sp|Q9FI43|MAPC2_ARATH ----> Calcium-dependent mitochondrial ATP-magnesium/phosphate carrier protein 2


Intron 1 GTATTAACAG ... GAAATTGCAG

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>TRINITY_DN39417_c0_g1_i1 from sample A7 / Example spliced isoform
CTCGGGAGGAGGATTACGTGTGGTTACCAATTAAAGTGCAAACAATTTGAAATTGAACGCGATCGAATCTACCCCACTCCACTCTAACTCCATATTCGCTCGGCAGAGGGCGAAGAGAGAATGCGAAGCCAATAACAACAACAAGAGCAGGCATATATTCAATGACTATATCTCCCTCGTGGGAACACTGGATCTTTCCA
TTATGCGCGTCAGGCCCCTATTCCTTGCAGATTCAGATGGATTTCCCGTCATCAGACGAAGCAAAAATGCCGATCTGCCGACTGAAATTAGGTATGAGAAATTAACAGAATATTCCAGGAAGCGTCTCGGGGTCCCGTAGAAGGTTCGATCCCCGGACGCTGCACAAATTCGGGAATTCAAAGTCCTGATGTCAGTCAAA
TTGGGGAAGTAGATCTCATGCGTGGACTTCAACGAGGGAATGTACGTCCGCCTGCCTGCCTGTCTGTCTGTTTGTCAATCGCTCTCAGAAGAAAGAAAGAAAGTAAGCAACTTTAAAGAAATTCAGAAAAATATTTGTCTCTGCGGTGAAATAAAGATACAGGGTTTCGCTGGAAAAAAGAAATAAAGATACAGGGTCCG
ATCGGCTACTAAGATTTAAATTTTCGAGCAAATTTAAGATTTTTATGGTCGTGAATTAGAGATACAGGCTTTGATTGGCCCTACGATTCAAATTTCCGAGTGAATATGAGTTTTGTTGTTTGTCTGTGGTGAATCGAGGATGTGGGGTTTGATCGGCCCTACAATTTAAATTTTCGAGCAAATTTATTATTATTTCTTTT
TTTTGGTTGTGCGTGGTGAATTAAAGATGCGGGGTTTGATCGGCAAATTTTGAGCATTTATGGTGACTTGAAGATATAGGGCCCTAGGATTTGAATTTCCGAGCCAATTAAGTCTTTTTCTGGATTGTCCGTAGTGAATTAAAGGTACATGGTTTGATTGGCCCGGGATTTAAATTTCCGAGGAAATTTGAGCATTTCTG
GTTGTCTGTGGCGACGCAAAGATATACGGGTTAATCAGCTTCAGGATTTCACTTTCTGAGCAAATCTAAGCATTTCTGGTTGCAAGTCGTCGCAATTGCTGGTCTTCAGAAAATCAAGAAATCAACTTCTGTCAGGTAATTCCGGTTGATTTCCTTTTCCGGGACAATATTTGTCTGGCGAAGATTTGACTAGTTTTAAA
GATATAGGGTTTGATCGGTTGTCCGGAGTTCATTTCTGAGCAAATTAAATCATTTTCTGGTTGCAATTCATCGTAATTTAAGCATTTCTTTTCTGGTTGCTACTAATTGCAACGCCGGCGCTCCGAAATTCATGTCCGGTGCTAGTCAGGCCGTTGACCCGGTCCCCTTCTCCAAAATGGGATCTAAACCGAAGTCACAG
CAGGATAATCGGCGGACCGAATGTTGCAATCCTGTGAGAAATTCAGGCGAGGCATCCTTAGAGCATGTTATGCTAGCTTTGAGGGAGACGAAAGAGGAGAGGGAATTAAGGATACGGAGTCTGTTTAATTTCTTCGATGCGATGAACAGTGGGCACCTTGATAATTCACAGATTGAGCGGGGTTTGCAGGCATTGCGGAT
ACCGGCTGAATACAAGTATGCCAAGGATCTGCTTAAAGTTTGCGATTCCAATCAGGATGGTTGTGTCGATTACCAGGAATTCCGGCTGTATATGGATGACAAGGAACTCGAGCTTTACCGCATTTTTCAGGCGATAGATGTTGCACACAATGGCTGCATTTTACCTGAAGAGCTATGGGAAGCACTTGTTAGAGCAGGCA
TTGAAATGAGTGATGAAGAGCTTGCACGTTTCGTGGAGCATATAGATAAGGATAATAATGGAATCATAACGTTTGAAGAGTGGCGGGATTTTCTCCTTTTATATCCACATGAGGCAACCATAGAAAACATTTATCGGTATTGGGAAAGGGTTTGCCCCATAGATATTGGGGAGCAAGCAGTTATTCCTGAAGGTGCAGAC
