NA ----> NA

Intron 1 GTAAGGGTAG ... TTTAACGTAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	57.97	7.8	9	12.5
A2	51.52	8	10	7
A3	41.18	7.8	4	6.7
A4	48.86	2.9	1	4.6
A5	50.12	5	1	9
A6	43.69	32.6	24	26.6
A7	47.88	46.1	31	53.4
A8	46.34	59	20	81.2
A9	45.42	58	39	57.3
A10	46.43	55.4	41	54.3

>TRINITY_DN119938_c0_g2_i2 from sample A1 / Example spliced isoform

TTGTAAGCCTACGGGCATTCAGTAAAAAGGGAGGATGGAAAAATAGGGGAGAGGAGGATTCTTTGATACATATACAGTTTCATTCTGATAATGAAAGGCAGATTTTCCTCTCTCTGTGTTTATTTGTTCATGAATACATTGGATTTGGTGAATATTAGATTAGCTCTGTGTTTAAACTAATTTTGTGCATGAATTCTGAT
ATTTAATTGAGGTTTGAGCGGAGTAGAATCAGTATAGAAGGTTCCCGTTCATATTGAGATTGGGCAGAACTCATATAGGTTTCAATTTCCGCAGAACTTTGTTAAAGACTTAAGATAATTCAATAAAGACCCTTCAGATGTGTATAACTGTGTAATTAGGAGGTGAAGAGCTCGAATGGTGGTTAGGAAGCTCTATGAAT
CTTTAATAAACGAGATTGGTGGAGTTGCGTTGTTCATATCAAATATGTGTGAAGGATCAGATTGAGGGTATTGTATATTTCTCTATTTGACAGAACATCATAATCACCTGTGCTTGAAGTCTGAGCAAGAGACGAGCATGAAGAACACATGATTCATGTTTAATTCATGTAGACACTGAACATTTGCAGTCTGAAAAACG
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ACCACCAACAAAAGGCAGAGCATCAGATTGCGTGGAGACTACCCTAGTACGAATTGACAAAAGGCTGAATATGGTGATTCTTCTGGTGAAAAGAGGTTACGAAGAAGTGAAAAGTGCAGTTAATCTCTTGGGCATGATATGTTGAGTGATGAGACATATTGATATGTTGATCTCTTCGAATGATGTTGTATGGCATTGTA
GAATCTCACTTCACGCTTGATTGTTGATTGAGATTGTTTTCATTCAAGCATAGCGCGTGGTTATAAGAAGGAACTGAGGTCTAAAGGAGAAGGCGCTAAAGGACATTAGCGCATAGTCCTAGGTTGAAATATCCTCGAGGTACAAGCTGATTTAGTGTGACAGATATTGACACAATATGACACTGACTGTGGCATTGCGA
GACTAACAGTGGCATTGTGTCAGAGACAAAGATACATCTACATCTTGATAGA

>TRINITY_DN119938_c0_g2_i4 from sample A1 / Example unspliced isoform:

TTGTAAGCCTACGGGCATTCAGTAAAAAGGGAGGATGGAAAAATAGGGGAGAGGAGGATTCTTTGATACATATACAGTTTCATTCTGATAATGAAAGGCAGATTTTCCTCTCTCTGTGTTTATTTGTTCATGAATACATTGGATTTGGTGAATATTAGATTAGCTCTGTGTTTAAACTAATTTTGTGCATGAATTCTGAT
ATTTAATTGAGGTTTGAGCGGAGTAGAATCAGTATAGAAGGTTCCCGTTCATATTGAGATTGGGCAGAACTCATATAGGTTTCAATTTCCGCAGAACTTTGTTAAAGACTTAAGATAATTCAATAAAGACCCTTCAGATGTGTATAACTGTGTAATTAGGAGGTGAAGAGCTCGAATGGTGGTTAGGAAGCTCTATGAAT
CTTTAATAAACGAGATTGGTGGAGTTGCGTTGTTCATATCAAATATGTGTGAAGGATCAGATTGAGGGTATTGTATATTTCTCTATTTGACAGAACATCATAATCACCTGTGCTTGAAGTCTGAGCAAGAGACGAGCATGAAGAACACATGATTCATGTTTAATTCATGTAGACACTGAACATTTGCAGTCTGAAAAACG
AGAGGTTTGTATAAGTCTGTTTTATAGGTTGCAAGAGAAAAAATGGGAGACAGAGATTTCTATGAATTTCATGTTATAGAAATTGAATTTCTGCGTTGTGGCAGAGATGGAATGATTGTGACAGAGTTATTGACTGTAGGTTCTATTATAAAGAACAATCGATGAGATTATGGAACAACGACCAGGGCTTATTAGTTTGT
CGAGCCATTCAAAAAAATCCAGTCGATTGGTTTGGGTTCCATTCAAACAAACACCAAATCTGAACAGTAAAAGATAAAAGGGTTTAGAGGGATGATGGAGGAGCGATGAATGGTTGCAATAGCCTATCACTCTTAGAGTAGCATGACGGTTAAAGGATTGATAGTGAGGTCGCGTGGTTGGGAATATGTAGACTGTTGTT
ACCACCAACAAAAGGCAGAGCATCAGATTGCGTGGAGACTACCCTAGTACGAATTGACAAAAGGCTGAATATGGTGATTCTTCTGGTGAAAAGAGGTTACGAAGAAGTGAAAAGTGCAGTTAATCTCTTGGGCATGATATGTTGAGTGATGAGACATATTGATATGTTGATCTCTTCGAATGATGTTGTATGGCATTGTA
GAATCTCACTTCACGCTTGATTGTTGATTGAGATTGTTTTCATTCAAGCATAGCGCGTGGTTATAAGAAGGAACTGAGGTCTAAAGGAGAAGGCGCTAAAGGACATTAGCGCATAGTCCTAGGTTGAAATATCCTCGAGgtaagggtaggctgagcccttgccataagtatatatcatggtgattatttgggaatatttt
atgatggttttggcatatatcatagtggctatcttggtatagtccatggttatgtttttgcatatggctcatctcttggagtgttcaatgttttgaaaatgtccatgatataaaagttgaggatgaaaatgaaatcgattaatgattgtttctgggtgtatatttaacgtagGTACAAGCTGATTTAGTGTGACAGATAT
TGACACAATATGACACTGACTGTGGCATTGCGAGACTAACAGTGGCATTGTGTCAGAGACAAAGATACATCTACATCTTGATAGA