGCAGTCGCAGGAACTAGATACTGCTCTTGCTTGGAACCTATTGGTAGCCAGCAGTTTCTTCCCTTTTATAAGAGTATTACGTGCTGAAA
AGTTCTGGCATTTTTTCTTCCATCATTATATCCTATGCCATTTTTATTTATCATAGTTTGTAGATGTCAAGCTATCTGAATTAGTAGCTTATTAGTGACATGTTCGAAGTGAATAAAAAGCATTGGAGTATTTATGCTCATTTATCTTTGTTTTAGAGCACTTCAAATAGGAAAAGCAATGGAGTAATTTTGTTCAGTTG
TGACCTTTATTTACAGGTTGCGACGTTTGATTTTTCTTCACATTACTGAAGCTTGTTAGGTTTGATTATTTTCTTTAATAGTCTCTAA

Intron 2 GTATTTCCTT ... TTCTCTGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	19.89	149	10	37
A2	26.09	136	2	48
A3	24.77	161	7	53
A4	15.11	118	3	21
A5	17.65	56	7	12
A6	23.57	668	3	206
A7	22.83	872	1	258
A8	23.3	1149	3	349
A9	22.64	895	2	262
A10	21.24	612	5	165

>TRINITY_DN120402_c1_g1_i3 from sample A1 / Example spliced isoform

ATTAAAGCGTAAGAGAGGGAAACAACGAAGTAAAGCGCCCACTCAGCACGAAACACCGTGCTGGTCGGTGACAGAAAAAAAAAAAAACGAAAAAGGGGTTTCAGAGTGAGAGAGTTTAAATAACGAGATGATATAACTGAAGTTTACGCAGTGCGAGCAATATTTGTTTAAGACGTTTCGGGTTCGAATCCGCGTGGAGG
AGGAGCAGCAGCAGCTCGGTTGAAACAGAGGGTAGAGTACAGAAAAAGACAGGAGAGATGGATGTAATAAAGACGCAGCAGATATCTGCGAGGGCTATAGAGAAAGTGATAGTGCATCCGTTGGTGTTACTGAGCATCGTGGACAACTACAACAGAGTTGCAAGGGAAACCCGGAAACGAGTTATTGGCGTATTACTGGG
AACCAGCCACCGCGGAATCGTAGATGTAACTAACAGCTACGCAGTGCCTTTTGAAGAAGATGACAAGGATCCAAGCATCTGGTTTTTGGATCACAACTATCATGAGTCTATGTTTGAAATGTTCAAGCGGATTAATGCAAAGGAACATGTGGTAGGATGGTATAGCACTGGTCCAAAGCTTCGGGAAAATGACTTGGATG
TGCATGAGTTGTTCCATGACTATGTGCCCAATCCTGTGCTTGTCATTATTGATGTCCAACCGAAGGAGCTGGGGATTCCTACCAAAGCATATTATGCAGTTGAGGAAGTTAAGGAGAATGCAACTCAGAAAAGCCAGAAGGTGTTTGTGCATGTGCCATCTGAAATTTGTGCACATGAAGTTGAGGAAATAGGTGTGGAG
CACTTGCTAAGGGATGTCAAGGACACAACTATCAGTACTCTTGCAACAGAGGTGAGCGGAAAATTGACAGCTCTGAAGGGTCTCGAAGCTAGGCTGAGAGAGATTCATGGATACCTGGATCTTGTTGTTGATGGAAGACTTCCACTCAACCATGAAATTCTATACCATCTTCAGGATGTATTCAATCTGTTGCCCAACTT
GAATGTTAATGAGTTAGTGAAGGCTTTTGCAGTGAAAACAAATGATATGATGCTGGTCATCTATCTCTCGTCCCTTATTCGGAGTGTCATTGCCATGCATAATCTCATAAACAATAAGATGTTAAACAAGGAACATGAGAAACTTGCAGATGCTTCTTCCTCACCCATAACAGCTGCAGCAGGGAGTTAAGTAGATGCTT
CTGCATCCTTGGTAGGAAGAAAGATTGTAGCTGGATTCTTTCCAGAGGTTTTCTTTTGCAGCTCAAAATATTCGAGCGTCATGAAAAATTTTGTGTACTGCCCATTTTTACCTCAATTCCGGCATTTGACTAGCAATTGGAAAGCAGTAAGGTGTTTTACCAGCTGCAGTCGCAGGAACTAGATACTGCTCTTGCTTGGA
ACCTATTGGTAGCCAGCAGTTTCTTCCCTTTTATAAGAGTATTGCATGCTGAAAAGTTCTGGCATTTTTTTATTCCATCATCTCCTATGCCATTTTTATTTATCATAGTTTGTAGATGTCAAGCTATCTGAATTAGTAGCTTATTAGTGACATGTTCGAAGTGAATAAAAAGCATTGGAGTATTTATGCTCATTTATCTT
TGTTTTAGAGCACTTCAA

