sp|O64765|UAP2_ARATH ----> UDP-N-acetylglucosamine diphosphorylase 2
Intron 1 GTGGGTATTC ... GGGTTATCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 12.35 | 142 | 26.9 | 20 |
| A2 | 13.51 | 128 | 25.4 | 20 |
| A3 | 16.99 | 127 | 24.2 | 26 |
| A4 | 17.89 | 101 | 23.7 | 22 |
| A5 | 10 | 45 | 10.9 | 5 |
| A6 | 15.02 | 266 | 41.6 | 47 |
| A7 | 11.76 | 405 | 60.8 | 54 |
| A8 | 19.48 | 401 | 52.1 | 97 |
| A9 | 12.93 | 330 | 46.9 | 49 |
| A10 | 10.69 | 401 | 46.9 | 48 |
>TRINITY_DN44523_c0_g1_i9 from sample A7 / Example spliced isoformGTCTCTAATCGAAATTGATAAACCGAAGGATTCGGCCTTTTTGATATTCGACGCTACGTGCTGTCACCAGGTAAGCGAGAAATAATGGAAGGAAAGATCGAGAACAACCCCTGAGAGCTCTGCAACAACGTCCACACCATTAACAGTTGCAATTCTACCTATGTTGCATGTTTCTTGATCCTGGAAATAGCAATCCGGAG
ATTCTTAATGCAGGAGCCGAACGTTTTTTCACAGTTTTGGTCTTTTTAATAGAGGAGCCGAAGTTGTTTTCGAAAAGATTTTGGTGAATTAATCTTCATTTGCGCGTTGCCAGGGTTTCGGATCTGCATTGATGGGGGAAGCAGGGGGCGAAGATGCAGCTCCGCCTCAGGCTGTGCTGGAGCGTCTCAAAGATTTCGGC
CAGGAACAAACCCTAGCGCTGTGGAAGGAGCTGAGCTCTAATGAGCGCGACCTCCTCATTAAAGATCTCGAGAGCTTGGATCTTCCTCGAGTGGATCGAATTATAAAACACTCTCTCGCTTCACGTGATCGACCTGTACTCAATCTAGAACCAGTTCCTGAAGCAAGTGTCTCAACTGTTGAGGAAAGGACATTAGAAGA
GAGAGAAAAATGGTGGAGCATGGGATTAAAGGCCATACGTGAGGGCAAGCTTGCAGTCGTGCTTTTGTCTGGAGGCCAGGGTACCCGTCTAGGAAGTTCAGAGCCGAAGGGATGTTTCAACATTGGGCTTCCTTCGGGTAAATCACTATTCCAACTTCAAGCAGAGCGTATTTTACGTGTTCAGAGACTTGCAGCCCAGT
CAGCAGCTGATGGGCGAGTTACCCGAATCCATTGGTATGTAATGACAAGTTCATTTACACATGATGTGATACGCAAATTCTTTGAAAGTCGAAAATATTTTGGCTTGGAATCAGAACAAGTAACCTTTTTCCAGCAAGGTACACTCCCTTGTATTTCTAAGGAAGGACGAATTATCATGGAAACTCCATATCAGGTTGCA
AGGGCTCCAGATGGGAACGGAGGTGTTTATTCAGCACTGAAATTCTCAAAATGCTTGGAAGATATGGCGATGAAAGGGATCAAATACATTGATTGCTACGGAGTTGACAATGCTTTGGTCCGTGTCGCAGATCCAATGTTCCTAGGTTACTGTATTGATAAAGGTGTAGCTACTGCAGCCAAGGTTGTCCGGAAGGCATA
TCCACAAGAGAAGGTTGGTGTGTTTGTCCAGCGGGGTAAAGGAGGATCTTTCAGAGTAATAGAATACAGTGAGATGGATTCTTCCATGGCATATGCTATAAACCAGGAGACTGGGCGTCTTCGATTCAATTGGAGTAATGTATGCTTGCACATGTTTTCATTGGACTTTTTGAACCAGGTTACCGAAGATCTTGAACAGG
ACAGCATCTACCATCTGGCAGAGAAGAAAATGCCTTCTGTTGAGGGACATATATTGGGCATAAAGTTGGAGCAATTTATATTTGATGCATTTCCGTATGCACCTTCAATGGCTCTCTTTGAGGTGTTGCGTGAAGAAGAATTTGCACCTGTTAAAAATGCAAGTGGCAATGCAACTGATACACCTGAAACTTCTCGAATT
CTTGTTCTCCATCTTCATACTCGCTGGGTTATTGCTGCTGGTGGCTTTGTGACACATTCAGTACCTTTGTACACAACTGGGGTGGAGGTTTCACCACTTTGCTCTTATGCGGGAGAAAATTTGGAAGACATTTGCCGTGGACGGACTTTCCATGCTCCATGCGAGCTCACAGCTTAGAGCAGGAGCGATTGGTTCCAATG
GTAGAGGTATGCATTTATTACCGGCAACGTGTTTAAGTTGCATCGACTATGAAGGTGTTGAATTTCCAGTTCAGTGCACTGCTAAATTTGTAAGATGGGAGAGTGGCATCGTCAGGCACTGATGTTCAATTTTGTTGTAGAAATTTGGCAGTGTTAGGTTGGCATTTGAGTGCACAGTAGGAATTAGACATTTGAGCCTG
GTATCCTACTAGGCCTTTGGTCTTTGATGTTTTCACATGCTTTTATGAATGTTGATGTTTAGCTTTATGTTGCATTCTTCATTAAAATAGCAGCTGCTCGTATAAATTGTGTCAGGCCGCTCATGAATTTATTGCTAAATGGACTAATATCTTATTAGTCGTCTAAACTTTTGCTGAAGATGCCATGTGAACATGTCATT
TTCTTTAAGAGCTTTGTCAATGTGCTACATAATTCTTATTTATTTGAGGTATTTCATAAAAGTAGACGTCAC
>TRINITY_DN44523_c0_g1_i4 from sample A7 / Example unspliced isoform:CAGAATATCTGGATGGAAAGCAATGCAATTGCCAACCACAATAGTGGCTGGTAACCTCGAGGGACTTGACTTTTTTTGAACCTTGTGACTTGTGGACTTCCCATTGGTGACTTGCCTTGGACAGATAGTTTAATTGATTGAGCTAACGCTTGGGCCTGATCATTTTTGTTTCTATGTCATCAGAGTATTTAAAAAGTAGT
ATTGAAATAGTATGATCTTTGAATAGTACTAATATAATAGTGAAATGTTTCTAAATTAATGTTAAATATTATAATGGAAAAATATATTAAATATAAAGGATTACGATGTCTTACATAGTGTAACTGAATTCACTTAGGATTGCTATTTGTGTGTGCTCATCTTCCCTTTATTATAATGGGATATAACCTGTAAATAATAA
GAAACAGATTTTATGTTATTCAAGTACCATTCATAAGTTGACATGAGTTCTCTCAATGAGACTCTACAACTTAACGACTCTTGTTATTGGTAAAATTGTTTTTCGGTTATATGTATGTGAGAATACTTTTTGGTTATAATTTTGCCTTTGTGTATTACTAGTGAGTAGTAAATTGCTTGTTAATTTTTTATCTGGCTTAA
TTGGCCCTTCTTAACATGACAGGTATGCTTGCACATGTTTTCATTGGACTTTTTGAACCAGGTTACCGAAGATCTTGAACAGGACAGCATgtgggtattctctcttacatttctgttttagttaagtgtggtgcttcatgtacattggttgctaccatgttttctttctctccttgcacatgttttgtgagatttgtagt
atttgtggatcaataggaatatcaaacagtttacacagaagttgttatattaacatttagctgtagtctgtgcctttctatgacctccatatattgtgttagtagaagatgtccttcataaaacttctctgttgatcgaacattagacaagttctcatatggaagagatgttactgtgaaaatatggttttggggaacaa
agagattttagcagtctattcaaatgacactactttaaacaaaatcattagttatcaatgattcaatatccaaattctgaatttggaagtcttaacacttggtttatgataagaaatgtgtcattgttcatgatttttacacctgagaattacgagtgtctttgtcaaaaccattggtactagactgttttcatagtaac
tgtattttggaaatatcttaatgctgaagttctaaaacattccaaacaatattttgaaaagagatcaccttgatgatgcataatataaattgaaaaaaattggcagatgatggtatatgtgagtaattgtggcattagttcatttaacgtatcctgaattattggtttgaaatgcttggaaaaaaagtctttaagagaga
gttaccagacattttaattcctgagaagtgccaccaacttggctatccaagcaagtttgaggagctatgcatcagtgaaataagtaggttgggtatatgcttcttcaagtgtgctgaatttctcttcaactatgtctctgccccaaaagtgtttgaggagttatctgtaggactaactgtagagaacacaaattgatttg
agcttatttaaagcttgtttagcccttctgttggttacttaatgtcaaattataaatccactttatgtcaaataataaattcagtggtgtttcgatgaagttttcatatgaacagtaatctagttgtttttgataaattattttattttttgcattgctaaaaatgtaaaggtgtgcaattttttatagagtgatgcttc
agtgatgttatgccaaagtcataggtagcatctcatgacatgttttgccgggttatcagCTACCATCTGGCAGAGAAGAAAATGCCTTCTGTTGAGGGACATATATTGGGCATAAAGTTGGAGCAATTTATATTTGATGCATTTCCGTATGCACCTTCAATGGCTCTCTTTGAGGTGTTGCGTGAAGAAGAATTTGCACC
TGTTAAAAATGCAAGTGGCAATGCAACTGATACACCTGAAACTTCTCGAATTCTTGTTCTCCATCTTCATACTCGCTGGGTTATTGCTGCTGGTGGCTTTGTGACACATTCAGTACCTTTGTACACAACTGGGGTGGAGGTTTCACCACTTTGCTCTTATGCGGGAGAAAATTTGGAAGACATTTGCCGTGGACGGACTT
TCCATGCTCCATGCGAGCTCACAGCTTAGGTGGAATTCTGATTAATAACTGTTGCAGTTTTAGAATGAAATTTTTATTACAAATTCAGCAATTGAAATTATTTGTGACAGAGCAGGAGCGATTGGTTCCAATGGTAGAGGTATGCATTTATTACCGGCAACGTAAGCTTTATGATTGTTCAGTTGATTTTCCTCAGTAGT
ACTGTTTATAGAACTTTGCAATCTTGTTTGTTGAATTAGGATTAAATTTCTTGTAAGTAGATTTGCACATACTTTGCCTGAGATTAATTGATTGATAGTGATGGACAGCTCCTGCATTCTGTGTGTTTTTATCCTACAAGAGCTTTATATGTTAATTATCTACCATGGAGGCAGTAATACATAAATTAGAGATTTTAAGG
ATTACTGCGTTGTTGTTTTTACCAGTTGATATTCGTAGTCAAATAATTTTTTTTGTTATCTGACATGGTCAACAGTACAGATCTATCTTTCAATCTGTCGTCTAAAATTGTTCATATCTTAATATCATTCTCTTTTCTTGTTTGTTTCCACATCAGGTGTTTAAGTTGCATCGACTATGAAGGTGTTGAATTTCCAGTTC
AGTGCACTGCTAAATTTGTAAGATGGGAGAGTGGCATCGTCAGGCACTGATGTTCAATTTTGTTGTAGAAATTTGGCAGTGTTAGGTTGGCATTTGAGTGCACAGTAGGAATTAGACATTTGAGCCTGGTATCCTACTAGGCCTTTGGTCTTTGATGTTTTCACATGCTTTTATGAATGTTGATGTTTAGCTTTATGTTG
CATTCTTCATTAAAATAGCAGCTGCTCGTATAAATTGTGTCAGGCCGCTCATGAATTTATTGCTAAATGGACTAATATCTTATTAGTCGTCTAAACTTTTGCTGAAGATGCCATGTGAACATGTCATTTTCTTTAAGAGCTTTGTCAATGTGCTACATAATTCTTATTTATTTGAGGTATTTCATAAAAGTAGACGTCAC
Intron 2 GTAAGATCCA ... ATGAAATCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 14.44 | 93.4 | 16.2 | 7 |
| A2 | 12.48 | 99.5 | 14.5 | 6 |
| A3 | 12.5 | 115.2 | 17.4 | 4 |
| A4 | 11.47 | 107.1 | 14.8 | 6 |
| A5 | 17.54 | 56.4 | 12.5 | 2 |
| A6 | 7.31 | 147.1 | 12.4 | 0 |
| A7 | 13.92 | 316.2 | 54.6 | 0 |
| A8 | 11.74 | 223.8 | 32.2 | 0 |
| A9 | 12.84 | 269.6 | 41.8 | 0 |
| A10 | 10.45 | 280.2 | 34.3 | 0 |
>TRINITY_DN116077_c6_g1_i8 from sample A2 / Example spliced isoformGAAACTGATAAACCGAAGGATTCGGCCTTTTTGATATTCGACGCTACGTGCTGTCACCAGGGTTTCGGATCTGCATTGATGGGGGAAGCAGGGGGCGAAGATGCAGCTCCGCCTCAGGCTGTGCTGGAGCGTCTCAAAGATTTCGGCCAGGAACAAACCCTAGCGCTGTGGAAGGAGCTGAGCTCTAATGAGCGCGACCT
CCTCATTAAAGACCTCGAGAGCTTGGATCTTCCTCGAGTGGATCGAATTATAAAACACTCTCTCGCTTCACGTGATCGACCTGTACTCAATCTAGAACCAGTTCCTGAAGCAAGTGTCTCAACTGTTGAGGAAAGGACATTAGAAGAGAGAGAAAAATGGTGGAGCATGGGATTAAAGGCCATACGTGAGGGCAAGCTTG
CAGTCGTGCTTTTGTCTGGAGGCCAGGGTACCCGTCTAGGAAGTTCAGAGCCGAAGGGATGTTTCAACATTGGGCTTCCTTCGGGTAAATCACTATTCCAACTTCAAGCAGAGCGTATTTTACGTGTTCAGAGACTTGCAGCCCAGTCAGCAGCTGATGGGCGAGTTACCCGAATCCATTGGTATGTAATGACAAGTTCA
TTTACACATGATGTGATACGCAAATTCTTTGAAAGTCGAAAATATTTTGGCTTGGAATCAGAACAAGTAACCTTTTTCCAGCAAGGTACACTCCCTTGTATTTCTAAGGAAGGACGAATTATCATGGAAACTCCATATCAGGTTGCAAGGGCTCCAGATGGGAACGGAGGTGTTTATTCAGCACTGAAATTCTCAAAATG
CTTGGAAGATATGGCGATGAAAGGGATCAAATACATTGATTGCTACGGAGTTGACAATGCTTTGGTCCGTGTCGCAGATCCAATGTTCCTAGGTTACTGTATTGATAAAGGTGTAGCTACTGCAGCCAAGGTTGTCCGGAAGGCATATCCACAAGAGAAGGTTGGTGTGTTCGTCCAGCGGGGTAAAGGAGGATCTTTCA
GAGTAATAGAATACAGTGAGATGGATTCTTCCATGGCATATGCTATAAACCAGGAGACTGGGCGTCTTCGATTCAATTGGAGTAATGTATGCTTGCACATGTTTTCATTGGACTTTTTGAACCAGGTTACCGAAGATCTTGAACAGGACAGCATCTACCATCTGGCAGAGAAGAAAATGCCTTCTGTTGAGGGACATATA
