sp|Q9LK50|AB26G_ARATH ----> ABC transporter G family member 26

Intron 1 GTGTTTTGGT ... GGCGATGGAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	75.13	10	31.5	29
A2	58.62	18	25	26
A3	67.62	11	20.5	25.5
A4	91.81	2	30	15
A5	89.77	1	12	6
A6	50	0	2	0
A7	83.75	1	7	4
A8	50	0	3	0
A9	100	0	1.5	0
A10	100	0	0.5	1

>TRINITY_DN114088_c1_g1_i15 from sample A3 / Example spliced isoform

ATTTATTTTAAATATACTACAGTGTATGGTTAACATTCTTCGTGAAAATTTTGTTGTATTTTTAAGATCTGCCATGTTTTTTTTGGTTTTGATCTTGTTAGTTTCAGTGGGGAAGTCAAGGCAGGTCAAACAACCAAGTTTATGCAGAGTATTCAGGTGTAGTGGGCGCAGGGGAAAGCTAAAAATGTTAAGTGGAGAAG
TGAAGGCAGGCCAAATAGCCAAGCCCATGTAGAGTCCACAGTGCAGTGGGTGCAGTGCGAAAGCGAAGAAACAGGGTGAAAGCTAAGAAGGCGGTGGTCTTAAAAGCTAGAGCAAACTCCACAAATACAATGGGTGAAGGTGAAGATTGAGATGGGTGTTCTTGGTTGGCCATGGATGCTTTCAAGGGTTGATATTTGTT
GTGTATTTAGTATTTCTCATAAGGGGGTGGACAAATCAAGATAGGTCCTAAAAATTAGATGCAGATTCCATAAGTGCAATCGGCGAAGGCGAAGATTGAGATGGCGGTGGTCTTAAAAGCTAGAGCAAACTCCACAAATACAATGGGTGAAGGTGAAGATTGAGATGGGTGTTCTTGGTTGGCCATGGATGCTTTCAAGG
GTTGATATTTGTTGTGTATTTAGTATT

>TRINITY_DN114088_c1_g1_i7 from sample A3 / Example unspliced isoform:

GTGTCTCATTTGTCTTCTATGGAGTTCGCTTCGCGGTGAAAATGCATTACTCTCCACATCAGATCTATGATTGCACGAGACCAGGTGGCTGTGCAAGCCTTCAGAGCTGGCCCAATTTTGAGACCAAGGGCTTGTATGGTGGTATGCAGGAGGTCTGGATATTAATGCCAATGGCTTTTGCATACCGCATTATGGCCTAC
TTATACTTGAATAAGATCAAGCTCATATGAAAACATTCATTTATACTACCGATCTGGTAAATACATTTTTTTGTAGAAGGTCAAAGGATTATATTCAATTGTATACATATTTGTTGTGTATTTAGTATTTCTCATAAGgtgttttggttttctattaataactttaatttttggtgtgcaagatgtacatggttggccat
ggacgctttctagggatacatgctgactatgctttttgattctttctctttattttctttttgttattttagtttttttttctatttttatttttcttttgctattgttgttttttttttcctttttttattgctagggttattgttttgcattttgtgagcatggccaatgtaatttatggtttggtattttttttcct
gcttgctttctggtctagttttctttgggtttcccataggtgtagtgggtaaaggcgatggagGGGGTGGACAAATCAAGATAGGTCCTAAAAATTAGATGCAGATTCCATAAGTGCAATCGGCGAAGGCGAAGATTGAGATGGCGGTGGTCTTAAAAGCTAGAGCAAACTCCACAAATACAATGGGTGAAGGTGAAGAT
TGAGATGGGTGTTCTTGGTTGGCCATGGATGCTTTCAAGGGTTGATATTTGTTGTGTATTTAGTATTTCTCATAAGgtgttttggttttctattaataactttaatttttggtgtgcaagatgtacatggttggccatggacgctttctagggatacatgctgactatgctttttgattctttctctttattttcttttt
gttattttagtttttttttctatttttatttttcttttgctattgttgttttttttttcctttttttattgctagggttattgttttgcattttgtgagcatggccaatgtaatttatggtttggtattttttttcctgcttgctttctggtctagttttctttgggtttcccataggtgtagtgggtaaaggcgatgga
gGTATGTATAGGGGAATGTATTCATTTGTTGCTACATAATTTTATGTGTTCATGCATTTTTAATTTTGCTCATCCATTGCACCATAATTACATGTTGTGTCTTTGTTTAAATATAGAGGCAATGCATGTATAAGACCTAGTCTCTATTAAATAATTTATGGTTTGACTTTTTTTGTTGGGTTCAGGGGGTGGACAAATCA
ATACAGATCCTAAAAACCAGACGCAGATTCCACAAGTGCAATGAGT

