sp|Q8RWE8|GGAP1_ARATH ----> GDP-L-galactose phosphorylase 1
Intron 1 GTTAGCTATT ... TATTTTGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 47.54 | 24.8 | 22.8 | 22 |
| A2 | 48.82 | 24.3 | 33 | 12 |
| A3 | 55.01 | 20.2 | 31.8 | 17 |
| A4 | 41.45 | 18.4 | 12 | 14 |
| A5 | 68.42 | 3 | 8 | 5 |
| A6 | 40.9 | 46.3 | 34.1 | 30 |
| A7 | 32.85 | 51.8 | 16.6 | 34 |
| A8 | 35.22 | 127.6 | 63.6 | 75 |
| A9 | 33.21 | 63.8 | 30.5 | 32.9 |
| A10 | 28.37 | 29.5 | 13.2 | 10 |
>TRINITY_DN126312_c6_g1_i3 from sample A1 / Example spliced isoformGACAATTGATGACACTGTACTGTCAGCAGAATGTCCATGTCTTCGCTGGTCTCACAGCATCGACCGAAAAAGAATTTTAAACAAGACATCAGATTCTCGAGAATGTGGCAATATAATGCAGTCTATTTTTCTGGAGGAACTATATGAACTGAAGGATTTAAAGCATGTTCTTTCATGTCAGGGAAAGTCAAGGTATAACA
ATGACTCAAATTGTAGTTGCATTTTGTTCCCTGCTTTGCGATAATTTGCTGCCATGCAATCCATAAAAAGATGTCAATATATTTCTCCTTCTTCCTTACAAAGAACACTTCTTGAAGGCGTGACTTTGGGTATAGAAGAGTATAACCAGCACTGATTTCAGTTTACACTCAGAATTTCAGGGGGCTGGACTGAGATAATA
AGTTGTGATGAATTTCTCCAACCGTGTATTTGCCTATCTTAATTGGTTTCCTCCAAATCAAAACATCCTCTCTATCTTCAGCTTCCAGATACCATGTCTTGATTATATTGGATATCTTCCTAGTCATCTTTCTCTTTCTATTTCCATTTCCTTATTGCTTGTTCCTGCAAACAAAAGACCACAACCACTGTGGGTAAGTT
GAGTGAAGTTATAAAACTGTATTTGAAGTGGACAAGGTGCTGTAGGAATTTGACCTCAGTACATTAAACTTTTAGGAAGTTGGTCAGGAAGAGGTGCTATTTCGTTTTGGTTAAAGTGAGGAAAACAGAGTTCATTAATTGGAAAAGGACCTTGTCTTGGACAATCCAAACCTAATCTCTATTAGTGTAATATAAATTAA
TGATGATGCCAGTACTTTTTGATGCAGTGTTTGATGTGTTCTGAATGTTGAAAGATGATGTCCATTGATCATCTTTGCTCTACTGTACGAAAATCT
>TRINITY_DN126312_c6_g1_i1 from sample A1 / Example unspliced isoform:AATGTGGTAATACATTAATGAATGATGTATTGAAGAAGCAGTTGATGATTGTTAAAGTTGAAAAAGTGATAAAAAGCTATACACACTGTTCACCCCCCCCTCTCAGTGTGTTCGGTGTGTCCAACAACAATCTCTGGTCTTGTAAACAGCAGGGAAATCATTTCTGAAAGACCAAATGATGGTAATGATGTTCAGGGTAT
GATGATGGTGATACTGTGGTGTTGAAACAAGGGATGGAGAATTAGATTGATGGTTTATTACTGACGTATCATGTATATGTGTCTATGTTTCAACTCTTCTAAGATATGATTTTCAAGTATTTCAAGAATTATTTGTAATGTATGAAATGAGTAGTACTTTAGACATGTTCCTGTTTCTGCTCTGAAAACTTTATCTAGAG