TTGGGCATAAAGTTGGAGCAATTTATATTTGATGCATTTCCGTATGCACCTTCAATGGCTCTCTTTGAGGTGTTGCGTGAAGAAGAATTTGCACCTGTTAAAAATGCAAGTGGCAATGCAACTGATACACCTGAAACTTCTCGAATTCTTGTTCTCCATCTTCATACTCGCTGGGTTATTGCTGCTGGTGGCTTTGTGAC
ACATTCAGTACCTTTGTACACAACTGGGGTGGAGGTTTCACCACTTTGCTCTTATGCGGGAGAAAATTTGGAAGACATTTGCCGTGGACGGACTTTCCATGCTCCATGCGAGCTCACAGCTTAGGTGGAATTCTGATTAATAACTGTTGCAGTTTTAGAATGAAATTTTTATTACAAATTCAGCAATTGAAATTATTTGT
GACAGAGCAGGAGCGATTGGTTCCAATGGTAGAGGTATGCATTTATTACCGGCAACGTAAGCTTTATGATTGTTCAGTTGATTTTCCTCAGTAGTACTGTTTATAGAACTTTGCAATCTTGTTTGTTGAATTAGGATTAAATTTCTTGTAAGTAGATTTGCACATACTTTGCCTGAGATTAATTGATTGATAGTGATGGA
CAGCTCCTGCATTCTGTGTGTTTTTA
>TRINITY_DN116077_c6_g1_i15 from sample A2 / Example unspliced isoform:ACATTGAGATATGCAATTGCAAACATGCGATGAAGAAGAGACTTTTTGTTTGTTTGTCTATTTTATCGTATCTTTTAGTGAGTCCACATTCAATAATGCATAGGAGTTGTTATCTTAATTCAACTTCTAGTTTATTAAAAGAAAGTGTGCTGCAATCTTAGGTTGCAAGGGCTCCAGATGGGAACGGAGGTGTTTATTCA
GCACTGAAATTCTCAAAATGCTTGGAAGATATGGCGATGAAAGGGATCAAATACATTGATTGCTACGGAGTTGACAATGCTTTGgtaagatccaaatgatgacagctgcaaatgtacattatatagcagcattcatgaaggaaacttgttcttatttctatatttcatgaaatcagGTCCGTGTCGCAGATCCAATGTTC
CTAGGTTACTGTATTGATAAAGGTGTAGCTACTGCAGCCAAGGTTGTCCGGAAGGTATGTTTGTTAGAATGTTAGCTAAACTCCGTTCTTATGCTTATGTTTATGCTGGATCATCTCTCTCTCTCTCTCTTTCTCTCTCATCTGACCATGCTTATATAATTTGTGTCTTGTTTCTTTCTCTGGACTGATCATGATGCTAA
TATTTTACGGACTGAATCATTACAATGTTTCTGAAATTTTTTATTAGAAATATATGATTAGGGCTCCATGATGTGCACATTATTTATCCTTTTCAAAGCTGAATTTGTTGTTCATGTGCTATTTATTTTGCTAATTTATCTTGTTGTTCAATGCAGGCATATCCACAAGAGAAGGTTGGTGTGTTCGTCCAGCGGGGTAA
AGGAGGATCTTTCAGAGTAATAGAATACAGTGAGATGGATTCTTCCATGGCATATGCTATAAACCAGGAGACTGGGCGTCTTCGATTCAATTGGAGTAATGTATGCTTGCACATGTTTTCATTGGACTTTTTGAACCAGGTTACCGAAGATCTTGAACAGGACAGCATCTACCATCTGGCAGAGAAGAAAATGCCTTCTG
TTGAGGGACATATATTGGGCATAAAGTTGGAGCAATTTATATTTGATGCATTTCCGTATGCACCTTCAATGGCTCTCTTTGAGGTGTTGCGTGAAGAAGAATTTGCACCTGTTAAAAATGCAAGTGGCAATGCAACTGATACACCTGAAACTTCTCGAATTCTTGTTCTCCATCTTCATACTCGCTGGGTTATTGCTGCT
GGTGGCTTTGTGACACATTCAGTACCTTTGTACACAACTGGGGTGGAGGTTTCACCACTTTGCTCTTATGCGGGAGAAAATTTGGAAGACATTTGCCGTGGACGGACTTTCCATGCTCCATGCGAGCTCACAGCTTAGGTGGAATTCTGATTAATAACTGTTGCAGTTTTAGAATGAAATTTTTATTACAAATTCAGCAA
TTGAAATTATTTGTGACAGAGCAGGAGCGATTGGTTCCAATGGTAGAGGTGTTTAAGTTGCATCGACTATGAAGGTGTTGAATTTCCAGTTCAGTGCACTGCTAAATTTGTAAGATGGGAGAGTGGCATCGTCAGGCACTGATGTTCAATTTTGTTGTAGAAATTTGGCAGTGTTAGGTTGGCATTTGAGTGCACAGTAG
GAATTAGACATTTGAGCCTGGTATCCTACTAGGCCTTTGGTCTTTGATGTTTTCACATGCTTTTATGAATGTTGATGTTTAGCTTTATGTTGCATTCTTCATTAAAATAGCAGCTGCTCGTATAAATTGTGTCAGGCTGCTCATGAATTTATTGCTAAATGGACTAATATCTTATTAGTCGTCTAAACTTTTGCTGAAGA
TGCCATGTGAACATGTCATTTTCTTTAAGAGCTTTGTCAATGTGCTACATAATTCTTATTTATTTGAGGTATTTCATAAAAGTAG
Intron 3 GTGGAATTCT ... GACAGAGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 44.84 | 63 | 47 | 57.2 |
| A2 | 45.5 | 75 | 64.6 | 61 |
| A3 | 42.86 | 70 | 60.2 | 45.8 |
| A4 | 44.4 | 53 | 39 | 47.4 |
| A5 | 36.2 | 26 | 12 | 18.1 |
| A6 | 44.09 | 244 | 222.3 | 169.4 |
| A7 | 45.68 | 353 | 340.8 | 265.1 |
| A8 | 45.04 | 471 | 401.6 | 390 |
| A9 | 53.62 | 241 | 295.6 | 273.7 |
| A10 | 47.8 | 293 | 307.2 | 239.9 |
>TRINITY_DN116077_c6_g1_i26 from sample A2 / Example spliced isoformGAAACTGATAAACCGAAGGATTCGGCCTTTTTGATATTCGACGCTACGTGCTGTCACCAGGGTTTCGGATCTGCATTGATGGGGGAAGCAGGGGGCGAAGATGCAGCTCCGCCTCAGGCTGTGCTGGAGCGTCTCAAAGATTTCGGCCAGGAACAAACCCTAGCGCTGTGGAAGGAGCTGAGCTCTAATGAGCGCGACCT
CCTCATTAAAGACCTCGAGAGCTTGGATCTTCCTCGAGTGGATCGAATTATAAAACACTCTCTCGCTTCACGTGATCGACCTGTACTCAATCTAGAACCAGTTCCTGAAGCAAGTGTCTCAACTGTTGAGGAAAGGACATTAGAAGAGAGAGAAAAATGGTGGAGCATGGGATTAAAGGCCATACGTGAGGGCAAGCTTG
CAGTCGTGCTTTTGTCTGGAGGCCAGGGTACCCGTCTAGGAAGTTCAGAGCCGAAGGGATGTTTCAACATTGGGCTTCCTTCGGGTAAATCACTATTCCAACTTCAAGCAGAGCGTATTTTACGTGTTCAGAGACTTGCAGCCCAGTCAGCAGCTGATGGGCGAGTTACCCGAATCCATTGGTATGTAATGACAAGTTCA
TTTACACATGATGTGATACGCAAATTCTTTGAAAGTCGAAAATATTTTGGCTTGGAATCAGAACAAGTAACCTTTTTCCAGCAAGGTACACTCCCTTGTATTTCTAAGGAAGGACGAATTATCATGGAAACTCCATATCAGGTTGCAAGGGCTCCAGATGGGAACGGAGGTGTTTATTCAGCACTGAAATTCTCAAAATG
CTTGGAAGATATGGCGATGAAAGGGATCAAATACATTGATTGCTACGGAGTTGACAATGCTTTGGTCCGTGTCGCAGATCCAATGTTCCTAGGTTACTGTATTGATAAAGGTGTAGCTACTGCAGCCAAGGTTGTCCGGAAGGCATATCCACAAGAGAAGGTTGGTGTGTTCGTCCAGCGGGGTAAAGGAGGATCTTTCA
GAGTAATAGAATACAGTGAGATGGATTCTTCCATGGCATATGCTATAAACCAGGAGACTGGGCGTCTTCGATTCAATTGGAGTAATGTATGCTTGCACATGTTTTCATTGGACTTTTTGAACCAGGTTACCGAAGATCTTGAACAGGACAGCATCTACCATCTGGCAGAGAAGAAAATGCCTTCTGTTGAGGGACATATA
TTGGGCATAAAGTTGGAGCAATTTATATTTGATGCATTTCCGTATGCACCTTCAATGGCTCTCTTTGAGGTGTTGCGTGAAGAAGAATTTGCACCTGTTAAAAATGCAAGTGGCAATGCAACTGATACACCTGAAACTTCTCGAATTCTTGTTCTCCATCTTCATACTCGCTGGGTTATTGCTGCTGGTGGCTTTGTGAC
ACATTCAGTACCTTTGTACACAACTGGGGTGGAGGTTTCACCACTTTGCTCTTATGCGGGAGAAAATTTGGAAGACATTTGCCGTGGACGGACTTTCCATGCTCCATGCGAGCTCACAGCTTAGGAGCGATTGGTTCCAATGGTAGAGGTGTTTAAGTTGCATCGACTATGAAGGTGTTGAATTTCCAGTTCAGTGCACT
GCTAAATTTGTAAGATGGGAGAGTGGCATCGTCAGGCACTGATGTTCAATTTTGTTGTAGAAATTTGGCAGTGTTAGGTTGGCATTTGAGTGCACAGTAGGAATTAGACATTTGAGCCTGGTATCCTACTAGGCCTTTGGTCTTTGATGTTTTCACATGCTTTTATGAATGTTGATGTTTAGCTTTATGTTGCATTCTTC
ATTAAAATAGCAGCTGCTCGTATAAATTGTGTCAGGCTGCTCATGAATTTATTGCTAAATGGACTAATATCTTATTAGTCGTCTAAACTTTTGCTGAAGATGCCATGTGAACATGTCATTTTCTTTAAGAGCTTTGTCAATGTGCTACATAATTCTTATTTATTTGAGGTATTTCATAAAAGTAG
>TRINITY_DN116077_c6_g1_i20 from sample A2 / Example unspliced isoform:TTCGGTTATATGTATGTGAGAATACTTTTTGGTTATAATTTTGCTTTTGTGTATTACTAGTGAGTAGTAAATTGCTTGTTAATTTTTTATCTTGATGGTTAATTTTTTATCTGGCTTAATTGGCCCTTCTTAACATGACAGGTATGCTTGCACATGTTTTCATTGGACTTTTTGAACCAGGTTACCGAAGATCTTGAACA
GGACAGCATCTACCATCTGGCAGAGAAGAAAATGCCTTCTGTTGAGGGACATATATTGGGCATAAAGTTGGAGCAATTTATATTTGATGCATTTCCGTATGCACCTTCAATGGCTCTCTTTGAGGTGTTGCGTGAAGAAGAATTTGCACCTGTTAAAAATGCAAGTGGCAATGCAACTGATACACCTGAAACTTCTCGAA
TTCTTGTTCTCCATCTTCATACTCGCTGGGTTATTGCTGCTGGTGGCTTTGTGACACATTCAGTACCTTTGTACACAACTGGGGTGGAGGTTTCACCACTTTGCTCTTATGCGGGAGAAAATTTGGAAGACATTTGCCGTGGACGGACTTTCCATGCTCCATGCGAGCTCACAGCTTAGgtggaattctgattaataact
gttgcagttttagaatgaaatttttattacaaattcagcaattgaaattatttgtgacagagcagGAGCGATTGGTTCCAATGGTAGAGGTGTTTAAGTTGCATCGACTATGAAGGTGTTGAATTTCCAGTTCAGTGCACTGCTAAATTTGTAAGATGGGAGAGTGGCATCGTCAGGCACTGATGTTCAATTTTGTTGTA
GAAATTTGGCAGTGTTAGGTTGGCATTTGAGTGCACAGTAGGAATTAGACATTTGAGCCTGGTATCCTACTAGGCCTTTGGTCTTTGATGTTTTCACATGCTTTTATGAATGTTGATGTTTAGCTTTATGTTGCATTCTTCATTAAAATAGCAGCTGCTCGTATAAATTGTGTCAGGCTGCTCATGAATTTATTGCTAAA
TGGACTAATATCTTATTAGTCGTCTAAACTTTTGCTGAAGATGCCATGTGAACATGTCATTTTCTTTAAGAGCTTTGTCAATGTGCTACATAATTCTTATTTATTTGAGGTATTTCATAAAAGTAG
Intron 4 GTATTTTTGT ... TTCAATGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 20.81 | 137 | 5 | 36 |
| A2 | 22.96 | 104 | 9 | 31 |
| A3 | 20.12 | 89 | 5 | 22.4 |
| A4 | 19.01 | 98 | 7 | 23 |
| A5 | 13.95 | 37 | 1 | 6 |
| A6 | 18.1 | 143 | 0 | 31.6 |
| A7 | 20.23 | 245.1 | 0 | 62.2 |
| A8 | 20.2 | 237 | 0 | 60 |
| A9 | 18.07 | 214.1 | 0 | 47.2 |
| A10 | 19.96 | 246 | 0 | 61.4 |
>TRINITY_DN116077_c6_g1_i8 from sample A2 / Example spliced isoformGAAACTGATAAACCGAAGGATTCGGCCTTTTTGATATTCGACGCTACGTGCTGTCACCAGGGTTTCGGATCTGCATTGATGGGGGAAGCAGGGGGCGAAGATGCAGCTCCGCCTCAGGCTGTGCTGGAGCGTCTCAAAGATTTCGGCCAGGAACAAACCCTAGCGCTGTGGAAGGAGCTGAGCTCTAATGAGCGCGACCT
CCTCATTAAAGACCTCGAGAGCTTGGATCTTCCTCGAGTGGATCGAATTATAAAACACTCTCTCGCTTCACGTGATCGACCTGTACTCAATCTAGAACCAGTTCCTGAAGCAAGTGTCTCAACTGTTGAGGAAAGGACATTAGAAGAGAGAGAAAAATGGTGGAGCATGGGATTAAAGGCCATACGTGAGGGCAAGCTTG
CAGTCGTGCTTTTGTCTGGAGGCCAGGGTACCCGTCTAGGAAGTTCAGAGCCGAAGGGATGTTTCAACATTGGGCTTCCTTCGGGTAAATCACTATTCCAACTTCAAGCAGAGCGTATTTTACGTGTTCAGAGACTTGCAGCCCAGTCAGCAGCTGATGGGCGAGTTACCCGAATCCATTGGTATGTAATGACAAGTTCA
TTTACACATGATGTGATACGCAAATTCTTTGAAAGTCGAAAATATTTTGGCTTGGAATCAGAACAAGTAACCTTTTTCCAGCAAGGTACACTCCCTTGTATTTCTAAGGAAGGACGAATTATCATGGAAACTCCATATCAGGTTGCAAGGGCTCCAGATGGGAACGGAGGTGTTTATTCAGCACTGAAATTCTCAAAATG
CTTGGAAGATATGGCGATGAAAGGGATCAAATACATTGATTGCTACGGAGTTGACAATGCTTTGGTCCGTGTCGCAGATCCAATGTTCCTAGGTTACTGTATTGATAAAGGTGTAGCTACTGCAGCCAAGGTTGTCCGGAAGGCATATCCACAAGAGAAGGTTGGTGTGTTCGTCCAGCGGGGTAAAGGAGGATCTTTCA