>TRINITY_DN120402_c1_g1_i1 from sample A1 / Example unspliced isoform:

CCCAGACTAAATCAAATTCCTGGTAACTGACCAGGTGCCTCCATTCTCCCAGAGAATGGCTCTCAATGCTGCTCAAAAATCAACAATTACTAGGGTCCAGGGTTAGTTTTAGGGTTTTGTTTTACCTTTTATTTTTATTTTTAATTTTCCCGGTCGAAATTGTGGTCCAATGTGTGGTGTATGGGTCCATACCAAACCAG
CTGGTTTAGGCATTTAAGGCCAGTTCTGTACTAAACCAGACATTTCTGGTTCAGGGCCATGATTTGGACTGGTTAGGCATTTAAAATAGTTGAACCAGCTGGTTTTGGCAAAACTGCGCCGGTTCTGATAGCACTGATTGTGACTAAGCTACTAATGTTTTTATTGGACACTGTCAGTAATGCTCCTTGTTTAATTAGCA
GATATTCACTCGAGTCTTGTGCAGCATGGCACATATTTATCCTGTAATCTTTACATAAAGAGTAATAGCATTATTAACTCAATATTTAGAATGTTTGTCATTTAATCTGTCCAGATTTAAGGTGATGAACTCTCTCGTTAAATTTCAACTATCTCCTTTCTGTAATTTCCAAAATCTGCTGAAGTTCTTGCAAATAATGT
CATCTTGTATTTAAGGTTCAGCAAATATTAAATGTCATGGCAAGCTGGTGAGGTTTGTCAGATTTTCTATTGTATGACTAAGTTTAAAAGAATTTTTAAGTGCAAAATGGTAAGTGTGAGTATTTATGTAAGTTTCAGTGTAGTTAATTTTCTATAACTTTCATAGAAGCATTAGGTGCACTGAGTGAAAGATGCAGTGT
TGCAGCTAATGGGATGGCTGAAATTGCACAAACTGCAGTAAAATGTTCTTGGAAGATAGGGTTATGTAGATGACTCTTCAAAATATTATATGGGAGCTAAAATGATAGTTTGCTTCTTTGAAAGCCAAATGACTTGCATAATCTCTGTTGGGTACATCTTTGCAGTCGAATTATCAATATATTTTTTGAGTTTATTGTCA
GGTCTTGATGCATTCTTTGCATATACTTTTCTAATGCTTCCCGGGTCAGTTGTATTCTCTTCAATGCATAAAATTGATATTTTTTAACCTTGGGGTGCTGTGTGGAGTCAAATTATTTTTTAACTTCTCCACATGGTTGTGAAAGATGGATAAGGCTCCAATGTTTTCTCTATTGTCCTCAGTCTTCTAAGAGTTCTCGT
TCTGAGACTTCAAGTTATTGTAATCTGAGATGGCACCTGTCTGCTCCATTTATTTTTGTCTTTTCGTCATTGCTGTGAAATATAATCTGTCCAGGCACCTATAACATCCATTCTGTAAATGGAAACTGTGCTTTAACCATATGTAGTTATTATAGGATAAAACATTTTTCAGATTTCATTTTCACACTAGGATTTGATGG
AGGGAAGAGCCTGAAGTTGAAACTTATTGTAGGTTGGGATCTTTAATTTTTGTTGAGTGCTCTGATTCTCATCTCTCTTTTCGCAGGATGTATTCAATCTGTTGCCCAACTTGAATGTTAATGAGTTAGTGAAGGCTTTTGCAGgtatttcctttcttgccatcttaagttgtagcatttaaaggaggtacagattaact
gcttgaactgatcgaagtaacttgctttctgaaagctgaacatttgctaagccactgccttattctctgcagTGAAAACAAATGATATGATGCTGGTCATCTATCTCTCGTCCCTTATTCGGAGTGTCATTGCCATGCATAATCTCATAAACAATAAGATGTTAAACAAGGAACATGAGAAACTTGCAGATGCTTCTTCC
TCACCCATAACAGCTGCAGCAGGGAGTTAAGTAGATGCTTCTGCATCCTTGGTAGGAAGAAAGATTGTAGCTGGATTCTTTCCAGAGGTTTTCTTTTGCAGCTCAAAATATTCGAGCGTCATGAAAAATTTTGTGTACTGCCCATTTTTACCTCAATTCCGGCATTTGACTAGCAATTGGAAAGCAGTAAGGTGTTTTAC
CAGCTGCAGTCGCAGGAACTAGATACTGCTCTTGCTTGGAACCTATTGGTAGCCAGCAGTTTCTTCCCTTTTATAAGAGTATTGCATGCTGAAAAGTTCTGGCATTTTTTTATTCCATCATCTCCTATGCCATTTTTATTTATCATAGTTTGTAGATGTCAAGCTATCTGAATTAGTAGCTTATTAGTGACATGTTCGAA
GTGAATAAAAAGCATTGGAGTATTTATGCTCATTTATCTTTGTTTTAGAGCACTTCAA