TTGGGGCAATTTTACACTGTATTTTATTTTTCTTTGTAGTGGAATGACAGTACTAAGATACAGTGCAATGGTAATAATGGATGAATGATTTGAGTTGTTTACTGTTAGGGGATTTCTCTCCAAATTGTACGTCTCTATAATAATGCTTGTTTTGTTGCAAGATTTTTGAAGCACAGAATTTTAAACAAGACATCAGATTC
TCGAGAATGTGGCAATATAATGCAGTCTATTTTTCTGGAGGAACTATATGAACTGAAGGATTTAAAGCATGTTCTTTCATGTCAGgttagctattattggtggttggaaattggaacgctttccattggcagtcataggtttatttccttgatacttgcttattttattctttttttatttttatttttgaagtataatg
ttattacatgtcattttgtgctactcattacaactgatctttcacaagatcacataatatcactctcgtacaattcttttggtgtttattttgcagGGAAAGTCAAGGTATAACAATGACTCAAATTGTAGTTGCATTTTGTTCCCTGCTTTGCGATAATTTGCTGCCATGCAATCCATAAAAAGATGTCAATATATTTC
TCCTTCTTCCTTACAAAGAACACTTCTTGAAGGCGTGACTTTGGGTATAGAAGAGTATAACCAGCACTGATTTCAGTTTACACTCAGAATTTCAGGGGGCTGGACTGAGATAATAAGTTGTGATGAATTTCTCCAACCGTGTATTTGCCTATCTTAATTGGTTTCCTCCAAATCAAAACATCCTCTCTATCTTCAGCTTC
CAGATACCATGTCTTGATTATATTGGATATCTTCCTAGTCATCTTTCTCTTTCTATTTCCATTTCCTTATTGCTTGTTCCTGCAAACAAAAGACCACAACCACTGTGGGTAAGTTGAGTGAAGTTATAAAACTGTATTTGAAGTGGACAAGGTGCTGTAGGAATTTGACCTCAGTACATTAAACTTTTAGGAAGTTGGTC
AGGAAGAGGTGCTATTTCGTTTTGGTTAAAGTGAGGAAAACAGAGTTCATTAATTGGAAAAGGACCTTGTCTTGGACAATCCAAACCTAATCTCTATTAGTGTAATATAAATTAATGATGATGCCAGTACTTTTTGATGCAGTGTTTGATGTGTTCTGAATGTTGAAAGATGATGTCCATTGATCATCTTTGCTCTACTG
TACGAAAATCT
Intron 2 GTCTCATAAT ... ACTCGTGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 59.32 | 36 | 39 | 66 |
| A2 | 57.26 | 25 | 31 | 36 |
| A3 | 75 | 12 | 26 | 46 |
| A4 | 62.5 | 18 | 25 | 35 |
| A5 | 55.14 | 8 | 12 | 7.7 |
| A6 | 51.41 | 172 | 230 | 134 |
| A7 | 51.12 | 164 | 203 | 140 |
| A8 | 54.92 | 158 | 230 | 155 |
| A9 | 52.96 | 163 | 216 | 151 |
| A10 | 53.48 | 127 | 189 | 103 |
>TRINITY_DN121429_c3_g1_i10 from sample A2 / Example spliced isoformCTCCGGGGTTGTGGTGTAATGGCGTCTGAAGGATGAGGGGGTTATGTAAACGTCGAGTTTTGGTCGCTGTCAGAGACAAAACCCTATGTCCAAGGGCCATGCAGAAATGAGGAGGGGGGTTATGTAAACACCGAGGTTTGGTCGCTGTCAGAGACAAAACCCTACGGCCATGGGTGACGCAGAACTACGGAGCGGATGGG
GAAGACAATTGATGACACTGTACTGTCAGCAGAATGTCTTCGCCGGTCTCACAGCAGCGACCGAAAAAGTATCAAAAGTACTTGGTGATGTGAAGAAGTTTTCTTCTAAACTCCAGTTAGAGGAAGTTCCTCGCTGCAGCTTCTGGCCATTGCAGTTTGAGTACAGTCACCGAAGTGATGAGAACATTGCACTCTATTTT