ATCAGGAGCTCATGTTATTCCAGCTATTAATAATATTTTAAGAGAAGGTGGTCTCAAAGGATTTTTCAGAGGGAATGGGATTAATGTTTTGAAAGTAGCTCCTGAATCTGCAATCAAATTTTTTGCTTATGAAATGATGAAAGATTTTGTTGTTAGCATAACTGGAGAAGAACAAAAGGAAGATATTGGAACTTTTGGCC
GCCTTTTTGCTGGTGGGACAGCTGGTGCAATAGCCCAGGCTGTTATTTATCCAATGGATTTAGTAAAAACACGTTTGCAAACATATACATGTGAGGGTGGAAAAGTTCCAAAGCTGTCAAAGTTGTCAAAGGACATATGGGTTCATGAAGGTCCTCGAGGATTCTATCGAGGGCTTCTTCCGTCTTTACTTGGGATGATA
CCATATGCAGGCATTGACCTTGCTGCTTATGAGACTTTTAAAGACATGTCGAGGCAATATATACTCAAAGACAAAGAGCCAGGTCCTATTGTGCAACTGGGATGTGGAACAGTTTCTGGAGCTCTTGGAGCAACATGTGTCTATCCTTTGCAACTTATCAGGACACGATTACAAGCTCAACCTATGAATTCACCTTCAAG
TTACAAGGGCATGTCTGATGTTTTTTGGAGAACACTGCAGCATGAAGGGTTTACAGGTTTCTACAAGGGTCTTTTTCCAAATTTGCTGAAAGTAGCTCCAGCAGCTAGTATTACTTATTTAGTCTACGAGAAAATGAAAAAGGTGCTCCAGCTAGATTGAAGAACAGGTTGAAGCGGGAACTCTTATTTTGTTTAAGGTA
ATAGGATAATGATGATAACATTTAGTTTTGACAAGAGTGGCAGGGCAAAGAGCCCTTCAGAATGATTTTTAGGTTATAATTTTATTCAGAATACCAGCTGACTGGGGCTGTACAGCAAAAGACAATTTCTTTCATTCATTCTCTGGCCTTTATCAAAATTTGATGTTCTCCAGTGGTTTGGGTTTCATCTTCTGAGCTCT
TTGCGATGGTAACAGGTAATTGTTAATATCATCATTTTTGTTCCTGTCCCCTTGCAATGTGAAGATGTCATGATATTGGTTTTTTATGGTCACGACCATCAAGGTCTTTAATGTTGTGCTACCTGTGATTTATATAACAAGTCAACATGTGCAGTATCACTTGGGCAGTCACCAGTGCTTATTATTTTTACATTTACTCT
TAATGATTTATTTTGAATTTACAAGTATTGTCTTGTACTTGAATATCTGTACTGTCTGCTACAGGATGACATGCAGGCTTGAGAAACCTAACATGTGCAAGAGATAGGACTCGCCTGTATATTGTTTCCAAGAAATTTTGTACTGATGGTAACATTATGCCATATTATTTTCAATATTATTGAAATTTATGAGGACTCTT
TGGCCTTGCCCATCAGCTTTGGTACATTGCTAAAGGTTCGGCATCTATGCAAATATATTTTTAGGTTAGCAGGTTTAAAACCTTTTTAGGTTCTTGTGCAAAAATTCAGAAGATTCTCCTTCCAGAACTGCTATGCTTAAGGCTGATCAATTTGGGGTTTCTTTAAAAAAAGATGACATTTTCTCTGTGAGTCTGATCCA
TTGGATGAAAAGGATGGCCTCATTGAATAGACATACAGTCTAAAGTATTTTAAATTTAAACTGCACTGATAACTACCCCATTCAATTTCTATAATGTTCTGTCAGGCAAAATAACCAATCAGTGAGCACTGCTTATAACCAATTTTGCAAGTTAATTATTCCATTATTGTTAAGCTGGACATAACTTCGTAGGAGTAAGC
TTGAAAGGAAATTTTGTGATTCAAATTCTCTCTTTCTCTCTTTCTAACATGGCAG


>TRINITY_DN39417_c0_g1_i2 from sample A7 / Example unspliced isoform:
CTCGGGAGGAGGATTACGTGTGGTTACCAATTAAAGTGCAAACAATTTGAAATTGAACGCGATCGAATCTACCCCACTCCACTCTAACTCCATATTCGCTCGGCAGAGGGCGAAGAGAGAATGCGAAGCCAATAACAACAACAAGAGCAGGCATATATTCAATGACTATATCTCCCTCGTGGGAACACTGGATCTTTCCA
TTATGCGCGTCAGGCCCCTATTCCTTGCAGATTCAGATGGATTTCCCGTCATCAGACGAAGCAAAAATGCCGATCTGCCGACTGAAATTAGGTATGAGAAATTAACAGAATATTCCAGGAAGCGTCTCGGGGTCCCGTAGAAGGTTCGATCCCCGGACGCTGCACAAATTCGGGAATTCAAAGTCCTGATGTCAGTCAAA
