NA ----> NA

Intron 1 GTTTTTGTTA ... GTCAACGCAG

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>TRINITY_DN46521_c0_g1_i2 from sample A7 / Example spliced isoform

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CTGTCATTTTAAATTGCACCGACTGTGACGGTAGTCACAATAAAACCTAAAACCCAAGGAATATGTATAGCATCCTCCTTTAAATAATATTTCAACTCCACTTGGGAAGCTCTAATGGCGGCCAGTAATACTTTGGGTAGCTATAATGGCGGCCAGAATCAAAGTATTACTGCTGCAGACCTCAGGATTGCTCGGGTCAT
CTCTGAAGCCTAACATAATATGCCATCTCAATGGAGTTTGCAATAATATGATGATCAGAAAATGGGTTATGCGATTGTAGATAGACACTACATGCCTCAATTCAGGCAATATACAAGTTGTGGTAAAAATCTTTCGAGGAGACAGTTTGGCGGTGTTTTGACCCGATCATAACAACTCCCACGAACTTTAGGTTGCAGTC
AGATCGTGGTAAAGAGGCGCATAGACTTGCCCACATGCAGCCTGCAATACGCTCTTTATTGGGCTCTCACCAGTATTTACAAGAGATGAAGGTATGGGGTCCTTTAATGTAATATGTGAATCCGAATTCCAGTATTCATGGATAGGAGACAATTTTTGAGATTTTTTAAAAACTATTTTGTGATTAGTTTTAAGCAAGTT
TGAGGTCGATGATGAACCCTATTTTGAGTACCTGCATTCCATGTTTTGTAACTAAAACTGCCGTTTAAATTCATGACATTCCACGGAATATGTCAATAATAATGGTAAGGGTTTCAAGTTTTGTAGGCCACCACTGCTACACGAGTTCGAGTCTCGCGCTGCAAATATAAAATAACAGCGTGAACACGCAATAATAGCAA
TCCTCTTCAAGTTCATGTCCCAAGTTCATTATTTCATTTCAATGAGTTCTTGAATTGAAACATGCAATCGCCCATTCTTCAATTTTTGCTGCTACATTTGCAGATTTAGACATTTAAACATAGTTGGTCATCTCGTTTGGCGTTCACAGTTTTGGGAGAATATTTTAAGGGCGCTACCCTCTGATTATTTTTTGGATATT
TTCTGGCCAAAACTACTGTTTTCAGATACTACTTTCAGGTAGCTAACCTGAAAGTTTTCCGACGAGGGTAGTGTTTATAAACCCCTTGGGTGTTAGAAAGGGTTAAAAGAGTATCAGCCATGGAAGTGGCTAGGCAGGTCTTCCATAATTCAAAACCCAAGTTCATCCCAATTGTCCCATATCTCAGGGATGAAGCTGAG
GATCTCAGGGATAAAGTTGAGGAACTTGAGGAATTTACATGTCCTCTCTGCTCCTATCTCTTCTTCTACTGCTTTCATGTAGACATGGTTTGAGCAAACTACTCCTATTGAAACCACTGTAGAAAAAACTTGTCTTTTACTTGAAAAAAATGAGGGATACGTAGAGAGCACGCCACGACTTCTTCCTTGTATTATTCGAT
AATATCTCTTAGGTTACTTGTCTCTTATCTATCTCTATACGTGTGGGACACGCCTTCAAGGTTTCCGCAACATCTGTCCAGCGTGCTGTCACACAACGAGAGGTGCCCATTAATCTCAAATATCTGCCCCCAGATCTTTATATGGGATGGCAGATATTTATATGGGCTCCTGCTCGACATTGTTTTCAACTTAATCTTAT
AGCAGCATTATCATAATATTATAGCATTGCATAGTTGCATTAAAGTTGAAGATCTAGATCGATCTAGCGTTATTCATCAAGATGGCGGATAAGTGCAAGCAATTTGGCCAGGAAACGACTAGACAAGTTCAACAAACAACTCAAGTAACAATCTCTCTCTATACCATTGTTATTTGTACGCTAATTTTCTGCAGTCTGTA
CTTGCTCTAAAAACTTGAGGTGGTATTGTATATTTTGTGATGCGAAGGGGGTGGGGGATATGATTCAGGACAAGGCTTCTCAGGCGACTAAAGCGACCAAGTCAATGGGTCAGTCAGCCATGGATACAGCCGAACAGGGAAAGAAACAAGTCATGGGTGCAGCCGGACAGGGAAGCAACCAAACTGGCTCTTACTTGCAA
CAGGCGGGAAACACAGTGATGAGTGCTACGCAGACCGTGGGAAACACAGTGATGAGTGCTACGCAGACCGTAGTGGACGTTGTGAAGAGCCCCTTTGTAAAAAAGTGAAGAGGACTTTCGTCCCATGCTAAGCCTATCTGTGTAGTTTGGTTTGGCAATAATTTTATAAGTCTCGCATTTCTGTATCTTAGAAATATTTA
TTACTTCTACAAGAAGATGAATCAGAACACTGGATATATGATAGTCTTTATCTCTACATGAGACAGAATATTTAACGCTGAAGATTTGATTTTTTCAATTGTCTCCGTCTTTATAGGAGATTTTGCATTCAGGAGTATAGATGTTTAACATGGGGATTATGCAGATCTTATGTTAATCTATCTCTGGTGTTTGCAGTTAT
TTTTATCTTTGTATCAGGAAATATTTTTGAGAATTTATAGTCTTCCAACATAGATTATGTTCATTAGATCTACATGTCCTGAAGTTTGCTTATAC