TTTGCCAAAGATCATGAGAGG
>TRINITY_DN121429_c3_g1_i13 from sample A2 / Example unspliced isoform:CTCCGGGGTTGTGGTGTAATGGCGTCTGAAGGATGAGGGGGTTATGTAAACGTCGAGTTTTGGTCGCTGTCAGAGACAAAACCCTATGTCCAAGGGCCATGCAGAAATGAGGAGGGGGGTTATGTAAACACCGAGGTTTGGTCGCTGTCAGAGACAAAACCCTACGGCCATGGGTGACGCAGAACTACGGAGCGGATGGG
GAAGACAATTGATGACACTGTACTGTCAGCAGAATGTCTTCGCCGGTCTCACAGCAGCGACCGAAAAAGgtctcataatttgtgattccattttgcaaaggtggctttgaagttagaaacaaggcaaattattttaactactttgatggaatatcaactcgtgcagTATCAAAAGTACTTGGTGATGTGAAGAAGTTTTC
TTCTAAACTCCAGTTAGAGGAAGTTCCTCGCTGCAGCTTCTGGCCATTGCAGTTTGAGTACAGTCACCGAAGTGATGAGAACATTGCACTCTATTTTTTTGCCAAAGATCATGAGAGG
Intron 3 GTTAGCTATT ... GCAGTCATAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 40.17 | 24.7 | 17 | 16 |
| A2 | 47.49 | 24 | 27 | 15 |
| A3 | 46.7 | 20 | 19.7 | 15 |
| A4 | 34.17 | 18.3 | 10 | 9 |
| A5 | 50 | 3 | 3 | 3 |
| A6 | 40.47 | 46.3 | 29 | 34 |
| A7 | 35.01 | 51.7 | 16.7 | 39 |
| A8 | 36.2 | 127.3 | 64.3 | 80 |
| A9 | 32.54 | 63.7 | 30.3 | 31 |
| A10 | 33.67 | 29.3 | 17.7 | 12 |
>TRINITY_DN126312_c6_g1_i3 from sample A1 / Example spliced isoformGACAATTGATGACACTGTACTGTCAGCAGAATGTCCATGTCTTCGCTGGTCTCACAGCATCGACCGAAAAAGAATTTTAAACAAGACATCAGATTCTCGAGAATGTGGCAATATAATGCAGTCTATTTTTCTGGAGGAACTATATGAACTGAAGGATTTAAAGCATGTTCTTTCATGTCAGGGAAAGTCAAGGTATAACA
ATGACTCAAATTGTAGTTGCATTTTGTTCCCTGCTTTGCGATAATTTGCTGCCATGCAATCCATAAAAAGATGTCAATATATTTCTCCTTCTTCCTTACAAAGAACACTTCTTGAAGGCGTGACTTTGGGTATAGAAGAGTATAACCAGCACTGATTTCAGTTTACACTCAGAATTTCAGGGGGCTGGACTGAGATAATA
AGTTGTGATGAATTTCTCCAACCGTGTATTTGCCTATCTTAATTGGTTTCCTCCAAATCAAAACATCCTCTCTATCTTCAGCTTCCAGATACCATGTCTTGATTATATTGGATATCTTCCTAGTCATCTTTCTCTTTCTATTTCCATTTCCTTATTGCTTGTTCCTGCAAACAAAAGACCACAACCACTGTGGGTAAGTT
GAGTGAAGTTATAAAACTGTATTTGAAGTGGACAAGGTGCTGTAGGAATTTGACCTCAGTACATTAAACTTTTAGGAAGTTGGTCAGGAAGAGGTGCTATTTCGTTTTGGTTAAAGTGAGGAAAACAGAGTTCATTAATTGGAAAAGGACCTTGTCTTGGACAATCCAAACCTAATCTCTATTAGTGTAATATAAATTAA
TGATGATGCCAGTACTTTTTGATGCAGTGTTTGATGTGTTCTGAATGTTGAAAGATGATGTCCATTGATCATCTTTGCTCTACTGTACGAAAATCT