TTGGGGAAGTAGATCTCATGCGTGGACTTCAACGAGGGAATGTACGTCCGCCTGCCTGCCTGTCTGTCTGTTTGTCAATCGCTCTCAGAAGAAAGAAAGAAAGTAAGCAACTTTAAAGAAATTCAGAAAAATATTTGTCTCTGCGGTGAAATAAAGATACAGGGTTTCGCTGGAAAAAAGAAATAAAGATACAGGGTCCG
ATCGGCTACTAAGATTTAAATTTTCGAGCAAATTTAAGATTTTTATGGTCGTGAATTAGAGATACAGGCTTTGATTGGCCCTACGATTCAAATTTCCGAGTGAATATGAGTTTTGTTGTTTGTCTGTGGTGAATCGAGGATGTGGGGTTTGATCGGCCCTACAATTTAAATTTTCGAGCAAATTTATTATTATTTCTTTT
TTTTGGTTGTGCGTGGTGAATTAAAGATGCGGGGTTTGATCGGCAAATTTTGAGCATTTATGGTGACTTGAAGATATAGGGCCCTAGGATTTGAATTTCCGAGCCAATTAAGTCTTTTTCTGGATTGTCCGTAGTGAATTAAAGGTACATGGTTTGATTGGCCCGGGATTTAAATTTCCGAGGAAATTTGAGCATTTCTG
GTTGTCTGTGGCGACGCAAAGATATACGGGTTAATCAGCTTCAGGATTTCACTTTCTGAGCAAATCTAAGCATTTCTGGTTGCAAGTCGTCGCAATTGCTGGTCTTCAGAAAATCAAGAAATCAACTTCTGTCAGGTAATTCCGGTTGATTTCCTTTTCCGGGACAATATTTGTCTGGCGAAGATTTGACTAGTTTTAAA
GATATAGGGTTTGATCGGTTGTCCGGAGTTCATTTCTGAGCAAATTAAATCATTTTCTGGTTGCAATTCATCGTAATTTAAGCATTTCTTTTCTGGTTGCTACTAATTGCAACGCCGGCGCTCCGAAATTCATGTCCGGTGCTAGTCAGGCCGTTGACCCGGTCCCCTTCTCCAAAATGGGATCTAAACCGAAGTCACAG
CAGGATAATCGGCGGACCGAATGTTGCAATCCTGTGAGAAATTCAGGCGAGGCATCCTTAGAGCATGTTATGCTAGCTTTGAGGGAGACGAAAGAGGAGAGGGAATTAAGGATACGGAGTCTGTTTAATTTCTTCGATGCGATGAACAGTGGGCACCTTGATAATTCACAGATTGAGCGGGGTTTGCAGGCATTGCGGAT
ACCGGCTGAATACAAGTATGCCAAGGATCTGCTTAAAGTTTGCGATTCCAATCAGGATGGTTGTGTCGATTACCAGGAATTCCGGCTGTATATGGATGACAAGGAACTCGAGCTTTACCGCATTTTTCAGGCGATAGATGTTGCACACAATGGCTGCATTTTACCTGAAGAGCTATGGGAAGCACTTGTTAGAGCAGGCA
TTGAAATGAGTGATGAAGAGCTTGCACGTTTCGTGGAGCATATAGATAAGGATAATAATGGAATCATAACGTTTGAAGAGTGGCGGGATTTTCTCCTTTTATATCCACATGAGGCAACCATAGAAAACATTTATCGGTATTGGGAAAGGGTTTGCCCCATAGATATTGGGGAGCAAGCAGTTATTCCTGAAGgtattaac
aggcacacacatgcatccaattatcttattgctggaggggttgctggtgctttgtctcgaaccgctacagctcctcttgaccgtttgaaggtgaaattgcagGTGCAGACATCAGGAGCTCATGTTATTCCAGCTATTAATAATATTTTAAGAGAAGGTGGTCTCAAAGGATTTTTCAGAGGGAATGGGATTAATGTTTT
GAAAGTAGCTCCTGAATCTGCAATCAAATTTTTTGCTTATGAAATGATGAAAGATTTTGTTGTTAGCATAACTGGAGAAGAACAAAAGGAAGATATTGGAACTTTTGGCCGCCTTTTTGCTGGTGGGACAGCTGGTGCAATAGCCCAGGCTGTTATTTATCCAATGGATTTAGTAAAAACACGTTTGCAAACATATACAT
GTGAGGGTGGAAAAGTTCCAAAGCTGTCAAAGTTGTCAAAGGACATATGGGTTCATGAAGGTCCTCGAGGATTCTATCGAGGGCTTCTTCCGTCTTTACTTGGGATGATACCATATGCAGGCATTGACCTTGCTGCTTATGAGACTTTTAAAGACATGTCGAGGCAATATATACTCAAAGACAAAGAGCCAGGTCCTATT
