NA ----> NA

Intron 1 GTCAACAGAT ... GGAGGTGAAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	65	14	17	35
A2	60	10	16	14
A3	57.14	21	18	38
A4	66.67	6	12	12
A5	38.46	8	2	8
A6	50.41	30	26	35
A7	51.27	125	103	160
A8	52.67	115	94	162
A9	52.17	66	56	88
A10	50.6	103	92	119

>TRINITY_DN47345_c0_g1_i1 from sample A10 / Example spliced isoform

GCCTTTGAAGTGTGCAGGCCATCCAAAAACAATGAGGTTTTGATGGATTGTTATTATTCCAAAATGCACACATTTCGCCACTTCGTCTTCTTAAATAACAGAAGAAGTCGGGGAAGGGCAAGACGTTTTGGGTGTGTAATGACTGCGGAGATTCGTTCGGCCAATGGTGGGGTTATTGTCCGGCCTGTAATCAAATTAAT
ACCCTGAAACGCTTTACTGAAGAGTTGGCGCCGTTGGGAGGAGGGGCAGGGACTAGAGCGGCCGAGTTGATAATTGGTGGATGCAGGCCGGATACCGAGTTCAGAGACCAACATACAGCCCACAAAGCATGGGTCGCGAATGGAACTATGAATAATAATTTGGAACCACAGCGTCTGTCAGATGTCGCTCAAGGGCATAA
TGAGGAACAGTGGCGCATTCCACTGACTGGACCTTTTGGTACAGAAGTGGCAAGGGTGTTAGGTGGCGGTTTAATACCTGGATCCTTGATTCTCATTGGTGGTGATCCTGGTGTTGGGAAAAGCACTCTTCTATTGCAGATAAGTGCTAACGTTTCGGAAGGCTGCGAGGTTAATAAACCAGCTCCGGTGCTATATGTAT
CGGCTGAAGAGAGTGTGGATCAAATAGCAAGTAGAGCTTCTCGCATGCAAATTGATAGTGAAAGTCTATTCTTGTATTCGGGCACTGATGTGGAGGACATAATTAATAAAATTAATGAGCTTTCTCCAAGGGCTGTGGTTGTGGACTCCATTCAAACAGTCTATCTGAAAGGGGCAACAGGGAGTCGTGGGGATGTCACC
CAGGTAAAAGAATGTGCAACAGCTTTTTTACTATATGCCAAGAAAAGGCAGATCCCAATTTTTCTGGTGGGGCATGTGACGAAGACTGGAGATATAGCTGGGCCTCGTGTTTTGGAGCATATTGTGGATGTGGTTCTATATTTGGAGGGGGATCGTTTATTGTCACATCGTATATTGAGAGCAGTTAAAAATCGTTTTGG
GTCAACCGATGAGATCGGAGTGTTAGAAATGGGGCGGGATGGTCTCCAAGCTATTGGAAATCCAAGTGAACTTTACATAAGTGAGCGAAATATCGATCAGGATGTATTAGCTGGTTTAGCTCTTACGGTGATTATTGATGGTTCACGACCATTCCTCATTGAAACTCAGGCTTTGTGTTACATTGGGAGATCGTCTGGGA
CAACAACTACGAGGCGTTTCAATGGCGTTGAAGACAAAAGGGCTGACCTTATTATTGCGGTGCTTGGAAGGCAGGTTGGTCTTGACCTTCATGGAAGTTCAATATTTTTGAATGTTGTTGGAGGAGTACGTGTGGAAGAAACTGCAGCAGATCTTGCATTTGCCGTCTCAATTTGTAGCAGTTTCTTGGAGATTCCTATA
CCTCTTAAAATGGCATTCATAGGGGAGATTGGTCTTGGTGGAGAACTTAGAACGGTTGCAAGGATGGATAAGCGGATAAATGAATTGGCAAAGCTGGGATTTACAAGATGTGTTATTCCCACATCATCGATGAATTCTATTAGTGGCCTTGAATGGGAGGATTTTTCAATAATACATTGTAAAAATGTGAGGGAAGTCAT
AAAGAAAGTATTTAAAATTAAACTCAAACCTGTCTCCAGCTTCATGAGGGTGGAGATGGAGGGTGAAGGTCAACAAGAGGTTGGGAGTGAGGCTTGGGGTAAAGGTGAACAAATGGGTGGGATTGACGATTGGGATGAAGACCAACACGAGGGTTGGAGTGAGGAATGGGATGAAAGTGAGAAAAAGCATGTGAGTGTAA
GTGTATGTGAGCAAACGGGTGTGGCTGTAAGTGAGGCTTGGGTTGAAGGTCAGCAAGAGGGTTGGAGTGAGGCTTGGCTTGAAGGTGAGAAAAAGCATGTAAGTGCAAGGGCATGTGAGAAAAAGGGTGTGGCTGTAAGTGTGGGCACATGTGAGCAGAAGGGTGTGGCTGTAAGTGTGGGCACATGTAAGCAAAAGGGT
GTGACTGAAAGTGTGGGCACAGATGAGAAACAAGTTGTTGGGGTTGAGCAAAAGGGTGTGACTGAAAGTGTGGAGACATGTGAGCAAAAGGGTGTGGC

>TRINITY_DN47345_c0_g1_i10 from sample A10 / Example unspliced isoform:

