sp|Q9LYE3|ASI1_ARATH ----> Protein ANTI-SILENCING 1
Intron 1 GTGAGTCGTT ... TCTTCTGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 44.72 | 68 | 55 | 15 |
| A2 | 54.43 | 36 | 43 | 5 |
| A3 | 51.47 | 33 | 35 | 9 |
| A4 | 47.37 | 20 | 18 | 6 |
| A5 | 43.48 | 13 | 10 | 3 |
| A6 | 50 | 1 | 1 | 0 |
| A7 | 52.08 | 23 | 25 | 1 |
| A8 | 62.5 | 6 | 10 | 0 |
| A9 | 53.49 | 20 | 23 | 0 |
| A10 | 48.28 | 15 | 14 | 0 |
>TRINITY_DN121636_c6_g1_i7 from sample A1 / Example spliced isoformTTGTCTCTCAGAAAACATTGGGAGCTGAATTTCAATCAACCAGAGAACCTAACCCTTAAACACATTCCTCTTTTTCCTTTTCTTGTATCTGTCTATTTTCCCTCTAAAAAATGGAGTTTATTTACAGCACAACTCTATTATTCCATGTTAATTATGAATCTGAAACAATGCCAAATATTACACGCGAATAAATACTAAAC
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ATAAGATAATTTTATTAATGTCCAACAAATGACCAAAAAAGTAGGTCAATGGGACTAAAGGATACATCCATATGATTACAATGGCATTCATTTTGTAGACTATGGCATTTATTTTGCGGCTTGGTTATATTGCTCTTCAATTATCTTTGGTAATTGTGAGAAATATCTTGCCTTTGGTCTCTAAATCTTATCCATTGTAT
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GAGGAACCTTTTGTGATAATTCATCATGAAGTGGCCTAATTGATGTCATATCTTGCACCTCAAGATAGTGTTTAAATAATCTTAGTTTGGTTCATTGGGAGCCATAAATGGCCTAATTGATGGCAGATCTTGCACCTCAAGGTAGTGTTTAAAAAGTTTTAGTTTGGTTCATTGGGAACCATAAGGATCTAGGATGATTG
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>TRINITY_DN121636_c6_g1_i5 from sample A1 / Example unspliced isoform:CTAATGCCTTTGCTTTTATAACTATTTTACTTTTTATTTTTTACCAAGCCTCTCTCACTAGTTTCTAATTTTGTAGATAATCTTTGAAGCCATGATATTTTATAACATCGCCTCGCTTACGTTACCATTCACATTGCAACTCTTAACTCGGAGCCAGAGCCAATGGTAGGGTTTGGGTTTGAGTTCATATATCCTTGTAT
GAGCTATAAGATAATAGGGATGGGCACTAGGCCGCTGGTAATTGAAGCATGACTTGAATATTCTCCACTTGAGCGGCCCATGACCTTTTAAAACCTCTGTTTCCCCCTTTTAAGGCGCCCTTTCGTGCTGATGGATGTCCATTCACCTTGAGACGAAGACCGGAATTCTGCATTTCCGCAAGATATCACAAACCTACCTT
TGCATTTCGAAGTTTACAAACTTTCAGTGGCGAATGCCAAGCCCTAAACATCGTTTGCAGTTTGCTCGGGGTTTAGGGCTCGGCTGGACAGTTTCATTTTAAAACCTTAAGGTAAATTCAGATTTGTCATGCCAGATATTCTTCATAAAAGCAAAAGAACTGATTGAAGGACAAAATAAGGGGCAGCAGAGAGCCAAAAC
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GGTACATCCGAATCAATACACAGTGGCAGTGCAAATGCATTTTCTATAAAAGAGGATCCAATCTATGAGATCTAAGACCTAGTAATGAGATTCTATCAACCAGTAGTAAAATACAAAGCTGTGAACCACAAAGAAGCACTGTCAAGACTCAAGAACTTGAGATACTGGTAGAATGTCTTGACTGAAGGTAACCGTGAAGA