>TRINITY_DN126312_c6_g1_i2 from sample A1 / Example unspliced isoform:GACAATTGATGACACTGTACTGTCAGCAGAATGTCCATGTCTTCGCTGGTCTCACAGCATCGACCGAAAAAGAATTTTAAACAAGACATCAGATTCTCGAGAATGTGGCAATATAATGCAGTCTATTTTTCTGGAGGAACTATATGAACTGAAGGATTTAAAGCATGTTCTTTCATGTCAGgttagctattattggtggt
tggaaattggaacgctttccattggcagtcatagGGAAAGTCAAGGTATAACAATGACTCAAATTGTAGTTGCATTTTGTTCCCTGCTTTGCGATAATTTGCTGCCATGCAATCCATAAAAAGATGTCAATATATTTCTCCTTCTTCCTTACAAAGAACACTTCTTGAAGGCGTGACTTTGGGTATAGAAGAGTATAACC
AGCACTGATTTCAGTTTACACTCAGAATTTCAGGGGGCTGGACTGAGATAATAAGTTGTGATGAATTTCTCCAACCGTGTATTTGCCTATCTTAATTGGTTTCCTCCAAATCAAAACATCCTCTCTATCTTCAGCTTCCAGATACCATGTCTTGATTATATTGGATATCTTCCTAGTCATCTTTCTCTTTCTATTTCCAT
TTCCTTATTGCTTGTTCCTGCAAACAAAAGACCACAACCACTGTGGGTAAGTTGAGTGAAGTTATAAAACTGTATTTGAAGTGGACAAGGTGCTGTAGGAATTTGACCTCAGTACATTAAACTTTTAGGAAGTTGGTCAGGAAGAGGTGCTATTTCGTTTTGGTTAAAGTGAGGAAAACAGAGTTCATTAATTGGAAAAG
GACCTTGTCTTGGACAATCCAAACCTAATCTCTATTAGTGTAATATAAATTAATGATGATGCCAGTACTTTTTGATGCAGTGTTTGATGTGTTCTGAATGTTGAAAGATGATGTCCATTGATCATCTTTGCTCTACTGTACGAAAATCT
Intron 4 GTAGATCTCT ... TTTGTGGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 13.95 | 173 | 5 | 28 |
| A2 | 13.72 | 170 | 4 | 27 |
| A3 | 16.92 | 137.7 | 7 | 28 |
| A4 | 18.83 | 108 | 3 | 25 |
| A5 | 13.49 | 64.3 | 2 | 10 |
| A6 | 17.69 | 993 | 14 | 213 |
| A7 | 17.61 | 595.3 | 16 | 127 |
| A8 | 16.17 | 784.7 | 9 | 151 |
| A9 | 17.18 | 569.7 | 15 | 118 |
| A10 | 14.39 | 322 | 12 | 54 |
>TRINITY_DN44150_c0_g1_i13 from sample A6 / Example spliced isoformCTTCAGTGATTTCGTCTGTCCAAGACAGTGAGTTGAGTTGAGGTCGGCTCCGGGGTTGTGGTGTAATGGCGTCTGAAGGATGAGGGAGTTATGTAAACGTCGAGTTTTGGTCGCTGTCAGAGACAAAACCCTATGTCCAAGGGCCATGCAGAAATGAGGAGGGGGGTTATGTAAACACCGAGGTTTGGTCGCTGTCAGAG
ACAAAACCCTACGGCCATGGGTGACGCAGAACTACGGAGCGGATGGGGAAGACAATTGATGACACTGTACTGTCAGCAGAATGTCTTCGCCGGTCTCACAGCAGCGACCGAAAAAGGTTGTGGCTTCCCAAGATTGGCCTCAAGTCACTAAATATGCAGGTTTAGTTTGTGCCCGAGCACATTGTCAAGAACTTATTCAA