GTGCAACTGGGATGTGGAACAGTTTCTGGAGCTCTTGGAGCAACATGTGTCTATCCTTTGCAACTTATCAGGACACGATTACAAGCTCAACCTATGAATTCACCTTCAAGTTACAAGGGCATGTCTGATGTTTTTTGGAGAACACTGCAGCATGAAGGGTTTACAGGTTTCTACAAGGGTCTTTTTCCAAATTTGCTGAA
AGTAGCTCCAGCAGCTAGTATTACTTATTTAGTCTACGAGAAAATGAAAAAGGTGCTCCAGCTAGATTGAAGAACAGGTTGAAGCGGGAACTCTTATTTTGTTTAAGGTAATAGGATAATGATGATAACATTTAGTTTTGACAAGAGTGGCAGGGCAAAGAGCCCTTCAGAATGATTTTTAGGTTATAATTTTATTCAGA
ATACCAGCTGACTGGGGCTGTACAGCAAAAGACAATTTCTTTCATTCATTCTCTGGCCTTTATCAAAATTTGATGTTCTCCAGTGGTTTGGGTTTCATCTTCTGAGCTCTTTGCGATGGTAACAGGTAATTGTTAATATCATCATTTTTGTTCCTGTCCCCTTGCAATGTGAAGATGTCATGATATTGGTTTTTTATGGT
CACGACCATCAAGGTCTTTAATGTTGTGCTACCTGTGATTTATATAACAAGTCAACATGTGCAGTATCACTTGGGCAGTCACCAGTGCTTATTATTTTTACATTTACTCTTAATGATTTATTTTGAATTTACAAGTATTGTCTTGTACTTGAATATCTGTACTGTCTGCTACAGGATGACATGCAGGCTTGAGAAACCTA
ACATGTGCAAGAGATAGGACTCGCCTGTATATTGTTTCCAAGAAATTTTGTACTGATGGTAACATTATGCCATATTATTTTCAATATTATTGAAATTTATGAGGACTCTTTGGCCTTGCCCATCAGCTTTGGTACATTGCTAAAGGTTCGGCATCTATGCAAATATATTTTTAGGTTAGCAGGTTTAAAACCTTTTTAGG
TTCTTGTGCAAAAATTCAGAAGATTCTCCTTCCAGAACTGCTATGCTTAAGGCTGATCAATTTGGGGTTTCTTTAAAAAAAGATGACATTTTCTCTGTGAGTCTGATCCATTGGATGAAAAGGATGGCCTCATTGAATAGACATACAGTCTAAAGTATTTTAAATTTAAACTGCACTGATAACTACCCCATTCAATTTCT
ATAATGTTCTGTCAGGCAAAATAACCAATCAGTGAGCACTGCTTATAACCAATTTTGCAAGTTAATTATTCCATTATTGTTAAGCTGGACATAACTTCGTAGGAGTAAGCTTGAAAGGAAATTTTGTGATTCAAATTCTCTCTTTCTCTCTTTCTAACATGGCAG



Intron 2 GTAATTGTTA ... TCTGCTACAG

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A1034.3913659



>TRINITY_DN111264_c0_g1_i1 from sample A1 / Example spliced isoform
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CAGACGAAGCAAAAATGCCGATCTGCCGACTGAAATTAGGTATGAGAAATTAACAGAATATTCCAGGAAGCGTCTCGGGGTCCCGTAGAAGGTTCGATCCCCGGACGCTGCACAAATTCGGGAATTCAAAGTCCTGATGTCAGTCAAATTGGGGAAGTAGATCTCATGCGTGGACTTCAACGAGGGAATGTACGTCCGCC
TGCCTGCCTGTCTGTCTGTTTGTCAATCGCTCTCAGAAGAAAGAAAGAAAGTAAGCAACTTTAAAGAAATTCAGAAAAATATTTGTCTCTGCGGTGAAATAAAGATACAGGGTTTCGCTGGAAAAAAGAAATAAAGATACAGGGTCCGATCGGCTACTAAGATTTAAATTTTCGAGCAAATTTAAGATTTTTATGGTCGT
GAATTAGAGATACAGGCTTTGATTGGCCCTACGATTCAAATTTCCGAGTGAATATGAGTTTTGTTGTTTGTCTGTGGTGAATCGAGGATGTGGGGTTTGATCGGCCCTACAATTTAAATTTTCGAGCAAATTTATTATTATTTCTTTTTTTTGGTTGTGCGTGGTGAATTAAAGATGCGGGGTTTGATCGGCAAATTTTG
AGCATTTATGGTGACTTGAAGATATAGGGCCCTAGGATTTGAATTTCCGAGCCAATTAAGTCTTTTTCTGGATTGTCCGTAGTGAATTAAAGGTACATGGTTTGATTGGCCCGGGATTTAAATTTCCGAGGAAATTTGAGCATTTCTGGTTGTCTGTGGCGACGCAAAGATATACGGGTTAATCAGCTTCAGGATTTCAC