Intron 3 GTATTTCCTT ... TTCTCTGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	19.89	149	10	37
A2	26.09	136	2	48
A3	24.77	161	7	53
A4	15.11	118	3	21
A5	17.65	56	7	12
A6	23.6	667	3	206
A7	22.81	873	1	258
A8	23.31	1148	3	349
A9	22.64	895	2	262
A10	21.24	612	5	165

>TRINITY_DN102944_c0_g1_i1 from sample A5 / Example spliced isoform

AAAGCGTAAGAGAGGGAAACAACGAAGTAAAGCGCCCACTCAGCACGAAACACCGTGCTGGTCGGTGACAGAAAAAAAAAAAAAACGAAAAAGGGGTTTCAGAGTGAGAGAGTTTAAATAACGAGATGATATAACTGAAGTTTACGCAGTGCGAGCAATATTTGTTTAAGACGTTTCGGGTTCGAATCCGCGTGGAGGAG
GAGCAGCAGCAGCTCGGTTGAAACAGAGGGTAGAGTACAGAAAAAGACAGGAGAGATGGATGTAATAAAGACGCAGCAGATATCTGCGAGGGCTATAGAGAAAGTGATAGTGCATCCGTTGGTGTTACTGAGCATCGTGGACAACTACAACAGAGTTGCAAGGGAAACCCGGAAACGAGTTATTGGCGTATTACTGGGAA
CCAGCCACCGCGGAATCGTAGATGTAACTAACAGCTACGCAGTGCCTTTTGAAGAAGATGACAAGGATCCAAGCATCTGGTTTTTGGATCACAACTATCATGAGTCTATGTTTGAAATGTTCAAGCGGATTAATGCAAAGGAACATGTGGTAGGATGGTATAGCACTGGTCCAAAGCTTCGGGAAAATGACTTGGATGTG
CATGAGTTGTTCCATGACTATGTGCCCAATCCTGTGCTTGTCATTATTGATGTCCAACCGAAGGAGCTGGGGATTCCTACCAAAGCATATTATGCAGTTGAGGAAGTTAAGGAGAATGCAACTCAGAAAAGCCAGAAGGTGTTTGTGCATGTGCCATCTGAAATTTGTGCACATGAAGTTGAGGAAATAGGTGTGGAGCA
CTTGCTAAGGGATGTCAAGGACACAACTATCAGTACTCTTGCAACAGAGGTGAGCGGAAAATTGACAGCTCTGAAGGGTCTCGAAGCTAGGCTGAGAGAGATTCATGGATACCTGGATCTTGTTGTTGATGGAAGACTTCCACTCAACCATGAAATTCTATACCATCTTCAGGATGTATTCAATCTGTTGCCCAACTTGA
ATGTTAATGAGTTAGTGAAGGCTTTTGCAGTGAAAACAAATGATATGATGCTGGTCATCTATCTCTCGTCCCTTATTCGGAGTGTCATTGCCATGCATAATCTCATAAACAATAAGATGTTAAACAAGGAACATGAGAAACTTGCAGATGCTTCTTCCTCACCCATAACAGCTGCAGCAGGGAGTTAAGTAGATGCTTCT
GCATCCTTGGTAGGAAGAAAGATTGTAGCTGGATTCTTTCCAGAGGTTTTCTTTTGCAGCTCAAAATATTCGAGCGTCATGAAAAATTTTGTGTACTGCCCATTTTTACCTCAATTCCGGCATTTGACTAGCAATTGGAAAGCAGTAAGGTGTTTTACCAGCTGCAGTCGCAGGAACTAGATACTGCTCTTGCTTGGAAC
CTATTGGTAGCCAGCAGTTTCTTCCCTTTTATAAGAGTATTGCATGCTGAAAAGTTCTGGCATTTTTTTATTCCATCATCTCCTATGCCATTTTTATTTATCATAGTTTGTAGATGTCAAGCTATCTGAATTAGTAGCTTATTAGTGACATGTTCGAAGTGAATAAAAAGCATTGGAGTATTTATGCTCATTTATCTTTG
TTTTAGAGCACTTCAAATAGGAAAAGCAATGGAGTAAATTTGTTTGCTTATCATTGTTTTATAGGGCCTTAAATATATGATCAGTTGTGACCTTTATTTACAGGTTGCGACGTTTGATTTTTCTTCACATTACTGAAGCTTGTTAGGTTTGATTATTTTCTTTAATAGTCTCTAAGGACTTCATATCTTCCTTTTGCTGG
CAAACTTCACCCGTAACCTTCAATGCAAGGA

>TRINITY_DN102944_c0_g1_i3 from sample A5 / Example unspliced isoform:

CCATATGTAGTTATTATAGGATAAAACATTTTTCAGATTTCATTTTCACACTAGGATTTGATGGAGGGAAGAGCCTGAAGTTGAAACTTATTGTAGGTTGGGATCTTTAATTTTTGTTGAGTGCTCTGATTCTCATCTCTCTTTTCGCAGGATGTATTCAATCTGTTGCCCAACTTGAATGTTAATGAGTTAGTGAAGGC
TTTTGCAGgtatttcctttcttgccatcttaagttgtagcatttaaaggaggtacagattaactgcttgaaactgatcgaagtaacttgctttctgaaagctgaacatttgctaagccactgccttattctctgcagTGAAAACAAATGATATGATGCTGGTCATCTATCTCTCGTCCCTTATTCGGAGTGTCATTGCCA
TGCATAATCTCATAAACAATAAGATGTTAAACAAGGAACATGAGAAACTTGCAGATGCTTCTTCCTCACCCATAACAGCTGCAGCAGGGAGTTAAGTAGATGCTTCTGCATCCTTGGTAGGAAGAAAGATTGTAGCTGGATTCTTTCCAGAGGTTTTCTTTTGCAGCTCAAAATATTCGAGCGTCATGAAAAATTTTGTG
TACTGCCCATTTTTACCTCAATTCCGGCATTTGACTAGCAATTGGAAAGCAGTAAGGTGTTTTACCAGCTGCAGTCGCAGGAACTAGATACTGCTCTTGCTTGGAACCTATTGGTAGCCAGCAGTTTCTTCCCTTTTATAAGAGTATTGCATGCTGAAAAGTTCTGGCATTTTTTTATTCCATCATCTCCTATGCCATTT
TTATTTATCATAGTTTGTAGATGTCAAGCTATCTGAATTAGTAGCTTATTAGTGACATGTTCGAAGTGAATAAAAAGCATTGGAGTATTTATGCTCATTTATCTTTGTTTTAGAGCACTTCAAATAGGAAAAGCAATGGAGTAAATTTGTTTGCTTATCATTGTTTTATAGGGCCTTAAATATATGATCAGTTGTGACCT
TTATTTACAGGTTGCGACGTTTGATTTTTCTTCACATTACTGAAGCTTGTTAGGTTTGATTATTTTCTTTAATAGTCTCTAAGGACTTCATATCTTCCTTTTGCTGGCAAACTTCACCCGTAACCTTCAATGCAAGGA

Intron 4 GTAAGGCTAT ... TCCTTTACAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	21.18	227	51	71
A2	22.71	194	51	63
A3	20.18	263	49	84
A4	21.72	164	37	54
A5	21.7	92	19	32
A6	21.42	466	94	160
A7	22.41	992	221	352
A8	21.33	603	108	219
A9	20.94	921	180	308
A10	20.41	819	131	289