GAGTAATAGAATACAGTGAGATGGATTCTTCCATGGCATATGCTATAAACCAGGAGACTGGGCGTCTTCGATTCAATTGGAGTAATGTATGCTTGCACATGTTTTCATTGGACTTTTTGAACCAGGTTACCGAAGATCTTGAACAGGACAGCATCTACCATCTGGCAGAGAAGAAAATGCCTTCTGTTGAGGGACATATA
TTGGGCATAAAGTTGGAGCAATTTATATTTGATGCATTTCCGTATGCACCTTCAATGGCTCTCTTTGAGGTGTTGCGTGAAGAAGAATTTGCACCTGTTAAAAATGCAAGTGGCAATGCAACTGATACACCTGAAACTTCTCGAATTCTTGTTCTCCATCTTCATACTCGCTGGGTTATTGCTGCTGGTGGCTTTGTGAC
ACATTCAGTACCTTTGTACACAACTGGGGTGGAGGTTTCACCACTTTGCTCTTATGCGGGAGAAAATTTGGAAGACATTTGCCGTGGACGGACTTTCCATGCTCCATGCGAGCTCACAGCTTAGGTGGAATTCTGATTAATAACTGTTGCAGTTTTAGAATGAAATTTTTATTACAAATTCAGCAATTGAAATTATTTGT
GACAGAGCAGGAGCGATTGGTTCCAATGGTAGAGGTATGCATTTATTACCGGCAACGTAAGCTTTATGATTGTTCAGTTGATTTTCCTCAGTAGTACTGTTTATAGAACTTTGCAATCTTGTTTGTTGAATTAGGATTAAATTTCTTGTAAGTAGATTTGCACATACTTTGCCTGAGATTAATTGATTGATAGTGATGGA
CAGCTCCTGCATTCTGTGTGTTTTTA
>TRINITY_DN116077_c6_g1_i15 from sample A2 / Example unspliced isoform:ACATTGAGATATGCAATTGCAAACATGCGATGAAGAAGAGACTTTTTGTTTGTTTGTCTATTTTATCGTATCTTTTAGTGAGTCCACATTCAATAATGCATAGGAGTTGTTATCTTAATTCAACTTCTAGTTTATTAAAAGAAAGTGTGCTGCAATCTTAGGTTGCAAGGGCTCCAGATGGGAACGGAGGTGTTTATTCA
GCACTGAAATTCTCAAAATGCTTGGAAGATATGGCGATGAAAGGGATCAAATACATTGATTGCTACGGAGTTGACAATGCTTTGGTAAGATCCAAATGATGACAGCTGCAAATGTACATTATATAGCAGCATTCATGAAGGAAACTTGTTCTTATTTCTATATTTCATGAAATCAGGTCCGTGTCGCAGATCCAATGTTC
CTAGGTTACTGTATTGATAAAGGTGTAGCTACTGCAGCCAAGGTTGTCCGGAAGgtatgtttgttagaatgttagctaaactccgttcttatgcttatgtttatgctggatcatctctctctctctctctttctctctcatctgaccatgcttatataatttgtgtcttgtttctttctctggactgatcatgatgctaa
tattttacggactgaatcattacaatgtttctgaaattttttattagaaatatatgattagggctccatgatgtgcacattatttatccttttcaaagctgaatttgttgttcatgtgctatttattttgctaatttatcttgttgttcaatgcagGCATATCCACAAGAGAAGGTTGGTGTGTTCGTCCAGCGGGGTAA
AGGAGGATCTTTCAGAGTAATAGAATACAGTGAGATGGATTCTTCCATGGCATATGCTATAAACCAGGAGACTGGGCGTCTTCGATTCAATTGGAGTAATGTATGCTTGCACATGTTTTCATTGGACTTTTTGAACCAGGTTACCGAAGATCTTGAACAGGACAGCATCTACCATCTGGCAGAGAAGAAAATGCCTTCTG
TTGAGGGACATATATTGGGCATAAAGTTGGAGCAATTTATATTTGATGCATTTCCGTATGCACCTTCAATGGCTCTCTTTGAGGTGTTGCGTGAAGAAGAATTTGCACCTGTTAAAAATGCAAGTGGCAATGCAACTGATACACCTGAAACTTCTCGAATTCTTGTTCTCCATCTTCATACTCGCTGGGTTATTGCTGCT
GGTGGCTTTGTGACACATTCAGTACCTTTGTACACAACTGGGGTGGAGGTTTCACCACTTTGCTCTTATGCGGGAGAAAATTTGGAAGACATTTGCCGTGGACGGACTTTCCATGCTCCATGCGAGCTCACAGCTTAGGTGGAATTCTGATTAATAACTGTTGCAGTTTTAGAATGAAATTTTTATTACAAATTCAGCAA
TTGAAATTATTTGTGACAGAGCAGGAGCGATTGGTTCCAATGGTAGAGGTGTTTAAGTTGCATCGACTATGAAGGTGTTGAATTTCCAGTTCAGTGCACTGCTAAATTTGTAAGATGGGAGAGTGGCATCGTCAGGCACTGATGTTCAATTTTGTTGTAGAAATTTGGCAGTGTTAGGTTGGCATTTGAGTGCACAGTAG
GAATTAGACATTTGAGCCTGGTATCCTACTAGGCCTTTGGTCTTTGATGTTTTCACATGCTTTTATGAATGTTGATGTTTAGCTTTATGTTGCATTCTTCATTAAAATAGCAGCTGCTCGTATAAATTGTGTCAGGCTGCTCATGAATTTATTGCTAAATGGACTAATATCTTATTAGTCGTCTAAACTTTTGCTGAAGA
TGCCATGTGAACATGTCATTTTCTTTAAGAGCTTTGTCAATGTGCTACATAATTCTTATTTATTTGAGGTATTTCATAAAAGTAG
Intron 5 GTGTGCTTAG ... GGTATGTTAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 27.96 | 75.9 | 2.3 | 30 |
| A2 | 25 | 82.8 | 0 | 27.5 |
| A3 | 30.53 | 96.6 | 3.7 | 43.5 |
| A4 | 31.31 | 88.7 | 5 | 40.8 |
| A5 | 27.69 | 57 | 1 | 22.5 |
| A6 | 25.98 | 124.4 | 0 | 45.2 |
| A7 | 27.82 | 286.6 | 0.1 | 114.5 |
| A8 | 26.17 | 195.4 | 0 | 70.8 |
| A9 | 28.57 | 238.7 | 0.1 | 99 |
| A10 | 27.93 | 250.1 | 0 | 100.7 |
>TRINITY_DN113623_c0_g2_i12 from sample A3 / Example spliced isoformATAGAGTAGCATTAGGAGCTGCTTTTTTACTCCCACTATGTATTTACACTGGATGTAATTTTGTTGGACATTGATAAAATTATCTTTTCTTATCAACTTCTCATTAAAGGTACATATCTCTCTATACAGTATTTTTATTGAGAAATTTTAATAAGTTCTGTTTCAGCTAGTTCATTTTTTTTCTTGGAATTTGCAATATA
TATGCAATATGTTTCTGCTCCAAAGCTCCCCTAGACTACCCTCTGTGTCTGGCATTAGATTTTGAAATATACTATATTTGCAGTTTAAATCTTCATGATTCAATGGGCCTTCTTTTATGAGTTTAATGACCTGTCATTCCATGAGTTTAATGACCTGTCATTCCATTCAGGGTACCCGTCTAGGAAGTTCAGAGCCGAAG
GGATGTTTCAGTAAGTTCAGTGACTCATGTGATTGTATGAATTATGTTTTAATTTATTTACTCACTGCACTGTTTAGACTGGTAAGTTTATGTAACATTAGTCTACCATATAAGGAATATGGTGGAATTAAGTTGGGAAAAAGATCCTCAGGTTGTTGTACCATTGATTATAATGGTTTAGAAGGCAAAGTCACTGTCTA
TTCATGAGCATGAAGCATTCATGTCCAAGATAATATTTCTTCCCTAATCTACAGAAAACTGGTTGTGCTGTTGTATTTCAGACATTGGGCTTCCTTCGGGTAAATCACTATTCCAACTTCAAGCAGAGCGTATTTTACGTGTTCAGAGACTTGCAGCCCAGTCAGCAGCTGATGGGCGAGTTACCCGAATCCATTGGTAT
GTAATGACAAGTTCATTTACACATGATGTGATACGCAAATTCTTTGAAAGTCGAAAATATTTTGGCTTGGAATCAGAACAAGTAACCTTTTTCCAGCAAGGTACACTCCCTTGTATTTCTAAGGAAGGACGAATTATCATGGAAACTCCATATCAGGTTGCAAGGGCTCCAGATGGGAACGGAGGTGTTTATTCAGCACT
GAAATTCTCAAAATGCTTGGAAGATATGGCGATGAAAGGGATCAAATACATTGATTGCTACGGAGTTGACAATGCTTTGGTCCGTGTCGCAGATCCAATGTTCCTAGGTTACTGTATTGATAAAGGTGTAGCTACTGCAGCCAAGGTTGTCCGGAAGGCATATCCACAAGAGAAGGTTGGTGTGTTTGTCCAGCGGGGTA
AAGGAGGATCTTTCAGAGTAATAGAATACAGTGAGATGGATTCTTCCATGGCATATGCTATAAACCAGGAGACTGGGCGTCTTCGATTCAATTGGAGTAATGTATGCTTGCACATGTTTTCATTGGACTTTTTGAACCAGGTTACCGAAGATCTTGAACAGGACAGCATCTACCATCTGGCAGAGAAGAAAATGCCTTCT
GTTGAGGGACATATATTGGGCATAAAGTTGGAGCAATTTATATTTGATGCATTTCCGTATGCACCTTCAATGGCTCTCTTTGAGGTGTTGCGTGAAGAAGAATTTGCACCTGTTAAAAATGCAAGTGGCAATGCAACTGATACACCTGAAACTTCTCGAATTCTTGTTCTCCATCTTCATACTCGCTGGGTTATTGCTGC
TGGTGGCTTTGTGACACATTCAGTACCTTTGTACACAACTGGGGTGGAGGTTTCACCACTTTGCTCTTATGCGGGAGAAAATTTGGAAGACATTTGCCGTGGACGGACTTTCCATGCTCCATGCGAGCTCACAGCTTAGAGCAGGAGCGATTGGTTCCAATGGTAGAGGTGTTTAAGTTGCATCGACTATGAAGGTGTTG
AATTTCCAGTTCAGTGCACTGCTAAATTTGTAAGATGGGAGAGTGGCATCGTCAGGCACTGATGTTCAATTTTGTTGTAGAAATTTGGCAGTGTTAGGTTGGCATTTGAGTGCACAGTAGGAATTAGACATTTGAGCCTGGTATCCTACTAGGCCTTTGGTCTTTGATGTTTTCACATGCTTTTATGAATGTTGATGTTT
AGCTTTATGTTGCATTCTTCATTAAAATAGCAGCTGCTCGTATAAATTGTGTCAGGCTGCTCATGAATTTATTGCTAAATGGACTAATATCTTATTAGTCGTCTAAACTTTTGTTGAAGATGCCATGTGAACATGTCATTTTCTTTAAGAGCTTTGTCAATGTGCTACATAATTCTTATTTATTTGAGGTATTTCATAAA
AG
>TRINITY_DN113623_c0_g2_i20 from sample A3 / Example unspliced isoform:GGATTACTCAAACTCATCACTATAGACAGTAGACTTTAGGCTTATTTTTTCCTTAACCACTCTTTTCACAGTAATGTAAAATGAGGCAAATTTTGTATCACAGGAATTTATTTCCCTTCACAAATTCTCTCATTGACACCTGGCAATTTGGCTAAATTGTGCAACAATAAATCAAGGTAGTGTGCAGCACAAGGGGGTCC
AATATATGGTTTGGTAGTTCTCCATAATCATCTTTTCATTATCAACACTATTTGTGGCATTATTTGTAACATCCTAGACCACATTTTCCTCCCCAACTTTATGAATTGCTTTCTGGAAAATTCAGAAAATATATTCTGATGTGTTCGTCTGATCCATTGCATCCACTGCCTTAAAAAATGATACAACTTGATGGAAATGA
ACCAACACATTATTTAATGGTCTATGACACGTCTGATCAACCACCACTTAAAATTGCGCAACTGTAAGTTTCTGAGACTCTTCAATAGAAGATAATATATCTCACTCTTTCCTTTGATCTCTTTAGAAGAGTGGTTCTCAAAACCTTGGATTTGGCAATAGCATACCCATTGCCAAACTATCAACCTTTTTGAAGGGCAT
CTCCCATGATGTTTGAAACTTTATTCTTGTGATATTTTTAGCTTGGGCATGCAGATTTATAAGAGATATGATGTGACTATGGCGCTTGTTGATTTGAGCATCCAACAAGCACTTGATGAAAGTTGGAATCTGCATGTTTAGCATTGTTTCCCTGGTACTGGTACATTTTATCAATGGACTTGGAGATATGGCTTGTATTT
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GTTTGTTAAAATATTCTCCAATGTATGAGGTTAAGTGGAATGCTGGTTGCTACAATACATTGAGATATGCAATTGCAAACATGCGATGAAGAAGAGACTTTTTGTTTGTTTGTCTATTTTATCGTATCTTTTAGTGAGTCCACATTCAATAATGCATAGGAGTTGTTATCTTAATTCAACTTCTAGTTTATTAAAAGAAA
GTGTGCTGCAATCTTAGGTTGCAAGGGCTCCAGATGGGAACGGAGGTGTTTATTCAGgtgtgcttagtgaagaaaaattctattgttatttattgagtttaattttgatttctagcattctaagatctaacacttagatgcataacagtacttacttatctatatgttgaactggtatgttagCACTGAAATTCTCAAAA
TGCTTGGAAGATATGGCGATGAAAGGGATCAAATACATTGATTGCTACGGAGTTGACAATGCTTTGGTCCGTGTCGCAGATCCAATGTTCCTAGGTTACTGTATTGATAAAGGTGTAGCTACTGCAGCCAAGGTTGTCCGGAAGGCATATCCACAAGAGAAGGTTGGTGTGTTTGTCCAGCGGGGTAAAGGAGGATCTTT
CAGAGTAATAGAATACAGTGAGATGGATTCTTCCATGGCATATGCTATAAACCAGGAGACTGGGCGTCTTCGATTCAATTGGAGTAATGTATGCTTGCACATGTTTTCATTGGACTTTTTGAACCAGGTTACCGAAGATCTTGAACAGGACAGCATCTACCATCTGGCAGAGAAGAAAATGCCTTCTGTTGAGGGACATA
TATTGGGCATAAAGTTGGAGCAATTTATATTTGATGCATTTCCGTATGCACCTTCAATGGCTCTCTTTGAGGTGTTGCGTGAAGAAGAATTTGCACCTGTTAAAAATGCAAGTGGCAATGCAACTGATACACCTGAAACTTCTCGAATTCTTGTTCTCCATCTTCATACTCGCTGGGTTATTGCTGCTGGTGGCTTTGTG
ACACATTCAGTACCTTTGTACACAACTGGGGTGGAGGTTTCACCACTTTGCTCTTATGCGGGAGAAAATTTGGAAGACATTTGCCGTGGACGGACTTTCCATGCTCCATGCGAGCTCACAGCTTAGAGCAGGAGCGATTGGTTCCAATGGTAGAGGTGTTTAAGTTGCATCGACTATGAAGGTGTTGAATTTCCAGTTCA