TTTCTGAGCAAATCTAAGCATTTCTGGTTGCAAGTCGTCGCAATTGCTGGTCTTCAGAAAATCAAGAAATCAACTTCTGTCAGGTAATTCCGGTTGATTTCCTTTTCCGGGACAATATTTGTCTGGCGAAGATTTGACTAGTTTTAAAGATATAGGGTTTGATCGGTTGTCCGGAGTTCATTTCTGAGCAAATTAAATCA
TTTTCTGGTTGCAATTCATCGTAATTTAAGCATTTCTTTTCTGGTTGCTACTAATTGCAACGCCGGCGCTCCGAAATTCATGTCCGGTGCTAGTCAGGCCGTTGACCCGGTCCCCTTCTCCAAAATGGGATCTAAACCGAAGTCACAGCAGGATAATCGGCGGACCGAATGTTGCAATCCTGTGAGAAATTCAGGCGAGG
CATCCTTAGAGCATGTTATGCTAGCTTTGAGGGAGACGAAAGAGGAGAGGGAATTAAGGATACGGAGTCTGTTTAATTTCTTCGATGCGATGAACAGTGGGCACCTTGATAATTCACAGATTGAGCGGGGTTTGCAGGCATTGCGGATACCGGCTGAATACAAGTATGCCAAGGATCTGCTTAAAGTTTGCGATTCCAAT
CAGGATGGTTGTGTCGATTACCAGGAATTCCGGCTGTATATGGATGACAAGGAACTCGAGCTTTACCGCATTTTTCAGGCGATAGATGTTGCACACAATGGCTGCATTTTACCTGAAGAGCTATGGGAAGCACTTGTTAGAGCAGGCATTGAAATGAGTGATGAAGAGCTTGCACGTTTCGTGGAGCATATAGATAAGGA
TAATAATGGAATCATAACGTTTGAAGAGTGGCGGGATTTTCTCCTTTTATATCCACATGAGGCAACCATAGAAAACATTTATCGGTATTGGGAAAGGGTTTGCCCCATAGATATTGGGGAGCAAGCAGTTATTCCTGAAGGTATTAACAGGCACACACATGCATCCAATTATCTTATTGCTGGAGGGGTTGCTGGTGCTT
TGTCTCGAACCGCTACAGCTCCTCTTGACCGTTTGAAGGTGAAATTGCAGGTGCAGACATCAGGAGCTCATGTTATTCCAGCTATTAATAATATTTTAAGAGAAGGTGGTCTCAAAGGATTTTTCAGAGGGAATGGGATTAATGTTTTGAAAGTAGCTCCTGAATCTGCAATCAAATTTTTTGCTTATGAAATGATGAAA
GATTTTGTTGTTAGCATAACTGGAGAAGAACAAAAGGAAGATATTGGAACTTTTGGCCGCCTTTTTGCTGGTGGGACAGCTGGTGCAATAGCCCAGGCTGTTATTTATCCAATGGATTTAGTAAAAACACGTTTGCAAACATATACATGTGAGGGTGGAAAAGTTCCAAAGCTGTCAAAGTTGTCAAAGGACATATGGGT
TCATGAAGGTCCTCGAGGATTCTATCGAGGGCTTCTTCCGTCTTTACTTGGGATGATACCATATGCAGGCATTGACCTTGCTGCTTATGAGACTTTTAAAGACATGTCGAGGCAATATATACTCAAAGACAAAGAGCCAGGTCCTATTGTGCAACTGGGATGTGGAACAGTTTCTGGAGCTCTTGGAGCAACATGTGTCT
ATCCTTTGCAACTTATCAGGACACGATTACAAGCTCAACCTATGAATTCACCTTCAAGTTACAAGGGCATGTCTGATGTTTTTTGGAGAACACTGCAGCATGAAGGGTTTACAGGTTTCTACAAGGGTCTTTTTCCAAATTTGCTGAAAGTAGCTCCAGCAGCTAGTATTACTTATTTAGTCTACGAGAAAATGAAAAAG
GTGCTCCAGCTAGATTGAAGAACAGGTTGAAGCGGGAACTCTTATTTTGTTTAAGGTAATAGGATAATGATGATAACATTTAGTTTTGACAAGAGTGGCAGGGCAAAGAGCCCTTCAGAATGATTTTTAGGTTATAATTTTATTCAGAATACCAGCTGACTGGGGCTGTACAGCAAAAGACAATTTCTTTCATTCATTCT
CTGGCCTTTATCAAAATTTGATGTTCTCCAGTGGTTTGGGTTTCATCTTCTGAGCTCTTTGCGATGGTAACAGGATGACATGCAGGCTTGAGAAACCTAACATGTGCAAGAGATAGGACTCGCCTGTATATTGTTTCCAAGAAATTTTGTACTGATGGTAACATTATGCCATATTATTTTCAATATTATTGAAATTTATG