Intron 2 GTATGTATAG ... TTGGGTTCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	59.65	23	29	39
A2	45.26	26	21	22
A3	48.98	25	20	28
A4	59.26	11	14	18
A5	64.44	8	11	18
A6	100	0	1	2
A7	46.67	4	2	5
A8	100	0	3	10
A9	100	0	0	2
A10	-1	0	0	0

>TRINITY_DN106801_c3_g2_i3 from sample A5 / Example spliced isoform

TGCTTTTTGATTCTTTCTCTTTATTTTCTTTTTGTTATTTTAGTTTTTTTTTCTATTTTTATTTTTCTTTTGCTATTGTTGTTTTTTTTTTCCTTTTTTTATTGCTAGGGTTATTGTTTTGCATTTTGTGAGCATGGCCAATGTAATTTATGGTTTGGTATTTTTTTTCCTGCTTGCTTTCTGGTCTAGTTTTCTTTGGG
TTTCCCATAGGTGTAGTGGGTAAAGGCGATGGAGGGGGTGGACAAATCAAGATAGGTCCTAAAAATTAGATGCAGATTCCATAAGTGCAATCGGCGAAGGCGAAGATTGAGATGGCGGTGGTCTTAAAAGCTAGAGCAAACTCCACAAATACAATGGGTGAAGGTGAAGATTGAGATGGGTGTTCTTGGTTGGCCATGGA
TGCTTTCAAGGGTTGATATTTGTTGTGTATTTAGTATTTCTCATAAGGGGGTGGACAAATCAAGATAGGTCCTAAAAATTAGATGCAGATTCCATAAGTGCAATCGGCGAAGGCGAAGATTGAGATGGCGGTGGTCTTAAAAGCTAGAGCAAACTCCACAAATACAATGGGTGAAGGTGAAGATTGAGATGGGTGTTCTT
GGTTGGCCATGGATGCTTTCAAGGGTTGATATTTGTTGTGTATTTAGTATTTCTCATAAGGTGTTTTGGTTTTCTATTAATAACTTTAATTTTTGGTGTGCAAGATGTACATGGTTGGCCATGGACGCTTTCTAGGGATACATGCTGACTATGCTTTTTGATTCTTTCT

>TRINITY_DN106801_c3_g2_i1 from sample A5 / Example unspliced isoform:

TGCTTTTTGATTCTTTCTCTTTATTTTCTTTTTGTTATTTTAGTTTTTTTTTCTATTTTTATTTTTCTTTTGCTATTGTTGTTTTTTTTTTCCTTTTTTTATTGCTAGGGTTATTGTTTTGCATTTTGTGAGCATGGCCAATGTAATTTATGGTTTGGTATTTTTTTTCCTGCTTGCTTTCTGGTCTAGTTTTCTTTGGG
TTTCCCATAGGTGTAGTGGGTAAAGGCGATGGAGgtatgtataggggaatgtattcatttgttgctacataattttaagttttcatgcatttttaattaattcatccattgtgtcataattacatatgtgtctttgtttaaatttagaggcaatgcatgtataggacctagtctctattaaataatttatggtttgattt
tttttgttgggttcagGGGGTGGACAAATCAAGATAGGTCCTAAAAATTAGATGCAGATTCCATAAGTGCAATCGGCGAAGGCGAAGATTGAGATGGTATGTATGGTTTCATATGTGTATGTTTAAATTAAGG