>TRINITY_DN46521_c0_g1_i3 from sample A7 / Example unspliced isoform:

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CTGTCATTTTAAATTGCACCGACTGTGACGGTAGTCACAATAAAACCTAAAACCCAAGGAATATGTATAGCATCCTCCTTTAAATAATATTTCAACTCCACTTGGGAAGCTCTAATGGCGGCCAGTAATACTTTGGGTAGCTATAATGGCGGCCAGAATCAAAGTATTACTGCTGCAGACCTCAGGATTGCTCGGGTCAT
CTCTGAAGCCTAACATAATATGCCATCTCAATGGAGTTTGCAATAATATGATGATCAGAAAATGGGTTATGCGATTGTAGATAGACACTACATGCCTCAATTCAGGCAATATACAAGTTGTGGTAAAAATCTTTCGAGGAGACAGTTTGGCGGTGTTTTGACCCGATCATAACAACTCCCACGAACTTTAGGTTGCAGTC
AGATCGTGGTAAAGAGGCGCATAGACTTGCCCACATGCAGCCTGCAATACGCTCTTTATTGGGCTCTCACCAGTATTTACAAGAGATGAAGGTATGGGGTCCTTTAATGTAATATGTGAATCCGAATTCCAGTATTCATGGATAGGAGACAATTTTTGAGATTTTTTAAAAACTATTTTGTGATTAGTTTTAAGCAAGTT
TGAGGTCGATGATGAACCCTATTTTGAGTACCTGCATTCCATGTTTTGTAACTAAAACTGCCGTTTAAATTCATGACATTCCACGGAATATGTCAATAATAATGGTAAGGGTTTCAAGTTTTGTAGGCCACCACTGCTACACGAGTTCGAGTCTCGCGCTGCAAATATAAAATAACAGCGTGAACACGCAATAATAGCAA
TCCTCTTCAAGTTCATGTCCCAAGTTCATTATTTCATTTCAATGAGTTCTTGAATTGAAACATGCAATCGCCCATTCTTCAATTTTTGCTGCTACATTTGCAGATTTAGACATTTAAACATAGTTGGTCATCTCGTTTGGCGTTCACAGTTTTGGGAGAATATTTTAAGGGCGCTACCCTCTGATTATTTTTTGGATATT
TTCTGGCCAAAACTACTGTTTTCAGATACTACTTTCAGGTAGCTAACCTGAAAGTTTTCCGACGAGGGTAGTGTTTATAAACCCCTTGGGTGTTAGAAAGGGTTAAAAGAGTATCAGCCATGGAAGTGGCTAGGCAGGTCTTCCATAATTCAAAACCCAAGTTCATCCCAATTGTCCCATATCTCAGGGATGAAGCTGAG
GATCTCAGGGATAAAGTTGAGGAACTTGAGGAATTTACATGTCCTCTCTGCTCCTATCTCTTCTTCTACTGCTTTCATGTAGACATGGTTTGAGCAAACTACTCCTATTGAAACCACTGTAGAAAAAACTTGTCTTTTACTTGAAAAAAATGAGGGATACGTAGAGAGCACGCCACGACTTCTTCCTTGTATTATTCGAT
AATATCTCTTAGGTTACTTGTCTCTTATCTATCTCTATACGTGTGGGACACGCCTTCAAGGTTTCCGCAACATCTGTCCAGCGTGCTGTCACACAACGAGAGGTGCCCATTAATCTCAAATATCTGCCCCCAGATCTTTATATGGGATGGCAGATATTTATATGGGCTCCTGCTCGACATTGTTTTCAACTTAATCTTAT
AGCAGCATTATCATAATATTATAGCATTGCATAGTTGCATTAAAGTTGAAGATCTAGATCGATCTAGCGTTATTCATCAAGATGGCGGATAAGTGCAAGCAATTTGGCCAGGAAACGACTAGACAAGTTCAACAAACAACTCAAGTAACAATCTCTCTCTATACCATTGTTATTTGTACGCTAATTTTCTGCAGTCTGTA
CTTGCTCTAAAAACTTGAGGTGGTATTGTATATTTTGTGATGCGAAGGGGGTGGGGGATATGATTCAGGACAAGGCTTCTCAGGCGACTAAAGCGACCAAGTCAATGGGTCAGTCAGCCATGGATACAGCCGAACAGGGAAAGAAACAAGTCATGGGTGCAGCCGGACAGGGAAGCAACCAAACTGGCTCTTACTTGCAA
CAGgtttttgttaatattaaacaatgtgtcgccagggttttaagaactgattcaacggattaattattaaatttgaaagttcatttttgttttgattgtatggaaattgattgagtttcgaccatgtcaaatgtcaacgcagGCGGGAAACACAGTGATGAGTGCTACGCAGACCGTGGGAAACACAGTGATGAGTGCTA
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GACAGAATATTTAACGCTGAAGATTTGATTTTTTCAATTGTCTCCGTCTTTATAGGAGATTTTGCATTCAGGAGTATAGATGTTTAACATGGGGATTATGCAGATCTTATGTTAATCTATCTCTGGTGTTTGCAGTTATTTTTATCTTTGTATCAGGAAATATTTTTGAGAATTTATAGTCTTCCAACATAGATTATGTT
CATTAGATCTACATGTCCTGAAGTTTGCTTATAC