GATCTTTATAAATTCTGGCAGGATCCTGTGCGAGGCACTTTAACTGGAGGCATGATAAAGGAATTGTTGATATCCTTCCGAAGGAATACAGGGCACAAGCCGGAGCGTATAATATTTTACAGAGATGGAGTAAGCGAGGGGCAGTTTTATCAAGTTCTATTGTATGAGTTAGATGCTATTCGCAAGGCCTGTGCATCTCT
TGAACCAAATTATCAACCTCCAGTGACTTTTGTGGTTGTTCAAAAGCGTCACCACACCAGGCTCTTTGCAAACAACCACCAAGATCGGTATGCTACAGACAAGAGTGGAAACATATTACCAGGCACTGTAGTGGATTCCAAAATTTGCCATCCCACAGAGTTTGACTTTTACCTATGCAGCCATGCTGGTATTCAGGGAA
CTAGCAGACCTGCCCATTATCATGTTCTTTGGGATGAAAACAAATTTACAGCTGATGGGTTGCAGTCCTTAACTAACAACCTCTGTTACACATATGCAAGATGTACACGCTCAGTTTCTATAGTTCCGCCTGCATATTATGCCCATCTGGCTGCATTTAGGGCTCGGTTTTATATGGAGCCTGAAACATCAGATAGTGGT
TCCTTATCTAGTGGTGTTCCTGGTAGTCGAATGACTGCTGCTAGTTCAGGTTCTCGGAGCACTCGTGTACCGGCAGGAACAACCGTTCGGCCTTTGCCGGCTCTGAAAGAAAATGTGAAGAGAGTCATGTTTTATTGTTAGAACTTGGTCCTAAGTTCTATATAGCATCCCTTTTTATGGGTTTAAGTAGGCGCAATTGA
GTGAAAGGCTAAGTGCATCACTATGATGCTTTTCAAATTGCATCTGAAAGATTTGGATTTGGAAAACTAAAGACCACAATTAATCACTTGCTTTCCACCTCTTGTACTGTTTGACATTTTTTAAATTGGCTATAGCCATTTAAATTGAAGAGACAACTATAAGCTTAGTGTCAACATTTGTGTCAAGTCTGTCGAGTTTC
ATGTTTTTTGAATTACAATTGGGAAAAATCATCGATACATGGGGCGTAAGTTGGCATCATGGTGTGAATCAATTAGTTATTTATTATGTGAG
>TRINITY_DN44150_c0_g1_i16 from sample A6 / Example unspliced isoform:CTTCTTGCGGCTAAGATGTTTTGTTGTCTGACATAGTAGAGATGAACACTTGGACTGGAAGGTTAACTGATCCTTGTTGATAATGTTACAGGGAACTAGCAGACCTGCCCATTATCATGTTCTTTGGGATGAAAACAAATTTACAGCTGATGGGTTGCAGTCCTTAACTAACAACCTCTGTTACACgtagatctctccct
catcctctattctcctgcattgtgtagataagataacttttttaccagttttatagtttcaggttgctattgtcatgtttaatcagtgggatataaattttatagtttcaggttgcttttgtcatgtttaatcggtgcgatataaatttgaagttctagatacacaatataaatagctatgtacctctagctgattttag
gtgaatcttaattaatgtttgaaaatcagttctttagtaaattatcgctctcctgctttgataaaggatgtgtaaatacctttgttgaaaatggatgtttaaatactctgtttattttctgtgctcatccaattgaaaactgggatctggtttttgtccttgaagttgaaacagttttagaaaaaagcaaactccaaact
ctttgtatatttgattgggtttctgttgacttatatcgtgtgttttgtggcagATATGCAAGATGTACACGCTCAGTTTCTATAGTTCCGCCTGCATATTATGCCCATCTGGCTGCATTTAGGGCTCGGTTTTATATGGAGCCTGAAACATCAGATAGTGGTTCCTTATCTAGTGGTGTTCCTGGTAGTCGAATGACTGC
TGCTAGTTCAGGTTCTCGGAGCACTCGTGTACCGGCAGGAACAACCGTTCGGCCTTTGCCGGCTCTGAAAGAAAATGTGAAGAGAGTCATGTTTTATTGTTAGAACTTGGTCCTAAGTTCTATATAGCATCCCTTTTTATGGGTTTAAGTAGGCGCAATTGAGTGAAAGGCTAAGTGCATCACTATGATGCTTTTCAAAT