>TRINITY_DN112255_c3_g1_i3 from sample A2 / Example spliced isoform

GGAGTAAAGCGCCCACTCAGCACGAAACACCGTGCTGGTCGGTGACAGAAAAAAAAAAAAACGAAAAAGGGGTTTCAGAGTGAGAGAGTTTAAATAACGAGATGATATAACTGAAGTTTACGCAGTGCGAGCAATATTTGTTTAAGACGTTTCGGGTTCGAATCCGCGTGGAGGAGGAGCAGCAGCAGCTCGGTTGAAAC
AGAGGGTAGAGTACAGAAAAAGACAGGAGAGATGGATGTAATAAAGACGCAGCAGATATCTGCGAGGGCTATAGAGAAAGTGATAGTGCATCCGTTGGTGTTACTGAGCATCGTGGACAACTACAACAGAGTTGCAAGGGAAACCCGGAAACGAGTTATTGGCGTATTACTGGGAACCAGCCACCGCGGAATCGTAGATG
TAACTAACAGCTACGCAGTGCCTTTTGAAGAAGATGACAAGGATCCAAGCATCTGGTTTTTGGATCACAACTATCATGAGTCTATGTTTGAAATGTTCAAGCGGATTAATGCAAAGGAACATGTGGTAGGATGGTATAGCACTGGTCCAAAGCTTCGGGAAAATGACTTGGATGTGCATGAGTTGTTCCATGACTATGTG
CCCAATCCTGTGCTTGTCATTATTGATGTCCAACCGAAGGAGCTGGGGATTCCTACCAAAGCATATTATGCAGTTGAGGAAGTTAAGGAGAATGCAACTCAGAAAAGCCAGAAGGTGTTTGTGCATGTGCCATCTGAAATTTGTGCACATGAAGTTGAGGAAATAGGTGTGGAGCACTTGCTAAGGGATGTCAAGGACAC
AACTATCAGTACTCTTGCAACAGAGGTGAGCGGAAAATTGACAGCTCTGAAGGGTCTCGAAGCTAGGCTGAGAGAGATTCATGGATACCTGGATCTTGTTGTTGATGGAAGACTTCCACTCAACCATGAAATTCTATACCATCTTCAGGATGTATTCAATCTGTTGCCCAACTTGAATGTTAATGAGTTAGTGAAGGCTT
TTGCAGTGAAAACAAATGATATGATGCTGGTCATCTATCTCTCGTCCCTTATTCGGAGTGTCATTGCCATGCATAATCTCATAAACAATAAGATGTTAAACAAGGAACATGAGAAACTTGCAGATGCTTCTTCCTCACCCATAACAGCTGCAGCAGGGAGTTAAGTAGATGCTTCTGCATCCTTGGTAGGAAGAAAGATT