GTGCTCAGCATCTTCTGGTGCCATTTCCTACTTATGAGGAGGAAAAGTTGCTATCCTCTGATTCTGTAGTATGTACTTGCAGGAAAGGGACCTCTCTTACTATCCGAGGCTGAAGCAAAGAAACTCCCGATGGAAGACCGTCTAGATGAAGTGGAAAGAAGTTGGGCTTTTCTTTTTTCTCCCGAGTTTTTCAAAACATT
CTCTATTCATAGTTTGGGGATTGGAGGATGGTTTCTTAAAAGGCAGGGATTTTTCATTTTAGGTTCAGCCTGGAAGAATGTTTTGTGATAATTCATCATACTGATGAGGAGGAGAAGTTGCTATCCTTTGATTCTGTAGCATGTGCTTTCAGGAAAGGGATCTCTCTTAATATCTGAGGCTTGAGCAAAGAAACTGATGG
AAGACTTTCTAGACGAAGTGGAAGGTAGTTGGGCTTTTCTTTTTAATCCTCCCGACTTTTTAAAAACATTCTCTATTCATTGTTTGGTTATTGGAGGAGGGTTTCAACTTTCTTAGAAGGCAGGGTTTTTTCATTTTAGGTTCCCCCTGGAGGAACCTTTTGTGATAATTCATCATGAAGTGGCCTAATTGATGTCATAT
CTTGCACCTCAAGATAGTGTTTAAATAATCTTAGTTTGGTTCATTGGGAGCCATAAATGGCCTAATTGATGGCAGATCTTGCACCTCAAGGTAGTGTTTAAAAAGTTTTAGTTTGGTTCATTGGGAACCATAAGGATCTAGGATGATTGTCTCACTGGTGGCAAGCCATTGCCTAGATTAATCTCAATACACAATCTAGC
ACAAGTAAACAAACCTTGCTTTCTCTAGTTCTGTTATCCAAGCTGAGATGACCAACCACAGAGTTTCCCATTTTTAAAAATTTTTCTTCCTAAAAGAAGTGATTGGGGAAATTAGGGAGTCTCATCCATATAGGTATGGTGGTGACACACTGACAGTCATGGAAGCTGTGTTGAACTCAGGTAACCAAGGTTTCAGGAAG
ATGGCAGCTCTTCCCCAAAACCGTGGTCCAGTCTCAAATATTTCAATTTGTTTCCTTAATCTTATCTTCTGGGTTTCTAAAGTAAACAATGAAAAATCGTTATTTCTAAAATATATTTAGAATTTATTTGTCTAGTGATCACTGATTGCTTACCCAGTTTGCCACTACATATGCATTCAGTCAGAGAACATTGAATCTAC
AAATATGAGTGCATTCCATGCAATTTTGGACTTTCTAGCTCGGTCTGAAGAAACCCATAGAACTGGGTCTTCCTCTGATTTTCCTGTGATGAATATTCCGCCTGACCTGCTTTTCTTCTCCGTTGGAGGTCAGCACAGCAAATGCTTTCCTGCTTTGGCATCATTCTTATAAGGGGAGTGGCAGCATTTGAAGGGATATA
TCTTCCTCCACCATTCAAATCAAGCAGCCATACATTATATGGTTGATCGTCAGATGTCTTAAAAATGAAGTTCACCATCTGGCAAGATTTATTCAAACATTAGTCAACTTTTTATATCGGAATTATCATTGCCAAATTTTAGAAGGGCTAATATTGTATTATGGTTTTTCCCTGAAACATTTTTAAGTGACATATAGAGT
TTCTGATTTGTAAAATAGTAAGATTCACTGCTTATTTCGTGCTGACATAAAACATTTCATTCCTTAATGTGTTTTCCCTGTATCTAGTACTAATTCAATTTTTTATTTAATCTTAACATCTTATATCTCACTTTCATATGTATGCTACATAATGTAAAATTCTAAATATTGGTAGGGTTTGGGATCATGGCGTTTTTATT
CTGAAACAGACTTTTGTTTAACATTTGGCATATATTACTCCATCCTAATGGTGTTTAATGTATTACTCCATCATTGCAGCCTCTTTCTTTTTGGATTTGAAGGTTTCTGTCATCATAGAATTTTTTCCATTGTAAATCTCCCTTTCTTATAGGTGGTTTGCTCATGCTTACATGACACTGTTAGATAGTTGTTTATAATG
AAATTTTCACCTTCAGTGATATGCTTCCATACTCTGGAGCTTTTTTTTTTTTTTTTTTATA