Intron 2 GTAACAATCT ... TGATGCGAAG

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A2	28.71	36	14	15
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A4	26.53	18	5	8
A5	33.33	19	6	13
A6	21.15	164	25	63
A7	30.88	75	21	46
A8	27.46	70	12	41
A9	25.28	99	20	47
A10	27.84	92	12	59

>TRINITY_DN46521_c0_g1_i1 from sample A7 / Example spliced isoform

CGGCGATGGAGCCTGGAGGGCGTGGAAAAAGAATAAGACACAGGCAACTTCAAAGTTACAGTAAGGTTGCCACCGGATTGCCACTTCACTGTTAACACTCAATGAATCTATGAACAATTACCATCAAGGATGTCAACCAGTGGAGATAGCCATCCCTTAGATGCTGCCAAGTATCATTTTAAGTAGCATTCTGTTGGCAC
CTGTCATTTTAAATTGCACCGACTGTGACGGTAGTCACAATAAAACCTAAAACCCAAGGAATATGTATAGCATCCTCCTTTAAATAATATTTCAACTCCACTTGGGAAGCTCTAATGGCGGCCAGTAATACTTTGGGTAGCTATAATGGCGGCCAGAATCAAAGTATTACTGCTGCAGACCTCAGGATTGCTCGGGTCAT
CTCTGAAGCCTAACATAATATGCCATCTCAATGGAGTTTGCAATAATATGATGATCAGAAAATGGGTTATGCGATTGTAGATAGACACTACATGCCTCAATTCAGGCAATATACAAGTTGTGGTAAAAATCTTTCGAGGAGACAGTTTGGCGGTGTTTTGACCCGATCATAACAACTCCCACGAACTTTAGGTTGCAGTC
AGATCGTGGTAAAGAGGCGCATAGACTTGCCCACATGCAGCCTGCAATACGCTCTTTATTGGGCTCTCACCAGTATTTACAAGAGATGAAGGTATGGGGTCCTTTAATGTAATATGTGAATCCGAATTCCAGTATTCATGGATAGGAGACAATTTTTGAGATTTTTTAAAAACTATTTTGTGATTAGTTTTAAGCAAGTT
TGAGGTCGATGATGAACCCTATTTTGAGTACCTGCATTCCATGTTTTGTAACTAAAACTGCCGTTTAAATTCATGACATTCCACGGAATATGTCAATAATAATGGTAAGGGTTTCAAGTTTTGTAGGCCACCACTGCTACACGAGTTCGAGTCTCGCGCTGCAAATATAAAATAACAGCGTGAACACGCAATAATAGCAA
TCCTCTTCAAGTTCATGTCCCAAGTTCATTATTTCATTTCAATGAGTTCTTGAATTGAAACATGCAATCGCCCATTCTTCAATTTTTGCTGCTACATTTGCAGATTTAGACATTTAAACATAGTTGGTCATCTCGTTTGGCGTTCACAGTTTTGGGAGAATATTTTAAGGGCGCTACCCTCTGATTATTTTTTGGATATT