AGGACTCTTTGGCCTTGCCCATCAGCTTTGGTACATTGCTAAAGGTTCGGCATCTATGCAAATATATTTTTAGGTTAGCAGGTTTAAAACCTTTTTAGGTTCTTGTGCAAAAATTCAGAAGATTCTCCTTCCAGAACTGCTATGCTTAAGGCTGATCAATTTGGGGTTTCTTTAAAAAAAGATGACATTTTCTCTGTGAG
TCTGATCCATTGGATGAAAAGGATGGCCTCATTGAATAGACATACAGTCTAAAGTATTTTAAATTTAAACTGCACTGATAACTACCCCATTCAATTTCTATAATGTTCTGTCAGGCAAAATAACCAATCAGTGAGCACTGCTTATAACCAATTTTGCAAGTTAATTATTCCATTATTGTTAAGCTGGACATAACTTCGTA
GGAGTAAGC


>TRINITY_DN111264_c0_g1_i3 from sample A1 / Example unspliced isoform:
TTGAACGCGATCGAATCTACCCCACTCCACTCTAACTCCATATTCGCTCGGCAGAGGGCGAAGAGAGAATGTGAAGCCAATAACAACAACAACAGCAGGCATATATTCAATGACTATATCTCCCTCGTGGGAACACTGGATCTTTCCATTATGCGCGTCAGGCCCCTATTCCTTGCAGATTCAGATGGATTTCCCGTCAT
CAGACGAAGCAAAAATGCCGATCTGCCGACTGAAATTAGGTATGAGAAATTAACAGAATATTCCAGGAAGCGTCTCGGGGTCCCGTAGAAGGTTCGATCCCCGGACGCTGCACAAATTCGGGAATTCAAAGTCCTGATGTCAGTCAAATTGGGGAAGTAGATCTCATGCGTGGACTTCAACGAGGGAATGTACGTCCGCC
TGCCTGCCTGTCTGTCTGTTTGTCAATCGCTCTCAGAAGAAAGAAAGAAAGTAAGCAACTTTAAAGAAATTCAGAAAAATATTTGTCTCTGCGGTGAAATAAAGATACAGGGTTTCGCTGGAAAAAAGAAATAAAGATACAGGGTCCGATCGGCTACTAAGATTTAAATTTTCGAGCAAATTTAAGATTTTTATGGTCGT
GAATTAGAGATACAGGCTTTGATTGGCCCTACGATTCAAATTTCCGAGTGAATATGAGTTTTGTTGTTTGTCTGTGGTGAATCGAGGATGTGGGGTTTGATCGGCCCTACAATTTAAATTTTCGAGCAAATTTATTATTATTTCTTTTTTTTGGTTGTGCGTGGTGAATTAAAGATGCGGGGTTTGATCGGCAAATTTTG
AGCATTTATGGTGACTTGAAGATATAGGGCCCTAGGATTTGAATTTCCGAGCCAATTAAGTCTTTTTCTGGATTGTCCGTAGTGAATTAAAGGTACATGGTTTGATTGGCCCGGGATTTAAATTTCCGAGGAAATTTGAGCATTTCTGGTTGTCTGTGGCGACGCAAAGATATACGGGTTAATCAGCTTCAGGATTTCAC
TTTCTGAGCAAATCTAAGCATTTCTGGTTGCAAGTCGTCGCAATTGCTGGTCTTCAGAAAATCAAGAAATCAACTTCTGTCAGGTAATTCCGGTTGATTTCCTTTTCCGGGACAATATTTGTCTGGCGAAGATTTGACTAGTTTTAAAGATATAGGGTTTGATCGGTTGTCCGGAGTTCATTTCTGAGCAAATTAAATCA
TTTTCTGGTTGCAATTCATCGTAATTTAAGCATTTCTTTTCTGGTTGCTACTAATTGCAACGCCGGCGCTCCGAAATTCATGTCCGGTGCTAGTCAGGCCGTTGACCCGGTCCCCTTCTCCAAAATGGGATCTAAACCGAAGTCACAGCAGGATAATCGGCGGACCGAATGTTGCAATCCTGTGAGAAATTCAGGCGAGG
CATCCTTAGAGCATGTTATGCTAGCTTTGAGGGAGACGAAAGAGGAGAGGGAATTAAGGATACGGAGTCTGTTTAATTTCTTCGATGCGATGAACAGTGGGCACCTTGATAATTCACAGATTGAGCGGGGTTTGCAGGCATTGCGGATACCGGCTGAATACAAGTATGCCAAGGATCTGCTTAAAGTTTGCGATTCCAAT
CAGGATGGTTGTGTCGATTACCAGGAATTCCGGCTGTATATGGATGACAAGGAACTCGAGCTTTACCGCATTTTTCAGGCGATAGATGTTGCACACAATGGCTGCATTTTACCTGAAGAGCTATGGGAAGCACTTGTTAGAGCAGGCATTGAAATGAGTGATGAAGAGCTTGCACGTTTCGTGGAGCATATAGATAAGGA