GTGCACTGCTAAATTTGTAAGATGGGAGAGTGGCATCGTCAGGCACTGATGTTCAATTTTGTTGTAGAAATTTGGCAGTGTTAGGTTGGCATTTGAGTGCACAGTAGGAATTAGACATTTGAGCCTGGTATCCTACTAGGCCTTTGGTCTTTGATGTTTTCACATGCTTTTATGAATGTTGATGTTTAGCTTTATGTTGC
ATTCTTCATTAAAATAGCAGCTGCTCGTATAAATTGTGTCAGGCTGCTCATGAATTTATTGCTAAATGGACTAATATCTTATTAGTCGTCTAAACTTTTGTTGAAGATGCCATGTGAACATGTCATTTTCTTTAAGAGCTTTGTCAATGTGCTACATAATTCTTATTTATTTGAGGTATTTCATAAAAG
Intron 6 GTAAGTTCAG ... TGTATTTCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 24.69 | 73.7 | 5 | 23 |
| A2 | 25.46 | 94.7 | 9 | 31 |
| A3 | 23.15 | 129.7 | 8 | 38 |
| A4 | 22.02 | 100.6 | 3 | 27 |
| A5 | 23.13 | 40.3 | 5 | 12 |
| A6 | 22.51 | 157.8 | 0 | 44 |
| A7 | 24.98 | 265.3 | 0 | 85 |
| A8 | 23.94 | 132.3 | 0 | 40 |
| A9 | 23.17 | 242.5 | 1 | 70 |
| A10 | 24.73 | 246.1 | 0 | 78 |
>TRINITY_DN124458_c4_g1_i14 from sample A1 / Example spliced isoformCGAAATTGATAAACCGAAGGATTCGGCCTTTTTGATATTCGACGCTACGTGCTGTCACCAGGGTTTCGGATCTGCATTGATGGGGGAAGCAGGGGGCGAAGATGCAGCTCCGCCTCAGGCTGTGCTGGAGCGTCTCAAAGATTTCGGCCAGGAACAAACCCTAGCGCTGTGGAAGGAGCTGAGCTCTAATGAGCGCGACC
TCCTCATTAAAGATCTCGAGAGCTTGGATCTTCCTCGAGTGGATCGAATTATAAAACACTCTCTCGCTTCACGTGATCGACCTGTACTCAATCTAGAACCAGTTCCTGAAGCAAGTGTCTCAACTGTTGAGGAAAGGACATTAGAAGAGAGAGAAAAATGGTGGAGCATGGGATTAAAGGCCATACGTGAGGGCAAGCTT
GCAGTCGTGCTTTTGTCTGGAGGCCAGGGTACCCGTCTAGGAAGTTCAGAGCCGAAGGGATGTTTCAACATTGGGCTTCCTTCGGGTAAATCACTATTCCAACTTCAAGCAGAGCGTATTTTACGTGTTCAGAGACTTGCAGCCCAGTCAGCAGCTGATGGGCGAGTTACCCGAATCCATTGGTATGTAATGACAAGTTC
ATTTACACATGATGTGATACGCAAATTCTTTGAAAGTCGAAAATATTTTGGCTTGGAATCAGAACAAGTAACCTTTTTCCAGCAAGGTACACTCCCTTGTATTTCTAAGGAAGGACGAATTATCATGGAAACTCCATATCAGGTTGCAAGGGCTCCAGATGGGAACGGAGGTGTTTATTCAGCACTGAAATTCTCAAAAT
GCTTGGAAGATATGGCGATGAAAGGGATCAAATACATTGATTGCTACGGAGTTGACAATGCTTTGGTCCGTGTCGCAGATCCAATGTTCCTAGGTTACTGTATTGATAAAGGTGTAGCTACTGCAGCCAAGGTTGTCCGGAAGGCATATCCACAAGAGAAGGTTGGTGTGTTTGTCCAGCGGGGTAAAGGAGGATCTTTC
AGAGTAATAGAATACAGTGAGATGGATTCTTCCATGGCATATGCTATAAACCAGGAGACTGGGCGTCTTCGATTCAATTGGAGTAATGTATGCTTGCACATGTTTTCATTGGACTTTTTGAACCAGGTTACCGAAGATCTTGAACAGGACAGCATCTACCATCTGGCAGAGAAGAAAATGCCTTCTGTTGAGGGACATAT
ATTGGGCATAAAGTTGGAGCAATTTATATTTGATGCATTTCCGTATGCACCTTCAATGGCTCTCTTTGAGGTGTTGCGTGAAGAAGAATTTGCACCTGTTAAAAATGCAAGTGGCAATGCAACTGATACACCTGAAACTTCTCGAATTCTTGTTCTCCATCTTCATACTCGCTGGGTTATTGCTGCTGGTGGCTTTGTGA
CACATTCAGTACCTTTGTACACAACTGGGGTGGAGGTTTCACCACTTTGCTCTTATGCGGGAGAAAATTTGGAAGACATTTGCCGTGGACGGACTTTCCATGCTCCATGCGAGCTCACAGCTTAGGTGGAATTCTGATTAATAACTGTTGCAGTTTTAGAATGAAATTTTTATTACAAATTCAGCAATTGAAATTATTTG
TGACAGAGCAGGAGCGATTGGTTCCAATGGTAGAGGTATGCATTTATTACCGGCAACGTAAGCTTTATGATTGTTCAGTTGATTTTCCTCAGTAGTACTGTTTATAGAACTTTGCAATCTTGTTTGTTGAATTAGGATTAAATTTCTTGTAAGTAGATTTGCACATACTTTGCCTGAGATTAATTGATTGATAGTGATGG
ACAGCTCCTGCATTCTGTGTGTTTTTATCCTACAAGAGCTTTATATGTTAATTATCTACCATGGAGGCAGTAATACATAAATTAAAGATTTTAAGGATTACTGCGTTGTTGTTTTTACCAGTTGATATTCGTAGTCAAATATTTTTTTTTGTTATCTGACATGGTCAACAGTACAGATCTATCTTTCAATCTGTCGTCTA
AAATTGTTCATATCTTAATATCATTCTCTTTTCTTGTTTGTTTCCACATCAGGTGTTTAAGTTGCATCGACTATGAAGGTGTTGAATTTCCAGTTCAGTGCACTGCTAAATTTGTAAGATGGGAGAGTGGCATCGTCAGGCACTGATGTTCAATTTTGTTGTAGAAATTTGGCAGTGTTAGGTTGGCATTTGAGTGCACA
GTAGGAATTAGACATTTGAGCCTGGTATCCTACTAGGCCTTTGGTCTTTGATGTTTTCACATGCTTTTATGAATGTTGATGTTTAGCTTTATGTTGCATTCTTCATTAAAATAGCAGCTGCTCGTATAAATTGTGTCAGGCCGCTCATGAATTTATTGCTAAATGGACTAATATCTTATTAGTCGTCTAAACTTTTGCTG
AAGATGCCATGTGAACATGTCATTTTCTTTAAGAGCTTTGTCAATGTGCTACATAATTCTTATTTATTTGAGGTATTTCATAAAAGTAGACGTCACATGCAATCTTTTACGTTGTAGATTCATAAAATGATTGTCATAATATTTAAGAAGCTGAATTAGTGATTTCGTGGATCTTGATAAATAAAATGCATGGATGGTAA
TCTATGAGGAGAGAACACATAAATATCTACAGTTTAATTCCCTCCAGGATATTTTAGGAATTAGGAAAATTTATAATCA
>TRINITY_DN124458_c4_g1_i7 from sample A1 / Example unspliced isoform:GTTTGCAGCCTGTTAAATTCCTTTAGCTGTGTGTTTATTGTTTATTTAATTGTGCATTAAGTAACCTACAGCCAATGCAAAACCGGCTGTAGGTGAAAACCACCCAAACTTGACATTAAACCAGCAGGCAGTTGAAGGCAGAAAATCTACATAAATGTACATGATATGACCCCAGGGGGGCATATATGGGGTTATAAGAG
GCTAAATGTATATATATTGATGTAAATGTATATGTAATAGTGGTCGCCGCTAATGAAGGGACCTAATGTGCAATGAGTGAATAGGTATATGTAGAGGTAATGTAGTCATTATAGAGAAGTGGGAATGGATTATGTGAATGTTTTGGGGTAAAAGGAGAGGGACCTGCTATTCTTTAAGGAGTTATTGTGTAACTTATATT
TATTATCTATATTGGAGTTGTGCTTCACGCTCACATTGCTTTACATGGTTTGTACTTCTTGTCTCTTATGCTATATTAAGGATTTGGTGCATAACACAGGGGCTGAAATGTTTCAAGATTTTGATGGAAATGGTGGATTCCCGTTTCCATCGACTGATATTTTCAGCAGCATTTCCATGCTGTATCTGCTTTGTTTTTGT
ATCCAGAATGCTGAATGGTGTTTCGGCCTTCCTTCCCAAATTTTTTCGGTAACTTATTTATGAACCCATTCTAAAAGAGGTGATCCCTCTGGCCAAAGTTTGTTAAATTTATAAAGCAGGGCATTCTCAGTATGGGGTATATTGTTTGCAGGAAAAACCTTCAGAAGAGAGCTCCAAAACAGGGGCAGTCTGATTTTTCC
ACAATAAACTGCCCCACATTCAAACTCGAGTTTCTTGAAATTGTGAGGTGCTATTTTTCTTGGCAGCATCTAAGAACGGTCTTGGCTTCATTTGAGAGAGGCCTGCATTTTTCTTAAGGCATCTTCGTCTTCATCTGAAGCTACCTGAAACACACCATCGGAAGGGCTGCTAGGGTTTTATCAACCCTAATGGCGTTGCT
GATGCAGCTGCAAACTGGGAGTAAGATAGCTCAGAGCCACCACCCAATGCTTTGTTCGGGTTCCTGCCTGGAGACAGGTTCTTTCCAGGAAATCATATACAAGCGGAAGGCCATTCTGAACAAGACTGATTGATGTTGGTCTTACAAAACAGAGTTTTGATCTTGATTTGATAAACATATTGAGATTGTTTGGACTGTTT
CACCATCTGTTATGTTCATTGCTTCCCAAAAAGCTGAAATGTTATCTTGTAATTATAAGTGTTTCTTTGTCTTTGTCATTTTTGTTTTCTGCATCTGGTAAGATAGATGGAACTCATCAAATAGAACCCTAGTTAGTCATGGTTTTGTTTCTGCAATGATTTTGTATTTCTTTTAGCGATGTACTTGGCTCTTTTATGCT
TTTAAGTTTTGATAGAGTAGCATTAGGAGCTGCTTTTTTACTCCCACTATGTATTTACACTAGATGTAATTTTGTTGGACATTGATAAAATTATCTTTTCTTATCAACTTCTCGTTAAAGGTACATATCTCTCTATACAGTATTTTTATTGAGAAATTTTAATAAGTTCTGTTTCAGCTAGTTCATTTTTTTTCTTGGAA
TTTGCAATATATATGCAATATGTTTCTGCTCCAAAGCTCCCCTAGACTACCCTCTGTGTCTGGCATTAGATTTTGAAATATACTATATTTGCAGTTTAAATCTTCATGATTCAATGGGCCTTCTTTTATGAGTTTAATGACCTGTCATTCCATTCAGGGTACCCGTCTAGGAAGTTCAGAGCCGAAGGGATGTTTCAgta
agttcagtgactcatgtgattgtatgaattatgttttaatttatttactcactgcactgtttagactggtaagtttatgtaacattagtctaccatataaggaatatggtggaattaagttgggaaaaaggtcctcaggttgttgtaccattgattataatggtttagaaggcaaagtcactgtctattcatgagcatga
agcattcatgtccaagataatatttcttccctaatctacagaaaactggttgtgctgttgtatttcagACATTGGGCTTCCTTCGGGTAAATCACTATTCCAACTTCAAGCAGAGCGTATTTTACGTGTTCAGAGACTTGCAGCCCAGTCAGCAGCTGATGGGCGAGTTACCCGAATCCATTGGTATGTAATGACAAGTT
CATTTACACATGATGTGATACGCAAATTCTTTGAAAGTCGAAAATATTTTGGCTTGGAATCAGAACAAGTAACCTTTTTCCAGCAAGGTACACTCCCTTGTATTTCTAAGGAAGGACGAATTATCATGGAAACTCCATATCAGGTTGCAAGGGCTCCAGATGGGAACGGAGGTGTTTATTCAGCACTGAAATTCTCAAAA
TGCTTGGAAGATATGGCGATGAAAGGGATCAAATACATTGATTGCTACGGAGTTGACAATGCTTTGGTCCGTGTCGCAGATCCAATGTTCCTAGGTTACTGTATTGATAAAGGTGTAGCTACTGCAGCCAAGGTTGTCCGGAAGGCATATCCACAAGAGAAGGTTGGTGTGTTTGTCCAGCGGGGTAAAGGAGGATCTTT
CAGAGTAATAGAATACAGTGAGATGGATTCTTCCATGGCATATGCTATAAACCAGGAGACTGGGCGTCTTCGATTCAATTGGAGTAATGTATGCTTGCACATGTTTTCATTGGACTTTTTGAACCAGGTTACCGAAGATCTTGAACAGGACAGCATCTACCATCTGGCAGAGAAGAAAATGCCTTCTGTTGAGGGACATA
TATTGGGCATAAAGTTGGAGCAATTTATATTTGATGCATTTCCGTATGCACCTTCAATGGCTCTCTTTGAGGTGTTGCGTGAAGAAGAATTTGCACCTGTTAAAAATGCAAGTGGCAATGCAACTGATACACCTGAAACTTCTCGAATTCTTGTTCTCCATCTTCATACTCGCTGGGTTATTGCTGCTGGTGGCTTTGTG
ACACATTCAGTACCTTTGTACACAACTGGGGTGGAGGTTTCACCACTTTGCTCTTATGCGGGAGAAAATTTGGAAGACATTTGCCGTGGACGGACTTTCCATGCTCCATGCGAGCTCACAGCTTAGGTGGAATTCTGATTAATAACTGTTGCAGTTTTAGAATGAAATTTTTATTACAAATTCAGCAATTGAAATTATTT
GTGACAGAGCAGGAGCGATTGGTTCCAATGGTAGAGGTATGCATTTATTACCGGCAACGTAAGCTTTATGATTGTTCAGTTGATTTTCCTCAGTAGTACTGTTTATAGAACTTTGCAATCTTGTTTGTTGAATTAGGATTAAATTTCTTGTAAGTAGATTTGCACATACTTTGCCTGAGATTAATTGATTGATAGTGATG
GACAGCTCCTGCATTCTGTGTGTTTTTATCCTACAAGAGCTTTATATGTTAATTATCTACCATGGAGGCAGTAATACATAAATTAAAGATTTTAAGGATTACTGCGTTGTTGTTTTTACCAGTTGATATTCGTAGTCAAATATTTTTTTTTGTTATCTGACATGGTCAACAGTACAGATCTATCTTTCAATCTGTCGTCT
AAAATTGTTCATATCTTAATATCATTCTCTTTTCTTGTTTGTTTCCACATCAGGTGTTTAAGTTGCATCGACTATGAAGGTGTTGAATTTCCAGTTCAGTGCACTGCTAAATTTGTAAGATGGGAGAGTGGCATCGTCAGGCACTGATGTTCAATTTTGTTGTAGAAATTTGGCAGTGTTAGGTTGGCATTTGAGTGCAC
AGTAGGAATTAGACATTTGAGCCTGGTATCCTACTAGGCCTTTGGTCTTTGATGTTTTCACATGCTTTTATGAATGTTGATGTTTAGCTTTATGTTGCATTCTTCATTAAAATAGCAGCTGCTCGTATAAATTGTGTCAGGCCGCTCATGAATTTATTGCTAAATGGACTAATATCTTATTAGTCGTCTAAACTTTTGCT
GAAGATGCCATGTGAACATGTCATTTTCTTTAAGAGCTTTGTCAATGTGCTACATAATTCTTATTTATTTGAGGTATTTCATAAAAGTAGACGTCACATGCAATCTTTTACGTTGTAGATTCATAAAATGATTGTCATAATATTTAAGAAGCTGAATTAGTGATTTCGTGGATCTTGATAAATAAAATGCATGGATGGTA