CATTCGTATTCGAGCGTGGCCGAACACACTCCCGCTCATTGTCGCGCAGGCCATCCAAAAACAATGAGGTTTTGATGGATTGTTATTATTCCAAAATGCACACATTTCGCCACTTCGTCTTCTTAAATAACAGAAGAAACTTCGGTGGCTCACATTTATTCAGAACCCTTAAATTCCTGCACACTTCAAAGGCTTCTAAC
AGAGATATTTACTCTCTCACCCATGCCCTGCAAATATTCAGCCATAATACTGTTAATATTCGGGGCACTGATTTTCGCAGGGCATGGATTCACACAAACGGCAGACGTCTAATGCCAGATATGAATAATAGGAGAATTAGTAGTACTAGTGGAAGTAGCAGTGCTGGAAGCGGCAATGGCAATGGCGATGGCTTCCACTC
GCCATCGAGGAAGAAGTCGGGGAAGGGCAAGACGTTTTGGGTGTGTAATGACTGCGGAGATTCGTTCGGCCAATGGTGGGGTTATTGTCCGGCCTGTAATCAAATTAATACCCTGAAACGCTTTACTGAAGAGTTGGCGCCGTTGGGAGGAGGGGCAGGGACTAGAGCGGCCGAGTTGATAATTGGTGGATGCAGGCCGG
ATACCGAGTTCAGAGACCAACATACAGCCCACAAAGCATGGGTCGCGAATGGAACTATGAATAATAATTTGGAACCACAGCGTCTGTCAGATGTCGCTCAAGGGCATAATGAGGAACAGTGGCGCATTCCACTGACTGGACCTTTTGGTACAGAAGTGGCAAGGGTGTTAGGTGGCGGTTTAATACCTGGATCCTTGATT
CTCATTGGTGGTGATCCTGGTGTTGGGAAAAGCACTCTTCTATTGCAGATAAGTGCTAACGTTTCGGAAGGCTGCGAGGTTAATAAACCAGCTCCGGTGCTATATGTATCGGCTGAAGAGAGTGTGGATCAAATAGCAAGTAGAGCTTCTCGCATGCAAATTGATAGTGAAAGTCTATTCTTGTATTCGGGCACTGATGT
GGAGGACATAATTAATAAAATTAATGAGCTTTCTCCAAGGGCTGTGGTTGTGGACTCCATTCAAACAGTCTATCTGAAAGGGGCAACAGGGAGTCGTGGGGATGTCACCCAGGTAAAAGAATGTGCAACAGCTTTTTTACTATATGCCAAGAAAAGGCAGATCCCAATTTTTCTGGTGGGGCATGTGACGAAGACTGGAG
ATATAGCTGGGCCTCGTGTTTTGGAGCATATTGTGGATGTGGTTCTATATTTGGAGGGGGATCGTTTATTGTCACATCGTATATTGAGAGCAGTTAAAAATCGTTTTGGGTCAACCGATGAGATCGGAGTGTTAGAAATGGGGCGGGATGGTCTCCAAGCTATTGGAAATCCAAGTGAACTTTACATAAGTGAGCGAAAT
ATCGATCAGGATGTATTAGCTGGTTTAGCTCTTACGGTGATTATTGATGGTTCACGACCATTCCTCATTGAAACTCAGGCTTTGTGTTACATTGGGAGATCGTCTGGGACAACAACTACGAGGCGTTTCAATGGCGTTGAAGACAAAAGGGCTGACCTTATTATTGCGGTGCTTGGAAGGCAGGTTGGTCTTGACCTTCA
TGGAAGTTCAATATTTTTGAATGTTGTTGGAGGAGTACGTGTGGAAGAAACTGCAGCAGATCTTGCATTTGCCGTCTCAATTTGTAGCAGTTTCTTGGAGATTCCTATACCTCTTAAAATGGCATTCATAGGGGAGATTGGTCTTGGTGGAGAACTTAGAACGGTTGCAAGGATGGATAAGCGGATAAATGAATTGGCAA
AGCTGGGATTTACAAGATGTGTTATTCCCACATCATCGATGAATTCTATTAGTGGCCTTGAATGGGAGGATTTTTCAATAATACATTGTAAAAATGTGAGGGAAGTCATAAAGAAAGTATTTAAAATTAAACTCAAACCTGTCTCCAGCTTCATGAGGGTGGAGATGGAGGGTGAAGGTCAACAAGAGGTTGGGAGTGAG
GCTTGGGGTAAAGGTGAACAAATGGGTGGGATTGACGATTGGGATGAAGACCAACACGAGGGTTGGAGTGAGGAATGGGATGAAAGTGAGAAAAAGCATGTGAGTGTAAGTGTATGTGAGCAAACGGGTGTGGCTGTAAGTGAGGCTTGGGTTGAAGGTCAGCAAGAGGGTTGGAGTGAGGCTTGGCTTGAAGgtcaaca
gatgggagggattgaagattgggatgaaggccaacatgagggttggggtgaggatggaggtgaagGTGAGAAAAAGCATGTAAGTGCAAGGGCATGTGAGAAAAAGGGTGTGGCTGTAAGTGTGGGCACATGTGAGCAGAAGGGTGTGGCTGTAAGTGTGGGCACATGTAAGCAAAAGGGTGTGACTGAAAGTGTGGGCA
CAGATGAGAAACAAGTTGTTGGGGTTGAGCAAAAGGGTGTGACTGAAAGTGTGGAGACATGTGAGCAAAAGGGTGTGGC