TAATAATGGAATCATAACGTTTGAAGAGTGGCGGGATTTTCTCCTTTTATATCCACATGAGGCAACCATAGAAAACATTTATCGGTATTGGGAAAGGGTTTGCCCCATAGATATTGGGGAGCAAGCAGTTATTCCTGAAGGTATTAACAGGCACACACATGCATCCAATTATCTTATTGCTGGAGGGGTTGCTGGTGCTT
TGTCTCGAACCGCTACAGCTCCTCTTGACCGTTTGAAGGTGAAATTGCAGGTGCAGACATCAGGAGCTCATGTTATTCCAGCTATTAATAATATTTTAAGAGAAGGTGGTCTCAAAGGATTTTTCAGAGGGAATGGGATTAATGTTTTGAAAGTAGCTCCTGAATCTGCAATCAAATTTTTTGCTTATGAAATGATGAAA
GATTTTGTTGTTAGCATAACTGGAGAAGAACAAAAGGAAGATATTGGAACTTTTGGCCGCCTTTTTGCTGGTGGGACAGCTGGTGCAATAGCCCAGGCTGTTATTTATCCAATGGATTTAGTAAAAACACGTTTGCAAACATATACATGTGAGGGTGGAAAAGTTCCAAAGCTGTCAAAGTTGTCAAAGGACATATGGGT
TCATGAAGGTCCTCGAGGATTCTATCGAGGGCTTCTTCCGTCTTTACTTGGGATGATACCATATGCAGGCATTGACCTTGCTGCTTATGAGACTTTTAAAGACATGTCGAGGCAATATATACTCAAAGACAAAGAGCCAGGTCCTATTGTGCAACTGGGATGTGGAACAGTTTCTGGAGCTCTTGGAGCAACATGTGTCT
ATCCTTTGCAACTTATCAGGACACGATTACAAGCTCAACCTATGAATTCACCTTCAAGTTACAAGGGCATGTCTGATGTTTTTTGGAGAACACTGCAGCATGAAGGGTTTACAGGTTTCTACAAGGGTCTTTTTCCAAATTTGCTGAAAGTAGCTCCAGCAGCTAGTATTACTTATTTAGTCTACGAGAAAATGAAAAAG
GTGCTCCAGCTAGATTGAAGAACAGGTTGAAGCGGGAACTCTTATTTTGTTTAAGGTAATAGGATAATGATGATAACATTTAGTTTTGACAAGAGTGGCAGGGCAAAGAGCCCTTCAGAATGATTTTTAGGTTATAATTTTATTCAGAATACCAGCTGACTGGGGCTGTACAGCAAAAGACAATTTCTTTCATTCATTCT
CTGGCCTTTATCAAAATTTGATGTTCTCCAGTGGTTTGGGTTTCATCTTCTGAGCTCTTTGCGATGGTAACAGgtaattgttaatatcatcatttttgttcctgtccccttgcaatgtgaagatgtcatgatattggttttttatggtcacgaccatcaaggtctttaatgttgtgctacctgtgatttatataacaagt
caacatgtgcagtatcacttgggcagtcaccagtgcttattatttttacatttactcttaatgatttattttgaatttacaagtattgtcttgtacttgaatatctgtactgtctgctacagGATGACATGCAGGCTTGAGAAACCTAACATGTGCAAGAGATAGGACTCGCCTGTATATTGTTTCCAAGAAATTTTGTA
CTGATGGTAACATTATGCCATATTATTTTCAATATTATTGAAATTTATGAGGACTCTTTGGCCTTGCCCATCAGCTTTGGTACATTGCTAAAGGTTCGGCATCTATGCAAATATATTTTTAGGTTAGCAGGTTTAAAACCTTTTTAGGTTCTTGTGCAAAAATTCAGAAGATTCTCCTTCCAGAACTGCTATGCTTAAGG
CTGATCAATTTGGGGTTTCTTTAAAAAAAGATGACATTTTCTCTGTGAGTCTGATCCATTGGATGAAAAGGATGGCCTCATTGAATAGACATACAGTCTAAAGTATTTTAAATTTAAACTGCACTGATAACTACCCCATTCAATTTCTATAATGTTCTGTCAGGCAAAATAACCAATCAGTGAGCACTGCTTATAACCAA
TTTTGCAAGTTAATTATTCCATTATTGTTAAGCTGGACATAACTTCGTAGGAGTAAGC



Intron 3 GTAATTCCGG ... TGCTAGTCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A171.024184117
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A868.94253477