ATCTATGAGGAGAGAACACATAAATATCTACAGTTTAATTCCCTCCAGGATATTTTAGGAATTAGGAAAATTTATAATCA
Intron 7 GTATGCATTT ... TCCACATCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 27.63 | 76.9 | 34.5 | 24 |
| A2 | 26.28 | 74.5 | 27.9 | 25 |
| A3 | 23.49 | 64.9 | 21.8 | 18 |
| A4 | 28.47 | 55.3 | 20.6 | 23 |
| A5 | 28.32 | 27.8 | 10.8 | 11 |
| A6 | 24.46 | 283.6 | 65.4 | 118 |
| A7 | 22.52 | 422.5 | 84.1 | 161 |
| A8 | 22.38 | 596.3 | 119.8 | 222 |
| A9 | 24.07 | 365.4 | 85.5 | 141.9 |
| A10 | 21.74 | 329.7 | 85.5 | 94 |
>TRINITY_DN124458_c4_g1_i5 from sample A1 / Example spliced isoformCGAAATTGATAAACCGAAGGATTCGGCCTTTTTGATATTCGACGCTACGTGCTGTCACCAGGGTTTCGGATCTGCATTGATGGGGGAAGCAGGGGGCGAAGATGCAGCTCCGCCTCAGGCTGTGCTGGAGCGTCTCAAAGATTTCGGCCAGGAACAAACCCTAGCGCTGTGGAAGGAGCTGAGCTCTAATGAGCGCGACC
TCCTCATTAAAGATCTCGAGAGCTTGGATCTTCCTCGAGTGGATCGAATTATAAAACACTCTCTCGCTTCACGTGATCGACCTGTACTCAATCTAGAACCAGTTCCTGAAGCAAGTGTCTCAACTGTTGAGGAAAGGACATTAGAAGAGAGAGAAAAATGGTGGAGCATGGGATTAAAGGCCATACGTGAGGGCAAGCTT
GCAGTCGTGCTTTTGTCTGGAGGCCAGGGTACCCGTCTAGGAAGTTCAGAGCCGAAGGGATGTTTCAACATTGGGCTTCCTTCGGGTAAATCACTATTCCAACTTCAAGCAGAGCGTATTTTACGTGTTCAGAGACTTGCAGCCCAGTCAGCAGCTGATGGGCGAGTTACCCGAATCCATTGGTATGTAATGACAAGTTC
ATTTACACATGATGTGATACGCAAATTCTTTGAAAGTCGAAAATATTTTGGCTTGGAATCAGAACAAGTAACCTTTTTCCAGCAAGGTACACTCCCTTGTATTTCTAAGGAAGGACGAATTATCATGGAAACTCCATATCAGGTTGCAAGGGCTCCAGATGGGAACGGAGGTGTTTATTCAGCACTGAAATTCTCAAAAT
GCTTGGAAGATATGGCGATGAAAGGGATCAAATACATTGATTGCTACGGAGTTGACAATGCTTTGGTCCGTGTCGCAGATCCAATGTTCCTAGGTTACTGTATTGATAAAGGTGTAGCTACTGCAGCCAAGGTTGTCCGGAAGGCATATCCACAAGAGAAGGTTGGTGTGTTTGTCCAGCGGGGTAAAGGAGGATCTTTC
AGAGTAATAGAATACAGTGAGATGGATTCTTCCATGGCATATGCTATAAACCAGGAGACTGGGCGTCTTCGATTCAATTGGAGTAATGTATGCTTGCACATGTTTTCATTGGACTTTTTGAACCAGGTTACCGAAGATCTTGAACAGGACAGCATCTACCATCTGGCAGAGAAGAAAATGCCTTCTGTTGAGGGACATAT
ATTGGGCATAAAGTTGGAGCAATTTATATTTGATGCATTTCCGTATGCACCTTCAATGGCTCTCTTTGAGGTGTTGCGTGAAGAAGAATTTGCACCTGTTAAAAATGCAAGTGGCAATGCAACTGATACACCTGAAACTTCTCGAATTCTTGTTCTCCATCTTCATACTCGCTGGGTTATTGCTGCTGGTGGCTTTGTGA
CACATTCAGTACCTTTGTACACAACTGGGGTGGAGGTTTCACCACTTTGCTCTTATGCGGGAGAAAATTTGGAAGACATTTGCCGTGGACGGACTTTCCATGCTCCATGCGAGCTCACAGCTTAGGTGGAATTCTGATTAATAACTGTTGCAGTTTTAGAATGAAATTTTTATTACAAATTCAGCAATTGAAATTATTTG
TGACAGAGCAGGAGCGATTGGTTCCAATGGTAGAGGTGTTTAAGTTGCATCGACTATGAAGGTGTTGAATTTCCAGTTCAGTGCACTGCTAAATTTGTAAGATGGGAGAGTGGCATCGTCAGGCACTGATGTTCAATTTTGTTGTAGAAATTTGGCAGTGTTAGGTTGGCATTTGAGTGCACAGTAGGAATTAGACATTT
GAGCCTGGTATCCTACTAGGCCTTTGGTCTTTGATGTTTTCACATGCTTTTATGAATGTTGATGTTTAGCTTTATGTTGCATTCTTCATTAAAATAGCAGCTGCTCGTATAAATTGTGTCAGGCCGCTCATGAATTTATTGCTAAATGGACTAATATCTTATTAGTCGTCTAAACTTTTGCTGAAGATGCCATGTGAACA
TGTCATTTTCTTTAAGAGCTTTGTCAATGTGCTACATAATTCTTATTTATTTGAGGTATTTCATAAAAGTAGACGTCACATGCAATCTTTTACGTTGTAGATTCATAAAATGATTGTCATAATATTTAAGAAGCTGAATTAGTGATTTCGTGGATCTTGATAAATAAAATGCATGGATGGTAATCTATGAGGAGAGAACA
CATAAATATCTACAGTTTAATTCCCTCCAGGATATTTTAGGAATTAGGAAAATTTATAATCA
>TRINITY_DN124458_c4_g1_i14 from sample A1 / Example unspliced isoform:CGAAATTGATAAACCGAAGGATTCGGCCTTTTTGATATTCGACGCTACGTGCTGTCACCAGGGTTTCGGATCTGCATTGATGGGGGAAGCAGGGGGCGAAGATGCAGCTCCGCCTCAGGCTGTGCTGGAGCGTCTCAAAGATTTCGGCCAGGAACAAACCCTAGCGCTGTGGAAGGAGCTGAGCTCTAATGAGCGCGACC
TCCTCATTAAAGATCTCGAGAGCTTGGATCTTCCTCGAGTGGATCGAATTATAAAACACTCTCTCGCTTCACGTGATCGACCTGTACTCAATCTAGAACCAGTTCCTGAAGCAAGTGTCTCAACTGTTGAGGAAAGGACATTAGAAGAGAGAGAAAAATGGTGGAGCATGGGATTAAAGGCCATACGTGAGGGCAAGCTT
GCAGTCGTGCTTTTGTCTGGAGGCCAGGGTACCCGTCTAGGAAGTTCAGAGCCGAAGGGATGTTTCAACATTGGGCTTCCTTCGGGTAAATCACTATTCCAACTTCAAGCAGAGCGTATTTTACGTGTTCAGAGACTTGCAGCCCAGTCAGCAGCTGATGGGCGAGTTACCCGAATCCATTGGTATGTAATGACAAGTTC
ATTTACACATGATGTGATACGCAAATTCTTTGAAAGTCGAAAATATTTTGGCTTGGAATCAGAACAAGTAACCTTTTTCCAGCAAGGTACACTCCCTTGTATTTCTAAGGAAGGACGAATTATCATGGAAACTCCATATCAGGTTGCAAGGGCTCCAGATGGGAACGGAGGTGTTTATTCAGCACTGAAATTCTCAAAAT
GCTTGGAAGATATGGCGATGAAAGGGATCAAATACATTGATTGCTACGGAGTTGACAATGCTTTGGTCCGTGTCGCAGATCCAATGTTCCTAGGTTACTGTATTGATAAAGGTGTAGCTACTGCAGCCAAGGTTGTCCGGAAGGCATATCCACAAGAGAAGGTTGGTGTGTTTGTCCAGCGGGGTAAAGGAGGATCTTTC
AGAGTAATAGAATACAGTGAGATGGATTCTTCCATGGCATATGCTATAAACCAGGAGACTGGGCGTCTTCGATTCAATTGGAGTAATGTATGCTTGCACATGTTTTCATTGGACTTTTTGAACCAGGTTACCGAAGATCTTGAACAGGACAGCATCTACCATCTGGCAGAGAAGAAAATGCCTTCTGTTGAGGGACATAT
ATTGGGCATAAAGTTGGAGCAATTTATATTTGATGCATTTCCGTATGCACCTTCAATGGCTCTCTTTGAGGTGTTGCGTGAAGAAGAATTTGCACCTGTTAAAAATGCAAGTGGCAATGCAACTGATACACCTGAAACTTCTCGAATTCTTGTTCTCCATCTTCATACTCGCTGGGTTATTGCTGCTGGTGGCTTTGTGA
CACATTCAGTACCTTTGTACACAACTGGGGTGGAGGTTTCACCACTTTGCTCTTATGCGGGAGAAAATTTGGAAGACATTTGCCGTGGACGGACTTTCCATGCTCCATGCGAGCTCACAGCTTAGGTGGAATTCTGATTAATAACTGTTGCAGTTTTAGAATGAAATTTTTATTACAAATTCAGCAATTGAAATTATTTG
TGACAGAGCAGGAGCGATTGGTTCCAATGGTAGAGgtatgcatttattaccggcaacgtaagctttatgattgttcagttgattttcctcagtagtactgtttatagaactttgcaatcttgtttgttgaattaggattaaatttcttgtaagtagatttgcacatactttgcctgagattaattgattgatagtgatgg
acagctcctgcattctgtgtgtttttatcctacaagagctttatatgttaattatctaccatggaggcagtaatacataaattaaagattttaaggattactgcgttgttgtttttaccagttgatattcgtagtcaaatatttttttttgttatctgacatggtcaacagtacagatctatctttcaatctgtcgtcta
aaattgttcatatcttaatatcattctcttttcttgtttgtttccacatcagGTGTTTAAGTTGCATCGACTATGAAGGTGTTGAATTTCCAGTTCAGTGCACTGCTAAATTTGTAAGATGGGAGAGTGGCATCGTCAGGCACTGATGTTCAATTTTGTTGTAGAAATTTGGCAGTGTTAGGTTGGCATTTGAGTGCACA
GTAGGAATTAGACATTTGAGCCTGGTATCCTACTAGGCCTTTGGTCTTTGATGTTTTCACATGCTTTTATGAATGTTGATGTTTAGCTTTATGTTGCATTCTTCATTAAAATAGCAGCTGCTCGTATAAATTGTGTCAGGCCGCTCATGAATTTATTGCTAAATGGACTAATATCTTATTAGTCGTCTAAACTTTTGCTG
AAGATGCCATGTGAACATGTCATTTTCTTTAAGAGCTTTGTCAATGTGCTACATAATTCTTATTTATTTGAGGTATTTCATAAAAGTAGACGTCACATGCAATCTTTTACGTTGTAGATTCATAAAATGATTGTCATAATATTTAAGAAGCTGAATTAGTGATTTCGTGGATCTTGATAAATAAAATGCATGGATGGTAA
TCTATGAGGAGAGAACACATAAATATCTACAGTTTAATTCCCTCCAGGATATTTTAGGAATTAGGAAAATTTATAATCA
Intron 8 GTAAGTGTGC ... TGAGGATCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 13.23 | 96.4 | 13.6 | 15.5 |
| A2 | 12.33 | 84.3 | 10 | 12.4 |
| A3 | 4.13 | 127.5 | 15.5 | 5.8 |
| A4 | 13.44 | 88.1 | 9.4 | 14.5 |
| A5 | 7.41 | 42.4 | 5.2 | 3.7 |
| A6 | 9.17 | 166.7 | 20.2 | 17.6 |
| A7 | 6.86 | 253.9 | 27.8 | 20 |
| A8 | 8.55 | 145.1 | 15.5 | 14.8 |
| A9 | 9.56 | 214.2 | 30.1 | 24.7 |
| A10 | 10.08 | 248.3 | 32.9 | 30.5 |
>TRINITY_DN124458_c4_g1_i14 from sample A1 / Example spliced isoformCGAAATTGATAAACCGAAGGATTCGGCCTTTTTGATATTCGACGCTACGTGCTGTCACCAGGGTTTCGGATCTGCATTGATGGGGGAAGCAGGGGGCGAAGATGCAGCTCCGCCTCAGGCTGTGCTGGAGCGTCTCAAAGATTTCGGCCAGGAACAAACCCTAGCGCTGTGGAAGGAGCTGAGCTCTAATGAGCGCGACC
TCCTCATTAAAGATCTCGAGAGCTTGGATCTTCCTCGAGTGGATCGAATTATAAAACACTCTCTCGCTTCACGTGATCGACCTGTACTCAATCTAGAACCAGTTCCTGAAGCAAGTGTCTCAACTGTTGAGGAAAGGACATTAGAAGAGAGAGAAAAATGGTGGAGCATGGGATTAAAGGCCATACGTGAGGGCAAGCTT
GCAGTCGTGCTTTTGTCTGGAGGCCAGGGTACCCGTCTAGGAAGTTCAGAGCCGAAGGGATGTTTCAACATTGGGCTTCCTTCGGGTAAATCACTATTCCAACTTCAAGCAGAGCGTATTTTACGTGTTCAGAGACTTGCAGCCCAGTCAGCAGCTGATGGGCGAGTTACCCGAATCCATTGGTATGTAATGACAAGTTC
ATTTACACATGATGTGATACGCAAATTCTTTGAAAGTCGAAAATATTTTGGCTTGGAATCAGAACAAGTAACCTTTTTCCAGCAAGGTACACTCCCTTGTATTTCTAAGGAAGGACGAATTATCATGGAAACTCCATATCAGGTTGCAAGGGCTCCAGATGGGAACGGAGGTGTTTATTCAGCACTGAAATTCTCAAAAT
GCTTGGAAGATATGGCGATGAAAGGGATCAAATACATTGATTGCTACGGAGTTGACAATGCTTTGGTCCGTGTCGCAGATCCAATGTTCCTAGGTTACTGTATTGATAAAGGTGTAGCTACTGCAGCCAAGGTTGTCCGGAAGGCATATCCACAAGAGAAGGTTGGTGTGTTTGTCCAGCGGGGTAAAGGAGGATCTTTC
AGAGTAATAGAATACAGTGAGATGGATTCTTCCATGGCATATGCTATAAACCAGGAGACTGGGCGTCTTCGATTCAATTGGAGTAATGTATGCTTGCACATGTTTTCATTGGACTTTTTGAACCAGGTTACCGAAGATCTTGAACAGGACAGCATCTACCATCTGGCAGAGAAGAAAATGCCTTCTGTTGAGGGACATAT
ATTGGGCATAAAGTTGGAGCAATTTATATTTGATGCATTTCCGTATGCACCTTCAATGGCTCTCTTTGAGGTGTTGCGTGAAGAAGAATTTGCACCTGTTAAAAATGCAAGTGGCAATGCAACTGATACACCTGAAACTTCTCGAATTCTTGTTCTCCATCTTCATACTCGCTGGGTTATTGCTGCTGGTGGCTTTGTGA
CACATTCAGTACCTTTGTACACAACTGGGGTGGAGGTTTCACCACTTTGCTCTTATGCGGGAGAAAATTTGGAAGACATTTGCCGTGGACGGACTTTCCATGCTCCATGCGAGCTCACAGCTTAGGTGGAATTCTGATTAATAACTGTTGCAGTTTTAGAATGAAATTTTTATTACAAATTCAGCAATTGAAATTATTTG