TGCATCTGAAAGATTTGGATTTGGAAAACTAAAGACCACAATTAATCACTTGCTTTCCACCTCTTGTACTGTTTGACATTTTTTAAATTGGCTATAGCCATTTAAATTGAAGAGACAACTATAAGCTTAGTGTCAACATTTGTGTCAAGTCTGTCGAGTTTCATGTTTTTTGAATTACAATTGGGAAAAATCATCGATAC
ATGGGGCGTAAGTTGGCATCATGGTGTGAATCAATTAGTTATTTATTATGTGAG
Intron 5 GTATAACAAT ... TTACACTCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 65.45 | 12 | 14.5 | 31 |
| A2 | 84.16 | 4 | 12.5 | 30 |
| A3 | 77.13 | 6 | 15.5 | 25 |
| A4 | 67.01 | 8 | 8.5 | 24 |
| A5 | 100 | 0 | 4 | 5 |
| A6 | 84.41 | 12 | 40 | 90 |
| A7 | 77.64 | 20 | 52 | 87 |
| A8 | 69.78 | 62 | 94.5 | 192 |
| A9 | 71.13 | 29 | 37 | 106 |
| A10 | 50.64 | 37 | 18 | 58 |
>TRINITY_DN47736_c3_g1_i6 from sample A10 / Example spliced isoformGGCGGCATGGCATTTTAAAATGAGCAGATCAAAAGGAGGAATGGCTTTCAACGACCTCTCCAAATGGCTAATGGTTAATTGGATAAATAGGTTCATCTATGAGATGTGGCCTTATCTTGATAAGAAATGAGGAGGGGGCCGGGGGGTTATGTAAACACCGAGGTTTGGTCGCTGTCAGAGACAAGACCCTACGGCCATGG
GTGATGCAGAACTACATAGCGGATGGGAAAGACAATTGATGACACTGTACTGTCAGCAGAATGTCCATGTCTTCGCTGGTCTCACAGCATCGACCGAAAAAGGTTAGCTATTATTGGTGGTTGGAAATTGGAACGCTTTCCATTGGCAGTCATAGGGAAAGTCAAGAATTTCAGGGGGCTGGACTGAGATAATAAGTTGT
GATGAATTTCTCCAACCGTGTATTTGCCTATCTTAATTGGTTTCCTCCAAATCAAAACATCCTCTCTATCTTCAGCTTCCAGCTACCATGTCTTGATTATATTGGATATCTTCCTAGTCATCTTTCTCTTTCTATTTCCATTTCCTTATTGCTTGTTCCTGCAAACAAAAGACCACAACCACTGTGGGTAAGTTGAGTGA
AGTTATAAAACTGTATTTGAAGTGGACAAGGTGCTGTAGGAATTTGACCTCAGTACATTAAACTTTTAGGAAGTTGGTCAGGAAGAGGTGCTATTTCGTTTTGGTTAAAGTGAGGAAAACAGAGTTCATTAATTGGAAAAGGACCTTGTCTTGGACAATCCAAACCTAATCTCTATTAGTGTAATATAAATTAATGATGA
TGCCAGTACTTTTTGATGCA
>TRINITY_DN47736_c3_g1_i5 from sample A10 / Example unspliced isoform:GGCGGCATGGCATTTTAAAATGAGCAGATCAAAAGGAGGAATGGCTTTCAACGACCTCTCCAAATGGCTAATGGTTAATTGGATAAATAGGTTCATCTATGAGATGTGGCCTTATCTTGATAAGAAATGAGGAGGGGGCCGGGGGGTTATGTAAACACCGAGGTTTGGTCGCTGTCAGAGACAAGACCCTACGGCCATGG