A974.672959112
A1074.76266094



>TRINITY_DN111264_c0_g1_i2 from sample A1 / Example spliced isoform
TTGAACGCGATCGAATCTACCCCACTCCACTCTAACTCCATATTCGCTCGGCAGAGGGCGAAGAGAGAATGTGAAGCCAATAACAACAACAACAGCAGGCATATATTCAATGACTATATCTCCCTCGTGGGAACACTGGATCTTTCCATTATGCGCGTCAGGCCCCTATTCCTTGCAGATTCAGATGGATTTCCCGTCAT
CAGACGAAGCAAAAATGCCGATCTGCCGACTGAAATTAGGTATGAGAAATTAACAGAATATTCCAGGAAGCGTCTCGGGGTCCCGTAGAAGGTTCGATCCCCGGACGCTGCACAAATTCGGGAATTCAAAGTCCTGATGTCAGTCAAATTGGGGAAGTAGATCTCATGCGTGGACTTCAACGAGGGAATGTACGTCCGCC
TGCCTGCCTGTCTGTCTGTTTGTCAATCGCTCTCAGAAGAAAGAAAGAAAGTAAGCAACTTTAAAGAAATTCAGAAAAATATTTGTCTCTGCGGTGAAATAAAGATACAGGGTTTCGCTGGAAAAAAGAAATAAAGATACAGGGTCCGATCGGCTACTAAGATTTAAATTTTCGAGCAAATTTAAGATTTTTATGGTCGT
GAATTAGAGATACAGGCTTTGATTGGCCCTACGATTCAAATTTCCGAGTGAATATGAGTTTTGTTGTTTGTCTGTGGTGAATCGAGGATGTGGGGTTTGATCGGCCCTACAATTTAAATTTTCGAGCAAATTTATTATTATTTCTTTTTTTTGGTTGTGCGTGGTGAATTAAAGATGCGGGGTTTGATCGGCAAATTTTG
AGCATTTATGGTGACTTGAAGATATAGGGCCCTAGGATTTGAATTTCCGAGCCAATTAAGTCTTTTTCTGGATTGTCCGTAGTGAATTAAAGGTACATGGTTTGATTGGCCCGGGATTTAAATTTCCGAGGAAATTTGAGCATTTCTGGTTGTCTGTGGCGACGCAAAGATATACGGGTTAATCAGCTTCAGGATTTCAC
TTTCTGAGCAAATCTAAGCATTTCTGGTTGCAAGTCGTCGCAATTGCTGGTCTTCAGAAAATCAAGAAATCAACTTCTGTCAGGCCGTTGACCCGGTCCCCTTCTCCAAAATGGGATCTAAACCGAAGTCACAGCAGGATAATCGGCGGACCGAATGTTGCAATCCTGTGAGAAATTCAGGCGAGGCATCCTTAGAGCAT
GTTATGCTAGCTTTGAGGGAGACGAAAGAGGAGAGGGAATTAAGGATACGGAGTCTGTTTAATTTCTTCGATGCGATGAACAGTGGGCACCTTGATAATTCACAGATTGAGCGGGGTTTGCAGGCATTGCGGATACCGGCTGAATACAAGTATGCCAAGGATCTGCTTAAAGTTTGCGATTCCAATCAGGATGGTTGTGT
CGATTACCAGGAATTCCGGCTGTATATGGATGACAAGGAACTCGAGCTTTACCGCATTTTTCAGGCGATAGATGTTGCACACAATGGCTGCATTTTACCTGAAGAGCTATGGGAAGCACTTGTTAGAGCAGGCATTGAAATGAGTGATGAAGAGCTTGCACGTTTCGTGGAGCATATAGATAAGGATAATAATGGAATCA
TAACGTTTGAAGAGTGGCGGGATTTTCTCCTTTTATATCCACATGAGGCAACCATAGAAAACATTTATCGGTATTGGGAAAGGGTTTGCCCCATAGATATTGGGGAGCAAGCAGTTATTCCTGAAGGTATTAACAGGCACACACATGCATCCAATTATCTTATTGCTGGAGGGGTTGCTGGTGCTTTGTCTCGAACCGCT
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>TRINITY_DN111264_c0_g1_i3 from sample A1 / Example unspliced isoform:
TTGAACGCGATCGAATCTACCCCACTCCACTCTAACTCCATATTCGCTCGGCAGAGGGCGAAGAGAGAATGTGAAGCCAATAACAACAACAACAGCAGGCATATATTCAATGACTATATCTCCCTCGTGGGAACACTGGATCTTTCCATTATGCGCGTCAGGCCCCTATTCCTTGCAGATTCAGATGGATTTCCCGTCAT
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