TGACAGAGCAGGAGCGATTGGTTCCAATGGTAGAGGTATGCATTTATTACCGGCAACGTAAGCTTTATGATTGTTCAGTTGATTTTCCTCAGTAGTACTGTTTATAGAACTTTGCAATCTTGTTTGTTGAATTAGGATTAAATTTCTTGTAAGTAGATTTGCACATACTTTGCCTGAGATTAATTGATTGATAGTGATGG
ACAGCTCCTGCATTCTGTGTGTTTTTATCCTACAAGAGCTTTATATGTTAATTATCTACCATGGAGGCAGTAATACATAAATTAAAGATTTTAAGGATTACTGCGTTGTTGTTTTTACCAGTTGATATTCGTAGTCAAATATTTTTTTTTGTTATCTGACATGGTCAACAGTACAGATCTATCTTTCAATCTGTCGTCTA
AAATTGTTCATATCTTAATATCATTCTCTTTTCTTGTTTGTTTCCACATCAGGTGTTTAAGTTGCATCGACTATGAAGGTGTTGAATTTCCAGTTCAGTGCACTGCTAAATTTGTAAGATGGGAGAGTGGCATCGTCAGGCACTGATGTTCAATTTTGTTGTAGAAATTTGGCAGTGTTAGGTTGGCATTTGAGTGCACA
GTAGGAATTAGACATTTGAGCCTGGTATCCTACTAGGCCTTTGGTCTTTGATGTTTTCACATGCTTTTATGAATGTTGATGTTTAGCTTTATGTTGCATTCTTCATTAAAATAGCAGCTGCTCGTATAAATTGTGTCAGGCCGCTCATGAATTTATTGCTAAATGGACTAATATCTTATTAGTCGTCTAAACTTTTGCTG
AAGATGCCATGTGAACATGTCATTTTCTTTAAGAGCTTTGTCAATGTGCTACATAATTCTTATTTATTTGAGGTATTTCATAAAAGTAGACGTCACATGCAATCTTTTACGTTGTAGATTCATAAAATGATTGTCATAATATTTAAGAAGCTGAATTAGTGATTTCGTGGATCTTGATAAATAAAATGCATGGATGGTAA
TCTATGAGGAGAGAACACATAAATATCTACAGTTTAATTCCCTCCAGGATATTTTAGGAATTAGGAAAATTTATAATCA
>TRINITY_DN124458_c4_g1_i8 from sample A1 / Example unspliced isoform:CGAAATTGATAAACCGAAGGATTCGGCCTTTTTGATATTCGACGCTACGTGCTGTCACCAGGGTTTCGGATCTGCATTGATGGGGGAAGCAGGGGGCGAAGATGCAGCTCCGCCTCAGGCTGTGCTGGAGCGTCTCAAAGATTTCGGCCAGGAACAAACCCTAGCGCTGTGGAAGGAGCTGAGCTCTAATGAGCGCGACC
TCCTCATTAAAGATCTCGAGAGCTTGGATCTTCCTCGAGTGGATCGAATTATAAAACACTCTCTCGCTTCACGTGATCGACCTGTACTCAATCTAGAACCAGTTCCTGAAGCAAGTGTCTCAACTGTTGAGGAAAGGACATTAGAAGAGAGAGAAAAATGGTGGAGCATGGGATTAAAGGCCATACGTGAGGGCAAGCTT
GCAGTCGTGCTTTTGTCTGGAGGCCAGGGTACCCGTCTAGGAAGTTCAGAGCCGAAGGGATGTTTCAACATTGGGCTTCCTTCGGGTAAATCACTATTCCAACTTCAAGCAGAGCGTATTTTACGTGTTCAGAGACTTGCAGCCCAGTCAGCAGCTGATGgtaagtgtgcattgttagaattattcttcaacaagttata
acttattctattatctaggataattgttgagctttatatagacatcattgttttcaatttttgctattgaggatcagGGCGAGTTACCCGAATCCATTGGTATGTAATGACAAGTTCATTTACACATGATGTGATACGCAAATTCTTTGAAAGTCGAAAATATTTTGGCTTGGAATCAGAACAAGTAAGTTTGGCTCATT
TATATTCCCTTTAGAGTATGAGTATGAAATGGGCATTCTTTAAAACACTTCTAGTTCTGGCATAGAACTGAGATTCTCAATTTTTTTTAATTGGATATAGAA
Intron 9 GTAAGCTTTA ... TCCACATCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 44.44 | 30 | 25 | 24 |
| A2 | 36.23 | 44 | 11 | 25 |
| A3 | 33.33 | 36 | 11 | 18 |
| A4 | 57.5 | 17 | 9 | 23 |
| A5 | 42.31 | 15 | 7 | 11 |
| A6 | 43.07 | 156 | 27 | 118 |
| A7 | 41.71 | 225 | 27 | 161 |
| A8 | 42.61 | 299 | 27 | 222 |
| A9 | 44.24 | 179 | 20 | 142 |
| A10 | 40.52 | 138 | 12 | 94 |
>TRINITY_DN44523_c0_g1_i9 from sample A7 / Example spliced isoformGTCTCTAATCGAAATTGATAAACCGAAGGATTCGGCCTTTTTGATATTCGACGCTACGTGCTGTCACCAGGTAAGCGAGAAATAATGGAAGGAAAGATCGAGAACAACCCCTGAGAGCTCTGCAACAACGTCCACACCATTAACAGTTGCAATTCTACCTATGTTGCATGTTTCTTGATCCTGGAAATAGCAATCCGGAG
ATTCTTAATGCAGGAGCCGAACGTTTTTTCACAGTTTTGGTCTTTTTAATAGAGGAGCCGAAGTTGTTTTCGAAAAGATTTTGGTGAATTAATCTTCATTTGCGCGTTGCCAGGGTTTCGGATCTGCATTGATGGGGGAAGCAGGGGGCGAAGATGCAGCTCCGCCTCAGGCTGTGCTGGAGCGTCTCAAAGATTTCGGC
CAGGAACAAACCCTAGCGCTGTGGAAGGAGCTGAGCTCTAATGAGCGCGACCTCCTCATTAAAGATCTCGAGAGCTTGGATCTTCCTCGAGTGGATCGAATTATAAAACACTCTCTCGCTTCACGTGATCGACCTGTACTCAATCTAGAACCAGTTCCTGAAGCAAGTGTCTCAACTGTTGAGGAAAGGACATTAGAAGA
GAGAGAAAAATGGTGGAGCATGGGATTAAAGGCCATACGTGAGGGCAAGCTTGCAGTCGTGCTTTTGTCTGGAGGCCAGGGTACCCGTCTAGGAAGTTCAGAGCCGAAGGGATGTTTCAACATTGGGCTTCCTTCGGGTAAATCACTATTCCAACTTCAAGCAGAGCGTATTTTACGTGTTCAGAGACTTGCAGCCCAGT
CAGCAGCTGATGGGCGAGTTACCCGAATCCATTGGTATGTAATGACAAGTTCATTTACACATGATGTGATACGCAAATTCTTTGAAAGTCGAAAATATTTTGGCTTGGAATCAGAACAAGTAACCTTTTTCCAGCAAGGTACACTCCCTTGTATTTCTAAGGAAGGACGAATTATCATGGAAACTCCATATCAGGTTGCA
AGGGCTCCAGATGGGAACGGAGGTGTTTATTCAGCACTGAAATTCTCAAAATGCTTGGAAGATATGGCGATGAAAGGGATCAAATACATTGATTGCTACGGAGTTGACAATGCTTTGGTCCGTGTCGCAGATCCAATGTTCCTAGGTTACTGTATTGATAAAGGTGTAGCTACTGCAGCCAAGGTTGTCCGGAAGGCATA
TCCACAAGAGAAGGTTGGTGTGTTTGTCCAGCGGGGTAAAGGAGGATCTTTCAGAGTAATAGAATACAGTGAGATGGATTCTTCCATGGCATATGCTATAAACCAGGAGACTGGGCGTCTTCGATTCAATTGGAGTAATGTATGCTTGCACATGTTTTCATTGGACTTTTTGAACCAGGTTACCGAAGATCTTGAACAGG
ACAGCATCTACCATCTGGCAGAGAAGAAAATGCCTTCTGTTGAGGGACATATATTGGGCATAAAGTTGGAGCAATTTATATTTGATGCATTTCCGTATGCACCTTCAATGGCTCTCTTTGAGGTGTTGCGTGAAGAAGAATTTGCACCTGTTAAAAATGCAAGTGGCAATGCAACTGATACACCTGAAACTTCTCGAATT
CTTGTTCTCCATCTTCATACTCGCTGGGTTATTGCTGCTGGTGGCTTTGTGACACATTCAGTACCTTTGTACACAACTGGGGTGGAGGTTTCACCACTTTGCTCTTATGCGGGAGAAAATTTGGAAGACATTTGCCGTGGACGGACTTTCCATGCTCCATGCGAGCTCACAGCTTAGAGCAGGAGCGATTGGTTCCAATG
GTAGAGGTATGCATTTATTACCGGCAACGTGTTTAAGTTGCATCGACTATGAAGGTGTTGAATTTCCAGTTCAGTGCACTGCTAAATTTGTAAGATGGGAGAGTGGCATCGTCAGGCACTGATGTTCAATTTTGTTGTAGAAATTTGGCAGTGTTAGGTTGGCATTTGAGTGCACAGTAGGAATTAGACATTTGAGCCTG
GTATCCTACTAGGCCTTTGGTCTTTGATGTTTTCACATGCTTTTATGAATGTTGATGTTTAGCTTTATGTTGCATTCTTCATTAAAATAGCAGCTGCTCGTATAAATTGTGTCAGGCCGCTCATGAATTTATTGCTAAATGGACTAATATCTTATTAGTCGTCTAAACTTTTGCTGAAGATGCCATGTGAACATGTCATT
TTCTTTAAGAGCTTTGTCAATGTGCTACATAATTCTTATTTATTTGAGGTATTTCATAAAAGTAGACGTCAC
>TRINITY_DN44523_c0_g1_i3 from sample A7 / Example unspliced isoform:GTCTCTAATCGAAATTGATAAACCGAAGGATTCGGCCTTTTTGATATTCGACGCTACGTGCTGTCACCAGGTAAGCGAGAAATAATGGAAGGAAAGATCGAGAACAACCCCTGAGAGCTCTGCAACAACGTCCACACCATTAACAGTTGCAATTCTACCTATGTTGCATGTTTCTTGATCCTGGAAATAGCAATCCGGAG
ATTCTTAATGCAGGAGCCGAACGTTTTTTCACAGTTTTGGTCTTTTTAATAGAGGAGCCGAAGTTGTTTTCGAAAAGATTTTGGTGAATTAATCTTCATTTGCGCGTTGCCAGGGTTTCGGATCTGCATTGATGGGGGAAGCAGGGGGCGAAGATGCAGCTCCGCCTCAGGCTGTGCTGGAGCGTCTCAAAGATTTCGGC
CAGGAACAAACCCTAGCGCTGTGGAAGGAGCTGAGCTCTAATGAGCGCGACCTCCTCATTAAAGATCTCGAGAGCTTGGATCTTCCTCGAGTGGATCGAATTATAAAACACTCTCTCGCTTCACGTGATCGACCTGTACTCAATCTAGAACCAGTTCCTGAAGCAAGTGTCTCAACTGTTGAGGAAAGGACATTAGAAGA
GAGAGAAAAATGGTGGAGCATGGGATTAAAGGCCATACGTGAGGGCAAGCTTGCAGTCGTGCTTTTGTCTGGAGGCCAGGGTACCCGTCTAGGAAGTTCAGAGCCGAAGGGATGTTTCAACATTGGGCTTCCTTCGGGTAAATCACTATTCCAACTTCAAGCAGAGCGTATTTTACGTGTTCAGAGACTTGCAGCCCAGT
CAGCAGCTGATGGGCGAGTTACCCGAATCCATTGGTATGTAATGACAAGTTCATTTACACATGATGTGATACGCAAATTCTTTGAAAGTCGAAAATATTTTGGCTTGGAATCAGAACAAGTAACCTTTTTCCAGCAAGGTACACTCCCTTGTATTTCTAAGGAAGGACGAATTATCATGGAAACTCCATATCAGGTTGCA
AGGGCTCCAGATGGGAACGGAGGTGTTTATTCAGCACTGAAATTCTCAAAATGCTTGGAAGATATGGCGATGAAAGGGATCAAATACATTGATTGCTACGGAGTTGACAATGCTTTGGTCCGTGTCGCAGATCCAATGTTCCTAGGTTACTGTATTGATAAAGGTGTAGCTACTGCAGCCAAGGTTGTCCGGAAGGCATA
TCCACAAGAGAAGGTTGGTGTGTTTGTCCAGCGGGGTAAAGGAGGATCTTTCAGAGTAATAGAATACAGTGAGATGGATTCTTCCATGGCATATGCTATAAACCAGGAGACTGGGCGTCTTCGATTCAATTGGAGTAATGTATGCTTGCACATGTTTTCATTGGACTTTTTGAACCAGGTTACCGAAGATCTTGAACAGG
ACAGCATCTACCATCTGGCAGAGAAGAAAATGCCTTCTGTTGAGGGACATATATTGGGCATAAAGTTGGAGCAATTTATATTTGATGCATTTCCGTATGCACCTTCAATGGCTCTCTTTGAGGTGTTGCGTGAAGAAGAATTTGCACCTGTTAAAAATGCAAGTGGCAATGCAACTGATACACCTGAAACTTCTCGAATT
CTTGTTCTCCATCTTCATACTCGCTGGGTTATTGCTGCTGGTGGCTTTGTGACACATTCAGTACCTTTGTACACAACTGGGGTGGAGGTTTCACCACTTTGCTCTTATGCGGGAGAAAATTTGGAAGACATTTGCCGTGGACGGACTTTCCATGCTCCATGCGAGCTCACAGCTTAGGTGGAATTCTGATTAATAACTGT
TGCAGTTTTAGAATGAAATTTTTATTACAAATTCAGCAATTGAAATTATTTGTGACAGAGCAGGAGCGATTGGTTCCAATGGTAGAGGTATGCATTTATTACCGGCAACgtaagctttatgattgttcagttgattttcctcagtagtactgtttatagaactttgcaatcttgtttgttgaattaggattaaatttctt
gtaagtagatttgcacatactttgcctgagattaattgattgatagtgatggacagctcctgcattctgtgtgtttttatcctacaagagctttatatgttaattatctaccatggaggcagtaatacataaattagagattttaaggattactgcgttgttgtttttaccagttgatattcgtagtcaaataatttttt
ttgttatctgacatggtcaacagtacagatctatctttcaatctgtcgtctaaaattgttcatatcttaatatcattctcttttcttgtttgtttccacatcagGTGTTTAAGTTGCATCGACTATGAAGGTGTTGAATTTCCAGTTCAGTGCACTGCTAAATTTGTAAGATGGGAGAGTGGCATCGTCAGGCACTGATG
TTCAATTTTGTTGTAGAAATTTGGCAGTGTTAGGTTGGCATTTGAGTGCACAGTAGGAATTAGACATTTGAGCCTGGTATCCTACTAGGCCTTTGGTCTTTGATGTTTTCACATGCTTTTATGAATGTTGATGTTTAGCTTTATGTTGCATTCTTCATTAAAATAGCAGCTGCTCGTATAAATTGTGTCAGGCCGCTCAT
GAATTTATTGCTAAATGGACTAATATCTTATTAGTCGTCTAAACTTTTGCTGAAGATGCCATGTGAACATGTCATTTTCTTTAAGAGCTTTGTCAATGTGCTACATAATTCTTATTTATTTGAGGTATTTCATAAAAGTAGACGTCAC