TTCTGGCCAAAACTACTGTTTTCAGATACTACTTTCAGGTAGCTAACCTGAAAGTTTTCCGACGAGGGTAGTGTTTATAAACCCCTTGGGTGTTAGAAAGGGTTAAAAGAGTATCAGCCATGGAAGTGGCTAGGCAGGTCTTCCATAATTCAAAACCCAAGTTCATCCCAATTGTCCCATATCTCAGGGATGAAGCTGAG
GATCTCAGGGATAAAGTTGAGGAACTTGAGGAATTTACATGTCCTCTCTGCTCCTATCTCTTCTTCTACTGCTTTCATGTAGACATGGTTTGAGCAAACTACTCCTATTGAAACCACTGTAGAAAAAACTTGTCTTTTACTTGAAAAAAATGAGGGATACGTAGAGAGCACGCCACGACTTCTTCCTTGTATTATTCGAT
AATATCTCTTAGGTTACTTGTCTCTTATCTATCTCTATACGTGTGGGACACGCCTTCAAGGTTTCCGCAACATCTGTCCAGCGTGCTGTCACACAACGAGAGGTGCCCATTAATCTCAAATATCTGCCCCCAGATCTTTATATGGGATGGCAGATATTTATATGGGCTCCTGCTCGACATTGTTTTCAACTTAATCTTAT
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>TRINITY_DN46521_c0_g1_i2 from sample A7 / Example unspliced isoform:

CGGCGATGGAGCCTGGAGGGCGTGGAAAAAGAATAAGACACAGGCAACTTCAAAGTTACAGTAAGGTTGCCACCGGATTGCCACTTCACTGTTAACACTCAATGAATCTATGAACAATTACCATCAAGGATGTCAACCAGTGGAGATAGCCATCCCTTAGATGCTGCCAAGTATCATTTTAAGTAGCATTCTGTTGGCAC
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TTCTGGCCAAAACTACTGTTTTCAGATACTACTTTCAGGTAGCTAACCTGAAAGTTTTCCGACGAGGGTAGTGTTTATAAACCCCTTGGGTGTTAGAAAGGGTTAAAAGAGTATCAGCCATGGAAGTGGCTAGGCAGGTCTTCCATAATTCAAAACCCAAGTTCATCCCAATTGTCCCATATCTCAGGGATGAAGCTGAG
GATCTCAGGGATAAAGTTGAGGAACTTGAGGAATTTACATGTCCTCTCTGCTCCTATCTCTTCTTCTACTGCTTTCATGTAGACATGGTTTGAGCAAACTACTCCTATTGAAACCACTGTAGAAAAAACTTGTCTTTTACTTGAAAAAAATGAGGGATACGTAGAGAGCACGCCACGACTTCTTCCTTGTATTATTCGAT
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