Intron 3 GTATGTATAG ... TGGTGTGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	-1	7	0	0
A2	58.99	5.3	6	0
A3	-1	4.7	0	0
A4	-1	3.3	0	0
A5	-1	4.3	0	0
A6	-1	0.3	0	0
A7	-1	1.7	0	0
A8	-1	0	0	0
A9	-1	0	0	0
A10	-1	0.7	0	0

>TRINITY_DN122173_c5_g3_i1 from sample A2 / Example spliced isoform

AGAAGCAAAGGGTGTTCTTGGTTGGCCATGGATGCTTTCAAGGGTTGATATTTGTTGTGTATTTAGTATTTCTCATAAGGTGTTTTGGTTTTCTATTAATAACTTTAATTTTTGGTGTGCAAGATGTACATGGTTGGCCATGGACGCTTTCTAGGGATACATGCTGACTATGCTTTTTGATTCTTTCTCTTTATTTTCTT
TTTGTTATTTTAGTTTTTTTTTCTATTTTTATTTTTCTTTTGCTATTGTTGTTTTTTTTTTCCTTTTTTTATTGCTAGGGTTATTGTTTTGCATTTTGTGAGCATGGCCAATGTAATTTATGGTTTGGTATTTTTTTTCCTGCTTGCTTTCTGGTCTAGTTTTCTTTGGGTTTCCCATAGGTGTAGTGGGTAAAGGCGAT
GGAGGGGGTGGACAAATCAAGATAGGTCCTAAAAATTAGATGCAGATTCCATAAGTGCAATCGGCGAAGGCGAAGATTGAGATGGCGGTGGTCTTAAAAGCTAGAGCAAACTCCACAAATACAATGGGTGAAGGTGAAGATTGAGATGGGTGTTCTTGGTTGGCCATGGATGCTTTCAAGGGTTGATATTTGTTGTGTAT
TTAGTATTTCTCATAAGGGGGTGGACAAATCAAGATAGGTCCTAAAAATTAGATGCAGATTCCATAAGTGCAATCGGCGAAGGCGAAGATTGAGATGGGGTTAGTTCTAAAAGCTAGATGCAGATTGCATAAGTGCAATGGTTGAAGCGAAGATTGAGATGGCGGTGGTCTTAAAAGCTAGAGCAAACTCCACAAATACA
ATGGGTGAAGGTGAAGATTTGTTTTGGTTTTCTATTAATAACTTTAATTTTTGGTGTGCAAGATGTACATGGTTGGCCATGGACGCTTTCTAGGGATACATGCTGACTATGCTTTTTGATTCTTTCTCTTTATTTTCTTTTTGTTATTTTAGTTTTTTTTTCTATTTTTATTTTTCTTTTGCTATTGTTGTTTTTTTTTT
CCTTTTTTTATTGCTAGGGTTATTGTTTTGCATTTTGTGAGCATGGCCAATGTAATTTATGGTTTGGTATTTTTTTTCCTGCTTGCTTTCTGGTCTAGTTTTCTTTGGGTTTCCCATAGGTGTAGTGGGTAAAGGCGATGGAGGTATGTATAGGGGAATGTATTCATTTGTTGCTACATAATTTTAAGTTTTCATGCATT
TTTAATTAATTCATCCATTGTGTCATAATTACATATGTGTCTTTGTTTAAATTTAGA

>TRINITY_DN122173_c5_g3_i11 from sample A2 / Example unspliced isoform:

TATATAGTCTCTATTAAATTATTTATTGTTTGGCTTTTTTTGTTGGGTTTAGGCGGTGGTCTTAAAAGCTAGAGCAAACTCCACAAATACAATGGGTGAAGGTGAAGATTGAGATGgtatgtatagttctttctttcatatttctcacaaggcatttgttgtgtactaatatttttcataagacgttttggtctatatct
aatacatctctaatttttggtgtgcagGGTGTTCTTGGTTGGCCG