Intron 10 GTGGAATTCT ... TTTGTGACAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 48.07 | 56.3 | 45.7 | 49.7 |
| A2 | 48.84 | 65.6 | 63.1 | 59.1 |
| A3 | 45.83 | 61.2 | 58.6 | 42.6 |
| A4 | 49.32 | 43.8 | 37.6 | 43.6 |
| A5 | 39.09 | 20.8 | 11.7 | 14.7 |
| A6 | 47.44 | 209.8 | 215 | 157 |
| A7 | 49.63 | 304.1 | 330.9 | 251.9 |
| A8 | 47.17 | 422.2 | 387.1 | 350.4 |
| A9 | 55.73 | 217.2 | 290.4 | 244 |
| A10 | 49.5 | 262.2 | 296.3 | 212.9 |
>TRINITY_DN113623_c0_g2_i12 from sample A3 / Example spliced isoformATAGAGTAGCATTAGGAGCTGCTTTTTTACTCCCACTATGTATTTACACTGGATGTAATTTTGTTGGACATTGATAAAATTATCTTTTCTTATCAACTTCTCATTAAAGGTACATATCTCTCTATACAGTATTTTTATTGAGAAATTTTAATAAGTTCTGTTTCAGCTAGTTCATTTTTTTTCTTGGAATTTGCAATATA
TATGCAATATGTTTCTGCTCCAAAGCTCCCCTAGACTACCCTCTGTGTCTGGCATTAGATTTTGAAATATACTATATTTGCAGTTTAAATCTTCATGATTCAATGGGCCTTCTTTTATGAGTTTAATGACCTGTCATTCCATGAGTTTAATGACCTGTCATTCCATTCAGGGTACCCGTCTAGGAAGTTCAGAGCCGAAG
GGATGTTTCAGTAAGTTCAGTGACTCATGTGATTGTATGAATTATGTTTTAATTTATTTACTCACTGCACTGTTTAGACTGGTAAGTTTATGTAACATTAGTCTACCATATAAGGAATATGGTGGAATTAAGTTGGGAAAAAGATCCTCAGGTTGTTGTACCATTGATTATAATGGTTTAGAAGGCAAAGTCACTGTCTA
TTCATGAGCATGAAGCATTCATGTCCAAGATAATATTTCTTCCCTAATCTACAGAAAACTGGTTGTGCTGTTGTATTTCAGACATTGGGCTTCCTTCGGGTAAATCACTATTCCAACTTCAAGCAGAGCGTATTTTACGTGTTCAGAGACTTGCAGCCCAGTCAGCAGCTGATGGGCGAGTTACCCGAATCCATTGGTAT
GTAATGACAAGTTCATTTACACATGATGTGATACGCAAATTCTTTGAAAGTCGAAAATATTTTGGCTTGGAATCAGAACAAGTAACCTTTTTCCAGCAAGGTACACTCCCTTGTATTTCTAAGGAAGGACGAATTATCATGGAAACTCCATATCAGGTTGCAAGGGCTCCAGATGGGAACGGAGGTGTTTATTCAGCACT
GAAATTCTCAAAATGCTTGGAAGATATGGCGATGAAAGGGATCAAATACATTGATTGCTACGGAGTTGACAATGCTTTGGTCCGTGTCGCAGATCCAATGTTCCTAGGTTACTGTATTGATAAAGGTGTAGCTACTGCAGCCAAGGTTGTCCGGAAGGCATATCCACAAGAGAAGGTTGGTGTGTTTGTCCAGCGGGGTA
AAGGAGGATCTTTCAGAGTAATAGAATACAGTGAGATGGATTCTTCCATGGCATATGCTATAAACCAGGAGACTGGGCGTCTTCGATTCAATTGGAGTAATGTATGCTTGCACATGTTTTCATTGGACTTTTTGAACCAGGTTACCGAAGATCTTGAACAGGACAGCATCTACCATCTGGCAGAGAAGAAAATGCCTTCT
GTTGAGGGACATATATTGGGCATAAAGTTGGAGCAATTTATATTTGATGCATTTCCGTATGCACCTTCAATGGCTCTCTTTGAGGTGTTGCGTGAAGAAGAATTTGCACCTGTTAAAAATGCAAGTGGCAATGCAACTGATACACCTGAAACTTCTCGAATTCTTGTTCTCCATCTTCATACTCGCTGGGTTATTGCTGC
TGGTGGCTTTGTGACACATTCAGTACCTTTGTACACAACTGGGGTGGAGGTTTCACCACTTTGCTCTTATGCGGGAGAAAATTTGGAAGACATTTGCCGTGGACGGACTTTCCATGCTCCATGCGAGCTCACAGCTTAGAGCAGGAGCGATTGGTTCCAATGGTAGAGGTGTTTAAGTTGCATCGACTATGAAGGTGTTG
AATTTCCAGTTCAGTGCACTGCTAAATTTGTAAGATGGGAGAGTGGCATCGTCAGGCACTGATGTTCAATTTTGTTGTAGAAATTTGGCAGTGTTAGGTTGGCATTTGAGTGCACAGTAGGAATTAGACATTTGAGCCTGGTATCCTACTAGGCCTTTGGTCTTTGATGTTTTCACATGCTTTTATGAATGTTGATGTTT
AGCTTTATGTTGCATTCTTCATTAAAATAGCAGCTGCTCGTATAAATTGTGTCAGGCTGCTCATGAATTTATTGCTAAATGGACTAATATCTTATTAGTCGTCTAAACTTTTGTTGAAGATGCCATGTGAACATGTCATTTTCTTTAAGAGCTTTGTCAATGTGCTACATAATTCTTATTTATTTGAGGTATTTCATAAA
AG
>TRINITY_DN113623_c0_g2_i16 from sample A3 / Example unspliced isoform:GTGTGGACAATATTTAAGAGCTAGATCTTGTCCATTGTCTCTAATCGAAATTGATAAACCGAAGGATTCGGCCTTTTTGATATTCGACGCTACGTGCTGTCACCAGGGTTTCGGATCTGCATTGATGGGGGAAGCAGGGGGCGAAGATGCAGCTCCGCCTCAGGCTGTGCTGGAGCGTCTCAAAGATTTCGGCCAGGAAC
AAACCCTAGCGCTGTGGAAGGAGCTGAGCTCTAATGAGCGCGACCTCCTCATTAAAGATCTCGAGAGCTTGGATCTTCCTCGAGTGGATCGAATTATAAAACACTCTCTCGCTTCACGTGATCGACCTGTACTCAATCTAGAACCAGTTCCTGAAGCAAGTGTCTCAACTGTTGAGGAAAGGACATTAGAAGAGAGAGAA
AAATGGTGGAGCATGGGATTAAAGGCCATACGTGAGGGCAAGCTTGCAGTCGTGCTTTTGTCTGGAGGCCAGGGTACCCGTCTAGGAAGTTCAGAGCCGAAGGGATGTTTCAACATTGGGCTTCCTTCGGGTAAATCACTATTCCAACTTCAAGCAGAGCGTATTTTACGTGTTCAGAGACTTGCAGCCCAGTCAGCAGC
TGATGGGCGAGTTACCCGAATCCATTGGTATGTAATGACAAGTTCATTTACACATGATGTGATACGCAAATTCTTTGAAAGTCGAAAATATTTTGGCTTGGAATCAGAACAAGTAACCTTTTTCCAGCAAGGTACACTCCCTTGTATTTCTAAGGAAGGACGAATTATCATGGAAACTCCATATCAGGTTGCAAGGGCTC
CAGATGGGAACGGAGGTGTTTATTCAGCACTGAAATTCTCAAAATGCTTGGAAGATATGGCGATGAAAGGGATCAAATACATTGATTGCTACGGAGTTGACAATGCTTTGGTCCGTGTCGCAGATCCAATGTTCCTAGGTTACTGTATTGATAAAGGTGTAGCTACTGCAGCCAAGGTTGTCCGGAAGGCATATCCACAA
GAGAAGGTTGGTGTGTTTGTCCAGCGGGGTAAAGGAGGATCTTTCAGAGTAATAGAATACAGTGAGATGGATTCTTCCATGGCATATGCTATAAACCAGGAGACTGGGCGTCTTCGATTCAATTGGAGTAATGTATGCTTGCACATGTTTTCATTGGACTTTTTGAACCAGGTTACCGAAGATCTTGAACAGGACAGCAT
CTACCATCTGGCAGAGAAGAAAATGCCTTCTGTTGAGGGACATATATTGGGCATAAAGTTGGAGCAATTTATATTTGATGCATTTCCGTATGCACCTTCAATGGCTCTCTTTGAGGTGTTGCGTGAAGAAGAATTTGCACCTGTTAAAAATGCAAGTGGCAATGCAACTGATACACCTGAAACTTCTCGAATTCTTGTTC
TCCATCTTCATACTCGCTGGGTTATTGCTGCTGGTGGCTTTGTGACACATTCAGTACCTTTGTACACAACTGGGGTGGAGGTTTCACCACTTTGCTCTTATGCGGGAGAAAATTTGGAAGACATTTGCCGTGGACGGACTTTCCATGCTCCATGCGAGCTCACAGCTTAGgtggaattctgattaataactgttgcagtt
ttagaatgaaatttttattacaaattcagcaattgaaattatttgtgacagAGCAGGAGCGATTGGTTCCAATGGTAGAGGTGTTTAAGTTGCATCGACTATGAAGGTGTTGAATTTCCAGTTCAGTGCACTGCTAAATTTGTAAGATGGGAGAGTGGCATCGTCAGGCACTGATGTTCAATTTTGTTGTAGAAATTTGG
CAGTGTTAGGTTGGCATTTGAGTGCACAGTAGGAATTAGACATTTGAGCCTGGTATCCTACTAGGCCTTTGGTCTTTGATGTTTTCACATGCTTTTATGAATGTTGATGTTTAGCTTTATGTTGCATTCTTCATTAAAATAGCAGCTGCTCGTATAAATTGTGTCAGGCTGCTCATGAATTTATTGCTAAATGGACTAAT
ATCTTATTAGTCGTCTAAACTTTTGTTGAAGATGCCATGTGAACATGTCATTTTCTTTAAGAGCTTTGTCAATGTGCTACATAATTCTTATTTATTTGAGGTATTTCATAAAAG
Intron 11 GTGGGTATTC ... GGGTTATCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 12.33 | 142.3 | 4 | 20 |
| A2 | 13.51 | 128 | 4 | 20 |
| A3 | 16.99 | 127 | 6 | 26 |
| A4 | 17.89 | 101 | 5 | 22 |
| A5 | 10 | 45 | 2 | 5 |
| A6 | 15.02 | 266 | 1 | 47 |
| A7 | 11.76 | 405 | 2 | 54 |
| A8 | 19.48 | 401 | 4 | 97 |
| A9 | 12.93 | 330 | 5 | 49 |
| A10 | 10.69 | 401.1 | 3 | 48 |
>TRINITY_DN42099_c2_g2_i12 from sample A8 / Example spliced isoformATTATATTAAAAAACACTATTAAAAGTTTATATTTTTTCAACCGATGACGAGATTGAAATAATAATAATAATAATAAATACGACAGTTGTATTTTTAAACTGTAACATTAAGACAATATTTAAGAGCTAGATCTTGTCCATTGTCTCTAATCGAAATTGATAAACCGAAGGATTCGGCCTTTTTGATATTCGACGCTACG
TGCTGTCACCAGGGTTTCGGATCTGCATTGATGGGGGAAGCAGGGGGCGAAGATGCAGCTCCGCCTCAGGCTGTGCTGGAGCGTCTCAAAGATTTCGGCCAGGAACAAACCCTAGCGCTGTGGAAGGAGCTGAGCTCTAATGAGCGCGACCTCCTCATTAAAGATCTCGAGAGCTTGGATCTTCCTCGAGTGGATCGAAT
TATAAAACACTCTCTCGCTTCACGTGATCGACCTGTACTCAATCTAGAACCAGTTCCTGAAGCAAGTGTCTCAACTGTTGAGGAAAGGACATTAGAAGAGAGAGAAAAATGGTGGAGCATGGGATTAAAGGCCATACGTGAGGGCAAGCTTGCAGTCGTGCTTTTGTCTGGAGGCCAGGGTACCCGTCTAGGAAGTTCAG
AGCCGAAGGGATGTTTCAACATTGGGCTTCCTTCGGGTAAATCACTATTCCAACTTCAAGCAGAGCGTATTTTACGTGTTCAGAGACTTGCAGCCCAGTCAGCAGCTGATGGGCGAGTTACCCGAATCCATTGGTATGTAATGACAAGTTCATTTACACATGATGTGATACGCAAATTCTTTGAAAGTCGAAAATATTTT
GGCTTGGAATCAGAACAAGTAACCTTTTTCCAGCAAGGTACACTCCCTTGTATTTCTAAGGAAGGACGAATTATCATGGAAACTCCATATCAGGTTGCAAGGGCTCCAGATGGGAACGGAGGTGTTTATTCAGCACTGAAATTCTCAAAATGCTTGGAAGATATGGCGATGAAAGGGATCAAATACATTGATTGCTACGG
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ACCAGGAGACTGGGCGTCTTCGATTCAATTGGAGTAATGTATGCTTGCACATGTTTTCATTGGACTTTTTGAACCAGGTTACCGAAGATCTTGAACAGGACAGCATCTACCATCTGGCAGAGAAGAAAATGCCTTCTGTTGAGGGACATATATTGGGCATAAAGTTGGAGCAATTTATATTTGATGCATTTCCGTATGCA
CCTTCAATGGCTCTCTTTGAGGTGTTGCGTGAAGAAGAATTTGCACCTGTTAAAAATGCAAGTGGCAATGCAACTGATACACCTGAAACTTCTCGAATTCTTGTTCTCCATCTTCATACTCGCTGGGTTATTGCTGCTGGTGGCTTTGTGACACATTCAGTACCTTTGTACACAACTGGGGTGGAGGTTTCACCACTTTG
CTCTTATGCGGGAGAAAATTTGGAAGACATTTGCCGTGGACGGACTTTCCATGCTCCATGCGAGCTCACAGCTTAGGTGGAATTCTGATTAATAACTGTTGCAGTTTTAGAATGAAATTTTTATTACAAATTCAGCAATTGAAATTATTTGTGACAGAGCAGGAGCGATTGGTTCCAATGGTAGAGGTGTTTAAGTTGCA
TCGACTATGAAGGTGTTGAATTTCCAGTTCAGTGCACTGCTAAATTTGTAAGATGGGAGAGTGGCATCGTCAGGCACTGATGTTCAATTTTGTTGTAGAAATTTGGCAGTGTTAGGTTGGCATTTGAGTGCACAGTAGGAATTAGACATTTGAGCCTGGTATCCTACTAGGCCTTTGGTCTTTGATGTTTTCACATGCTT
TTATGAATGTTGATGTTTAGCTTTATGTTGCATTCTTCATTAAAATAGCAGCTGCTCGTATAAATTGTGTCAGGCTGCTCATGAATTTATTGCTAAATGGACTAATATCTTATTAGTCGTCTAAACTTTTGTTGAAGATGCCATGTGAACATGTCATTTTCTTTAAGAGCTTTGTCAATGTGCTACATAATTCTTATTTA
TTTGAGGTATTTCATAAAAGTAGACGTCACATGCAATCTTTTACGTTGTAAATTCATAAAATGATTGTCATA
>TRINITY_DN42099_c2_g2_i13 from sample A8 / Example unspliced isoform:GGGGGAGGTGTGTGTGTTGGGGGGGTGCTTTTTAAGTTTTTTACCCCCTCATGGTATTTAATCCACAAACACTTGGCTATGCATTGTAATTTATAACTCTAATTGTTAGTTCAAGCATGCAGCTATGACAAGGAAATTAAAGTCACCGAGGAAGCACATGCTTAGTTAGTACATTGTGCATGCTCAGGGCTCTATTAAGT