GTAGCTGGATTCTTTCCAGAGGTTTTCTTTTGCAGCTCAAAATATTCGAGCGTCATGAAAAATTTTGTGTACTGCCCATTTTTACCTCAATTCCGGCATTTGACTAGCAATTGGAAAGCAGTAAGGTGTTTTACCAGCTGCAGTCGCAGGAACTAGATACTGCTCTTGCTTGGAACCTATTGGTAGCCAGCAGTTTCTTC
CCTTTTATAAGAGTATTGCATGCTGAAAAGTTCTGGCATTTTTTTATTCCATCATCTCCTATGCCATTTTTATTTATCATAGTTTGTAGATGTCAAGCTATCTGAATTAGTAGCTTATTAGTGACATGTTCGAAGTGAATAAAAAGCATTGGAGTATTTATGCTCATTTATCTTTGTTTTAGAGCACTTCAAATAGGAAA
AGCAATGGAGTAATTTTGTTCAGTTGTGACCTTTATTTACAGGTTGTAACATTTGATTTTTGTTCACATTATCAAGGTTATTAGTTTTGATTATTTTCTTTAATAGTCTCTAAGGACTTCATTATCTTCCTTTTTCTGGCAAATTTGGGGGAGGGCACAAAACTTGTCCTTAGGAATGAGGTACAAATTCACTTCGATTC
CTCCACTTTTCCAGTTGCTTGGAATATCTTTTCAACCCATTTGCCAAACTGATTACACAGAATCACTGATTTTATGTGTTAAACTACAATATTCACAGAAAAGAGAGTTGGGCAAGCCAAATTTCTAAATACAGGGCAAACACATATTTGGAACAACTTTTAAAACTATAAGGGAATTCAGAAAATCCATCACATAAGAA
AGCTAACACAATCACACCAGAGAGAAACTAAACATTCTCAGAGAGAAACTCAGGATCATTATACAAACTGAACATGGAAAATTGCTGCCAAAGGAATCATGCATGACCCAGCCACAGGCATCCTGTTTGAATGTCATCTTTAAGTTGGGGCTATGAGATGATGACAAGGCTTAAGGCTGACTATGGTCTTACTCACAAAA
GTTCCC

>TRINITY_DN112255_c3_g1_i7 from sample A2 / Example unspliced isoform:

GGAGTAAAGCGCCCACTCAGCACGAAACACCGTGCTGGTCGGTGACAGAAAAAAAAAAAAACGAAAAAGGGGTTTCAGAGTGAGAGAGTTTAAATAACGAGATGATATAACTGAAGTTTACGCAGTGCGAGCAATATTTGTTTAAGACGTTTCGGGTTCGAATCCGCGTGGAGGAGGAGCAGCAGCAGCTCGGTTGAAAC
AGAGGGTAGAGTACAGAAAAAGACAGGAGAGATGGATGTAATAAAGACGCAGCAGATATCTGCGAGGGCTATAGAGAAAGTGATAGTGCATCCGTTGGTGTTACTGAGCATCGTGGACAACTACAACAGAGTTGCAAGGGAAACCCGGAAACGAGTTATTGGCGTATTACTGGGAACCAGCCACCGCGGAATCGTAGATG
TAACTAACAGCTACGCAGTGCCTTTTGAAGAAGATGACAAGGATCCAAGCATCTGGTTTTTGGATCACAACTATCATGAGTCTATGTTTGAAATGTTCAAGCGGATTAATGgtaaggctatattgtttcttcacatcttttatatgctttttcacttataactgtttcatggatgtaaagaataacatgatggaaattta
tgcttaaggttattgttggtatcctttacagCAAAGGAACATGTGGTAGGATGGTATAGCACTGGTCCAAAGCTTCGGGAAAATGACTTGGATGTGCATGAGTTGTTCCATGACTATGTGCCCAATCCTGTGCTTGTCATTATTGATGTCCAACCGAAGGAGCTGGGGATTCCTACCAAAGCATATTATGCAGTTGAGGA
AGTTAAGGAGAATGCAACTCAGAAAAGCCAGAAGGTGTTTGTGCATGTGCCATCTGAAATTTGTGCACATGAAGTTGAGGAAATAGGTGTGGAGCACTTGCTAAGGGATGTCAAGGACACAACTATCAGTACTCTTGCAACAGAGGTGAGCGGAAAATTGACAGCTCTGAAGGGTCTCGAAGCTAGGCTGAGAGAGATTC
ATGGATACCTGGATCTTGTTGTTGATGGAAGACTTCCACTCAACCATGAAATTCTATACCATCTTCAGGATGTATTCAATCTGTTGCCCAACTTGAATGTTAATGAGTTAGTGAAGGCTTTTGCAGTGAAAACAAATGATATGATGCTGGTCATCTATCTCTCGTCCCTTATTCGGAGTGTCATTGCCATGCATAATCTC
ATAAACAATAAGATGTTAAACAAGGAACATGAGAAACTTGCAGATGCTTCTTCCTCACCCATAACAGCTGCAGCAGGGAGTTAAGTAGATGCTTCTGCATCCTTGGTAGGAAGAAAGATTGTAGCTGGATTCTTTCCAGAGGTTTTCTTTTGCAGCTCAAAATATTCGAGCGTCATGAAAAATTTTGTGTACTGCCCATT
TTTACCTCAATTCCGGCATTTGACTAGCAATTGGAAAGCAGTAAGGTGTTTTACCAGCTGCAGTCGCAGGAACTAGATACTGCTCTTGCTTGGAACCTATTGGTAGCCAGCAGTTTCTTCCCTTTTATAAGAGTATTGCATGCTGAAAAGTTCTGGCATTTTTTTATTCCATCATCTCCTATGCCATTTTTATTTATCAT
AGTTTGTAGATGTCAAGCTATCTGAATTAGTAGCTTATTAGTGACATGTTCGAAGTGAATAAAAAGCATTGGAGTATTTATGCTCATTTATCTTTGTTTTAGAGCACTTCAAATAGGAAAAGCAATGGAGTAATTTTGTTCAGTTGTGACCTTTATTTACAGGTTGTAACATTTGATTTTTGTTCACATTATCAAGGTTA
TTAGTTTTGATTATTTTCTTTAATAGTCTCTAAGGACTTCATTATCTTCCTTTTTCTGGCAAATTTGGGGGAGGGCACAAAACTTGTCCTTAGGAATGAGGTACAAATTCACTTCGATTCCTCCACTTTTCCAGTTGCTTGGAATATCTTTTCAACCCATTTGCCAAACTGATTACACAGAATCACTGATTTTATGTGTT
AAACTACAATATTCACAGAAAAGAGAGTTGGGCAAGCCAAATTTCTAAATACAGGGCAAACACATATTTGGAACAACTTTTAAAACTATAAGGGAATTCAGAAAATCCATCACATAAGAAAGCTAACACAATCACACCAGAGAGAAACTAAACATTCTCAGAGAGAAACTCAGGATCATTATACAAACTGAACATGGAAA
ATTGCTGCCAAAGGAATCATGCATGACCCAGCCACAGGCATCCTGTTTGAATGTCATCTTTAAGTTGGGGCTATGAGATGATGACAAGGCTTAAGGCTGACTATGGTCTTACTCACAAAAGTTCCC