GTGATGCAGAACTACATAGCGGATGGGAAAGACAATTGATGACACTGTACTGTCAGCAGAATGTCCATGTCTTCGCTGGTCTCACAGCATCGACCGAAAAAGGTTAGCTATTATTGGTGGTTGGAAATTGGAACGCTTTCCATTGGCAGTCATAGGGAAAGTCAAGgtataacaatgactcaaattgtagttgcattttg
ttccctgctttgcgataatttgctgccatgcaatccataaaaagatgtcaatatatttctccttcttccttacaaagaacacttcttgaaggcgtgactttgggtatagaagagtataaccagcactgatttcagtttacactcagAATTTCAGGGGGCTGGACTGAGATAATAAGTTGTGATGAATTTCTCCAACCGTG
TATTTGCCTATCTTAATTGGTTTCCTCCAAATCAAAACATCCTCTCTATCTTCAGCTTCCAGCTACCATGTCTTGATTATATTGGATATCTTCCTAGTCATCTTTCTCTTTCTATTTCCATTTCCTTATTGCTTGTTCCTGCAAACAAAAGACCACAACCACTGTGGGTAAGTTGAGTGAAGTTATAAAACTGTATTTGA
AGTGGACAAGGTGCTGTAGGAATTTGACCTCAGTACATTAAACTTTTAGGAAGTTGGTCAGGAAGAGGTGCTATTTCGTTTTGGTTAAAGTGAGGAAAACAGAGTTCATTAATTGGAAAAGGACCTTGTCTTGGACAATCCAAACCTAATCTCTATTAGTGTAATATAAATTAATGATGATGCCAGTACTTTTTGATGCA
Intron 6 GTTTATTTCC ... TATTTTGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 62.69 | 15.5 | 30.1 | 22 |
| A2 | 57.79 | 13.9 | 26.2 | 12 |
| A3 | 58.25 | 15 | 25.2 | 17 |
| A4 | 57.38 | 9.5 | 11.6 | 14 |
| A5 | 57.91 | 4.1 | 5.9 | 5 |
| A6 | 43.06 | 37.2 | 26.1 | 30 |
| A7 | 35.04 | 44.8 | 13.9 | 34 |
| A8 | 40.46 | 89.8 | 46.4 | 75 |
| A9 | 45.77 | 36.8 | 28.5 | 32.9 |
| A10 | 33.26 | 16.8 | 5.9 | 10 |
>TRINITY_DN126312_c6_g1_i2 from sample A1 / Example spliced isoformGACAATTGATGACACTGTACTGTCAGCAGAATGTCCATGTCTTCGCTGGTCTCACAGCATCGACCGAAAAAGAATTTTAAACAAGACATCAGATTCTCGAGAATGTGGCAATATAATGCAGTCTATTTTTCTGGAGGAACTATATGAACTGAAGGATTTAAAGCATGTTCTTTCATGTCAGGTTAGCTATTATTGGTGGT
TGGAAATTGGAACGCTTTCCATTGGCAGTCATAGGGAAAGTCAAGGTATAACAATGACTCAAATTGTAGTTGCATTTTGTTCCCTGCTTTGCGATAATTTGCTGCCATGCAATCCATAAAAAGATGTCAATATATTTCTCCTTCTTCCTTACAAAGAACACTTCTTGAAGGCGTGACTTTGGGTATAGAAGAGTATAACC
AGCACTGATTTCAGTTTACACTCAGAATTTCAGGGGGCTGGACTGAGATAATAAGTTGTGATGAATTTCTCCAACCGTGTATTTGCCTATCTTAATTGGTTTCCTCCAAATCAAAACATCCTCTCTATCTTCAGCTTCCAGATACCATGTCTTGATTATATTGGATATCTTCCTAGTCATCTTTCTCTTTCTATTTCCAT
TTCCTTATTGCTTGTTCCTGCAAACAAAAGACCACAACCACTGTGGGTAAGTTGAGTGAAGTTATAAAACTGTATTTGAAGTGGACAAGGTGCTGTAGGAATTTGACCTCAGTACATTAAACTTTTAGGAAGTTGGTCAGGAAGAGGTGCTATTTCGTTTTGGTTAAAGTGAGGAAAACAGAGTTCATTAATTGGAAAAG