GTTAGTCATTGTCCATGCTCAGGGCTCTATTAAGGACACTAGTATGAAGCAACTTCTCAAATGTGGGTTCTTTTTTTTCCAAGGAAAACCTCGTGGGATACACCCTCTTTCCCAGAATATCTGGATGGAAAGCAATGCAATTGCCAACCACAATAGTGGCTGGTAACCTCGAGGGACTTGACCTTTTTTGAACCTTGTGA
CTTGTGGACTTCCCATTGGTGACTTGCCTTGGACAGATAGTTTAATTGATTGAGCTAACGCTTGGGCCTGATCATTTTTGTTTCTATGTCATCAGAGTATTTAAAAAGTAGTATTGAAATAGTATGATCTTTGAATAGTACTAATATAATAGTGAAATGTTTCTAAATTAATGTTAAATATTATAATGGAAAAATATATT
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aaataataaattcagtggtgtttcgatgaagttttcatatgaacagtaatctagttgtttttgataaattattttattttttgcattgctaaaaatgtaaaggtgtgcaattttttatagagtgatgcttcagtgatgttatgccaaagtcataggtagcatctcatgacatgttttgccgggttatcagCTACCATCTG
GCAGAGAAGAAAATGCCTTCTGTTGAGGGACATATATTGGGCATAAAGTTGGAGCAATTTATATTTGATGCATTTCCGTATGCACCTTCAATGGCTCTCTTTGAGGTGTTGCGTGAAGAAGAATTTGCACCTGTTAAAAATGCAAGTGGCAATGCAACTGATACACCTGAAACTTCTCGAATTCTTGTTCTCCATCTTCA
TACTCGCTGGGTTATTGCTGCTGGTGGCTTTGTGACACATTCAGTACCTTTGTACACAACTGGGGTGGAGGTTTCACCACTTTGCTCTTATGCGGGAGAAAATTTGGAAGACATTTGCCGTGGACGGACTTTCCATGCTCCATGCGAGCTCACAGCTTAGGTGGAATTCTGATTAATAACTGTTGCAGTTTTAGAATGAA
ATTTTTATTACAAATTCAGCAATTGAAATTATTTGTGACAGAGCAGGAGCGATTGGTTCCAATGGTAGAGGTATGCATTTATTACCGGCAACGTAAGCTTTATGATTGTTCAGTTGATTTTCCTCAGTAGTACTGTTTATAGAACTTTGCAATCTTGTTTGTTGAATTAGGATTAAATTTCTTGTAAGTAGATTTGCACA
TACTTTGCCTGAGATTAATTGATTGATAGTGATGGACAGCTCCTGCATTCTGTGTGTTTTTATCCTACAAGAGCTTTATATGTTAATTATCTACCATGGAGGCAGTAATACATAAATTAAAGATTTTAAGGATTACTGCGTTGTTGTTTTTACCAGTTGATATTCGTAGTCAAATAATTTTTTTTGTTATCTGACATGGT
CAACAGTACAGATCTATCTTTCAATCTGTCGTCTAAAATTGTTCATATCTTAATATCATTCTCTTTTCTTGTTTGTTTCCACATCAGGTGTTTAAGTTGCATCGACTATGAAGGTGTTGAATTTCCAGTTCAGTGCACTGCTAAATTTGTAAGATGGGAGAGTGGCATCGTCAGGCACTGATGTTCAATTTTGTTGTAGA
AATTTGGCAGTGTTAGGTTGGCATTTGAGTGCACAGTAGGAATTAGACATTTGAGCCTGGTATCCTACTAGGCCTTTGGTCTTTGATGTTTTCACATGCTTTTATGAATGTTGATGTTTAGCTTTATGTTGCATTCTTCATTAAAATAGCAGCTGCTCGTATAAATTGTGTCAGGCTGCTCATGAATTTATTGCTAAATG
GACTAATATCTTATTAGTCGTCTAAACTTTTGTTGAAGATGCCATGTGAACATGTCATTTTCTTTAAGAGCTTTGTCAATGTGCTACATAATTCTTATTTATTTGAGGTATTTCATAAAAGTAGACGTCACATGCAATCTTTTACGTTGTAAATTCATAAAATGATTGTCATA
Intron 12 GTAAGCGAGA ... GCGTTGCCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 46.39 | 89 | 4 | 77 |
| A2 | 51.71 | 69 | 12 | 73.9 |
| A3 | 44.38 | 70.2 | 24.9 | 56 |
| A4 | 42.34 | 79 | 4.6 | 58 |
| A5 | 42.74 | 71 | 7 | 53 |
| A6 | 37.89 | 59 | 4 | 36 |
| A7 | 44.58 | 92 | 11.6 | 74 |
| A8 | 41.18 | 70 | 1 | 49 |
| A9 | 33.18 | 145 | 5.6 | 72 |
| A10 | 34.98 | 132 | 2 | 71 |
>TRINITY_DN124458_c4_g1_i14 from sample A1 / Example spliced isoformCGAAATTGATAAACCGAAGGATTCGGCCTTTTTGATATTCGACGCTACGTGCTGTCACCAGGGTTTCGGATCTGCATTGATGGGGGAAGCAGGGGGCGAAGATGCAGCTCCGCCTCAGGCTGTGCTGGAGCGTCTCAAAGATTTCGGCCAGGAACAAACCCTAGCGCTGTGGAAGGAGCTGAGCTCTAATGAGCGCGACC
TCCTCATTAAAGATCTCGAGAGCTTGGATCTTCCTCGAGTGGATCGAATTATAAAACACTCTCTCGCTTCACGTGATCGACCTGTACTCAATCTAGAACCAGTTCCTGAAGCAAGTGTCTCAACTGTTGAGGAAAGGACATTAGAAGAGAGAGAAAAATGGTGGAGCATGGGATTAAAGGCCATACGTGAGGGCAAGCTT
GCAGTCGTGCTTTTGTCTGGAGGCCAGGGTACCCGTCTAGGAAGTTCAGAGCCGAAGGGATGTTTCAACATTGGGCTTCCTTCGGGTAAATCACTATTCCAACTTCAAGCAGAGCGTATTTTACGTGTTCAGAGACTTGCAGCCCAGTCAGCAGCTGATGGGCGAGTTACCCGAATCCATTGGTATGTAATGACAAGTTC
ATTTACACATGATGTGATACGCAAATTCTTTGAAAGTCGAAAATATTTTGGCTTGGAATCAGAACAAGTAACCTTTTTCCAGCAAGGTACACTCCCTTGTATTTCTAAGGAAGGACGAATTATCATGGAAACTCCATATCAGGTTGCAAGGGCTCCAGATGGGAACGGAGGTGTTTATTCAGCACTGAAATTCTCAAAAT
GCTTGGAAGATATGGCGATGAAAGGGATCAAATACATTGATTGCTACGGAGTTGACAATGCTTTGGTCCGTGTCGCAGATCCAATGTTCCTAGGTTACTGTATTGATAAAGGTGTAGCTACTGCAGCCAAGGTTGTCCGGAAGGCATATCCACAAGAGAAGGTTGGTGTGTTTGTCCAGCGGGGTAAAGGAGGATCTTTC
AGAGTAATAGAATACAGTGAGATGGATTCTTCCATGGCATATGCTATAAACCAGGAGACTGGGCGTCTTCGATTCAATTGGAGTAATGTATGCTTGCACATGTTTTCATTGGACTTTTTGAACCAGGTTACCGAAGATCTTGAACAGGACAGCATCTACCATCTGGCAGAGAAGAAAATGCCTTCTGTTGAGGGACATAT
ATTGGGCATAAAGTTGGAGCAATTTATATTTGATGCATTTCCGTATGCACCTTCAATGGCTCTCTTTGAGGTGTTGCGTGAAGAAGAATTTGCACCTGTTAAAAATGCAAGTGGCAATGCAACTGATACACCTGAAACTTCTCGAATTCTTGTTCTCCATCTTCATACTCGCTGGGTTATTGCTGCTGGTGGCTTTGTGA
CACATTCAGTACCTTTGTACACAACTGGGGTGGAGGTTTCACCACTTTGCTCTTATGCGGGAGAAAATTTGGAAGACATTTGCCGTGGACGGACTTTCCATGCTCCATGCGAGCTCACAGCTTAGGTGGAATTCTGATTAATAACTGTTGCAGTTTTAGAATGAAATTTTTATTACAAATTCAGCAATTGAAATTATTTG
TGACAGAGCAGGAGCGATTGGTTCCAATGGTAGAGGTATGCATTTATTACCGGCAACGTAAGCTTTATGATTGTTCAGTTGATTTTCCTCAGTAGTACTGTTTATAGAACTTTGCAATCTTGTTTGTTGAATTAGGATTAAATTTCTTGTAAGTAGATTTGCACATACTTTGCCTGAGATTAATTGATTGATAGTGATGG
ACAGCTCCTGCATTCTGTGTGTTTTTATCCTACAAGAGCTTTATATGTTAATTATCTACCATGGAGGCAGTAATACATAAATTAAAGATTTTAAGGATTACTGCGTTGTTGTTTTTACCAGTTGATATTCGTAGTCAAATATTTTTTTTTGTTATCTGACATGGTCAACAGTACAGATCTATCTTTCAATCTGTCGTCTA
AAATTGTTCATATCTTAATATCATTCTCTTTTCTTGTTTGTTTCCACATCAGGTGTTTAAGTTGCATCGACTATGAAGGTGTTGAATTTCCAGTTCAGTGCACTGCTAAATTTGTAAGATGGGAGAGTGGCATCGTCAGGCACTGATGTTCAATTTTGTTGTAGAAATTTGGCAGTGTTAGGTTGGCATTTGAGTGCACA
GTAGGAATTAGACATTTGAGCCTGGTATCCTACTAGGCCTTTGGTCTTTGATGTTTTCACATGCTTTTATGAATGTTGATGTTTAGCTTTATGTTGCATTCTTCATTAAAATAGCAGCTGCTCGTATAAATTGTGTCAGGCCGCTCATGAATTTATTGCTAAATGGACTAATATCTTATTAGTCGTCTAAACTTTTGCTG
AAGATGCCATGTGAACATGTCATTTTCTTTAAGAGCTTTGTCAATGTGCTACATAATTCTTATTTATTTGAGGTATTTCATAAAAGTAGACGTCACATGCAATCTTTTACGTTGTAGATTCATAAAATGATTGTCATAATATTTAAGAAGCTGAATTAGTGATTTCGTGGATCTTGATAAATAAAATGCATGGATGGTAA
TCTATGAGGAGAGAACACATAAATATCTACAGTTTAATTCCCTCCAGGATATTTTAGGAATTAGGAAAATTTATAATCA
>TRINITY_DN124458_c4_g1_i16 from sample A1 / Example unspliced isoform:CGACGCTACGTGCTGTCACCAGgtaagcgagaaataatggaaggaaagatcgagaacaacccctgagagctctgcaacaacgtccacaccattaacagttgcaattctacctatgttgcatgtttcttgatcctggaaatagcaatccggagattcttaatgcaggagccgagcgttttttcacagttttggtcttttta
atagaggagccgaagttgttttcgaaaagattttggtgaattaatcttcatttgcgcgttgccagGGTTTCGGATCTGCATTGATGGGGGAAGCAGGGGGCGAAGATGCAGCTCCGCCTCAGGCTGTGCTGGAGCGTCTCAAAGATTTCGGCCAGGAACAAACCCTAGCGCTGTGGAAGGAGCTGAGCTCTAATGAGCGC
GACCTCCTCATTAAAGACCTCGAGAGCTTGGATCTTCCTCGAGTGGATCGAATTATAAAACACTCTCTCGCTTCACGTGATCGACCTGTACTCAATCTAGAACCAGTTCCTGAAGCAAGTGTCTCAACTGTTGAGGAAAGGACATTAGAAGAGAGAGAAAAATGGTGGAGCATGGGATTAAAGGCCATACGTGAGGGCAA
GCTTGCAGTCGTGCTTTTGTCTGGAGGCCAGGGTACCCGTCTAGGAAGTTCAGAGCCGAAGGGATGTTTCAACATTGGGCTTCCTTCGGGTAAATCACTATTCCAACTTCAAGCAGAGCGTATTTTACGTGTTCAGAGACTTGCAGCCCAGTCAGCAGCTGATGGGCGAGTTACCCGAATCCATTGGTATGTAATGACAA
GTTCATTTACACATGATGTGATACGCAAATTCTTTGAAAGTCGAAAATATTTTGGCTTGGAATCAGAACAAGTAACCTTTTTCCAGCAAGGTACACTCCCTTGTATTTCTAAGGAAGGACGAATTATCATGGAAACTCCATATCAGGTTGCAAGGGCTCCAGATGGGAACGGAGGTGTTTATTCAGCACTGAAATTCTCA
AAATGCTTGGAAGATATGGCGATGAAAGGGATCAAATACATTGATTGCTACGGAGTTGACAATGCTTTGGTCCGTGTCGCAGATCCAATGTTCCTAGGTTACTGTATTGATAAAGGTGTAGCTACTGCAGCCAAGGTTGTCCGGAAGGCATATCCACAAGAGAAGGTTGGTGTGTTTGTCCAGCGGGGTAAAGGAGGATC
TTTCAGAGTAATAGAATACAGTGAGATGGATTCTTCCATGGCATATGCTATAAACCAGGAGACTGGGCGTCTTCGATTCAATTGGAGTAATGTATGCTTGCACATGTTTTCATTGGACTTTTTGAACCAGGTTACCGAAGATCTTGAACAGGACAGCATCTACCATCTGGCAGAGAAGAAAATGCCTTCTGTTGAGGGAC
ATATATTGGGCATAAAGTTGGAGCAATTTATATTTGATGCATTTCCGTATGCACCTTCAATGGCTCTCTTTGAGGTGTTGCGTGAAGAAGAATTTGCACCTGTTAAAAATGCAAGTGGCAATGCAACTGATACACCTGAAACTTCTCGAATTCTTGTTCTCCATCTTCATACTCGCTGGGTTATTGCTGCTGGTGGCTTT
GTGACACATTCAGTACCTTTGTACACAACTGGGGTGGAGGTTTCACCACTTTGCTCTTATGCGGGAGAAAATTTGGAAGACATTTGCCGTGGACGGACTTTCCATGCTCCATGCGAGCTCACAGCTTAGGTGGAATTCTGATTAATAACTGTTGCAGTTTTAGAATGAAATTTTTATTACAAATTCAGCAATTGAAATTA
TTTGTGACAGAGCAGGAGCGATTGGTTCCAATGGTAGAGGTGTTTAAGTTGCATCGACTATGAAGGTGTTGAATTTCCAGTTCAGTGCACTGCTAAATTTGTAAGATGGGAGAGTGGCATCGTCAGGCACTGATGTTCAATTTTGTTGTAGAAATTTGGCAGTGTTAGGTTGGCATTTGAGTGCACAGTAGGAATTAGAC
ATTTGAGCCTGGTATCCTACTAGGCCTTTGGTCTTTGATGTTTTCACATGCTTTTATGAATGTTGATGTTTAGCTTTATGTTGCATTCTTCATTAAAATAGCAGCTGCTCGTATAAATTGTGTCAGGCCGCTCATGAATTTATTGCTAAATGGACTAATATCTTATTAGTCGTCTAAACTTTTGCTGAAGATGCCATGTG
AACATGTCATTTTCTTTAAGAGCTTTGTCAATGTGCTACATAATTCTTATTTATTTGAGGTATTTCATAAAAGTAGACGTCACATGCAATCTTTTACGTTGTAGATTCATAAAATGATTGTCATAATATTTAAGAAGCTGAATTAGTGATTTCGTGGATCTTGATAAATAAAATGCATGGATGGTAATCTATGAGGAGAG
AACACATAAATATCTACAGTTTAATTCCCTCCAGGATATTTTAGGAATTAGGAAAATTTATAATCA