GACCTTGTCTTGGACAATCCAAACCTAATCTCTATTAGTGTAATATAAATTAATGATGATGCCAGTACTTTTTGATGCAGTGTTTGATGTGTTCTGAATGTTGAAAGATGATGTCCATTGATCATCTTTGCTCTACTGTACGAAAATCT
>TRINITY_DN126312_c6_g1_i5 from sample A1 / Example unspliced isoform:GTGGTTTTTCCCCCAAGACTTGGGTTCCACATAAAAATATTGTGTACTGTGTTTTGCTATGCTTCCTATGTGATGATGATAGAATGAGTTGTAATTGTTAATAATGTTGATGATATAATGATAATGTGATAATGGATTAATGAATGATGTATTGAATAAGCTGTTGATGATTGTTAAAGTTGAAAAAGTGATAAAAAGCT
ATACACACTGTTCACCCCCCCCTCTCAGTGTGTTCGGTGTGTCCAACAACAATCTCTGGTCTTGTAAACAGCAGGGAAATCATTTCTGAAAGACCAAATGATGGTAATGATGTTCAGGGGAACATCTTAGCTAATACAAGGATATATGATGATGGTGATACTGTGGTGTTGAAACAAGGGATGGAGAATTAGATTGATGG
TTTATTACTGACGTATCATGTATATGTGTCTATGTTTCAACTCTTCTAAGATATGATTTTCAAGTATTTCAAGAATTATTTGTAATGTATGAAATGAGTAGTACTTTAGACATGTTCCTGTTTCTGCTCTGAAAACTTTATCTAGAGTTGGGGCAATTTTACACTGTATTTTATTTTTCTTTGTAGTGGAATGACAGTAC
TAAGATACAGTGCAATGGTAATAATGGATGAATGATTTGAGTTGTTTACTGTTAGGGGATTTCTCTCCAAATTGTACGTCTCTATAATAATGCTTGTTTTGTTGCAAGATTTTTGAAGCACAGAATTTTAAACAAGACATCAGATTCTCGAGAATGTGGCAATATAATGCAGTCTATTTTTCTGGAGGAACTATATGAAC
TGAAGGATTTAAAGCATGTTCTTTCATGTCAGGTTAGCTATTATTGGTGGTTGGAAATTGGAACGCTTTCCATTGGCAGTCATAGgtttatttccttgatacttgcttattttattctttttttatttttatttttgaagtataatgttattacatgtcattttgtgctactcattacaactgatctttcacaagatcac
ataatatcactctcgtacaattcttttggtgtttattttgcagGGAAAGTCAAGGTATAACAATGACTCAAATTGTAGTTGCATTTTGTTCCCTGCTTTGCGATAATTTGCTGCCATGCAATCCATAAAAAGATGTCAATATATTTCTCCTTCTTCCTTACAAAGAACACTTCTTGAAGGCGTGACTTTGGGTATAGAAG
AGTATAACCAGCACTGATTTCAGTTTACACTCAGAATTTCAGGGGGCTGGACTGAGATAATAAGTTGTGATGAATTTCTCCAACCGTGTATTTGCCTATCTTAATTGGTTTCCTCCAAATCAAAACATCCTCTCTATCTTCAGCTTCCAGATACCATGTCTTGATTATATTGGATATCTTCCTAGTCATCTTTCTCTTTC
TATTTCCATTTCCTTATTGCTTGTTCCTGCAAACAAAAGACCACAACCACTGTGGGTAAGTTGAGTGAAGTTATAAAACTGTATTTGAAGTGGACAAGGTGCTGTAGGAATTTGACCTCAGTACATTAAACTTTTAGGAAGTTGGTCAGGAAGAGGTGCTATTTCGTTTTGGTTAAAGTGAGGAAAACAGAGTTCATTAA
TTGGAAAAGGACCTTGTCTTGGACAATCCAAACCTAATCTCTATTAGTGTAATATAAATTAATGATGATGCCAGTACTTTTTGATGCAGTGTTTGATGTGTTCTGAATGTTGAAAGATGATGTCCATTGATCATCTTTGCTCTACTGTACGAAAATCT